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lowQualScore                  :     ..   . . .   .  ..........  .....   .. ... ........  ..... ...  .    . . ... .  ...... ....  ........  ... . ... ..   .. ...  .. . . .........................    .................. .  ... ..... . . ..  .....      .......... .  .... . . . .. ...    .. ..     
lowQualScore                  :     88   6 3 4   5  0000000000  11111   55 222 99999999  77777 111  5    5 5 666 2  333333 1111  88888888  222 5 111 55   00 111  55 5 5 7777777777777777777777777    333333333333333333 5  666 77777 5 1 11  11111      3333333333 1  3333 5 5 5 22 222    33 44     
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Reference ( gi|101514 )       : TGGA--TGA-TTG-AGT-TG------G---AA-----AGT--T--GA--------TA-----A---TC-CATT-A-AA--TAAA------A-A--GA-G------TA---A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-C----G--A-----T-------A---TTTT-----------------GT-TT---G-----T-T-T--CGC----AATGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA
gi|101513                     : TGGA--TGA-TGG-AGT-TG------G---AA-----AGT--T--GA--------TA-----A---TC-CATT-A-AA--T-AA------A-G--GG-G------TA---A-A---T-ACGT--G---GT--A-A-TG---G--A-----T-------C---TTTT-----------------GT-TT---G-----T-T-T--CCT----AATGTG--G-------T-TT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAA
gi|101515                     : TGGA--TGA-TGG-AGT-TG-----------A-----AGT--T--GA--------TT-----A---TC-CATT-A-A---TAAA------A-G--GA-G------TA---A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-CG---G--A-----T-------C---TTTT-----------------CT-TT---G-----T-T-TTCTGT----AATGTG--C-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA
gi|101516                     : TGGA--TTA-TGG-AGT-TG------A---AA-----AGT--T--GA--------TA-----A---TC-CATT---TA--TAAA------A-G--GA-G------TA---A-A---C-ACGC--G---AC--A-A-CG---G--A-----T-------C---TTTT-----------------CT-TT---G-----T-T-T--CGT----AATGTG--C-------T-CT----A-T-C-G--C-A-TTTT--C--TAACA
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gi|101527                     :   GA--TGA-TGG-AGT-TG------G---AA-----AGT--T--GA--------TA-----A---TC-C-TT---AA--TAAA------A-AGGGA-G------TA---ATA---T-ACGT--G---AC--A-A-CGGT-G--A-----T-------C---TTTT-----------------CT-TTTTGA-----T-T-T--CGT----AATGTG--C-------T-CT----A-T-C-A--G-A-TTTT--C--TAACA
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gi|101529                     :   GA--TGA---G-AGT-TG------G---AA-----A----T--GAATAGGCACTA-----A---TC-CATT-A-A---TAAA------A-G--GA-G------TACAAA-A---T--CGT--G---AC--ACA-T----GG-A-----T-------C---TCTT-----------------CT-TT---T-----T-T-T--CGT----AATGTG----------C-CT----A-T-C-G--G-A--TTT--C--GAACA
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gi|101535                     :        GA-TGG-AGT-TG------G---AA-----AGT--T-------------------------------A-AA--TAAA------A-G--GA-G------TA---A------------------C--A--------G--A-----T-------A---TTTT-----------------GT-TT---G-----T-T-T--CGT----AATGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--G--TATCA
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gi|101536                     :         A-TGG-AGT-TG------A---AATT---AGT--T---A--------TA-----AA--TC-CATT-T-A---TAAA------A-G--GA-G------TA---A-A---CGACGC--GT--AC--A-C-G----G--A-----T-------C---TTTT-----------------CT-TT---G-----T-T-T--CGT-----ATGTG--C-------T-CT----A-T-C-AACG-A-TTTTTCC--TACCA
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Alignments
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lowQualScore                  :     ..   .. . . .   .  .................   .. ..... ........  ..... ...  .    . . .. ...  ...... ..   . ......  ... . ... .    .. ...  .. . . ......................    ................... .  ... ..... . . ..   ....  .    .......... .  .... . . . .. . .    .. ..     
