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Reference ( gi|109748 ) : ATATAACAA-CTTA-A-TTCC--CAT-A-CA--AT-AT-T-AA-ATCAA-----TCT-C-A-GT-TAT---C--A-A---T--C-A-AAA-----TTACT-----GC---------------AAAA---------G---------AAC---------TA---AC---G-------T-----GTTATATT-------------------TG---TGCC-C--TTTT--TAG----A-CT-A----C----T--A---T-GA----------A--AAT---GG-T-T-----G-TTC-AC-----AAAC---TATT-T----AACTTGCCAAA--CG-GACGCTATAAG---AG-CA-TGT--CTT-TAT-TC--GGTCTG-ACTC-CAT-----TTG---AC--TTC----GCAT----CTT-----TC-A----------------T--A-A-GA-T--A-----TTCCGA---A-T-AC---ATA----ACATG-A-TTT-GTAA--G--GT---GTGGAGA-GTCA-GATCTGATAAA
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Reference ( family-575 ) : ATATAACAA-CTTA-A-TTCC--CAT-AA-AAT-ATN---AA-ATC-----AATCT-C-A-GTTAT---C--A-A---T--C-A-AAA-----TTACT-----G-C--------------AAA---A---------G---------AA------------C---------CAACG-------TGTTATAT---T-------------------TG-TGCC-C--TTTT--TAG----A-CT-A----C----T--A---T-GA----------A--AAT---GG-TT-------G-TT-A-AA---AC---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGA-C-C-TATAAG---AG-CA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTG-ACTCCATC-TG---AC--TTCGCA-TCTGT---C-AT-----------------A-NG--AT-----NTTC-----CG-A-TT-ACACG----------ACATG-A-TTT-GTAA------G--ATGTGGCGA-GTCA-GATCTGACAAA
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gi|109762 : -CC--CAT-GA-AAT-A--T-G-AAGTT-----AATCC-CTA-GATAT---C--A-A---A--C-A-AA------TTACTTTGGAG-C--------------AAAG---------GTTCTGGAAAAA------------T---------TCATG-------TGTTAT-----T-------------------TG-TGCC-A--TTCT--TAA----G-CT-A----C----C--A---T------------------------------------TT-A-TA---AC----AT-C-GTCTT--T-AAAT---GG-----T-TAAA---AT-TA-TCTAACTT-TAT-TC--GGTCTG-GCTCCATC-TG---AC--TTAACA-TCTGT---C-AT-----------------A-AG--GT-----ATTCCGA-TTACC--TA----ACATG-A-TTT-GTAA------G--ATGTGGCAA-GTCA-GATCTTACAAA
gi|109763 : AT-A--T-C-AAATT-----CATTT-C-T-ATTTTGTTC--A-A---T--C-T-AAA-----TTACT-----T-T--------------AGAG---------C---------AA------------C---------CCACG-------GGTTAT-----T-------------------TG-TGCT-G--TATT--TAG----A-TT-A------------A---T-TA----------A--CCT-------T-------A-TA-A-AA---AT---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGAA-T-TAT-AC---AG-CA-CGT--GTC---T-TC--GATCTG-ACTT---------------------TCTGT---C-GT-----------------A-TG--AT-----TTTCCTATTTACA--CG-------TG-A-TTT-GTAA------G--ATCTG
gi|109764 : cccaacattATC-----AATTT-CTA---TAT---C--A-A---T--CTA-AAACGACTTTACA-----G-G--------------AAAA---------GTTCGGGA--AA------------CAT-------CCACA-------TGTTATCT---G-------------------TGCTGTA-T--TTTT--TAGTTTAA-CT-T----C----T--A--------------------ATT---GG-TT-------G------AA---AC---CGC-CTGACTTGAC-AGAC---GGA-----ATAC----AG-CA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTA-ACGCCATC-TA---AC--TTTTTA-TCAGT---T-AT-----------------A-AG--AT-----TTTCCTATTTATA--CG----AAATG-A-TTT-GTAA------G--ATGTGGCGA-GTCA-GATCTGACAAA
gi|109765 : atcaacTTAT---C--T-AGATT--T-A-AAG-----TT--T-----G-----------------AGA---------A---------AA------------T---------CCACG-------CGTTTTAT------------------------G-TGCT-G--TATT--TAG----A-TT-A----TCCTTT--A---T-GA----------C----C---TG-TT-------T-TT-A-AATTGGT---TCT-CCAACTTGAC-AGAC---GGA-----ATA-G---AG-CA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTG-ACTCCATC-TG---AT--TTCATA-TCTGT---C-TT-----------------A-TG--AT-----TTTCCTATTTACA--CG----GTATG-A-TTT-GTCA------G--ATGTGGCGA-GTCA-GAT
gi|109766 : TAT---C--ATA---C--C-ATAAA-----TTACT-----G-C--------------AAAATAAAAAGGGG---------AA------------G---------CAGCGGAGCGGGTGTAATAT---T-------------------TG-TGCCGC--CTTT--TAG----G-AT-A----C----TGGA---T-TT----------A--AAT---GG-TT-------C-GA-A-AA---ACATATAT-CTAACTTGCC-AAAC---GGAC-CCTATAAG---AC-CA-TGT--CTT-TAT-TC--GGTCTG-ACTCCGTC-TG------------------T---C-AT-----------------G-AG--AT-----ATTCCGATT-ACA--TC----ATATG-A-TTTTGTAA------G--ATGTGGCGA-GTCA-GATCTGAAAAA
