lowQualScore : 11111111 222
lowQualScore : 6 22 3 333 1 8 1 00000000 1 5555 3 1 1 1 22 3 1 99999 22 999 88 55 44 1 1 1 1 1 1 77777777777 44 3 444444 333 22 44 1 333 3 22 33 44 2 2
lowQualScore : . .. . ... . . . ........ . .... . . . . .. . . ..... .. ... .. .. .. . . . . . . ........... .. . ...... ... .. .. . ... . .. .. .. . .
lowQualScore : 9 33 5 111 7 9 6 22222222 6 0000 2 6 6 6 22 2 6 00000 22 222 88 44 22 5 5 5 5 5 7 66666666666 11 5 000000 000 44 88 7 000 5 44 00 11 0 0
consensus : TTTTTATG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T--G--A--C-T-T--G--AA--ATC-G-C-CCC-TA-T-AT-T-T-TCCC-C--TT-ATT-C----CG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
Reference ( gi|102713 ) : TTTTCATG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T--A--A--C---T--G--AA--ATC-G-C-CCC-TA-T-AT-T-T-TCCT-C--TT-ATT-C----CG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102712 : TTTTTATG-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--A-A-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAC--AT-TG-T--G--A--C---T--G--AA--ATT-G-T-CCC-TA-T-AT-C-T-TCTC-C--TT-ATT-C----CG---A--T--T-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102715 : TTTTTATT-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--T-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--GT-TG-T--G--A--CTT-T--G--AA--ATC-G-C-CCC-TA-T-AT-T-T---CC-C--TT-ATTCC----CG---A--T--C-T---TCACT-G---G-TTTT--AGGAAAAT--CA-ATCTAcatgat
gi|102717 : TTTTAATG-TA-TA--A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-T-AT--AT-TG-T--G--A--CTT-T--G--AA--ATC-G-C-CGC-TAGT-AT-T-T-TTCTCC--TT-ATT-C----CG---A-----C-T---TC-CTGG--CG-TTTTAAAGGACCATC-CA-ATCTAcataat
gi|102716 : tTTTCTATG-TA-TAT-A-A-TATA-TG---A--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T--G--A--CCT-T--G--AA--ATC-G-C-ACC-TA-T-ATAT-TATCCT-C--A--ATT-C----T----A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--TGGAACATC-CA-ATCTAcataa
gi|102718 : TTTTTA-G-TA-TAG-A-CCTATA-TG---T--T-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-T-AT--GT-TG-T--G--A--C---T--GT-AA--ATC-GGC-CCC-TA-T-AC-T-T-CTTC-C--TT-ATT-C----CG---A--T--C-T---TCAC--G--CG-TTTA--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102714 : TTTTTAAG-TA-TAG-A-A-TGTA--G---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T--A--A--CTT-T--G--AA--ATC-G-C-CCC-TA-T-ATAT-T-TC---C--TT-ATT------CG---ACTT--G-T---TGACT-G--C--TTTT--A-GAACATC-CA-ATCcataa
gi|102720 : TTTTAATG-TACTAGTA-A-TATA-TG---T--T-G-TTT---GAT-A-TTCAT-AATCCA--GT-TG-T--GGGA--C---TTTG--AA--ATC-G-C-CCA-TA-T-CT-T-C-TCCT----TT-ATT-T----TG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CC-ATCTatactaat
gi|102719 : tTTTTTATG-TAATAG-G-A-T-TA-TG---T--T-G-TTTTATG-T-A-TTCATCA-TCAT--GT-TG-T--G--A--C---TTTG--AA--ATC-G-C-CCC-TA-T-AA-T-C-TCTC-C--TT-ATT-C----CG---A--T--C-T---TCACT-AGCCGTTTTT--AGGAATATC-C--ATCTAtacataat
gi|102721 : TTTTTA-G-TA--AG-ATA-T-TA-TG---T--A-G-CT----GAT-AATTCAT-A-TCAT--AT-TG-T--G--A--CTCTT--GC-AA--ATC-G---CCC-TA-T-AG-C-T-CTCT-C---T-ATT-C---------A--T--C-T---TCACT-G------TTT--AGGAACATC-CA-ATCTcataa
gi|102723 : TTTCTATG-TA-TTG-A-C-T-TA-TG---A--AAG-TT----GAT-A-GTCAT-A-TTAT--AT-TT-TTGA--C--C---T--AGAAA--ATC-G-C-CCC--A-T-AA-T-C-TTCT-C--TA-ATT-AGGTGCG---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAgacataat
gi|102724 : TTTCTATGATA-TAG-A-A-ATTAATG---A--A-A-TT----GAT-A-TTC-T-A-TTAT---T-TG-T--G--A--C---T--T--GA--ATCTG-C-CCC--A-T-AA-TAT-TCCC-C--TT-ATT-C----CGGTTA--T--T-TCCATCACT-G--CG-TTTTT-AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102722 : TTTCTAT--TA-TAA-G-A-T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-TTCCT-A-TTTT---T-TG-T--G--A--CCT-T--G--AA--ATT-G-C-CC---A-T-AT-T-T-CTC--C--TT-ATT-C----CG---A--T--C-A---TCACT-G--CG--TTT--AGG---ACC-CA-ATCTAcaataat
gi|102729 : TTCTTATA-TT-TTG-T-A-TGTG-TG---A--G-G-TT----GAA-A-TTCAT-A-TAAT--AT-TG-T--G--A--CAT-T--G--AA--ATT-G-C-CCC-TA-cataat
gi|102726 : TTTTTAT---A-TAG-----TGTG-CG---TTAA-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TCAT--AT-TG-T--G--G--CTT-T--G--AA--ATC-A-T-CCC-TA-
gi|102727 : TTTTTAT---A-TAG-T-A-TGCG-CT---A--A-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TTAT--AT-TG-T--A--A--CTT-T--G--AA--ATC-A-T-CC-------------------C--TT-ATC-C----AA---G--T--C-T---TTGGT-G--CG-TTTT--A
gi|102730 : TTTCTATT-TA-TAG-T-A-TGTG-TG---A--T-G-TT----GAT-A-T----------T--AT-TA-T--G--G--CCT-T--G--AA--ATC-G-T-CCC-T--T-AA-T-T-CTCT-C---G-ATC-C----TG---A--T--C-A---TCACT-G--C--TTTT--Ataattgaatattctcatataat
