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gi|65700                      : ATATTT-TA-TTG-T-ATCA-T--A--T---A-----------A-----CA-T---ATACCAAA---AGG-TT-CAG-A--ACACAAG--GT--C--CAC----A-CTTA-CGA-GGTTC-TCACCTTGAAT
gi|65701                      : ATATTT-TA-TTG-T-AT-A-T--A--T---ATGAAA------A-----TA-T---A---CAAA---AGG-TT-T-C-A--ACACAAG--TT--CT-GAC----AACTTA-CGA-GGTTC-TCACCTTAAGT
gi|65702                      : ATATTT-TA-TTG-TTAT-A-T--A--TGAAA-----------A-----TAAT---A---CAAA---AGG-TT-C------ACACA-G--TT--CT-GA-----AACTTA-CGA-GGTTC-TCAACTTTAA
gi|65703                      : ATATTT-TA-TTG-TTAT-A-T--A--TGAAA-----------A-----TAAT---A---CAAA---AGG-TT-C------ACACA-G--TT--CT-GA-----AACTTA-CGA-GGTTC-TCAACTTTAA
gi|65704                      : ATATTG-TT-TTG-T-AT-A-T--A--T---A-----------AA----TA-T---A---CAAA---AGG-TTCT-GCA--ACACTAT--TT--CT-AAC----AACTTA-CGA-GGTTC-TCACCTTGAAT
gi|65705                      : ATATTT-TA-TTG-T-AT-A-A--A--TT--C-----------A-----TA-T---A---CAAA---AGG-TT-T-G-A--ACACAAG--TT--CT-TAC----AATTTA-CGG-GGTTC-TCACCT
gi|65706                      : ATATTT-T---TG-T-AT-A-TGAA--T---A-----------A-----TA-CCA-A---CAAA---AGGGTT-T-G-A--ACACAAGCATC--TT-AAC----AACTTAGCGAGGGTTC-TCACC
gi|65707                      : ATATTT-TAATTG-T-AT-A-G--A--A---A-----------A-----CA-TT--A---AAAA---AGG-TT-T-T-G--ACACAAG--CTTGCT-TAC----AACTTA--GA-GGTTA-TCAACT
gi|65708                      :  TATTTGTA-TTA-T-AT-A-T--A--C---G-----------AACA--TA-T---A---CAAA---AG---T-T-G-A--ACACAGG--TT--CT-AAC----AACT-A-CGA-GGTTC-TCACCTTGAAT
gi|65709                      :   ATTT-TA-TTG-T-AT-A-T-----T---C-----------A-----TA-T---A---CTAA---AGG-TT-C-G-A--ACACAAG--TT--CT-AACAATTAACTTA-CGA-GGTTC-TCACCTT
gi|65710                      :      T-TA-TTG-T-AT-A-C--A--T---ATATTT------A-----TA-TTGTA---CAAA---AGA-TT-T-C-A--ACACAAG--TT--CT-TTC----AAATTA-CAG-GGTTC-TCACCTT
gi|65711                      :   aTTT-TG-T-G-T-AT-AAT--A--T---A-----------------TA-T---A---CAAA---AGG-TT-T-G-AGAACACACG--TT--CG-TAC----AAACTG-CGG-GGTTC-TCA
gi|65712                      :              -T-AT-A-A--A--T---AC----------A-----TA-T---A---CAAA---AGG-TT-T-G-A--ACACAAG--TT--CT-TAC----AACTTA-ATG-GGTTC-TCATCT
gi|65713                      :                                                   tataaat---CAAA---AGG-AT-T-G-G--AGACAAG--TT--CT-AAC----AACTTA-CTG-GCTCC-TCTCCTT
gi|65714                      :                                                                         T-T-G-T--ATATAAG--TT--AT-AAC----AACTTA-CGA-GGTTC-TCACCTT


blockSeqs                     :       G  A   G T  C A GA AA ATATATACGAACA          A TGT TAC    CCC   G  C A C GA       GT  TG  AA  AATT      G   G     T
blockSeqs                     :       .  .   G T  C . .  .  AAGAACA                A CA  TAC    CCC   .  . A . .        GT  .   AA  .         .   .     T
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  ACGAACA                . T   .      .     .  . . . .        CA  .   T   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  ATGAAAA                . .   .      .     .  . . . .        .   .   A   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  ATATTTA                . .   .      .     .  . . . .        .   .   G   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  AAGAA                  . .   .      .     .  . . . .        .   .   G   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  AAGAA                  . .   .      .     .  . . . .        .   .   G   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  GAAAA                  . .   .      .     .  . . . .        .   .   C   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  GAAAA                  . .   .      .     .  . . . .        .   .   C   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  GAACA                  . .   .      .     .  . . . .        .   .   