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Reference ( gi|107260 )       : AATTTG-TTGGTTTGT-AA-TTT-TCTTTCATT-CAATTTAA-GTAGG--AGCACCTCTTCATTA-TAGTCATTTT-AAGTTG-TA--GTTTATT---TT-ACCGGTAATTGGAA---ACCA---T-CA-AACA-TA----C--C-----CGC-GAAATTAT--TTT-A-T--GAAAA-CTA-TC--------ATA-TC-----AAA-CGT---CAA--TTAGTGCA-TT-G-AT-AAACCCA---GT--CCT-AAACAAACA
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Reference ( family-633 )      : AATTTGTTTGTT--TGT-AA-TTT-TCTTTCGTT-CAATTTAA-TTAGG--AGCACCTCTTCATTA-TAGTCATTTT-AA-GTTG-TA--GTTTATT---TT-ACCGGTA-TTGG-A---A---ACCA---T-CA-AACA-TA----C--C-----CGC-GNAATTAT--TTT-ATT--AAAA--CTA-TC--------ATA-TC-----AAA-CGT---CAA--TTAGTGCA-TT-G-AT-AAACCCA---GT--CCT-AAACAAACA
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blockSeqs                     :             GT   T  A   G         T        T     TA               G          T  A    TAAC       TATT  A       .    G ATT TTA    CCC A  T    A  ATTGC   CAATA   T A      AG   T   AA    AA   T  ATACCATT   T A AATTG      TTA   AT        T  T A  A      AACT  TA   A
blockSeqs                     :             .    T  .   G         T        .     G                A          .  A    CTA        AA    .       .    . .   C      G   .  .    .  CAC     .       . A      .    .   A     T    T  .          . . A          .     AT        .  . A  G      A     .    A
blockSeqs                     :             .    .  .   .         .        .     .                .          .  .    CTA        T     .       .    . .   .      .   .  .    .  CA      .       . A      .    .   A     .    .  .          . . .          .     G         .  . .  .      A     .    .
blockSeqs                     :             .    .  .   .         .        .     .                .          .  .    AAT        T     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      A     .    .
blockSeqs                     :             .    .  .   .         .        .     .                .          .  .    GC         T     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . A      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      A     .    .
blockSeqs                     :             .    .  .   .         .        .     .                .          .  .    GA         T     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . A      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      A     .    .
blockSeqs                     :             .    .  .   .         .        .     .                .          .  .    TA         T     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . A      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      A     .    .
blockSeqs                     :             .    .  .   .         .        .     .                .          .  .    TC         T     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . T      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      A     .    .
blockSeqs                     :             .    .  .   .         .        .     .                           .  .    GA         T     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      C     .    .
blockSeqs                     :                                                                                      TA         A     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      A     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                 T     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      C     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                 A     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      C     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                 A     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      C     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                 A     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      C     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                 A     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      C     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                 A     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      C     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                 T     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      A     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                 T     .       .    . .   .      .   .  .    .  C       .       . C      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      A     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                    . .   .      .   .  .    .  C       .       . A      .    .   .     .    .  .          . . .          .     .         .  . .  .      T     .    .
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Reference ( family-633 )      : AATTTGTTTGTT--TGT-AA-TTT-TCTTTCGTT-CAATTTAA-TTAGG--AGCACCTCTTCATTA-TAGTCATTTT-AA-GTTG-TA--GTTTATT---TT-ACCGGTA-CTGG-A---A---ACCA---T-CA-AACA-TA----C--C-----CGC-GCAATTAT--TTT-ATT--AAAA--CTA-TC--------ATA-T-C-----AAACGT---CAA--TTAGTGCA-TT-G-AT-AAACCCA---GT--CCT-AAACAAACA
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