lowQualScore : 5555 333 333 3 1 22 1 1 5 1 22 1 1 1 22 1 1 55 8 1 44 22 44 3333 88888888 1 22 444 2 88888888 2
lowQualScore : .... ... ... . . .. . . . . .. . . . .. . . .. . . .. .. .. .... ........ . .. ... . ........ .
lowQualScore : 7777 000 000 3 7 33 7 7 0 7 33 7 7 7 33 7 7 66 1 7 00 55 77 9999 44444444 8 66 777 0 44444444 4
consensus : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC--ATGA-A--ATGG--TC-TT----TGC--------A-TAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
Reference ( gi|102815 ) : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC--AAGA-A--ATGG--TT-TT----TGC--------A-TAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102797 : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC--AAGA-A--ATGG--GC-TT----TGA--------A-TAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102798 : atATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-AC-GCA--GCGA-A-GC--ACGA-A--ATGG--TC-TT----TGC--------A-TAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102799 : atATGTAT----A---CG---GTTG-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC--ACGA-A--ATGG--TT-TT----TGC--------A-TAA--TTA-T-AAT-TTA-T------TC-AAGTA
gi|102800 : acATATAT----A---TG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-C-A--GCGG-A-GC--ATGA-A--ATGA--TC-TT----TGC--------A-TAA--TTA-T-AAT-TTA-G------TT-AAGTA
gi|102801 : atATGTAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGAGCC-G-A--GCGA---GC--AA-A-A--ATGG--TT-TT----TGC--------G-TAA--TCA-T-AAT-TTA--------TT-AAGTA
gi|102813 : atATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-TG-T-T--GGG-CC-G-A--ATGA-C-GC--ATGA-A--ATGG--TC-AT----TGG--------A-TAA--TCA-T-AAT-TCA-T------TT-AAGTA
gi|102802 : tATAGAT----A---CG---GT-GGTG--A-C--G-T-T--GGA-CC-G-A--GCAA-A-GC--ACGA-A--ATGG--TC-TT----TGC--------A-ATA--TCA-TCAAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102804 : atATATAT----A---CG---GT-G-TG--C-C-TG-T-T--CGA-CT-G-A--GCGA-A-GC--ATGA-AACATGG---T-TT----TGC--------A-TAA--TCA-T-AAT-TTA-G------TT-GAG
gi|102803 : atATGTAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GTGA-A-GC--ATGA-A--ATTG--TC-TC----TGC--------A-TAA--TCA---AAT-
gi|102805 : atATATATT---A---CG---GT-G-TT--A-C-CGAT-T--AGA-CC---A--GCGA-A-GC--ATGA-A--ATGG--TC-TT----TGC--------A-TGA--TCA-T-ACT-TTA-T------TG-AAG
gi|102814 : ATATAT----A---CG---GT-G-TGTGA-C-CG-T-TTTGGA-CC-G-A--GCGA-A-GCATAAGA-AT-ATGG--TT-TT----TGCA-------A-TAAACTCAGTAAAT-TTA-TACATCATT-AAGTA
gi|102807 : tATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CT-T-T--G-A-CC-G-T--GCGA-A-GC--ATGG-A--ATAG--TA-TT----TGC--------T-AAA--TCA-C-AAT-ATA-T------CT-ATGT
gi|102817 : atATATAT----AACGCG---GG-A-TT--A-C-CGCT-T--GGA-CA-G-A--GTGA-A-GC--ATGA-A--ATGGGACT-TT----GAC--------A-TAA--TCA-T-AATATTA-G------TT-AAGTA
gi|102816 : ATATATTCTAA---CG----T-G-TT--A-C-CG-T-T--AGA-CC-G-A--GCGA-A-GC---ATA-A--AT-G--TC-TT----TGC--------A-T-A--TCATT-AAT-TTA-
gi|102808 : ATATAT----A----G---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GCA-AAGA-A--A
gi|102810 : atATATAT----A---CG---GT-G-GA--A-C-CGTT-T--GGA--C-G-A--GCGA-A-GC--ATGA-A--ATG
gi|102809 : atATATTT----A---CGCGGGT-G-TT--ATC-CG-A-T----A-CC-G-ACAGCGACA-GC--TTGA-A--ATGG--TC-TT----TAC--------AATGA--TCA-T-AAT-TTA-T------TG-AAG
gi|102811 : atACATAT----T---CG---GT-T-TA--A-C-AA-T-A--GGG-CC-G-A--GCGA-A-GC--ATGA-A--ATGG--TCATTAGTGTGCTCCATGTGA-TAA--TCG-T-CAT-TTA-
gi|102818 : atTATTT----A---CG---GT-G-TG--A-C-TG-T-T--GGA-CC-G-A--GAAA-A-GC--AAGA-A--ATGG--TC-TT----TGC--------A-TAA--TCA-T-AAT-TTA-G------TCAAAGTA
