lowQualScore : 1 3333333333333
lowQualScore : 33 777 2 22 2 2 1 1 1 6 44 1 44 444 22 3 22 1 1 222 44444 5555555 222 444 1 1 44 22 222 3333333333333 3333 1 777 1 222 1 55 1 1 22 55 1 66 1 444444 44 3 44 1 1 1 1 44 1 1 1 55 3 666666 55 3 444 22 1 44 22
lowQualScore : .. ... . .. . . . . . . .. . .. ... .. . .. . . ... ..... ....... ... ... . . .. .. ... ............. .... . ... . ... . .. . . .. .. . .. . ...... .. . .. . . . . .. . . . .. . ...... .. . ... .. . .. ..
lowQualScore : 33 444 1 99 1 1 9 8 7 7 00 7 00 888 33 3 33 7 7 999 22222 4444444 999 666 7 7 00 33 999 0000000000000 5555 7 555 7 999 7 66 7 7 33 88 7 22 7 888888 77 3 00 7 7 7 7 00 7 7 7 66 3 555555 66 3 666 33 7 00 44
consensus : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTAGAT-CTAT--GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-AA--TG--T---TGT-----T-------T----G-T---T-T---T-ATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--T-A-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
Reference ( gi|101010 ) : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTAGAT-C-AT--GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-AA--TG--T---TGT-----C-------T----G-T---T-T---T-ATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--T-A-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101011 : AAAAAA-C---T-T--AA-TC-TT-GTGA-TTAGAG-A-AT--GC-GTAA--GG--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----AT-------T---A---A-A-AA--TG--T---TGT-----T-------T----G-T---T-T---T-ATTTT--A-GC-TA--TA-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--T-A-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101012 : AAAAAC-C-----C--AA-TC-TT-GTGA-TTAGAT-C-AT--GC-GTAA--GT--AA--T-C---G-AAT-C---T-----AT-------T---T---A-A-AATTTG--T---TGT-----T-------T----G-----T-T---T-ATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAATATT-A--T---TT-G-A--T-TC-A-C----GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101024 : aAAAAAC-T---C-A--AA-TC-TT-GTGA-TTAGAT-CTAT--GC-GTTAT-GT--AA--T-CGCGG-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-AA--TG--T---TGT-----T-------T----G-T---T-T---T-ATTTT--A-GC-TC--TCAAA-AA--T-G------AAAA-ATTAA--T-A-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TTA-AT-T---G--AA-TA--TTAAAGAAAAA
gi|101015 : AAAAAC-CCCAT-C--AA-TC-TT-GTGA-TTAAGT-CTAT--GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----AC-------T---T---A-A-AA--TG--T---TGT-----T-------T----G-T---T-T---T-ATTTTA-A-GC-TC--TCAAA-AA--T-G------AAAA---T-A--T-A-TT-G-ATCT-TC-ACC--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA---C--AGAAAAA
gi|101014 : aAACAAC-C---C-CCAAA-TC-TT-GTGA-TCAGAT-C-AT--GC-GTAA--GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-AA--TG--T---TGG-----CG------T----G-TTGGT-T---T-AATTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G-------AAA-ATT-A--T-A-TT-G-A--T-TCAA-C--TGGAA------CT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101013 : aAAAAAA-C---T-C--AA-TA-TT-GTGA-TTAGAT-C-AT--TC-GTAT--GG--AA--T-CC--G-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-AA--TG--T---T---------------T----G-T---T-T---T-ATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-AAA-AATT-A-TT-G-A--T-TC-A-A--T-AAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAA
gi|101018 : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-G-GA-TTAGAT-T-ATATGC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AACGC---T-----AT-------T---T---A-A-AA--TG--T---TGT-----TGTT----T----GAT---T-T---T-ATTTTTAA-GC-TC--TC-AA-AA--T-T------GAAA-ATT-A--T-A-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TTTAGT-T---C--AA-TAT-TC--AGCAAAA
gi|101016 : AAAAAA-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA-AT-CTAT--GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-AA--TG--T---TGT-----T-------T----G-TTTGT-T---T-ATTTT--A-GC-TC--C---A-AA--T-G------TAAA-TAT-A--T-A-TT-G-A--T-TC-A-TTAT-GA--------T--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101019 : AAAAAT-T---T-C--AA-TT-TT-GTTA-TTAGAG-C-AT--GT-GTAA--GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-TA--TG--T---TAT-----T-------TACTTG-T---T-T---T-ATTTC--A-GC-TC--T--AA-AA--TCA------AAAA-ATA-A--T-C-TT-G-A--T-TC-A-C--T-AAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--GGAAAAA
gi|101017 : AAAAA------T-C--CA-TC-TT-GTGA-TTAGAT-CTAT--GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-A---C---T-----AT-------T---T---T-A-AA--TG--T---TGT-----TGTT----T----G-T---T-T---TTATTTT--A-GC-TC--TC-AA-A---T-G------TAAA--TT-A--TTA-TT-G-A--T-TC-A-T--T-GTA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAA
gi|101026 : aaAAAACC-C---T-C--AA-TCCTT-GTGA-TTAGAT-C-GT---T-GTAA--GTCCAA--T-CG--G-AAC-C---T-----AT-------T---TT--A-A-AA--TG--T---TGT-----TGTTT---C----G-T---T-T---T-ATTTT--C-GC-TCCGTC-AA-AAA-T-G------AAAA--TT-G--T-A-AT-G-A--T-TC-A-C--T-GAATTTTTTTT--ATCT---G--AA-TGATTC--AGAAAAA
gi|101021 : aAAAAACTC---T-A--AA-TC-TT-GTGA-TTAAAG-A-AT--GT-GTAA--GA--AA--T-CG--G-ATC-C---T-----AT-------TAAAT---A-A-AC--TA--T---TGT-----T-------T----G-T---T-T---T-ACTTG--A-GC-TT--TA-AA-AA--T--------AAAA-ATT-GC-T-C-TT-G-T--A-TC-A-C--T-GAA------TT--CT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101022 : aAAAAAC-T---TTC--AA-TC-TT-GTGA-TTAGGT-CTAT--GC----A--GT--AA--T-C---G-AAC-T---TTCAAAATATCGACCT---T---AGA-AA--TG--T---TTT-----G-------T------T---T-T---T-ATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-T------AAAATAAT-A--T-A-TT-G-A--T-TC-A----T-GAA------TT--AT-T---G--AAGTA--TC--AGAAAAA
gi|101023 : aAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTAGAT-CTAT--GC-GTAG--GT--AA--T-CG--G-AAC-A---T-----AT-------T---T---A-A-AA--GT--T---TGT-----T-------T----G-T---TCT---T-ATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AC--T-G------AAAA-ATT-A--T-A-TT-G-A--T-TC-A-C--TAAAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101020 : AAAAC-CAACT-C--AA-TC-TT-GTGA-TTTGAT-C-AT--GCCGTAAAAG---AA--T-CG--A-AAC-T---T-----AT-------T---TTTAA-A-AAC-TG--T---TGTGG---T-------T----G-T---T-T---T-ATTTT--A-TCCTC--TC-AA-AACCT-G------AAAA-ATT-T--T-A-TT-G----T-TC-A-C--T-GAA------TT--AC-T---G--AA-TA--TC--AGAAAA
gi|101027 : AAAA-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTAGAT-C-AT--GC-GTAA--GG--AA--T-CG--G-AA---------------------------------AA--TG--T---TGT------------------------T-T---T-ATTTT--A-GC-TC--TA-AA-AA--T-G------TAAA-ATT-A--T-A-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101028 : AAAA-C---T-C--A--TC-TT-G-GA-TTAGAA-C-TG--GC-GTAA--GA--AA--T-CC--G-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-TA--TG--G---TAT-------------T----G-TG--T-T---G-GTTTT--A-GC-TG--T--AA-AATTT-A------AAAA-A-----------T-G-A--T-TC-A-C--T-G---------T--ATAT---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101029 : -C---T-C--AAATC-TT-GTTA-TTAGAT-CTAT--GC-GTAA--GT--AAATTGTG--G-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-AA---G--T---TGT-----TGGGTAGAT----G-T---T-T---T-ATTTT--A-GC-TC--TC-AAGAA--T-G-------AAA-ATT-A--T-A-TT-GTA--T-TC-A-CA-T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101030 : -C---T-C--AA-TC-GTAGTGAATTATATAT-ATA-GC-GTC---GT--AA--TGCG--GGAAC-CATCT-----AT-------T---A---G-ATAA--TG--TGTTTGT-----T-------T----G-T---T-T---T-ATTTT--A-GC-TT--TC-AA-AA--T-G------AAAA---T-A--T-ATTT-G-A--TATC-A-C--T-GCA------TTC-AT-T---GAAAA-TA--TG--AAAAAAA
gi|101031 : T-GTGA-TTAGAA-A-AT--GC-GTAA--GG--AA--T-TG--G-AAC-C---T-----AT-------T---A---A-A-CA--TG--A---TGT-------------T----G-T---T-T--------------GT-T------AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--T-A-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--ATAAAAA
gi|101032 : -GTGA-TTAGAT-CTAT--GC-GTA----T--CA--T-CG--G-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-A---TG--T---TGTTGTGTC-------T----G-T---T-TATTT-ATTTT--AAGC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-TTT-A--T-G----G-A--A-TT-A-C--T-GAA------TT--AT-G---C--AA-T---TC--CGAAAAA
gi|101033 : TGA-TTA--T-CTAT--G--GTAA--GT--AA--T-GG--A-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-AA--TG--T---T---------------T----G-T---T-T---T-ATTTT--A-GT-TC------A-AA--T-G------AAAA-ATT-A--T-A-TTCG-AG-T-TC-A-CA-C-GAAT-----TT--AT-TG--G--AA-TA--TA--ATAAAAA
gi|101034 : AGAT-CTAT--GC-GT-----T--AA-----------AG-C---T-----AT-------T---T---A-A-AA--TG--T---TGT-----T-------T----G-T---T-T---T-ATTTTA-A-GC-TC--TC-AA-AA--T-GAACAAAAAAA-AAT-A--T-A-TT-G-A--T-TC-A-G--T-GAA------TT--GT-TGCAG--AA-TA--T
gi|101025 : T-C-AT--GC-GTA---GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----AT-------T---T---A-A-AA--TGCGT---TGT-----T-------T----G-T---T-T---T-ATTTT--A-GT-TC--TA-CA-AA--T-G------AAAA-ATTTA--T-G-TT-G-A--T-TA-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
Alignments
lowQualScore : 11 1111111
lowQualScore : 22 777 2 22 2 2 1 1 22 33 1 1 33 444 22 3 22 1 1 222 44444 1 5555555 222 222 1 1 3333 666 22 222 222 3333 55 2222222 3333 4 444 1 222 55 1 1 22 66 1 44 1 6666666 3 3 55 1 1 1 33 1 1 1 55 3 666666 55 3 444 22 1 33 22
