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gi|59268 : AAATGAAG-T--TCTACAACGGCA--T-TTACA-T-TAT---ATTT-G-G-TTCC-A---A-CAT-A--G-TTTTTTCT--AAC-------TA-TT-TCGCA-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-AAAAAA----------TATTTGCT--GG-C-T--T-C--AA--T-G---A---AA--ATG-G-C-G-TTTTA-A-GT-AG---G-------TCC----AA-A-A-T--G-CG-A-T-T-CAA-A-A-TA-G-G-C--GGA---C---C-C--A-A----ATTTTTTTCCAAATT
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Alignments
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Reference ( family-606 ) : AAAAAAAC-T--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TATT-TATTT-G-G-T-CC-A---G-CAT-A--G-TTTTTT----AACC------TA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--NC--G-AAAAAA----------TAT--GCT--GG-C-C--T-C--A---T-G---A---AA--ATG-G-C-N-TT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-T--G-G-C--GGA---C-A-C-C--A-A----A-TTTTTCCCAAATTT
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gi|59274 : AATAAG-T--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TACTGTATTT-G-GGT-CC-A---A-C-T-G-----TTTTT----AACC------TA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G--AAAAA----------TAT--GCTTGAG-C-CT-T-C--A---TGG---A---AA--ATG-GCC-G-TT--A-C-GT-AG---G-------T-C----AA-A-ATT-GG-CG-A-T-T-C-A-A-A-T--G-G-C--GGA---CGA-C-C--A-A----A-TTTT--CCAAATT
gi|59275 : AAGT-T--TCTA--ACGGCA--TCTTA-A-TATATA-TATTT-G-G-T-CCCA---A-CA--A--G-TTTCTT----AAC-------TA-TT--CG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--ACACG-AAAAAT----------TAT--GCT--GGAC-C--T-T--ACAAT-G---A---AA--ATG-G-C-GATT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AA-A-A-T--G-CGAA-T-T-CAA-A-A-T--G-G-CCGGGA---C-A-CTC--A-A----A-TTTTCTCCAAA
gi|59276 : -T--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-T--T-TATTT-G-G---CC-A---A-CAT-A--G-TCTTTT----AAC-------TA-TTGTCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-AAAAAACT--------TAT--GCT--GC-C-T--T-CATA---T-G---A---AA--AT--G-C-G-TT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AACA-A-TCGC-CG-A-T-T-CAA-A-A-T----G-C---GA---C-A-C-TCGA-A----A-TTTTCTCCAAA
gi|59277 : --TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TA-T-TATTTGG-G-T-CC-A---A-CTT-A--G-TTTTTT----AACT------AA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-----AA----------TTT--GC---GG-C-CATT-CA-A---T-GGATA---AA--ATG-G-CGC-TT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-T--G-G-C--GGA---C-A-C-C--A---------TTTTTCCAAAT
gi|59278 : --TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TA-T-TATTTGG-G-T-CC-A---A-CTT-A--G-TTTTTT----AACT------AA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-----AA----------TTT--GC---GG-C-CATT-CA-A---T-GGATA---AA--ATG-G-CGC-TT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-T--G-G-C--GGA---C-A-C-C--A---------TTTTTCCAAAT
gi|59279 : A--ACGGCAATC-TTACA-T-TAAT-TATTT-G-G-T-CC-A---A-CAT-A--G-TTTT-T----AACC------TA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-AAAAAA----------TAT--GCT--GG-C-C--TGCA-A---TAG---A---AA--ATGAG-CGG-TT--A-G-GTAAG---G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CGAA-T-T-CAA-C-A-T--G-G-C--GGA---CAA-C-C--A-A----A-TTTTTTCCAAATT
