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lowQualScore                  :       ..     . ....     ..    . ..     ..  ...       .    .    ..     .  .   . .      . ...  .  ...  .. ...   .     . ..  ..  ..  .     ... .    .  .  .   . . .. .. ..  . ...    ....  . . .  . .   . .   ..   .  .    . .  .  ......... .. ...  ...      .    .   . .   .  .........  .   .. .   .    ..  . . .  .   . . .........  .. .  .  .  .... .  . . .    .  . .       . ..    .  .  .....    .... . .  . ..  . .  . .   ..   .  .  .      
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Reference ( gi|73749 )        : TTGCTC--AAGTA-C----AACAG--GTAA-G--CGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-C-TAA-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-ACGG--A--C-A--CA--GT-A-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------CGTGGA-CG-CAA-CAATT-AC-G-C-AA-CAA-T-G-GCA--TA-TC--T-GC-AG-TG---CA-AC-A-T-AAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT-T--TGTG-AA-A-ACC--AAAATA-CCCCTTACC
gi|73750                      : TTGCTC--AAGTA-C----AACAG--GTAA-G--GGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-C-TAA-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-ACGG--A--C-A--CA--GT-A-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------CGTGGA-CG-CAA-CAATT-AC-G-C-AA-CAA-T-G-GCA--TA-TC--T-GC-AG-TG---CA-AC-A-T-AAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT-T--TGTG-AA-A-ACC--AAAATA-CCCCTTACC
gi|73751                      : TTGCCC--AAGTA-C----AACAG--GTAT-G--CGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-C-TAA-TGTGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-TA-TTAC-G-TT-ACAA--A--C-A--CA--GT-G-AAGTAA-GAAG-TGC-G-AGC-TT---------CGTTGA-CG-CAA-CAATT-AC-G-C-AA-CAA-T-G-GCA--TA-TC--T-AC-AG-TG---CT-AC-A-T-AAAA-GT-C-AATTAAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT-T--TGGG-AA-A-ACC--AAAGTA-CCCCTTACC
gi|73752                      : TCGCTT--AAGTA-C----AACAG--GTAA-G--CGCCA--AA---TTTTAAC-GGCC-AGGA--CTCGT-GC-TGT-A-TCGTTG-T---TT-CA---CG--T-A-TAA-------G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--CTAAG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAAAT-CTA--CTA-CA-CTAT-G-TT-ACTA--A--TTA--CATTGT-G-AAGTAA-GAAA-CGC-G-AGC-TT---------TGAGGA-CG-CAA-CAATG-AC-A-C-AA-CAA-T-G-GCA--TC-TA--T-GC-AG-TA---CA-AC-A-T-AAAA-GT-A-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----TGAG----T-C-AT-T--TAGG-AA-A-ACC--AAAGTA-CCGCTTACC
gi|73753                      : TTGCTC--AAGTA-C----AACAG--GTAA-G--CGCCA--AT---TTTGAGC-AGCC-AGGGATTTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-----TT-CA---CG--T-C-TAATTGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AAC--AC-AATCGA-C-G--C--T---G-A---CAAT----GA-C-G--C-A-CAA-TCCTAATCTA-CA-CTAC-G-TT-ACGGA-A--C-A--CA--GT-A-AAGTAA-GAAG-CGCGG-AGC-TT---------AGT-GA-CGCCAA-CAATTAAC-G-C-AATCAA-T-G-GCA--TA-TCTTT-TT-A--TG---CACAC-A-T-AAAA-GTCC-AATTGAC-C--AATGAAA-AT-----CGGC----T-CAAT-T--TGTG-AAGA-ACCAAAAAATATCCCCTTACC
gi|73755                      : TCGCTC--AAGTAGC----AACAGCCGTAAAG--CGCCA--AT---TTTTGAC-AGCA-GGGA--TTCGG-GCATGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CGGTT-C-TAA-TGTGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--CATT--AG-A---CAAT----GA-C-GTTC-A-CAA-A-TTA--CTATCA-CTACAG-TTAACGG--AACC-A--AA--GTAA-AAGTAAGGAAG-CGC---AGC-TTC--------CGTGGACCG-CAACCAATT-AC-G-C-AA-CAA-T-G---A--TA-TC--T-GC-AG-TG----A-AC-A-T-AAAAGGT-C-AATTGAC-C--AATG-AAGAT-----C-GC----T-C-AT-T--TGTG-AA-ACACC--AAAATT-CCC
gi|73754                      : TTTCTT--GAGTA-C----AACAG--GTAA-G--CGCCA--AT---TTT-GAT-AGCC-AGAA--TTCGG-GC-TGT-A-TTGTTA-T---TT-CA---TG--T-A-TAA-TGCAA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-GA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CTGT----GA-C-A-TC-A-CAA-T-CTA--CAA-CA-CTAC-G-TT-ACGAGTA--C-A--CG--TT-G-AAGTAT-GAAG-CGT-G-AGC-TT---------CGAGGA-CA-CAA-CAATC-AC-G-C-TA-CAT-TCG-AAA--TC-TC--T-CT-AG-AG---CT-AC-A-T-AAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AT-AT-----CAGC----T-A-AT-T--TAGG-AA-A-ACC--AAAGTA-C
gi|73756                      : TTGCTC--A-GTA-A----GACAG--GTT--G--CGTCC--ATGTTTTTTGAA-CGCC-AGGA--ATCGG-GCATCT-A-TCGTTG-T---TTGCA---CG--T-C-TAA-TGCGA-G--AG--TTTTCA-TTTCA---A-AACA-AC-AAACGA-C-GGGC--T--AG-AA--CAATATT-GA-C-G-TT-A--AA-T-CTA--C---CG-CTAC-GGTT-ACGG--A----A--CG-----A-CAGTAA-GTAG-CGC-G-AGG-TT---------CTTGGA-CG--GA-CAATT-AC-G-C-AA-CAAGT-G-GCA--TC-TT--T-GC-AG-TGATACA-AC-A-T-AAAA-GT-C-AATTGACGC--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT-T--GTTG-GT-A-ACC--AAAGTA--CCTTTACC