gi|102731 : TTTTAAG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T--A--A--CTT-T--G--AA--ATC-G-C-CCC-TA-T-AT-A-T-TCTC-C--TT-ATT-C----CG---A--T--T-T---TGACT-G--CG-TTTT--A-GAACATC-CA-ATCTA
gi|102732 : TTCTATG-TA-TAA-G-A-T------------A-G-TT----GAT-A-T-CA--A-TCATTGATGTG-T--G--A--C---TTTG--AA--ATC-G-C-CCC-TA-T-CT-C-T-TCTC-C--TA-ATT-C----CG---A--T--C-A---TCTCTGG--CG-TTTT--AGG-ATATCGCA-ATTTcataat
gi|102734 : TTTATG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T--A--C--T---T--G--GATAATC-G-C-CCA-T--T-AT-C-T-TCTC-C--TTAATT-C----CG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTActacata
gi|102733 : TTTATG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T--A--C--T---T--G--GATAATC-G-C-CCA-T--T-AT-C-T-TCTC-C--TTAATT-C----CG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTAtataat
gi|102725 : ATG-TA-TTG-A---T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-ATCAT-A-TTA---AT-TG-T--G--A--CCT-T--G--AA---TC-G-C-CTC-CA-T-AT-C-T-TC-T-C--TA-ATTTC----CG---A--T--CAT---GCACT-G--CG-TTTT--AGGAAC-TC-CATATCTAtataat
gi|102735 : tctctTA-TA-TAG-T-G-TGTG-CG---A--A-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T--GATA--T---T--A--AA--ATC-G-C-CCC-TA-G-A---------T-C--TG-ATC-C----CA---A--T--C-A---TCACT-G--CA--TTT--AGGAAAATC-TA-cgttaat
gi|102728 : tt-TA-CAT-A-A-TATG-TG---T--A-A-CT----GGC-A-TTCAT-A-TTGT--AT-TG-T--G--A--CAA-T--G--AA--TTC-A-C-CCT-TC-G-AT-G-G-T-CT-CGATC-ATT-----------A-----C-T---GCACT-G--CA-CTTT--AGGGAAATC-TA-ATCTttttgaata
gi|102736 : tttctagcGTA-TGGCAT--ACG-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--ATCTG-T--G--GTTT---T--G--AA--ATA-A-C-CCCATA-T-A
gi|102737 : TA-TG---T--A-GGCT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TGCT--G--A--C---TTTG--AA--ATC-G-CTCCC-TA-TTAT-T-C-TTCT-CC-TT-AAT-T----CG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGG-ACATC-CA-
gi|102738 : A--ATC-G-C-CCC-AT-T-AT-C-T-TCTC-C--TT-ATT-C----CG---A--T--A-T---TCACT-G--CG-TTTT--Attacata
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 5555 3 222 1 8 1 99999999 1 4444 3 1 1 1 22 3 1 1 22 55 5 7 33 44 1 1 222 1 3 1 555 555 5 22 1 3333 222 22 44 1 222 3 22 44 22 1 1
lowQualScore : .... . ... . . . ........ . .... . . . . .. . . . .. .. . . .. .. . . ... . . . ... ... . .. . .... ... .. .. . ... . .. .. .. . .
lowQualScore : 4444 3 666 7 1 5 22222222 5 8888 1 5 5 5 11 1 5 5 11 22 4 7 77 11 5 5 777 5 2 6 999 777 0 33 7 5555 999 33 66 7 999 3 33 11 33 9 9
consensus : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCCT--A-T-A-T-T-TTC--TCCTT-A--TT-C----CG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
Reference ( family-605 ) : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCCT--A-T-A-T-T-TTC--CCCTT-A--TT-C----CG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102712 : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--A-A-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAC--AT-TG-T-G--A--C-T--G--AA--ATTG-T-CCCT--A-T-A-T-C-TTC--TCCTT-A--TT-C----CG---A--T--T-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102713 : TTTTCA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-A--A--C-T--G--AA--ATCG-C-CCCT--A-T-A-T-T-TTC--CTCTT-A--TT-C----CG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcatgat
gi|102714 : TTTTTA-AG-TA-TAG-A-A-TGTA--G---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T-A--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CCCT--A-T-A-TAT-TT----CCTT-A--TT------CG---ACTT--G-T---TGACT-G--C--TTTT--A-GAACATC-CA-ATC
gi|102715 : TTTTTA-TT-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--T-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--GT-TG-T-G--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CCCT--A-T-A-T-T-T----CCCTT-A--TTCC----CG---A--T--C-T---TCACT-G---G-TTTT--AGGAAAAT--CA-ATCTAatactaat
gi|102716 : TTTCTA-TG-TA-TAT-A-A-TATA-TG---A--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--CCTT-G--AA--ATCG-C-ACCT--A-T-A-T-A-TTA--TCCTC-A--AT-T----CT---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--TGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102717 : TTTTTAATG-TA-TA--A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-T-AT--AT-TG-T-G--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CGCT--AGT-ATT-T-TTC--TCCTT-A--TT-C----CG---A-----C-T---TC-CTGG--CG-TTTTAAAGGACCATC-CA-ATCTAcataat
gi|102718 : TTTTTA--G-TA-TAG-A-CCTATA-TG---T--T-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-T-AT--GT-TG-T-G--A--C-TG-T--AA--ATCGGC-CCCT--A-T-A-C-T-TCT--TCCTT-A--TT-C----CG---A--T--C-T---TCAC--G--CG-TTTA--AGGAACATC-CA-ATCTAcataa
