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originalCons : TTAAC-----G--A-C-GAC-AGACCC--A-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGT-GC-T--TCTG--CG--CAGAAAA-CCGCG-C-A--T-AT----G---C-A--------AC-TTTC--A-------T---A--GG---CA--T------------AAAC----A-AAA---A----TC----TT----CA-C----------------T--------CT--TTT--AA-G------TATTG--AAAG--TCTAC---GGC-AA--C-A----------------T-------------AT---T-TA-----------G----------A-TC-----A-T--G-AATA-TT--AT--T-TATA-GT-----GG-TGA--CGTTGA
finalCons : TTAAC-----G--A-C-GAC-AGACCC--A-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGT-GC-T--TCTG--CG--CAGAAAA-CCGCG-C-A--T-AT----G---C-A--------AC-TTTC--A-------T---A--GG---CA--T------------AAAC----A-AAA---A----TC----TT----CA-C----------------T--------CT--TTT--AA-G------TATTG--AAAG--TCTAC---GGC-AA--C-A----------------T-------------AT---T-TA----------------------A-TC-----A-T--G-AATA-TT--AT--T-TATA-GT-----GG-TGA--CGTTGA
Alignments
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consensus : TTAAC-----G--A-C-GAC-AGACCC--A-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGT-GC-T--TCTG--CG--CAGAAAA-CCGCG-C-A--T-AT----G---C-A--------AC-TTTC--A-------T---A--GG---CA--T------------AAAC----A-AAA---A----TC----TT----CA-C----------------T--------CT--TTT--AA-G------TATTG--AAAG--TCTAC---GGC-AA--C-A----------------TAT------------TT--A-----------ATC------A-T--G-AATA-TT--AT--T-TATA-GT-----GG-TGA--CGTTGA
Reference ( family-608 ) : TTAAC-----G--A-C-GAC-AGACCC--A-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGT-GC-T--TCTG--CG--CAGAAAA-CCGCG-C-A--T-AT----G---C-A--------AC-TTTC--A-------T---A--GG---CA--T------------AAAC----A-AAA---A----TC----TT----CA-C----------------T--------CT--TTT--AA-G------TATTG--AAAG--TCTAC---GGC-AA--C-A----------------TAT------------TT--A-----------ATC------A-T--G-AATA-TT--AT--T-TATA-GT-----GG-TGA--CGTTGA
gi|5702 : TTAAC-----G--A-C-GAC-AGACCC--A-AT------T--CAA--AAT-T-T-CAT-GC-T--TCTG--CG--CAGAAAA-CCGCG-C-A--T-AT----G---T-A--------AC-TTTC--A-------T---A--GG---CA--T------------AAACA---A-AAA---A----TC----TT----CA-C----------------T--------CT--TTT---A-G------TATTG--AAAG--TCTAG---GGC-AA--G-A----------------TAT------------TT--AG----------AT---------T--T-AATA-TT--AT--T-TATA-GT-----GG-TGA--CGTTGA
gi|5703 : TTAAC-----G--A-C-GAC-AGACCT--A-AG------T--CGA--AAT-T-T-CGT-GC-T--TCTG--CG--CAGAAAA-CCGCG-C-A--T-AT----G---C-A--------AC-TTTT--A-------T---A--GG---CA--T------------AACA----A-AAA---A----TC----TT----CA-T----------------T--------CT--------------------------AG--TCTAC---GGC-AA--C-A----------------TAT------------TT--------------ATC------A-T--G-AATA-TT--AT--T-TATA-GT-----GG-TGA--CGTTGA
gi|5704 : TTAAC-----G--A-C-GAC-AGACCT--A-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGT-GC-T--TCTG--CG--CAGATAA-CCGTG-C-A--T-AT----G---T-A--------AC-TTTC--A-------T---A--GG---CA--T------------AAACTA--A-AAA---A----TC----TT----CA-C----------------T--------CT--TTT--AA-G------TATTG--AAAG--TCTAC---GGC-AA--G-A----------------T-T------------T---------------ATC------A-T--G-AATA-GT--AT--T-TATA-GT-----TG-TGA--CGTTGA