lowQualScore : .. ... . .. . . . . .. .. . . .. ... .. . .. . . ... ..... . ....... ... ... . . .... ... .. ... ... .... .. ....... .... . ... . ... .. . . .. .. . .. . ....... . . .. . . . .. . . . .. . ...... .. . ... .. . .. ..
lowQualScore : 66 000 0 88 0 0 8 7 33 88 6 6 88 222 22 2 22 6 6 888 00000 6 2222222 888 888 6 6 4444 666 22 888 888 4444 44 0000000 4444 8 444 6 888 44 6 6 22 88 6 44 6 1111111 2 2 44 6 6 6 88 6 6 6 44 2 222222 44 2 444 22 6 88 33
consensus : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
Reference ( family-655 ) : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101010 : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--C-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101011 : AAAAAA-C---T-T--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GAGA--AT-GC-GTAA--GG--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---A---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TA--TA-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101012 : AAAAAC-C-----C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-GC-GTAA--GT--AA--T-C---G-AAT-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----ATT-TG--T---T---G----T--T-------T----G-----T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAATATT-A--T--TT-G-A--T-TC-A-C----GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101013 : aAAAAAA-C---T-C--AA-TA-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-TC-GTAT--GG--AA--T-CC--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T-------------------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-AAA-AATTA-TT-G-A--T-TC-A-A--T-AAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAA
gi|101014 : AACAAC-C---C-CCAAA-TC-TT-GTGA-TCA--GATC--AT-GC-GTAA--GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---TGGCG----TG-T-------T----G-G---T-T---TAATTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G-------AAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TCAA-C--TGGAA------CT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101015 : aAAAAAC-CCCAT-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--AGTC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-C-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTTA-A-GC-TC--TCAAA-AA--T-G------AAAA---T-A--TA-TT-G-ATCT-TC-ACC--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA---C--AGAAAAA
gi|101016 : aAAAAAA-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA---ATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-TTTGT-T---TATTTT--A-GC-TC--C---A-AA--T-G------TAAA-TAT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-TTAT-GA--------T--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101017 : AAAAA------T-C--CA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-A---C---T-----A-T-------T---T---T-A-A----ATGTTG--T---T---G----T--T-------T----GTT---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC--A-AA--T-G-------TAA-ATT-AT-TA-TT-G-A--T-TC-A-T--T-GTA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAA
gi|101018 : aaAAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-G-GA-TTA--GATTATAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AACGC---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--TGTT----T----GAT---T-T---TATTTTTAA-GC-TC--TC-AA-AA--T-T------GAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TTTAGT-T---C--AA-TAT-TC--AGCAAAA
gi|101019 : AAAAAT-T---T-C--AA-TT-TT-GTTA-TTA--GAGC--AT-GT-GTAA--GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-T----A---TG--T---T---A----T--T-------TACTTG-T---T-T---TATTTC--A-GC-TC--T--AA-AA--TCA------AAAA-ATA-A--TC-TT-G-A--T-TC-A-C--T-AAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--GGAAAAA
gi|101020 : AAAAC-CAACT-C--AA-TC-TT-GTGA-TTT--GATC--AT-GCCGTAAAAG---AA--T-CG--A-AAC-T---T-----A-T-------T---TTTAA-A-A----AC--TG--T---T---G----TGGT-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-TCCTC--TC-AA-AACCT-G------AAAA-ATT-T--TA-TT-G----T-TC-A-C--T-GAA------TT--AC-T---G--AA-TA--TC--AGAAAA
gi|101021 : AAAAACTC---T-A--AA-TC-TT-GTGA-TTAAAGA----AT-GT-GTAA--GA--AA--T-CG--G-ATC-C---T-----A-T-------TAAAT---A-A-A----C---TA--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TACTTG--A-GC-TT--TA-AA-AA--T--------AAAA-ATT-GC-TC-TT-G-T--A-TC-A-C--T-GAA------TT--CT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101022 : aAAAAAC-T---TTC--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GGTC-TAT-GC----A--GT--AA--T-C---G-AAC-T---TTCAAAA-TATCGACCT---T---AGA-A----A---TG--T------------T--T-------T----GTT---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-T------AAAATAAT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A----T-GAA------TT--AT-T---G--AAGTA--TC--AGAAAAA