gi|102719 : TTTTTA-TG-TAATAG-G-A-T-TA-TG---T--T-G-TTTTATG-T-A-TTCATCA-TCAT--GT-TG-T-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCCT--A-T-A-A-T-CTC--TCCTT-A--TT-C----CG---A--T--C-T---TCACT-AGCCGTTTTT--AGGAATATC-C--ATCTAcataa
gi|102720 : TTTTTAATG-TACTAGTA-A-TATA-TG---T--T-G-TTT---GAT-A-TTCAT-AATCCA--GT-TG-T-GGGA--C-TTTG--AA--ATCG-C-CC----A-T-A-T-C-TTC--TCCTTTA--TT-T----TG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CC-ATCTcataa
gi|102721 : TTTTTA--G-TA--AG-ATA-T-TA-TG---T--A-G-CT----GAT-AATTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--ACTC-TT-GC-AA--ATCG---CCCT--A-T-A---G-CTC--TCTCT-A--TT-C---------A--T--C-T---TCACT-G------TTT--AGGAACATC-CA-ATCTtacataat
gi|102722 : TTTCTA-T--TA-TAA-G-A-T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-TTCCT-A-TTTT---T-TG-T-G--A--CCTT-G--AA--ATTG-C-CC----A-T-A-T-T-T-C--TCCTT-A--TT-C----CG---A--T--C-A---TCACT-G--CG--TTT--AGG---ACC-CA-ATCTAgacataat
gi|102723 : TTTCTA-TG-TA-TTG-A-C-T-TA-TG---A--AAG-TT----GAT-A-GTCAT-A-TTAT--AT-TT-TTG--A--C-CT-AGAAA--ATCG-C-CCC---A-T-A-A-T-CTT--CTCTA-A--TT-AGGTGCG---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102724 : TTTCTA-TGATA-TAG-A-A-ATTAATG---A--A-A-TT----GAT-A-TTC-T-A-TTAT---T-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--TCTG-C-CCC---A-TAA-T-A-TTC--CCCTT-A--TT-C----CGGTTA--T--T-TCCATCACT-G--CGTTTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102725 : TCTCTA-TG-TA-TTG-A---T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-ATCAT-A-TTA---AT-TG-T-G--A--C-CT-T--GA--ATCG-C-CTCC--A-T-A-T-C-TTC--TC--T-AATTT-C----CG---A--T--CAT---GCACT-G--CG-TTTT--AGGAAC-TC-CATATCTAcaataat
gi|102726 : TTTTTA-T---A-TAG-----TGTG-CG---TTAA-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TCAT--AT-TG-T-G--G--CTTT-G--AA--ATCA-T-CCCT--A-cgttaat
gi|102727 : TTTTTA-T---A-TAG-T-A-TGCG-CT---A--A-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TTAT--AT-TG-T-A--A--CTTT-G--AA--ATC----------A-T------------CCCTT-A--TC-C----AA---G--T--C-T---TTGGT-G--CG-TTTT--A
gi|102728 : TTTCTA-GC-TA-CAT-A-A-TATG-TG---T--A-A-CT----GGC-A-TTCAT-A-TTGT--AT-TG-T-G--A--CAAT-G--AA--TTCA-C-CCTTCGA-T-G-G-T-CTCGATCATT-A---------------------C-T---GCACT-G--CA-CTTT--AGGGAAATC-TA-ATCTtaattgaatattctcatataat
gi|102729 : TTCTTA-TA-TT-TTG-T-A-TGTG-TG---A--G-G-TT----GAA-A-TTCAT-A-TAAT--AT-TG-T-G--A--CATT-G--AA--ATTG-C-CCCT--A-
gi|102730 : TTTCTA-TT-TA-TAG-T-A-TGTG-TG---A--T-G-TT----GAT-A-T----------T--AT-TA-T-G--GC-C-TT-G--AA--ATCG-T-CCCT--T-A-A-T-T-CTC--TC--G-A--TC-C----TG---A--T--C-A---TCACT-G--C--TTTT--A
gi|102731 : TTTTA-AG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T-A--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCCT--A-T-A-T-A-TTC--TCCTT-A--TT-C----CG---A--T--T-T---TGACT-G--CG-TTTT--A-GAACATC-CA-ATCTA
gi|102732 : TTCTA-TG-TA-TAA-G-A-T------------A-G-TT----GAT-A-T-CA--A-TCATTGATGTG-T-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCCT--A-T-C-T-C-TTC--TCCTA-A--TT-C----CG---A--T--C-A---TCTCTGG--CG-TTTT--AGG-ATATCGCA-ATTTcataat
gi|102733 : TTTA-TG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T----A--C-TT-G--GATAATCG-C-CCAT----T-A-T-C-TTC--TCCTTAA--TT-C----CG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTActacata
gi|102734 : TTTA-TG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T----A--C-TT-G--GATAATCG-C-CCAT----T-A-T-C-TTC--TCCTTAA--TT-C----CG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTAtataat
gi|102735 : TTTA-T---A-TAG-T-G-TGTG-CG---A--A-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--TATT-A--AA--ATCG-C-CCCT--A-G-A-T----------CTG-A--TC-C----CA---A--T--C-A---TCACT-G--CA--TTT--AGGAAAATC-TA-tataat
gi|102736 : GTA-TGGCAT--ACG-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--ATCTG-T-G--GT-T-TT-G--AA--ATAA-C-CCC---A-T-A-T-ttttgaata
gi|102737 : TA-TG---T--A-GGCT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TGCT-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-CTCCCT--A-TTA-T-TCTTC--TCCTT-A--AT-T----CG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGG-ACATC-CA-a
gi|102738 : A--ATCG-C-CCCA--T-T-A-T-C-TTC--TCCTT-A--TT-C----CG---A--T--A-T---TCACT-G--CG-TTTT--Attacata
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 5555 3 222 1 8 1 99999999 1 4444 3 1 1 1 22 3 1 1 22 55 5 7 33 44 1 1 2222 1 3 1 66 22 22 5 22 1 1 222 22 44 1 222 3 22 44 22 1 1
lowQualScore : .... . ... . . . ........ . .... . . . . .. . . . .. .. . . .. .. . . .... . . . .. .. .. . .. . . ... .. .. . ... . .. .. .. . .
