lowQualScore                  :                          1111                                                                                                                                              22222222                               1                                                                 11111111                          111                                                    11111111111111                                                                     
lowQualScore                  :        666   66  2   333 8888   2    2 4444 4  2 4    2     333  2 2 4       2  4444  1      1 333   777 1  3  77777 1   1 22   1 22 1  3 5  3  66  77777   6 3    444     33333333  1 3  1 1  5  8888 22 1 66666 3 3333 1    1 22 22   44 1  1    1 1 1 66   3  1   1 33  1  44 11 66666666  1 22   2  2  111 333333 000  1 1 1      1  22 6666 44  2  1 1 1 5555  3 1  1   44444444444444      1  1  22  44   1 44  222   1 3    1  1 1     3 3 1  44444      
lowQualScore                  :        ...   ..  .   ... ....   .    . .... .  . .    .     ...  . . .       .  ....  .      . ...   ... .  .  ..... .   . ..   . .. .  . .  .  ..  .....   . .    ...     ........  . .  . .  .  .... .. . ..... . .... .    . .. ..   .. .  .    . . . ..   .  .   . ..  .  .. .. ........  . ..   .  .  ... ...... ...  . . .      .  .. .... ..  .  . . . ....  . .  .   ..............      .  .  ..  ..   . ..  ...   . .    .  . .     . . .  .....      
lowQualScore                  :        333   66  2   999 6666   1    2 7777 4  2 4    2     999  2 2 4       2  7777  9      8 222   111 9  8  44444 9   9 22   9 66 8  6 5  6  11  55555   6 6    222     11111111  9 8  9 9  7  4444 66 9 77777 8 7777 7    7 44 44   11 7  7    7 7 7 55   5  7   2 22  1  99 66 66666666  0 33   0  0  999 888888 555  0 0 0      0  44 0000 77  4  2 2 2 8888  9 5  7   77777777777777      7  8  44  11   7 00  999   7 3    7  7 3     5 5 9  88888      
consensus                     : ATCTCTT-C-GTC-GCC-ATT---T-GC-ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CATAA-GAGT-T-GTTCAAAG----CGA-G-TC-C-AA-AA-TC-G--C-G-----ATC----G-TTCA-C--C--AAC--G-TA-TTCG-T-C-A--CAG-TA-AGA-T--CA-CG-TG--A-C-CT---AT-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AG-G-C-AGGTAA-TA--T-A--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------NAACGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
Reference ( gi|59283 )        : ATCTCTT-T-GTC-ACC-ATT---T-GA-ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CATGA-GAGT-T-GTTCACAA----TGA-G-TC-C-AA-AA-TC-G--C-G-----AGC----G-TTCA-C--C--AAC--G-TA-TTCG-T-C-A--CAG-TA-AGA-T--CA-TG-TG--A-T-CC---AT-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AG-G-C-AGGTAA-TA--T-A--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------TAATGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59282                      : ATATCTT-C-GTC-GCC-ATT---T-GC-ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-A-C-TGCCCGT-GT----AA-TACATT-A---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CATAA-GAGT-T-GTTCAAAG----CGA-G-TC-C-AA-AA-TC-G--C-G-----ATC----G-TTCA-C--C--AAC--G-TT-TTCG-T-C-A--CAG-TA-AGA-T--CA-CG-TG--A-T-CT---AT-A--TTA-CC-TA-T-C------T-C-AG-G-C-AGGTAA-TA--T-A--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------AAATGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59284                      : ATCTCTT-C-GTC-GCC-ATT---T-GC-ACT-ATTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTC---CA-T-C-TGCCTTT-GT----AA-TACATT-C---TTT---G-CA-AA-----C---T-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CATAA-GAGT-T-GTTCAAAG----CGA-G-TC-C-AA-AA-TC-G--T-G-----TTC----G-CTCA-C--C--AAC--C-CA-TTCG-T-C-A--AAG-CA-AGA-T--CA-CG-TG--A-T-CT---AT-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AG-G-C-AGGCAA-TA--T-G--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------AAACGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----GATAAA
gi|59285                      : ATCTCTT-T-GTT-GTC-ATT---T-GC-ACTTGTTT-A----C-AA-AACTTT-GTGTT---CAAT-C-TGCA-TT-AT----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-G---AT-T--G-CT-T-CA-GA--CT--A--CAT-A-GAAT-T-GTTCAAAG----CGA-G-TC-C-AA-AA-TC-G--C-G-----A-C----GATTCA-C--C--GAC--G-TA-TTCG-T-C-A--CAG-TA-AGA-T--CACTG-TG--A-A-CT---AT-A--ATA-CC-TG-T-C------T-C-AG-G-C-AG--AA-TA--T-A--G--TC-TC-A-TTA----AT-A-AC-GGC-------------TAACGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAA
gi|59286                      : ATCTCTT-C-GTC-GAC-ATT---T-GC-ACT-GTTT-ATATAC-AA-A-CTTC-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-G---------------------------CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-TA-GA--CA--A--CATAA-GAGT-T-GTTAA-AG----TGA-G-TC-C-AA-AA-TG-G--T-G-----ATC----G-TTTA-C--C--AAC--G-TA-TTCG-T-C-A--CAG-TA-ACA-T--CA-CG-TG--A-T-CTATAAT-A--TTA-CC-TG-T-C------TGC-AG-G-C-AGGTAA-TA--T-G--G--TC-TC-A-T-AAT--AT-A-AC-GGCTAATGATTATTATTAATGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATA-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59287                      : ATCTCTCAT-TTC-GC--ATT---T-GC-A-T-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-C-C-TGCC-TT-GT----AA-TATGTT-T---TTT---AACAGAA-----G-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--TG--A--CATAA-GAGT-T-GTTCAAAAG---CGA-G-TC-CAAA-AA-TG-G--C-A-----ATC----G-TT-A-C--C--AAC--A-TA-TTCG-T-C-A--CAG-TT-AGATT--CA-TG-TT--A-C-CTA--AT-A--TTA-CCTTG-T-C------TGC-AG-G-C-AGGTAA-TA--T-G--G--TC-TC-AGT-A----AT-A-AC-GGC-------------TAATGAA-TC-AA--TT--AAA----TC---CTA-G-AATC-TA-A-TTGCA-G-TAAT-----GACAAA
gi|59289                      : ATATCTT-C-GTC-GCCCATT---T-GC-ACT-GTTT-A------AA-A-CT---GTGTT---CA-T-C-TGTTCTT-TT----AA-TATTTT-T---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-G--GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CAGAA--CATAA--AGT-T-CTTCAAAG----CGA-G-TC---AA-AA-T--G--C-G-----ATC----G-TTCA-C--C--A-C--G-TA-TTCG-T-CCA--AAG-TA-AGA-T--CA-CG-TG--A-C-TT---AT-A--TTA-CC-CC-T-T------T-G-CG-G-C-AGGTAA-TA--T-G--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GAC-------------TAATGAA-CC-A---TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATCCTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GCCAA
gi|59292                      : ATCTCTT-TCGTC-GCC-ATT---T-GT-ACT-------------------TTT-GTGTT---AA-T-C-TGCCCTT-GG----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AAAA---C-GGT-GT-GAT-T--G-GC-T-GA-GA--CG--A--CA----GACC-T-CT--ATAA-----GATA-TC-A-AA-AAATG-G--A-G-----ATC----G-TTCA-C--C-------G-TA----A-T-C-A--C-G-TA-----------CG-TG--A-C-CCT--AT-AA-TTA-CC-CG-T-C------TGC-AA-G-C-AGGTAA-TA--T-G--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------TATTGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGC--G-T-AT-----GACAA
gi|59291                      : ATCTCTT-C-GTC-AGC-ATT---T-GC-ACT-GTTT-A----C-AA-A-CATTAGTGTTAATCA-T-C-TGCCCTT-GTCCATAC-TACATT-C---TTTT--A-CA-AAACTCAC-AAT-TT--AT-TATG-TA-T-TACGATGCTG-A--CATAA--AGTAT-GTTCGCGG----CGA-GGTC-C-AA-AA--C-GAGC-G-----ATC----G-TTCA-C--C--AACC-G-TA-TTTG-T-C-A--CAGCTA-AGA-T--CA-CG-TG--A-T-CTT--AT-AAATTAACCATG-G-C------T-CCAG-G-C-AGGTAA-TAAAT-A--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------AAATAAA-CC-AA--TCAAAAA-TTATCACACTA-G-AATT-TA-A---GTA-G-T-GTACACAGACAAA
gi|59288                      : ATCTCTT-C--TC-GCC-ATT---T-TC-ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AACTACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CACGA--CT--T--CA-GA-AGCT-T-GTTCAAGA-----GA-G-TC-C-AA-AA-TCGG--C-GC----AGC----A-TTCA-C--C--AAC--A-CATTTCG-T-C-A--CAGTTA-AGA-T--CA-CGTTG--A-T-CT---AT-G--CCC-CT-TG-T-TGGTGTAT-C-AG-A-C-ATATTA-TA--T-AT-A--TA-TC-A-T-AT---AT-A-