gi|73757                      : TTGCTCCAAAGT---------CAC--GTAC-ATCCGCCACCAT---TTTTGACCAGCCCAGGA--TTCGG-GC-TGT-AATCGTTA-T---TT-CAAAACG--T-C-TA--TGCAA-AGAAGCCTT--CACTTTCA---AGAAC---C-AA-CGA-C-G--CG-T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-AACAA-G-TAA--CTA-CATCTAC-G-TT-A-GG--A--C-A--CC--AT-GTAAGTA--GAAG--GC-G-AGC-TTT--------CGTGGA-CG-CAA-CAATT-AC-G-CAAA-CCA-T-G-G-A--TATTC--T-GC-AG-TG---------------------C-AATTGAC-CCAAATG-GA-AT-----CGCCTCCTT-C-AT-TCCTGTGAAA-A-ACC--AAAATA-CCCC-TACC
gi|73758                      : TTGCTC--AAGTA-C----AACAG---TAA-G--CGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGGTGC-TGT-A-TCGTT--T---TT-CA---CG--T-C-T-A-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTC----A-AACA-A--AA-CGA-C-GC-C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-
gi|73759                      :    CTC--GAGTA-C----AACAG--GTAA-G--TGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCAG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-A-TAA-TGCGA-G------TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-TG-------T--T--AG-A---CTAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-ACGA--ATAC-A--CG--GT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------TGAGGA-TG-TAA-CAATG-CC-G-C--T-CAT-TCA-AAA--TT-TC--T-GT-AG-TG---CA-AT-A-T-AAAA-CT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CCGC----T-C-AT-T--TGGG-AA-A-ACT--AAAGTA-CTGCTTACC
gi|73760                      :    CTC--GAATA-C----AACAG--GTAA-A--CGCCA--AT---TTTTGAC-GGCC-AGGA--TTCGG-GT-TGT-A-CCGTTA-T---TT-CA---CG--T-A-TAA-TACGC-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA----------------C--T--A---------T----GA-T-G-TC-G-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-ACGA--ATAC-A--CG--GT-G-AAGTAA-TAAG-CGC-G-AGC-TT---------CGAAAA-CG-CAA-CAATC-AC-G-C-TA-CAT-TCG-AAA--TA-TC--T-CT-AG-TC---GA-AC-A-T-AAAA-GT-C-AACTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AA-T--TGGG-AA-A-ACC--AAAGTA-CCGCTTGCC
gi|73761                      :    CTC--ATGTT-C----AACAG--GTAA-G--CACCA--AT---CACAGAC-GGCC-AGGA--TTTGG-GC-TGTTA-TCTTTA-T---CT-CA---CG--T-A-TAA-TGTGA------------C--TTTCA---A-AACA-AC-AA-C----------------------------------G-TC-A-CAG-T-CTA--CTA-CA-TTAT-A-TC-ACGA--A--T-ATACG--GT-G-AAGTAA-GAAG-CAC-A-AGC-TT---------TCAGGA--G-CTA-CAATG-AG-G-C-TA-CCA-T-T-GAAAATC-TC--T-CT-AG-TG---GA-AC-A-T-AAAA-AT-C-AATTAAC-C--AATG-AA-AT-----CCGC----T-C-AT-T--TGGG-TA-A-ACT--ATAGTA-TTGCTTACC
gi|73762                      :    CTC--GAGTA-C----AACAG--GTAA-G--CGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA-----------TAT-A-TAGTTA-T---TT-CA---CA--A-A-TAA-TGCAA-G--AG--TA--TG-TTTCA---A-AACA-AC-AA-GGA-
gi|73763                      :     TC--GAGTA-CTTGTAACAG--GTAT-G--TGCCA--AT---TTTCGAC-AGCC-AGGA--TTTGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-
gi|73764                      :                                                     C-ACCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---TG--T-A-TTA-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A----A-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---AAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAT-G-TT-ACGA--A--T-A--CACCGT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TTGGNNNNNNNNNNNNN-NN-NNN-NNNNN-NN-N-N-NN-NNN-N-N-NNN--NN-NN--N-NN-NN-NN---NN-NN-N-N-NNNN-NN-N-NNNNNNN-N--NNNN-NA-ATGAAATCGGG----T-C-AT-T--TGGG-AA-A-ACC--AAAGCA-CCGCTTACC
gi|73765                      :                                                                    CGG-AC-CGT-T-T--TTAGT---TT-CA---CG--C-A-TAA-TGCAA-G--AG--TT--AA-TT-CA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--T--T--AG-G----AATTGGGGA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA--------------------------------------AGTAA-GAAG-CGC-GGAGC-GT---------CG-AGA--G-CAA-CAAT--AT-G-C-AA-CAA-T-G-ACAA-TT-TC--C-GT-AG-T----TA-AC-A-T-AAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----C-C-AT-T--TG
gi|73766                      :                                                                                   GTTA-TAGTTT-CA---CG--T-A-TAA-TGCAA-G--AG--TT--CAATTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AT-A---TATT----GACC-G-TCAA-CAA-T-CTA--CTA-CATCTAC-G----------------------GT-A-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC--T---------CGGAGA-GC-CAA-CAATG-AC-G-C-AA-CAA-T-G-AC---TT-TC--C-GTAAG-TT---AA-AC-A-T-AAAA-G--C-AATTG-C-C--AATG-AA-AT-----CGGC----C-C-AT-T--TG