lowQualScore : 4444 3 666 7 1 5 22222222 5 8888 1 5 5 5 11 1 5 5 11 22 4 7 77 11 5 5 3333 5 2 6 00 33 33 0 33 7 7 999 33 66 7 999 3 33 11 33 9 9
consensus : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCC-T--A-T-A-TC-TTC--TCC--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
Reference ( family-605 ) : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCC-T--A-T-A-TT-TTC--TCC--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102712 : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--A-A-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAC--AT-TG-T-G--A--C-T--G--AA--ATTG-T-CCC-T--A-T-A-TC-TTC--TCC--TT-A--T-T-CCG---A--T--T-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102713 : TTTTCA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-A--A--C-T--G--AA--ATCG-C-CCC-T--A-T-A-TT-TTC--CTC--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcatgat
gi|102714 : TTTTTA-AG-TA-TAG-A-A-TGTA--G---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T-A--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CCC-T--A-T-A-TA-TT---TCC--TT-A--T-T--CG---ACTT--G-T---TGACT-G--C--TTTT--A-GAACATC-CA-ATC
gi|102715 : TTTTTA-TT-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--T-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--GT-TG-T-G--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CCC-T--A-T-A-TT-T----CCC--TT-A--T-TCCCG---A--T--C-T---TCACT-G---G-TTTT--AGGAAAAT--CA-ATCTAatactaat
gi|102716 : TTTCTA-TG-TA-TAT-A-A-TATA-TG---A--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--CCTT-G--AA--ATCG-C-ACC-T--A-T-A-TA-TTA--TCC--TC-A--A-T-TCT---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--TGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102717 : TTTTTAATG-TA-TA--A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-T-AT--AT-TG-T-G--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CGC-T--AGT-ATTT-TTC--TCC--TT-A--T-T-CCG---A-----C-T---TC-CTGG--CG-TTTTAAAGGACCATC-CA-ATCTAcataat
gi|102718 : TTTTTA--G-TA-TAG-A-CCTATA-TG---T--T-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-T-AT--GT-TG-T-G--A--C-TG-T--AA--ATCGGC-CCC-T--A-T-A-CT-TCT--TCC--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCAC--G--CG-TTTA--AGGAACATC-CA-ATCTAcataa
gi|102719 : TTTTTA-TG-TAATAG-G-A-T-TA-TG---T--T-G-TTTTATG-T-A-TTCATCA-TCAT--GT-TG-T-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-T--A-T-A-AT-CTC--TCC--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-AGCCGTTTTT--AGGAATATC-C--ATCTAcataa
gi|102720 : TTTTTAATG-TACTAGTA-A-TATA-TG---T--T-G-TTT---GAT-A-TTCAT-AATCCA--GT-TG-T-GGGA--C-TTTG--AA--ATCG-C-CC-----A-T-A-TC-TTC--TCC--TTTA--T-T-TTG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CC-ATCTcataa
gi|102721 : TTTTTA--G-TA--AG-ATA-T-TA-TG---T--A-G-CT----GAT-AATTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--ACTC-TT-GC-AA--ATCG---CCC-T--A-T-A--G-CTC--TCT--CT-A--T-T-C-----A--T--C-T---TCACT-G------TTT--AGGAACATC-CA-ATCTtacataat
gi|102722 : TTTCTA-T--TA-TAA-G-A-T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-TTCCT-A-TTTT---T-TG-T-G--A--CCTT-G--AA--ATTG-C-CC-----A-T-A-TT-T-C--TCC--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-A---TCACT-G--CG--TTT--AGG---ACC-CA-ATCTAgacataat
gi|102723 : TTTCTA-TG-TA-TTG-A-C-T-TA-TG---A--AAG-TT----GAT-A-GTCAT-A-TTAT--AT-TT-TTG--A--C-CT-AGAAA--ATCG-C-CCCAT--A---A-TC-TTC--TCTAATT-A--GGT-GCG---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102724 : TTTCTA-TGATA-TAG-A-A-ATTAATG---A--A-A-TT----GAT-A-TTC-T-A-TTAT---T-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--TCTG-C-CCC----A-TAA-TA-TTC--CCC--TT-A--T-T-CCGGTTA--T--T-TCCATCACT-G--CGTTTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102725 : TCTCTA-TG-TA-TTG-A---T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-ATCAT-A-TTA---AT-TG-T-G--A--C-CT-T--GA--ATCG-C-CTC-C--A-T-A-TC-TTC--TC----T-AATT-T-CCG---A--T--CAT---GCACT-G--CG-TTTT--AGGAAC-TC-CATATCTAcaataat
gi|102726 : TTTTTA-T---A-TAG-----TGTG-CG---TTAA-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TCAT--AT-TG-T-G--G--CTTT-G--AA--ATCA-T-CCC-T--A-cgttaat
gi|102727 : TTTTTA-T---A-TAG-T-A-TGCG-CT---A--A-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TTAT--AT-TG-T-A--A--CTTT-G--AA--ATCA-T-C---------------------CC--TT-A--T-C-CAA---G--T--C-T---TTGGT-G--CG-TTTT--A
gi|102728 : TTTCTA-GC-TA-CAT-A-A-TATG-TG---T--A-A-CT----GGC-A-TTCAT-A-TTGT--AT-TG-T-G--A--CAAT-G--AA--TTCA-C-CCT-TCGA-T-G-GT-CTCGATCA--TT-A------------------C-T---GCACT-G--CA-CTTT--AGGGAAATC-TA-ATCTtaattgaatattctcatataat
gi|102729 : TTCTTA-TA-TT-TTG-T-A-TGTG-TG---A--G-G-TT----GAA-A-TTCAT-A-TAAT--AT-TG-T-G--A--CATT-G--AA--ATTG-C-CCC-T--A-
gi|102730 : TTTCTA-TT-TA-TAG-T-A-TGTG-TG---A--T-G-TT----GAT-A-T----------T--AT-TA-T-G--GC-C-TT-G--AA--ATCG-T-CCC-T--T-A-A-TT-CTC--TC----G-A--T-C-CTG---A--T--C-A---TCACT-G--C--TTTT--A
gi|102731 : TTTTA-AG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T-A--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-T--A-T-A-TA-TTC--TCC--TT-A--T-T-CCG---A--T--T-T---TGACT-G--CG-TTTT--A-GAACATC-CA-ATCTA
gi|102732 : TTCTA-TG-TA-TAA-G-A-T------------A-G-TT----GAT-A-T-CA--A-TCATTGATGTG-T-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-T--A-T-C-TC-TTC--TCC--TA-A--T-T-CCG---A--T--C-A---TCTCTGG--CG-TTTT--AGG-ATATCGCA-ATTTcataat
gi|102733 : TTTA-TG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T----A--C-TT-G--GATAATCG-C-CCA-T----T-A-TC-TTC--TCC--TTAA--T-T-CCG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTActacata
gi|102734 : TTTA-TG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T----A--C-TT-G--GATAATCG-C-CCA-T----T-A-TC-TTC--TCC--TTAA--T-T-CCG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTAtataat
gi|102735 : TTTA-T---A-TAG-T-G-TGTG-CG---A--A-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--TATT-A--AA--ATCG-C-CCC-T--A-G-A-T---------C--TG-A--T-C-CCA---A--T--C-A---TCACT-G--CA--TTT--AGGAAAATC-TA-tataat
gi|102736 : GTA-TGGCAT--ACG-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--ATCTG-T-G--GT-T-TT-G--AA--ATAA-C-CCC----A-T-A-Tttttgaata
gi|102737 : TA-TG---T--A-GGCT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TGCT-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-CTCCC-T--A-TTA-TTCTTC--TCC--TT-A--A-T-TCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGG-ACATC-CA-a
gi|102738 : A--ATCG-C-CCC-A--T-T-A-TC-TTC--TCC--TT-A--T-T-CCG---A--T--A-T---TCACT-G--CG-TTTT--Attacata
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 5555 3 222 1 8 1 99999999 1 4444 3 1 1 1 22 3 1 1 22 55 5 7 33 44 1 1 1 1 3 1 66 1 1 22 5 22 1 1 222 22 44 1 222 3 22 44 22 1 1
lowQualScore : .... . ... . . . ........ . .... . . . . .. . . . .. .. . . .. .. . . . . . . .. . . .. . .. . . ... .. .. . ... . .. .. .. . .
