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lowQualScore                  :      1     2 2 4    22         777      777777777 22     1 44  1 6666666 99 1 1  666  333333  1         333 1 3 1  1 44444 66 1 77 1   444        1 2 1  0 3 33   33  4444  2   222     222222   2 4 3 4  333 2  2       33     22  999999999   333  55    2 33    77777   33   3333333  2 2   55      4  2     2  2 2 2    666666   111111   2 22 66  22 4   3    44 2 2 22 22 55   7  3333 2  22  2  2 5555    000000 4   2       999999   4 22 2  555555     4  333 22   2 9999999999 22    11 2   2     2  9999999999  0       2  2 333     22   333  666 2 333  33    3 2     
lowQualScore                  :      .     . . .    ..         ...      ......... ..     . ..  . ....... .. . .  ...  ......  .         ... . . .  . ..... .. . .. .   ...        . . .  . . ..   ..  ....  .   ...     ......   . . . .  ... .  .       ..     ..  .........   ...  ..    . ..    .....   ..   .......  . .   ..      .  .     .  . . .    ......   ......   . .. ..  .. .   .    .. . . .. .. ..   .  .... .  ..  .  . ....    ...... .   .       ......   . .. .  ......     .  ... ..   . .......... ..    .. .   .     .  ..........  .       .  . ...     ..   ...  ... . ...  ..    . .     
lowQualScore                  :      9     0 0 0    66         888      444444444 55     8 33  8 2222222 77 9 9  777  444444  9         222 8 6 8  8 55555 88 9 44 9   111        9 4 9  7 1 11   88  7777  2   555     444444   2 4 5 4  999 2  2       22     99  222222222   999  33    2 11    88888   11   4444444  2 2   88      4  2     2  2 2 2    111111   444444   1 99 33  88 0   1    88 0 0 88 88 44   4  8888 0  99  1  1 9999    555555 2   0       888888   0 88 0  888888     0  555 88   0 4444444444 88    55 0   0     0  8888888888  7       0  8 555     88   999  111 2 999  44    9 5     
consensus                     : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAG--TCTCACT---A-C---T--TGACT-G--GG-T-------GGCC-G-AC---TG----C-AA-GTTCAGCTG---G-T-G-AG-T-----T--A-TG-T-CTGG--TGCTGAGG-ACC-CAAACC--TCTC-GT---CGA-ATT-T-CCCCACGN---TTT-C-TCC-AA---G-AC-TGAGGTT--GGGTGA-GAT--AAT-TATCC---AG--TAGC-A--GCGT-----GTA--ATAG------TC-A-CTGG-CGGCTC-CC-TCCGG-AG-A-G-AAGC------AGAA-----GTG-A--TC-AT--G-TTGCTCAT--C-T-T--C--CG-TCCACT-G-TT-GA--CT-GC-GG---GCCA------G-CCT-CACAAAC------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AA--CTTGC-C-TTG-CCATC-AT------A---ATGCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GTCAGAGGAACA
