lowQualScore : 222222222222222222
lowQualScore : 1 22 222 22 1 222222222222222222 1 1 55 777777 8888 3 33 1 1 1 1 222 2 1 2 555555 1 1 1 2 1 1 3 1 1
lowQualScore : . .. ... .. . .................. . . .. ...... .... . .. . . . . ... . . . ...... . . . . . . . . .
lowQualScore : 7 33 999 33 7 666666666666666666 6 6 44 888888 3333 1 55 5 5 5 5 555 9 4 8 333333 4 4 4 8 4 4 6 4 4
consensus : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-AA-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
Reference ( gi|72718 ) : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-AA-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72721 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---ACAAACGT--TTG-A-TAA--T--A---TT-T--T-TTT-CAATT-CC-A-AA-TG---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72724 : ATTTT-CAT--CCTGACA---ATT-GA-C---AA---CC----GT--TTG-A-TAA--T--A---AT-C--T-TT--CAATT-CC-A-AA-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTTA-C-ACCT
gi|72719 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GC--TTG-A-TA---T------TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-AA-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72722 : ATTTT-ATT--TCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TCG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-AA-TA---AATTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72720 : ACTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTT-AA---GC-----T--TTG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-AA-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72723 : ATTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTC-AA---GC-----T--TTG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-AA-TA---T-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-G-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72727 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AA----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A----------TGCAA-----A-A------TA-TGAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72725 : ATTTTATAT--TCCGACA---ATT-AA-TCT-AA---GT-----T--TTG-A-TAA--T--A---TT-T--T-TTTTCAATT-CC-A-AA-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-A-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72729 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATTTAA-T---AA---AC----GT--TTGGA-TAAC-T--A---TT-C--T-TT-----------------A---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACG-AA-C-ACCT
gi|72726 : ATTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTT-AA---GC-----T--TTA-A-TA---T------TT-C--T-TT--CAATT-TC-A-AA-TA---A-TTTCTT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAT-T-ACCT
gi|72730 : ATTTT-CAT--TCCTACA---ATT-GA-T---AA---AC----G---TTG-A-AGA--T--A---TT-C--T-T----AATT-CC-A-AA-T----A-TTTCAT-TCTTGCA------TA-TTAGCGC-AA-T-C-A-GT-A-C-ACCT
gi|72728 : ATTTT-TAT--CCCGACA---CTT-AG-TTT-AA---GC-----T--TTG-A-TGA--T--A---TT-TCTT-TT--CAATG-CC-A-AA-TA---A-TTTCAG-TCATT-A------TATTTAGC-C-AA-TAC-ACGCAA-C-ACCT
gi|72733 : ATTTC-AAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----G-----------------------------TT--CAATT-CCAA-AA-TA---A---TCAT-TCTTG-AG-----TA-TTAGC-C-AAGT-C-A-GTAA-C-ACCT
gi|72732 : ATTTT-CAT--CCCAACA---ATT-AA-T-----------------------------T--A---TTTC--T-TT--CAATT-T------------------AT-TCTTG-A------TA-T-AGC-C-AG-T-T-ACGTAA-C-ACCT
gi|72731 : ATTTT-CAT--CCCAACC---ATT-AACT---AA---AG----CT--TTG-A-TAT--T------TT-C--T-TT------------------------TCCAT-CCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-AGGCAC-C-AC
gi|72734 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-A-----------------GT--T-------A--T------TT-C--C-TT--TAATT-C------------------AT-TCTTG-A------TA-A-AGC-C-AA-T-C-ATGCAA-C-ACC