lowQualScore : 4444 3 666 7 1 5 22222222 5 8888 1 5 5 5 11 1 5 5 11 22 4 7 77 11 5 5 5 5 2 6 11 7 7 33 0 33 7 7 999 33 66 7 999 3 33 11 33 9 9
consensus : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
Reference ( family-605 ) : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102712 : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--A-A-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAC--AT-TG-T-G--A--C-T--G--AA--ATTG-T-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--T-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102713 : TTTTCA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-A--A--C-T--G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-TTTCC-T-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcatgat
gi|102714 : TTTTTA-AG-TA-TAG-A-A-TGTA--G---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T-A--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-ATT-T-C-C--TT-A--T-T--CG---ACTT--G-T---TGACT-G--C--TTTT--A-GAACATC-CA-ATC
gi|102715 : TTTTTA-TT-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--T-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--GT-TG-T-G--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T--TTC--C-C--TT-A--T-TCCCG---A--T--C-T---TCACT-G---G-TTTT--AGGAAAAT--CA-ATCTAatactaat
gi|102716 : TTTCTA-TG-TA-TAT-A-A-TATA-TG---A--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--CCTT-G--AA--ATCG-C-ACC-TA-T-A-T-ATTAT-C-C--TC-A--A-T-TCT---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--TGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102717 : TTTTTAATG-TA-TA--A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-T-AT--AT-TG-T-G--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CGC-TAGT-ATT-TTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A-----C-T---TC-CTGG--CG-TTTTAAAGGACCATC-CA-ATCTAcataat
gi|102718 : TTTTTA--G-TA-TAG-A-CCTATA-TG---T--T-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-T-AT--GT-TG-T-G--A--C-TG-T--AA--ATCGGC-CCC-TA-T-A---CTTCTTC-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCAC--G--CG-TTTA--AGGAACATC-CA-ATCTAcataa
gi|102719 : TTTTTA-TG-TAATAG-G-A-T-TA-TG---T--T-G-TTTTATG-T-A-TTCATCA-TCAT--GT-TG-T-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-A-TCTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-AGCCGTTTTT--AGGAATATC-C--ATCTAcataa
gi|102720 : TTTTTAATG-TACTAGTA-A-TATA-TG---T--T-G-TTT---GAT-A-TTCAT-AATCCA--GT-TG-T-GGGA--C-TTTG--AA--ATCG-C-CC---A-T-A-T-CTTCT-C-C--TTTA--T-T-TTG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CC-ATCTcataa
gi|102721 : TTTTTA--G-TA--AG-ATA-T-TA-TG---T--A-G-CT----GAT-AATTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--ACTC-TT-GC-AA--ATCG---CCC-TA-T-A-G-C-TCT-C-T--CT-A--T-T-C-----A--T--C-T---TCACT-G------TTT--AGGAACATC-CA-ATCTtacataat
gi|102722 : TTTCTA-T--TA-TAA-G-A-T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-TTCCT-A-TTTT---T-TG-T-G--A--CCTT-G--AA--ATTG-C-CC---A-T-A-T--TTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-A---TCACT-G--CG--TTT--AGG---ACC-CA-ATCTAgacataat
gi|102723 : TTTCTA-TG-TA-TTG-A-C-T-TA-TG---A--AAG-TT----GAT-A-GTCAT-A-TTAT--AT-TT-TTG--A--C-CT-AGAAA--ATCG-C-CCCATA---A-T-CTTCT-C-TAATT-A--GGT-GCG---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102724 : TTTCTA-TGATA-TAG-A-A-ATTAATG---A--A-A-TT----GAT-A-TTC-T-A-TTAT---T-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--TCTG-C-CCC--A-TAA-T-ATTCC-C-C--TT-A--T-T-CCGGTTA--T--T-TCCATCACT-G--CGTTTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102725 : TCTCTA-TG-TA-TTG-A---T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-ATCAT-A-TTA---AT-TG-T-G--A--C-CT-T--GA--ATCG-C-CTC-CA-T-A-T-CTTCT-C-----T-AATT-T-CCG---A--T--CAT---GCACT-G--CG-TTTT--AGGAAC-TC-CATATCTAcaataat
gi|102726 : TTTTTA-T---A-TAG-----TGTG-CG---TTAA-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TCAT--AT-TG-T-G--G--CTTT-G--AA--ATCA-T-CCC-TA-cgttaat
gi|102727 : TTTTTA-T---A-TAG-T-A-TGCG-CT---A--A-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TTAT--AT-TG-T-A--A--CTTT-G--AA--ATC-------------A-T-C-----C-C--TT-A--T-C-CAA---G--T--C-T---TTGGT-G--CG-TTTT--A
gi|102728 : TTTCTA-GC-TA-CAT-A-A-TATG-TG---T--A-A-CT----GGC-A-TTCAT-A-TTGT--AT-TG-T-G--A--CAAT-G--AA--TTCA-C-CCT-TC-G-A-T-GGTCT-CGA--TC-A--T-T-------A-----C-T---GCACT-G--CA-CTTT--AGGGAAATC-TA-ATCTtaattgaatattctcatataat
gi|102729 : TTCTTA-TA-TT-TTG-T-A-TGTG-TG---A--G-G-TT----GAA-A-TTCAT-A-TAAT--AT-TG-T-G--A--CATT-G--AA--ATTG-C-CCC-TA-
gi|102730 : TTTCTA-TT-TA-TAG-T-A-TGTG-TG---A--T-G-TT----GAT-A-T----------T--AT-TA-T-G--GC-C-TT-G--AA--ATCG-T-CCC-T--T-A---ATTCT-C-T--CG-A--T-C-CTG---A--T--C-A---TCACT-G--C--TTTT--A
gi|102731 : TTTTA-AG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T-A--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-ATTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--T-T---TGACT-G--CG-TTTT--A-GAACATC-CA-ATCTA
gi|102732 : TTCTA-TG-TA-TAA-G-A-T------------A-G-TT----GAT-A-T-CA--A-TCATTGATGTG-T-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-C-T-CTTCT-C-C--TA-A--T-T-CCG---A--T--C-A---TCTCTGG--CG-TTTT--AGG-ATATCGCA-ATTTcataat
gi|102733 : TTTA-TG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T----A--C-TT-G--GATAATCG-C-CCA-T--T-A-T-CTTCT-C-C--TTAA--T-T-CCG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTActacata
