lowQualScore : 222 11 11 33333
lowQualScore : 1 1 1 1 3 33 33 77777777777 1 1 33 3 22 3 1 8 6666666666 1 1 55 1 7777 22 1 44 1 5555555 3 1 1 1 22 3 22 3333 1 1 1 22 3333 1 77 77 999 555 1 55 1 3 22 444 1 1 1 1 66 1 1 22 22 1 33 6 3333 99999 1 1 1 1 1
lowQualScore : . . . . . .. .. ........... . . .. . .. . . . .......... . . .. . .... .. . .. . ....... . . . . .. . .. .... . . . .. .... . .. .. ... ... . .. . . .. ... . . . . .. . . .. .. . .. . .... ..... . . . . .
lowQualScore : 6 6 6 6 2 88 88 66666666666 6 6 88 2 22 2 6 0 6666666666 6 6 44 6 0000 22 6 44 6 2222222 2 6 6 6 22 2 22 4444 6 6 6 44 4444 6 66 66 222 222 7 66 7 3 44 888 7 7 7 7 00 7 7 88 33 7 55 2 5555 77777 7 7 7 7 7
consensus : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TTT-A-T--T-T--T-T-T-GC---------GGG-T-GT--AGAAA-AA---TG--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AAC-CTTTG--CAG--CAA--TTT-TTTAT--AAAAT-G-AAACCAT--C---T-AA-TT-GCG-T-AAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAATT----TA-----ATTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
Reference ( gi|107003 ) : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TTT-A-T--T-T--T-T-T-GT---------GGG-T-GT--AGAAA-AA---TG--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AAC-TTTTG--CAG--TAAT-TTT-TTTAT--AAAAT-G-AAACCAT--C---T-AA-TT-GCG-T-GAT-A-A-GTGA--G-C-CTATAATT----TAAT---ATTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107004 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GC-A--TAATA-----------TTT-A-T--T-T--T-T-T-GT---------GGG-T-GT--AGAAA-A----TG--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T--AAAT----A-AAC-TTTTG--CAG--TAAT-TTT-TTTATA-AAAAT-G-AAACCAT--C---T-AA-TT-GCG-T-GAT-A-A-GTGA--G-C-CTATAATT----TAAT---ATTG-C--GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107008 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TGATA-----------TTT-A-T--T-T--T-T-T-GT---------GGG-T-GT--AGAAA-AA---TG--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CGT-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AAC-CTCTG--CAG--CAA---TT-TTTAT--ACAAT-A-AAACCAT--C---T-AT-TT-GCA-T-AAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAATT----TA-----ATTA-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107009 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TGATA-----------TTT-A-T--T-T--T-T-TTGC---------GGT-T-GT--AGAAA-AA---TG--T-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AAC-ATTTG--CAG--CAA---TT-TCTAT--AAAAT-G-AAACCAT--C---T-AA-TT-GCG-T-AAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAATT----TA-----ATTG-CG-GCTC-G-
gi|107007 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TTT-A-T--T-T--TTT-T-GT---------GGG-T-GT--AGAAA-AA---TG--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-T-T--G-CC--TC----AC-ATC-AAA-T-AAAAT----A-AAC-CTTTG--CAG--CAA---TT-TTTAT--GAAAT-G-ACACCAT--C---T-TA-TT-GCG-T-AAT-A-A-ATGA--G-C-GTAAGATC----TA-----ATTG-CG-GCTC-G-G-TGCTATT
gi|107005 : TTA-AAGATAT-AC-AG--C-T--CCC---TAATA-----------TTT-A-T--T-T--T-T-T-GT---------G---T-GT--A-AAA-AA---TG--A-TT---AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--GTCC--TC----AA-ACC-AAA---AAAAT----A-AAC-TTTTG--CAG--TAA--TTT-TTTAT--AAAAT-GAAAACCAT--C---T-AA-TT-GCG-T-GAT-A-A---GA--GTC-CTATAA-T----TAAT---ATTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107000 : TTA-AAAATAA-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------GTT-A-T--T-T--T-T-TAGT---------GGT-T-GT--AGAAA-TG---TT--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAATA----A-AAC-CTTTG--CAG--CAA--TTT-TTTAT--AAAAC-G-AAACCAT--C---T-AA-TT-GCG-T-AATAA-A-ATGA--G-C-GTAGAATT----TA-----ATTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107001 : TTA-AAAATAA-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA------------TT-A-T--T-T--T-T-TAGT---------GGT-T-GT--AGAAA-TG---TT--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAATA----A-AAC-CTTTG--CAG--CAA----T-TTTAT--AAAAC-G-AAACCAT--C---T-AA-TT-GCG-T-AAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAATT-------T---ATTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107013 : TTA-AAGAT-T-AC-AG-GC-TT-GCTA---AATA-----------TTT-A-T--T-T--T-T-TTGT---------AGG-T-GT--AGAAA-AA---TG--A-TTT--AA-G--------TT-A-CCT-G-T--G--C--TC----AA-A-C-AAA-T-AAAAT------AAC-CTTTG--CAG--CAAT-TTT-TTTATAAAAAAT-G-AAACCAT--C---T-AA-TTGGCG-T-AAT-AGA-ATGA--G-C-ATATAATT----TA-----ATTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107012 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CAT-A-T--TGT--T-T-T-GC---------GGG-T-AT--AGAAA-A----TG--A-TTTTTAA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AAC-CTTTG--CAG--CAA---TT-CTAAT--CAAAT-G-AAACCAT--C---T-AA-TT-GCG-T-AAT-G-A-TTGA--G-C-ATAGAATT----TA-----ATTG-CG-GATC-G-G-T--TTTT
gi|107011 : TCA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CTT-A-T--T-T--T-T---GT---------GGT-T-GT--AGAAA-TA---TT--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CAT-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-----------T----A-AAC-CTTTG--CAG--CAAT-TTT-TATAT--AA--C-G-AAACCAT--C---T-AA-TT-GCA-T-AAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAATT----TA-----ATTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107010 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAAT------------TTT-A-T--T-TATT-T-T-AC---------GGT-T-GT--AGAAA-A----TG--A-TTT--AAAGT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T--AAAT----A-AAC--ATTG--CAG--CAA---TT-TCTAT--AAAAT-GAAAACCAT--C---T-AA-TT-GCG-T-AAT-A-A-AAGA--G-C-GTAGAATT----TA-----ATTG-CG-GTTC-G-GCTGCTTTT
