lowQualScore                  :            33333333333                                                                                                                         
lowQualScore                  :        1 1 55555555555     1    6666 1  1 1 1 222 1  1 1  1 77  22 444  1  1 1  1 1  3 33       1 1      1  1 3 3   1  222  3 22 66   1    2   
lowQualScore                  :        . . ...........     .    .... .  . . . ... .  . .  . ..  .. ...  .  . .  . .  . ..       . .      .  . . .   .  ...  . .. ..   .    .   
lowQualScore                  :        9 9 44444444444     6    6666 6  5 5 5 777 5  5 5  5 33  11 111  5  5 5  5 5  1 77       5 5      5  5 1 1   5  777  1 22 00   7    2   
consensus                     : AAAGAGG-G-ATAN-CT--T--AAGGG-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
Reference ( gi|61158 )        : AAAGAGG-G-ACAA-CT--G--AAGGG-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61155                      : AAAGAGG-G-ATAT-CT--T--AAGGA-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ATCT-TGG
gi|61156                      : AAAGAAG-G-ATTT-CT--T--AAGGG-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61157                      : AAAGAGG-G-ATAT-TTTTG--A-GGG-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61159                      : AAAGAGG-G-ATAG-TT-----AAGGG-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA-AA-CA--A-A-TG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATT--AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61160                      : AAAGAGC-G-AT---CT--T--AAGGG-CTTT----G-GT-A-T-T---T-CT-A-TA-A--CA--A-AATG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61162                      : AAAGAGG-G-ATTGTCT--A--AAGGG-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA-AAACA--A-A-TG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTCAAC-T-A-CCA-GA---GCTT--A--TTG-ATCC-TGG
gi|61161                      : AAAGAGG-G-ATGATCT--T--AAGGC-TTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA----CA--A-A-TG-TA-T-C--T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-ACTT-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61164                      : AATGAGG-G-ATAG-CT--T--AAGGGGCTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-C--T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCC-AG---GC-T--A--TCG-ACCT-
gi|61166                      : AAAGAGTTG-ACAT-CTT-A--AAGGG-CTTTT---G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA----CA--ACA-TG-TAAT-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCTCTGG
gi|61163                      : AAAGAGG-G-ATCT-CT--T--AAGGG-CTTT----G-AT-A-T-T---T-T----AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-CT-TCTT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AT-T---CCA-GA---GC-------TTG-ACCT-TGG
gi|61165                      : AAAGAGG-G-ATAGTCT--T--AAGTG-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-A-----CA--A-A-TG-TA-T-CT-T-TT-CA-AAGACAT-T-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TGG-AC
gi|61167                      : AAAGAGG-A-AT---CT--T--AAGGG-CTTT----G-ATGA-T-T---T-CT-A-AAGA--TC--A-A-TG-TA-T-CT-T-TTTC--AAGACATGT-TCATTC-AC-T-AACCA-GA---GC-T--A--TTGAACCT-TGG
gi|61168                      : AAAGAGG-GGATAT-CT--ATAAAGGG-CTTTT---G-AT-A-TAT---T-CT-A-AA-A--CAGGA-A-AG-TA-T-AC-T-TT-CTGAAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-C----A---GC-TTAA--TTG-A
gi|61169                      : AAAGAGG-G-ATAT-CT-----AAGGG-CT------G-AT-A-T-T-----CA-A-AA-A--CA--A-A-T--------T-T-CT-C--AAGACAA-T-TCATTC-AC-A-C-CCA-GA---GC-
gi|61170                      : AAAG-GG-G-ATAG-CT--T--A-GGG-CTTC----T-GT-A-T-T-------------------------G-TA-T-CT-T-TTTC--AAGACAA-T-TCATTC-AC-T-ACCCA-GATAGAC-T-----TTG-ACCT-
gi|61171                      :  AAGAGG-G-ATAT-CT--T--AAGGG-ATTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TTCT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCA-TGG
gi|61172                      :  AAGAGG-G-AT---TT--T--AAGGG-CTT-----G-AT-AAT-T---T-CT-AGAA-A--CA--A---TG-TA-T-CT-T-T--C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GCTT--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61174                      :  AAGAGG-G-ACAG-CT-----AAGGG-TGTT----G------------T-CT-T-AA-A--CA--A---TG-TA-T-CT-T-TT-C--AGGA-AT-T-TCATTC-AC-T-C-CGA-GA---GC-T--ATTTTG-ACTT-