gi|101023 : aAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAG--GT--AA--T-CG--G-AAC-A---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---GT--T---T---G----T--T-------T----G-T---TCT---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AC--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--TAAAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101024 : AAAAAC-T---C-A--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTTAT-GT--AA--T-CGCGG-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TCAAA-AA--T-G------AAAA-ATTAA--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TTA-AT-T---G--AA-TA--TTAAAGAAAAA
gi|101025 : ATT-CAT-GC-GTA---GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TGCGT---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GT-TC--TA-CA-AA--T-G------AAAA-ATTTA--TG-TT-G-A--T-TA-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101026 : aaaaactcaAAAACC-C---T-C--AA-TCCTT-GTGA-TTA--GATC--GT--T-GTAA--GTCCAA--T-CG--G-AAC-C---T-----ATT-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---GTTGTT--T-------C----G-T---T-T---TATTTT--C-GC-TCCGTCAAA-AA--T-G-------AAA-ATT-G--TA-AT-G-A--T-TC-A-C--T-GAATTTTTTTT--ATCT---G--AA-TGATTC--AGAAAAA
gi|101027 : aAAAA-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-GC-GTAA--GG--AA--T-CG--G-AA----------------------------------A----A---TG--T---T---G----T---------------------T-T---TATTTT--A-GC-TC--TA-AA-AA--T-G------TAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101028 : AAAA-C---T-C--A--TC-TT-G-GA-TTA--GAAC-TG--GC-GTAA--GA--AA--T-CC--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-T----A---TG----------G----TA-T-------T----G-TG--T-T---GGTTTT--A-GC-TG--T--AA-AATTT-A------AAAA-A----------T-G-A--T-TC-A-C--T-G---------T--ATAT---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101029 : -C---T-C--AAATC-TT-GTTA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AAATTGTG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A----G--T---T---G----T--TGGGTAGAT----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AAGAA--T-G-------AAA-ATT-A--TA-TT-GTA--T-TC-A-CA-T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101030 : -C---T-C--AA-TC-GTAGTGAATTA--TATA-TATAGC-GTC---GT--AA--TGCG--GGAAC-CATCT-----A-T-------T---A---G-ATA----A---TG--TGTTT---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TT--TC-AA-AA--T-G------AAAA---T-A--TATTT-G-A--TATC-A-C--T-GCA------TTC-AT-T---GAAAA-TA--TG--AAAAAAA
gi|101031 : T-GTGA-TTA--GAAA--AT-GC-GTAA--GG--AA--T-TG--G-AAC-C---T-----A-T-------T-------A-A-ACATGA---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-------------------------AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--ATAAAAA
gi|101032 : -GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTA----T--CA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A--------TG--T---T---G----T--TGTGTC--T----G-T---T-TATTTATTTT--AAGC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-TTT-A--TG----G-A--A-TT-A-C--T-GAA------TT--AT-G---C--AA-T---TC--CGAAAAA
gi|101033 : TGA-TTA----TC-TAT-G--GTAA--GT--AA--T-GG--A-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A-----------T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GT-TC------A-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TTCG-AG-T-TC-A-CA-C-GAAT-----TT--AT-TG--G--AA-TA--TA--ATAAAAA
gi|101034 : A--GATC-TAT-GC-GT-----T--AA-----------AG-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTTA-A-GC-TC--TC-AA-AA--T-GAACAAAAAAA-AAT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-G--T-GAA------TT--GT-TGCAG--AA-TA--T
Alignments
lowQualScore : 11 1111111
lowQualScore : 22 777 2 22 2 2 1 1 22 33 1 1 33 444 22 3 22 1 1 222 44444 1 5555555 222 222 1 1 3333 666 22 222 222 3333 55 2222222 3333 4 444 1 222 55 1 1 22 66 1 44 1 6666666 3 3 55 1 1 1 33 1 1 1 55 3 666666 55 3 444 22 1 33 22
lowQualScore : .. ... . .. . . . . .. .. . . .. ... .. . .. . . ... ..... . ....... ... ... . . .... ... .. ... ... .... .. ....... .... . ... . ... .. . . .. .. . .. . ....... . . .. . . . .. . . . .. . ...... .. . ... .. . .. ..