gi|107006 : TTA-AAGATCT-A---G-GC-T--GC-A--TAATA-----------TT--A-TA-T-T--T-T-T-GT---------GGG-T-GT--AGAAA-AC---TG--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TC-----A-ACC-AAA-T--AAAT----A-AAC-TTTTG---AG--TAAT-TTT-TTTAT--TAAAT-G-AAACATT--C---T-AA-TT-GCG-T-GAT-A-A-GTGA--G-C-CT-TAATT----T--T----TTG-CG---CC-G-G--GCTTTT
gi|107014 : TTT-AAGATAT-AC-AG-GCCT--GCCA--TAATA-----------TTT-ATT--T-T--T-T-T-GC---------GGG-T-GT---GAAA-AA---TG--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-C----T----AA-A---AA----AAAAT----A-AACATTTGG--CAG--CA----TT-TTTAT--AAAAT-G--AACCAT--C---T-AA-TT-GC--T-AAT-A-A-ATGT--G-C-ATATAATT----TA-----ATTG-CA-ACTC-G-G-TGCTTTT
gi|107017 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-CTGGCCAATTAATA-----------TTT-A-T--T-T--TGT-T-GC---------GGGGT-GTTTAGAAA-AAA--TG--ACTTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TT----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AAC-ATTTG--CAG--CCA---TT-TTTAT--AAATT-A-ACATC----C---T-AATTT-GCG-T-TAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAATT----CAA------TG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107015 : TTT-AAGATAT-AC-AG-GCCT--GCCA--TAATA-----------TTT-A-T--T-T--T-T-T-GC---------GGG-T-GT---GAAA-AA---TG--A-TTT--AT-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--TA----AA-AAA-AAA-T---AAT----A-A---TTTGG--CAG---A----TT-TTTAT--AAAAT-G--AACCAT------T-AA-TT-GCG-T-AAT-A-A-ATGT--G-C-ATATAATT----TA-----ATTG-CA-ACTC---G-TGCTTTT
gi|107002 : TTA-AAAATA--AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT--A-T--T-T--T-A---GT---------GGT-T-GT--AGAAA-TG---TT--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G--C--TC----AA-ACCAAAA-T-AAATA----A-AAC-CTTTG--CAG--CAA----T-TTTATA-AAAAC-G-AAACCAT--C---T-AA-TT-GCGTT-AAT-A-A-A-GA--G-C-GTAGAATT----TTA----ATTG-CGCGCTC-GCG-TGCCTTT
gi|107016 : TTA-AAGTAATGAC-AGAGC-T--GCCA--TAATA-----------TTTTA-T--T-T--T-T-TCGC---------GGG-TTGT--AGAAA-A----TGATA-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--T-AC---------A-CCC-AAA-T-AAAAT------AAC-CTTTG--CAG--CAAT-TTTACAAAT--AAAAT-G-AAACCATCGC---T--A-TT-GCG-T-AGT-A-A-ATGA--G-C-GTAAAATT----TA-----ATTG-C--GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107018 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TTT-A-TGTT-T--T-T-T-GC---------GGT-T-GTT-AGAAA-AA---TG--A-TTT--AA----------------------------------------TC-AAA-T-AAAAT----A-AAC-ATTTGC-CAG--CAA---TT-TCTAT--GAAAT-G-AAACAAT--CTTAT-AA-TT-GTG-T-AAT-A-A--TGA--G-C-GTAGAATT----TA-------TG-CG-GCTC-G-C-TGCTTTT
gi|107019 : TTACAAGATAT-ACCAG-G--T--GCCA----ATA-----------CTT-A-T--T-T--T-T---AC---------GGG-T-GT--AGAAA-AA---TG--A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-GCT--G-CC--TT----AA-CCA-AAA-T-AAATA----A-AAC-ATTTG--CAC--AAA---TT-TCTAT--AAAAT-G-AA--CAT--C---T-AA--T-GC--T-AAT-A-A--TGA--G---GTAGAATT----TAAT----TTG-CG-GCTC---G-TGCTTT
gi|107023 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATACATGACTTGTATTT-A-T--T-T--T-T-T-GC---------GGG-T-GT--AGAAA-AC---TG--A-T-------------------A-CCT-G-G--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AAC-TTTTG--CAG--
gi|107022 : TTA-AAGATAT-AT-AG-GG-T--GCCA--TAATA-----------TTT-A-A--TAT--T-T-T-GT---------GGG-T-GT--AGAAA-AA---TG--A-TTT--AA-GTTTAGTTATT-A-CCT---T--G-CT--TC----AA-ACC--AA-T-AAAAT----ACAAC-CTTTGACTAG--CAAT-TTC-T
gi|107021 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CTT-----------T-T-T-G----------------------AAATAACCTTG--A-TTTTCAA-GT-------TTTATCCT-G-TAAG-CCCATCTATAGA-ACC-AAAAT-AAAACCCTAA-AAC-CTTTG--CAGG-CAAGATGT-TTTAT--AAAAAAG-AGAACAT--CG--T-AA-TT-GCG-TAAAT-A-A--TGA--G-C-GTGAAATT----TTATGTAATTGCCG-GCTCGG-G-TGCTTTT
gi|107024 : TA-AAGATAT-A--AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TTA-T-T--T-T--T-T-T-GC---------GGG-T-GTA-AGAAA-AA---TG--A-TTT--AA-CT-------TT-A-CCTGG-T--T-CC--TC----AACACC-AAA-TAAAAAT----A-AAC-ATTTGACCAG--CAAT-TTT-----T--AAAAT---AAACCAT--C---T-AA-TT-GCA-T-AAT-A-ACATGA--G-C-ATGTAATTTTTCTA-----ATTG-CG-GCTC-G-G-TGCCTTT
gi|107025 : A-AAGGTA---C-AG-GC-T--GCCGG-TAATA-----------TTT---T--T-T--T-T-T-GTTTTTTTTGCAGG-T-GT--AGAAA-AA---TG--A-TTT--AA-GT-------TTTA-CC--G-T--GGCC--TC----GA---C-A------------------C-CTTTG--CAG--CAAT-TGT-TT-AT--AGAAT-G-AAACCAT--C---TGAG-TT-GCG-T-AAT-A-A-ATGAAGG-CGGTATACTT----TA-----ATTG-CG-GCTC-G-G-TGC
gi|107020 : A-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TATTT-----------TTA-A-T--T-T--T-TCT-GC---------GCG-T-GT--AGAAA-AA-------A-TTT--AA-GT-------TT-A-CCT-G-T--G-CC--C------A-ACC-AAA-T-AAAA-----A-AAC-CTTTGA-CAGCATGA--TTG-TTTAT--AAAAT-G-A
gi|107026 : ttaTTAT--AAATT-G-AAACCAT--C---T-AA-TT-GCG-T-AAT-A-A-TTGA--G-C-ATATAATT----TA-----ATTG-AG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107027 : -TT-GCG-T-AAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAATT----TA-----ATTG-CG-CCTC-T-G-TGCTTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111
lowQualScore : 1 1 1 1 3 33 33 77777777777 1 1 1 22 3 22 1 4444444444 1 1 55 1 6666 1 22 44 1 5555555 3 1 1 1 1 22 1 22 3333 1 1 1 11 3333 1 0 1 77 1 22 666 1 22 1 22 1 3 1 666 1 1 1 1 1 1 1 22 1 1 1 1 77777 66 1 1 1 1 1 1
lowQualScore : . . . . . .. .. ........... . . . .. . .. . .......... . . .. . .... . .. .. . ....... . . . . . .. . .. .... . . . .. .... . . . .. . .. ... . .. . .. . . . ... . . . . . . . .. . . . . ..... .. . . . . . .
