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Reference ( gi|89708 )        :  AATTTTGGAAACAAA-AA-A-TG-TCTTT-A-TT--GCAA-TAAATGAA--TA-AAA---A-A-TA-T-A-----TAC-A------TG-T-AAAAAT---A-CAT-AGC-C-A----CG----A--TG--GCTA-----CC-GAAA--GT-G-TT------ACT-TT------A-----A-T--TTC-----------A-------TCG---TA---AC---AA-GAACTA-GATAAAT-C----A---C-C-A-AGC--AATA-TTC-T-ATGA-AT-ACCT----CA-A----AAACAT-G-TCC------AAG-CG--TACTAAAAG-AATG-AATAAGA
gi|89709                      :  AATTTTTGAAACAAA-AA-A-TA-TCTTA-T-TT--GC-A-TAAATGAA--TG-AAA---A-A-TA-T-------TAC-A------TG-T-AAAAAT---A-CAT-AGCGC-A----CG----A--TG--GCTA-----CCAGAAA--GT-G-TT------ACT-TT------A-----A-T--TTC-----------A-------TCG---TA---AC---AA-GAACTA-GATAAAT-C----T---C-C-A-AGT--AATA-TTC-T-ATCA-AT-ACCT----CACA----AAACATCG-TCC------AAG-CG--TACTAAAAG-AATG-AATAAGA
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Reference ( family-562 )      :                                                                                                                                                               AATTT-TTGAAACAAA-AA-A-TG-T-TTTTA-TT--GCAA-TAAATGAA--TA-AAA---A-A-TA-T-A-----TAC-A------TG-T-AAAAA-T---A-CAT-AGC-C-ACG--A-T----GGCT-----G-C-C-GAAA---GT-G-TTA------CT-TT------A-----A-T--TTC-----------A-------TCGTA---AC---AA-GAACTA-GATAAAT-C----A---C-CN-AGT-AATA-TTC-T-ATCAAT-A-CCT----CA--------NA--A-G-CAT-G-TCC------AAG-CG--TACTAAAAG-AATG-AATAAGA
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Reference ( family-562 )      :                                                                                                                                                               AATTT-TTGAAACAAA-AA-A-TG-T-TTTTA-TT--GCAA-TAAATGAA--TA-AAA---A-A-TA-T-A-----TA-CA------TG-TAAAAA-T---A-CAT-AGC-C-ACG--A-T----GGCT-----GC-C-GAAA---GT-GTTA------CT-TT------A-----A-T--TTC-----------A-------TCG---TA---AC---AA-GAACTA-GATAAAT-C----A---C-CN-A-GT-AATA-TTC-T-ATCAAT-A-CCT----CA----T--------AA-G-CAT-G-TCC------AAG-CG--TACTAAAAG-AATG-AATAAGA
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Reference ( family-562 )      :                                                                                                                                                               AATTT-TTGAAACAAA-AA-A-TG-T-TTTTA-TT--GCAA-TAAATGAA--TA-AAA---A-A-TA-T-A-----TA-CA------TG-TAAAAA-T---A-CAT-AGC-C-ACG--A-T----GGCT-----GC-C-GAAA---GT-GTTA------CT-TT------A-----A-T--TTC-----------A-------TCG---TA---AC---AA-GAACTA-GATAAAT-C----A---C-CN-A-GT-AATA-TTC-T-ATCAAT-A-CCT----CA----T--------AA-G-CAT-G-TCC------AAG-CG--TACTAAAAG-AATG-AATAAGA
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gi|89725                      :                                                                                                                                                      tctttatagcaTTT-TTGAAACAAA-TG-T-TGAT-TTTTA-TTATGCAAGTAAAT-AA--TA-AAA---AGA-TAAT-ACCGCTTA-CA------TAATAAAAA-T---A-CATTAGC-CCACG--A-T----G-CT-----GC-A-AAAAAAAGT-GTTA------CT-TTCCCAA-A-----A-T--T-------------A-------CCG---TAC--AC---AG-AAACTA-GATACAT-C----A---T-TA-A-GT-AATATTTC-T-CTCAATCA-TCTAATACAACTGT--------AA-G-TAT-G-TTC------AAGTCG--TACTAAAAG-AA-G-AA
gi|89726                      :                                                                                                                                                                  TT-TTGAA-CAAA-AA---TG-T-TTTTA-TT--GCAA-TAAATGAA------AA---A-A-TA-T-A-----CA-CA---------------------------GC-C-ACA--G-T----GGCT-----GC-C--AAA---GT-GTTA------CT-TTTGTCAAA-----A-T--TT------------A-------TTG---TA---AC---AA--AACTA-GATAAAT-C----A---C-CC-A-GT-AATA-TTC-T-ATTAAT-A-CCT----CA----T--------AA-G-CAT-G-TCC------AAG-CA--TACTAAAAG-AATGAAATAAGA
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gi|89729                      :                                                                                                                                                                                                                                    -A-----TG-CA------AA-TAAAAA-A---A-AAT--GC-C-ACG--A-A----AACT-----TT-C-GGA-----T--TTA------GT-AC------G-----A-T--TTT-------------------TCG---TG---AC---AA-GAAATA-TATAAAA-C----A---C-CT-A-GT-AATA-TTC-T-TTAAAT-A-CCT----TA----T--------AT-G-CAT-G-TCC------GCG-TG--TACTAAAAT-AATA-GGTAAGA
gi|89730                      :                                                                                                                                                                                                  aaacaacatttaaatgttttaAA---T-A-TA-T-ACAC--TA-CA------TA-TAAAAA-T---A-CAT-AGC-T-ACG--G-T----GGCT-----GC-C-AAAA---GT-GTTA------CT-TTTTTAA-A-----A-T--TT------------A-------TCG---TA---AC---AA-GAACTA-GATAAAC-C----A---C-TA-A-GT-AA
gi|89731                      :                                                                                                                                                                                                                               -TA-T-A-----TA-CA------TG-TAAAAA-T---A-CAT-AGC-C-ACA--G-T----GACT-----GC-A-GAAA---GT-GTTA------CT-TT------ATCAAAA-T--TT------------A-------TCG---TA---AC---AA-GAACTA-GGTAAAT-C----A---A-CT-A-GT-GATA-TTC-T-ATTAAT-A-CCT----CA----T--------AA-G-CAT-T-TCC------A
