lowQualScore : 1
lowQualScore : 1 1 1 1 4444 1 1 3 55 1 222 222 1 1 5 3 1 1 1 22 444444 1 1 1 6 22 1 22 3 8 1
lowQualScore : . . . . .... . . . .. . ... ... . . . . . . . .. ...... . . . . .. . .. . . .
lowQualScore : 7 7 7 7 5555 7 7 3 66 7 999 999 7 7 0 3 7 7 7 33 888888 7 7 7 4 33 7 33 3 3 7
consensus : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CG------C-GC-T-GCG--C-T--G-TCCTCT-CTCT
Reference ( gi|5372 ) : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CG------C-GC-T-GTG--C-T--G-TCTTCT-CTCT
gi|5373 : CCCCCA-TG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CG------C-GC-T-GCG--C-T--G-TCT
gi|5374 : CCCCCA-CG-G-CCC-TT----TA-AA-TCT-G--CC-A---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CG------C-GC-T-GCG--C-T--G-TC-TCT-CTCTcttttt
gi|5375 : CCCCCA-CG-C-CC---T-T--TA-AA-TCC-G--C--A---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CG------C-GCTT-GCG--C-T--G-TC-TCT-CTCT
gi|5376 : CCCCCA-CGGC-CCC-CT-C--TA-A--TCC-G--CC-A---G---T-T-T-A-TC-G-T-G--CG------C-GC-T-GCG--C-T--T-TC-TCT-CTCT
gi|5384 : CCCCCA-CG-C-CCG-CT-C--TA-AA-TCT-G--CC-A---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CGCTGAAAC-GC-T------T-T--G-TCTTCT-CTCT
gi|5383 : CTCCCA-CG-C-CCC-TT-C--TA-A--TCG-GT-CC-A---G---T-GGT-A-TC-G-T-G--CG------C-GC-T-GCG--C-T--G-TCCTCT-CTCT
gi|5378 : CTCCCA-CG-C-CCC-TT-T--TA-AA-TCC-GGCTC-A---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CT------CGGC-T-GCG--C-T--G-TC-TCT-CTCT
gi|5379 : CTCCCA-CG-C-CCTATT-T--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-TC-T-T-G--CT------C-GC-T-GCG--C-T--G-TC-TCT-CTC
gi|5387 : CCCCCC-CC-C-CCC-CA-C--TA-TT-TCC-G--CC-A---G---T-G-TAA-TC-G-C-G--CG------C-GC-T-GCG--C-T--GCTCTTCT-CTCT
gi|5381 : CTCCCA-CG-C-CCC-CT-T--TA-AA-T-C-G--CC-A---G---T-G---A-TC-G-T-G--CT------C-GC-T-GCG--CGT--G-CTCTCT-CTCTct
gi|5380 : CCCCCA-CC-C-CTC-TC-C--TA-AA-TCC-AT-CC-A---G---T-G-T-ATTC-G-T-G--CG------C-GC-T-GCGCTC-T--G-TC-TCT-CTCT
gi|5386 : CCCCTA--G-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCCGG--CC-A---G---TAG-TAA-TC-GAT-G--CG------C-GC-T-GCG--C-T--C-TCTCTT-CTCT
gi|5382 : CCCCCA-CG-C-CC---T-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---GCTTT-G-T-ATTC-G-T-G--CG------C-GC-TAGCG--C-TTGA-TC-TCT-CTCT
gi|5385 : CCCCCA-CG-C-CCC-CTAT--TA-AA--AC-G--CC-A---G---T-G-T-A-TCAG-T-G--CG------C-GC-T-TCG--C-T--G--CCTCT-CT
gi|5388 : CCCCTA-C--C-CCC-CTAC--TA-AT-ACC-G--CCTA---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CG------C-GC-T-GCG--C----A-TCCTCT-CTCT
gi|5377 : CCCCCA-C--C-CCC-CT-C--TA-AA-TCCGG--CC-A---G---T-T-T---TC---T-G--CG------C-GC-T-GCG--C-T--T-TC-TCT-CTCT
gi|5390 : CCCCA-CG-C-CCC-C--C--TA-AA-TC--G--CC-A---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CG------C-GT-T-GCG--C-T--G-TCATCT-CTCT
gi|5389 : CCCCC-CG-C-CCC--T-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CG------C-GC-T-CCG--C-T--G-TCTCTC-CTCT
gi|5391 : CCTCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-AGTTG---T-A-T-A-TC-G-TCG--CG------C-GC-T-GCG--C-T--G-TGCTCT-CTC
gi|5393 : CCCCC-CG-C-CCC-TC-T--TATAA-TCC-G--CC-A---G---T-G-TAA-TC-G-T-G--TG------C-GC-T-GCG--C-T--G-TTCTCTGCTCT
gi|5392 : CCCCATCG-C-CCC-TT----TA-AG-TCC-G--CC-C---G---T-G-T-A-TC-G-T-G--C-------C-GC-G-ACG--C-T--G-TC-TCT-CTCT
gi|5394 : CCCCA-TG-C-CCC-CC-CCCTA-AA-TCC-G--CC-A------------------G-T-G--CG------C-GC-T-GCG--C-T--G-TC-TCT-CTCT
gi|5395 : CCA-CG-CACCC-CT-T--TA-AA-TCC-G--C--A---G---T-G-T-A-TC-G-T-GCTCG------G-GC-T-GCG--C-T--GTTCTCCT-CTCT
gi|5396 : G-T-CCC-CC-C--TA-AAATCC-G--C------G---T-G-T-A-TC-G-T-G--CG------C-GG-T-GCG--C-T--G-TC-TCT-CTCTc
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 1 1 1 1 3333 1 1 3 55 1 222 222 1 1 3 3 1 1 1 1 22 1 1 1 222 22 55 1 44 1 1
lowQualScore : . . . . .... . . . .. . ... ... . . . . . . . . .. . . . ... .. .. . .. . .