lowQualScore : 5 5 5 5 1 77 77 33333333333 5 5 5 11 1 11 5 9999999999 5 5 22 5 3333 5 11 22 5 0000000 1 5 5 5 5 11 5 11 3333 5 5 5 99 3333 5 8 5 33 5 22 777 6 22 6 22 6 2 7 999 7 6 6 6 6 6 6 22 6 6 6 6 44444 00 6 6 6 6 6 7
consensus : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
Reference ( family-585 ) : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107000 : TTA-AAAATAA-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------GT-T-A-T--T-T--T-T--------TAGTGGT-T-GT--AGAAA-TG---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAATA----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAATAA-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107001 : TTA-AAAATAA-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA------------T-T-A-T--T-T--T-T--------TAGTGGT-T-GT--AGAAA-TG---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAATA----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A----TTTT-A--T-AAAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----T---A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107002 : TTA-AAAATA--AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT---A-T--T-T--T-A----------GTGGT-T-GT--AGAAA-TG---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G--C--TC----AA-ACCAAAA-T-AAATA----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTAT-A----AAAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CGTTAAT-A-A-A-GA--G-C-GTAGAATTT-----TA--A-TTG-CGCGCTC-GCG-TGCCTTT
gi|107003 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACTTTT-G--CAG-TA--AT-TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A-GTGA--G-C-CTATAA-TT-----TAATA-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107004 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GC-A--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-A----TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T--AAAT----A-AACTTTT-G--CAG-TA--AT-TTTTTT-A--TAAAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A-GTGA--G-C-CTATAA-TT-----TAATA-TTG-C--GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107005 : TTA-AAGATAT-AC-AG--C-T--CCC---TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTG---T-GT--A-AAA-AA---TGA-T--T---AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--GTCC--TC----AA-ACC-AAA---AAAAT----A-AACTTTT-G--CAG-TA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-GAAAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A---GA--GTC-CTATAA-TT-----AAT-A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107006 : TTA-AAGATCT-A---G-GC-T--GC-A--TAATA-----------TTAT-A-T--T-T--T-T----------GTGGG-T-GT--AGAAA-AC---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC-----A-ACC-AAA-T--AAAT----A-AACTTTT-G---AG-TA--AT-TTTTTT-A--T-TAAA--T-G-AAACATT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A-GTGA--G-C-CTTAAT-TT-----T-----TTG-CG---CC-G-G--GCTTTT
gi|107007 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------TTGTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-T-T--G-CC--TC----AC-ATC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A---TTTTT-A--T-GAAA--T-G-ACACCAT-C---T-TA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAAGA-TC-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTATT
gi|107008 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TGATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CG-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTCT-G--CAG-CA--A---TTTTT-A--T-ACAA--T-A-AAACCAT-C---T-AT-TTG-CA-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTA-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107009 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TGATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------TTGCGGT-T-GT--AGAAA-AA---TGT-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACATTT-G--CAG-CA--A---TTTCT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-
gi|107010 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAAT------------TT-T-A-T--T-TATT-T--------T-ACGGT-T-GT--AGAAA-A----TGA-T--TT--AAAGT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T--AAAT----A-AACA-TT-G--CAG-CA--A---TTTCT-A--T-AAAA--T-GAAAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-AAGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GTTC-G-GCTGCTTTT
gi|107011 : TCA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CT-T-A-T--T-T--T-T----------GTGGT-T-GT--AGAAA-TA---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CA-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-----------T----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTT--A--T-ATAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CA-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107012 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CA-T-A-T--TGT--T-T--------T-GCGGG-T-AT--AGAAA-A----TGA-T--TTTTAA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A---TTCTA-A--T-CAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-G-A-TTGA--G-C-ATAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GATC-G-G-T--TTTT