lowQualScore                  :     55   55 0 5 4   4  00000000000000000   44 88888 66666666  66666 999  4    9 4 11 777  111111 55   5 333333  111 4 444 3    00 999  44 4 4 7777777777777777777777    9999999999999999999 4  555 66666 4 0 00   7777  5    7777777777 0  1111 5 5 5 11 6 1    22 33     
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Reference ( family-574 )      : TGGA--TGA--T-G-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AA-T--AAA------A--GGA-G------TA---A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-C----G--A-----T-------NTTTT-----------------G-T-TT---G-----T-T-T--CGT----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA
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gi|101523                     : TGGA--TGA--T-G-GGAGT-TG------G---A-A----A----T--G--A--------TA----------T-CAT--A-AA-T--TAC------A--GGA-G-------A---A-A---TCACGT--G---A---A-A-C----A--A-----T-------ATTTT-------------------T-TT---G-----T-TGT--CGT----AA-TGTG--G-------T-T-------T-C-G--ATG-TCTT--C--TA
gi|101524                     : TAGA--TGA--T-G-G-AGT-TGTAATTGG---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AA-T--AAA------
gi|101525                     :  GGA--TGA--T-G---AGT-TG------G---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-G-AA-TG-AAA------A--GGA-G-------A---A-A---T-ACG---G---AC--C-A-CG---G--A-----T-------TATTT-----------------GTT-TT---G-----T-T-T--CGG----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA
gi|101526                     :  GGT--TGA--T-G-G-AGT-TT------G---A-ATTTTAGT--TTGG--A--------TA-----A---TC-CATTAA-AA-T--AAAGGAGAGA--GGA-G------TAG--A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-CA---G--AGGAAGTA------GTTTT-----------------G-T-TT---G-----T-
gi|101527                     :   GA--TGA--T-G-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-C-TT---AA-T--AAA------AAGGGA-G------TA---ATA---T-ACGT--G---AC--A-A-CGGT-G--A-----T-------CTTTT-----------------C-T-TTTTGA-----T-T-T--CGT----AA-TGTG--C-------T-CT----A-T-C-A--G-A-TTTT--C--TAACA
gi|101528                     :   GA--TTA--T-A-G-AGT--G------G---A-A----AGTC-T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AA-T--AAA------A--GGA--------TA---A-AT--T-ATGG--G---AT--A-----------T-----T-------TTTTT-----------------G-T-TA---G-----T-T------T----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--GAA-TTTT--C--TAACA
gi|101529                     :   GA--TGA--T-GAG-AGT-TG------G---A-A----A----T--G--AATAGGCACTA-----A---TC-CATT-A-A--T--AAA------A--GGA-G------TACAAA-A---T--CGT--G---AC--ACA-T----GG-A-----T-------CTCTT-----------------C-T-TT---T-----T-T-T--CGT----AA-TGT---G-------C-CT----A-T-C-G--G-A--TTT--C--GAACA
gi|101530                     :    A--TGA--T-G-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T-----A--------TA-----A---TC-CATT---AA-T--AAA------A--GGA-G------T----A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-CG---G--A-----T-------CTTTT-----------------C-T-TT---G-----T-T-T--C-T----AATTGTG--C-------T-CT----ACT-CAG--G-ATTTTT--C--TAA
gi|101531                     :    A--TGAA-T-G-G-AGT-TT------G---A-A----AGT--T-----A--------TATCAGTA---AC-CATT-A-A--T--AAA------A--GGATG------TA---A-A---T-AC-T--G---GC--A-A-C----G--AA----T-------CTTTT-----------------A-T-TT---G-----T-T----CGT----AA-TGTG--C-------T-CT----A-T-C-G--G-A--TTT--C--TAACA
gi|101532                     :    A--TGG--T-G-G-AGT-TGGT----G---A-A----AG---T--G--A--------TG-----A---TC-CATT-ATAA-T--AAA------AG-GGA-G------TA---A-AT--T-ACGT--G---AT--A-A-CG---G--A-----T-------CTTTTCTC--------------T-T-TT---G-------T-T--CGT----AA-TGTGTCC-------T-CT----A-TCC-G--G-G-TTT
gi|101533                     :    A--TGA--T-G-G-AGT-TG------------ATTC-AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AG-T--CAA------G--GAA-T------TT---A-A---T-ACGT--G---ACA-A-A-C----A--A-----T-------ATTTT-----------------G-T-T----------T-T-A--GGG----AA-TATA--G-------T-CT----T-T-C-
gi|101534                     :     --TGA--TTG-G-AGT-TG------A---T-C----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AAAT--CAA------A--GGA-A------TA---A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-CG---G--A-----T-------A-TTT-----------------G-T-TT---G-----TGT-T--CGT----AA-T-TG--G-------T-CT----A-T-C-G--GCATTTTT--C--TAACA
gi|101535                     :        GA--T-G-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T---------------------------------A-AA-T--AAA------A--GGA-G------TA---A------------------C--A--------G--A-----T-------ATTTT-----------------G-T-TT---G-----T-T-T--CGT----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--G--TATCA