gi|61173                      :  AAGAGG-G-ATA-----------GGG-CTTT----A-GT-A-T-T---T-CC-T-AT-A--CA--G-A-TG-CT-G-CT-T-CC-C--TAGACAT-T-TCATTC-AG-T-A-CCA-GA---AC-T--A--TTG-ACC
gi|61177                      :   AGAGG-G-ATAT-CT--T--AAGGG-CTTT----GGAT-A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-AATG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61178                      :   AAAAG-G-ATAG-CT------AGGG-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AT-A--CA--A-A-TG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCG-GA---GC-T--A--TTG-GACT-TGG
gi|61180                      :                     --AAGTG-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CT-A-AA-AA-CA--A-A-TG-TA-T-CT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--AT-TTG-ACCT-TG
gi|61179                      :                          GG-CTTT----G-AT-A-T-T---TTCT-A-AA-AAATA--A-A-TG-TA-T-TT-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TTG-AC
gi|61175                      :                     tatctGG-CTTTTGGGG-AT-A-T-TCTCT-CTTA-AA-A--CA--A-T-TG-TA-T-CT-T-TT-C---AGACAT-T-TC-TTC--C-T-T-CCA-GA---GC-T--ATTTTG-ACC
gi|61181                      :     aaggggacattcttttaaaaggt-CTTT----G-AT-A-T-T---T-CC-T-AA-A--CA--A-C-TG-TA-C-TT-T-TC-C--AAGACAT-TATCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACC
gi|61176                      :                                        T-A-T-A---T-CT-A-A-----CA--A---TGATA-T-CGAT-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCAGGA---GC-T--A--





Alignments
lowQualScore                  :              1111                                                                                                                                           
lowQualScore                  :       1 1 1  0000  999999  3  22 1 33333   6666 1  33 1 1 222 1  3 1  1 55  22 333  1  1 1 1 1 1  1 33       1 1      1  1 4 1   1  222  3 22 55   1    2   
lowQualScore                  :       . . .  ....  ......  .  .. . .....   .... .  .. . . ... .  . .  . ..  .. ...  .  . . . . .  . ..       . .      .  . . .   .  ...  . .. ..   .    .   
lowQualScore                  :       7 7 7  9999  111111  2  11 5 77777   1111 5  55 5 5 666 5  0 5  5 66  00 666  5  5 5 5 5 5  5 55       5 5      5  5 4 5   5  666  0 11 88   6    1   
consensus                     : AAAGAG-G-G-AT-AT-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
Reference ( family-604 )      : AAAGAG-G-G-AT-AN-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61155                      : AAAGAG-G-G-AT-AT-CT-T----AA-GG--A-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ATCT-TGG
gi|61156                      : AAAGAA-G-G-AT-TT-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61157                      : AAAGAG-G-G-AT-AT-TT-TT---GA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61158                      : AAAGAG-G-G-AC-AA-CT-G----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61159                      : AAAGAG-G-G-AT-AG--T-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CTAA-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATT--AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61160                      : AAAGAG-C-G-AT----CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-GT--A-T-T---T-CT-A-TA-A--CA--A-AATG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61161                      : AAAGAG-G-G-ATGAT-CT-T----AA-GG--C-T-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA----CA--A-A-TG-TA-T-C---T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-ACTT-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61162                      : AAAGAG-G-G-ATTGT-CT-A----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-AAACA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTCAAC-T-A-CCA-GA---GCTT--A--TTG-ATCC-TGG
gi|61163                      : AAAGAG-G-G-AT-CT-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-T----AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-C-T-TCTT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AT-T---CCA-GA---GC-------TTG-ACCT-TGG
gi|61164                      : AATGAG-G-G-AT-AG-CT-T----AA-GG--GGC-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-T-C---T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCC-AG---GC-T--A--TCG-ACCT-