gi|72735 : TTTC-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--C-ATT-CC-A-AA-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGT-C-AA-T-C-ACGTAA-C-
gi|72736 : TTTT-CAT--CCCAACA---AGT-AA-T---AA---AT----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-TA-T-TC--CCATT-CC-T-AA-TA---A-TTTCAT-TCTTG-ATACTAGTA-TTAGC-C-AA-T-T-ACGCAA-A-ACCT
gi|72737 : TTTT-CAT--CTCGGCA---ACC-AA-TTC-AA---TT----AA--TTA-A-TAA--T--A---TT-T--TGTT--CAATT-CC-A-AA-TC---A-CCCCAT-TCTTG-A------TT-TTGGT-A-AA-T-
gi|72738 : TTG-CAC--CCCTACC---ATC-AA-T---TA---AA----GC--TTT-A-TTA--TTTA---TT----T-TT--CAATT-CC-A-AA-TA---A-TTTCAC-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGAAA-C-ACCT
gi|72739 : TTT-CATAGTCCGACA---ATT-AA-T---AATGCAT----GTATTTG-A-TAA--T--G---TTTC--T-TT--CAATT-AC-A-AAATA---AATTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-TAACGCAATC-AC
gi|72740 : TCT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTC-AA---GG----CT--TTG-AATAAA-T--AAATTT-C--T-CT--CAATT-CC-A-AA-TATTAA-TTTCTG-TCTTG-A------TA--TAGC-C-AAGT-C-ACGCAA-CAACCT
gi|72741 : TTT-TGT--TTCGTCA---ATT-GA-TTCCAA---CT----CT--TTT-A-TAAAAT--AC--TT-C--T-TT--CAATT-CA-A-AA-TA---G-TTTCAC-TCTTA-A------TT-CTGGT-C-AA-T-C-ACACAA-C-ATCT
gi|72742 : --CCCGACATAAATT-GA-T---TA---A-----GC--TTG-A-TAA--T--A---TT-G--TCTT--CAATTTCC-A-TA-CT---A-TTTTATCTCTTG-A------TA-TTAGC-CGAA-T-C-AAGGCA-C-AC
gi|72743 : --TTG-A-TAA------------C--G-TT--CAATT-TC-A-AA-TT---A-ATTCAT-ACTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T---ACGTAA-C-TCCT
gi|72744 : ---TT-C--T-TT--CAAT---C-ATAA-TA---A-TTTCAT-TCTTGAA------TA-TTGAC-C-AA-T-C-ACACAA-C-
gi|72745 : t--CAATT-CC-A-AA-TA---A-TTTCAT-TCTTA-A------TA-TTAAG-C-AA-T-C-ACTCAA-C-ACCT
gi|72746 : ---A-TTTCAT-TCTTG-G------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-T-ATCT
gi|72747 : T-TCTTG-A------TA-TTAGT-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111
lowQualScore : 1 22 222 1 1 888888888888888 22 1 1 55 777777 7777 3 33 1 1 1 1 1 222 2 1 2 555555 1 1 1 2 1 1 1 1
lowQualScore : . .. ... . . ............... .. . . .. ...... .... . .. . . . . . ... . . . ...... . . . . . . . .
lowQualScore : 7 22 888 6 6 666666666666666 11 5 5 22 222222 6666 0 44 4 4 4 4 4 444 8 3 7 222222 3 3 3 7 3 4 4 4
consensus : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
Reference ( family-555 ) : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72718 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72719 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GC--TTG-A-TA---T------TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72720 : ACTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTT-AA---GC-----T--TTG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72721 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---ACAAACGT--TTG-A-TAA--T--A---TT-T--T-TTT-CAATT-CC-A-A-A-TG---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72722 : ATTTT-ATT--TCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TCG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---AATTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72723 : ATTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTC-AA---GC-----T--TTG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---T-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-G-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72724 : ATTTT-CAT--CCTGACA---ATT-GA-C---AA---CC----GT--TTG-A-TAA--T--A---AT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTTA-C-ACCT
gi|72725 : ATTTTATAT--TCCGACA---ATT-AA-TCT-AA---GT-----T--TTG-A-TAA--T--A---TT-T--T-TTTTCAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-A-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72726 : ATTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTT-AA---GC-----T--TTA-A-TA---T------TT-C--T-TT--CAATT-TC-A-A-A-TA---A-TTTCTT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAT-T-ACCT