gi|102734 : TTTA-TG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T----A--C-TT-G--GATAATCG-C-CCA-T--T-A-T-CTTCT-C-C--TTAA--T-T-CCG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTAtataat
gi|102735 : TTTA-T---A-TAG-T-G-TGTG-CG---A--A-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--TATT-A--AA--ATCG-C-CCC-TA-G-A-T---------C--TG-A--T-C-CCA---A--T--C-A---TCACT-G--CA--TTT--AGGAAAATC-TA-tataat
gi|102736 : GTA-TGGCAT--ACG-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--ATCTG-T-G--GT-T-TT-G--AA--ATAA-C-CCC--A-T-A-T-ttttgaata
gi|102737 : TA-TG---T--A-GGCT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TGCT-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-CTCCC-TA-TTA-TTCTTCT-C-C--TT-A--A-T-TCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGG-ACATC-CA-a
gi|102738 : A--ATCG-C-CCC-AT-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--A-T---TCACT-G--CG-TTTT--Attacata
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 5555 3 222 1 8 1 99999999 1 4444 3 1 1 1 22 3 1 1 22 55 5 7 33 44 1 1 1 1 3 1 66 1 1 22 5 22 1 1 222 22 44 1 222 3 22 44 22 1 1
lowQualScore : .... . ... . . . ........ . .... . . . . .. . . . .. .. . . .. .. . . . . . . .. . . .. . .. . . ... .. .. . ... . .. .. .. . .
lowQualScore : 4444 3 666 7 1 5 22222222 5 8888 1 5 5 5 11 1 5 5 11 22 4 7 77 11 5 5 5 5 2 6 11 7 7 33 0 33 7 7 999 33 66 7 999 3 33 11 33 9 9
consensus : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
Reference ( family-605 ) : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102712 : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--A-A-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAC--AT-TG-T-G--A--C-T--G--AA--ATTG-T-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--T-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102713 : TTTTCA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-A--A--C-T--G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-TTTCC-T-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcatgat
gi|102714 : TTTTTA-AG-TA-TAG-A-A-TGTA--G---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T-A--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-ATT-T-C-C--TT-A--T-T--CG---ACTT--G-T---TGACT-G--C--TTTT--A-GAACATC-CA-ATC
gi|102715 : TTTTTA-TT-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--T-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--GT-TG-T-G--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T--TTC--C-C--TT-A--T-TCCCG---A--T--C-T---TCACT-G---G-TTTT--AGGAAAAT--CA-ATCTAatactaat
gi|102716 : TTTCTA-TG-TA-TAT-A-A-TATA-TG---A--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--CCTT-G--AA--ATCG-C-ACC-TA-T-A-T-ATTAT-C-C--TC-A--A-T-TCT---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--TGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102717 : TTTTTAATG-TA-TA--A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-T-AT--AT-TG-T-G--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CGC-TAGT-ATT-TTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A-----C-T---TC-CTGG--CG-TTTTAAAGGACCATC-CA-ATCTAcataat
gi|102718 : TTTTTA--G-TA-TAG-A-CCTATA-TG---T--T-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-T-AT--GT-TG-T-G--A--C-TG-T--AA--ATCGGC-CCC-TA-T-A---CTTCTTC-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCAC--G--CG-TTTA--AGGAACATC-CA-ATCTAcataa
gi|102719 : TTTTTA-TG-TAATAG-G-A-T-TA-TG---T--T-G-TTTTATG-T-A-TTCATCA-TCAT--GT-TG-T-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-A-TCTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-AGCCGTTTTT--AGGAATATC-C--ATCTAcataa
gi|102720 : TTTTTAATG-TACTAGTA-A-TATA-TG---T--T-G-TTT---GAT-A-TTCAT-AATCCA--GT-TG-T-GGGA--C-TTTG--AA--ATCG-C-CC---A-T-A-T-CTTCT-C-C--TTTA--T-T-TTG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CC-ATCTcataa
gi|102721 : TTTTTA--G-TA--AG-ATA-T-TA-TG---T--A-G-CT----GAT-AATTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--ACTC-TT-GC-AA--ATCG---CCC-TA-T-A-G-C-TCT-C-T--CT-A--T-T-C-----A--T--C-T---TCACT-G------TTT--AGGAACATC-CA-ATCTtacataat
gi|102722 : TTTCTA-T--TA-TAA-G-A-T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-TTCCT-A-TTTT---T-TG-T-G--A--CCTT-G--AA--ATTG-C-CC---A-T-A-T--TTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-A---TCACT-G--CG--TTT--AGG---ACC-CA-ATCTAgacataat
gi|102723 : TTTCTA-TG-TA-TTG-A-C-T-TA-TG---A--AAG-TT----GAT-A-GTCAT-A-TTAT--AT-TT-TTG--A--C-CT-AGAAA--ATCG-C-CCCATA---A-T-CTTCT-C-TAATT-A--GGT-GCG---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102724 : TTTCTA-TGATA-TAG-A-A-ATTAATG---A--A-A-TT----GAT-A-TTC-T-A-TTAT---T-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--TCTG-C-CCC--A-TAA-T-ATTCC-C-C--TT-A--T-T-CCGGTTA--T--T-TCCATCACT-G--CGTTTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102725 : TCTCTA-TG-TA-TTG-A---T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-ATCAT-A-TTA---AT-TG-T-G--A--C-CT-T--GA--ATCG-C-CTC-CA-T-A-T-CTTCT-C-----T-AATT-T-CCG---A--T--CAT---GCACT-G--CG-TTTT--AGGAAC-TC-CATATCTAcaataat
gi|102726 : TTTTTA-T---A-TAG-----TGTG-CG---TTAA-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TCAT--AT-TG-T-G--G--CTTT-G--AA--ATCA-T-CCC-TA-cgttaat