lowQualScore : 7 6 6 6 9999 6 6 2 44 6 888 888 6 6 2 2 6 6 6 6 22 6 6 6 888 22 44 6 44 6 6
consensus : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
Reference ( family-638 ) : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
gi|5372 : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---TG--C--TG-TC-TT-CT-CTCT
gi|5373 : CCCCCA-TG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-TTTT
gi|5374 : CCCCCA-CG-G-CCC-TT----TA-AA-TCT-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5375 : CCCCCA-CG-C-CC---T-T--TA-AA-TCC-G--C--A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GCTT-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5376 : CCCCCA-CGGC-CCC-CT-C--TA-A--TCC-G--CC-A---G---T-T-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--T--TT-CT-CT-CTCT
gi|5377 : CCCCCA-C--C-CCC-CT-C--TA-AA-TCCGG--CC-A---G---T-T-T---T-C---T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--T--TT-CT-CT-CTCT
gi|5378 : CTCCCA-CG-C-CCC-TT-T--TA-AA-TCC-GGCTC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CTCGGC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5379 : CTCCCA-CG-C-CCTATT-T--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-T-T-G--CTC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTC
gi|5380 : CCCCCA-CC-C-CTC-TC-C--TA-AA-TCC-AT-CC-A---G---T-G-T-A-TTC-G-T-G--CGC-GC-T-G---CGCTC--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5381 : CTCCCA-CG-C-CCC-CT-T--TA-AA-T-C-G--CC-A---G---T-G---A-T-C-G-T-G--CTC-GC-T-G---CG--CG-TG-CT-CT-CT-CTCT
gi|5382 : CCCCCA-CG-C-CC---T-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---GCTTT-G-T-ATT-C-G-T-G--CGC-GC-TAG---CG--CT-TG-AT-CT-CT-CTCT
gi|5383 : CTCCCA-CG-C-CCC-TT-C--TA-A--TCG-GT-CC-A---G---T-GGT-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
gi|5384 : CCCCCA-CG-C-CCG-CT-C--TA-AA-TCT-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-----GC-GC-T-GAAACG--CTTTG-TC-TT-CT-CTCT
gi|5385 : CCCCCA-CG-C-CCC-CTAT--TA-AA--AC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-CAG-T-G--CGC-GC-T-T---CG--C--TG--C-CT-CT-CT
gi|5386 : CCCCTA--G-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCCGG--CC-A---G---TAG-TAA-T-C-GAT-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TC-TC-TC-TT-CTCT
gi|5387 : CCCCCC-CC-C-CCC-CA-C--TA-TT-TCC-G--CC-A---G---T-G-TAA-T-C-G-C-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TGCTC-TT-CT-CTCT
gi|5388 : CCCCTA-C--C-CCC-CTAC--TA-AT-ACC-G--CCTA---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C---A-TC-CT-CT-CTCTct
gi|5389 : CCCCC-CG-C-CCC--T-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-C---CG--C--TG-TCTCT-C--CTCT
gi|5390 : CCCCA-CG-C-CCC-C--C--TA-AA-TC--G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GT-T-G---CG--C--TG-TC-AT-CT-CTCT
gi|5391 : CCTCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-AGTTG---T-A-T-A-T-C-G-TCG--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TG-CT-CT-CTC
gi|5392 : CCCCATCG-C-CCC-TT----TA-AG-TCC-G--CC-C---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--C-C-GC-G-A---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5393 : CCCCC-CG-C-CCC-TC-T--TATAA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-AAT-C-G-T-G--TGC-GC-T-G---CG--C--TG-TT-CT-CTGCTCT
gi|5394 : CCCCA-TG-C-CCC-CC-CCCTA-AA-TCC-G--CC-A-------------------G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5395 : CCA-CG-CACCC-CT-T--TA-AA-TCC-G--C--A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-GCTCGG-GC-T-G---CG--C--TG-TT-CTCCT-CTCT
gi|5396 : G-T-CCC-CC-C--TA-AAATCC-G--C------G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GG-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCTc
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 1 1 1 1 3333 1 1 3 55 1 222 222 1 1 3 3 1 1 1 1 22 1 1 1 222 22 55 1 44 1 1
lowQualScore : . . . . .... . . . .. . ... ... . . . . . . . . .. . . . ... .. .. . .. . .