gi|72727 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AA----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-ATG-CA---A------------A-A------TA-TGAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72728 : ATTTT-TAT--CCCGACA---CTT-AG-TTT-AA---GC-----T--TTG-A-TGA--T--A---TT-TCTT-TT--CAATG-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAG-TCATT-A------TATTTAGC-C-AA-TAC-ACGCAA-C-ACCT
gi|72729 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATTTAA-T---AA---AC----GT--TTGGA-TAAC-T--A---TT-C--T-TT------------------A---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACG-AA-C-ACCT
gi|72730 : ATTTT-CAT--TCCTACA---ATT-GA-T---AA---AC----G---TTG-A-AGA--T--A---TT-C--T-T----AATT-CC-A-A-A-T----A-TTTCAT-TCTTGCA------TA-TTAGCGC-AA-T-C-A-GT-A-C-ACCT
gi|72731 : ATTTT-CAT--CCCAACC---ATT-AACT---AA---AG----CT--TTG-A-TAT--T------TT-C--T-TT-------------------------TCCAT-CCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-AGGCAC-C-AC
gi|72732 : ATTTT-CAT--CCCAACA---ATT-AA-T-----------------------------T--A---TTTC--T-TT--CAATT-T-------------------AT-TCTTG-A------TA-T-AGC-C-AG-T-T-ACGTAA-C-ACCT
gi|72733 : ATTTC-AAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--T-----------------------------CAATT-CCAA-A-A-TA---A---TCAT-TCTTG-AG-----TA-TTAGC-C-AAGT-C-A-GTAA-C-ACCT
gi|72734 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-A-----------------GT--T-------A--T------TT-C--C-TT--TAATT-C-------------------AT-TCTTG-A------TA-A-AGC-C-AA-T-C-ATGCAA-C-ACC
gi|72735 : TTTC-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--C-ATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGT-C-AA-T-C-ACGTAA-C-
gi|72736 : TTTT-CAT--CCCAACA---AGT-AA-T---AA---AT----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-TA-T-TC--CCATT-CC-T-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-ATACTAGTA-TTAGC-C-AA-T-T-ACGCAA-A-ACCT
gi|72737 : TTTT-CAT--CTCGGCA---ACC-AA-TTC-AA---TT----AA--TTA-A-TAA--T--A---TT-T--TGTT--CAATT-CC-A-A-A-TC---A-CCCCAT-TCTTG-A------TT-TTGGT-A-AA-T-
gi|72738 : TTG-CAC--CCCTACC---ATC-AA-T---TA---AA----GC--TTT-A-TTA--TTTA---TT----T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAC-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGAAA-C-ACCT
gi|72739 : TTT-CATAGTCCGACA---ATT-AA-T---AATGCAT----GTATTTG-A-TAA--T--G---TTTC--T-TT--CAATT-AC-A-A-AATA---AATTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-TAACGCAATC-AC
gi|72740 : TCT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTC-AA---GG----CT--TTG-AATAAA-T--AAATTT-C--T-CT--CAATT-CC-A-A-A-TATTAA-TTTCTG-TCTTG-A------TA-T-AGC-C-AAGT-C-ACGCAA-CAACCT
gi|72741 : TTT-TGT--TTCGTCA---ATT-GA-TTCCAA---CT----CT--TTT-A-TAAAAT--AC--TT-C--T-TT--CAATT-CA-A-A-A-TA---G-TTTCAC-TCTTA-A------TT-CTGGT-C-AA-T-C-ACACAA-C-ATCT
gi|72742 : --CCCGACATAAATT-GA-T---TA---A-----GC--TTG-A-TAA--T--A---TT-G--TCTT--CAATTTCC-A-T-A-CT---A-TTTTATCTCTTG-A------TA-TTAGC-CGAA-T-C-AAGGCA-C-AC
gi|72743 : --TTG-A-TAA------------C--G-TT--CAATT-TC-A-A-A-TT---A-ATTCAT-ACTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T---ACGTAA-C-TCCT
gi|72744 : ---TT-C--T-TT--CAAT---C-ATA-A-TA---A-TTTCAT-TCTTGAA------TA-TTGAC-C-AA-T-C-ACACAA-C-
gi|72745 : t--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTA-A------TA-TTAAG-C-AA-T-C-ACTCAA-C-ACCT
gi|72746 : ---A-TTTCAT-TCTTG-G------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-T-ATCT
gi|72747 : T-TCTTG-A------TA-TTAGT-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111
lowQualScore : 1 22 222 1 1 888888888888888 22 1 1 55 777777 7777 3 33 1 1 1 1 1 222 2 1 2 555555 1 1 1 2 1 1 1 1
lowQualScore : . .. ... . . ............... .. . . .. ...... .... . .. . . . . . ... . . . ...... . . . . . . . .