gi|61165                      : AAAGAG-G-G-AT-AGTCT-T----AA-GT--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT----A-A--CA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-CA-AAGACAT-T-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TGG-AC
gi|61166                      : AAAGAG-TTG-AC-AT-CT-T----AAAGG--G-C-----TTTT---G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA----CA--ACA-TG-TAAT-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCTCTGG
gi|61167                      : AAAGAG-G-A-AT----CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-ATG-A-T-T---T-CT-A-AAGA--TC--A-A-TG-TA-T-CTT-T-TT-C--AAGACATGT-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TTGAACCT-TGG
gi|61168                      : AAAGAG-G-GGAT-AT-CTAT----AAAGG--G-C-----TTTT---G-AT--A-TAT---T-CT-A-AA-A--CAGGA-A-AG-TA-T-A-C-T-TT-CTGAAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-C----A---GC-TTAA--TTG-A
gi|61169                      : AAAGAG-G-G-AT-AT-CT------AA-GG--G-C-----T------G-AT--A-T-T-----CA-A-AA-A--CA--A-A-T---------T-T-CT-C--AAGACAA-T-TCATTC-AC-A-C-CCA-GA---GC-
gi|61170                      : AAAG-G-G-G-AT-AG-CT-T----A--GG--G-C-----TTC----T-GT--A-T-T-------------------------G-TA-T-C-T-T-TTTC--AAGACAA-T-TCATTC-AC-T-ACCCA-GATAGAC-T-----TTG-ACCT-
gi|61171                      :  AAGAG-G-G-AT-AT-CT-T----AA-GG--G-A-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TTC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCA-TGG
gi|61172                      :  AAGAG-G-G-AT----TT-T----AA-GG--G-C-----TT-----G-AT--AAT-T---T-CT-AGAA-A--CA--A---TG-TA-T-C-T-T-T--C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GCTT--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61173                      :  AAGAG-G-G-AT-A-------------GG--G-C-----TTT----A-GT--A-T-T---T-CC-T-AT-A--CA--G-A-TG-CT-G-C-T-T-CC-C--TAGACAT-T-TCATTC-AG-T-A-CCA-GA---AC-T--A--TTG-ACC
gi|61174                      :  AAGAG-G-G-AC-AG-CT------AA-GG--G-T-----GTT----G-------------T-CT-T-AA-A--CA--A---TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AGGA-AT-T-TCATTC-AC-T-C-CGA-GA---GC-T--ATTTTG-ACTT-
gi|61175                      :  AAG-G-G-G-AC-ATTCT-TTTAAAA-GGTGG-C-----TTTTGGGG-AT--A-T-TCTCT-CTTA-AA-A--CA--A-T-TG-TA-T-C-T-T-TT-C---AGACAT-T-TC-TTC--C-T-T-CCA-GA---GC-T--ATTTTG-ACC
gi|61176                      :  AAGAGTG-G-AA-AT-CT-TTT--AA-TG--G-CAGCTCTTA----G-ATGTA-T-A---T-CT-A-A-----CA--A---TGATA-T-C-GAT-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCAGGA---GC-T--A--
gi|61177                      :   AGAG-G-G-AT-AT-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----GGAT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-AATG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61178                      :   AAAA-G-G-AT-AG-CT-------A-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AT-A--CA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCG-GA---GC-T--A--TTG-GACT-TGG
gi|61179                      :                              G--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---TTCT-A-AA-AAATA--A-A-TG-TA-T-T-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TTG-AC
gi|61180                      :                 tatct----AA-GT--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-AA-CA--A-A-TG-TA-T-C-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--AT-TTG-ACCT-TG
gi|61181                      :                                  -C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CC-T-AA-A--CA--A-C-TG-TA-C-T-T-T-TC-C--AAGACAT-TATCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACC





Alignments
lowQualScore                  :                     111111                                                                                                                                  
lowQualScore                  :       1 1 1  88888  000000  3  22 1 33333   6666 1  33 1 1 222 1  3 1  1 55  22 333  1  3  1 1 1  1 33       1 1      1  1 4 1   1  222  3 22 55   1    2   
lowQualScore                  :       . . .  .....  ......  .  .. . .....   .... .  .. . . ... .  . .  . ..  .. ...  .  .  . . .  . ..       . .      .  . . .   .  ...  . .. ..   .    .   