lowQualScore : 66 000 0 88 0 0 8 7 33 88 6 6 88 222 22 2 22 6 6 888 00000 6 2222222 888 888 6 6 4444 666 22 888 888 4444 44 0000000 4444 8 444 6 888 44 6 6 22 88 6 44 6 1111111 2 2 44 6 6 6 88 6 6 6 44 2 222222 44 2 444 22 6 88 33
consensus : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
Reference ( family-655 ) : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101010 : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--C-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101011 : AAAAAA-C---T-T--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GAGA--AT-GC-GTAA--GG--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---A---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TA--TA-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101012 : AAAAAC-C-----C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-GC-GTAA--GT--AA--T-C---G-AAT-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----ATT-TG--T---T---G----T--T-------T----G-----T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAATATT-A--T--TT-G-A--T-TC-A-C----GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101013 : aAAAAAA-C---T-C--AA-TA-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-TC-GTAT--GG--AA--T-CC--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T-------------------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-AAA-AATTA-TT-G-A--T-TC-A-A--T-AAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAA
gi|101014 : AACAAC-C---C-CCAAA-TC-TT-GTGA-TCA--GATC--AT-GC-GTAA--GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---TGGCG----TG-T-------T----G-G---T-T---TAATTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G-------AAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TCAA-C--TGGAA------CT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101015 : aAAAAAC-CCCAT-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--AGTC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-C-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTTA-A-GC-TC--TCAAA-AA--T-G------AAAA---T-A--TA-TT-G-ATCT-TC-ACC--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA---C--AGAAAAA
gi|101016 : aAAAAAA-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA---ATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-TTTGT-T---TATTTT--A-GC-TC--C---A-AA--T-G------TAAA-TAT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-TTAT-GA--------T--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101017 : AAAAA------T-C--CA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-A---C---T-----A-T-------T---T---T-A-A----ATGTTG--T---T---G----T--T-------T----GTT---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC--A-AA--T-G-------TAA-ATT-AT-TA-TT-G-A--T-TC-A-T--T-GTA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAA
gi|101018 : aaAAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-G-GA-TTA--GATTATAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AACGC---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--TGTT----T----GAT---T-T---TATTTTTAA-GC-TC--TC-AA-AA--T-T------GAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TTTAGT-T---C--AA-TAT-TC--AGCAAAA
gi|101019 : AAAAAT-T---T-C--AA-TT-TT-GTTA-TTA--GAGC--AT-GT-GTAA--GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-T----A---TG--T---T---A----T--T-------TACTTG-T---T-T---TATTTC--A-GC-TC--T--AA-AA--TCA------AAAA-ATA-A--TC-TT-G-A--T-TC-A-C--T-AAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--GGAAAAA
gi|101020 : AAAAC-CAACT-C--AA-TC-TT-GTGA-TTT--GATC--AT-GCCGTAAAAG---AA--T-CG--A-AAC-T---T-----A-T-------T---TTTAA-A-A----AC--TG--T---T---G----TGGT-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-TCCTC--TC-AA-AACCT-G------AAAA-ATT-T--TA-TT-G----T-TC-A-C--T-GAA------TT--AC-T---G--AA-TA--TC--AGAAAA
gi|101021 : AAAAACTC---T-A--AA-TC-TT-GTGA-TTAAAGA----AT-GT-GTAA--GA--AA--T-CG--G-ATC-C---T-----A-T-------TAAAT---A-A-A----C---TA--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TACTTG--A-GC-TT--TA-AA-AA--T--------AAAA-ATT-GC-TC-TT-G-T--A-TC-A-C--T-GAA------TT--CT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101022 : aAAAAAC-T---TTC--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GGTC-TAT-GC----A--GT--AA--T-C---G-AAC-T---TTCAAAA-TATCGACCT---T---AGA-A----A---TG--T------------T--T-------T----GTT---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-T------AAAATAAT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A----T-GAA------TT--AT-T---G--AAGTA--TC--AGAAAAA