gi|59293                      : ATCT-TT-C-ATT-GCC-ATT---T-GC-AC--GTTT-A----C-AA-A-TTTT-GTGTT---CA-T-A-TGCCCTT-AT----AA-TATATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--AG-CATAA-AAAT----TTATCAA----TG------------------G--C-G-----ATC----G-TTCA-A--C--AAC--G-TG-TTCG-T-C-A--CAG-TA-AGA-T--CA-CG-TG--A-C-CT---AT-G--TTA-CC-TG-T-C------T-C-A
gi|59290                      : ATCTCTT-T-GTC-GCC-ATT---T-GC-ACT-GTTaattcctagaatctagtttgcggtatgacaa
gi|59294                      : ATCTCTT-T-GTC-GCC-ATT---T-GC-ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AT-TAC-TT-C---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattacctgtctcaggcaggtaatatggtctcataataacggcaaatgaaccaatcaaattcctagaatctaatttgcagtat
gi|59295                      :  TCTCTT---GTT-GTC-ATT---T-GCCACT-GTTTTA----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-TTC-TGCCATT-AT----AA-TACATT-C---TTTT--A-CA-AA-----C-AGT-G---AT-T--G-CT-T-CA-GAA-CT--A--CATAA-GAAT-T-ATGTGCAAAGCTTGA-G-TC-C-AACAA-TC-G--CTG-----AGC----A-TTCA-C--C--AAC--G-TA-TCCT-C-C-AACCAG-TA-AGA-T--CA-C--TG--A-T-CT---ATCA--ATATCC-TGGT-C------T-C-GA-G-G-AGGTAA-T---T-A--G--GG-CC-A-T-A----ATTA-AC-GGC-------------TAACGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATT--CA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59296                      :  TCTCTT-A-GCCGATC-TTT---C----ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT--TGTT---TA-T-C-TGCCCTT-------AA-TACATT-C---CTT---A-CA-A------C-AGG-GT-GAT-T--G-CA-T-CA--A--CT-----CATG--GAGT---GTTCAAAG----CGA-GATC-C-AA-AA----G--C-G-----A-------------------------------CT-T-C-A--CAT-TA-AGG-T--CA-CA-TG--AAT-CT---AT-A--TTA-CC-TG-T-CC-----T-CTAG-G-C-AGGTAA-TA--T-G--G--TC--C-A-T-A----A--A-AC-GGCC------------TAATGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATGTGCAGG-T-AT-----
gi|59297                      :   CTCTT-T-GTT-GTC-ATT---T-GC-ACT-GTTT-A----C-AA---CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCATT-AT----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-G---AT-T--G-CT-T-CA-GA--CT--A--CATAA-GAAT-T-GTTCAAAG----CGA-G-AC-C-AA-AA-TC-G--C-G-----AGC----A-TGCA-C--C--AAC--G-TA-TTCG-T-C-A--CAG-TA-AGA-T--CA-CG-TG--A-T-CT---AT-A--ATA-C--TG-T-C------T-C-AG-G-C-AGGTAA-TA--T-A--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------TAACGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59298                      :   CTCTT-C-G-C-GCC-ATTCCTT----ACT-GTT--A----C-AATATCTGT-ATGTT---CA-T-C-TGCTCTTTGT----AA-TACATT-C---TTT---A-CGCAA-----C-AGTTGTTGATAT--GTCAGTGCA-GA--CT-----CATGA-GAGT---GTTCA-AA-----GA-A-TCTC-AATAA-TCTG--C-GTTCGGAGTCGATG-TGCA-CGTCTAGAC--G-TA-TTCG-T-C-AAACAG-TA-AAA-T--CA-TG-TG--A-T-CT---AT-A--ATA-CC-GG-T-C------T-C-A--G-C-AGGTAA-TA--C-AC-GCTCC-TC-A-T-A----AT-ACACTGGC-------------TAATGAACCC-AA--TCT-AAA-T--CC---CTA-G-AATC-TA-ATTTG
gi|59300                      :      TT-T-GTC-GCC-ATT---TTGC-AC--GTTT-A----CCAA-A-TGTT-GTGTT---CA-T-CATGCCCTT-AT----AA-TACATT-C---TT----A-CA-AA-------AGT-GT-GAT-T--G-CT-TACA-GA--CT--A--CATAAAGAGA-T-GTTCGAAG----CGA-G-TC-C-AA-AA-AT-G--C-G-----A-C----G-TT-A-C--C--AAC--G-T--TTCG-T-C-A--CAG-TT-AGA-TTCCA-CG--G--A-C-CT---AC-A--TTA-CC-TG-T-C----------AG-C-A-AGGTAA-TA--T----G--TC-TC-A-T-T----ATTA-AC-GGC-------------AAATGAA-CC-AA--TC--AAA-A--TT---CCA-G-AATC-TA-TATTGCA-G-
gi|59299                      :      TT-T-GTC-GCC-ATT---TTGC-AC--GTTT-A----CCAA-A-TGTT-GTGTT---CA-T-CATGCCCTT-AT----AA-TACATT-C---TT----A-CA-AA-------AGT-GT-GAT-T--G-CT-TACA-GA--CT--A--CATAAAGAGA-T-GTTCGAAG----CGA-G-TC-C-AA-AA-AT-G--C-G-----A-C----G-TT-A-C--C--AAC--G-T--TTCG-T-C-A--CAG-TT-AGA-TTCCA-CG--G--A-C-CT---AC-A--TTA-CC-TG-T-C----------AG-C-A-AGGTAA-TA--T----G--TC-TC-A-T-T----ATTA-AC-GGC-------------AAATGAA-CC-AA--TC--AAA-A--TT---CCA-G-AATC-TA-TATTGCA-G-
gi|59302                      :                             -ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT--TATT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-CTTTTTT---A-CA-AA-----CAAGT-GT-GAT------------A-AAT-TT--A--CATAA-GAG--------AAAG----CGA-G--C-C-AA-AA-TC-G--C-------ATC----T-TTCA----C--ACC--G-TA--GCG-TAC-G--CAG-TA-AGA-T--CA-CG-TGAAA-C-CT---AT----TTA-CC-TG-TGC------T-C-A--G-C-AGGTAA-TA--T-G--G--TCATC-A-T-A----AT-A-AT-GGC-------------AAATGAA-CC-AA--TT--AAA-TA-TC---CTA---AATC-TA-A--TGCACG-T-AT-----GACAAA
gi|59303                      :                                                                                  tttcA-TACATT-T---T----------AA-----C-AGT-GT-AAT-T--G-CAAT-TA-GA--CT-----CATGA-GATT-TTATTCA-AA----GGA-G--C-C-AACAA-TC-G--C-G-----AGC----A-TTCC-C--C--AAC--G-TA-TACG-T-C-A--CAG-TA-AT--T--TA-T----------------T-A--TTA-CC--G-T-C------T-CCAG-G-C-TGGTGA-TA--T-A--G---C-T--A-G-A----AT-A-AC-G-C-------------TAATGAA-CC-AATCTC--AAATT--TC---CTATG-AATC-TATATTTGCA-G-T-AT-----TACAA
gi|59304                      :                                                                                       -TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CATAA-AAGT-T-------AG----CGA-G-TC-C-AT-AA-TG-G--C-G-----ATC----G-TTCA-C--C--AAC--G-TA-TTCG-T-C-A--CAG-TA-ATA-T--CA-CG-TG--A-C-CT---AT-A--TTT-CC-TG-T-C------T-C-AG-G-C-AGATAA-TA--T-G--G--TA-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------AAATGAA-C
gi|59301                      :                                                                                       -TACATTGC---TTTTCAA-CA-AG-----C-AGT-GT--AT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--AAACAT-A-GAAT-A-GTT---AG----CGA-G-TC-C-AT-AA-TG-C--C-G-----ATC----G-TTCAAC--T--AATCAG-TA-TTCGAT-C-A--CAG-TATATA-T---A-CG-TG--A-C-CTTTTAT-T--TT--CC-TG-T-T------C-T-AG-G-C-AGATAA-TA--T-G--G--TTATC-A-T-A----AT-A-A--GGC-------------AAATGAA-CCCAA--TC--ACA-T--TC---CTA-GAAATC-TA-A-TTGTA-GTT-AT-----GACAAA
gi|59305                      :                                               gccaattgttttgttatcagaatatctctttatcttttactctCATT-A---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CATAA-GA
gi|59306                      :                                                                                                                                      -CA-T-CA--A--TC--A--CATAA-TAGT-T-TTTCAAAG----CGA-G-TC-C-AA-AA-TG-G--C-G-----ATC----G-TTCA-C--C--AAC--G-CA-TTCG-T-C-A--CAG-TA-AGA-T--CA-CG-TG--A-C-TT---AT-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AG-G-C-AGGTAA-TA--T-A--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------GAATGAA-CC-AA--TC--ATA-T--CT---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59307                      :                                                                                                                                                                                                                    C----G-TTTA-C--C--AAC--G-TT-TCCG-T-C-A--CAG-AA-AGA-T--CC-CG-TG--A-C-CT---AT-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AG-G-C-AGGTAA-TA--T-G--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------AAACGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-----AT-----GACAAA
gi|59286                      :                                                                                                                                                                                                                    t----G-TTCA-T--T--AAT--AATA-ATCA-T-T-AG-CCG-TT-ATA-T--TA-TG-AG--A---CC---AT-A--TTA-CC-TG-C-C------TGC-AG-A-C-AGGTAA-TA--T-