lowQualScore : 7 22 888 6 6 666666666666666 11 5 5 22 222222 6666 0 44 4 4 4 4 4 444 8 3 7 222222 3 3 3 7 3 4 4 4
consensus : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
Reference ( family-555 ) : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72718 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72719 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GC--TTG-A-TA---T------TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72720 : ACTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTT-AA---GC-----T--TTG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72721 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---ACAAACGT--TTG-A-TAA--T--A---TT-T--T-TTT-CAATT-CC-A-A-A-TG---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72722 : ATTTT-ATT--TCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TCG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---AATTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72723 : ATTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTC-AA---GC-----T--TTG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---T-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-G-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72724 : ATTTT-CAT--CCTGACA---ATT-GA-C---AA---CC----GT--TTG-A-TAA--T--A---AT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTTA-C-ACCT
gi|72725 : ATTTTATAT--TCCGACA---ATT-AA-TCT-AA---GT-----T--TTG-A-TAA--T--A---TT-T--T-TTTTCAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-A-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72726 : ATTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTT-AA---GC-----T--TTA-A-TA---T------TT-C--T-TT--CAATT-TC-A-A-A-TA---A-TTTCTT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAT-T-ACCT
gi|72727 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AA----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-ATG-CA---A------------A-A------TA-TGAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72728 : ATTTT-TAT--CCCGACA---CTT-AG-TTT-AA---GC-----T--TTG-A-TGA--T--A---TT-TCTT-TT--CAATG-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAG-TCATT-A------TATTTAGC-C-AA-TAC-ACGCAA-C-ACCT
gi|72729 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATTTAA-T---AA---AC----GT--TTGGA-TAAC-T--A---TT-C--T-TT------------------A---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACG-AA-C-ACCT
gi|72730 : ATTTT-CAT--TCCTACA---ATT-GA-T---AA---AC----G---TTG-A-AGA--T--A---TT-C--T-T----AATT-CC-A-A-A-T----A-TTTCAT-TCTTGCA------TA-TTAGCGC-AA-T-C-A-GT-A-C-ACCT
gi|72731 : ATTTT-CAT--CCCAACC---ATT-AACT---AA---AG----CT--TTG-A-TAT--T------TT-C--T-TT-------------------------TCCAT-CCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-AGGCAC-C-AC
gi|72732 : ATTTT-CAT--CCCAACA---ATT-AA-T-----------------------------T--A---TTTC--T-TT--CAATT-T-------------------AT-TCTTG-A------TA-T-AGC-C-AG-T-T-ACGTAA-C-ACCT
gi|72733 : ATTTC-AAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--T-----------------------------CAATT-CCAA-A-A-TA---A---TCAT-TCTTG-AG-----TA-TTAGC-C-AAGT-C-A-GTAA-C-ACCT
gi|72734 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-A-----------------GT--T-------A--T------TT-C--C-TT--TAATT-C-------------------AT-TCTTG-A------TA-A-AGC-C-AA-T-C-ATGCAA-C-ACC
gi|72735 : TTTC-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--C-ATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGT-C-AA-T-C-ACGTAA-C-
gi|72736 : TTTT-CAT--CCCAACA---AGT-AA-T---AA---AT----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-TA-T-TC--CCATT-CC-T-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-ATACTAGTA-TTAGC-C-AA-T-T-ACGCAA-A-ACCT
gi|72737 : TTTT-CAT--CTCGGCA---ACC-AA-TTC-AA---TT----AA--TTA-A-TAA--T--A---TT-T--TGTT--CAATT-CC-A-A-A-TC---A-CCCCAT-TCTTG-A------TT-TTGGT-A-AA-T-
gi|72738 : TTG-CAC--CCCTACC---ATC-AA-T---TA---AA----GC--TTT-A-TTA--TTTA---TT----T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAC-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGAAA-C-ACCT