lowQualScore : 7 6 6 6 9999 6 6 2 44 6 888 888 6 6 2 2 6 6 6 6 22 6 6 6 888 22 44 6 44 6 6
consensus : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
Reference ( family-638 ) : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
gi|5372 : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---TG--C--TG-TC-TT-CT-CTCT
gi|5373 : CCCCCA-TG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-TTTT
gi|5374 : CCCCCA-CG-G-CCC-TT----TA-AA-TCT-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5375 : CCCCCA-CG-C-CC---T-T--TA-AA-TCC-G--C--A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GCTT-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5376 : CCCCCA-CGGC-CCC-CT-C--TA-A--TCC-G--CC-A---G---T-T-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--T--TT-CT-CT-CTCT
gi|5377 : CCCCCA-C--C-CCC-CT-C--TA-AA-TCCGG--CC-A---G---T-T-T---T-C---T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--T--TT-CT-CT-CTCT
gi|5378 : CTCCCA-CG-C-CCC-TT-T--TA-AA-TCC-GGCTC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CTCGGC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5379 : CTCCCA-CG-C-CCTATT-T--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-T-T-G--CTC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTC
gi|5380 : CCCCCA-CC-C-CTC-TC-C--TA-AA-TCC-AT-CC-A---G---T-G-T-A-TTC-G-T-G--CGC-GC-T-G---CGCTC--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5381 : CTCCCA-CG-C-CCC-CT-T--TA-AA-T-C-G--CC-A---G---T-G---A-T-C-G-T-G--CTC-GC-T-G---CG--CG-TG-CT-CT-CT-CTCT
gi|5382 : CCCCCA-CG-C-CC---T-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---GCTTT-G-T-ATT-C-G-T-G--CGC-GC-TAG---CG--CT-TG-AT-CT-CT-CTCT
gi|5383 : CTCCCA-CG-C-CCC-TT-C--TA-A--TCG-GT-CC-A---G---T-GGT-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
gi|5384 : CCCCCA-CG-C-CCG-CT-C--TA-AA-TCT-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-----GC-GC-T-GAAACG--CTTTG-TC-TT-CT-CTCT
gi|5385 : CCCCCA-CG-C-CCC-CTAT--TA-AA--AC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-CAG-T-G--CGC-GC-T-T---CG--C--TG--C-CT-CT-CT
gi|5386 : CCCCTA--G-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCCGG--CC-A---G---TAG-TAA-T-C-GAT-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TC-TC-TC-TT-CTCT
gi|5387 : CCCCCC-CC-C-CCC-CA-C--TA-TT-TCC-G--CC-A---G---T-G-TAA-T-C-G-C-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TGCTC-TT-CT-CTCT
gi|5388 : CCCCTA-C--C-CCC-CTAC--TA-AT-ACC-G--CCTA---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C---A-TC-CT-CT-CTCTct
gi|5389 : CCCCC-CG-C-CCC--T-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-C---CG--C--TG-TCTCT-C--CTCT
gi|5390 : CCCCA-CG-C-CCC-C--C--TA-AA-TC--G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GT-T-G---CG--C--TG-TC-AT-CT-CTCT
gi|5391 : CCTCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-AGTTG---T-A-T-A-T-C-G-TCG--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TG-CT-CT-CTC
gi|5392 : CCCCATCG-C-CCC-TT----TA-AG-TCC-G--CC-C---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--C-C-GC-G-A---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5393 : CCCCC-CG-C-CCC-TC-T--TATAA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-AAT-C-G-T-G--TGC-GC-T-G---CG--C--TG-TT-CT-CTGCTCT
gi|5394 : CCCCA-TG-C-CCC-CC-CCCTA-AA-TCC-G--CC-A-------------------G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5395 : CCA-CG-CACCC-CT-T--TA-AA-TCC-G--C--A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-GCTCGG-GC-T-G---CG--C--TG-TT-CTCCT-CTCT
gi|5396 : G-T-CCC-CC-C--TA-AAATCC-G--C------G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GG-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCTc
blockSeqs : T G A A CCC T A G GC T GTT CTT A G A T T A A C CT G T A AAA CT TT C CT C G
blockSeqs : . . . . AT . . G T . . . . . A A . . . . . . . . . . G . T . .