gi|59282                      :                                                                                                     atctcttcgtcgacatttgcactgtttatatacaaacttcgtgttcatctgcccttgcaaacagtgtgattgcattagacaacataagagttgttaaagtgagtccaaaatggtgatcgtttaccaacgtattcgtcacagtaacatcacgtgatctataA-T--TA-TG-AG--A---CT---AT-A--TTA-CC-TG-C-C------T-G-AG-A-T-AGGTAA-TA--T-A--GA-TC-AC-G-T-G----AT-caatcaaattcctagaatataatttgcagtatgacaaa
gi|59297                      :                                                                                                         atatcttcgtcgccatttgcactgtttacaaactttgtgttcaactgcccgtgtaatacattatttacaaacagtgtgattgcatcagactacataagagttgttcaaagcgagtccaaaatcgcgatcgttcaccaacgttttcgtcacagtaagA-T--TA-TG-AG--A---CT---AT-A--TTA-CC-TG-C-C------T-G-AG-A-C-A-GTAT-TA--T-A--GA-TC-AC-G-T-G----AT-aacggcaaatgaaccaatcaaattcctagaatctaatttgcagtatgacaaa
gi|59284                      :                                                                                                              ctctttgttgtcatttgcactgtttacaactttgtgttcatctgccattataatacattctttacaaacagtgattgcttcagactacataagaattgttcaaagcgagaccaaaatcgcgagcatgcaccaacgtattcgtcacagtaagA-T--TA-TG-AG--A---CC---AT-A--TTG-CC-TG-C-C------T-G-AG-A-C-AGGTAA-TA--T-A--GA-TC-AC-G-T-G----AT-aacggctaacgaaccaatcaaattcctagaatctaatttgcagtatgacaaa
gi|59289                      :                                                                                                           atctcttcgtcgccatttgcactatttacaaactttgtgtccatctgcctttgtaatacattctttgcaaactgtgattgcatcagactacataagagttgttcaaagcgagtccaaaatcgtgttcgctcaccaacccattcgtcaaagcaagA-T--TA-TG-AG--A---CC---AT-A--TTA-CC-TG-C-C------G-C-AA-A-G-GGGTAA-TA--TAA--G--TC-AC-G-T-G----AT-aacggcaaacgaaccaatcaaattcctagaatctaatttgcagtatgataaa
gi|59306                      :                                                                                                             atatcttcgtcgcccatttgcactgtttaaaactgtgttcatctgttcttttaatattttttttacaaacagtggattgcatcagacagaacataaagttcttcaaagcgagtcaaaatgcgatcgttcaccacgtattcgtccaaagtaagA-T--TA-TG-AG--A---CT---AT-A--TTA-CC-TG-C-C------T-G-AG-A-C-AGGTAA-TA--TAA--G--TC-AC-G-T-G----AT-aacgactaatgaaccatcaaattcctagaatcctaatttgcagtatgccaa
gi|59300                      :                                                                                                                                                                                            catcaatcacataatagtttttcaaagcgagtccaaaatggcgatcgttcaccaacgcattcgtcacagtaagA-T--AA-TG-AG--A----C---AT-A--TTA-CC-TT-G-C------T----G-A-C-AGGTAA-TG--T-A--G--aacggcgaatgaaccaatcatatctctagaatctaatttgcagtatgacaaa
gi|59299                      :                                                                                                    tttgtcgccattttgcacgtttaccaaatgttgtgttcatcatgcccttataatacattcttacaaaagtgtgattgcttacagactacataaagagatgttcgaagcgagtccaaaaatgcgacgttaccaacgtttcgtcacagttagattccacggacA-T--AA-TG-AG--A----C---AT-A--TTA-CC-TT-G-C------T----G-A-C-AGGTAA-TG--T-A--G--taacggcaaatgaaccaatcaaaattccagaatctatattgcag
gi|59292                      :                                                                                                    tttgtcgccattttgcacgtttaccaaatgttgtgttcatcatgcccttataatacattcttacaaaagtgtgattgcttacagactacataaagagatgttcgaagcgagtccaaaaatgcgacgttaccaacgtttcgtcacagttagattccacggacA-T--TA-TG-AG--A---CC---AT-A--TTA-CC-TG-C-T------TGC-AG-A-C-GGGTAATTA--T-AGGG--TC-AC-G-T-ACGTGAT-T-AC-GGT-------------GAACGAtaacggcaaatgaaccaatcaaaattccagaatctatattgcag
gi|59302                      :                                                                                                                                                 atctctttcgtcgccatttgtacttttgtgttaatctgcccttggaatacattctttacaaaaacggtgtgattggctgagacgacagacctctataagatatcaaaaaatggagaA-T--TA-TGATG--A---CC---AT-A--TTA-CC-TG---C------T-G-AGCA-C-AGGTAA--A--T-AG-G--TT-TC-A-aacggctattgaaccaatcaaattcctagaatctaatttgcgtatgacaa
gi|59307                      :                                                                                                                              tttcactgtttacaaacttttattcatctgcccttgtaatacattcttttttacaaacaagtgtgataaatttacataagagaaagcgagccaaaatcgcatctttcacaccgtagcgtacgcagtaagatcacgA-T--TA-TG-AG--A---CC---AT-A--TTA-CC-TG-C-C------T-G-AG-A-C-AGGTAA-TA--T-A--G--aatggcaaatgaaccaattaaatatcctaaatctaatgcacgtatgacaaa
gi|59290                      :                                                                                                                                                                                                                              tcgtttaccaacgtttccgtcacagaaagatcccgtgacA-T--TA-TG-AG--A---CC---AT-A--TTA-CC-TG-C-C------T-G-AG-A-C-AGGTAA-Taacggcaaacgaaccaatcaaattcctagaatctaatttgcaatgacaaa
gi|59304                      :                                                                                          atctctttgtcgccatttgcactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc-TA-TG--A-TACC---AT-A--TTA-TC-TG-C-C------T-G-AG-A-C-AGGAAA-TA--T-AG-G--TC-AC-G-T-G----AT-A-aacggcaaatgaaccaatcaaattcctagaatctaatttgcagtat
gi|59287                      :                                                                                                                                                                                          tacattctttacaaacagtgtgattgcatcagactacataaaagttagcgagtccataatggcgatcgttcaccaacgtattcgtcacagtaa-CC---AT-A--TTA-CC-TG-C-C------TGC-AG-A-CAAGGTAA-TA--T-ataacggcaaatgaac
gi|59296                      :                                                                                                            atctctcatttcgcatttgcatgtttacaaactttgtgttcacctgccttgtaatatgttttttaacagaagagtgtgattgcatcagatgacataagagttgttcaaaagcgagtccaaaaatggcaatcgttaccaacatattcgtcacagttagattcatgttaccta-CC---AT-A--TTA-CC-TG-C-C------T-AGAG-GAC-AGGTAA-TA--T-A--G--AT-TC-A-T-tctcagtaataacggctaatgaatcaattaaatcctagaatctaattgcagtaatgacaaa
gi|59308                      :                                                                                                                                                  tctcttagccgatctttcactgtttacaaacttttgtttatctgcccttaatacattccttacaacagggtgattgcatcaactcatggagtgttcaaagcgagatccaaaagcgacttcacattaaggtcac-CT---AT-A--TTA-CC-TG---C------T-G-AG-A-C-AGGTAA-TAG-T-A--G--tccataaaacggcctaatgaaccaatcaaattcctagaatctaatgtgcaggtat
gi|59309                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-A--TTA-CA--G-C-T------T-C-AG-G-C-AGGTAA-TA--T-A--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------TAACGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAAtctcaataataacggctaatgaaccatcaaattcctagaaatctaatttgcggttatgacaa
gi|59308                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-A--G-C-AGGTAA-TA--T-A--G--TC-TCAA-T-A----AT-A-AC-GGC-------------TAATGAA-CC--A--TC--AAA-T--TC---CTA-GAAATC-TA-ATTTGCG-GTT-AT-----GACAA
gi|59290                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctac-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AG-G-C-AGGTAA-TA--T-G--G--TC-TC-A-T-A----AT-A-AC-GGC-------------AAATGAA-CC-AA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----