lowQualScore                  :       7 7 7  66666  333333  1  11 5 77777   1111 5  55 5 5 666 5  0 5  5 66  00 666  5  0  5 5 5  5 55       5 5      5  5 4 5   5  666  0 11 88   6    1   
consensus                     : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
Reference ( family-604 )      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61155                      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--A-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ATCT-TGG
gi|61156                      : AAAGAA-G-G-AT-T-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61157                      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-TT-TT---GA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61158                      : AAAGAG-G-G-AC-A-A-CT-G----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61159                      : AAAGAG-G-G-AT-A---GT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CTAA-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATT--AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61160                      : AAAGAG-C-G-AT-----CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-GT--A-T-T---T-CT-A-TA-A--CA--A-AATG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61161                      : AAAGAG-G-G-ATGA-T-CT-T----AA-GG--C-T-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA----CA--A-A-TG-TA-TC---T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-ACTT-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61162                      : AAAGAG-G-G-ATTG-T-CT-A----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-AAACA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTCAAC-T-A-CCA-GA---GCTT--A--TTG-ATCC-TGG
gi|61163                      : AAAGAG-G-G-AT-C-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-T----AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-TCTT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AT-T---CCA-GA---GC-------TTG-ACCT-TGG
gi|61164                      : AATGAG-G-G-AT-A-G-CT-T----AA-GG--GGC-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC---T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCC-AG---GC-T--A--TCG-ACCT-
gi|61165                      : AAAGAG-G-G-AT-AGT-CT-T----AA-GT--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT----A-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-CA-AAGACAT-T-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TGG-AC
gi|61166                      : AAAGAG-TTG-AC-A-T-CT-T----AAAGG--G-C-----TTTT---G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA----CA--ACA-TG-TAATC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCTCTGG
gi|61167                      : AAAGAG-G-A-AT-----CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-ATG-A-T-T---T-CT-A-AAGA--TC--A-A-TG-TA-TCTT-T-TT-C--AAGACATGT-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TTGAACCT-TGG
gi|61168                      : AAAGAG-G-GGAT-A-T-CTAT----AAAGG--G-C-----TTTT---G-AT--A-TAT---T-CT-A-AA-A--CAGGA-A-AG-TA-TA-C-T-TT-CTGAAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-C----A---GC-TTAA--TTG-A
gi|61169                      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT------AA-GG--G-C-----T------G-AT--A-T-T-----CA-A-AA-A--CA--A-A-T--------T-T-CT-C--AAGACAA-T-TCATTC-AC-A-C-CCA-GA---GC-
gi|61170                      : AAAG-G-G-G-AT-A-G-CT-T----A--GG--G-C-----TTC----T-GT--A-T-T-------------------------G-TA-TC-T-T-TTTC--AAGACAA-T-TCATTC-AC-T-ACCCA-GATAGAC-T-----TTG-ACCT-
gi|61171                      :  AAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-A-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TATTC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCA-TGG
gi|61172                      :  AAGAG-G-G-AT-----TT-T----AA-GG--G-C-----TT-----G-AT--AAT-T---T-CT-AGAA-A--CA--A---TG-TA-TC-T-T-T--C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GCTT--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61173                      :  AAGAG-G-G-AT-A--------------GG--G-C-----TTT----A-GT--A-T-T---T-CC-T-AT-A--CA--G-A-TG-CT-GC-T-T-CC-C--TAGACAT-T-TCATTC-AG-T-A-CCA-GA---AC-T--A--TTG-ACC
gi|61174                      :  AAGAG-G-G-AC-A-G-CT------AA-GG--G-T-----GTT----G-------------T-CT-T-AA-A--CA--A---TG-TA-TC-T-T-TT-C--AGGA-AT-T-TCATTC-AC-T-C-CGA-GA---GC-T--ATTTTG-ACTT-
gi|61175                      :  AAG-G-G-G-AC-A-TTCT-TTTAAAA-GGTGG-C-----TTTTGGGG-AT--A-T-TCTCT-CTTA-AA-A--CA--A-T-TG-TA-TC-T-T-TT-C---AGACAT-T-TC-TTC--C-T-T-CCA-GA---GC-T--ATTTTG-ACC
gi|61176                      :  AAGAGTG-G-AA-A-T-CT-TTT--AA-TG--G-CAGCTCTTA----G-ATGTA-T-A---T-CT-A-A-----CA--A---TGATA-TC-GAT-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCAGGA---GC-T--A--
gi|61177                      :   AGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----GGAT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-AATG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61178                      :   AAAA-G-G-AT-A-G-CT-------A-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AT-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCG-GA---GC-T--A--TTG-GACT-TGG
gi|61179                      :             T-A-T-CT----------G--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---TTCT-A-AA-AAATA--A-A-TG-TA-TT-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TTG-AC
gi|61180                      :                       ----AA-GT--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-AA-CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--AT-TTG-ACCT-TG
gi|61181                      :                                   -C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CC-T-AA-A--CA--A-C-TG-TA-CT-T-T-TC-C--AAGACAT-TATCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACC





Alignments
lowQualScore                  :                     111111                                                                                                                                  
lowQualScore                  :       1 1 1  88888  000000  3  22 1 33333   6666 1  33 1 1 222 1  3 1  1 55  22 333  1  3  1 1 1  1 33       1 1      1  1 4 1   1  222  3 22 55   1    2   
lowQualScore                  :       . . .  .....  ......  .  .. . .....   .... .  .. . . ... .  . .  . ..  .. ...  .  .  . . .  . ..       . .      .  . . .   .  ...  . .. ..   .    .   