gi|59280 : TT-TAT---G-G-TTCC-A---G-CAT-ATAG-TTTTTTTCGTAATCCGGGCTTA-TT-TTG-A-GTAT-GC-T-GAT----C--CT--G-AAAAAA----------TAT--GCT--GG-C-CCTT-CTGA---T-A---AGT-AG--ATG-G-CTT-TT--A-A-GT-TGCCTG-------T-TTGAGAA-A-C-T-GGTCG-A-T-T-CAATA-ATT--G-GTC--GGATC-T-A-C-CCTA-A----A-TTGTTCCCAAATTT
gi|59281 : tttaatttatgctatgt-G---A---AA--ATT-G-G-G-TT--ACA-GT-AG---GGCGTCTGC-C----AA-A-T-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-TTCG-G-C--GGA---C-A-C-C--A-A----T-TGTTTTCCAAATT
blockSeqs : CA CT CA AT C C C A CTGT A A G T C ATGG G TA T TCGT CCGGGCT T C C A G T G TTTC TAG AC A TATTGTCACT TT TG T T AT T AT CAA G GAT CAA TC A C GA TT C C A CCT GCGTCTG C TGAG C C T G G A T C C G C T TC C G CG TCC G T A CG C ACCC T C
blockSeqs : T . . . . C . . TTT G . . T . AC . A . TT C C G . . . . . GG A . . CT . . A . AT T TG A A GAT GT . . C GC . . . . C A C A . . . G T A . . . T . T A . T . TC A . T CT . . T C
blockSeqs : C . . . . . . . TTT G . . . . A . . . CT C . . . . . . . . C . . . . . . . CT T A . . A . . . . GC . . . . . . T A . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T C
blockSeqs : C . . . . . . . TTA . . . . . G . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . T G A . . . . . . . GG . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C
blockSeqs : C . . . . . . . ATT . . . . . G . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . T . A . . . . . . . TT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : C . . . . . . . TTT . . . . . G . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : C . . . . . . . ATT . . . . . G . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
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blockSeqs : . . . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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originalCons : AAAAAAAC-T--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TATT-TATTT-G-G-T-CC-A---G-CAT-A--G-TTTTTT----AACC------TA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--NC--G-AAAAAA----------TAT--GCT--GG-C-C--T-C--A---T-G---A---AA--ATG-G-C-N-TT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-T--G-G-C--GGA---C-A-C-C--A-A----A-TTTTTCCCAAATTT
finalCons : AAAAAAAC-T--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TATT-TATTT-G-G-T-CC-A---G-CAT-A--G-TTTTTT----AACC------TA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--NC--G-AAAAAA----------TAT--GCT--GG-C-C--T-C--A---T-G---A---AA--ATG-G-C-N-TT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-T--G-G-C--GGA---C-A-C-C--A-A----A-TTTTTCCCAAATTT
Alignments
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gi|59270 : AAATAAG-T--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TTAT-TATTT-G-G-T-CC-A---A-CAT-A--G-TTTTTT----AACC------TA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-AAAAAA----------TAT--GCT--GG-C-CT-T-C--A---T-G---A---AA--ATG-G-C-G-TT--A-A-GT-AG---G-------T-CA---AA-A-A-T-GG-CG-A-T-TCCAA-A-A-T--G-G-C--GGA---C-A-C-C--A-A----A-TTTTT-CCAAATT
gi|59271 : AAATAAG-T--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TATT--ATTT-G-G-T-CC-A---A-CAT-A--G-TTTTTT----AACC------TA-TT--CG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-AAAAAA----------TAT--GCT--GG-C-C--TTC--A---T-G---A---AA--ATG-G-C-G-T-----A-GT-AG---G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-T--G-G-C--GGA---C-A-C-CA-A-A----A-TTTTTTCCAAATT
