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Reference ( gi|7347 )         : TTTATTTTGA-GTTTA-AT---TC---CAGTGTTTTTTTT---GGG-----------CCCGATT-TGGGG--CCG--A-TATT-CGGCC----C----CAGTCCCAA-T-CC--T---AAA---------T----T---TCCT--A----A--TA--TTTT----CC-C-A-A--T-T--T-----T--------GA-GGGGAAAATTCCCA-A--TCGTAA---CCAAAAA--AAAA
gi|7346                       : TTTATTTTGA-GTTTA-AT---TC---CAGTGTTTTTTTT---GGG-----------CCCGATT-TGGGG--CCG--A-TATT-CGGCC----C----CAGTCCCAA-T-CC--T---AAA---------T----T---TCCT--A----A--TA--TTTT----CC-C---A--T-T--T-----T--------GA-GGGGAAAATTCCCA-A--TCGTAA---CCAAAAA--AAA
gi|7348                       : TTTATTTTGA-GTTTA-AT---TC---CAGTGTTTTTTTT---GGG-----------CCCGATT-TGGGG--CCG--A-TATT-CGGCC----C----CAGTCCCAA-T-CC--T---AAA---------T----T---TCCT--A----A--TA--TTTT----CC-C-A-T--T-T--T-----T--------GA-GGGGAAAATCCC---A--TCGTAA---CCAAAAA--AAAA
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Reference ( family-561 )      :                                        TTTATTTTGAGTTTA-AT---TC---CAGTGNTTTTTTT---GGG--CCCGATT-T--GGGNCCG--A-TA-TTCGGCCCCATTCCCAA-T-CC---NA--AA----T---T------TC--CTA----A-----T-T-TTT----CCC--A-A--TT--T-----T--------GA-NGGGAAAATTCCCA-A--TCGTAA---CCAAAAA--AAAA
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gi|7363                       :                                                               ---CAGTGATTTTTTA---AGG--ACCAGTT-T--GGGTCCG--A-AT-TTCGGCCCT-TTCCCTT-C-CC---AA--AA----A---T------TG--CTA----A-----T-T-TTTT---CCC--A-
gi|7364                       :                                                               ---CAGTGATTTTTCA---AGG--CCCAATT-T--GGGTCTG--A-AT-TTCGGCCCTTTCCCC---T-CC---CATAAA----T---T------GT--CAA----T-----T-T-TTT----CCC--A-A--TT--T-----tt
gi|7365                       :                                                                                   GA--CCTAAAT-T--GGGTCCG--A-TA-TTCGGCTCCAGTCCCAA-T-CC----A--AA----G---G------TC--CT-----------T-T-TTT----CCC--A-A--TT--T-----G--------CA-AGTGAAAATTCCCA-A--TT-CAG---CCAAacccaagattaagaaaggaaaactcattaaaaaaaa
gi|7366                       :                                                                                     --CCTGATT-T--GGGTCCG--A-TC-TTCGGCCCCATTCCCAA-T-CC---AA--AA----TGGGG------TC--CT-----------T-T-TTT----CCC--A-A--TT--T-----A--------CA-AGTAAAAATTCCCA-A--TT-TAA---CCAA
gi|7367                       :                                                                                     --CCTGATT-T--GGGTCCA--A-TA-TTTTGCCCCATTCCTAA-T-CCAAAGA--AG----G---G------TC--CT-----------T-T-TTT----CCC--A-A--TT--T-----A--------CA-AGTGAAAATTCCCA-A--TT-CAA---CCAA
gi|7368                       :                                                                                                --GGGTCCG--A-AA-TTCGGCCCCATTCCCAA-T-GC---AG--AA----T---------------TAAAGCA-----T-T-TTT----CCC--A-A--TTTGT-----T--------GA-C----AAATTCCCA-A--TCTTAT---TTAAACA--ACAA
gi|7369                       :                                                                             ccctgttgtggCTGACT-T--GGGTCCG--A-TA-TTCAGCCCCATTCCCAA-T-CC---AA--AAAAAGA---G------TC--CT-----------T-T-TTA----CCC--A-A--TT--T-----G--------CA-AGTGAAAATTCCCA-A--TT-CAA---CCA
gi|7370                       :                                                                                          GATT-T--GGGGCCG--T-TA-T-CGGCCCCAGTCCCAA-T-CC---GA--AA----T---T------CC--CTG----A-----T-A-TTT----TCCAAA-A--AC--C-----T--------GA-CCAAAAATTTCCCA-A--TCGTAAATTCCGAAAA--
gi|7371                       :                                                                                            TT-T--GGGCCCG--A-TA-TTCGGCCCTAGTCCCAACT-CC---TA--AA----T---T------TT--CTA----A-------A-TTT----CCA--A-A--TT--T---------------A-GGGGAAAATTCCCA-A--TCGTAA---CC
gi|7372                       :                                                                                            TT-T--GGGTCCG--A-TA-TTCGGCCTCATTCCCAA-T-TA---AA--AAAAG-G---G------TC--TT-----------T-T-TTT----CCC--A-A--TT--TGCAACT--------TA-CGTAAAAATTCCCA-A--T-GCAA---CCAA
gi|7373                       :                                                                                                --GGGGCCG--A-AA-TTTGGCCCCATTCCCAA-T-GC---TA--AA---------------TA--GTA----A-----C-T-TTTCCCCCCC--A-A--TTTGT-----T--------AA-C---AAAATTCACA-G--TTTTAT---TCAAACA--AAAA
gi|7374                       :                                                                                                --GGGTCCG--A-AA-TTCGGCCCCATTCCCAA-T-GC---AG--AA----T---------------TA----AAGCATT-T-TTT----CCC--A-A--TTTGT-----T--------GA-C--AAAAATTCCCA-A--TCTTAT---TTAAACA--ACAAa


blockSeqs                     :                                                       T  CTTTT        T      TTGG   GC  C    G AG   G   GA AT T                 C G  TTAA TA  TTCCCTCTGAT                        T   CCCC   CA T TC  TACCTAAGATTAAGAAAGG               C AT CG   ATT       TC
blockSeqs                     :                                                       .  TTTTA        T      TAA    .   C    . T    G   .  T  .                 . .  AAAG .   AAAGAGTCCTT                        .   T      AA . .   TGCAACTTACGTA                     . .  CG   ATT       . 