gi|107013 : TTA-AAGAT-T-AC-AG-GC-TT-GCTA---AATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------TTGTAGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------T--A-CC-T-G-T--G-C---TC----AA-AC--AAA-T-AAAAT----A-A-CCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTTTA--T-AAAAAAT-G-AAACCAT-C---T-AA-TTGGCG-TAAT-AGA-ATGA--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107014 : TTT-AAGATAT-AC-AG-GCCT--GCCA--TAATA-----------TT-T-ATT--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT---GAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-C----T----AA-A---AA----AAAAT----A-AACATTTGG--CAG-CA------TTTTT-A--T-AAAA--T-G--AACCAT-C---T-AA-TTG-C--TAAT-A-A-ATGT--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-CA-ACTC-G-G-TGCTTTT
gi|107015 : TTT-AAGATAT-AC-AG-GCCT--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT---GAAA-AA---TGA-T--TT--AT-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TA----AA-AAA-AAA-T---AAT----A-A---TTT-G----G-CA--G--ATTTTT-A--T-AAAA--T-G--AACCAT-----T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGT--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-CA-ACTC---G-TGCTTTT
gi|107016 : TTA-AAGTAATGAC-AGAGC-T--GCCA--TAATA-----------TT-TTA-T--T-T--T-T--------TCGCGGG-TTGT--AGAAA-A----TGA-TATTT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--T-AC---------A-CCC-AAA-T-AAAAT----A-A-CCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTAC-AAAT-AAAA--T-G-AAACCAT-CGC-T-A--TTG-CG-TAGT-A-A-ATGA--G-C-GTAAAA-TT-----TA--A-TTG-C--GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107017 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-CTGGCCAATTAATA-----------TT-T-A-T--T-T--TGT--------T-GCGGGGT-GTTTAGAAA-AAA--TGACT--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TT----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACATTT-G--CAG-CC--A---TTTTT-A--T-AAAT--T-A-A---CATCC---T-AATTTG-CG-TTAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----CA--A--TG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107018 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-TGTT-T--T-T--------T-GCGGT-T-GTT-AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-----------------------------------------TC-AAA-T-AAAAT----A-AACATTT-GC-CAG-CA--A---TTTCT-A--T-GAAA--T-G-AAACAAT-CTTAT-AA-TTG-TG-TAAT---A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA-----TG-CG-GCTC-G-C-TGCTTTT
gi|107019 : TTACAAGATAT-ACCAG-G--T--GCCA----ATA-----------CT-T-A-T--T-T--T-T----------ACGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-GCT--G-CC--TT----AA-CCA-AAA-T-AAATA----A-AACATTT-G--CA--CA--A--ATTTCT-A--T-AAAA--T-G-AA--CAT-C---T-AA--TG-C--TAAT---A-ATGA--G---GTAGAA-TT-----TA--ATTTG-CG-GCTC---G-TGCTTT
gi|107020 : A-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TATTT-----------TT-A-A-T--T-T--T-TC-------T-GCGCG-T-GT--AGAAA-AA-----A-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--C------A-ACC-AAA-T-AAAA-----A-AACCTTT-GA-CAG-CATGA--TTGTTT-A--T-AAAA--T-G-A
gi|107021 : ttaTTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CT-T-----------T-T--------T-G-------------AAATAACCTTGA-T--TTTCAA-GT-------TTTATCC-T-G-TAAG-CCCATCTATAGA-ACC-AAAAT-AAAACCCTAA-AACCTTT-G--CAGGCA--AGATGTTTT-A--T-AAAA--AAG-AGAACAT-CG--T-AA-TTG-CG-TAAA-T-A-ATGA--G-C-GTGAAA-TTTTATGTA--A-TTGCCG-GCTCGG-G-TGCTTTT
gi|107022 : TTA-AAGATAT-AT-AG-GG-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-A--TAT--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GTTTAGTTATT-A-CC-T---T--G-CT--TC----AA-ACC--AA-T-AAAAT----ACAACCTTT-GACTAG-CA--A--TTTCT
gi|107023 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATACATGACTTGTATT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT--AGAAA-AC---TGA-T---------------------A-CC-T-G-G--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACTTTT-G--CAG-
gi|107024 : TA-AAGATAT-A--AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-A-T-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GTA-AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-CT-------TT-A-CC-TGG-T--T-CC--TC----AACACC-AAA-TAAAAAT----A-AACATTT-GACCAG-CA--A--TTTT------T-AAAA--T---AAACCAT-C---T-AA-TTG-CA-TAAT-A-ACATGA--G-C-ATGTAA-TTTTTC-TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCCTTT
gi|107025 : A-AAGGTA---C-AG-GC-T--GCCGG-TAATA-----------TT-T-T-T--T-T--T-TGTTTTTTTT-GCAGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TTTA-CCGT-G----G-CC--TC----GA---C-A------------------CCTTT-G--CAG-CA--A--TTGTTT-A--T-AGAA--T-G-AAACCAT-C---TGAG-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGAAGG-CGGTATAC-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGC
gi|107026 : TT-A--T-AAAT--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-TTGA--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-AG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107027 : -TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-CCTC-T-G-TGCTTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111
lowQualScore : 1 1 1 1 3 33 33 77777777777 1 1 1 22 3 22 1 4444444444 1 1 55 1 6666 1 22 44 1 5555555 3 1 1 1 1 22 1 22 3333 1 1 1 11 3333 1 0 1 77 1 22 666 1 22 1 22 1 3 1 666 1 1 1 1 1 1 1 22 1 1 1 1 77777 66 1 1 1 1 1 1
lowQualScore : . . . . . .. .. ........... . . . .. . .. . .......... . . .. . .... . .. .. . ....... . . . . . .. . .. .... . . . .. .... . . . .. . .. ... . .. . .. . . . ... . . . . . . . .. . . . . ..... .. . . . . . .
lowQualScore : 5 5 5 5 1 77 77 33333333333 5 5 5 11 1 11 5 9999999999 5 5 22 5 3333 5 11 22 5 0000000 1 5 5 5 5 11 5 11 3333 5 5 5 99 3333 5 8 5 33 5 22 777 6 22 6 22 6 2 7 999 7 6 6 6 6 6 6 22 6 6 6 6 44444 00 6 6 6 6 6 7
consensus : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