lowQualScore                  :       7 7 7  66666  333333  1  11 5 77777   1111 5  55 5 5 666 5  0 5  5 66  00 666  5  0  5 5 5  5 55       5 5      5  5 4 5   5  666  0 11 88   6    1   
consensus                     : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
Reference ( family-604 )      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61155                      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--A-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ATCT-TGG
gi|61156                      : AAAGAA-G-G-AT-T-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61157                      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-TT-TT---GA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61158                      : AAAGAG-G-G-AC-A-A-CT-G----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61159                      : AAAGAG-G-G-AT-A---GT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CTAA-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATT--AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61160                      : AAAGAG-C-G-AT-----CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-GT--A-T-T---T-CT-A-TA-A--CA--A-AATG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61161                      : AAAGAG-G-G-ATGA-T-CT-T----AA-GG--C-T-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA----CA--A-A-TG-TA-TC---T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-ACTT-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61162                      : AAAGAG-G-G-ATTG-T-CT-A----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-AAACA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTCAAC-T-A-CCA-GA---GCTT--A--TTG-ATCC-TGG
gi|61163                      : AAAGAG-G-G-AT-C-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-T----AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-TCTT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AT-T---CCA-GA---GC-------TTG-ACCT-TGG
gi|61164                      : AATGAG-G-G-AT-A-G-CT-T----AA-GG--GGC-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC---T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCC-AG---GC-T--A--TCG-ACCT-
gi|61165                      : AAAGAG-G-G-AT-AGT-CT-T----AA-GT--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT----A-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-CA-AAGACAT-T-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TGG-AC
gi|61166                      : AAAGAG-TTG-AC-A-T-CT-T----AAAGG--G-C-----TTTT---G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA----CA--ACA-TG-TAATC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCTCTGG
gi|61167                      : AAAGAG-G-A-AT-----CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-ATG-A-T-T---T-CT-A-AAGA--TC--A-A-TG-TA-TCTT-T-TT-C--AAGACATGT-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TTGAACCT-TGG
gi|61168                      : AAAGAG-G-GGAT-A-T-CTAT----AAAGG--G-C-----TTTT---G-AT--A-TAT---T-CT-A-AA-A--CAGGA-A-AG-TA-TA-C-T-TT-CTGAAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-C----A---GC-TTAA--TTG-A
gi|61169                      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT------AA-GG--G-C-----T------G-AT--A-T-T-----CA-A-AA-A--CA--A-A-T--------T-T-CT-C--AAGACAA-T-TCATTC-AC-A-C-CCA-GA---GC-
gi|61170                      : AAAG-G-G-G-AT-A-G-CT-T----A--GG--G-C-----TTC----T-GT--A-T-T-------------------------G-TA-TC-T-T-TTTC--AAGACAA-T-TCATTC-AC-T-ACCCA-GATAGAC-T-----TTG-ACCT-
gi|61171                      :  AAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-A-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TATTC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCA-TGG
gi|61172                      :  AAGAG-G-G-AT-----TT-T----AA-GG--G-C-----TT-----G-AT--AAT-T---T-CT-AGAA-A--CA--A---TG-TA-TC-T-T-T--C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GCTT--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61173                      :  AAGAG-G-G-AT-A--------------GG--G-C-----TTT----A-GT--A-T-T---T-CC-T-AT-A--CA--G-A-TG-CT-GC-T-T-CC-C--TAGACAT-T-TCATTC-AG-T-A-CCA-GA---AC-T--A--TTG-ACC
gi|61174                      :  AAGAG-G-G-AC-A-G-CT------AA-GG--G-T-----GTT----G-------------T-CT-T-AA-A--CA--A---TG-TA-TC-T-T-TT-C--AGGA-AT-T-TCATTC-AC-T-C-CGA-GA---GC-T--ATTTTG-ACTT-
gi|61175                      :  AAG-G-G-G-AC-A-TTCT-TTTAAAA-GGTGG-C-----TTTTGGGG-AT--A-T-TCTCT-CTTA-AA-A--CA--A-T-TG-TA-TC-T-T-TT-C---AGACAT-T-TC-TTC--C-T-T-CCA-GA---GC-T--ATTTTG-ACC
gi|61176                      :  AAGAGTG-G-AA-A-T-CT-TTT--AA-TG--G-CAGCTCTTA----G-ATGTA-T-A---T-CT-A-A-----CA--A---TGATA-TC-GAT-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCAGGA---GC-T--A--