blockSeqs : . . . . AC . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
finalCons : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 1 1 1 1 3333 1 1 3 55 1 222 222 1 1 3 3 1 1 1 1 22 1 1 1 222 22 55 1 44 1 1
lowQualScore : . . . . .... . . . .. . ... ... . . . . . . . . .. . . . ... .. .. . .. . .
lowQualScore : 7 6 6 6 9999 6 6 2 44 6 888 888 6 6 2 2 6 6 6 6 22 6 6 6 888 22 44 6 44 6 6
consensus : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
Reference ( family-638 ) : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
gi|5372 : CCCCCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---TG--C--TG-TC-TT-CT-CTCT
gi|5373 : CCCCCA-TG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-TTTT
gi|5374 : CCCCCA-CG-G-CCC-TT----TA-AA-TCT-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5375 : CCCCCA-CG-C-CC---T-T--TA-AA-TCC-G--C--A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GCTT-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5376 : CCCCCA-CGGC-CCC-CT-C--TA-A--TCC-G--CC-A---G---T-T-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--T--TT-CT-CT-CTCT
gi|5377 : CCCCCA-C--C-CCC-CT-C--TA-AA-TCCGG--CC-A---G---T-T-T---T-C---T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--T--TT-CT-CT-CTCT
gi|5378 : CTCCCA-CG-C-CCC-TT-T--TA-AA-TCC-GGCTC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CTCGGC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5379 : CTCCCA-CG-C-CCTATT-T--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-T-T-G--CTC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTC
gi|5380 : CCCCCA-CC-C-CTC-TC-C--TA-AA-TCC-AT-CC-A---G---T-G-T-A-TTC-G-T-G--CGC-GC-T-G---CGCTC--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5381 : CTCCCA-CG-C-CCC-CT-T--TA-AA-T-C-G--CC-A---G---T-G---A-T-C-G-T-G--CTC-GC-T-G---CG--CG-TG-CT-CT-CT-CTCT
gi|5382 : CCCCCA-CG-C-CC---T-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---GCTTT-G-T-ATT-C-G-T-G--CGC-GC-TAG---CG--CT-TG-AT-CT-CT-CTCT
gi|5383 : CTCCCA-CG-C-CCC-TT-C--TA-A--TCG-GT-CC-A---G---T-GGT-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TC-CT-CT-CTCT
gi|5384 : CCCCCA-CG-C-CCG-CT-C--TA-AA-TCT-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-----GC-GC-T-GAAACG--CTTTG-TC-TT-CT-CTCT
gi|5385 : CCCCCA-CG-C-CCC-CTAT--TA-AA--AC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-CAG-T-G--CGC-GC-T-T---CG--C--TG--C-CT-CT-CT
gi|5386 : CCCCTA--G-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCCGG--CC-A---G---TAG-TAA-T-C-GAT-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TC-TC-TC-TT-CTCT
gi|5387 : CCCCCC-CC-C-CCC-CA-C--TA-TT-TCC-G--CC-A---G---T-G-TAA-T-C-G-C-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TGCTC-TT-CT-CTCT
gi|5388 : CCCCTA-C--C-CCC-CTAC--TA-AT-ACC-G--CCTA---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C---A-TC-CT-CT-CTCTct
gi|5389 : CCCCC-CG-C-CCC--T-C--TA-AA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GC-T-C---CG--C--TG-TCTCT-C--CTCT
gi|5390 : CCCCA-CG-C-CCC-C--C--TA-AA-TC--G--CC-A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GT-T-G---CG--C--TG-TC-AT-CT-CTCT
gi|5391 : CCTCA-CG-C-CCC-CT-C--TA-AA-TCC-G--CC-AGTTG---T-A-T-A-T-C-G-TCG--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-TG-CT-CT-CTC
gi|5392 : CCCCATCG-C-CCC-TT----TA-AG-TCC-G--CC-C---G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--C-C-GC-G-A---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5393 : CCCCC-CG-C-CCC-TC-T--TATAA-TCC-G--CC-A---G---T-G-T-AAT-C-G-T-G--TGC-GC-T-G---CG--C--TG-TT-CT-CTGCTCT
gi|5394 : CCCCA-TG-C-CCC-CC-CCCTA-AA-TCC-G--CC-A-------------------G-T-G--CGC-GC-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCT
gi|5395 : CCA-CG-CACCC-CT-T--TA-AA-TCC-G--C--A---G---T-G-T-A-T-C-G-T-GCTCGG-GC-T-G---CG--C--TG-TT-CTCCT-CTCT
gi|5396 : G-T-CCC-CC-C--TA-AAATCC-G--C------G---T-G-T-A-T-C-G-T-G--CGC-GG-T-G---CG--C--TG-T--CT-CT-CTCTc