gi|59293                      :                                                                                                                                                                                                                      atctctttgtcgccatttgcactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-GTTTGCG-G-T-AT-----GACAA
gi|59310                      :                                                                                                                                                                                                                                          atctttcattgccatttgcacgtttacaaattttgtgttcatatgcccttataatatattctttacaaacagtgtgattgcatcagactagcataaaaatttatcaatggcgatcgttcaacaacgtgttcgtcacagtaagatcacgtgacctatgttacctgtcA-T--TC---CTA-G-AATC-TA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAGA

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11111111111111                                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                          2   22    2    4  44   2    2 4444 4  2 4    2     333  2 2 4       2  4444  1      1 333   666 1  3  77777 1   1  1   1 22 1  3 5  3  55  66666  66666666   3    1 44       1  22   3  1 1  5   66 22 1 1 3  777777777   1  22 22   44   1    1 3  44   3  1   1 44   1 1  44   444 666 1 3 33   3  3  1 3 444444 6 3            22 44 22  3  1 3  33  4 1  1  1 00000000000000  2   3    22  44   1 33  222   1 3   1   1 0     3 3 1  44444      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                          .   ..    .    .  ..   .    . .... .  . .    .     ...  . . .       .  ....  .      . ...   ... .  .  ..... .   .  .   . .. .  . .  .  ..  .....  ........   .    . ..       .  ..   .  . .  .   .. .. . . .  .........   .  .. ..   ..   .    . .  ..   .  .   . ..   . .  ..   ... ... . . ..   .  .  . . ...... . .            .. .. ..  .  . .  ..  . .  .  . ..............  .   .    ..  ..   . ..  ...   . .   .   . .     . . .  .....      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                          1   99    1    0  88   0    1 5555 2  1 2    1     777  1 1 2       1  5555  8      7 000   888 8  6  00000 8   8  8   8 55 7  5 2  5  99  88888  33333333   5    8 33       8  55   6  8 8  5   55 55 8 8 3  000000000   7  44 44   11   7    7 5  88   5  7   7 88   7 7  11   666 222 6 1 77   1  1  5 1 444444 2 1            22 77 22  2  6 2  88  8 6  7  7 22222222222222  0   3    33  00   6 88  888   6 2   6   6 9     3 3 8  55555      
consensus                     :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-CGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATC-G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG--ACC---T---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAATA--TG-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------NAATGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
Reference ( family-564 )      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-CGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATC-G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG--ACC---T---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAATA--TA-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------NAACGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59282                      :                                                                                                                                                                                   ATATCTT-CGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-A-C-TGCCCGT-GT----AA-TACATT-A---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATC-G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C--AAC--GTT-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG--ATC---T---A-T-A--TTA-CC-TA-T-C------T-C-AGGCAGGTAATA--TA-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAATGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59283                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-TGT--CACC-ATTT-GA--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TGA-GAGT-T--GTTCACA-AT--GAG-TC-C-AA-AATC-G--C-G-AGCG---------TTC-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAT-G-TG--ATC---C---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAATA--TA-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------TAATGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59284                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-CGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-ATTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTC---CA-T-C-TGCCTTT-GT----AA-TACATT-C---TTT---G-CA-AA-----C---T-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATC-G--T-G-TTCG---------CTC-AC--C--AAC--CCA-TTCG-T-CA--AAG-CA-AGA-T--CAC-G-TG--ATC---T---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGCAATA--TG-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAACGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GATAAA
gi|59285                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-TGT--TGTC-ATTT-GC--ACTTGTTT-A----C-AA-AACTTT-GTGTT---CAAT-C-TGCA-TT-AT----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-G---AT-T--G-CT-T-CA-GA--CT--A--CA--------TA--GAAT-T--GTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATC-G--C-G-ACGA---------TTC-AC--C--GAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CACTG-TG--AAC---T---A-T-A--ATA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAG--AATA--TA-G--TC-TC-ATTA--AT-A-AC-GG-C-------------TAACGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAA
gi|59286                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-CGT--CGAC-ATTT-GC--ACT-GTTT-ATATAC-AA-A-CTTC-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-G---------------------------CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-TA-GA--CA--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTT-AAA-GT--GAG-TC-C-AA-AATG-G--T-G-ATCG---------TTT-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-ACA-T--CAC-G-TG--ATC---TATAA-T-A--TTA-CC-TG-T-C------TGC-AGGCAGGTAATA--TG-G--TC-TC-A-TAATAT-A-AC-GG-CTAATGATTATTATTAATGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-ATA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59287                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCT--CATTTCGC--ATTT-GC--A-T-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-C-C-TGCC-TT-GT----AA-TATGTT-T---TTT---AACAGAA-----G-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--TG--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTTCAAAAGC--GAG-TC-CAAA-AATG-G--C-A-ATCG---------TT--AC--C--AAC--ATA-TTCG-T-CA--CAG-TT-AGATT--CAT-G-TT--ACC---TA--A-T-A--TTA-CCTTG-T-C------TGC-AGGCAGGTAATA--TG-G--TC-TC-AGTA--AT-A-AC-GG-C-------------TAATGAA-TCAA--TT--AAA----TC---CTA-G-AAT-CTA-A-TTGCA-G-TAAT-----GACAAA
gi|59288                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-C-T--CGCC-ATTT-TC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AACTACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CACGA--CT--T--CA--------GAA-G-CT-T--GTTC-AA-GA--GAG-TC-C-AA-AATCGG--C-GCAGCA---------TTC-AC--C--AAC--ACATTTCG-T-CA--CAGTTA-AGA-T--CAC-GTTG--ATC---T---A-T-G--CCC-CT-TG-T-TGGTGTAT-C-AGACATATTATA--TATA--TA-TC-A-TAT-AT-A-