gi|102819 : TATAT----A---CT---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-TC-G-A--GTGA-A-GC--ATAA-A--ATGG--TC-CT----TGC--------A-TAA--TCT-T-AA
gi|102806 : TATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA--C-G-A--GCGA-A-GCA-AAGAGA--ATGG--TT-TT----TGC--------A-T
gi|102812 : atgTAT----A---CG---GT---TG--A-CTCG-T-T--GGA-CCCG-A--GCGA-A-GC--AAGA-A--ATGG--GT-TT----TGC--------A-TAA--TCA-C-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102820 : tatattc---CG---GTTG-TG----C-CG-CAT--AGA-C--G-A--GCGA-AAGC--ATGA-A--ATGG--TCATT----TGC--------A-TGA--TCA-T-AA----A-T------AT-AAG
gi|102821 : -G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GTGA-A-GC--ATGA-A--ATGT--CT-TT----TGC--------A-TAA--CCA---AAT-TTAGT------TT-AAG
Alignments
lowQualScore : 5555 222 222 3 1 22 1 1 4 1 22 1 1 1 22 1 1 1 222 1 44 1 3 3333 1 99999999 22 444 1 77777777 2
lowQualScore : .... ... ... . . .. . . . . .. . . . .. . . . ... . .. . . .... . ........ .. ... . ........ .
lowQualScore : 4444 999 999 2 6 22 6 6 8 6 22 6 6 6 22 6 6 6 666 7 00 7 5 7777 7 88888888 55 111 9 44444444 2
consensus : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
Reference ( family-640 ) : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102797 : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AA--GA-A--ATGGG-C-TT----TG-A--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102798 : atATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-AC-GCA--GCGA-A-GC-AC--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102799 : atATGTAT----A---CG---GTTG-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AC--GA-A--ATGGT-T-TT----TG-C--------ATAA--TTA-T-AAT-TTA-T------TC-AAGTA
gi|102800 : acATATAT----A---TG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-C-A--GCGG-A-GC-AT--GA-A--ATGAT-C-TT----TG-C--------ATAA--TTA-T-AAT-TTA-G------TT-AAGTA
gi|102801 : atATGTAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGAGCC-G-A--GCGA---GC-A---AA-A--ATGGT-T-TT----TG-C--------GTAA--TCA-T-AAT-TTA--------TT-AAGTA
gi|102802 : atATAGAT----A---CG---GT-GGTG--A-C--G-T-T--GGA-CC-G-A--GCAA-A-GC-AC--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------AATA--TCA-TCAAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102803 : atATGTAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GTGA-A-GC-AT--GA-A--ATTGT-C-TC----TG-C--------ATAA--TCA---AAT-
gi|102804 : atATATAT----A---CG---GT-G-TG--C-C-TG-T-T--CGA-CT-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-AACATGGT---TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-G------TT-GAG
gi|102805 : atATATATT---A---CG---GT-G-TT--A-C-CGAT-T--AGA-CC---A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATGA--TCA-T-ACT-TTA-T------TG-AAG
gi|102806 : TATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA--C-G-A--GCGA-A-GCAAA--GAGA--ATGGT-T-TT----TG-C--------AT
gi|102807 : atgATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CT-T-T--G-A-CC-G-T--GCGA-A-GC-AT--GG-A--ATAGT-A-TT----TG-C--------TAAA--TCA-C-AAT-ATA-T------CT-ATGT
gi|102808 : atATATAT----A----G---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-A
gi|102809 : atATATTT----A---CGCGGGT-G-TT--ATC-CG-A-T----A-CC-G-ACAGCGACA-GC-TT--GA-A--ATGGT-C-TT----TA-CA-------ATGA--TCA-T-AAT-TTA-T------TG-AAGaagaaa
gi|102810 : atATATAT----A---CG---GT-G-GA--A-C-CGTT-T--GGA--C-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATG
gi|102811 : atACATAT----T---CG---GT-T-TA--A-C-AA-T-A--GGG-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-CATTAGTGTG-CTCCATGTGATAA--TCG-T-CAT-TTA-
gi|102812 : atTAT----A---CG---GT---TG--A-CTCG-T-T--GGA-CCCG-A--GCGA-A-GC-AA--GA-A--ATGGG-T-TT----TG-C--------ATAA--TCA-C-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102813 : tatattcATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-TG-T-T--GGG-CC-G-A--ATGA-C-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-AT----TG-G--------ATAA--TCA-T-AAT-TCA-T------TT-AAGTA
gi|102814 : tATATAT----A---CG---GT-G-TGTGA-C-CG-T-TTTGGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-ATAAGA-AT-ATGGT-T-TT----TG-CA-------ATAAACTCAGTAAAT-TTA-TACATCATT-AAGTA
gi|102815 : tATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AA--GA-A--ATGGT-T-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102816 : ATATATTCTAA---CG----T-G-TT--A-C-CG-T-T--AGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT---A-A--AT-GT-C-TT----TG-C--------AT-A--TCATT-AAT-TTA-
gi|102817 : ATATAT----AACGCG---GG-A-TT--A-C-CGCT-T--GGA-CA-G-A--GTGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGGAC-TT----TGAC--------ATAA--TCA-T-AATATTA-G------TT-AAGTA
gi|102818 : TATTT----A---CG---GT-G-TG--A-C-TG-T-T--GGA-CC-G-A--GAAA-A-GC-AA--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-G------TCAAAGTA
gi|102819 : TATAT----A---CT---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-TC-G-A--GTGA-A-GC-AT--AA-A--ATGGT-C-CT----TG-C--------ATAA--TCT-T-AA
gi|102820 : ---CG---GTTG-TG----C-CG-CAT--AGA-C--G-A--GCGA-AAGC-AT--GA-A--ATGGT-CATT----TG-C--------ATGA--TCA-T-AA----A-T------AT-AAG
gi|102821 : -G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GTGA-A-GC-AT--GA-A--ATGTC-T-TT----TG-C--------ATAA--CCA---AAT-TTAGT------TT-AAG
Alignments
lowQualScore : 5555 222 222 3 1 22 1 1 4 1 22 1 1 1 22 1 1 1 222 1 44 1 3 3333 1 99999999 22 444 1 77777777 2
lowQualScore : .... ... ... . . .. . . . . .. . . . .. . . . ... . .. . . .... . ........ .. ... . ........ .
lowQualScore : 4444 999 999 2 6 22 6 6 8 6 22 6 6 6 22 6 6 6 666 7 00 7 5 7777 7 88888888 55 111 9 44444444 2
consensus : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
Reference ( family-640 ) : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102797 : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AA--GA-A--ATGGG-C-TT----TG-A--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102798 : atATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-AC-GCA--GCGA-A-GC-AC--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102799 : atATGTAT----A---CG---GTTG-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AC--GA-A--ATGGT-T-TT----TG-C--------ATAA--TTA-T-AAT-TTA-T------TC-AAGTA
gi|102800 : acATATAT----A---TG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-C-A--GCGG-A-GC-AT--GA-A--ATGAT-C-TT----TG-C--------ATAA--TTA-T-AAT-TTA-G------TT-AAGTA
gi|102801 : atATGTAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGAGCC-G-A--GCGA---GC-A---AA-A--ATGGT-T-TT----TG-C--------GTAA--TCA-T-AAT-TTA--------TT-AAGTA
gi|102802 : atATAGAT----A---CG---GT-GGTG--A-C--G-T-T--GGA-CC-G-A--GCAA-A-GC-AC--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------AATA--TCA-TCAAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102803 : atATGTAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GTGA-A-GC-AT--GA-A--ATTGT-C-TC----TG-C--------ATAA--TCA---AAT-