Reference ( gi|96086 )        : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAG--CCTCACT---C-C---T--TGACT-G--GG-T-------G-CC-G-AC---TG----G-AA-GTTCAGCTG---G-T-G-AG-T-----T--A-T--T-CTGT--TGCTGAGG-ATC-CAAAGC--TCTT-GT---GGA-ATT-T-CCCCATAG---TTT-C-TGC-AA---G-AC-TGAGGTT--GGGTGA-GAT--AAT-TATCC---AG--TAGC-A--GCGT-----GTA--ATAA------TC-A-CTGC-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------AGAC-----GTG-A--TA-AT--G-TTGTTCAT--C-T-T--C--CA-TCCGCT-T-TT-GA--CT-GC-GA---GCCA------G-CCT-CACAAAC------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AA--CTTGG-C-TTG-CCATC-AT------A---ATGCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GTCAAAAGAACA
gi|96087                      : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAG--CCTCACT---C-C---T--TGACT-G--GG-T-------G-CC-G-AC---TG------AA-GT-CAGCTG---G-T-G-AG-T-----T--A-T--T-CTGT--TGCTGAGG-ATC-CAAAGC--TCTT-GT---GGA-ATT-T-CCCCATAG---TTT-C-TGC-AA---G-AC-TGAGGTT--GGGTGAAGAT--AAT-TATCC---AG--TAGC-A--GCGT-----GTA--ATAA------TC-A-CTGC-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------A-AC-----GTG-A---A-AT--G-TTGTTCAT--C-T-T--T--CA-TC-GCT-T-TT-GA--CT-GC-GA---GCCA------G-CCT-CACAAAC------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AA--CTTGG-C-TTG-CCATC-AT------A---ATGCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GCGTGTCAAAAGAACA
gi|96088                      : TATGTGCTCTG-C-C-CATT--CCTC--AAG--TCTCAAT---A-C---A--TGACT-G--GG-T-------GGTC-G-AC---TG----C-AA-GTTAAGATG---A-T-G-AG-T-----T--A-TG-C-CTGG--TGCTGTGG-ACC-CAAACC--TCTC-TT---CGA-ATT-T-CCCCA-GG---TTT-C-TCC-AA---G-AC-TGAGGTT--GGGTGA-GAT--C-----TTC---AG--TAGC-A--GCGT-----GTA--ATAG------TA-A-CTGG-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-G-G-AAGC------AGAA-----GTG-A--TC-GT--G-ATGCTCAT--C-T-T--C--CG-TCCACT-G-CT-GA--AT-GC-GG---GATA------A-TCT-CACAAAC------TTC-A--T-CG------AAAAC-GA---T--TCC-C---------CA--CTTGC-T-TTG-CCATC-AT------A---ATGCAGGTCC-TTGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GTCAGAGGAACA
gi|96089                      : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--TTTTCAAAG--TCTCACC---A-C---T--TGACT-A--GG-T-------GGCC-G-AC---AG----C-AA-GTTCAGCTG---G-T-G-AG-T-----T--A-TG-T-CTGA--TGATGGGG-ACT-CAAACC--TCTC-GT---CGA-ATT-T-CTC-AGGA---TTT-C-TAC-AA---G-AC-TGAGGTT--GGGTTG-GGT--GAGATATCC---AG--TAGC-A--ACGTAACGTGTG--A-AA------GC-C-CCCC-C--CCC-CA-CCCCG-AG-A-G-AAGC------AGAA-----GTG-A--TT-AT--G-TT---CAT--C-T-T--C--CG-TCCTTT-T-TT-GA--CT-GC-GG---ACCA------G-CCT-CACAAAC------TTC-A--T-CA------ATAAC-GA---T--TTC-T---------AA--CTTGC-C-TTG-CCATC-AT------A---ATGTAGATCC-TCGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GTCAGAGGAACA