gi|61177                      :   AGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----GGAT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-AATG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61178                      :   AAAA-G-G-AT-A-G-CT-------A-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AT-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCG-GA---GC-T--A--TTG-GACT-TGG
gi|61179                      :             T-A-T-CT----------G--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---TTCT-A-AA-AAATA--A-A-TG-TA-TT-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TTG-AC
gi|61180                      :                       ----AA-GT--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-AA-CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--AT-TTG-ACCT-TG
gi|61181                      :                                   -C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CC-T-AA-A--CA--A-C-TG-TA-CT-T-T-TC-C--AAGACAT-TATCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACC


blockSeqs                     :       T T G  GAT    TTTAA   A  TG G AGCTC   TGGG G  GT A A CTC T  A G  G AA  GG AA   A  A  T A C  T TG       G A      A  T A C   G  TAG  T TA TT   A    C
blockSeqs                     :       . . .  TGT    TTT     A  .  . .       T    .  G  . . .   .  T .  . AA  .  CA   .  T  . . .  . A        . .      .  . A .   .  .    T .  TT   .    .
blockSeqs                     :       . . .  AGT    TT      .  .  . .       T    .  .  . . .   .  . .  . A   .  AA   .  .  . . .  . .        . .      .  . A .   .  .    . .  T    .    .
blockSeqs                     :       . . .  ATT    AT      .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  TT     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AT     G       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AA     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  CT     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AG     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AT     A       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AT     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AT     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AG     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AT     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AG     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AT     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AT     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AG     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  T    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .    .
blockSeqs                     :       . . .  AT     T       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .     
blockSeqs                     :       . . .  A      .       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .     
blockSeqs                     :       . . .  A      .       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  A    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .     
blockSeqs                     :       . . .  .      .       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  C    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .     
blockSeqs                     :       . . .  .      .       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  .    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .     
blockSeqs                     :              .      .       .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  .    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .    .     
blockSeqs                     :                             .  .  . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  .    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    . .  .          
blockSeqs                     :                                   . .       .    .  .  . . .   .  . .  . .   .  .    .  .  . . .  . .        . .      .  . . .   .  .    .               


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
finalCons                     : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG





Alignments
lowQualScore                  :                     111111                                                                                                                                  
lowQualScore                  :       1 1 1  88888  000000  3  22 1 33333   6666 1  33 1 1 222 1  3 1  1 55  22 333  1  3  1 1 1  1 33       1 1      1  1 4 1   1  222  3 22 55   1    2   
lowQualScore                  :       . . .  .....  ......  .  .. . .....   .... .  .. . . ... .  . .  . ..  .. ...  .  .  . . .  . ..       . .      .  . . .   .  ...  . .. ..   .    .   