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Reference ( family-662 )      :                       TTGCTCGAGTA-C----AACAG--GTAA-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--TN-T-AA-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-AC-GA--A---CA--CGGT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------CGNGG-A-CG-CAA-CAA-TNAC-G-C-AA-CAA-T-G-GCA--T-NTC--T-GC-AG-T-G---CA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT--T--TG-GGAA-A-ACC--AAAGTA-CCCCTTACC
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gi|73751                      :                       TTGCCCAAGTA-C----AACAG--GTAT-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--TC-T-AA-TGTGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-TA-TTAC-G-TT-AC-AA--A---CA--CAGT-G-AAGTAA-GAAG-TGC-G-AGC-TT---------CGTTG-A-CG-CAA-CAA-TTAC-G-C-AA-CAA-T-G-GCA--T-ATC--T-AC-AG-T-G---CT-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTAAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT--T--TG-GGAA-A-ACC--AAAGTA-CCCCTTACC
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gi|73758                      : ttgctccaaagtcacgtacatcTTGCTCAAGTA-C----AACAG---TAA-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGGTGC-TGT-A-TCGTT--T---TT-CA---CG--TC-T--A-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTC----A-AACA-A--AA-CGA-C-GC-C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-
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Reference ( family-662 )      :                       TTGCTCGAGTA-C----AACAG--GTAA-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-AT-AA-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-AC-GA--A---CA--CGGT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------CGNGG-A-CG-CAA-CAA-TNAC-G-C-AA-CAA-T-G-GCA--T-NTC--T-GC-AG-T-G---CA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT--T--TG-GGAA-A-ACC--AAAGTA-CCCCTTACC
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gi|73756                      :                       TTGCTC-AGTA-A----GACAG--GTT--GCGTCC--ATGTTTTTTGAA-CGCC-AGGA--ATCGG-GCATCT-A-TCGTTG-T---TTGCA---CG--T-CT-AA-TGCGA-G--AG--TTTTCA-TTTCA---A-AACA-AC-AAACGA-C-GGGC--T--AG-AA--CAATATT-GA-C-G-TT-A--AA-T-CTA--C---CG-CTAC-GGTT-AC-GG--A----A--CGAC----AGTAA-GTAG-CGC-G-AGG-TT---------CTTGG-A-CG--GA-CAA-TTAC-G-C-AA-CAAGT-G-GCA--T-CTT--T-GC-AG-T-GATACA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGACGC--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-ATTGT--TG-GT---A-ACC--AAAGTA--CCTTTACC
gi|73757                      :                                                     CGCCACCAT---TTTTGACCAGCCCAGGA--TTCGG-GC-TGT-AATCGTTA-T---TT-CAAAACG--T-CT-A--TGCAA-AGAAGCCTT--CACTTTCA---AGAAC---C-AA-CGA-C-G--CG-T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-AACAA-G-TAA--CTA-CATCTAC-G-TT-A--GG--A---CA--CCAT-GTAAGTA--GAAG--GC-G-AGC-TTT--------CGTGG-A-CG-CAA-CAA-TTAC-G-CAAA-CCA-T-G-G-A--TATTC--T-GC-AG-T-G--------------------C-AATTGAC-CCAAATG-GA-AT-----CGCCTCCTT-C-AT--TCCTGTGAAA-A-ACC--AAAATA-CCCC-TACC
gi|73758                      : ttgctccaaagtcacgtacatcTTGCTCAAGTA-C----AACAG---TAA-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGGTGC-TGT-A-TCGTT--T---TT-CA---CG--T-CT--A-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTC----A-AACA-A--AA-CGA-C-GC-C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-
gi|73759                      :                          CTCGAGTA-C----AACAG--GTAA-GTGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCAG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-AT-AA-TGCGA-G------TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-TG-------T--T--AG-A---CTAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-AC-GA--ATA-CA--CGGT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------TGAGG-A-TG-TAA-CAA-TGCC-G-C--T-CAT-TCA-AAA--T-TTC--T-GT-AG-T-G---CA-AT-A-TAAAA-CT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CCGC----T-C-AT--T--TG-GGAA-A-ACT--AAAGTA-CTGCTTACC