gi|101536                     :         A--T-G-G-AGT-TG------A---A-ATT--AGT--T-----A--------TA-----AA--TC-CATT-T-A--T--AAA------A--GGA-G------TA---A-A---CGACGC--GT--AC--A-C-G----G--A-----T-------CTTTT-----------------C-T-TT---G-----T-T-T--CGT-----A-TGTG--C-------T-CT----A-T-C-AACG-A-TTTTTCC--TACCA
gi|101537                     :         A--T-G-G-AGT-TA------G---A-A----TGT--T--G--A--------TA---------TC-ACCT-A-AA-T--AAC------A--GG--G------TA---A-A---T-ACGA--T---AT--A-A-C-------A-----T-------ATCTTAGAAAGTAAGTTAGTGTG-T-TT---G-----T-T-T--CAC----AA-TGTG--A-------T-CT----A-T-T-G--G-A-TTTT--C--TA
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gi|101541                     :                                                                                                                     -A---T-ACGT--G---AC--A-A-C----GG-A-----T-------ATTTT-----------------G-T-TT---G-----T-G-T--CGT----AA-TGTG--G-------T-AT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA





Alignments
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lowQualScore                  :     55   55 0 5 4   4  00000000000000000   44 88888 66666666  66666 999  4    9 4 11 777  111111 55   5 333333  111 4 444 3    00 999  44 4 4 7777777777777777777777    9999999999999999999 4  555 66666 4 0 00   7777  5    7777777777 0  1111 5 5 5 11 6 1    22 33     
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Reference ( family-574 )      : TGGA--TGA--T-G-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AA-T--AAA------A--GGA-G------TA---A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-C----G--A-----T-------NTTTT-----------------G-T-TT---G-----T-T-T--CGT----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA
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gi|101535                     :        GA--T-G-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T---------------------------------A-AA-T--AAA------A--GGA-G------TA---A------------------C--A--------G--A-----T-------ATTTT-----------------G-T-TT---G-----T-T-T--CGT----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--G--TATCA
gi|101536                     :         A--T-G-G-AGT-TG------A---A-ATT--AGT--T-----A--------TA-----AA--TC-CATT-T-A--T--AAA------A--GGA-G------TA---A-A---CGACGC--GT--AC--A-C-G----G--A-----T-------CTTTT-----------------C-T-TT---G-----T-T-T--CGT-----A-TGTG--C-------T-CT----A-T-C-AACG-A-TTTTTCC--TACCA
gi|101537                     :         A--T-G-G-AGT-TA------G---A-A----TGT--T--G--A--------TA---------TC-ACCT-A-AA-T--AAC------A--GG--G------TA---A-A---T-ACGA--T---AT--A-A-C-------A-----T-------ATCTTAGAAAGTAAGTTAGTGTG-T-TT---G-----T-T-T--CAC----AA-TGTG--A-------T-CT----A-T-T-G--G-A-TTTT--C--TA
gi|101538                     :         A--T-G-G-AGT-TG------A---T-C----AGT--T--C--A---------A-----A---TC-CATT-A-AA-T--CAA------A--GGA--------------------------------C--A-A-C----G--A-------------ATTTA-----------------G-T-TG---G-----T-G-T--CGT----AA-TGTG--G-------C-TT----A-T-C-G--G----TTT--C--TAACA
gi|101539                     :         A--T-G-G-AGTATG------GCACA-A----CGC--T--G--AA-------TA-----A---TC-TATT-A-GA-T----------------------------------------GT--G---AT--A-A-G----G--G-----A-------TTTTT-----------------G-T-TT---G-----T-T-T--CCT----AA-TGTG--G-------T-CTA---A-T-T-G--G-A-TTTT--C--
gi|101540                     :                 -AGT-TG------G---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CACT-A-AA-T---AA------A--GGG-G------TA---A-A---C-ACGT--C---GT--A-A-CA---G--A-----T-------CTTTT-----------------A-T-TT---G-----T-T-T--CCT----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA
gi|101541                     :                                                                                                                     -A---T-ACGT--G---AC--A-A-C----GG-A-----T-------ATTTT-----------------G-T-TT---G-----T-G-T--CGT----AA-TGTG--G-------T-AT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA


blockSeqs                     :     AT   AT T A G   A  TAATTGGAA           CT GAA   ATAGGCAC  TCAGT ATC  A    A T AT TAA  GGAGAG AG   T AAAATT  CAA T AAG A    GG GGA  AA C A CGGGGATTCTTTTCC           AGAAAGTAAGTTAGTGTG  A  TTG GTTAT G G TC   AAAA  T    GTCTAGAC   C  ACTA C C A AC T T    TC AA