gi|102804 : atATATAT----A---CG---GT-G-TG--C-C-TG-T-T--CGA-CT-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-AACATGGT---TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-G------TT-GAG
gi|102805 : atATATATT---A---CG---GT-G-TT--A-C-CGAT-T--AGA-CC---A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATGA--TCA-T-ACT-TTA-T------TG-AAG
gi|102806 : TATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA--C-G-A--GCGA-A-GCAAA--GAGA--ATGGT-T-TT----TG-C--------AT
gi|102807 : atgATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CT-T-T--G-A-CC-G-T--GCGA-A-GC-AT--GG-A--ATAGT-A-TT----TG-C--------TAAA--TCA-C-AAT-ATA-T------CT-ATGT
gi|102808 : atATATAT----A----G---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-A
gi|102809 : atATATTT----A---CGCGGGT-G-TT--ATC-CG-A-T----A-CC-G-ACAGCGACA-GC-TT--GA-A--ATGGT-C-TT----TA-CA-------ATGA--TCA-T-AAT-TTA-T------TG-AAGaagaaa
gi|102810 : atATATAT----A---CG---GT-G-GA--A-C-CGTT-T--GGA--C-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATG
gi|102811 : atACATAT----T---CG---GT-T-TA--A-C-AA-T-A--GGG-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-CATTAGTGTG-CTCCATGTGATAA--TCG-T-CAT-TTA-
gi|102812 : atTAT----A---CG---GT---TG--A-CTCG-T-T--GGA-CCCG-A--GCGA-A-GC-AA--GA-A--ATGGG-T-TT----TG-C--------ATAA--TCA-C-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102813 : tatattcATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-TG-T-T--GGG-CC-G-A--ATGA-C-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-AT----TG-G--------ATAA--TCA-T-AAT-TCA-T------TT-AAGTA
gi|102814 : tATATAT----A---CG---GT-G-TGTGA-C-CG-T-TTTGGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-ATAAGA-AT-ATGGT-T-TT----TG-CA-------ATAAACTCAGTAAAT-TTA-TACATCATT-AAGTA
gi|102815 : tATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AA--GA-A--ATGGT-T-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102816 : ATATATTCTAA---CG----T-G-TT--A-C-CG-T-T--AGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT---A-A--AT-GT-C-TT----TG-C--------AT-A--TCATT-AAT-TTA-
gi|102817 : ATATAT----AACGCG---GG-A-TT--A-C-CGCT-T--GGA-CA-G-A--GTGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGGAC-TT----TGAC--------ATAA--TCA-T-AATATTA-G------TT-AAGTA
gi|102818 : TATTT----A---CG---GT-G-TG--A-C-TG-T-T--GGA-CC-G-A--GAAA-A-GC-AA--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-G------TCAAAGTA
gi|102819 : TATAT----A---CT---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-TC-G-A--GTGA-A-GC-AT--AA-A--ATGGT-C-CT----TG-C--------ATAA--TCT-T-AA
gi|102820 : ---CG---GTTG-TG----C-CG-CAT--AGA-C--G-A--GCGA-AAGC-AT--GA-A--ATGGT-CATT----TG-C--------ATGA--TCA-T-AA----A-T------AT-AAG
gi|102821 : -G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GTGA-A-GC-AT--GA-A--ATGTC-T-TT----TG-C--------ATAA--CCA---AAT-TTAGT------TT-AAG
blockSeqs : TCTA ACG CGG T G TG T T A A TT G C C CA C A A TAA G AC A A AGTG A TCCATGTG AC GTA A TACATCA A
blockSeqs : T . . T . . . . T . . . . . . . . . C . T . A . . A . TC . GT .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . A . TT . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . T . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
finalCons : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
Alignments
lowQualScore : 5555 222 222 3 1 22 1 1 4 1 22 1 1 1 22 1 1 1 222 1 44 1 3 3333 1 99999999 22 444 1 77777777 2
lowQualScore : .... ... ... . . .. . . . . .. . . . .. . . . ... . .. . . .... . ........ .. ... . ........ .