gi|109767 : --------------AGAA---------A---------AA------------T---------CCACG-------TGTTAT-----T-------------------TG-TGCT-GAATTTCAATGA----A-CC-T----T----T--A---T-GATCCGCTTTTTA--ATT---GG-TT-------G------AA---AC---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGAA---TATA------T-TA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTG-ACTCCATC-AT---AC--TTCATA-TCTGT---A-TT-----------------A-TG--AT-----TTTCCTATTTACC--TG----GTATG-G-TTT-GTCA------G--ATATGGCGA-GTCA-TAT
gi|109768 : AAA---------A---------AA------------T---------CCGCG-------TGCTATAC---A-------------------TG-TGCT-GAATTTT--TAG----A-TT-AACATT----T--A---T-GA----------CCTAAT---GT-TTTATTG--G-TT-C-AA---AC---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGA-----ATA-G---AG-CA-TTT--CTC-TAT-TC--GATCT---------------------TCATA-TCTGT---C-TT-----------------A-TG--AT-----TTTTCTATTTACA--CG----GTATG-A-TTT-GTCA------G--ATGTGGCGA-GACA-CATCTGACAAA
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blockSeqs : . . . . . . . . . GT . . ATGG . . . . G . . C TTGGAGC GAACGTAGACTTAGTCCC . A AGAT . GAA A . . . ACATT . . GACCTGAATTTTAATTGGTTA T T . C . . CGCT AG . . A . . . . . A . GC . . AA AAAAGTCTCATAG A . T G A ATCAC A . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . TAGA . . . . . . . . TCGC GTTCTGGAAAAATTC . A TA . CT A . . . CCTT . . GATCCGCTTTTTAATTGGTTG . T . C . . CGCT AG . . . . . . . . . . GC . . A . A . A G T TAAC A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . AGT . . . . . . . . GCC GTTCGGGAAACATCC . A T . GC . . . . AC . . GACCTAATGTTTTATTGGTTC . T . C . . CCCT AG . . . . . . . . . . GC . . A . A . A G T TAAC . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . AGT . . . . . . . . GC TAAAAAGGGGAAGCA . A T . C . . . . C . . GAAAATGGTTGTTCAC . T . C . . CCCT AG . . . . . . . . . . GC . . A . A . C G T TCAC . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . AGT . . . . . . . . GC GAACTA . A A . C . . . . C . . GAAAAAGGTTGTTCAC . T . C . . CCCT AG . . . . . . . . . . AT . . A . A . A G T TTAC . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . ATG . . . . . . . . GC GAACTA . A T . C . . . . C . . AGTCAATAAGTGTGA . T . C . . CGCT GG . . . . . . . . . . AC . . A . A . A G T TCAA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . AGG . . . . . . . . GC GAACCA . T T . C . . . . C . . TTAAATGGTTCGAA . T . A . . CCCT AG . . . . . . . . . . GC . . A . A . T T T CGGT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . GAG . . . . . . . . GC AAAACA . A T . C . . . . C . . AAAAATGATTGA . T . A . . CCT AA . . . . . . . . . . AT . . G . A . T T T TAAC . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . AAA . . . . . . . . GC AAATCC . A T . C . . . . G . . TTAAATGGTCTA . T . A . . ATT AC . . . . . . . . . . AC . . T . T . T G T CGAA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . TGT . . . . . . . . GC AAACCC . A T . C . . . . C . . AAAAATGGCTTG . C . A . . AT AG . . . . . . . . . . TT . . A . T . A T T CGGT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . TAT . . . . . . . . GG CAACCC . A T . C . . . . C . . GACCTGTTTTTA . C . A . . T GA . . . . . . . . . . AT . . G . A . T T T TCAT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . TA . . . . . . . . TT AAATCC . C T . C . . . . C . . CTAAATAGTTG . C . C . . . A . . . . . . . . . . AT . . A . T . T T T TGGT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . . . . . . GG AAATCC . A T . G . . . . C . . TTAAATGGTTG . T . A . . . G . . . . . . . . . . AT . . T . A . T G T CGGT . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . . . GC AAATCC . A G . G . . . . C . . TAACCTTATAA . C . A . . . C . . . . . . . . . . AT . . A . T . A T T CGGT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G AACCA . A T . A . . . . C . . ATTGGTTG . C . A . . . G . . . . . . . . . . AT . . T . A . T T . CGGT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G AACCA . . T . G . . . . T . . TTA . C . A . . . G . . . . . . . . . . AT . . T . T . T T . CGGT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAAC . . A . T . . . . . . . . C . A . . . G . . . . . . . . . . AT . . T . T . T T . CGGT . . . . . . .
