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Reference ( gi|109288 )       : TTGT--AC-AACGT-A-TT-GG-AA--AAC--TAA-T-----A-C--A--T------------T----TA----T--G-GAA-TT-A-T-TCT---TA---AA-T-G--CCA-G--T-T-AC-AGGA-ATAT--TTCC----ATA-TT-T--TTG-TTT-ACCT-TGAGGTT-TG-CT-TCG-A-TCGA-GT---A--A-AAATTTCTT
gi|109290                     : TTGT--CC---CGT-A-TTTGG-AA--AAC--TAA-T-----A-C--A--T------------T----TA----T--G-GAA-TT-A-G-TTT---TA---AA-T-G--TCA-G--T-T-AC-AGGA-ATAT--TTCC----ATA--T-T--TTG-TTT-ACC--TGAGGTT-TG-CT-TCG-A-TCGA-GT---A--A-AAATTTCTT
gi|109289                     : TTGT--CC-AACGT-A-TT-GG-AA--AAC--TAA-T-----A-C--A--T------------T----TA----A--A-GAG-TG-A-T-TCT---TA---AA-T-G--TCA-G--T-T-AC-AGGA-ATAT--TTCC----ATA--C-T--TTA-TTT-ACC--TGAGGTT-TG-CT-TCG-A-TCAA-GT---A--A-AAATTTC
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Reference ( family-667 )      :                                                                        TTGT-CC--A-ACG-T-A-TT-GG-AA--AAC--TAA-T-----AC--A--T------------T----TA----T--G-GAA-TT-A-T-TCT---TA---AA-T-GTC-A-G--T-T-AC-AGGA-ATAT--TTCCATA-T----T-T--TTG-TTT-ACCT-TGAGGTT-TG-CT-TCG-A-TCGA-GT---A--A-AAATTTCTT
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Reference ( family-667 )      :                                                                        TTGT-CC--A-ACG-T-A-TT-GG-AA--AAC--TAA-T-----AC--A--T------------T----TA----T--G-GAA-TT-A-T-TCT---TA---AA-T-GTC-A-G--T-T-AC-AGGA-ATAT--TTCCATA-T----T-T--TTG-TTT-ACCT-TGAGGTT-TG-CT-TCG-A-TCGA-GT---A--A-AAATTTCTT
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gi|109301                     :                                                                         TGC-CC--A-ATG-T-A-TT-TG-AA--AAC--TGG-T-----AC--A--TGTACATTAAATTT----TA----T--G-GAA-TA-A-T-TCT---TC---AG-T-GTC-A-G--T-T-AC-A-GA-ATTT--TTCCATA------T-T--TTG-TTT-ACC--TGAGATT-TG-CT-----A-T-GG-GT---A--T-AAAT
gi|109302                     :                                                                         TGT-CC--A-CTC-T-A-TT-GG-AA--AAC--ATA-T-----AC--A--T------------T----T-----T--G-GAA-TT-A-T-TTTCTGTA---AAGTGGTCGA-G--T-T-AC-A-GA-ATAT--TTCCA-A-A----T-T--TTG--TT-ACC--TGAAATC-TG-CTCTCGCA-TCGAGGTTA-A--A-AAATTTTTT
gi|109303                     :                                                                          GT-TT--A-ATG-T-A-TTTGA-AA--AAC--AAA-T-----AC--A--T------------A----TA----CTGG-GAA-CTCA-T-TCT---TC---AG-A-GTC-A-G--T-T-AC-AGGA-ATAT--TTCCA-A-T----TAT--TTG--TT-ACCTCTGAGGTT-TG-CT-----A--CGG-GT---A--A-GAATTCCT
gi|109304                     :                                                                           T-CC--A-ACG-T-A-TT-G--AA--AAC--TAA-T-----AC--A--T------------TA---TA----T--G-GAA-TT-AAT-TCG---TC---AA-T-GTC-A-G--T-T-AC-AGGA-ATAT----------------------G-TTT-ACCG-TGGTGTT-TG-CT-TCA-A-TCGA-GT---A--C-AAATTTCTT
gi|109305                     :                                                                              C--A-ATG-T-A-TT-G--AA--AAC--TAA-TC----AC--A--GA-----------T----TA----T--G-AAGCTT-A-T-TCT---TA---AA-T-G---A-G----T-A--AGGA-A
gi|109305                     :                                                                                                                                                                                                 C-AAAA-ATAT--TTCCATA-T----T-T--T-G-TTT-ACCT-TGAGGTT-TG-CT-TCG-A-TCGA-GT---A--A-AAATCTCTTataacataataatataaaaacacaaaaggcaaaaatatttccatattttgtttaccttgaggtttgcttcgatcgagtaaaaatctctt
gi|109306                     : caatgtattgaaaactaatcacagattatgaagcttattcttaaatgagtaaggaaataacataataatataaaaacacaaaagg-T-A-TT-GGTAA--AATA-TAA-T-----A------T------------T----TA----T--G-GAA-TC-A-T-TCT---TC---AG-T-GTC-A-G--T-T-GC-AGAA-ATAT--TTCCATA------G-T--TTG-TTT-ACC--TGAGATT-TG-CT-----A-T-GG-GT---A--T-AAATTTCTT
gi|109307                     :                                                                                            T-GG-AA--AAC--TGA-T-----AC--A--T------------T----TA----T--G-GAA-TC-A-C-TCT---TC---AT-T-GTC-A-G--T-T-AC-TGGA-ATAG--TTCCATA------G-T--TTG-TTT-ACC--TAAGGTTATG-CT-ATG-A-TCGA-GT---A--C-AAATTTCTT
gi|109308                     :                                                                                               G-AA--CAC--TAA-T-----AC--A--T------------T----TA----T--G-GAA-TT-A-T-TTT---TA---AA-T-GTC-A-G--T-T-AC-AGGA-ATAT--TTCCATA------T-T--TTG-TTT-ACC--TGAGGTT-TG-CT-TTG-A-TCGA-GT---A--A-AAATTTCTT
gi|109309                     :                                                                                                   --AAC--T---T-----AC--A--T------------T----TA----T--A-GA--TT-A----CT---TAG--AA-T-GTC-A-G--TAT-AC-AGGA-TT-T--TTCCAT--T----T-TAATT--TTT-ACCT--GAGGTT-TGGCT-TCG-A-TCGA-GTTCAA--A-AAATTTCT
gi|109310                     :                                                                                                                            ------------T----TA----T--G-AAA-TC-A-T-TCT---TC---AG-T-ATC-A-T--T-T-AT-AGGA-ATAT--TTCCATA-T----T-C--TT--TTT-A