Reference ( family-585 ) : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107000 : TTA-AAAATAA-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------GT-T-A-T--T-T--T-T--------TAGTGGT-T-GT--AGAAA-TG---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAATA----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAATAA-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107001 : TTA-AAAATAA-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA------------T-T-A-T--T-T--T-T--------TAGTGGT-T-GT--AGAAA-TG---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAATA----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A----TTTT-A--T-AAAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----T---A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107002 : TTA-AAAATA--AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT---A-T--T-T--T-A----------GTGGT-T-GT--AGAAA-TG---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G--C--TC----AA-ACCAAAA-T-AAATA----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTAT-A----AAAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CGTTAAT-A-A-A-GA--G-C-GTAGAATTT-----TA--A-TTG-CGCGCTC-GCG-TGCCTTT
gi|107003 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACTTTT-G--CAG-TA--AT-TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A-GTGA--G-C-CTATAA-TT-----TAATA-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107004 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GC-A--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-A----TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T--AAAT----A-AACTTTT-G--CAG-TA--AT-TTTTTT-A--TAAAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A-GTGA--G-C-CTATAA-TT-----TAATA-TTG-C--GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107005 : TTA-AAGATAT-AC-AG--C-T--CCC---TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTG---T-GT--A-AAA-AA---TGA-T--T---AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--GTCC--TC----AA-ACC-AAA---AAAAT----A-AACTTTT-G--CAG-TA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-GAAAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A---GA--GTC-CTATAA-TT-----AAT-A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107006 : TTA-AAGATCT-A---G-GC-T--GC-A--TAATA-----------TTAT-A-T--T-T--T-T----------GTGGG-T-GT--AGAAA-AC---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC-----A-ACC-AAA-T--AAAT----A-AACTTTT-G---AG-TA--AT-TTTTTT-A--T-TAAA--T-G-AAACATT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A-GTGA--G-C-CTTAAT-TT-----T-----TTG-CG---CC-G-G--GCTTTT
gi|107007 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------TTGTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-T-T--G-CC--TC----AC-ATC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A---TTTTT-A--T-GAAA--T-G-ACACCAT-C---T-TA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAAGA-TC-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTATT
gi|107008 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TGATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CG-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTCT-G--CAG-CA--A---TTTTT-A--T-ACAA--T-A-AAACCAT-C---T-AT-TTG-CA-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTA-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107009 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TGATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------TTGCGGT-T-GT--AGAAA-AA---TGT-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACATTT-G--CAG-CA--A---TTTCT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-
gi|107010 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAAT------------TT-T-A-T--T-TATT-T--------T-ACGGT-T-GT--AGAAA-A----TGA-T--TT--AAAGT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T--AAAT----A-AACA-TT-G--CAG-CA--A---TTTCT-A--T-AAAA--T-GAAAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-AAGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GTTC-G-GCTGCTTTT
gi|107011 : TCA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CT-T-A-T--T-T--T-T----------GTGGT-T-GT--AGAAA-TA---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CA-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-----------T----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTT--A--T-ATAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CA-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107012 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CA-T-A-T--TGT--T-T--------T-GCGGG-T-AT--AGAAA-A----TGA-T--TTTTAA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A---TTCTA-A--T-CAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-G-A-TTGA--G-C-ATAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GATC-G-G-T--TTTT
gi|107013 : TTA-AAGAT-T-AC-AG-GC-TT-GCTA---AATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------TTGTAGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------T--A-CC-T-G-T--G-C---TC----AA-AC--AAA-T-AAAAT----A-A-CCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTTTA--T-AAAAAAT-G-AAACCAT-C---T-AA-TTGGCG-TAAT-AGA-ATGA--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107014 : TTT-AAGATAT-AC-AG-GCCT--GCCA--TAATA-----------TT-T-ATT--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT---GAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-C----T----AA-A---AA----AAAAT----A-AACATTTGG--CAG-CA------TTTTT-A--T-AAAA--T-G--AACCAT-C---T-AA-TTG-C--TAAT-A-A-ATGT--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-CA-ACTC-G-G-TGCTTTT
