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lowQualScore : . . .. . .. . ... . .. .. .. . ..... .... . ...... .. ..... .. ..... . . .. . ... ... . ...... ..... . . . .. . . . .. . . . . ..... . ..... . . . ... . .. ... . . ..... .. .. . . .. . . .. . .
lowQualScore : 5 4 11 3 55 6 777 8 33 55 77 8 55555 9999 7 888888 44 55555 44 44444 8 8 55 9 333 555 0 111111 88888 9 9 9 66 5 9 9 66 9 9 9 3 33333 8 55555 8 6 3 222 8 33 222 8 8 55555 77 55 6 8 33 9 9 33 2 4
consensus : AAGTC-CG-A--TCTGGAG--CA-A---GGT-GCC--G--ATGGAGA-ACG-----CCC----T-TGGGAACATTTA--CN--GTCCCT--CC----GA--GCAGCT--T--CAATGCGCTG-CA-TTCTG--TC-C---AACAA---CTCTCCG-A----A-A-----AT-GT-TCCTGG-AG--TCCAGGTCT-GGA-GAAGG--GTCC-C-TTGA-CGCTACCCCCACTTG--G--CG-TT-----C-TT-TC-GG---C-TTTGAGGGA--C---AA-C-TCC-----GGCG-AG--AAT-GCT-G--GAA-AT-ACT-GCATCC-G-ATCAA
Reference ( family-600 ) : AAGTC-CG-A--TCTGGAG--CA-A---GGT-GCC--G--ATGGAGA-ACG-----CCC----T-TGGGAACATTTA--CN--GTCCCT--CC----GA--GCAGCT--T--CAATGCGCTG-CA-TTCTG--TC-C---AACAA---CTCTCCG-A----A-A-----AT-GT-TCCTGG-AG--TCCAGGTCT-GGA-GAAGG--GTCC-C-TTGA-CGCTACCCCCACTTG--G--CG-TT-----C-TT-TC-GG---C-TTTGAGGGA--C---AA-C-TCC-----GGCG-AG--AAT-GCT-G--GAA-AT-ACT-GCATCC-G-ATCAA
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