gi|96090                      : TATGCGCTCTA-C-C-CACT--TTTTCAAAG--TCTCAAC---A-C---T--TAACG-G--GT-T-------G-CC-A-AC---TG----G-AA-GTTCAGCTA---G-T-G-AG-T-----T----------TGG--TGCTGAGG-ATC-CAAACC--TCAT-GT---CGA-ACT-T-CCCC--AG---TTT-TATTCAAA---A-AT-TGAGATT--GGGTG--------AT-TATCC---CGT-TAGC-A--GCGTA----GTA--ATA--------------GC---GCT--CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC-------GA------GTG-A--TC-AT--G-TTGCTCAT--C-T-T--T--CC-TCCACTGC-TG-GA--CT-GCTGA---GCCA------GCCCT-CACAAACG-----TTC-ATCT-CG------AGAAC-GA---T--TT-------------A--CTTAT-C-TTG-TCACG-AT------A---AAGCTGGTCT-TTGTATGATCTA--GCT---TTATAA-C---GC--ATCAGAGGGACA
gi|96091                      : TATGTGCTTTG-C-C-CACT--TTTTCAAAG--TCTCACT---A-C---T--TGACT-G--GG-A-------GTCC-G-AC---TG----C-AA-GTTCAGCTT---G-T-G-AG-T-----T--A-TG-T-CTGG--TGCTGAGG-ATA-CAAACC--TCTC-GT---CGA-ATG-T-CCCCAGGT---TTT-C-TCC-AA---G-AC-GGGGG
gi|96092                      : TATGCGCTCTG-C-C-AATG--TTTTCAAAG--TCTCACC---G-T---T--TGACT-----G-T---------------T---TG----G-AA-TTTCAACTG---G-T-G-AG-T-----T--A-TG-T-CTGA--TGTTGAGG-A------------CTT-G------------T-C----TAA---TTT-C-TCC-AA---A-AC-TAAGGTT--GGGT---GAT--A---TCTCC---AG--TAGC-A--GAGC-----GCA--ATAG------TA-A-ATGG-TGGATC-CCATCCAA-AG---C-AAGC------AGAT-----GAG-A--TC-AT--G-TTGCTTAT--T-T-TTGC--CG-TCTACT-G-TT-aggtctggtaaatct
gi|96093                      : TATGTGATCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAG--TCTCACT---A-C---T--TGACT-G--GG-TGGCCATGG-CT-G-AC---TG----C-AA-GTTCAGCTC---G-TCG-AA-T-----T--
gi|96094                      : TACGCGGTCTG-C-C-CAAT--GTCGCAGCG--ACTCGCC---CACA--T--T--CT-GT-GA-A-------G-CT-G-AC---TG----G-AA-GTTGAGCTG---A-T-G-AG-T-----G--A-GA-T-CTGG--CGCAGACG-ACCTCAAA
gi|96095                      :  ATGTTCTCTG-C-C-AACT--CTTTCAGAG--TCTCACT---A-C---T--TGACT-G--GA-T-------GGTC-G-AC---TG----C-AA-GTTTAGCTG---G-T-G-AG-C-----T--AAG--T-CTGG--TGTTGAGG-ACC-CATACC--TCTC-GT---CGA-ATC-A-TCGCACGT---TTT-C-TCC-AA---G-AC-TGAGGTT--GGGTGA-GAT--C-----TCC---AG--TAGC-A--GCGT-----GTA--ATAG------TC-A-CTGG-CGGCTC-CC-TCCGG-AG-A-G-AAGA------ATTA-----GTG-A--TC-AG--G-TTACTCAT--G-T-T--C--CG-TCCACT-G-GT-GA--CT-GT-GG---ACCA------G-CCT-CACAAAG------TTC-A--T-CA------AGAAC-GT---T--TTC-C---------CA--CTTTC-C-TTG-TCATC-TT------C---ATTCAAATCC-TTCT---ATCTA--GAC---TT---A-C---GC--GTCAGAGAAACAc
gi|96096                      :  ATGTTCTCTGGC-C-CACT--CATTCGGAG--TCTCATTAACT-T---T--TGATT-G--G--T-------G-GC-G-AC---TG----C-AA-GTTTAGCTG---C-T-GGAGCT-----T--A-TGTT-CTGA--TGTTCAGG-ATC-CATACC--TCTC-GT---CGA-ATTATATCCCACAT---TTT-C-TTC-AA---G-AC-TGAGGTTGAGGGCGT-GAG--AAT-C-TCC---AG--TAGCAA--GCGT-----GTA--A-AG------TC-A-CTGG-CGGCTC-CC-TCCGG-AGAA-G-AAGC------ATAA-----GTA-A--TC-AT--G-TTGCTCAT--CTT-T--C--CG-TCCACT-GAGT-GAACCT-GT-GG---ACCA------G-CCT-TACAAAG------TTCAA--T-CA------AGAACGGA---T--TGC-C---------CA--CTTGC-C-TTGTTCATC-TT------C---ATTCAAATCC-TTCT---ATCTAGGGAC---TT---A-C---GC--GTCAGAGAAACA