G   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  ACA                    . .   .      .     .  . . . .        .   .   G   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  ACA                    . .   .      .     .  . . . .        .   .   G   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  AAA                    . .   .      .     .  . . . .        .   .   A   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  TCA                    . .   .      .     .  . . . .        .   .   T   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  ACA                    . .   .      .     .  . . . .        .   .   A   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  AA                     . .   .      .     .  . . . .        .   .   T   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  AA                     . .   .      .     .  . . . .        .   .   A   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  AA                     . .   .      .     .  . . . .        .   .   A   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  AA                     . .   .      .     .  . . . .        .   .   T   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  AA                     . .   .      .     .  . . . .        .   .   T   .         .   .     .
blockSeqs                     :       .  .   . .  . . .  .  CA                     . .   .      .     .  . . . .        .   .   T   .         .   .     .
blockSeqs                     :              . .  . . .  .  A                      . .   .      .     .  . . . .        .   .   A   .         .   .     .
blockSeqs                     :                                                          .      .     .  . . . .        .   .   A   .         .   .     .
blockSeqs                     :                                                                          . . . .        .   .   .   .         .   .     .


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ATATTT-TA-TTG-T-AT-A-T--A--T---A-----------A-----TA-T---A---CAAA---AGG-TT-T-G-A--ACACAAG--TT--CT-NAC----AACTTA-CGA-GGTTC-TCACCTTGAAT
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Alignments
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lowQualScore                  :       .  .   . .  . . .. .. .....................  . ... ...    ...   .  . . . ..       ..  ..  ..  ....      .   .     .           
lowQualScore                  :       8  8   5 5  5 7 44 44 444444444444444444444  5 222 888    888   7  6 2 6 22       66  22  88  4444      6   6     2           
consensus                     : ATATTT-TA-TTG-T-AT-A-T--A--T---A-----------A-----TA-T---A---CAAA---AGG-TT-T-G-A--ACACAAG--TT--CT-NAC----AACTTA-CGA-GGTTC-TCACCTTGAAT
Reference ( family-637 )      : ATATTT-TA-TTG-T-AT-A-T--A--T---A-----------A-----TA-T---A---CAAA---AGG-TT-T-G-A--ACACAAG--TT--CT-NAC----AACTTA-CGA-GGTTC-TCACCTTGAAT
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gi|65706                      : ATATTT-T---TG-T-AT-A-TGAA--T---A-----------A-----TA-CCA-A---CAAA---AGGGTT-T-G-A--ACACAAGCATC--TT-AAC----AACTTAGCGAGGGTTC-TCACC
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gi|65710                      :      T-TA-TTG-T-AT-A-C--A--T---ATATTT------A-----TA-TTGTA---CAAA---AGA-TT-T-C-A--ACACAAG--TT--CT-TTC----AAATTA-CAG-GGTTC-TCACCTT
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gi|65712                      :              -T-AT-A-A--A--T---AC----------A-----TA-T---A---CAAA---AGG-TT-T-G-A--ACACAAG--TT--CT-TAC----AACTTA-ATG-GGTTC-TCATCT
gi|65713                      :                                                   tataaat---CAAA---AGG-AT-T-G-G--AGACAAG--TT--CT-AAC----AACTTA-CTG-GCTCC-TCTCCTT
gi|65714                      :                                                                         T-T-G-T--ATATAAG--TT--AT-AAC----AACTTA-CGA-GGTTC-TCACCTT