gi|59289                      :                                                                                                                                                                                   ATATCTT-CGT--CGCCCATTT-GC--ACT-GTTT-A------AA-A-CT---GTGTT---CA-T-C-TGTTCTT-TT----AA-TATTTT-T---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-G--GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CAGAA--CA--------TAA--AGT-T--CTTCAAA-GC--GAG-TC---AA-AAT--G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C---AC--GTA-TTCG-TCCA--AAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG--ACT---T---A-T-A--TTA-CC-CC-T-T------T-G-CGGCAGGTAATA--TG-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GA-C-------------TAATGAA-CC-A--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AATCCTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GCCAA
gi|59290                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-TGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-GTT
gi|59290                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAATA--TG-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAATGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattacctgtctcaggcaggtaatatggtctcataataacggcaaatgaaccaatcaaattcctagaatctaatttgcagtat
gi|59291                      : atctctttgtcgccatttgcactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncATCTCTT-CGT--CAGC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CATTAGTGTTAATCA-T-C-TGCCCTT-GTCCATAC-TACATT-C---TTTT--A-CA-AAACTCAC-AAT-TT--AT-TATG-TA-T-TACGATGCTG-A--CA--------TAA--AGTAT--GTTCGCG-GC--GAGGTC-C-AA-AA-C-GAGC-G-ATCG---------TTC-AC--C--AACC-GTA-TTTG-T-CA--CAGCTA-AGA-T--CAC-G-TG--ATC---TT--A-T-AAATTAACCATG-G-C------T-CCAGGCAGGTAATAAATA-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAATAAA-CCAA--TCAAAAA-TTATCACACTA-G-AAT-TTA-A---GTA-G-T-GTACACAGACAAA
gi|59292                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTTTCGT--CGCC-ATTT-GT--ACT-------------------TTT-GTGTT---AA-T-C-TGCCCTT-GG----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AAAA---C-GGT-GT-GAT-T--G-GC-T-GA-GA--CG--A--CAGACCTCTATAA-GA---T--AT-CAAA---------------A-AATG-G--A-G-ATCG---------TTC-AC--C-------GTA----A-T-CA--C-G-TA----------C-G-TG--ACCC--T---A-T-AA-TTA-CC-CG-T-C------TGC-AAGCAGGTAATA--TG-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------TATTGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGC--G-T-AT-----GACAA
gi|59293                      :                                                                                                                                                                                   ATCT-TT-CAT--TGCC-ATTT-GC--AC--GTTT-A----C-AA-A-TTTT-GTGTT---CA-T-A-TGCCCTT-AT----AA-TATATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--AG-CA--------TAA-AAAT-T--TATC--------------------AATG-G--C-G-ATCG---------TTC-AA--C--AAC--GTG-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG--ACC---T---A-T-G--TTA-CC-TG-T-C------T-C-A
gi|59293                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-GTTTGCG-G-T-AT-----GACAAaattcctagaatctagtttgcggtatgacaa
gi|59294                      :             atctttcattgccatttgcacgtttacaaattttgtgttcatatgcccttataatatattctttacaaacagtgtgattgcatcagactagcataaaaatttatcaatggcgatcgttcaacaacgtgttcgtcacagtaagatcacgtgacctatgttacctgtcATCTCTT-TGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AT-TAC-TT-C---
gi|59295                      :                                                                                                                                                                                    TCTCTT--GT--TGTC-ATTT-GCC-ACT-GTTTTA----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-TTC-TGCCATT-AT----AA-TACATT-C---TTTT--A-CA-AA-----C-AGT-G---AT-T--G-CT-T-CA-GAA-CT--A--CA--------TAA-GAAT-TATGTGCAAA-GCTTGAG-TC-C-AACAATC-G--CTG-AGCA---------TTC-AC--C--AAC--GTA-TCCT-C-CAACCAG-TA-AGA-T--CAC---TG--ATC---T---A-TCA--ATATCC-TGGT-C------T-C-GAGGAGGTAAT---TA-G--GG-CC-A-TA--ATTA-AC-GG-C-------------TAACGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATT--CA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59296                      :                                                                                                                                                                                    TCTCTT-AGC--CGAT-CTTT--C--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT--TGTT---TA-T-C-TGCCCT---T----AA-TACATT-C---CTT---A-C--AA-----C-AGG-GT-GAT-T--G-CA-T-CA--A--CT-----CA--------T-G-GAG--T--GTTCAAA-GC--GAGATC-C-AA-AA---G--C-G-A----------------------------------CT-T-CA--CAT-TA-AGG-T--CAC-A-TGA-ATC---T---A-T-A--TTA-CC-TG-TCC------T-CTAGGCAGGTAATA--TG-G--TC--C-A-TA--A--A-AC-GGCC-------------TAATGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATGTGCAGG-T-AT-----
gi|59297                      :                                                                                                                                                                                     CTCTT-TGT--TGTC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA---CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCATT-AT----AA-TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-G---AT-T--G-CT-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GAAT-T--GTTCAAA-GC--GAG-AC-C-AA-AATC-G--C-G-AGCA---------TGC-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG--ATC---T---A-T-A--ATA--C-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAATA--TA-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------TAACGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59298                      :                                                                                                                                                                                     CTCTT-CG---CGCC-ATTC--CTTACT-GTT--A----C-AATATCTGT-ATGTT---CA-T-C-TGCTCTTTGT----AA-TACATT-C---TTT---A-CGCAA-----C-AGTTGTTGATAT--GTCAGTGCA-GA--CT-----CA--------TGA-GAGT----GTTCAAA-G----AA-TCTC-AATAATCTG--C-G-TTCGGAGTCGATGTGC-ACGTCTAGAC--GTA-TTCG-T-CAAACAG-TA-AAA-T--CAT-G-TG--ATC---T---A-T-A--ATA-CC-GG-T-C------T-C-A-GCAGGTAATA--CACGCTCC-TC-A-TA--AT-ACACTGG-C-------------TAATGAACCCAA--TCT-AAA-T--CC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTG
gi|59299                      :                                                                                                                                                                                        TT-TGT--CGCC-ATTTTGC--AC--GTTT-A----CCAA-A-TGTT-GTGTT---CA-T-CATGCCCTT-AT----AA-TACATT-C---TT----A-CA-AA-------AGT-GT-GAT-T--G-CT-TACA-GA--CT--A--CA--------TAAAGAGA-T--GTTCGAA-GC--GAG-TC-C-AA-AAAT-G--C-G-A-CG---------TT--AC--C--AAC--GT--TTCG-T-CA--CAG-TT-AGA-TTCCAC-G--G--ACC---T---A-C-A--TTA-CC-TG-T-C----------AGCAAGGTAATA--T--G--TC-TC-A-TT--ATTA-AC-GG-C-------------AAATGAA-CCAA--TC--AAA-A--TT---CCA-G-AAT-CTA-TATTGCA-G-
gi|59300                      :                                                                                                                                                                                        TT-TGT--CGCC-ATTTTGC--AC--GTTT-A----CCAA-A-TGTT-GTGTT---CA-T-CATGCCCTT-AT----AA-TACATT-C---TT----A-CA-AA-------AGT-GT-GAT-T--G-CT-TACA-GA--CT--A--CA--------TAAAGAGA-T--GTTCGAA-GC--GAG-TC-C-AA-AAAT-G--C-G-A-CG---------TT--AC--C--AAC--GT--TTCG-T-CA--CAG-TT-AGA-TTCCAC-G--G--ACC---T---A-C-A--TTA-CC-TG-T-C----------AGCAAGGTAATA--T--G--TC-TC-A-TT--ATTA-AC-GG-C-------------AAATGAA-CCAA--TC--AAA-A--TT---CCA-G-AAT-CTA-TATTGCA-G-
