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originalCons : AATTCTATTTC-TGTAA-G--A-A-TGT-AA--C-AG-A-TATGGA-AGGG-G-A-AA-A-T---GTCC-TG-A---------AA--CTCT---T---CA-C-C-A--CG-TTG-AAAT--A----TA-AA-CT---T----TG-T--AT-GCTG--TTGA-TAAA
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Alignments
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lowQualScore : . . .. . . . .. . . . . . . . . . ... . . ......... .. . ... ... . . . .. . . .. .... . . ... .... . .. . .. .
lowQualScore : 0 0 88 0 0 0 55 9 9 7 7 7 7 7 7 7 555 2 7 333333333 55 0 222 222 8 6 6 55 8 8 55 0000 5 8 000 9999 8 11 8 33 9
consensus : AATTCTATTTC-TGTAA-G--A-A-TGT-AA--C-AG-A-TATGGA-AGGG-G-A-AA-A-T---GTCC-TG-A---------AA--CTCT---T---CA-C-C-A--CG-TTG-AAAT--A----TA-AA-CT---T----TG-T--AT-GCTG--TTGA-TAAA
Reference ( family-681 ) : AATTCTATTTC-TGTAA-G--A-A-TGT-AA--C-AG-A-TATGGA-AGGG-G-A-AA-A-T---GTCC-TG-A---------AA--CTCT---T---CA-C-C-A--CG-TTG-AAAT--A----TA-AA-CT---T----TG-T--AT-GCTG--TTGA-TAAA
gi|81351 : AACTCTATTTC-TGCAA-G--A-A-TGT-AA--C-AT-A-TATGGA-AGAG-G-A-AA-A-T---GTCC-TG-A---------AA--CTCT---T---CA-C-C-A--CG-TTG-AAAT--A----TA-AA-CT---T----TG-T--AT-GCTG--TTGA-TAAA
gi|81352 : AATTCTATTTC-TGTAA-G--A-A-TGT-AA--C-AG-A-TATGGA-AGTG-G-A-AA-A-T---GTCC-TG-A---------AA--CTCA---T---CA-C-C-A--CT-TTG-AAAT--A----TA-AA-CT---T----TG-T--AT-GCTG--TTGA-TAAA
gi|81353 : AATTCTATTTC-TGTAA-G--A-A-TGT-AA--CAAG-A-TATGGA-AGGG-GAA-AA-A-T---GTCCTTG-A---------AA--CTCT---T---CA-C-CGA--CG-TTG-AAAT--A----TA-AA-CT---T----TG-T--ATGGCTG--TTGA-TAAA
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gi|81373 : TGGA-AGGG-G-A-AA-A-T---GTCC-TG-A---------AA--ATCT---T---CA-C-G-A--CG-TTG-AAAT--G----TA-AA-CT---T----TG-T--AT-GCTG--TTGA-TA