gi|96097                      :  ATGTTCTCTG-TAC-CACT--CTTTCAGAGTCCCTCACT---A-CAG-TAGTGACTCA--GG-T-------GGCC-G-A----TGCCAAG-AA-TTTAAGCTG---G-T-G-AG-C-----T--A-TG-T-CTGG--TGTTGATG-ATC-----------TC-GT---CGA-ATA-T-CGACA-AT---TTT-C-TCC-AA---G-AC-TGAGGTT--GGGTGA-GAT--------TCC---AG--TAGC-A--GCGT-----GTA--ATAG------TC-ACCTG--CGGCTCTCC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------ATAA-----GTG-AATCA-GT--A-ATGCTCAT--C-T-T--C--CG-TCC-CT-G-GT-GA--CT-GG-GA---CGCA------G-CCTACAAAAGT------GTC-A--C-CA------AGAAC-GA---T--TTCTC---------GA--CTTGGCC-TTG-TCATCTTT------C---ATTCAAATCT-TTCT---ATCTA--GCT---TA---A-C---GC--GTCCAGAGAA
gi|96098                      :  ATGT-CTCTG-C-C-CACT--CTT-CAGA---TCTCACT---A-C---T--TTACT-G--G--T-------G-CC-G-A----TG----C-AA-GTTAAGCTG---G-T-G-AG-C-----T----T--G-TTGG--TGTTGAGG-ATC-CATA-C--TCTTCGT---CGA-ATT-A-TCCTACAT---TTT-T-TAC-AA---G-AC-TGAGGTT--GGGTGA-GA-------TCTCC---AG--TAGC-A--GCGT-----GTA--ATAG------TC-A-CTG--CAGCT--CC-TCCGG-AG-A-GAAAGC------ATAA-----GTG-A--TC-AT--GTTTGCTCATA-C-T-T--C--CG-TCCACT-aca
gi|96099                      :  ATGTTCTCTG-C-CGCACTATCTTTCAGAG--TCTCACT---A-C---T--TAACT-G--GG-gt
gi|96100                      :   TGTTCTTTG-C-C-CACT--CTTTCAAAG--CCTCACT---A-C---T--TGACT-G--GG-T-------G-C--G-AC---TG----T-AA-GTTCAGCAG---G-T-G-AG-T-----T--A-TG-T-CTGG--TGCTGCGG-ATC-CAAATC--TCGC-AT---CGA-ATT-T-CCCAAGGA---TTT-C-TCCTAA---G-AC-TGAGGCT--GGGTGA-GAT--AAT-TATCC---AG--TAGA-A--GCGT-----GTA--ATAA------TC-A-CTGA-CG-CTC-CC-TCTAG-AG-A-G-AAGC------AGAA-----GTG-A--TC-AT--G-T-GTTCAT--C-T-T--C--TG-TCCACT-T-TT-GA--CC-GC-GA---GTCA------G-CCT-CACAAAC------TTC-A--T-CA------AGAAT-GA------TTC-C---------AA--CATAC-C-TTG-CCATC-AT------A---ATGCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC----T---A-C---GC--GTCAGAgtgggcgcacatgaaaatt
gi|96101                      :    GTACTTTG-C-C-CACT--ATTTTA--G--TCTCACT---A-C---T--TGACT-C--GG-T-------GGCC-G-AC---TG----C-AG-GTTCAACTG---G-C-G-AG-T-----T--A-T--TTCTGT--TGTTGATG-ATC-CAAACC--TCTA-GT---CGA-ATT-T-CTCCAGGT---TTT-C-TCC-AA---G-AT-TGTGGTT--GGGTGA------AAT-C-TCC---AG--TAGA-A--GTGT-----GCA--ATAG------TA-A-CTGG-TGGATC-TA-TCCAG-AG-A-G-AAGC------AGAA-----GTG-A--TT-AT--G-TTGCTCAT--C-T-T--C--CA-TCCACT-G-GC-GA--CT-GC-G------------------T-C----AC------TTT-A--T-CA------AGAAT-GA---T--TTG-C---------CA--CTTGC-C-TTG-CAATC-AT------A---ATGCAGATCCTTTGT---ATCTA--GCC---GT---A-A---GT--GTTAg