gi|59301                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       -TACATTGC---TTTTCAA-CA-AG-----C-AGT-GT--AT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--AAACA--------TA--GAAT-A--GTT---A-GC--GAG-TC-C-AT-AATG-C--C-G-ATCG---------TTCAAC--T--AATCAGTA-TTCGAT-CA--CAG-TATATA-T---AC-G-TG--ACCTTTT---A-T----TTT-CC-TG-T-T------C-T-AGGCAGATAATA--TG-G--TTATC-A-TA--AT-A-A--GG-C-------------AAATGAACCCAA--TC--ACA-T--TC---CTA-GAAAT-CTA-A-TTGTA-GTT-AT-----GACAAA
gi|59302                      :                                                                                                                                                            gccaattgttttgttatcagaatatctctttatcttttactctTT-TC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT--TATT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-CTTTTTT---A-CA-AA-----CAAGT-GT-GAT------------A-AAT-TT--A--CA--------TAA-GAG---------AAA-GC--GAG--C-C-AA-AATC-G--C---ATCT---------TTC-A---C--ACC--GTA--GCG-TACG--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TGAAACC---T---A-T----TTA-CC-TG-TGC------T-C-A-GCAGGTAATA--TG-G--TCATC-A-TA--AT-A-AT-GG-C-------------AAATGAA-CCAA--TT--AAA-TA-TC---CTA---AAT-CTA-A--TGCACG-T-AT-----GACAAA
gi|59303                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      A-TACATT-T---T----------AA-----C-AGT-GT-AAT-T--G-CAAT-TA-GA--CT-----CA--------TGA-GATT-TT-ATTCAAA-G---GAG--C-C-AACAATC-G--C-G-AGCA---------TTC-CC--C--AAC--GTA-TACG-T-CA--CAG-TA-A-----------------TT---T---A-TTA--TTA-CC--G-T-C------TCC-AGGCTGGTGATA--TA-G---C-T--A-GA--AT-A-AC--G-C-------------TAATGAA-CCAATCTC--AAATT--TC---CTATG-AAT-CTATATTTGCA-G-T-AT-----TACAA
gi|59304                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       -TACATT-C---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-AAGT-T--------A-GC--GAG-TC-C-AT-AATG-G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-ATA-T--CAC-G-TG--ACC---T---A-T-A--TTT-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGATAATA--TG-G--TA-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAATGAA-C
gi|59305                      :                                                                                                                                                                                                                                                                          CATT-A---TTT---A-CA-AA-----C-AGT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GA
gi|59306                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -CA-T-CA--A--TC--A--CA--------TAA-TAGT-T--TTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATG-G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C--AAC--GCA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG--ACT---T---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAATA--TA-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------GAATGAA-CCAA--TC--ATA-T--CT---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59307                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCG---------TTT-AC--C--AAC--GTT-TCCG-T-CA--CAG-AA-AGA-T--CCC-G-TG--ACC---T---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAATA--TG-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAACGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-----AT-----GACAAA
gi|59308                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C---T---ACT-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-A-GCAGGTAATA--TA-G--TC-TCAA-TA--AT-A-AC-GG-C-------------TAATGAA-CC-A--TC--AAA-T--TC---CTA-GAAAT-CTA-ATTTGCG-GTT-AT-----GACAA
gi|59309                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -T-A--TTA-CA--G-C-T------T-C-AGGCAGGTAATA--TA-G--TC-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------TAACGAA-CCAA--TC--AAA-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59310                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A-T--TC---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAGA

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                   111                                                                                                                                                                                                                                                                     11111111111111                                                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                          2   22    2    4  44   2    2 4444 4  2 4    2     333  2 2 4       2  4444  1      1    000 1  3  77777  1  1  1   1 22 1  3 5  3  44  88888  66666666   3    1 44       1  22   3  1 1  5   66 22 1 1 3  777777777   1  22 22   44   1    1 3  44   3  1   1 44   1 1  1 22  444 666 1 3 33   3  3  1 3 444444 4 4           22 22  1  1 3  1 3  33  4 1  1  1 00000000000000      3      66    33 1 222   1 3   1   1 0     3 3 1  44444      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                          .   ..    .    .  ..   .    . .... .  . .    .     ...  . . .       .  ....  .      .    ... .  .  .....  .  .  .   . .. .  . .  .  ..  .....  ........   .    . ..       .  ..   .  . .  .   .. .. . . .  .........   .  .. ..   ..   .    . .  ..   .  .   . ..   . .  . ..  ... ... . . ..   .  .  . . ...... . .           .. ..  .  . .  . .  ..  . .  .  . ..............      .      ..    .. . ...   . .   .   . .     . . .  .....      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                          1   99    1    0  88   0    1 5555 2  1 2    1     777  1 1 2       1  5555  8      7    000 8  6  00000  8  8  8   8 55 7  5 2  5  11  55555  33333333   5    8 33       8  55   6  8 8  5   55 55 8 8 3  000000000   7  44 44   11   7    7 5  88   5  7   7 88   7 7  7 44  666 222 6 1 77   1  1  5 1 444444 6 6           22 22  6  6 2  6 2  88  8 6  7  7 22222222222222      3      22    88 6 888   6 2   6   6 9     3 3 8  55555      
consensus                     :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-CGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-CTTT---A-CA-AA-----CA-GT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATC-G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG-A--CC---T---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAAT--A--TG-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------NAATGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