gi|73760                      :                          CTCGAATA-C----AACAG--GTAA-ACGCCA--AT---TTTTGAC-GGCC-AGGA--TTCGG-GT-TGT-A-CCGTTA-T---TT-CA---CG--T-AT-AA-TACGC-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA----------------C--T--A---------T----GA-T-G-TC-G-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-AC-GA--ATA-CA--CGGT-G-AAGTAA-TAAG-CGC-G-AGC-TT---------CGAAA-A-CG-CAA-CAA-TCAC-G-C-TA-CAT-TCG-AAA--T-ATC--T-CT-AG-T-C---GA-AC-A-TAAAA-GT-C-AACTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AA--T--TG-GGAA-A-ACC--AAAGTA-CCGCTTGCC
gi|73761                      :                          CTCATGTT-C----AACAG--GTAA-GCACCA--AT---CACAGAC-GGCC-AGGA--TTTGG-GC-TGTTA-TCTTTA-T---CT-CA---CG--T-AT-AA-TGTGA------------C--TTTCA---A-AACA-AC-AA-CG-----------------------------------TC-A-CAG-T-CTA--CTA-CA-TTAT-A-TC-AC-GA--A---TATACGGT-G-AAGTAA-GAAG-CAC-A-AGC-TT---------TCAGG-A--G-CTA-CAA-TGAG-G-C-TA-CCA-T-T-GAAAAT-CTC--T-CT-AG-T-G---GA-AC-A-TAAAA-AT-C-AATTAAC-C--AATG-AA-AT-----CCGC----T-C-AT--T--TG-GGTA-A-ACT--ATAGTA-TTGCTTACC
gi|73762                      :                          CTCGAGTA-C----AACAG--GTAA-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA-----------TAT-A-TAGTTA-T---TT-CA---CA--A-AT-AA-TGCAA-G--AG--TA--TG-TTTCA---A-AACA-AC-AA-GGA-
gi|73763                      :                           TCGAGTA-CTTGTAACAG--GTAT-GTGCCA--AT---TTTCGAC-AGCC-AGGA--TTTGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-
gi|73764                      :                                                                       C-ACCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---TG--T-AT-TA-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A----A-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---AAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAT-G-TT-AC-GAATA---CA--CCGT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TTGGNNNNNNNNNNNN-N-NN-NNN-NNN-NNNN-N-N-NN-NNN-N-N-NNN--N-NNN--N-NN-NN-N-N---NN-NN-N-NNNNN-NN-N-NNNNNNN-N--NNNN-NA-ATGAAATCGGG----T-C-AT--T--TG-GGAA-A-ACC--AAAGCA-CCGCTTACC
gi|73765                      :                                                                                      CGG-AC-CGT-T-T--TTAGT---TT-CA---CG--C-AT-AA-TGCAA-G--AG--TT--AA-TT-CA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--T--T--AG-G----AATTGGGGA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-------------------------------------AGTAA-GAAG-CGC-GGAGC-GT---------CGAGA----G-CAA-CAA-T-AT-G-C-AA-CAA-T-G-ACAA-T-TTC--C-GT-AG-T-----TA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----C-C-AT--T--TG-
gi|73766                      :                                                                                                     GTTA-TAGTTT-CA---CG--T-AT-AA-TGCAA-G--AG--TT--CAATTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AT-A---TATT----GACC-G-TCAA-CAA-T-CTA--CTA-CATCT--------------------A--CGGT-A-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC--T---------CGGAG-A-GC-CAA-CAA-TGAC-G-C-AA-CAA-T-G-AC---T-TTC--C-GTAAG-T-T---AA-AC-A-TAAAA-G--C-AATTG-C-C--AATG-AA-AT-----CGGC----C-C-AT--T--TG-G
gi|73767                      :                                                                                                         -T---TT-CA---CG--T-AT-AA-TGCGAAG--AG--TT--CA-TT-CA---A-AACA-ACTAA-CGAAC-GG-C--T--AG-ATGACAAT-----A-CAG-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-C-------------C---------CA--CAGT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------CAAGG-A--G-CAA-CAA-TGAC-G-C-AA-CAA-T-G-ACA--T-TTC--C-GT-AG-T-G---CA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGA----C-C-AT--T--TG-G
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Reference ( family-662 )      :                       TTGCTCGAGTA-C----AACAG--GTAA-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-AT-AA-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-AC-GA--A---CA--CGGT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------CGNGG-A-CG-CAA-CAA-TNAC-G-C-AA-CAA-T-G-GCA--T-NTC--T-GC-AG-T-G---CA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT--T--TG-GGAA-A-ACC--AAAGTA-CCCCTTACC
gi|73749                      :                       TTGCTCAAGTA-C----AACAG--GTAA-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-CT-AA-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-AC-GG--A---CA--CAGT-A-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------CGTGG-A-CG-CAA-CAA-TTAC-G-C-AA-CAA-T-G-GCA--T-ATC--T-GC-AG-T-G---CA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT--T--TG-TGAA-A-ACC--AAAATA-CCCCTTACC