lowQualScore                  :       7 7 7  66666  333333  1  11 5 77777   1111 5  55 5 5 666 5  0 5  5 66  00 666  5  0  5 5 5  5 55       5 5      5  5 4 5   5  666  0 11 88   6    1   
consensus                     : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
Reference ( family-604 )      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61155                      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--A-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ATCT-TGG
gi|61156                      : AAAGAA-G-G-AT-T-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61157                      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-TT-TT---GA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61158                      : AAAGAG-G-G-AC-A-A-CT-G----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61159                      : AAAGAG-G-G-AT-A---GT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CTAA-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATT--AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61160                      : AAAGAG-C-G-AT-----CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-GT--A-T-T---T-CT-A-TA-A--CA--A-AATG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61161                      : AAAGAG-G-G-ATGA-T-CT-T----AA-GG--C-T-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA----CA--A-A-TG-TA-TC---T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-ACTT-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61162                      : AAAGAG-G-G-ATTG-T-CT-A----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-AAACA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTCAAC-T-A-CCA-GA---GCTT--A--TTG-ATCC-TGG
gi|61163                      : AAAGAG-G-G-AT-C-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-T----AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-TCTT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AT-T---CCA-GA---GC-------TTG-ACCT-TGG
gi|61164                      : AATGAG-G-G-AT-A-G-CT-T----AA-GG--GGC-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TA-TC---T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCC-AG---GC-T--A--TCG-ACCT-
gi|61165                      : AAAGAG-G-G-AT-AGT-CT-T----AA-GT--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT----A-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-CA-AAGACAT-T-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TGG-AC
gi|61166                      : AAAGAG-TTG-AC-A-T-CT-T----AAAGG--G-C-----TTTT---G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA----CA--ACA-TG-TAATC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCTCTGG
gi|61167                      : AAAGAG-G-A-AT-----CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----G-ATG-A-T-T---T-CT-A-AAGA--TC--A-A-TG-TA-TCTT-T-TT-C--AAGACATGT-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TTGAACCT-TGG
gi|61168                      : AAAGAG-G-GGAT-A-T-CTAT----AAAGG--G-C-----TTTT---G-AT--A-TAT---T-CT-A-AA-A--CAGGA-A-AG-TA-TA-C-T-TT-CTGAAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-C----A---GC-TTAA--TTG-A
gi|61169                      : AAAGAG-G-G-AT-A-T-CT------AA-GG--G-C-----T------G-AT--A-T-T-----CA-A-AA-A--CA--A-A-T--------T-T-CT-C--AAGACAA-T-TCATTC-AC-A-C-CCA-GA---GC-
gi|61170                      : AAAG-G-G-G-AT-A-G-CT-T----A--GG--G-C-----TTC----T-GT--A-T-T-------------------------G-TA-TC-T-T-TTTC--AAGACAA-T-TCATTC-AC-T-ACCCA-GATAGAC-T-----TTG-ACCT-
gi|61171                      :  AAGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-A-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-A-TG-TATTC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCA-TGG
gi|61172                      :  AAGAG-G-G-AT-----TT-T----AA-GG--G-C-----TT-----G-AT--AAT-T---T-CT-AGAA-A--CA--A---TG-TA-TC-T-T-T--C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GCTT--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61173                      :  AAGAG-G-G-AT-A--------------GG--G-C-----TTT----A-GT--A-T-T---T-CC-T-AT-A--CA--G-A-TG-CT-GC-T-T-CC-C--TAGACAT-T-TCATTC-AG-T-A-CCA-GA---AC-T--A--TTG-ACC
gi|61174                      :  AAGAG-G-G-AC-A-G-CT------AA-GG--G-T-----GTT----G-------------T-CT-T-AA-A--CA--A---TG-TA-TC-T-T-TT-C--AGGA-AT-T-TCATTC-AC-T-C-CGA-GA---GC-T--ATTTTG-ACTT-
gi|61175                      :  AAG-G-G-G-AC-A-TTCT-TTTAAAA-GGTGG-C-----TTTTGGGG-AT--A-T-TCTCT-CTTA-AA-A--CA--A-T-TG-TA-TC-T-T-TT-C---AGACAT-T-TC-TTC--C-T-T-CCA-GA---GC-T--ATTTTG-ACC
gi|61176                      :  AAGAGTG-G-AA-A-T-CT-TTT--AA-TG--G-CAGCTCTTA----G-ATGTA-T-A---T-CT-A-A-----CA--A---TGATA-TC-GAT-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCAGGA---GC-T--A--
gi|61177                      :   AGAG-G-G-AT-A-T-CT-T----AA-GG--G-C-----TTT----GGAT--A-T-T---T-CT-A-AA-A--CA--A-AATG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACCT-TGG
gi|61178                      :   AAAA-G-G-AT-A-G-CT-------A-GG--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AT-A--CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCG-GA---GC-T--A--TTG-GACT-TGG
gi|61179                      :             T-A-T-CT----------G--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---TTCT-A-AA-AAATA--A-A-TG-TA-TT-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-TAA-CCA-GA---GC-T--A--TTG-AC
gi|61180                      :                       ----AA-GT--G-C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CT-A-AA-AA-CA--A-A-TG-TA-TC-T-T-TT-C--AAGACAT-T-TCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--AT-TTG-ACCT-TG
gi|61181                      :                                   -C-----TTT----G-AT--A-T-T---T-CC-T-AA-A--CA--A-C-TG-TA-CT-T-T-TC-C--AAGACAT-TATCATTC-AC-T-A-CCA-GA---GC-T--A--TTG-ACC