gi|72739 : TTT-CATAGTCCGACA---ATT-AA-T---AATGCAT----GTATTTG-A-TAA--T--G---TTTC--T-TT--CAATT-AC-A-A-AATA---AATTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-TAACGCAATC-AC
gi|72740 : TCT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTC-AA---GG----CT--TTG-AATAAA-T--AAATTT-C--T-CT--CAATT-CC-A-A-A-TATTAA-TTTCTG-TCTTG-A------TA-T-AGC-C-AAGT-C-ACGCAA-CAACCT
gi|72741 : TTT-TGT--TTCGTCA---ATT-GA-TTCCAA---CT----CT--TTT-A-TAAAAT--AC--TT-C--T-TT--CAATT-CA-A-A-A-TA---G-TTTCAC-TCTTA-A------TT-CTGGT-C-AA-T-C-ACACAA-C-ATCT
gi|72742 : --CCCGACATAAATT-GA-T---TA---A-----GC--TTG-A-TAA--T--A---TT-G--TCTT--CAATTTCC-A-T-A-CT---A-TTTTATCTCTTG-A------TA-TTAGC-CGAA-T-C-AAGGCA-C-AC
gi|72743 : --TTG-A-TAA------------C--G-TT--CAATT-TC-A-A-A-TT---A-ATTCAT-ACTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T---ACGTAA-C-TCCT
gi|72744 : ---TT-C--T-TT--CAAT---C-ATA-A-TA---A-TTTCAT-TCTTGAA------TA-TTGAC-C-AA-T-C-ACACAA-C-
gi|72745 : t--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTA-A------TA-TTAAG-C-AA-T-C-ACTCAA-C-ACCT
gi|72746 : ---A-TTTCAT-TCTTG-G------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-T-ATCT
gi|72747 : T-TCTTG-A------TA-TTAGT-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
blockSeqs : A AG TAA T C AAACAAACG AT G A AA AAAT TCT G TT T A T T A TTA A C C TACTAG T G G G A A T A
blockSeqs : . . . . . AATGCATG . . . C TTA TC C T . . . . . . A . A G . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TCCAACTC . . . A AC TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCAATTA . . . . A TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCAAGGC . . . . A TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTAAGC . . . . A TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCAAGC . . . . A TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CTAAGT . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTAAGC . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTAAGC . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAACG . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAACG . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AACCG . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAAAG . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAACG . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAACG . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAAGC . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAACG . . . . G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAACG . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAATG . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TAAAG . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TAAG . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
finalCons : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111
lowQualScore : 1 22 222 1 1 888888888888888 22 1 1 55 777777 7777 3 33 1 1 1 1 1 222 2 1 2 555555 1 1 1 2 1 1 1 1
lowQualScore : . .. ... . . ............... .. . . .. ...... .... . .. . . . . . ... . . . ...... . . . . . . . .
lowQualScore : 7 22 888 6 6 666666666666666 11 5 5 22 222222 6666 0 44 4 4 4 4 4 444 8 3 7 222222 3 3 3 7 3 4 4 4
consensus : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
Reference ( family-555 ) : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72718 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72719 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GC--TTG-A-TA---T------TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72720 : ACTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTT-AA---GC-----T--TTG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72721 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---ACAAACGT--TTG-A-TAA--T--A---TT-T--T-TTT-CAATT-CC-A-A-A-TG---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72722 : ATTTT-ATT--TCCGACA---ATT-AA-T---AA---AC----GT--TCG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---AATTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72723 : ATTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTC-AA---GC-----T--TTG-A-TAA--T--A---TTTC--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---T-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-G-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72724 : ATTTT-CAT--CCTGACA---ATT-GA-C---AA---CC----GT--TTG-A-TAA--T--A---AT-C--T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGTTA-C-ACCT