gi|73750                      :                       TTGCTCAAGTA-C----AACAG--GTAA-GGGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-CT-AA-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-AC-GG--A---CA--CAGT-A-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------CGTGG-A-CG-CAA-CAA-TTAC-G-C-AA-CAA-T-G-GCA--T-ATC--T-GC-AG-T-G---CA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT--T--TG-TGAA-A-ACC--AAAATA-CCCCTTACC
gi|73751                      :                       TTGCCCAAGTA-C----AACAG--GTAT-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-CT-AA-TGTGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-TA-TTAC-G-TT-AC-AA--A---CA--CAGT-G-AAGTAA-GAAG-TGC-G-AGC-TT---------CGTTG-A-CG-CAA-CAA-TTAC-G-C-AA-CAA-T-G-GCA--T-ATC--T-AC-AG-T-G---CT-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTAAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AT--T--TG-GGAA-A-ACC--AAAGTA-CCCCTTACC
gi|73752                      :                       TCGCTTAAGTA-C----AACAG--GTAA-GCGCCA--AA---TTTTAAC-GGCC-AGGA--CTCGT-GC-TGT-A-TCGTTG-T---TT-CA---CG--T-AT-AA-------G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--CTAAG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAAAT-CTA--CTA-CA-CTAT-G-TT-AC-TA--ATTACA--TTGT-G-AAGTAA-GAAA-CGC-G-AGC-TT---------TGAGG-A-CG-CAA-CAA-TGAC-A-C-AA-CAA-T-G-GCA--T-CTA--T-GC-AG-T-A---CA-AC-A-TAAAA-GT-A-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----TGAG----T-C-AT--T--TA-GGAA-A-ACC--AAAGTA-CCGCTTACC
gi|73753                      :                       TTGCTCAAGTA-C----AACAG--GTAA-GCGCCA--AT---TTTGAGC-AGCC-AGGGATTTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-----TT-CA---CG--T-CT-AATTGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AAC--AC-AATCGA-C-G--C--T---G-A---CAAT----GA-C-G--C-A-CAA-TCCTAATCTA-CA-CTAC-G-TT-ACGGA--A---CA--CAGT-A-AAGTAA-GAAG-CGCGG-AGC-TT---------AGT-G-A-CGCCAA-CAATTAAC-G-C-AATCAA-T-G-GCA--T-ATCTTT-TT-A--T-G---CACAC-A-TAAAA-GTCC-AATTGAC-C--AATGAAA-AT-----CGGC----T-CAAT--T--TG-TGAAGA-ACCAAAAAATATCCCCTTACC
gi|73754                      :                       TTTCTTGAGTA-C----AACAG--GTAA-GCGCCA--AT---TTT-GAT-AGCC-AGAA--TTCGG-GC-TGT-A-TTGTTA-T---TT-CA---TG--T-AT-AA-TGCAA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-GA-CGA-C-G--C--T--AG-A---CTGT----GA-C-A-TC-A-CAA-T-CTA--CAA-CA-CTAC-G-TT-AC-GAGTA---CA--CGTT-G-AAGTAT-GAAG-CGT-G-AGC-TT---------CGAGG-A-CA-CAA-CAA-TCAC-G-C-TA-CAT-TCG-AAA--T-CTC--T-CT-AG-A-G---CT-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AT-AT-----CAGC----T-A-AT--T--TA-GGAA-A-ACC--AAAGTA-
gi|73755                      :                       TCGCTCAAGTAGC----AACAGCCGTAAAGCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCA-GGGA--TTCGG-GCATGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CGGTT-CT-AA-TGTGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--CATT--AG-A---CAAT----GA-C-GTTC-A-CAA-A-TTA--CTATCA-CTACAG-TTAAC-GG--AAC-CA--AAGTAA-AAGTAAGGAAG-CGC---AGC-TTC--------CGTGG-ACCG-CAACCAA-TTAC-G-C-AA-CAA-T-G---A--T-ATC--T-GC-AG-T-G----A-AC-A-TAAAAGGT-C-AATTGAC-C--AATG-AAGAT-----C-GC----T-C-AT--T--TG-TGAA-ACACC--AAAATT-CCC
gi|73756                      :                       TTGCTC-AGTA-A----GACAG--GTT--GCGTCC--ATGTTTTTTGAA-CGCC-AGGA--ATCGG-GCATCT-A-TCGTTG-T---TTGCA---CG--T-CT-AA-TGCGA-G--AG--TTTTCA-TTTCA---A-AACA-AC-AAACGA-C-GGGC--T--AG-AA--CAATATT-GA-C-G-TT-A--AA-T-CTA--C---CG-CTAC-GGTT-AC-GG--A----A--CGAC----AGTAA-GTAG-CGC-G-AGG-TT---------CTTGG-A-CG--GA-CAA-TTAC-G-C-AA-CAAGT-G-GCA--T-CTT--T-GC-AG-T-GATACA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGACGC--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-ATTGT--TG-GT---A-ACC--AAAGTA--CCTTTACC
gi|73757                      :                                                     CGCCACCAT---TTTTGACCAGCCCAGGA--TTCGG-GC-TGT-AATCGTTA-T---TT-CAAAACG--T-CT-A--TGCAA-AGAAGCCTT--CACTTTCA---AGAAC---C-AA-CGA-C-G--CG-T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-AACAA-G-TAA--CTA-CATCTAC-G-TT-A--GG--A---CA--CCAT-GTAAGTA--GAAG--GC-G-AGC-TTT--------CGTGG-A-CG-CAA-CAA-TTAC-G-CAAA-CCA-T-G-G-A--TATTC--T-GC-AG-T-G--------------------C-AATTGAC-CCAAATG-GA-AT-----CGCCTCCTT-C-AT--TCCTGTGAAA-A-ACC--AAAATA-CCCC-TACC
gi|73758                      : ttgctccaaagtcacgtacatcTTGCTCAAGTA-C----AACAG---TAA-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCGGTGC-TGT-A-TCGTT--T---TT-CA---CG--T-CT--A-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTC----A-AACA-A--AA-CGA-C-GC-C--T--AG-A---CAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-