blockSeqs : AAA . . . . G . . . . . . . . C . A . . . G . . . . . . . . . . AT . . T . T . T T . CTGC . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . A . . . G . . . . . . . . . . GC . . T . T . T T . TCAC . . . . . . .
blockSeqs : . C . C . . . G . . . . . . . . . . . . . T . T . T T . CG . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . T . T G . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . G . . . . . . . .
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blockSeqCons : TTAAATGGTTG****************************** CCT**
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gi|109755 : ATATAACAA-CTTA-A-TT-CC--CAT-AA-AAT-A--T-G-----------------------TAT---C--A-A---T--C-A-AAA-----TTACT-----G-C--------------AAAA-------------------AA------------C---------CAACG-------TGTTATAT---T-------------------TG-TGC--------------C-C--TTTT-TAGA-CT-A-----------C---T--A
gi|109756 : ATTTAACAA-CTTATA-TTGTG--CAT-AACAAT-A--T-A-AAATC----------------------------A---T--C-A-AAAC----TTACTTC---G-C--------------AAAA---------G---------AACGTAGACTTAGTC---------CCACG-------TCGTATTTAGAT-------------------TG-AGC--------------C-----TTA-TAGA-CT-A-----------TA--T--AG-----------------TCAAT---A------AGT-G----------T----G-----ACATA--CTT-TTAACTTG-C-AAAA---CGA-CGC-TATAAGTAAAGACA-TGTA-CTT-TAT-TCGTGGTCTGAACTTCATCGTA---AT--TGAACACTCTGTGAGC-ATAAAAGTCTCATAG----A-AG--AT-----TATTCGAATAACAATC-----ACATGAA-TTT-GTAA------GT-GTGTGGAGAGGTTA-GATATGATA
gi|109757 : ATATAACAA-CTTA-ACTT-CC--CATTAA-AATTA--TTG-AAATC-----AATCTTC-ATGGTAT---C--A-A---TTCC-A-AAA-----TTACT-----G-C--------------AAAA---------A---------AA------------C------------CG-------TGTTATAC---TTGGATCGAATTTGTTAAAATG-TGC--------------C-C--TTTTATAGA-CT-
gi|109758 : ATAACAA-CTTA-A-TT-CCGACAT-AA-AAT-A--T-G-----------------------TAT---C--A-A---T--C-A-ACA-----TTACT-----G-C--------------AAA--------------------AA------------C---------CAACG-------TGTTATAT---TA------------------TG-TGC--------------C-CT-TTTT-TAGACCT-A-----------C---T--AT-----------------T---TTAAA------AAT-G--------GCT----T-----GAAC---TAT-CTAACTTGCCAAAACCGAGGC-C-C-TATAAG---A--CA-TGT--CTT-TATGTC--GATCTG-ACT-CATT-TGA--AC--TTCGCA-TCTGT---CAAT-----------------A-AG--ATATCCATTTCAGAATTACA--TACATCACATG-A-TTT-GCTA------G--ATGT-GCGA-GTCA-GATCTGATAAA
gi|109759 : CAC-CTTA-A-TT-CC--CAT-AA-AAT-A--T-G-AAATCAAGTTAATCT-C-G-AGTAT---C--A-A---T--C-T-AAA-----TTACT-----G-CCACCCCCCCCCCCAAAAA---------A---------AA------------A---------CAAAG-------TGTTATAT---T-------------------TG-TGC--------------C-C--TTTT-TAGA-CT-A-----------C---T--A
gi|109760 : -CCTA-A-TT-CC--CAT-GA-TAT-ACAT-GTACAT-------GTAT-C-A-AATAT---C--G-A---CG-C-A-AAA-------ATT-----G-G--------------GGGG---------A---------AA------------T---------CCACG-------TGTT---T---T-------------------TG-TGC--------------T-G--TATC-AAGA-AT-AA----------C---T--ATAACTTTGTGACCTGGTTT---T---T------AAT-T--------GTT----A-----AAAC---TAT-GTTACTTGAC-AGAC---GGA------ATAA----AG-TA-CAT--CTC-TAT-TC--GATCTG--------------------------TCTGT---C-GT-----------------A-TG--AT-----TTTCATATTTAC-----------------------AA------G--ATGTGGCGA-GTCA-GATCTGACAAA