gi|107015 : TTT-AAGATAT-AC-AG-GCCT--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT---GAAA-AA---TGA-T--TT--AT-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TA----AA-AAA-AAA-T---AAT----A-A---TTT-G----G-CA--G--ATTTTT-A--T-AAAA--T-G--AACCAT-----T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGT--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-CA-ACTC---G-TGCTTTT
gi|107016 : TTA-AAGTAATGAC-AGAGC-T--GCCA--TAATA-----------TT-TTA-T--T-T--T-T--------TCGCGGG-TTGT--AGAAA-A----TGA-TATTT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--T-AC---------A-CCC-AAA-T-AAAAT----A-A-CCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTAC-AAAT-AAAA--T-G-AAACCAT-CGC-T-A--TTG-CG-TAGT-A-A-ATGA--G-C-GTAAAA-TT-----TA--A-TTG-C--GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107017 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-CTGGCCAATTAATA-----------TT-T-A-T--T-T--TGT--------T-GCGGGGT-GTTTAGAAA-AAA--TGACT--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TT----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACATTT-G--CAG-CC--A---TTTTT-A--T-AAAT--T-A-A---CATCC---T-AATTTG-CG-TTAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----CA--A--TG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107018 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-TGTT-T--T-T--------T-GCGGT-T-GTT-AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-----------------------------------------TC-AAA-T-AAAAT----A-AACATTT-GC-CAG-CA--A---TTTCT-A--T-GAAA--T-G-AAACAAT-CTTAT-AA-TTG-TG-TAAT---A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA-----TG-CG-GCTC-G-C-TGCTTTT
gi|107019 : TTACAAGATAT-ACCAG-G--T--GCCA----ATA-----------CT-T-A-T--T-T--T-T----------ACGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-GCT--G-CC--TT----AA-CCA-AAA-T-AAATA----A-AACATTT-G--CA--CA--A--ATTTCT-A--T-AAAA--T-G-AA--CAT-C---T-AA--TG-C--TAAT---A-ATGA--G---GTAGAA-TT-----TA--ATTTG-CG-GCTC---G-TGCTTT
gi|107020 : A-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TATTT-----------TT-A-A-T--T-T--T-TC-------T-GCGCG-T-GT--AGAAA-AA-----A-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--C------A-ACC-AAA-T-AAAA-----A-AACCTTT-GA-CAG-CATGA--TTGTTT-A--T-AAAA--T-G-A
gi|107021 : ttaTTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CT-T-----------T-T--------T-G-------------AAATAACCTTGA-T--TTTCAA-GT-------TTTATCC-T-G-TAAG-CCCATCTATAGA-ACC-AAAAT-AAAACCCTAA-AACCTTT-G--CAGGCA--AGATGTTTT-A--T-AAAA--AAG-AGAACAT-CG--T-AA-TTG-CG-TAAA-T-A-ATGA--G-C-GTGAAA-TTTTATGTA--A-TTGCCG-GCTCGG-G-TGCTTTT
gi|107022 : TTA-AAGATAT-AT-AG-GG-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-A--TAT--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GTTTAGTTATT-A-CC-T---T--G-CT--TC----AA-ACC--AA-T-AAAAT----ACAACCTTT-GACTAG-CA--A--TTTCT
gi|107023 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATACATGACTTGTATT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT--AGAAA-AC---TGA-T---------------------A-CC-T-G-G--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACTTTT-G--CAG-
gi|107024 : TA-AAGATAT-A--AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-A-T-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GTA-AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-CT-------TT-A-CC-TGG-T--T-CC--TC----AACACC-AAA-TAAAAAT----A-AACATTT-GACCAG-CA--A--TTTT------T-AAAA--T---AAACCAT-C---T-AA-TTG-CA-TAAT-A-ACATGA--G-C-ATGTAA-TTTTTC-TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCCTTT
gi|107025 : A-AAGGTA---C-AG-GC-T--GCCGG-TAATA-----------TT-T-T-T--T-T--T-TGTTTTTTTT-GCAGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TTTA-CCGT-G----G-CC--TC----GA---C-A------------------CCTTT-G--CAG-CA--A--TTGTTT-A--T-AGAA--T-G-AAACCAT-C---TGAG-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGAAGG-CGGTATAC-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGC
gi|107026 : TT-A--T-AAAT--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-TTGA--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-AG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107027 : -TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-CCTC-T-G-TGCTTTT
blockSeqs : C G C A C TG AT CATGACTTGTA A T T GT G AT G GTTTTTTTT G T TT T ACCT C AT TT A TTAGTTA T T G G C AA T CA TATA C A A AA CCTA C G AC G TG GAT T AA A AA A A C TTA G T G T . G C AG T G G T TTATG AT T C C G C C
blockSeqs : . . . . C T G . . . . . A . . TA . . T . AA . . TC . . T . . . . . . . . . . . A . . . AC . . TT . . . . . A . GC . . . . . . . . . . G . TTTC AT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TT . . A . G . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . TT . . . . . . . G . . . . . . . . . . T . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : T*********
originalCons : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
finalCons : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-TT---------GCGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111
lowQualScore : 1 1 1 1 3 33 33 77777777777 1 1 1 22 3 22 1 4444444444 1 1 55 1 6666 1 22 44 1 5555555 3 1 1 1 1 22 1 22 3333 1 1 1 11 3333 1 0 1 77 1 22 666 1 22 1 22 1 3 1 666 1 1 1 1 1 1 1 22 1 1 1 1 77777 66 1 1 1 1 1 1
lowQualScore : . . . . . .. .. ........... . . . .. . .. . .......... . . .. . .... . .. .. . ....... . . . . . .. . .. .... . . . .. .... . . . .. . .. ... . .. . .. . . . ... . . . . . . . .. . . . . ..... .. . . . . . .