gi|73759                      :                          CTCGAGTA-C----AACAG--GTAA-GTGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA--TTCAG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---CG--T-AT-AA-TGCGA-G------TT--CA-TTTCA---A-AACA-AC-AA-TG-------T--T--AG-A---CTAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-AC-GA--ATA-CA--CGGT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------TGAGG-A-TG-TAA-CAA-TGCC-G-C--T-CAT-TCA-AAA--T-TTC--T-GT-AG-T-G---CA-AT-A-TAAAA-CT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CCGC----T-C-AT--T--TG-GGAA-A-ACT--AAAGTA-CTGCTTACC
gi|73760                      :                          CTCGAATA-C----AACAG--GTAA-ACGCCA--AT---TTTTGAC-GGCC-AGGA--TTCGG-GT-TGT-A-CCGTTA-T---TT-CA---CG--T-AT-AA-TACGC-G--AG--TT--CA-TTTCA---A-AACA----------------C--T--A---------T----GA-T-G-TC-G-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAC-G-TT-AC-GA--ATA-CA--CGGT-G-AAGTAA-TAAG-CGC-G-AGC-TT---------CGAAA-A-CG-CAA-CAA-TCAC-G-C-TA-CAT-TCG-AAA--T-ATC--T-CT-AG-T-C---GA-AC-A-TAAAA-GT-C-AACTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----T-C-AA--T--TG-GGAA-A-ACC--AAAGTA-CCGCTTGCC
gi|73761                      :                          CTCATGTT-C----AACAG--GTAA-GCACCA--AT---CACAGAC-GGCC-AGGA--TTTGG-GC-TGTTA-TCTTTA-T---CT-CA---CG--T-AT-AA-TGTGA------------C--TTTCA---A-AACA-AC-AA-CG-----------------------------------TC-A-CAG-T-CTA--CTA-CA-TTAT-A-TC-AC-GA--A---TATACGGT-G-AAGTAA-GAAG-CAC-A-AGC-TT---------TCAGG-A--G-CTA-CAA-TGAG-G-C-TA-CCA-T-T-GAAAAT-CTC--T-CT-AG-T-G---GA-AC-A-TAAAA-AT-C-AATTAAC-C--AATG-AA-AT-----CCGC----T-C-AT--T--TG-GGTA-A-ACT--ATAGTA-TTGCTTACC
gi|73762                      :                          CTCGAGTA-C----AACAG--GTAA-GCGCCA--AT---TTTTGAC-AGCC-AGGA-----------TAT-A-TAGTTA-T---TT-CA---CA--A-AT-AA-TGCAA-G--AG--TA--TG-TTTCA---A-AACA-AC-AA-GGA-
gi|73763                      :                           TCGAGTA-CTTGTAACAG--GTAT-GTGCCA--AT---TTTCGAC-AGCC-AGGA--TTTGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-
gi|73764                      :                                                                       C-ACCC-AGGA--TTCGG-GC-TGT-A-TCGTTA-T---TT-CA---TG--T-AT-TA-TGCGA-G--AG--TT--CA-TTTCA---A----A-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AG-A---AAAT----GA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-CA-CTAT-G-TT-AC-GAATA---CA--CCGT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TTGGNNNNNNNNNNNN-N-NN-NNN-NNN-NNNN-N-N-NN-NNN-N-N-NNN--N-NNN--N-NN-NN-N-N---NN-NN-N-NNNNN-NN-N-NNNNNNN-N--NNNN-NA-ATGAAATCGGG----T-C-AT--T--TG-GGAA-A-ACC--AAAGCA-CCGCTTACC
gi|73765                      :                                                                                      CGG-AC-CGT-T-T--TTAGT---TT-CA---CG--C-AT-AA-TGCAA-G--AG--TT--AA-TT-CA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--T--T--AG-G----AATTGGGGA-C-G-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-------------------------------------AGTAA-GAAG-CGC-GGAGC-GT---------CGAGA----G-CAA-CAA-T-AT-G-C-AA-CAA-T-G-ACAA-T-TTC--C-GT-AG-T-----TA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGC----C-C-AT--T--TG-
gi|73766                      :                                                                                                     GTTA-TAGTTT-CA---CG--T-AT-AA-TGCAA-G--AG--TT--CAATTTCA---A-AACA-AC-AA-CGA-C-G--C--T--AT-A---TATT----GACC-G-TCAA-CAA-T-CTA--CTA-CATCT--------------------A--CGGT-A-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC--T---------CGGAG-A-GC-CAA-CAA-TGAC-G-C-AA-CAA-T-G-AC---T-TTC--C-GTAAG-T-T---AA-AC-A-TAAAA-G--C-AATTG-C-C--AATG-AA-AT-----CGGC----C-C-AT--T--TG-G
gi|73767                      :                                                                                                         -T---TT-CA---CG--T-AT-AA-TGCGAAG--AG--TT--CA-TT-CA---A-AACA-ACTAA-CGAAC-GG-C--T--AG-ATGACAAT-----A-CAG-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-C-------------C---------CA--CAGT-G-AAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------CAAGG-A--G-CAA-CAA-TGAC-G-C-AA-CAA-T-G-ACA--T-TTC--C-GT-AG-T-G---CA-AC-A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CGGA----C-C-AT--T--TG-G
