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Reference ( family-587 ) : CCAAAAAAT--GCAA--TTG--CTT-AATT--T--T-AT--T--C--AT---T-TATAG-TC--A-TCA--TT---G-AC--C-AA-TC-GA-------A--T-------AAT-CC-AA-ATC-AA-AG-A--ATC-T-A-T-TCT-CA-TC-A--T-----A-A-T-CGAA---C-G-G--A-AG--A------CC-T-A-C-T-CG-TTG-C-T----C-G----C-A--A--CG-AGA-TCGGAA----T--C--T-AGT--T-TAT-TNT-TATTA
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blockSeqs : . . . . . . . . A . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . A .
blockSeqs : . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . .
blockSeqs : . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
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originalCons : CCAAAAAAT--GCAA--TTG--CTT-AATT--T--T-AT--T--C--AT---T-TATAG-TC--A-TCA--TT---G-AC--C-AA-TC-GA-------A--T-------AAT-CC-AA-ATC-AA-AG-A--ATC-T-A-T-TCT-CA-TC-A--T-----A-A-T-CGAA---C-G-G--A-AG--A------CC-T-A-C-T-CG-TTG-C-T----C-G----C-A--A--CG-AGA-TCGGAA----T--C--T-AGT--T-TAT-TNT-TATTA
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lowQualScore : .. ... .. . .. .. . .. .. .. ... . . . .. . .. ..... .. . . . ....... .. ....... .. . ..... . . . ... .. . . . . . . .. ..... . . . ... . . . .. ...... . . . . . . . . .... . .... . .. .. . . . . . .... .. .. . ... . . . .
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Reference ( family-587 ) : CCAAAAAAT--GCAA--TTG--CTT-AATT--T--T-AT--T--C--AT---T-TATAG-TC--A-TCA--TT---G-AC--C-AA-TC-GA-------A--T-------AA--T-CCAA-A-TC-AA-AG-A--ATC-T-AT-T-CT-CA-T-CA--T-----A-A-T-CGAA---C-G-GA-A--GA------CCT-A-C-T-CG-TT-G-C-T----C-G----C-A--A--CG-AGA-TC-G-A-A----T--C--T-AGT--T-TAT-TNT-TATTA
gi|87571 : CCAAAACAT--GCAA--TTG--CTT-AATT--T--T-AT--T--CT-AT---T-TATAG-TC--A-TCA--TT---G-AC--C-AA-TC-GA-------A--T-------AA--T-CC-A-A-TC-AA-AA-A--ATC-TAAT-T-TT-CA-T-CA--T-----A-A-T-CGAA---C-G-GA-A--GA------CCT-A-C-T-CG-TT-G-CTT----T-G----C-A--A--CG-AGA-TCGG-A-A----T--C--TAAGC--T-TAT-TTGATATTA
gi|87572 : CCAAAACAT--GCA---TTGA-CTT-AATT--T--T-AT--T--CT-AT---T-TATAG-TCC-A-TCA--TT---G-AC--C-AA-TC-GA-------A--T-------AA--T-CCAA-A-TC-AA-AA-A--ATC-T-AT-T-TT-CA-T-CA--T-----A-A-T-CGAA---C-G-GA-A--GA------CCT-A-C-T-CG-TT-G-C-T----T-G----C-A--A--CG-AGA-TCGG-A-A----T--C--T-AGC--T-TAT-TGA-TATTAtatgtacattttttt
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gi|87578 : CCAAAAAA---GCAAAATTG--CTA-AATT--T--T-AT-----C--AT---C-TATAA-TC--A-TCA--TT-----AC--C-AA-TC-GA-------A--TGACCGTAAA--T-CCAA-T-CT-AA-AG-A--TGC-T-AT-T-CT-CA-T-CA--T-----A-A-T-CGAA---C-G-GA-A--GA------CC--A-C---CG-TT-G-C-T----C-G----T-A--AGCCGAAGA-TC-GAA-A----T--C--T-AGT--T-
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gi|87585 : AAAAAAT--GTAG--CTA--CTT-AATT--C--T-GT--T--C--AT---T-TATAG-GC--A-TCA--TT---C-AC--CAAA-TA-AA-------A--T-------AA--T-C------TC-AAGAA-A--ATT-T-TTGT-CT-CA-T-TA--T-----A-A-T-CGAA---C-G-GA-A--agttt
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gi|87597 : --T-----A-A-T-CGA----C-G-GA-A--A--------CT-A-C-T-CG-T--G-C-TT---C-G----C-A--A--CG-AGA-TC-G---A----T--C--T-AGT--T-TA--TAT-TGTT
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