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  A    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . ACAC     .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . G    .    .    .       .  TTTAAA       . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   CT   .  .    .   . A  C   . .   CAT                  A     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  A    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . AA       .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . G    .    .    .       .  ATCAAA       . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   CT   .  .    .   . A  C   . .   CAC                  A     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  A    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . AA       .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . A    .    .    .       .  TTTGAA       . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   CT   .  .    .   . A  C   . .   TCT                  A     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  A    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . AA       .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . G    .    .    .       .  GTCAAA       . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   TA   .  .    .   . A  C   . .   TCT                  A     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  A    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . G    .    .    .       .  AAT          . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   CT   .  .    .   . A  C   . .   TCT                  G     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  A    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . G    .    .    .       .  AAT          . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   GT   .  .    .   . C  C   . .   CAT                  G     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  A    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . A    .    .    .       .  AAT          . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   CT   .  .    .   . A  G   . .   CAT                  G     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  T    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . G    .    .    .       .  A            . .   T            .         .    .    .    .      .       . .    .   CA   .  .    .   . C  G   . .   AAT                  G     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  A    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . G    .    .    .       .  A            . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   CT   .  .    .   . A  C   . .   AAA                  G     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  A    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . A    .    .    .       .  A            . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   TA   .  .    .   . A  C   . .   CAT                  A     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  .    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . G    .    .    .       .  A            . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   CT   .  .    .   . C  A   . .   AAA                  G     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  .    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . A    .    .    .       .  A            . .   G            .         .    .    .    .      .       . .    .   TA   .  .    .   . C  C   . .   CAT                  G     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  .    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . G    .    .    .       .  A            . .   C            .         .    .    .    .      .       . .    .   CC   .  .    .   . C  T   . .   CAT                  G     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  .    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . G    .    .    .       .  G            . .   T            .         .    .    .    .      .       . .    .   CC   .  .    .   . A  T   . .   CAA                  G     . .   .        .  .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .          .  .    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . A    .    .    .       .  A            . .   T            .         .    .    .    .      .       . .    .   CA   .  .    .   . A  G   . .   TAT                  A     . .   .        .  .          .    .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .  .    . .     .  .     .        .   .   .   . .  . A        .  .       .      . .   .   .   . .   .  . .       .      . A    .    .    .       .  G            . .   .            .         .    .    .    .      .       . .    .   TA   .  .    .   . T  T   . .   AAT                  A     . .   .        .  .          .     
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Reference ( family-562 )      :                                                                                                                                                               AATTT-TTGAAACAAA-AA-A-TG-T-TTTTA-TT--GCAA-TAAATGAA--TA-AAA---A-A-TA-T-A-----TA-CA------TG-TAAAAA-T---A-CAT-AGC-C-ACG--A-T----GGCT-----GC-C-GAAA---GT-GTTA------CT-TT------A-----A-T--TTC-----------A-------TCG---TA---AC---AA-GAACTA-GATAAAT-C----A---C-CN-A-GT-AATA-TTC-T-ATCAAT-A-CCT----CA----T--------AA-G-CAT-G-TCC------AAG-CG--TACTAAAAG-AATG-AATAAGA
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