gi|73768                      :                                                                                                         -T---TT-CA---CG--T-ATTAA-TGCGAAG--AG--TTT-CA-TTT-A---A-AACACACTAA-CGA-C-GGGC--T--AG-ATA-CAAT----GA-CAG-TC-A-CAA-T-CTA--CTA-C-------------C---------CA--CAGT-A-TAGTAA-GAAG-CGC-G-AGC-TT---------CAAGG-A--G-CAA-CAA-TGACGG-C-AA-CAA-T-GAACT--T-ATC--CGGT-AGTT-G---CA-AC-ATTAAAA-GT-CTAATTGGC-A--CATG-AA-AT-----CGGA----TCC-AT--T--TG-G
gi|73769                      :                                                                                                         -T---TT-CA---CG--TTAT-AAATGC-A-G--AGC-TT--CA-TTTCAAATA-AACA-AC-CA-CGA-CGG--C--T--AGAA---TATT----GA---G-TC-A-CAA-T-C-A--CTA-CA-T--C-A-TT-A-----------A--CCGT-G-AAGTAA-GCAGCCGC-G-AGCTTT---------CGAGGAA-GG-CAA-C-A-CGAT-G-C-AA------------------------------------A-ACAA-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CG------C-C-AT--T--TG-G
gi|73770                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -CAA-TTAC-GGC-AA--AA-T-G---A--T-ATC--T-GC-AG-TTG---CA-A--A-TAAAAAGC-C-AATTAAC-C--A-TG-AA-AT-----CGGC----T-C-ATA-T--TG-GAAA-A-ACC---AAGTA-ACCTCTACC
gi|73771                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -CAA-TGAC-G-C-AA-TAA-T-G-ACA--C-TTC--C-GT-AG-T-G---CA-A--A-TAAAA-GT-C-AATTGAC-C--AATG-AA-AT-----CTGT----C-C-AT--T--TG-G
gi|73772                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAA-GT-C-AGTTGAC-C--AATG-AA-AT-----CTGT----C-C-AT--T--TA-GGAA-A-ACC--AAAGTA-CCACTTACC


blockSeqs                     :                             A    G TTGT     CC    A      CC  GTT       C    C    AT     T  A   T A      G AGT  G  AAA  GT TA T  T     A GA  CC  TT  C     AAT G    C  T  T   A G GG AT TA  A TGA    TGGG  C A T  A A   A C   AT   T  T    A G  A  TAATTA     TA A  AA       G    C   G G   T  GGNNNNNNN  T  A CC C   C   T T  G G A  T   G C GAAAA  AT  TT G  A  T T ATAC C  A T     G  C T       G CA    A  G  GAAAT    TCCT C A  TG CC  T    G C   AA      T
blockSeqs                     :                             A    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  A   . .      . .    .  .    .  C  .  A     A .   C   T   A     .   .    .  T  A   . . GG G  .   . TA     ATT   . A .  . .   . .   .    .  T    . .  .  GAGTA      .  A  GT       .    .   . .   .  C          T  . C  .   .   . T  . . .  .   . C ACAA   A   .  .  .  . . C    .  . .     A  . .       . .     .  .  .        .    . .  A  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             A    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  C  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . C  .  .   . A      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  GGAAC      .  T  A        .    .   . .   .  T          A  . C  .   .   . G  . . .  .   . C AACT   A   .  .  .  . . C    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             A    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . G  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  GAATA      .  A  G        .    .   . .   .  .          T  . C  .   .   . A  . . .  .   . . GCA    C   .  .  .  . . C    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             G    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  C  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  GAATA      .  G  G        .    .   . .   .  .          A  . C  .   .   . C  . . .  .   . . GCA    A   .  .  .  . . C    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             A    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  GAATA      .  A  A        .    .   . .   .  .          T  . C  .   .   . T  . . .  .   . . GCA    C   .  .  .  . . C    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             A    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  C  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  GGAA       .  G  G        .    .   . .   .  .          T  . C  .   .   . T  . . .  .   . . GCA    A   .  .  .  . . C    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             G    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  C  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  GGA        .  C  G        .    .   . .   .  .          T  . C  .   .   . T  . . .  .   . . AAA    C   .  .  .  . . G    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             G    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  C  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  AAA        .  