lowQualScore : 5 5 5 5 1 77 77 33333333333 5 5 5 11 1 11 5 9999999999 5 5 22 5 3333 5 11 22 5 0000000 1 5 5 5 5 11 5 11 3333 5 5 5 99 3333 5 8 5 33 5 22 777 6 22 6 22 6 2 7 999 7 6 6 6 6 6 6 22 6 6 6 6 44444 00 6 6 6 6 6 7
consensus : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
Reference ( family-585 ) : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107000 : TTA-AAAATAA-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------GT-T-A-T--T-T--T-T--------TAGTGGT-T-GT--AGAAA-TG---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAATA----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAATAA-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107001 : TTA-AAAATAA-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA------------T-T-A-T--T-T--T-T--------TAGTGGT-T-GT--AGAAA-TG---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAATA----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A----TTTT-A--T-AAAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----T---A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107002 : TTA-AAAATA--AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT---A-T--T-T--T-A----------GTGGT-T-GT--AGAAA-TG---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G--C--TC----AA-ACCAAAA-T-AAATA----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTAT-A----AAAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CGTTAAT-A-A-A-GA--G-C-GTAGAATTT-----TA--A-TTG-CGCGCTC-GCG-TGCCTTT
gi|107003 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACTTTT-G--CAG-TA--AT-TTTTTT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A-GTGA--G-C-CTATAA-TT-----TAATA-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107004 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GC-A--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-A----TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T--AAAT----A-AACTTTT-G--CAG-TA--AT-TTTTTT-A--TAAAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A-GTGA--G-C-CTATAA-TT-----TAATA-TTG-C--GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107005 : TTA-AAGATAT-AC-AG--C-T--CCC---TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTG---T-GT--A-AAA-AA---TGA-T--T---AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--GTCC--TC----AA-ACC-AAA---AAAAT----A-AACTTTT-G--CAG-TA--A--TTTTTT-A--T-AAAA--T-GAAAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A---GA--GTC-CTATAA-TT-----AAT-A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107006 : TTA-AAGATCT-A---G-GC-T--GC-A--TAATA-----------TTAT-A-T--T-T--T-T----------GTGGG-T-GT--AGAAA-AC---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC-----A-ACC-AAA-T--AAAT----A-AACTTTT-G---AG-TA--AT-TTTTTT-A--T-TAAA--T-G-AAACATT-C---T-AA-TTG-CG-TGAT-A-A-GTGA--G-C-CTTAAT-TT-----T-----TTG-CG---CC-G-G--GCTTTT
gi|107007 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------TTGTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-T-T--G-CC--TC----AC-ATC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A---TTTTT-A--T-GAAA--T-G-ACACCAT-C---T-TA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAAGA-TC-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTATT
gi|107008 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TGATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CG-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTCT-G--CAG-CA--A---TTTTT-A--T-ACAA--T-A-AAACCAT-C---T-AT-TTG-CA-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTA-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107009 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TGATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------TTGCGGT-T-GT--AGAAA-AA---TGT-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACATTT-G--CAG-CA--A---TTTCT-A--T-AAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-
gi|107010 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAAT------------TT-T-A-T--T-TATT-T--------T-ACGGT-T-GT--AGAAA-A----TGA-T--TT--AAAGT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T--AAAT----A-AACA-TT-G--CAG-CA--A---TTTCT-A--T-AAAA--T-GAAAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-AAGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GTTC-G-GCTGCTTTT
gi|107011 : TCA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CT-T-A-T--T-T--T-T----------GTGGT-T-GT--AGAAA-TA---TTA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CA-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-----------T----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTT--A--T-ATAA--C-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CA-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107012 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CA-T-A-T--TGT--T-T--------T-GCGGG-T-AT--AGAAA-A----TGA-T--TTTTAA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACCTTT-G--CAG-CA--A---TTCTA-A--T-CAAA--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-G-A-TTGA--G-C-ATAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GATC-G-G-T--TTTT