gi|109311                     :                                                                                                                                                                          A---AA-T-GTC-A-G--T-T-AC-AGGA-ATAT----------------------G-TTT-ACCT--GAGGTT-TG-CT-TCA-A-TCGA-GT---


blockSeqs                     :                                                                            A  GC T   C T G  T  T  TA   CG   A TTAAT  CA GA GTACATTAAATT AAAA  AACA TG T   C  C A A   CTG  TAC  G T   G T TA A A  G    T    TG       TTATA  A AA   TT  A   TCT      A  G  CT  C T    G  TCA GT G
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . T .  T  .  .    A    C T      .  G  A            A     .    C  .   .  . . .   A    G    . G   . . .  . .  .    .    .        TT     . .    T   .   TG       A  .  T   . .    .  TA  G  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  T  .  .    .    . A      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        TT     . .    T   .   TC       .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . C      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        T      . .    T   .   TC       .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        T      . .    T   .   CT       .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        T      . .    T   .   TC       .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        T      . .    T   .   GT       .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        A      . .    T   .   TT       .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        T      . .    T   .   T        .  .  A   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        T      . .    T   .   T        .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        T      . .    T   .   T        .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        T      . .    T   .   T        .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        .      . .    T   .   T        .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        .      . .    T   .   T        .  .  A   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        .      . .    T   .   T        .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                            .  .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        .      . .    T   .   T        .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                               .  .   . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        .      . .    T   .   T        .  .  T   . .    .  .   .  .
blockSeqs                     :                                                                                      . . .  .  .  .    .    . .      .  .  .            .     .    .  .   .  . . .   .    .    . .   . . .  . .  .    .    .        .      . .    T   .   T        .  .  .   . .    .  .   .  .
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gi|109306                     : caatgtattgaaaactaatcacagattatgaagcttattcttaaatgagtaaggaaataacataataatataaaaacacaaaagg-T-A-TT-GGTAA--AATA-TAA-T-----A------T------------T----TA----T--G-GAA-TC-A-T-TCT---TC---AG-T-GTC-A-G--T-T-GC-AGAA-ATAT--TTCCATA------G-T--TTGTTT--AC--C-T-G-AGATT-T-GCT-----A-T-GG-GT---A--T-AAATTTCTT
gi|109307                     :                                                                                            T-GG-AA--AAC--TGA-T-----AC--A--T------------T----TA----T--G-GAA-TC-A-C-TCT---TC---AT-T-GTC-A-G--T-T-AC-TGGA-ATAG--TTCCATA------G-T--TTGTTT--AC--C-T-A-AGGTTAT-GCT-ATG-A-TCGA-GT---A--C-AAATTTCTT
gi|109308                     :                                                                                               G-AA--CAC--TAA-T-----AC--A--T------------T----TA----T--G-GAA-TT-A-T-TTT---TA---AA-T-GTC-A-G--T-T-AC-AGGA-ATAT--TTCCATA------T-T--TTGTTT--AC--C-T-G-AGGTT-T-GCT-TTG-A-TCGA-GT---A--A-AAATTTCTT
gi|109309                     :                                                                                                   --AAC--T---T-----AC--A--T------------T----TA----T--A-GA--TT-A----CT---TAG--AA-T-GTC-A-G--TAT-AC-AGGA-TT-T--TTCCAT--T----T-TAATT-TTT--AC--C-T-G-AGGTT-TGGCT-TCG-A-TCGA-GTTCAA--A-AAATTTCT
gi|109310                     :                                                                                                                            ------------T----TA----T--G-AAA-TC-A-T-TCT---TC---AG-T-ATC-A-T--T-T-AT-AGGA-ATAT--TTCCATA-T----T-C--TT-TTT--A
gi|109311                     :                                                                                                                                                                          A---AA-T-GTC-A-G--T-T-AC-AGGA-ATAT----------------------GTTT--AC--C-T-G-AGGTT-T-GCT-TCA-A-TCGA-GT---