Reference ( family-564 )      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-CGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-CTTT---A-CA-AA-----CA-GT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATC-G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG-A--CC---T---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAAT--A--TG-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------NAATGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59282                      :                                                                                                                                                                                   ATATCTT-CGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-A-C-TGCCCGT-GT----AA-TACATT-ATTT---A-CA-AA-----CA-GT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATC-G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C--AAC--GTT-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG-A--TC---T---A-T-A--TTA-CC-TA-T-C------T-C-AGGCAGGTAAT--A--TA-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAATGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59283                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-TGT--CACC-ATTT-GA--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-CTTT---A-CA-AA-----CA-GT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TGA-GAGT-T--GTTCACA-AT--GAG-TC-C-AA-AATC-G--C-G-AGCG---------TTC-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAT-G-TG-A--TC---C---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAAT--A--TA-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------TAATGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59284                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-CGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-ATTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTC---CA-T-C-TGCCTTT-GT----AA-TACATT-CTTT---G-CA-AA-----C---T-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATC-G--T-G-TTCG---------CTC-AC--C--AAC--CCA-TTCG-T-CA--AAG-CA-AGA-T--CAC-G-TG-A--TC---T---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGCAAT--A--TG-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAACGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GATAAA
gi|59285                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-TGT--TGTC-ATTT-GC--ACTTGTTT-A----C-AA-AACTTT-GTGTT---CAAT-C-TGCA-TT-AT----AA-TACATT-CTTT---A-CA-AA-----CA-GT-G---AT-T--G-CT-T-CA-GA--CT--A--CA--------TA--GAAT-T--GTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATC-G--C-G-ACGA---------TTC-AC--C--GAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CACTG-TG-A--AC---T---A-T-A--ATA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAG--AAT--A--TA-GT-C-TC-ATTA--AT-A-AC-GG-C-------------TAACGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAA
gi|59286                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-CGT--CGAC-ATTT-GC--ACT-GTTT-ATATAC-AA-A-CTTC-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-G------------------------CA-AA-----CA-GT-GT-GAT-T--G-CA-T-TA-GA--CA--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTT-AAA-GT--GAG-TC-C-AA-AATG-G--T-G-ATCG---------TTT-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-ACA-T--CAC-G-TG-A--TC---TATAA-T-A--TTA-CC-TG-T-C------TGC-AGGCAGGTAAT--A--TG-GT-C-TC-A-TAATAT-A-AC-GG-CTAATGATTATTATTAATGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-ATA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59287                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCT--CATTTCGC--ATTT-GC--A-T-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-C-C-TGCC-TT-GT----AA-TATGTT-TTTT---AACAGAA-----GA-GT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--TG--A--CA--------TAA-GAGT-T--GTTCAAAAGC--GAG-TC-CAAA-AATG-G--C-A-ATCG---------TT--AC--C--AAC--ATA-TTCG-T-CA--CAG-TT-AGATT--CAT-G-TT-A--CC---TA--A-T-A--TTA-CCTTG-T-C------TGC-AGGCAGGTAAT--A--TG-GT-C-TC-AGTA--AT-A-AC-GG-C-------------TAATGAA-TCAATT--AAA---T-C---CTA-G-AAT-CTA-A-TTGCA-G-TAAT-----GACAAA
gi|59288                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-C-T--CGCC-ATTT-TC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AACTACATT-CTTT---A-CA-AA-----CA-GT-GT-GAT-T--G-CA-T-CACGA--CT--T--CA--------GAA-G-CT-T--GTTC-AA-GA--GAG-TC-C-AA-AATCGG--C-GCAGCA---------TTC-AC--C--AAC--ACATTTCG-T-CA--CAGTTA-AGA-T--CAC-GTTG-A--TC---T---A-T-G--CCC-CT-TG-T-TGGTGTAT-C-AGACATATTAT--A--TATAT-A-TC-A-TAT-AT-A-
gi|59289                      :                                                                                                                                                                                   ATATCTT-CGT--CGCCCATTT-GC--ACT-GTTT-A------AA-A-CT---GTGTT---CA-T-C-TGTTCTT-TT----AA-TATTTT-TTTT---A-CA-AA-----CA-GT-G--GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CAGAA--CA--------TAA--AGT-T--CTTCAAA-GC--GAG-TC---AA-AAT--G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C---AC--GTA-TTCG-TCCA--AAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG-A--CT---T---A-T-A--TTA-CC-CC-T-T------T-G-CGGCAGGTAAT--A--TG-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GA-C-------------TAATGAA-CC-ATC--AAAT--T-C---CTA-G-AATCCTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GCCAA
gi|59290                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTT-TGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-GTT
gi|59290                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAAT--A--TG-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAATGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattacctgtctcaggcaggtaatatggtctcataataacggcaaatgaaccaatcaaattcctagaatctaatttgcagtat
gi|59291                      : atctctttgtcgccatttgcactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncATCTCTT-CGT--CAGC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CATTAGTGTTAATCA-T-C-TGCCCTT-GTCCATAC-TACATT-CTTTT--A-CA-AAACTCACA-AT-TT--AT-TATG-TA-T-TACGATGCTG-A--CA--------TAA--AGTAT--GTTCGCG-GC--GAGGTC-C-AA-AA-C-GAGC-G-ATCG---------TTC-AC--C--AACC-GTA-TTTG-T-CA--CAGCTA-AGA-T--CAC-G-TG-A--TC---TT--A-T-AAATTAACCATG-G-C------T-CCAGGCAGGTAAT--AAATA-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAATAAA-CCAATCAAAAATTAT-CACACTA-G-AAT-TTA-A---GTA-G-T-GTACACAGACAAA
gi|59292                      :                                                                                                                                                                                   ATCTCTTTCGT--CGCC-ATTT-GT--ACT-------------------TTT-GTGTT---AA-T-C-TGCCCTT-GG----AA-TACATT-CTTT---A-CA-AAAA---CG-GT-GT-GAT-T--G-GC-T-GA-GA--CG--A--CAGACCTCTATAA-GA---T--AT-CAAA---------------A-AATG-G--A-G-ATCG---------TTC-AC--C-------GTA----A-T-CA--C-G-TA----------C-G-TG-A--CCC--T---A-T-AA-TTA-CC-CG-T-C------TGC-AAGCAGGTAAT--A--TG-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------TATTGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGC--G-T-AT-----GACAA
gi|59293                      :                                                                                                                                                                                   ATCT-TT-CAT--TGCC-ATTT-GC--AC--GTTT-A----C-AA-A-TTTT-GTGTT---CA-T-A-TGCCCTT-AT----AA-TATATT-CTTT---A-CA-AA-----CA-GT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--AG-CA--------TAA-AAAT-T--TATC--------------------AATG-G--C-G-ATCG---------TTC-AA--C--AAC--GTG-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG-A--CC---T---A-T-G--TTA-CC-TG-T-C------T-C-A
gi|59293                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-GTTTGCG-G-T-AT-----GACAAaattcctagaatctagtttgcggtatgacaa
gi|59294                      :             atctttcattgccatttgcacgtttacaaattttgtgttcatatgcccttataatatattctttacaaacagtgtgattgcatcagactagcataaaaatttatcaatggcgatcgttcaacaacgtgttcgtcacagtaagatcacgtgacctatgttacctgtcATCTCTT-TGT--CGCC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AT-TAC-TT-C
