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Reference ( gi|96513 ) : GCGAGTCTC-GCGCCACTCCA-GTGCGAGG---CT------G---GTGC--CAC-T-CA-ATTGCAATG------GTACTGCCGCAG-T-A--CGACAAATCGCC-GG-AG-TG--GTACGGG-G------G---TA--GCCGA---TGT-GGT-GCGAG---TCT-CAC-ACCACTG-TGAC-----------ACACC---GC--CGA--T--ATCGCACTCGCGCGAG
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Alignments
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gi|96528 : GTCTC-GCGCCATTCCA-GTGCGAGA---AT------G--GTGC-CAT-T-CA-ATTGCA------ATTGTACTGCCGCAG-T-A--CGACAAATCGCG-GA-AT-TGGTACGGGG------G---TAACAG---CTGT-GGT-GCGAG---TCT-CGC-GCCACTT-CGGCA-C-GCC-GCCAGT--ACCACA-----CTCGCACGAG
gi|96529 : TC-GCACCACTCCA-GTGCGAGG---CT------G--GTGA-CAC-T-CA-ATTGCA------GTTGTACTGCTGCAG-T-A--CGACAAATCGTC-GG-AG-TGGTACGTGG------G---TAGTCG---TTGT-GAT-GCGAG---TCT-TGC-GCCACTG-TGGCA-C-GCC-GCCAGA--ACCACA-----CTAGCG-GAG
gi|96530 : GCCACTCTC-GTACGAGG---GT------G--GTGG-GACGT-CT-ACTGCA------ATCGCACGGCCGCCG-T-G--CGATAAATCGCG-GG-AA-TCGTACGGGG------G---TAGCGG---TTAT-CGT-GCGAT---TCA-CGC-GCAACTA-TGGTA-CTGCC-A-CAGT--ACCAC
gi|96531 : CACTCTAAGTGCGAGAGGACT------G--GTGC-GAC-T-CA-ATTACA------ATTGTACGGAAGAAG-C-A--C---AAAT-GCCTGGTAG-TGGTACGAGG------GGATTAGAAG---C-GT-AGTAGCGAA---TCT-CGC--CAACTG-TGGCA-C-GCCTG--AGT----CACAATCGTCTCGCGCGAG
gi|96532 : CGAGT---CT------C--GCGC-TAT-T-CA-ATTGCA------ATTGTACTGCCGCAG-T-A--CGACAAATCGCC-GG-AG-TGTTATGGGG------G---TAGCCG---CTGA-GGT-GCGAG---TCT-CGC-GCCACTG-TGGCA-C-GCC-GTCAGT--GCCACA-----CTCGCACGAG
gi|96533 : CGAGT---CT------C--GCGC-CAC-T-CA-GTTGCA------ATTGTACTGCGGTAG-T-A--CGACAAATCGCC-GA-CG-AGACATGTGG----------TAGTCG---CTGT-GGT-GCGAG---TCT-CAA-GCAATTG-TGGCA-C-GAC-GCCAGT--ACCACA-----CTCGCACGAG
gi|96534 : TACTGCAG-T-A--CGACAAATCGCC-AT-GG-TGGTATGGAG------G---TAGCCG---CTGT-AGT-GCGAG---TCT-CGC-GCCGATG-TGCCA-C-GTC-GCCAGT--ACCACA-----CTCACGCGAG
gi|96535 : GG------G---TAGCCG---CTGT-GGT-GCGAA---TCT-CAC-GCCACTG-TGGCA-C-ACT-GCCAGT--ACCACA-----CTCGCACGAG
gi|96536 : GT-GCGAG---TCT-CGC-GCCACTG-TGGCA-C-GCT-GCAAGT--GCCACA-----CTCGTGCGAG
blockSeqs : C A GGA CGATGT TA G A A C ATAATT C T CC T T T CCGAGA GAT AGT C A ATT T G C C T T GG ATCGT
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Alignments
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lowQualScore : 4 1 222 555555 55 8 8 8 9 555555 8 8 55 8 8 8 000000 888 000 7 7 999 7 7 7 7 7 7 55 88888
consensus : GCGAGTCTC-GCGCCACTCCA-GTGCGAGG---CT------G--GTGC-CAC-T-CA-ATTGCA------ATTGTACTGCCGCAG-T-A--CGACAAATCGCC-GG-AG-TGGTACGGGG------G---TAGCCG---CTGT-GGT-GCGAG---TCT-CGC-GCCACTG-TGGCA-C-GCC-GCCAGT--ACCACA-----CTCGCGCGAG
Reference ( family-666 ) : GCGAGTCTC-GCGCCACTCCA-GTGCGAGG---CT------G--GTGC-CAC-T-CA-ATTGCA------ATTGTACTGCCGCAG-T-A--CGACAAATCGCC-GG-AG-TGGTACGGGG------G---TAGCCG---CTGT-GGT-GCGAG---TCT-CGC-GCCACTG-TGGCA-C-GCC-GCCAGT--ACCACA-----CTCGCGCGAG