gi|59272 : AAAAAACAT--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TATT--ATTT-G-G-T-CT-A---G-CAT-A--G-TTTTTT----AAC-------TA-TT-T-G-A-GTAT-GC-T-GAA--------C--G-AAAAAT----------TAT--GCT--GG-C-C--TTC--A---T-G---A---AA--ATG-G-C-T-TT--A---GT-AG---G-------TTC----AA-A-A-T-GGGCG-A-T-T-CAA-A-A-T--G-GGC--GGA---C-A-C-C--A-A----A-TTTTTCCCAAATTT
gi|59273 : AAATAAG-T--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TA-T-TATTT-G-G-T-CC-A---ACCAT-A--G-TTTTTT----AACC------TA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----TTAGC--G-AAAAAA----------AA----CT--GG-C-T--T-C--A---T-G---A---AA--ATG-G-C-G-TT--A-A--T-A----G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-T--G-G-C--GGA---C-A-C-C--A-A----A-TTTTTCCAAAATT
gi|59274 : AATAAG-T--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TACTGTATTT-G-GGT-CC-A---A-C-T-G-----TTTTT----AACC------TA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G--AAAAA----------TAT--GCTTGAG-C-CT-T-C--A---TGG---A---AA--ATG-GCC-G-TT--A-C-GT-AG---G-------T-C----AA-A-ATT-GG-CG-A-T-T-C-A-A-A-T--G-G-C--GGA---CGA-C-C--A-A----A-TTTT--CCAAATT
gi|59275 : AAGT-T--TCTA--ACGGCA--TCTTA-A-TATATA-TATTT-G-G-T-CCCA---A-CA--A--G-TTTCTT----AAC-------TA-TT--CG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--ACACG-AAAAAT----------TAT--GCT--GGAC-C--T-T--ACAAT-G---A---AA--ATG-G-C-GATT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AA-A-A-T--G-CGAA-T-T-CAA-A-A-T--G-G-CCGGGA---C-A-CTC--A-A----A-TTTTCTCCAAA
gi|59276 : -T--TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-T--T-TATTT-G-G---CC-A---A-CAT-A--G-TCTTTT----AAC-------TA-TTGTCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-AAAAAACT--------TAT--GCT--GC-C-T--T-CATA---T-G---A---AA--AT--G-C-G-TT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AACA-A-TCGC-CG-A-T-T-CAA-A-A-T----G-C---GA---C-A-C-TCGA-A----A-TTTTCTCCAAA
gi|59277 : --TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TA-T-TATTTGG-G-T-CC-A---A-CTT-A--G-TTTTTT----AACT------AA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-----AA----------TTT--GC---GG-C-CATT-CA-A---T-GGATA---AA--ATG-G-CGC-TT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-T--G-G-C--GGA---C-A-C-C--A---------TTTTTCCAAAT
gi|59278 : --TCTA--ACGGCA--T-TTA-A-T-TA-T-TATTTGG-G-T-CC-A---A-CTT-A--G-TTTTTT----AACT------AA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-----AA----------TTT--GC---GG-C-CATT-CA-A---T-GGATA---AA--ATG-G-CGC-TT--A-A-GT-AG---G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-T--G-G-C--GGA---C-A-C-C--A---------TTTTTCCAAAT
gi|59279 : A--ACGGCAATC-TTACA-T-TAAT-TATTT-G-G-T-CC-A---A-CAT-A--G-TTTT-T----AACC------TA-TT-TCG-A-GTAT-GC-T-GAA----T--AC--G-AAAAAA----------TAT--GCT--GG-C-C--TGCA-A---TAG---A---AA--ATGAG-CGG-TT--A-G-GTAAG---G-------T-C----AA-A-A-T-GG-CGAA-T-T-CAA-C-A-T--G-G-C--GGA---CAA-C-C--A-A----A-TTTTTTCCAAATT
gi|59280 : TT-TAT---G-G-TTCC-A---G-CAT-ATAG-TTTTTTTCGTAATCCGGGCTTA-TT-TTG-A-GTAT-GC-T-GAT----C--CT--G-AAAAAA----------TAT--GCT--GG-C-CCTT-CTGA---T-A---AGT-AG--ATG-G-CTT-TT--A-A-GT-TGCCTG-------T-TTGAGAA-A-C-T-GGTCG-A-T-T-CAATA-ATT--G-GTC--GGATC-T-A-C-CCTA-A----A-TTGTTCCCAAATTT
gi|59281 : tttaatttatgctatgt-G---A---AA--ATT-G-G-G-TT--ACA-GT-AG---GGCGTCTGC-C----AA-A-T-T-GG-CG-A-T-T-CAA-A-A-TTCG-G-C--GGA---C-A-C-C--A-A----T-TGTTTTCCAAATT