blockSeqs                     :     .    A  T . .   .  TCAAATT             C  TGG   A         .     AA   .    A . AA GA   .      G    . .       G   . T   C    .  T    A  . . AGAGGAAGTAG               CTCT                .  .   .     . G .    AAA   .    TCC        C  A    . . . .  A T    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GAATTTT             .  G     .         .     A    .    . . A  A    .      .    . .       .   . T   G    .  .    .  . . GGGGATTC                  GT                  .  .   .     . . .    .     .    G          .  A    . . . .  C .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GCACAA              .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . AAGGATA                   G                   .  .   .     . . .    .     .    C          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GTGAA               .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGTGATC                   C                   .  .   .     . . .    .     .    C          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  AAATT               .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGCATC                    C                   .  .   .     . . .    .     .    C          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  ATTC                .  G     .         .     .    .    . . A  G    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGATC                     C                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GATC                .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGATC                     G                   .  .   .     . . .    .     .    C          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  ATTC                .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGATA                     C                   .  .   .     . . .    .     .    C          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GAA                 .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGATT                     G                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  AAA                 .  G     .         .     .    .    . . A  T    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGATC                     G                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GAA                 .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGATC                     G                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  AGA                 .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GAATC                     G                   .  .   .     . . .    .     .    C          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GAA                 .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGATC                     C                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GAA                 .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGATA                     G                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GAA                 .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . AGATC                     C                   .  .   .     . . .    .     .    C          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GAA                 .  G     .         .     .    .    . . G  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGATA                     C                   .  .   .     . . .    .     .    C          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GAA                 .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GATA                      A                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GAA                 .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GATA                      G                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  GAA                 .  C     .         .     .    .    . . A  C    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . AATA                      G                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :     .    .  . . .   .  ATC                 .  G     .         .     .    .    . . A  C    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . AATA                      G                   .  .   .     . . .    .     .    C          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :          .  . . .   .  GAA                 .  G     .         .     .    .    . . A  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GATA                      C                   .  .   .     . . .    .     .    A          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :          .  . . .   .  GAA                 .  .     .         .     .    .    . . .  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GATC                      G                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .  . 