gi|59295                      :                                                                                                                                                                                    TCTCTT--GT--TGTC-ATTT-GCC-ACT-GTTTTA----C-AA-A-CTTT-GTGTT---CA-TTC-TGCCATT-AT----AA-TACATT-CTTTT--A-CA-AA-----CA-GT-G---AT-T--G-CT-T-CA-GAA-CT--A--CA--------TAA-GAAT-TATGTGCAAA-GCTTGAG-TC-C-AACAATC-G--CTG-AGCA---------TTC-AC--C--AAC--GTA-TCCT-C-CAACCAG-TA-AGA-T--CAC---TG-A--TC---T---A-TCA--ATATCC-TGGT-C------T-C-GAGGAGGTAAT--T--AG-GG-C--C-A-TA--ATTA-AC-GG-C-------------TAACGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATT--CA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59296                      :                                                                                                                                                                                    TCTCTT-AGC--CGAT-CTTT--C--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT--TGTT---TA-T-C-TGCCCT---T----AA-TACATT-CCTT---A-C--AA-----CA-GG-GT-GAT-T--G-CA-T-CA--A--CT-----CA--------T-G-GAG--T--GTTCAAA-GC--GAGATC-C-AA-AA---G--C-G-A----------------------------------CT-T-CA--CAT-TA-AGG-T--CAC-A-TGAA--TC---T---A-T-A--TTA-CC-TG-TCC------T-CTAGGCAGGTAAT--A--TG-GT-C--C-A-TA--A--A-AC-GGCC-------------TAATGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATGTGCAGG-T-AT-----
gi|59297                      :                                                                                                                                                                                     CTCTT-TGT--TGTC-ATTT-GC--ACT-GTTT-A----C-AA---CTTT-GTGTT---CA-T-C-TGCCATT-AT----AA-TACATT-CTTT---A-CA-AA-----CA-GT-G---AT-T--G-CT-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GAAT-T--GTTCAAA-GC--GAG-AC-C-AA-AATC-G--C-G-AGCA---------TGC-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG-A--TC---T---A-T-A--ATA--C-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAAT--A--TA-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------TAACGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59298                      :                                                                                                                                                                                     CTCTT-CG---CGCC-ATTC--CTTACT-GTT--A----C-AATATCTGT-ATGTT---CA-T-C-TGCTCTTTGT----AA-TACATT-CTTT---A-CGCAA-----CA-GTTGTTGATAT--GTCAGTGCA-GA--CT-----CA--------TGA-GAGT----GTTCAAA-G----AA-TCTC-AATAATCTG--C-G-TTCGGAGTCGATGTGC-ACGTCTAGAC--GTA-TTCG-T-CAAACAG-TA-AAA-T--CAT-G-TG-A--TC---T---A-T-A--ATA-CC-GG-T-C------T-C-A-GCAGGTAATACA--CG-CTCC-TC-A-TA--AT-ACACTGG-C-------------TAATGAACCCAATCT-AAAT--C-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTG
gi|59299                      :                                                                                                                                                                                        TT-TGT--CGCC-ATTTTGC--AC--GTTT-A----CCAA-A-TGTT-GTGTT---CA-T-CATGCCCTT-AT----AA-TACATT-CTT----A-CA-AA------A-GT-GT-GAT-T--G-CT-TACA-GA--CT--A--CA--------TAAAGAGA-T--GTTCGAA-GC--GAG-TC-C-AA-AAAT-G--C-G-A-CG---------TT--AC--C--AAC--GT--TTCG-T-CA--CAG-TT-AGA-TTCCAC-G--G-A--CC---T---A-C-A--TTA-CC-TG-T-C----------AGCAAGGTAAT--A--TG--T-C-TC-A-TT--ATTA-AC-GG-C-------------AAATGAA-CCAATC--AAAA--T-T---CCA-G-AAT-CTA-TATTGCA-G-
gi|59300                      :                                                                                                                                                                                        TT-TGT--CGCC-ATTTTGC--AC--GTTT-A----CCAA-A-TGTT-GTGTT---CA-T-CATGCCCTT-AT----AA-TACATT-CTT----A-CA-AA------A-GT-GT-GAT-T--G-CT-TACA-GA--CT--A--CA--------TAAAGAGA-T--GTTCGAA-GC--GAG-TC-C-AA-AAAT-G--C-G-A-CG---------TT--AC--C--AAC--GT--TTCG-T-CA--CAG-TT-AGA-TTCCAC-G--G-A--CC---T---A-C-A--TTA-CC-TG-T-C----------AGCAAGGTAAT--A--TG--T-C-TC-A-TT--ATTA-AC-GG-C-------------AAATGAA-CCAATC--AAAA--T-T---CCA-G-AAT-CTA-TATTGCA-G-
gi|59301                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       -TACATTGCTTTTCAA-CA-AG-----CA-GT-GT--AT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--AAACA--------TA--GAAT-A--GTT---A-GC--GAG-TC-C-AT-AATG-C--C-G-ATCG---------TTCAAC--T--AATCAGTA-TTCGAT-CA--CAG-TATATA-T---AC-G-TG-A--CCTTTT---A-T----TTT-CC-TG-T-T------C-T-AGGCAGATAAT--A--TG-GT-TATC-A-TA--AT-A-A--GG-C-------------AAATGAACCCAATC--ACAT--T-C---CTA-GAAAT-CTA-A-TTGTA-GTT-AT-----GACAAA
gi|59302                      :                                                                                                                                                            gccaattgttttgttatcagaatatctctttatcttttactctTT-TC--ACT-GTTT-A----C-AA-A-CTTT--TATT---CA-T-C-TGCCCTT-GT----AA-TACATT-CTTTTTTA-CA-AA-----CAAGT-GT-GAT------------A-AA--TTT-A--CA--------TAA-GAG---------AAA-GC--GAG--C-C-AA-AATC-G--C---ATCT---------TTC-AC-----ACC--GTA-G-CG-TACG--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG-AAACC---T---A-T----TTA-CC-TG-TGC------T-C-AG-CAGGTAAT--A--TG-GT-CATC-A-TA--AT-A-AT-GG-C-------------AAATGAA-CCAATT--AAATA-T-C---CTA---AAT-CTA-A--TGCACG-T-AT-----GACAAA
gi|59303                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      A-TACATT-TT----------AA-----CA-GT-GT-AAT-T--G-CAAT-TA-GA--CT-----CA--------TGA-GATT-TT-ATTCAAA-G---GAG--C-C-AACAATC-G--C-G-AGCA---------TTC-CC--C--AAC--GTA-TACG-T-CA--CAG-TA-A------------------TT---T---A-TTA--TTA-CC--G-T-C------T-CCAGGCTGGTGAT--A--TA-G--C-T--A-GA--AT-A-AC-G--C-------------TAATGAA-CCAATCTCAAAT--TTC---CTATG-AAT-CTATATTTGCA-G-T-AT-----TACAA
gi|59304                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       -TACATT-CTTT---A-CA-AA-----CA-GT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-AAGT-T--------A-GC--GAG-TC-C-AT-AATG-G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C--AAC--GTA-TTCG-T-CA--CAG-TA-ATA-T--CAC-G-TG-A--CC---T---A-T-A--TTT-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGATAAT--A--TG-GT-A-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAATGAA-C
gi|59305                      :                                                                                                                                                                                                                                                                          CATT-ATTT---A-CA-AA-----CA-GT-GT-GAT-T--G-CA-T-CA-GA--CT--A--CA--------TAA-GA
gi|59306                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CA-T-CA--A--TC--A--CA--------TAA-TAGT-T--TTTCAAA-GC--GAG-TC-C-AA-AATG-G--C-G-ATCG---------TTC-AC--C--AAC--GCA-TTCG-T-CA--CAG-TA-AGA-T--CAC-G-TG-A--CT---T---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAAT--A--TA-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------GAATGAA-CCAATC--ATAT--C-T---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59307                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCG---------TTT-AC--C--AAC--GTT-TCCG-T-CA--CAG-AA-AGA-T--CCC-G-TG-A--CC---T---A-T-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-AGGCAGGTAAT--A--TG-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------AAACGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-----AT-----GACAAA
gi|59308                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C---T---ACT-A--TTA-CC-TG-T-C------T-C-A-GCAGGTAAT--A--TA-GT-C-TCAA-TA--AT-A-AC-GG-C-------------TAATGAA-CC-ATC--AAAT--T-C---CTA-GAAAT-CTA-ATTTGCG-GTT-AT-----GACAA
gi|59309                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T-A--TTA-CA--G-C-T------T-C-AGGCAGGTAAT--A--TA-GT-C-TC-A-TA--AT-A-AC-GG-C-------------TAACGAA-CCAATC--AAAT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAAA
gi|59310                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AT--T-C---CTA-G-AAT-CTA-ATTTGCA-G-T-AT-----GACAGA