gi|107013 : TTA-AAGAT-T-AC-AG-GC-TT-GCTA---AATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------TTGTAGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------T--A-CC-T-G-T--G-C---TC----AA-AC--AAA-T-AAAAT----A-A-CCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTTTTA--T-AAAAAAT-G-AAACCAT-C---T-AA-TTGGCG-TAAT-AGA-ATGA--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107014 : TTT-AAGATAT-AC-AG-GCCT--GCCA--TAATA-----------TT-T-ATT--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT---GAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-C----T----AA-A---AA----AAAAT----A-AACATTTGG--CAG-CA------TTTTT-A--T-AAAA--T-G--AACCAT-C---T-AA-TTG-C--TAAT-A-A-ATGT--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-CA-ACTC-G-G-TGCTTTT
gi|107015 : TTT-AAGATAT-AC-AG-GCCT--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT---GAAA-AA---TGA-T--TT--AT-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TA----AA-AAA-AAA-T---AAT----A-A---TTT-G----G-CA--G--ATTTTT-A--T-AAAA--T-G--AACCAT-----T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGT--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-CA-ACTC---G-TGCTTTT
gi|107016 : TTA-AAGTAATGAC-AGAGC-T--GCCA--TAATA-----------TT-TTA-T--T-T--T-T--------TCGCGGG-TTGT--AGAAA-A----TGA-TATTT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--T-AC---------A-CCC-AAA-T-AAAAT----A-A-CCTTT-G--CAG-CA--A--TTTTAC-AAAT-AAAA--T-G-AAACCAT-CGC-T-A--TTG-CG-TAGT-A-A-ATGA--G-C-GTAAAA-TT-----TA--A-TTG-C--GCTC-G-G-TGCTTT
gi|107017 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-CTGGCCAATTAATA-----------TT-T-A-T--T-T--TGT--------T-GCGGGGT-GTTTAGAAA-AAA--TGACT--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--TT----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACATTT-G--CAG-CC--A---TTTTT-A--T-AAAT--T-A-A---CATCC---T-AATTTG-CG-TTAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----CA--A--TG-CG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107018 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-TGTT-T--T-T--------T-GCGGT-T-GTT-AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-----------------------------------------TC-AAA-T-AAAAT----A-AACATTT-GC-CAG-CA--A---TTTCT-A--T-GAAA--T-G-AAACAAT-CTTAT-AA-TTG-TG-TAAT---A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA-----TG-CG-GCTC-G-C-TGCTTTT
gi|107019 : TTACAAGATAT-ACCAG-G--T--GCCA----ATA-----------CT-T-A-T--T-T--T-T----------ACGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-GCT--G-CC--TT----AA-CCA-AAA-T-AAATA----A-AACATTT-G--CA--CA--A--ATTTCT-A--T-AAAA--T-G-AA--CAT-C---T-AA--TG-C--TAAT---A-ATGA--G---GTAGAA-TT-----TA--ATTTG-CG-GCTC---G-TGCTTT
gi|107020 : A-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TATTT-----------TT-A-A-T--T-T--T-TC-------T-GCGCG-T-GT--AGAAA-AA-----A-T--TT--AA-GT-------TT-A-CC-T-G-T--G-CC--C------A-ACC-AAA-T-AAAA-----A-AACCTTT-GA-CAG-CATGA--TTGTTT-A--T-AAAA--T-G-A
gi|107021 : ttaTTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------CT-T-----------T-T--------T-G-------------AAATAACCTTGA-T--TTTCAA-GT-------TTTATCC-T-G-TAAG-CCCATCTATAGA-ACC-AAAAT-AAAACCCTAA-AACCTTT-G--CAGGCA--AGATGTTTT-A--T-AAAA--AAG-AGAACAT-CG--T-AA-TTG-CG-TAAA-T-A-ATGA--G-C-GTGAAA-TTTTATGTA--A-TTGCCG-GCTCGG-G-TGCTTTT
gi|107022 : TTA-AAGATAT-AT-AG-GG-T--GCCA--TAATA-----------TT-T-A-A--TAT--T-T--------T-GTGGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GTTTAGTTATT-A-CC-T---T--G-CT--TC----AA-ACC--AA-T-AAAAT----ACAACCTTT-GACTAG-CA--A--TTTCT
gi|107023 : TTA-AAGATAT-AC-AG-GC-T--GCCA--TAATACATGACTTGTATT-T-A-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GT--AGAAA-AC---TGA-T---------------------A-CC-T-G-G--G-CC--TC----AA-ACC-AAA-T-AAAAT----A-AACTTTT-G--CAG-
gi|107024 : TA-AAGATAT-A--AG-GC-T--GCCA--TAATA-----------TT-A-T-T--T-T--T-T--------T-GCGGG-T-GTA-AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-CT-------TT-A-CC-TGG-T--T-CC--TC----AACACC-AAA-TAAAAAT----A-AACATTT-GACCAG-CA--A--TTTT------T-AAAA--T---AAACCAT-C---T-AA-TTG-CA-TAAT-A-ACATGA--G-C-ATGTAA-TTTTTC-TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGCCTTT
gi|107025 : A-AAGGTA---C-AG-GC-T--GCCGG-TAATA-----------TT-T-T-T--T-T--T-TGTTTTTTTT-GCAGG-T-GT--AGAAA-AA---TGA-T--TT--AA-GT-------TTTA-CCGT-G----G-CC--TC----GA---C-A------------------CCTTT-G--CAG-CA--A--TTGTTT-A--T-AGAA--T-G-AAACCAT-C---TGAG-TTG-CG-TAAT-A-A-ATGAAGG-CGGTATAC-TT-----TA--A-TTG-CG-GCTC-G-G-TGC
gi|107026 : TT-A--T-AAAT--T-G-AAACCAT-C---T-AA-TTG-CG-TAAT-A-A-TTGA--G-C-ATATAA-TT-----TA--A-TTG-AG-GCTC-G-G-TGCTTTT
gi|107027 : -TTG-CG-TAAT-A-A-ATGA--G-C-GTAGAA-TT-----TA--A-TTG-CG-CCTC-T-G-TGCTTTT