blockSeqs                     :          .  . . .   .  ATC                 .  .     .         .     .    .    . . .  A    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . GGAT                      G                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .    .    
blockSeqs                     :          .  . . .   .  GAA                 .  .     .         .     .    .    . . .  C    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . TTT                       A                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . . .  . .         
blockSeqs                     :          .  . . .   .  GA                  .  .     .         .     .    .    . . .  .    .      .    . .       .   . .   .    .  .    .  . . ATA                       G                   .  .   .     . . .    .     .    G          .  .    . . .                
blockSeqs                     :                 .   .  A                   .  .     .         .     .    .    . . .  .    .                         . .   .    .  .    .  . . GAA                       .                   .  .   .     .                                                           


blockSeqCons                  :                                                                                      A**
originalCons                  : TGGA--TGA--T-G-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AA-T--AAA------A--GGA-G------TA---A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-C----G--A-----T-------NTTTT-----------------G-T-TT---G-----T-T-T--CGT----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA
finalCons                     : TGGA--TGA--T-G-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AA-TA--AA------A--GGA-G------TA---A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-C----G--A-----T-------NTTTT-----------------G-T-TT---G-----T-T-T--CGT----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA





Alignments
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lowQualScore                  :     ..   .. . . .   .  .................   .. ..... ........  ..... ...  .    . . .. ...  ...... ..   . ......  ... . ... .    .. ...  .. . . ......................    ................... .  ... ..... . . ..   ....  .    .......... .  .... . . . .. . .    .. ..     
lowQualScore                  :     55   55 0 5 4   4  00000000000000000   44 88888 66666666  66666 999  4    9 4 11 777  111111 55   5 333333  111 4 444 3    00 999  44 4 4 7777777777777777777777    9999999999999999999 4  555 66666 4 0 00   7777  5    7777777777 0  1111 5 5 5 11 6 1    22 33     
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Reference ( family-574 )      : TGGA--TGA--T-G-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AA-T--AAA------A--GGA-G------TA---A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-C----G--A-----T-------NTTTT-----------------G-T-TT---G-----T-T-T--CGT----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA
gi|101513                     : TGGA--TGA--T-G-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AA-T---AA------A--GGG-G------TA---A-A---T-ACGT--G---GT--A-A-TG---G--A-----T-------CTTTT-----------------G-T-TT---G-----T-T-T--CCT----AA-TGTG--G-------T-TT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAA
gi|101514                     : TGGA--TGA--T-T-G-AGT-TG------G---A-A----AGT--T--G--A--------TA-----A---TC-CATT-A-AA-T--AAA------A--AGA-G------TA---A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-C----G--A-----T-------ATTTT-----------------G-T-TT---G-----T-T-T--CGC----AA-TGTG--G-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA
gi|101515                     : TGGA--TGA--T-G-G-AGT-TG------------A----AGT--T--G--A--------TT-----A---TC-CATT-A-A--T--AAA------A--GGA-G------TA---A-A---T-ACGT--G---AC--A-A-CG---G--A-----T-------CTTTT-----------------C-T-TT---G-----T-T-TTCTGT----AA-TGTG--C-------T-CT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA
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gi|101541                     :                                                                                                                     -A---T-ACGT--G---AC--A-A-C----GG-A-----T-------ATTTT-----------------G-T-TT---G-----T-G-T--CGT----AA-TGTG--G-------T-AT----A-T-C-G--G-A-TTTT--C--TAACA