gi|96102                      :     TGCTCTT-T-C-CACT--CTTTCAA-GTTCTTCACT---C-----T--TAACT-G--GG-T-------GGCC-G-AC---AG----C-AA-TTGC-GCTA---GCT-G-AA-T-----T--A-T--T-ATATGGTGCTGAGGGACC-CAAACT--TCTC--C---GAT-GTT-----CCAAAGGATTTT-C-T-C-AAAGGG-AC-TAAGGTT--GGGTGA-GAT------TACCC----GCTTGGC-A--GCGT-----GTA--ATGAG-----TC-A-CTGGGCGGCTC-CC-TTCAG-AG-ACG-AAGC------AGAATTTAAGTG-A--TTTATTGG-TTGTTC-T--G-T-T--C--CG-TCCAAT-T-TT-CA--CCCGC-GG---GCCA------G-CCT-T-CAAACC-----TTCTA--T-CA------AG--CTGA---T--TTC-----------AA--CTTTG-CCTTG-CCATC-AT------A---ATGCTGATTC-TTTT---ATCTA--GCC---TC---T-G---GA--ATCAGAGGAACggga
gi|96103                      :       CTCCG-C-CACACT--CTTCAGAAG--TCTCACT---A-CAAAT--ATACT-GATGG-T-------GGCCAG-AC---TA----GCAA-GTTAAAGTGAAAG-TAG-AG-CAATAATGAA-T--C-CTGA--TGTCG-GG-AAC-CATACC--TCTC-GCCTCGGACAAT-T-ACCTACAA---TTTTC-TAC-AA-----ACATGAGGTT--GGG-GA-GA---AAT-C-TCCAAGAA--TAGC-A--GAAC-----GTA--GTAAATAGAGTCAA-CTGG-CAGCTCGCC-TCCGGAAG-A-A-AAGCACAAATAAAA-----GTGAA--TC-AT--GAATGCTCATCAC-T-T--C--CG-TC
gi|96104                      :           G-T-C-CACT--ACCTTAATG--TCTCACC---G-C---T--AGACT-G--GT-T-------G----G-GCCCTTG----G-AA-ATTCAGCTG---G-T-G-AT-T-----G--A-TA-T-CTGG--CGCCGAAG-ACC-CAAAaact
gi|96105                      :           G-T-C-CACT--ACCTTAATG--TCTCACC---G-C---T--AGACT-G--GT-T-------G----G-GCCCTTG----G-AACATTCAGCTG---G-T-G-CA-T-----TGGA-TA-T-CTGC--GCCGGAAG-ACC-CAAAc
gi|96106                      :            -C-C-CACT--TTCTCAAAG--TCTCACC---A-C---T--TGACT-G--AG-T-------G-GC-GGAC---TG----A-AA-ATTCAGCTG---G-T-G-AG-T-----T--A-TG-T-CTGG--TGCTGAAG-ACC-CAAACC--TCTT-GT---CAA-ATT-T-CC------------------------------AAGGTT--GGGTAA-GAT--C-----TCC---AG--TAAC-A--GAGT-----GTAGTATAG------TC-A-CTGG-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------AGAA-----GTG-A--TC-AT--G-TTGCTCGT--T-T-T--C--CA-TCCACT-G-CT-GA--CT-GC-GA---GCTA------G-CCT-CTCAAAC------TTA-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AAATATTGC-C-TTG-CCATC-AT------A---ACGCAGATCC-ATGC---ATCTA--GCCTGATT---A-C---GC--ATTAGAGGGACAc
gi|96107                      :                    T--CTTTCAG-G--CTCTACT---A-C---T--TGACT-G--GGGT-------GGCC-G--C---TG----C-TA-GTTAAGCTG---G-T-G-AG-T-----TT-A-TG-T-ATGG--TGTCGAGG-ACC-CATCACCGTCTC-GT---CGA-ATT-T-CCCCACGA---TTT-CCTCC-AA---GCAC-C-AGGTT--GGTTG----TCGAAT--ATCC---AG--TAGG-AAAGCGT-----GTA--ATG-------TA-C-CCGG-CGGCTC-C--TCTGG-AG-A-G-AAGC------CGAAA----GTG-A--TC-AT--G-TTGCTCAT--C-T-T--CTCCG-TCCATT-G-GT-GA--CT-GT-AG---AACA------G-CCT-CACAAAC------TTC-A--T-CA--------GAC-GATTGT--TCC-C---------AC--CTTGC-C-TTG-TTATC--T------GTCCATTCA-ATCC-TTCT---TTCTA--GTA---CT---ACC---GC--G