gi|96513 : GCGAGTCTC-GCGCCACTCCA-GTGCGAGG---CT------G--GTGC-CAC-T-CA-ATTGCA------ATGGTACTGCCGCAG-T-A--CGACAAATCGCC-GG-AG-TGGTACGGGG------G---TAGCCG---ATGT-GGT-GCGAG---TCT-CAC-ACCACTG-TGACA-C-ACC-GCCGAT--ATCGCA-----CTCGCGCGAG
gi|96514 : GCGAGTCTA-GCGCCACTCTA-GTGCGAGG---CT------G--GTGC-CAC-T-CA-ATTACA------ATTGTACTGCCACAG-A-A--CGACAAATCGCT-GG-AG-TGGTACGGGG------G---TAGAAG---CTGT-AGT-GCGAA---TCT-CCC-GCCACTG-TGGCA-C-GCC-GCCAGT--ATCACA-----CTCGCGCGAG
gi|96515 : GCGAGTCT--GCGCCACTCTA-GTGCGAGG---CT------G--GTGC-CAC-T-CA-ATTACAATAATTATTGTACTGCCACAG-A-A--CGACAAATCGCC-GG-AGTTGGTACGGGGCCGAGAG---TAGCCG---CTGT-AGT-GCAAAATTTCC-CGC--CCACTG-TGGCACC-GCC-A-CAGT--ATCACA-----
gi|96516 : GCGAGTCTC-GCGCCGCTCCA-GTGCGAGG---CT------G--GTGC-CAC-T-AA-GTTGCA------ATTGTGCTACCGCAG-T-G--CAACAATTCGCC-GG-TG-TGATAC-GGG------G---TAGCCG---CTGT-GGT-GCGAG---TCT-CGC-GCCACTG-CGGCA-C-GCC-GCCAGT--GCCACA-----CTCTTGCGAG
gi|96517 : GCGAGTCTC-TA--CACTCCA-G-GCGAGGG--CT------G--GTGCGCAC-TATA-AT-GCA------ATCGTAC-GCCGCAGCT-A--CGACAAGTCGTC-GG-AG-TGGTACGGAG------G---TAGCCT---TTAT-GGT-GCGAT---TCT-CGCGGTCACTG-TGGCA-C-GCT-GCCAGT--GCCACA-----CTCGTGCGAG
gi|96518 : GCG-GTCTCCGCACCACTCCA-GTGCGAGG---CT------G--GTGC-CAC-TGTA-ATTGCA------ATT-TACTGCCGCAG-T-ACCCGACAAATCGCC-TG--G-TGGTAC-GGA------G---TA-CCAAGTTTAT-GGT-GAGAA---TCT-CGC-GCCACTGCTAGCA-C-GGC-GCCAGTGGGCCACA-----CTCGCGCGAG
gi|96519 : GCGAGTCTT-GCACCACTCCA-GTACGAGG---CT------ATAGTGC-CAC-T-TA-ATTGCA------ATCGTACTGCAGTAG-T-A--CGACAAATCGCC-GG-GG-TGGTACGGAA------G---TAGCCA---TTAT-GGT-GCGAG---TCT-CGC-GCCA
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gi|96526 : GAGTCTC-GCGCCACTCCA-GTGCGAAG---CT------G--GCGC-CAC-T-CA-ATCGCA------ATTATACTGCTGCAG-T-A--CGACAAATCGCA-GG-AG-TATTACGGGG------A---TA--------------------------------ACCACTG-TGGCA-C-GCC-ACCAGT--ACCACA-----CTCG
gi|96527 : GAGT-TC-GCGCCACTC-A-ATGTG-GA---CT------GT-GCGG-CACAT-CACATCGCA------AT-ATACTGCTGCAG-TTA--CGACAAATCGCT-AA-GA-TGTTACGGGG------GA--TAACTA---CTGT-GG--------------CAC-GCCACAG-TGCCA-C-AGC-GTC
gi|96528 : GTCTC-GCGCCATTCCA-GTGCGAGA---AT------G--GTGC-CAT-T-CA-ATTGCA------ATTGTACTGCCGCAG-T-A--CGACAAATCGCG-GA-AT-TGGTACGGGG------G---TAACAG---CTGT-GGT-GCGAG---TCT-CGC-GCCACTT-CGGCA-C-GCC-GCCAGT--ACCACA-----CTCGCACGAG
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gi|96532 : CGAGT---CT------C--GCGC-TAT-T-CA-ATTGCA------ATTGTACTGCCGCAG-T-A--CGACAAATCGCC-GG-AG-TGTTATGGGG------G---TAGCCG---CTGA-GGT-GCGAG---TCT-CGC-GCCACTG-TGGCA-C-GCC-GTCAGT--GCCACA-----CTCGCACGAG
gi|96533 : CGAGT---CT------C--GCGC-CAC-T-CA-GTTGCA------ATTGTACTGCGGTAG-T-A--CGACAAATCGCC-GA-CG-AGACATGTGG----------TAGTCG---CTGT-GGT-GCGAG---TCT-CAA-GCAATTG-TGGCA-C-GAC-GCCAGT--ACCACA-----CTCGCACGAG
gi|96534 : TACTGCAG-T-A--CGACAAATCGCC-AT-GG-TGGTATGGAG------G---TAGCCG---CTGT-AGT-GCGAG---TCT-CGC-GCCGATG-TGCCA-C-GTC-GCCAGT--ACCACA-----CTCACGCGAG
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