gi|72725 : ATTTTATAT--TCCGACA---ATT-AA-TCT-AA---GT-----T--TTG-A-TAA--T--A---TT-T--T-TTTTCAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-A-C-ACGCAA-C-ACCT
gi|72726 : ATTTT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTT-AA---GC-----T--TTA-A-TA---T------TT-C--T-TT--CAATT-TC-A-A-A-TA---A-TTTCTT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAT-T-ACCT
gi|72727 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AA----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--CAATT-CC-A-ATG-CA---A------------A-A------TA-TGAGC-C-AA-T-C-ACGTAA-C-ACCT
gi|72728 : ATTTT-TAT--CCCGACA---CTT-AG-TTT-AA---GC-----T--TTG-A-TGA--T--A---TT-TCTT-TT--CAATG-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAG-TCATT-A------TATTTAGC-C-AA-TAC-ACGCAA-C-ACCT
gi|72729 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATTTAA-T---AA---AC----GT--TTGGA-TAAC-T--A---TT-C--T-TT------------------A---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACG-AA-C-ACCT
gi|72730 : ATTTT-CAT--TCCTACA---ATT-GA-T---AA---AC----G---TTG-A-AGA--T--A---TT-C--T-T----AATT-CC-A-A-A-T----A-TTTCAT-TCTTGCA------TA-TTAGCGC-AA-T-C-A-GT-A-C-ACCT
gi|72731 : ATTTT-CAT--CCCAACC---ATT-AACT---AA---AG----CT--TTG-A-TAT--T------TT-C--T-TT-------------------------TCCAT-CCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-AGGCAC-C-AC
gi|72732 : ATTTT-CAT--CCCAACA---ATT-AA-T-----------------------------T--A---TTTC--T-TT--CAATT-T-------------------AT-TCTTG-A------TA-T-AGC-C-AG-T-T-ACGTAA-C-ACCT
gi|72733 : ATTTC-AAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--T-----------------------------CAATT-CCAA-A-A-TA---A---TCAT-TCTTG-AG-----TA-TTAGC-C-AAGT-C-A-GTAA-C-ACCT
gi|72734 : ATTTT-CAT--CCCGACA---ATT-A-----------------GT--T-------A--T------TT-C--C-TT--TAATT-C-------------------AT-TCTTG-A------TA-A-AGC-C-AA-T-C-ATGCAA-C-ACC
gi|72735 : TTTC-CAT--CCCGACA---ATT-GA-T---AA---AC----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-C--T-TT--C-ATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGT-C-AA-T-C-ACGTAA-C-
gi|72736 : TTTT-CAT--CCCAACA---AGT-AA-T---AA---AT----GT--TTG-A-TAA--T--A---TT-TA-T-TC--CCATT-CC-T-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTG-ATACTAGTA-TTAGC-C-AA-T-T-ACGCAA-A-ACCT
gi|72737 : TTTT-CAT--CTCGGCA---ACC-AA-TTC-AA---TT----AA--TTA-A-TAA--T--A---TT-T--TGTT--CAATT-CC-A-A-A-TC---A-CCCCAT-TCTTG-A------TT-TTGGT-A-AA-T-
gi|72738 : TTG-CAC--CCCTACC---ATC-AA-T---TA---AA----GC--TTT-A-TTA--TTTA---TT----T-TT--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAC-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGAAA-C-ACCT
gi|72739 : TTT-CATAGTCCGACA---ATT-AA-T---AATGCAT----GTATTTG-A-TAA--T--G---TTTC--T-TT--CAATT-AC-A-A-AATA---AATTTCAT-TCTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T-TAACGCAATC-AC
gi|72740 : TCT-TAT--CCCGACA---ATT-AA-TTC-AA---GG----CT--TTG-AATAAA-T--AAATTT-C--T-CT--CAATT-CC-A-A-A-TATTAA-TTTCTG-TCTTG-A------TA-T-AGC-C-AAGT-C-ACGCAA-CAACCT
gi|72741 : TTT-TGT--TTCGTCA---ATT-GA-TTCCAA---CT----CT--TTT-A-TAAAAT--AC--TT-C--T-TT--CAATT-CA-A-A-A-TA---G-TTTCAC-TCTTA-A------TT-CTGGT-C-AA-T-C-ACACAA-C-ATCT
gi|72742 : --CCCGACATAAATT-GA-T---TA---A-----GC--TTG-A-TAA--T--A---TT-G--TCTT--CAATTTCC-A-T-A-CT---A-TTTTATCTCTTG-A------TA-TTAGC-CGAA-T-C-AAGGCA-C-AC
gi|72743 : --TTG-A-TAA------------C--G-TT--CAATT-TC-A-A-A-TT---A-ATTCAT-ACTTG-A------TA-TTAGC-C-AA-T---ACGTAA-C-TCCT
gi|72744 : ---TT-C--T-TT--CAAT---C-ATA-A-TA---A-TTTCAT-TCTTGAA------TA-TTGAC-C-AA-T-C-ACACAA-C-
gi|72745 : t--CAATT-CC-A-A-A-TA---A-TTTCAT-TCTTA-A------TA-TTAAG-C-AA-T-C-ACTCAA-C-ACCT
gi|72746 : ---A-TTTCAT-TCTTG-G------TA-TTAGC-C-AA-T-C-ACGCAA-T-ATCT
gi|72747 : T-TCTTG-A------TA-TTAGT-C-AA-T-C-ACGCAA-C-ACCT