G  G        .    .   . .   .  .          A  . T  .   .   . G  . . .  .   . . GCA    T   .  .  .  . . G    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             A    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  C  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  GGA        .  G  G        .    .   . .   .  .          A  . C  .   .   . C  . . .  .   . . AAA    A   .  .  .  . . N    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             G    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  GGA        .  G  G        .    .   . .   .  .          A  . N  .   .   . G  . . .  .   . . AAA    C   .  .  .  . . T    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             G    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  GAA        .  C  A        .    .   . .   .  .          N  . G  .   .   . N  . . .  .   . . NNN    N   .  .  .  . . A    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                             .    . .        .     .      .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  .          .  G  G        .    .   . .   .  .          A  . G  .   .   . G  . . .  .   . . ACA    T   .  .  .  . . C    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                                                          .   .         .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  .          .  A  A        .    .   . .   .  .          G  . .  .   .   . G  . . .  .   . . ACA    T   .  .  .  . . C    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .    . .   .       .
blockSeqs                     :                                                                        .    .    .      .  .   . .      . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  .          .  A  G        .    .   . .   .  .          A  . .  .   .   . G  . . .  .   . . GA     T   .  .  .  . . C    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .                   
blockSeqs                     :                                                                                         .  .   . .      . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  .          .  C  .        .    .   . .   .  .          A  . .  .   .   . G  . . .  .   . . AC     A   .  .  .  . . C    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .                   
blockSeqs                     :                                                                                                         . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   . .   .    .  .    . .  .  .          .  .  .        .    .   . .   .  .          A  . .  .   .   . T  . . .  .   . . A      A   .  .  .  . . .    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .                   
blockSeqs                     :                                                                                                         . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   . . .  .  .   . .      .     . . .  . .   .                                                                                             .   . G  . . .  .   . . A      T   .  .  .  . . .    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .                   
blockSeqs                     :                                                                                                         . .    .  .    .  A  .  .     . .   .   .   .     .   .    .  .  .   .                                                                                                                                       .   . .  . . .  .   . . .      .   .  .  .  . . .    .  . .     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .                   
blockSeqs                     :                                                                                                         . .    .                                                                                                                                                                                                                                                                     .  . .       . .     .  .  .        .    . .  .  .   .                   


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                   GAA******
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