gi|101023 : aAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAG--GT--AA--T-CG--G-AAC-A---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---GT--T---T---G----T--T-------T----G-T---TCT---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AC--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--TAAAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101024 : AAAAAC-T---C-A--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTTAT-GT--AA--T-CGCGG-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TCAAA-AA--T-G------AAAA-ATTAA--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TTA-AT-T---G--AA-TA--TTAAAGAAAAA
gi|101025 : ATT-CAT-GC-GTA---GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TGCGT---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GT-TC--TA-CA-AA--T-G------AAAA-ATTTA--TG-TT-G-A--T-TA-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101026 : aaaaactcaAAAACC-C---T-C--AA-TCCTT-GTGA-TTA--GATC--GT--T-GTAA--GTCCAA--T-CG--G-AAC-C---T-----ATT-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---GTTGTT--T-------C----G-T---T-T---TATTTT--C-GC-TCCGTCAAA-AA--T-G-------AAA-ATT-G--TA-AT-G-A--T-TC-A-C--T-GAATTTTTTTT--ATCT---G--AA-TGATTC--AGAAAAA
gi|101027 : aAAAA-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-GC-GTAA--GG--AA--T-CG--G-AA----------------------------------A----A---TG--T---T---G----T---------------------T-T---TATTTT--A-GC-TC--TA-AA-AA--T-G------TAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101028 : AAAA-C---T-C--A--TC-TT-G-GA-TTA--GAAC-TG--GC-GTAA--GA--AA--T-CC--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-T----A---TG----------G----TA-T-------T----G-TG--T-T---GGTTTT--A-GC-TG--T--AA-AATTT-A------AAAA-A----------T-G-A--T-TC-A-C--T-G---------T--ATAT---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101029 : -C---T-C--AAATC-TT-GTTA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AAATTGTG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A----G--T---T---G----T--TGGGTAGAT----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AAGAA--T-G-------AAA-ATT-A--TA-TT-GTA--T-TC-A-CA-T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101030 : -C---T-C--AA-TC-GTAGTGAATTA--TATA-TATAGC-GTC---GT--AA--TGCG--GGAAC-CATCT-----A-T-------T---A---G-ATA----A---TG--TGTTT---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TT--TC-AA-AA--T-G------AAAA---T-A--TATTT-G-A--TATC-A-C--T-GCA------TTC-AT-T---GAAAA-TA--TG--AAAAAAA
gi|101031 : T-GTGA-TTA--GAAA--AT-GC-GTAA--GG--AA--T-TG--G-AAC-C---T-----A-T-------T-------A-A-ACATGA---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-------------------------AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--ATAAAAA
gi|101032 : -GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTA----T--CA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A--------TG--T---T---G----T--TGTGTC--T----G-T---T-TATTTATTTT--AAGC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-TTT-A--TG----G-A--A-TT-A-C--T-GAA------TT--AT-G---C--AA-T---TC--CGAAAAA
gi|101033 : TGA-TTA----TC-TAT-G--GTAA--GT--AA--T-GG--A-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A-----------T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GT-TC------A-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TTCG-AG-T-TC-A-CA-C-GAAT-----TT--AT-TG--G--AA-TA--TA--ATAAAAA
gi|101034 : A--GATC-TAT-GC-GT-----T--AA-----------AG-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTTA-A-GC-TC--TC-AA-AA--T-GAACAAAAAAA-AAT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-G--T-GAA------TT--GT-TGCAG--AA-TA--T
blockSeqs : CT CCA T CA A C A A AA AT A C AA TCC AT G CG G G ATC TCAAA T ATCGACC AAA TTA G T CATG TGT CG GTT GGC TTGT GG GGGTAGA ACTT T TTG C ATT TA A C CG CA G CC C AACAAAA T A AT T C T TC A A C TA G TTTTTT TA C GCA AA G AT AA
blockSeqs : A AAC . . . . . . . T . . T G . G . . . . . . . . . . . . TT . . . . G GTGTC . A G . . A . . . CA . TT . A T T T . . . G . . . A A T A A G . . T .