blockSeqs                     :                                                       .  TC           T      TA     .   T    . .    G   .  T  .                 . .  CAA  .   TTTCCTAATA                         .   T      A  . .   TTGAGGGGG                         . .  CG   ATT       . 
blockSeqs                     :                                                       .  TC           T      T      .   G    . .    G   .  T  .                 . .  T    .   TTTCCTAATA                         .   T      A  . .   TTGAGGGG                          . .  AG   CC        . 
blockSeqs                     :                                                       .  TC           A      T      .   T    . .    T   .  T  .                 . .  T    .   TTTCCTAATT                         .   .      .  . .   TTGAGGGG                          . .  CG   TT        . 
blockSeqs                     :                                                       .  TG           T      T      .   C    . .    T   .  T  .                 . .  T    .   AACGGTCCTT                         .   .      .  . .   CTGACCGA                          . .  CA   .         . 
blockSeqs                     :                                                       .  CT           A      T      .   C    . .    G   .  A  .                 . .  A    .   TTGAAGCATC                         .   .      .  . .   TGCAAGTA                          . .  CG   .         . 
blockSeqs                     :                                                       .  TT           A      C      .   C    . .    T   .  T  .                 . .  A    .   AAGCAGGAAT                         .   .      .  . .   TGTTGACA                          . .  CG   .         . 
blockSeqs                     :                                                          .            G      T      .   T    . .    C   .  A  .                 . .  A    .   TTTCCTAATA                         .   .      .  . .   TTTACTTT                          . .  CG   .         . 
blockSeqs                     :                                                                       A      T      .   C    . .    G   .  A  .                 . .  T    .   TTCCCTGATA                         .   .      .  . .   CTGACCGA                          . .  CT   .         . 
blockSeqs                     :                                                                       T      T      .   T    . .    G   .  T  .                 . .  T    .   TGGGGTCCTT                         .   .      .  . .   CTGACTGA                          . .  CG   .         . 
blockSeqs                     :                                                                       A      T      .   T    . .    G   .  A  .                 . .  T    .   AAGGGTCTTT                         .   .      .  . .   TAGAGGAG                          . .  CG   .         . 
blockSeqs                     :                                                                       A      A      .   C    . .    T   .  T  .                 . .  G    .   TTAAAGCATT                         .   .      .  . .   TGCAAGTG                          . .  TT   .         . 
blockSeqs                     :                                                                       A      A      .   C    . .    T   .  T  .                 . .  G    .   ATTGCTAAT                          .   .      .  . .   TACAAGTA                          . .  CT   .         . 
blockSeqs                     :                                                                       A      A      .   C    . .    T   .  A  .                 . .  A    .   TTAGTCAAT                          .   .      .  . .   TACAAGTG                          . .  T    .           
blockSeqs                     :                                                                       .      A      .   C    . .    T   .  A  .                 . .  A    .   ATTGCTAAT                          .   .      .  . .   TGCAAGTG                          . .  T    .           
blockSeqs                     :                                                                       .      .      .   T    . .    T   .  A  .                 . .  A    .   ATTGCCAAT                          .   .      .  . .   CTGACCAA                          . .  T    .           
blockSeqs                     :                                                                                     .   T    . .    T   .  A  .                 . .  C    .   ATTGCTAAT                          .   .      .  . .   TGTTGACA                          . .  T    .           
blockSeqs                     :                                                                                     .   T    . .    T   .  T  .                 . .  A    .   TTGTCAATT                          .   .      .  . .   GTGAGAG                           . .  T    .           
blockSeqs                     :                                                                                     .   T    . .    T   .  T  .                 . .  A    .   TTAAAGCAT                          .   .      .  . .   TGAGGGG                           . .  G    .           
blockSeqs                     :                                                                                     .   .    . .    T   .  T  .                 . .  A    .   TTCCCTGAT                          .   .      .  . .   TGTTGAC                           . .  .    .           
blockSeqs                     :                                                                                         .    . .    G   .  A  .                 . .  G    .   TTCTAATA                           .   .      .  . .   TGTTAAC                           . .                   
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gi|7374                       :                                                                                                --GGGTCCG--A-AA-TTCGGCCCCATTCCCAA-T-GC---AG--AA----T---------------TA----AAGCATT-T-TTT----CCC--A-A--TTTGT-----T--------GA-C--AAAAATTCCCA-A--TCTTAT---TTAAACA--ACAAa