gi|102727 : TTTTTA-T---A-TAG-T-A-TGCG-CT---A--A-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TTAT--AT-TG-T-A--A--CTTT-G--AA--ATC-------------A-T-C-----C-C--TT-A--T-C-CAA---G--T--C-T---TTGGT-G--CG-TTTT--A
gi|102728 : TTTCTA-GC-TA-CAT-A-A-TATG-TG---T--A-A-CT----GGC-A-TTCAT-A-TTGT--AT-TG-T-G--A--CAAT-G--AA--TTCA-C-CCT-TC-G-A-T-GGTCT-CGA--TC-A--T-T-------A-----C-T---GCACT-G--CA-CTTT--AGGGAAATC-TA-ATCTtaattgaatattctcatataat
gi|102729 : TTCTTA-TA-TT-TTG-T-A-TGTG-TG---A--G-G-TT----GAA-A-TTCAT-A-TAAT--AT-TG-T-G--A--CATT-G--AA--ATTG-C-CCC-TA-
gi|102730 : TTTCTA-TT-TA-TAG-T-A-TGTG-TG---A--T-G-TT----GAT-A-T----------T--AT-TA-T-G--GC-C-TT-G--AA--ATCG-T-CCC-T--T-A---ATTCT-C-T--CG-A--T-C-CTG---A--T--C-A---TCACT-G--C--TTTT--A
gi|102731 : TTTTA-AG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T-A--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-ATTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--T-T---TGACT-G--CG-TTTT--A-GAACATC-CA-ATCTA
gi|102732 : TTCTA-TG-TA-TAA-G-A-T------------A-G-TT----GAT-A-T-CA--A-TCATTGATGTG-T-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-C-T-CTTCT-C-C--TA-A--T-T-CCG---A--T--C-A---TCTCTGG--CG-TTTT--AGG-ATATCGCA-ATTTcataat
gi|102733 : TTTA-TG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T----A--C-TT-G--GATAATCG-C-CCA-T--T-A-T-CTTCT-C-C--TTAA--T-T-CCG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTActacata
gi|102734 : TTTA-TG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T----A--C-TT-G--GATAATCG-C-CCA-T--T-A-T-CTTCT-C-C--TTAA--T-T-CCG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTAtataat
gi|102735 : TTTA-T---A-TAG-T-G-TGTG-CG---A--A-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--TATT-A--AA--ATCG-C-CCC-TA-G-A-T---------C--TG-A--T-C-CCA---A--T--C-A---TCACT-G--CA--TTT--AGGAAAATC-TA-tataat
gi|102736 : GTA-TGGCAT--ACG-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--ATCTG-T-G--GT-T-TT-G--AA--ATAA-C-CCC--A-T-A-T-ttttgaata
gi|102737 : TA-TG---T--A-GGCT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TGCT-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-CTCCC-TA-TTA-TTCTTCT-C-C--TT-A--A-T-TCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGG-ACATC-CA-a
gi|102738 : A--ATCG-C-CCC-AT-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--A-T---TCACT-G--CG-TTTT--Attacata
blockSeqs : ATG A TA C G A GCATAC G TTAT T A C A TG G C T GG CT T T GA TA G T A G A T TC T G AA T AT G C GTT CT AG A CCA G GC TT AA G T
blockSeqs : ATG C AT . G . TTAA . T T . . . . C . . . C T T C TA . . . . T . T . . . A . . . . . AG . . G . TT . . .
blockSeqs : TGA . A . A . AAA . . . . . . . . . . . T C T . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TG . A . A . TA . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : AG . A . G . TA . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TT . A . A . TT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TG . A . A . AA . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TG . A . T . TA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TG . G . G . TT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TG . G . G . TT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : GC . A . A . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TA . A . G . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TT . A . G . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : AG . T . G . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TG . A . A . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TG . T . A . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : TG . T . G . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : G . A . G . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : G . G . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . A . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . A . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . T . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
finalCons : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 5555 3 222 1 8 1 99999999 1 4444 3 1 1 1 22 3 1 1 22 55 5 7 33 44 1 1 1 1 3 1 66 1 1 22 5 22 1 1 222 22 44 1 222 3 22 44 22 1 1
lowQualScore : .... . ... . . . ........ . .... . . . . .. . . . .. .. . . .. .. . . . . . . .. . . .. . .. . . ... .. .. . ... . .. .. .. . .
lowQualScore : 4444 3 666 7 1 5 22222222 5 8888 1 5 5 5 11 1 5 5 11 22 4 7 77 11 5 5 5 5 2 6 11 7 7 33 0 33 7 7 999 33 66 7 999 3 33 11 33 9 9
consensus : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
Reference ( family-605 ) : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102712 : TTTTTA-TG-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--A-A-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAC--AT-TG-T-G--A--C-T--G--AA--ATTG-T-CCC-TA-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--T-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTA
gi|102713 : TTTTCA-TG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-A--A--C-T--G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-TTTCC-T-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcatgat
gi|102714 : TTTTTA-AG-TA-TAG-A-A-TGTA--G---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T-A--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-ATT-T-C-C--TT-A--T-T--CG---ACTT--G-T---TGACT-G--C--TTTT--A-GAACATC-CA-ATC
gi|102715 : TTTTTA-TT-TA-TAG-A-A-TATA-TG---T--T-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--GT-TG-T-G--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T--TTC--C-C--TT-A--T-TCCCG---A--T--C-T---TCACT-G---G-TTTT--AGGAAAAT--CA-ATCTAatactaat
gi|102716 : TTTCTA-TG-TA-TAT-A-A-TATA-TG---A--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--CCTT-G--AA--ATCG-C-ACC-TA-T-A-T-ATTAT-C-C--TC-A--A-T-TCT---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--TGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102717 : TTTTTAATG-TA-TA--A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-T-AT--AT-TG-T-G--A--CTTT-G--AA--ATCG-C-CGC-TAGT-ATT-TTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A-----C-T---TC-CTGG--CG-TTTTAAAGGACCATC-CA-ATCTAcataat
gi|102718 : TTTTTA--G-TA-TAG-A-CCTATA-TG---T--T-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-T-AT--GT-TG-T-G--A--C-TG-T--AA--ATCGGC-CCC-TA-T-A---CTTCTTC-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCAC--G--CG-TTTA--AGGAACATC-CA-ATCTAcataa
gi|102719 : TTTTTA-TG-TAATAG-G-A-T-TA-TG---T--T-G-TTTTATG-T-A-TTCATCA-TCAT--GT-TG-T-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-A-TCTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-T---TCACT-AGCCGTTTTT--AGGAATATC-C--ATCTAcataa
gi|102720 : TTTTTAATG-TACTAGTA-A-TATA-TG---T--T-G-TTT---GAT-A-TTCAT-AATCCA--GT-TG-T-GGGA--C-TTTG--AA--ATCG-C-CC---A-T-A-T-CTTCT-C-C--TTTA--T-T-TTG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CC-ATCTcataa
gi|102721 : TTTTTA--G-TA--AG-ATA-T-TA-TG---T--A-G-CT----GAT-AATTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--ACTC-TT-GC-AA--ATCG---CCC-TA-T-A-G-C-TCT-C-T--CT-A--T-T-C-----A--T--C-T---TCACT-G------TTT--AGGAACATC-CA-ATCTtacataat
gi|102722 : TTTCTA-T--TA-TAA-G-A-T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-TTCCT-A-TTTT---T-TG-T-G--A--CCTT-G--AA--ATTG-C-CC---A-T-A-T--TTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--C-A---TCACT-G--CG--TTT--AGG---ACC-CA-ATCTAgacataat
gi|102723 : TTTCTA-TG-TA-TTG-A-C-T-TA-TG---A--AAG-TT----GAT-A-GTCAT-A-TTAT--AT-TT-TTG--A--C-CT-AGAAA--ATCG-C-CCCATA---A-T-CTTCT-C-TAATT-A--GGT-GCG---A--T--C-A---TCACT-G--CG-TTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102724 : TTTCTA-TGATA-TAG-A-A-ATTAATG---A--A-A-TT----GAT-A-TTC-T-A-TTAT---T-TG-T-G--A--C-TT-G--AA--TCTG-C-CCC--A-TAA-T-ATTCC-C-C--TT-A--T-T-CCGGTTA--T--T-TCCATCACT-G--CGTTTTT--AGGAACATC-CA-ATCTAcataat
gi|102725 : TCTCTA-TG-TA-TTG-A---T-TA-TG---A--A-A-TT----GAT-A-ATCAT-A-TTA---AT-TG-T-G--A--C-CT-T--GA--ATCG-C-CTC-CA-T-A-T-CTTCT-C-----T-AATT-T-CCG---A--T--CAT---GCACT-G--CG-TTTT--AGGAAC-TC-CATATCTAcaataat
gi|102726 : TTTTTA-T---A-TAG-----TGTG-CG---TTAA-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TCAT--AT-TG-T-G--G--CTTT-G--AA--ATCA-T-CCC-TA-cgttaat
gi|102727 : TTTTTA-T---A-TAG-T-A-TGCG-CT---A--A-G-TT----GAT-A-TTTAC-A-TTAT--AT-TG-T-A--A--CTTT-G--AA--ATC-------------A-T-C-----C-C--TT-A--T-C-CAA---G--T--C-T---TTGGT-G--CG-TTTT--A
gi|102728 : TTTCTA-GC-TA-CAT-A-A-TATG-TG---T--A-A-CT----GGC-A-TTCAT-A-TTGT--AT-TG-T-G--A--CAAT-G--AA--TTCA-C-CCT-TC-G-A-T-GGTCT-CGA--TC-A--T-T-------A-----C-T---GCACT-G--CA-CTTT--AGGGAAATC-TA-ATCTtaattgaatattctcatataat
gi|102729 : TTCTTA-TA-TT-TTG-T-A-TGTG-TG---A--G-G-TT----GAA-A-TTCAT-A-TAAT--AT-TG-T-G--A--CATT-G--AA--ATTG-C-CCC-TA-
gi|102730 : TTTCTA-TT-TA-TAG-T-A-TGTG-TG---A--T-G-TT----GAT-A-T----------T--AT-TA-T-G--GC-C-TT-G--AA--ATCG-T-CCC-T--T-A---ATTCT-C-T--CG-A--T-C-CTG---A--T--C-A---TCACT-G--C--TTTT--A
gi|102731 : TTTTA-AG-TA-TAG-A-A-TGTA-TG---T--A-G-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AA-TG-T-A--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-A-T-ATTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--T-T---TGACT-G--CG-TTTT--A-GAACATC-CA-ATCTA
gi|102732 : TTCTA-TG-TA-TAA-G-A-T------------A-G-TT----GAT-A-T-CA--A-TCATTGATGTG-T-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-C-CCC-TA-T-C-T-CTTCT-C-C--TA-A--T-T-CCG---A--T--C-A---TCTCTGG--CG-TTTT--AGG-ATATCGCA-ATTTcataat
gi|102733 : TTTA-TG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T----A--C-TT-G--GATAATCG-C-CCA-T--T-A-T-CTTCT-C-C--TTAA--T-T-CCG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTActacata
gi|102734 : TTTA-TG-TA--AG-A-A-AATT-TG---T-------T----GATTA-TTCA--G-TC-T--A---G-T----A--C-TT-G--GATAATCG-C-CCA-T--T-A-T-CTTCT-C-C--TTAA--T-T-CCG---A--TAGC-T---TCACT-G--CG---TT--AAGAACATC-TA-ATCTAtataat
gi|102735 : TTTA-T---A-TAG-T-G-TGTG-CG---A--A-G-TT----AAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TG-T-G--A--TATT-A--AA--ATCG-C-CCC-TA-G-A-T---------C--TG-A--T-C-CCA---A--T--C-A---TCACT-G--CA--TTT--AGGAAAATC-TA-tataat
gi|102736 : GTA-TGGCAT--ACG-TT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--ATCTG-T-G--GT-T-TT-G--AA--ATAA-C-CCC--A-T-A-T-ttttgaata
gi|102737 : TA-TG---T--A-GGCT----GAT-A-TTCAT-A-TCAT--AT-TGCT-G--A--C-TTTG--AA--ATCG-CTCCC-TA-TTA-TTCTTCT-C-C--TT-A--A-T-TCG---A--T--C-T---TCACT-G--CG-TTTT--AGG-ACATC-CA-a
gi|102738 : A--ATCG-C-CCC-AT-T-A-T-CTTCT-C-C--TT-A--T-T-CCG---A--T--A-T---TCACT-G--CG-TTTT--Attacata