gi|109761 : TTA-A----CC--CAT-AA-CGT-A--T-A-AAATT-----AATCT-C-T-GTTCT---TTGA-A---G--C-A-AAA-----GT-TT-----G----------------AGAA---------A---------AA------------C---------CCATG-------TGTTATAT------------------------G-TGC--------------T-G--AATT-TAGA-TTCA-----------CCTTT--ATGACCTGAATT-------T---T---A------ATT-G--------GTT----A-----AAAC---CAT-GTGACTTGAC-AGAC---GGA------ATA-G---AG-CA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTG-AATCCATC-TG---AC--TTCATA-TCTGT---C-TT-----------------C-TG--AT-----TTTCCTATTTACA--CG----GTGTG-A-TTT-GTCA------G--ATGTGGCGA-GTCA-GATGTGAAAAA
gi|109762 : -CC--CAT-GA-AAT-A--T-G-AAGTT-----AATCC-CTA-GATAT---C--A-A---A--C-A-AA------TTACTTTGGAG-C--------------AAAG---------GTTCTGGAAAAA------------T---------TCATG-------TGTTAT-----T-------------------TG-TGC--------------C-A--TTCT-TAAG-CT-A-----------C---C--AT-----------------T---T---A---------------------T----A-----ACAT---CGT-CT---TTAA----AT---GG------T-TAAA---AT-TA-TCTAACTT-TAT-TC--GGTCTG-GCTCCATC-TG---AC--TTAACA-TCTGT---C-AT-----------------A-AG--GT-----ATTCCGA-TTACC--TA----ACATG-A-TTT-GTAA------G--ATGTGGCAA-GTCA-GATCTTACAAA
gi|109763 : AT-A--T-C-AAATT-----CATTT-C-T-ATTTTGTTC--A-A---T--C-T-AAA-----TTACT-----T-T--------------AGAG---------C---------AA------------C---------CCACG-------GGTTAT-----T-------------------TG-TGC--------------T-G--TATT-TAGA-TT-A------------------AT-----------------T---A---A------CCT-T--------ATA----A-----AAAT---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGA-A-T-TAT-AC---AG-CA-CGT--GTC---T-TC--GATCTG-ACTT---------------------TCTGT---C-GT-----------------A-TG--AT-----TTTCCTATTTACA--CG-------TG-A-TTT-GTAA------G--ATCTG
gi|109764 : cccaacattATC-----AATTT-CTA---TAT---C--A-A---T--CTA-AAACGACTTTACA-----G-G--------------AAAA---------GTTCGGGA--AA------------CAT-------CCACA-------TGTTATCT---G-------------------TGCTGT--------------A-T--TTTT-TAGT-TT-AA----------C---T---T-----------------C---T---A------ATT-G--------GTT----G-----AAAC---CGC-CTGACTTGAC-AGAC---GGA------ATAC----AG-CA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTA-ACGCCATC-TA---AC--TTTTTA-TCAGT---T-AT-----------------A-AG--AT-----TTTCCTATTTATA--CG----AAATG-A-TTT-GTAA------G--ATGTGGCGA-GTCA-GATCTGACAAA
gi|109765 : atcaacTTAT---C--T-AGATT--T-A-AAG-----TT--T-----G-----------------AGA---------A---------AA------------T---------CCACG-------CGTTTTAT------------------------G-TGC--------------T-G--TATT-TAGA-TT-ATCCTTTATGACC---T--GT-----------------T---TTT-A------AATTG--------GTT-----------------C-T-CCAACTTGAC-AGAC---GGA------ATA-G---AG-CA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTG-ACTCCATC-TG---AT--TTCATA-TCTGT---C-TT-----------------A-TG--AT-----TTTCCTATTTACA--CG----GTATG-A-TTT-GTCA------G--ATGTGGCGA-GTCA-GAT