lowQualScore : 4444 999 999 2 6 22 6 6 8 6 22 6 6 6 22 6 6 6 666 7 00 7 5 7777 7 88888888 55 111 9 44444444 2
consensus : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
Reference ( family-640 ) : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102797 : ATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AA--GA-A--ATGGG-C-TT----TG-A--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102798 : atATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-AC-GCA--GCGA-A-GC-AC--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102799 : atATGTAT----A---CG---GTTG-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AC--GA-A--ATGGT-T-TT----TG-C--------ATAA--TTA-T-AAT-TTA-T------TC-AAGTA
gi|102800 : acATATAT----A---TG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-C-A--GCGG-A-GC-AT--GA-A--ATGAT-C-TT----TG-C--------ATAA--TTA-T-AAT-TTA-G------TT-AAGTA
gi|102801 : atATGTAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGAGCC-G-A--GCGA---GC-A---AA-A--ATGGT-T-TT----TG-C--------GTAA--TCA-T-AAT-TTA--------TT-AAGTA
gi|102802 : atATAGAT----A---CG---GT-GGTG--A-C--G-T-T--GGA-CC-G-A--GCAA-A-GC-AC--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------AATA--TCA-TCAAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102803 : atATGTAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GTGA-A-GC-AT--GA-A--ATTGT-C-TC----TG-C--------ATAA--TCA---AAT-
gi|102804 : atATATAT----A---CG---GT-G-TG--C-C-TG-T-T--CGA-CT-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-AACATGGT---TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-G------TT-GAG
gi|102805 : atATATATT---A---CG---GT-G-TT--A-C-CGAT-T--AGA-CC---A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATGA--TCA-T-ACT-TTA-T------TG-AAG
gi|102806 : TATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA--C-G-A--GCGA-A-GCAAA--GAGA--ATGGT-T-TT----TG-C--------AT
gi|102807 : atgATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CT-T-T--G-A-CC-G-T--GCGA-A-GC-AT--GG-A--ATAGT-A-TT----TG-C--------TAAA--TCA-C-AAT-ATA-T------CT-ATGT
gi|102808 : atATATAT----A----G---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-A
gi|102809 : atATATTT----A---CGCGGGT-G-TT--ATC-CG-A-T----A-CC-G-ACAGCGACA-GC-TT--GA-A--ATGGT-C-TT----TA-CA-------ATGA--TCA-T-AAT-TTA-T------TG-AAGaagaaa
gi|102810 : atATATAT----A---CG---GT-G-GA--A-C-CGTT-T--GGA--C-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATG
gi|102811 : atACATAT----T---CG---GT-T-TA--A-C-AA-T-A--GGG-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGT-CATTAGTGTG-CTCCATGTGATAA--TCG-T-CAT-TTA-
gi|102812 : atTAT----A---CG---GT---TG--A-CTCG-T-T--GGA-CCCG-A--GCGA-A-GC-AA--GA-A--ATGGG-T-TT----TG-C--------ATAA--TCA-C-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102813 : tatattcATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-TG-T-T--GGG-CC-G-A--ATGA-C-GC-AT--GA-A--ATGGT-C-AT----TG-G--------ATAA--TCA-T-AAT-TCA-T------TT-AAGTA
gi|102814 : tATATAT----A---CG---GT-G-TGTGA-C-CG-T-TTTGGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-ATAAGA-AT-ATGGT-T-TT----TG-CA-------ATAAACTCAGTAAAT-TTA-TACATCATT-AAGTA
gi|102815 : tATATAT----A---CG---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AA--GA-A--ATGGT-T-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-T------TT-AAGTA
gi|102816 : ATATATTCTAA---CG----T-G-TT--A-C-CG-T-T--AGA-CC-G-A--GCGA-A-GC-AT---A-A--AT-GT-C-TT----TG-C--------AT-A--TCATT-AAT-TTA-
gi|102817 : ATATAT----AACGCG---GG-A-TT--A-C-CGCT-T--GGA-CA-G-A--GTGA-A-GC-AT--GA-A--ATGGGAC-TT----TGAC--------ATAA--TCA-T-AATATTA-G------TT-AAGTA
gi|102818 : TATTT----A---CG---GT-G-TG--A-C-TG-T-T--GGA-CC-G-A--GAAA-A-GC-AA--GA-A--ATGGT-C-TT----TG-C--------ATAA--TCA-T-AAT-TTA-G------TCAAAGTA
gi|102819 : TATAT----A---CT---GT-G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-TC-G-A--GTGA-A-GC-AT--AA-A--ATGGT-C-CT----TG-C--------ATAA--TCT-T-AA
gi|102820 : ---CG---GTTG-TG----C-CG-CAT--AGA-C--G-A--GCGA-AAGC-AT--GA-A--ATGGT-CATT----TG-C--------ATGA--TCA-T-AA----A-T------AT-AAG
gi|102821 : -G-TG--A-C-CG-T-T--GGA-CC-G-A--GTGA-A-GC-AT--GA-A--ATGTC-T-TT----TG-C--------ATAA--CCA---AAT-TTAGT------TT-AAG