gi|96108                      :                        TTTCAGAG--TCTCACT---A-C---T--TGACT-G--GG-T-------GGTC-T-AC---TG----C-AA-GTTAAGCTG---G-T-G-AG-T-----T--A-TG-T-CTGG--TGCTAAGG-ACC-CATTCC--TCTT-GT---CAA-AAT-T-TTCCACGT---TTT-C-TCC-AA---G-AC-TGAGGTT--GAGTGA-GAT--C-----TCC---AG--TAGC-A--GCGT-----GTA--ATAG------TC-A-CCGG-TGGCTC-CC-TCTAG-AG-A-A-AAGC------AGAA-----GTG-A--TC-AT--G-TTGCTCAT--C-T-T--C--CG-TCCACT-G-GT-GA--CT-GA-GG---ACCA------G-TCT-TACACAC------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------CA--CTTGC-T-TTG-TCATC-TT------C---ATTCAGATCC-TTCT---ATCTA--GAC---TTA--A-C---GC--ATTAGAGAAACAggcggagaaaca
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Reference ( family-553 )      : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-TGGCC------G-AC-T-GC-AA-G---TTCAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GAGG-ACC-CA-AACC-TCTCG--TCGAAT--T-T-CCCCAC-GNTTT-C-TCC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GAT--AAT-TA--TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCGG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--C--CGTCCA-CTG-TT----GA--CT-GC-GGGC------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AA--C-TT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AT-GCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GT-CAGAGGAACA
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gi|96089                      : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--TTTTCAAAGTC--T-CA-CCA---C---T--TGACT-A--GG-TGGCC------G-AC-A-GC-AA-G---TTCAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGATGAT-GGGG-ACT-CA-AACC-TCTCG--TCGAAT--T-T-CTC-AG-GATTT-C-TAC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTTG-GGT--GAGATA--TCC---AG--TAGCA--A--CGTAACGTGT-G--AA--AGCC-CC----CCCCCC-CA-CCCCG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATT-AT--G-T--T---CAT--C-TT--C--CGTCCT-TTT-TT----GA--CT-GC-GGAC------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------ATAAC-GA---T--TTC-T---------AA--C-TT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AT-GTAGATCC-TCGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GT-CAGAGGAACA
gi|96090                      : TATGCGCTCTA-C-C-CACT--TTTTCAAAGTC--T-CA-ACA---C---T--TAAC--G--GG-TTGCC------A-AC-T-GG-AA-G---TTCAGCTA---G-T-G-AG---TT------------TGGTGCT-GAGG-ATC-CA-AACC-TCATG--TCGAAC--T-T-CCCCA--GTTTTAT-TCA-AAA--AT-TGAGATTG--GGTG--------AT-TA--TCC---CGT-TAGCA--G--CGTA----GT-A--AT--AG-C-GCT----------CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC--------G-A-----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--T--CCTCCA-CTG-CTG---GA--CT-GCTGAGC------CA----GCCCT-CACAAA-CG-----TTC-ATCT-CG------AGAAC-GA---T--TT-------------A--C-TT-ATCTTG-TCACG-AT------A---AA-GCTGGTCT-TTGTATGATCTA--GCT---TTATAA-C---GC--AT-CAGAGGGACA