blockSeqs : C . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A GTT . T . . . A . . . CA . . . A . . C . . . . . . . A . . C . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : T*
originalCons : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
finalCons : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATCT-AT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
Alignments
lowQualScore : 11 1111111
lowQualScore : 22 777 2 22 2 2 1 1 22 33 1 1 33 444 22 3 22 1 1 222 44444 1 5555555 222 222 1 1 3333 666 22 222 222 3333 55 2222222 3333 4 444 1 222 55 1 1 22 66 1 44 1 6666666 3 3 55 1 1 1 33 1 1 1 55 3 666666 55 3 444 22 1 33 22
lowQualScore : .. ... . .. . . . . .. .. . . .. ... .. . .. . . ... ..... . ....... ... ... . . .... ... .. ... ... .... .. ....... .... . ... . ... .. . . .. .. . .. . ....... . . .. . . . .. . . . .. . ...... .. . ... .. . .. ..
lowQualScore : 66 000 0 88 0 0 8 7 33 88 6 6 88 222 22 2 22 6 6 888 00000 6 2222222 888 888 6 6 4444 666 22 888 888 4444 44 0000000 4444 8 444 6 888 44 6 6 22 88 6 44 6 1111111 2 2 44 6 6 6 88 6 6 6 44 2 222222 44 2 444 22 6 88 33
consensus : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
Reference ( family-655 ) : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101010 : AAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--C-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101011 : AAAAAA-C---T-T--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GAGA--AT-GC-GTAA--GG--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---A---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TA--TA-AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101012 : AAAAAC-C-----C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-GC-GTAA--GT--AA--T-C---G-AAT-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----ATT-TG--T---T---G----T--T-------T----G-----T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAATATT-A--T--TT-G-A--T-TC-A-C----GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101013 : aAAAAAA-C---T-C--AA-TA-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-TC-GTAT--GG--AA--T-CC--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T-------------------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-AAA-AATTA-TT-G-A--T-TC-A-A--T-AAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAA
gi|101014 : AACAAC-C---C-CCAAA-TC-TT-GTGA-TCA--GATC--AT-GC-GTAA--GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---TGGCG----TG-T-------T----G-G---T-T---TAATTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-G-------AAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TCAA-C--TGGAA------CT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101015 : aAAAAAC-CCCAT-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--AGTC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-C-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTTA-A-GC-TC--TCAAA-AA--T-G------AAAA---T-A--TA-TT-G-ATCT-TC-ACC--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA---C--AGAAAAA
gi|101016 : aAAAAAA-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA---ATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-TTTGT-T---TATTTT--A-GC-TC--C---A-AA--T-G------TAAA-TAT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-TTAT-GA--------T--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101017 : AAAAA------T-C--CA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-A---C---T-----A-T-------T---T---T-A-A----ATGTTG--T---T---G----T--T-------T----GTT---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC--A-AA--T-G-------TAA-ATT-AT-TA-TT-G-A--T-TC-A-T--T-GTA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAA
gi|101018 : aaAAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-G-GA-TTA--GATTATAT-GC-GTAA--GT--AA--T-CG--G-AACGC---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--TGTT----T----GAT---T-T---TATTTTTAA-GC-TC--TC-AA-AA--T-T------GAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TTTAGT-T---C--AA-TAT-TC--AGCAAAA
gi|101019 : AAAAAT-T---T-C--AA-TT-TT-GTTA-TTA--GAGC--AT-GT-GTAA--GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-T----A---TG--T---T---A----T--T-------TACTTG-T---T-T---TATTTC--A-GC-TC--T--AA-AA--TCA------AAAA-ATA-A--TC-TT-G-A--T-TC-A-C--T-AAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--GGAAAAA
