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Reference ( gi|74424 )        : TTTTTTTGC---CA--ACTTTAAGCT-CTC-G-T-CA---TATG-A-ACAC-AA-A-T-C-A-T--T-TCA-CTGAT------AA---AACTGAGT-G------GA--T---TT----------T-T-G-G-A----TT--G--CTAA--T----A--TG--TTC--C--TTA--T---TT---GA-CTGGC-AAG------G--------GTT--T---G-A--T-C--C---AAG--T-GA--AAT-CA-TCA-A-TA-TTT--T--GG--GCC-AG--CA-GAC--T--A--TA-G-A------AAC-TGTAC-CT--A-GTTCTTT
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Reference ( family-558 )      : TTTTTTTGC---CA--ACTTCAAGCT-CTC-G-T-CA---TATG-A-ACACAAA-T-C-AT--T-TTA-CTGAT-C-----A---A-A-C-TGAG---C-G---GA---T---TT----------TT-G-G----N-TT--G--CTA------A--TA--TA-TTC--C--TTA--T---TT---GA-CTGG-CAAG------G--------GTTT--GA-G-T--C-C--AAG--T-GA--AAT-CA-TCA-A-TA-TTT--T--G---G--GCC-AG-NT-GAC-T----NTA-G-A------AAC-TGTAC-CTAC-TTCTTT
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Reference ( family-558 )      : TTTTTTTGC---CA--ACTTCAAGCT-CTC-G-T-CA---TATG-A-ACACAAA-T-C-AT--T-TTA-CTGAT-C-----A---A-A-C-TGAG---C-G---GA---T---TT----------TT-G-G----N-TT--G--CTA------A--TA--TA-TTC--C--TTA--T---TT---GA-CTGG-CAAG------G--------GTTT--GA-G-T--C-C--AAG--T-GA--AAT-CA-TCA-A-TA-TTT--T--G---G--GCC-AG-NT-GAC-T----NTA-G-A------AAC-TGTAC-CTAC-TTCTTT
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gi|74444                      :   TTTTTGC---CA--ACTTCAAGCT-CTT-G-C-GA---TATG---ACTCAAA-T-C-AT--TGTTA-CTGAT-C-----A---A-A---TGA----C-G---GA---T---GC----------TT-G-A----A--T--G--C-A------A--TA---A-TTT--C--CTA--T---TTA--AA-CTTG-CAA-------G--------GTTT--GA-G-T--T-C--AAG--T-----AAT----TC----CA-TTT--T--G---G--G-C-AG-TT-GAC-T----ATA-G--------AAC-TGTAC-TT-C-TTCTTTctc
gi|74445                      :    TTTTAC---CA--ACTTCAAGCT-CTT-G-T-CA---TATA-G-ACACAAACT-C-AT--T-TTA-CTGAT-C-----A---A-ACC-TGAG---C-G---GA---T---TTA---------TT-GCG----A-TTA-G--CTA------A--TA--TA-TTCA-C--TTA--T---TT---GA-CT-G-CAAG------G--------GTTTTCGA-G-TTCT-C--AAG--T-GA--AAT-CAGTCA-A-TA-TTT--T--G---GTCACC-AG-CT-G-C-T----ATA-G-A------AACTTGTAC-TTAC-TTCTTT
gi|74446                      :     TTTGT---CG--ACTTCAAGCT-CTC-G-T-CA---TATG-A--CACAAA-T-C-AT--T-TTA-CAAAT-C-----A---A-A-C-TGGG---T-G---GA---T---TT----------TT-G-G----T-TT--G--CTG------A--TA--TA-TTC--C--TAA--T---TT---GA-CTGT-C-AG------G--------GTTT--GT-GCT--C-T--AAG--T-GA--AAT-AA-TCA-A-TA-TTT--T--G---G--GCC-AG-TT-
gi|74447                      :       TGC---CA--AATTCAACCT-CCC-G-T-CA---TATG-ATATATATA-T-A-AT--T-TTG-CTGAT-C-----A---A-A-G-CGAG---C-A---AA---T---TT----------TT-G-G----T-TT--G--CTA------A--TC--CA-TTC--C--TTT--T---TT---CA-CTG--CAAG------G--------ATTT--GA-T-T--TTC--AAG--T-GA--AAT-CA-TCG-A-T--TT--------------------CT-AAC-------TA-G-A------AAT-TCTAC-CTAC-TTGTTT
gi|74448                      :              A--ACTTCAAGCT-CTC-G-T-CA---TATATG-ACACAAT-T-C-AT--T-TTA-CTGAT-C-----A---A-A-C-TGAG---C-G---GA---T---TT----------TT-G-G----A-TT--G--CTA------A--TA--TA-TTC--C--TTA--T---TT---GA-CTGC-AAAG------G--------GTTT--GA-GTT--C-C--AAG--T-GA--AAT-CA-TCA-A-TA-TTT--T--G---G--GCC-AG-TT-GAC-T----ACA-T-A------AAC-TGTAC-CTAC-TTCTTT
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gi|74450                      :                          T-CTT-G-T-CA----ATG-ACACACCA--T-C-AA--T-TTAACTGATTC-----A---ACA-C-TGGGAGCC-G---GAAGAT---TT----------TT-G-G----A-TT--G---TA------AATTA--TACTTC--C--TTA--T---TTAGAAA-CTGG-CAAG------GCGCGCTTAATTT--GA-GTT--C-C--AAG--T-TA--AAT--A-TCA-A-TA-TTT--TTCG---G--GCCTAGTATAGAC-T----ATA-G-ACATCCTAAC-TGTACTCTACATTCTTT
gi|74451                      :                                 -T-TA---TATG-A-ACA--AA-T---AT-----------GC-C-----A---A-A-T-TAAG-----A---GA----------------------G-G----A-TT--G--CTA------A--TG--TA-TTC--C--TTA--T---TT---GA-CT-G-CAAG------G--------GTTT--GA-GCT--C-C--AAG--T-GA--ACT-CA-TCA-A-TA-TTT--T--G---G--GCC-AG-TT-GAC-T----TTA-G-A------AAC---TAC-TTAC-TTCTTT
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blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      TGA       C . .  G  .   A     . .     .   C C .    TT    .    GT  .    A           . . AA      A  .    .      T  A    .   A  .    .  .    A    .  GG     C      .           A   . C A  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  TA .   G TAA    . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      AGA       . . .  .  .   .     . .     .   . . .    T     .    T   .    .           . . A       .  .    .      .  A    .   A  .    .  .    .    .  GG     .      .           .   . A .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  C  .   . A      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      ACA       . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  GG     .      .           .   . A .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  C  .   . A      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      AA        . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  GG     .      .           .   . T .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  T  .   . T      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      CA        . . .  .  .   .     . .     .   . . .    T     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  AG     .      .           .   . C .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  C  .   . A      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      GA        . . .  .  .   .     . .     .   . . .    T     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  AG     .      .           .   . C .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  T  .   . T      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      AA        . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  C    .   .  .    .  .    .    .  GG     .      .           .   . A .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  T  .   . T      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  C    .   .  .    .  .    .    .  TG     .      .           .   . C .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  A  .   . T      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    A     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  C    .   .  .    .  .    .    .  GT     .      .           .   . C .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  A  .   . T      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    A     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  T    .   .  .    .  .    .    .  GC     .      .           .   . C .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  A  .   . T      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    T     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  G    .   .  .    .  .    .    .  GG     .      .           .   . A .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  A  .   . T      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    T     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  GG     .      .           .   . C .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  A  .   . A      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    T     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  C    .   .  .    .  .    .    .  TG     .      .           .   . T .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  A  .   . T      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    T     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . A .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  C  .   . T      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . T .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  T  .   . A      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . C .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  C  .   . T      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . T .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  A  .   . A      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . . .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  T  .   . A      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . . .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  C  .   . A      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    T     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . . .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  T  .   . A      . . .        .     .    .
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . T       .  .    .      .  C    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . . .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  C  .   . T      . . .        .     .     
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    C     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . . .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  T  .   . A      . . .        .           
blockSeqs                     :          .    .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    T     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  T    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . . .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  T  .   . .      . . .        .           
blockSeqs                     :               .           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    .     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  A    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . . .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  T  .   . .                               
blockSeqs                     :                           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    .     .    .   .    .           . . A       .  .    .      .  G    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . . .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .    .  .  .                                     
blockSeqs                     :                           .   . . .  .      A         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    .     .    .   .    .           . . .       .  .    .      .  .    .   .  .    .  .    .    .  G      .      .           .   . . .  . .    .  .  .    .  .   . .  .   .  .  .   .                                                
blockSeqs                     :                                 . .  .      .         . . .  .  .   .     . .     .   . . .    .     .    .   .    .           . . .       .  .    .      .  .    .   .  .    .  .    .    .  .      .      .           .   . . .  . .    .  .  .    .  .   .                                                                   
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gi|74452                      :                                                                                                                                         -TT--G--C-A------A--T---TA-T-C--C--TTA--T---TTG---A--CTT-G--C-AAG------G--------ATTT--GA-G-TT-C--CAAG--T-GA--AAT-CA-TCA-A-GA-TTT---------G--TTC-AG-TT-AACGT----ATA-GAA------AAT-TGTAC-CTAC-ATCTT