gi|5705 : TTAAC-----G--A-C-GAC-AGACCC--A-AT------T--CGA--A-T-T-T-CGT-GC-T--TCTG--CG--CAGAAAA-CCGCG-C-A--T-AT----G---C-A--------A--TTTC--A-------T---A--GG---CA--T------------AAAC----A-AAA---A----TC----TT----CA-C----------------T--------CT--TTT--AA-A------TATTG--AAAG--TCTAC---GGC-AA--C-A----------------TAT------------TT--AG----------ATT------A-T--A-AATA-TT--AT--T-TATAGGC-----GG-TGA--CGTTGA
gi|5706 : TTAAC-----G--A-C-GAC-AGACCT--A-AT------T--CGA--A-T-T-T-CGTTGC-TATTCTG--CG--CAGAAAA-TCGCG-CCA--TTAT----G---C-A--------AC-TTTC--A-------T---A--GG---CA--T-------------AAC----A-AAA---AAATTTC----TT----CATT----------------T--------CC--TTT--A---------TATTGGAAAGG--TCTAC---GGC-AA--CGA----------------TAT------------TT--------------ATC------A-T--G-AATA-TT--AT--TGTATA-GT-----GG-TGA--CGTTGA
gi|5707 : TTAAC-----G--A-C-GAC-AAATCC--A-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGT-AC-T--TCTG--CG--CAGAAAA--TAAG-C-A--T-AT----G---C-A--------AC-TTTT--A-------T---A--GG---TA--T------------AAACA---A-AAA---A----TC----TT----CA-C----------------T--------CT--TTT--AA-G------TATTG--AAAG--TCTAC---GGC-AA--C-A----------------TAT------------TT--AGATTATAATTCATC------A-T--G-AATA-AT--AT--T-TATA-GT-----GG-TCA--CGTTGA
gi|5708 : TTAAC-----G--A-C-GA---GACT---A-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGT-GC-T--TCTTT-CG--CAGAAAA-CCGCG-C-A--T-AT----G---C-A--------AC-TTTC--A-------T---A--GG---CA--T-------------AAC----A-AAA---A----TCT---TT----CA-TA---------------T--------CT--TT----A-A------TTTTGA-AAAG--TT--C---GGC-AT--A-A----------------TAT------------TT--------------ATC------A-T--G-AATA-TT--AT--T-TATA-GT-----GG-TGA---GTTGA
gi|5709 : TTAAC----------T-GAC-AAGACT--A-AT------T--CGACCAAT-T---CGT----C--TCTG--CG--CAGAAAT-CCGCGAC-A--T-ATT---G---C-A--------A--TTTC--A-------T---A--GG---CA--T------------AAACAG--A-AAA---A----TC----TT----CA-T----------------T--------TC--TTT--AA--------TATTG--AAA---TCTAC---GGC-AA--C-A----------------TAT------------TT--------------GTC------A-T--G-AATG-TT--A---T-GATA-GT-----GGTTGA--CGTT
gi|5710 : TTAAC-----G--A-C-GACTGGACCC--A-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGTGGC-T--TCTG--CG--CAGAAAA--CGCG-C-A--T-AT----G---C-A--------AT-TTTC--A-------T---A--GG---CA--T------------AAAC----A-AAA---A------------------------------------------------------AA-G------TATTG--AAAG--TCTAC---GG--AA--C-A----------------TAT------------TT--AGATTATAATTGATC------A-T--G-AATA-TT--AT--T-TATA-GT-----GG-TGA--CGTTAA
gi|5711 : TTAAC-----G--AAC-GAC-AGACCCT-A-AT------TTTCGA--AAT-T-T-CGT-GC-T--TCTG--CG--TAGAAAA-CCGCG---A--T-AT----G---C-A--------AC---------------------------------------------AACA---A-AAA---A----TCT---TT----CA-T----------------T--------CC--TTT--AATT------TATTT--GAAG--TCTAC---GGC-AA--C-A----------------TAT------------TT--AT----------TTC------A-T--G-AATATTT--AT--T-TATAGGTTG---GG-TGA--CGT