gi|101020 : AAAAC-CAACT-C--AA-TC-TT-GTGA-TTT--GATC--AT-GCCGTAAAAG---AA--T-CG--A-AAC-T---T-----A-T-------T---TTTAA-A-A----AC--TG--T---T---G----TGGT-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-TCCTC--TC-AA-AACCT-G------AAAA-ATT-T--TA-TT-G----T-TC-A-C--T-GAA------TT--AC-T---G--AA-TA--TC--AGAAAA
gi|101021 : AAAAACTC---T-A--AA-TC-TT-GTGA-TTAAAGA----AT-GT-GTAA--GA--AA--T-CG--G-ATC-C---T-----A-T-------TAAAT---A-A-A----C---TA--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TACTTG--A-GC-TT--TA-AA-AA--T--------AAAA-ATT-GC-TC-TT-G-T--A-TC-A-C--T-GAA------TT--CT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101022 : aAAAAAC-T---TTC--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GGTC-TAT-GC----A--GT--AA--T-C---G-AAC-T---TTCAAAA-TATCGACCT---T---AGA-A----A---TG--T------------T--T-------T----GTT---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AA--T-T------AAAATAAT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A----T-GAA------TT--AT-T---G--AAGTA--TC--AGAAAAA
gi|101023 : aAAAAC-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAG--GT--AA--T-CG--G-AAC-A---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---GT--T---T---G----T--T-------T----G-T---TCT---TATTTT--A-GC-TC--TC-AA-AC--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--TAAAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101024 : AAAAAC-T---C-A--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTTAT-GT--AA--T-CGCGG-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TCAAA-AA--T-G------AAAA-ATTAA--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TTA-AT-T---G--AA-TA--TTAAAGAAAAA
gi|101025 : ATT-CAT-GC-GTA---GA--AA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TGCGT---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GT-TC--TA-CA-AA--T-G------AAAA-ATTTA--TG-TT-G-A--T-TA-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101026 : aaaaactcaAAAACC-C---T-C--AA-TCCTT-GTGA-TTA--GATC--GT--T-GTAA--GTCCAA--T-CG--G-AAC-C---T-----ATT-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---GTTGTT--T-------C----G-T---T-T---TATTTT--C-GC-TCCGTCAAA-AA--T-G-------AAA-ATT-G--TA-AT-G-A--T-TC-A-C--T-GAATTTTTTTT--ATCT---G--AA-TGATTC--AGAAAAA
gi|101027 : aAAAA-C---T-C--AA-TC-TT-GTGA-TTA--GATC--AT-GC-GTAA--GG--AA--T-CG--G-AA----------------------------------A----A---TG--T---T---G----T---------------------T-T---TATTTT--A-GC-TC--TA-AA-AA--T-G------TAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101028 : AAAA-C---T-C--A--TC-TT-G-GA-TTA--GAAC-TG--GC-GTAA--GA--AA--T-CC--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-T----A---TG----------G----TA-T-------T----G-TG--T-T---GGTTTT--A-GC-TG--T--AA-AATTT-A------AAAA-A----------T-G-A--T-TC-A-C--T-G---------T--ATAT---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101029 : -C---T-C--AAATC-TT-GTTA-TTA--GATC-TAT-GC-GTAA--GT--AAATTGTG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A----G--T---T---G----T--TGGGTAGAT----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TC--TC-AAGAA--T-G-------AAA-ATT-A--TA-TT-GTA--T-TC-A-CA-T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--AGAAAAA
gi|101030 : -C---T-C--AA-TC-GTAGTGAATTA--TATA-TATAGC-GTC---GT--AA--TGCG--GGAAC-CATCT-----A-T-------T---A---G-ATA----A---TG--TGTTT---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GC-TT--TC-AA-AA--T-G------AAAA---T-A--TATTT-G-A--TATC-A-C--T-GCA------TTC-AT-T---GAAAA-TA--TG--AAAAAAA
gi|101031 : T-GTGA-TTA--GAAA--AT-GC-GTAA--GG--AA--T-TG--G-AAC-C---T-----A-T-------T-------A-A-ACATGA---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-------------------------AA-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-C--T-GAA------TT--AT-T---G--AA-TA--TC--ATAAAAA
gi|101032 : -GTGA-TTA--GATC-TAT-GC-GTA----T--CA--T-CG--G-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A--------TG--T---T---G----T--TGTGTC--T----G-T---T-TATTTATTTT--AAGC-TC--TC-AA-AA--T-G------AAAA-TTT-A--TG----G-A--A-TT-A-C--T-GAA------TT--AT-G---C--AA-T---TC--CGAAAAA
gi|101033 : TGA-TTA----TC-TAT-G--GTAA--GT--AA--T-GG--A-AAC-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A-----------T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTT--A-GT-TC------A-AA--T-G------AAAA-ATT-A--TA-TTCG-AG-T-TC-A-CA-C-GAAT-----TT--AT-TG--G--AA-TA--TA--ATAAAAA
gi|101034 : A--GATC-TAT-GC-GT-----T--AA-----------AG-C---T-----A-T-------T---T---A-A-A----A---TG--T---T---G----T--T-------T----G-T---T-T---TATTTTA-A-GC-TC--TC-AA-AA--T-GAACAAAAAAA-AAT-A--TA-TT-G-A--T-TC-A-G--T-GAA------TT--GT-TGCAG--AA-TA--T