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lowQualScore                  :           . ..     .   .  .. . . .. . .   .  .    .  ...... .. .  ...    . . ..  ....  .  . ..  .. . . .  . .  .    ... ..   .. .   .     .   ....... .    
lowQualScore                  :           5 55     4   4  33 8 4 99 4 4   8  4    8  333333 99 4  222    4 4 22  9999  4  1 99  99 4 8 4  8 8  4    555 00   88 4   5     5   7777777 7    
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Reference ( family-571 )      : ATTAGGGATG-G--CAATT-TTT-AA--T-C-G--G-T-TAA-CC-GGTT-AC------T--C-GG---TCGG-A-A--CA----GT-GG-T--AA--T-C-G-GT-T-GC-AAAA---T--CCG--T-AAT-CGGTT-AAT-GG----A-AAAA
gi|94168                      : ATTAGGGATG-A--CAATT-TTT-AA--T-C-G--G-T-TAA-CC-GGTT-AC------T--C-GG---TCGG-A-A--CA----GT-GG-T--AA--T-C-G-GT-T-GC-AAAA---T--CCG--T-AAT-CGGTT-AAT-GG----A-TAAA
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blockSeqs                     :           . G      .   .  T  A . .  . .   T  .    T  T      .  .  AAC    . . GC  TCTT  .  T .   .  . G .  G G  .    .   .    C  .   .     .   GGTAAT  .
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blockSeqs                     :           . .      .   .  .  . . .  . .   .  .    .  .      .  .  .      . . .   .     .  . .   .  . . .  . .  .    .   .    .  .   .     .   TG      .
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blockSeqs                     :           . .      .   .  .  . . .  . .   .  .    .  .      .  .  .      . . .   .     .  . .   .  . . .  . .  .    .   .    .  .   .     .   CA      .
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Reference ( family-571 )      : ATTAGGGATG-G--CAATT-TTT-AA--T-C-G--G-T-TAA-CC-GGTT-AC------T--C-GG---TCGG-A-A--CA----GT-GG-T--AA--T-C-G-GT-T-GC-AAAA---T--CCG--T-AAT-CGGTT-AAT-GG----A-AAAA
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