gi|5712 : TTTAC-----G----C-GAC-A-ACCT--ACAT------T--CGA--AAT-T-T--GT-GC-T---CTG--CG--CAGAAAA-C-GCG---A--T-AT----G---C-A--------AC-TTTC--A-------T---T--GG---CA--T------------AAAC----A-AAA---A----TT----GT----CA------------------T--------CT--TTT--AA-T------TAT------GG--TC-AC---GGCAAA--C-A----------------TAT------------TT--------------ATC------A-T--GAAATA-TT--AT--T-TATA-GT-----G---GA--C-TTGA
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gi|5714 : TTAAG-----G--A-C-GAC-AGACCC--A-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGC-GC-T--TCTG--CG--CTGAAAA-ACGCG-C-A--T-AT----G---C-C--------AC-TGTC--A-------T---A--GACATCA--T------------AAA-----A-AAT---A----TC----TA----CA-C----------------T--------CT--CTT--AA-G------AATTG--AAAG--TCTAC---GTC-TA--C-A----------------TATATAGA-------TT--ATAATT------ATC------A-T--G-AATA-TT--AT--
gi|5715 : TTAAG-----G--A-T-GAC-AGACCC--A-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGC-TC-T--TCTG--CG--CAGAAAA-CCGCG-C-A--T-AT----G---C----------AC-TGTC--A-------T---G--GG---CA--T------------AACC----A-
gi|5716 : TTAAC-----G--A-C-GAT-AGACCC--G-AT------T--CGA--AAT-T-T-CGT-GC-T--TCTG--CG--AATAAAA-CCGCG-C-A--T-AA----G---T-A--------AC-TTTC--A-------T---A--GG---C
gi|5717 : TTAAC-----G--A-C-GAC-AGACCC--A-ATTCGAAAT--CGA--AAT-T-T-CGT-GCTT--TCTGGCCGGCTAGAAAACCCGCC-C-AATT-AT----GCCCC-A--------ATAGTTC--A-------TTA-A--GGCC-CA--T------------AAACAAAAA-AAA---A----TCCT--TT----CA-C----------------T--------CTTCTTT--AA-G------TAATGA-AAAG--TTTACCGGGGC-AC--G-A----------------TATTTAAAATTATAATT--A-----------ATC------ATT--G-AATA--T--A---T-TATA-GT-----GG--GA--CGT
gi|5718 : TTAAG-----G--A-C-GAC-AGACCT--A-AT------T--CAA--AAT-G-T-TGT-GC-T--TCTG--CG--CAGAAAA-CCGCG-C-A--T-AT----A---C-C--------AC-
gi|5719 : TTAAA-----G--A-C-GGC-AGA-------AT------T--CGA--AAT-T-T-CTC-GC-T--TCTG--CG--CAGAAAG-CCGGG-T-A--T-AT----GT--C-ATAAATCATAC-TGTC--A-------T---A--GA---CA--G------------AAACAA--A-AAA---A----TC----TA----CA-C-----------------------------------A-C------CATT-----------CAC---GTC-TA--C-A----------------TAT------------TA--T-----------ATT------A-TAGG-GATA-TTTAAC--T-TATA-TT-----GG-TGA--
gi|5720 : TTAACTGAGAG--A-C-GAC-AGACACTAA-AT------T--CGACAAATATAT-CGT-GC-T--ATTG--TG--CAGAATA-CCGCG-C-A--T-AT----G---T-A--------AC-TTTC--ATGCCCCGT---A--GG---CA--TGATGGGGCTACCAAAC----ATAAACATA----TCA---TTAACATA-C----------------T--------CT--TTT--AA-G------TATTG--AAAGGTTCTAC---GGT-AA--G-AGAGTTAAAAGCTGATTTATAAA---------TT--A-----------ATTCTACAAA-T--G-AATA-TT--ATAAT-TATA-GTAGGTAGG-TGAATCGTT
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gi|5727 : G--CAGAATA---GCG-C-A--T-AT----G---C-A--------AC-TTTC--A-------T---A--GA---CACCT------------TAAC----A-AAAC--A----TC----TT----CA-C----------------T--------TT--TTT--AA-G------CATTG--AAAG--TCTAC---GGC-AA--C-A----------------TACATGTATATGAAATT--ATAAAT------ATC------A-T--G-AAT--TT--AT--T-TATA-GT------G-TGA--CGTTGA
gi|5728 : ----A-AAA---A----TCGCATTT----CA-T----------------TGCATAGACCC--TTT--AA-G------CATTG--AAAGA-TTTA----GAT-TA--T-A-----------------AT------------TT--A------------TC------A-T--G-GATA-TT--AT--T-TATA-GT-----GG-TGA--CGTTGA