gi|109766 : TAT---C--ATA---C--C-ATAAA-----TTACT-----G-C--------------AAAATAAAAAGGGG---------AA------------G---------CAGCGGAGCGGGTGTAATAT---T-------------------TG-TGC--------------CGC--CTTT-TAGG-AT-A-----------C---TGGAT-----------------T---T---A------AAT-G--------GTTCGA-A-----AAACATATAT-CTAACTTGCC-AAAC---GGA-C-CCTATAAG---AC-CA-TGT--CTT-TAT-TC--GGTCTG-ACTCCGTC-TG------------------T---C-AT-----------------G-AG--AT-----ATTCCGATT-ACA--TC----ATATG-A-TTTTGTAA------G--ATGTGGCGA-GTCA-GATCTGAAAAA
gi|109767 : --------------AGAA---------A---------AA------------T---------CCACG-------TGTTAT-----T-------------------TG-TGCTGAATTTCAATGAAC-C--TTTA-TGAT-CC-G-----------C---T--TT-----------------T---T---A------ATT-G--------GTT----G-----AAAC---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGA-A---TATA------T-TA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTG-ACTCCATC-AT---AC--TTCATA-TCTGT---A-TT-----------------A-TG--AT-----TTTCCTATTTACC--TG----GTATG-G-TTT-GTCA------G--ATATGGCGA-GTCA-TAT
gi|109768 : AAA---------A---------AA------------T---------CCGCG-------TGCTATAC---A-------------------TG-TGC--------------T-GAATTTT-TAGA-TT-A-----------A---C--AT-----------------T---T---ATGACCTAAT-GTTTTATTGGTT----C-----AAAC---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGA------ATA-G---AG-CA-TTT--CTC-TAT-TC--GATCT---------------------TCATA-TCTGT---C-TT-----------------A-TG--AT-----TTTTCTATTTACA--CG----GTATG-A-TTT-GTCA------G--ATGTGGCGA-GACA-CATCTGACAAA
gi|109769 : AT-G--------GTTTAGTA-----AAAC---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGA------ATA-G---AG-CA-TGT--CTA-T-T-TC--GATCTG-A--------------C--TTCATA-TCTGT---C-TT-----------------A-TG--AT-----TTTCCTATTTACA--CG----GTATG-ATTTT-GTCA------G--ATGTGGCGA-GTCACAATCTGACAAA
gi|109770 : aaatggt-----AAGC---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGA------ATA-G---AG-CA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTG-ACTCCATC-TG---AC--TTCATA-TCTGT---C-TT-----------------A-TG--AT-----TTTCCTATTTACA--CG----GTATG-A-TTT-GTCA------G--ATGTGGCGA-GTCA-CATCTGACAAA
gi|109771 : -----AAAC---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGA------ATA-G---AG-CA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTG-ACTCCATC-TG---AC--TTCATA-TCTGT---C-TT-----------------A-TG--AT-----TTTCCTATTTACA--CG----GTATG-A-TTT-GTCA------G--ATGCGGCGA-GTCA-CATCTGACAAA
gi|109772 : -----AAGC---CATTCTGACTTGAC-AGAC---GGA------ATAGA---GG-CAATGT--CTCATAT-TC--GATCTG-ACTCCATC-TG---AC--TTCATA-TCTGT---C-TT-----------------A-TG--AT-----TTTCCTATTTACA--CG----GTATG-A-TTT-TGCA------G--ATGTGGCGA-GTCA-CATCGGA
gi|109773 : -----AAAC---CAT-CTGACTTGAC-AGAC---GGA------ATA-G---AG-CA-TGT--CTC-TAT-TC--GATCTG-ACTCCATC-TG---AC--TTCATA-TCTGT---C-TT-----------------ATAG--AT-----
gi|109774 : -----AAAC---CAT-CTAGCTTGCC-AGAC---GGA------ATA-G---AG-CA-TGT--CTC-CAT-TC-------------CATC-TC---AC--T----A-----------AT-----------------G-TG--AT-----TTTCATATTTACA--CT----GCATG-A-TTT-GCAA------GATATATAGCGA-GTCA-GATCTGA
gi|109775 : -CA-TAT--CTT-TAT-TC--GGTCTG-ACTCCATT-TG---ACATTTCGCA-TCTGT---C-ATGTTATATATTTTTTTTAA-TG--AT-----GGTCCGA-TCACA--TC----ACATG-A-TTT-GTAA------G--GTGTAGAGA-GTC