gi|96091                      : TATGTGCTTTG-C-C-CACT--TTTTCAAAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-AGTCC------G-AC-T-GC-AA-G---TTCAGCTT---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GAGG-ATA-CA-AACC-TCTCG--TCGAAT--G-T-CCCCAG-GTTTT-C-TCC-AAG--AC-GGGGG
gi|96092                      : TATGCGCTCTG-C-C-AATG--TTTTCAAAGTC--T-CA-CCG---T---T--TGACT-G--TT-TGG------------------AA-T---TTCAACTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGATGTT-GAGG-A------------CTTG--TCTAA----------------TTT-C-TCC-AAA--AC-TAAGGTTG--GGT---GAT--A---TC--TCC---AG--TAGCA--G--AGC-----GC-A--AT--AGTA-AATGG-TGGATC-CCATCCAA-AG---C-AAGC------AGA-T-----GAG-ATC-AT--G-T--TGCTTAT--T-TTTGC--CGTCTA-CTG-TT----aggtctggtaaatct
gi|96093                      : TATGTGATCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-TGGCCATGGCTG-AC-T-GC-AA-G---TTCAGCTC---G-TCG-AA---TT--
gi|96094                      : TACGCGGTCTG-C-C-CAAT--GTCGCAGCGAC--T-CGCCCA---CA--T--T--CT-G--TG-AAGCT------G-AC-T-GG-AA-G---TTGAGCTG---A-T-G-AG---TG--AG-A---T-CTGGCGCA-GACG-ACCTCA-AAC
gi|96095                      :  ATGTTCTCTG-C-C-AACT--CTTTCAGAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GA-TGGTC------G-AC-T-GC-AA-G---TTTAGCTG---G-T-G-AG---CT--AA-G---T-CTGGTGTT-GAGG-ACC-CA-TACC-TCTCG--TCGAAT--C-A-TCGCAC-GTTTT-C-TCC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GAT--C-------TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCGG-AG-A-G-AAGA------ATT-A-----GTG-ATC-AG--G-T--TACTCAT--G-TT--C--CGTCCA-CTG-GT----GA--CT-GT-GGAC------CA----G-CCT-CACAAA-G------TTC-A--T-CA------AGAAC-GT---T--TTC-C---------CA--C-TT-TCCTTG-TCATC-TT------C---AT-TCAAATCC-TTCT---ATCTA--GAC---TT---A-C---GC--GT-CAGAGAAACA
gi|96096                      :  ATGTTCTCTGGC-C-CACT--CATTCGGAGTC--T-CA-TTAACTT---T--TGATT-G--G--TGGC-------G-AC-T-GC-AA-G---TTTAGCTG---C-T-GGAGC--TT--AT-G---TTCTGATGTT-CAGG-ATC-CA-TACC-TCTCG--TCGAAT--TATATCCCAC-ATTTT-C-TTC-AAG--AC-TGAGGTTGAGGGCGT-GAG--AAT-C---TCC---AG--TAGCAA-G--CGT-----GT-A--A---AGTC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCGG-AGAA-G-AAGC------ATA-A-----GTA-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--CTTT--C--CGTCCA-CTGAGT----GAACCT-GT-GGAC------CA----G-CCT-TACAAA-G------TTCAA--T-CA------AGAACGGA---T--TGC-C---------CA--C-TT-GCCTTGTTCATC-TT------C---AT-TCAAATCC-TTCT---ATCTAGGGAC---TT---A-C---GC--GT-CAGAGAAACA
gi|96097                      :  ATGTTCTCTG-TAC-CACT--CTTTCAGAGTCCCT-CA-CTA---CAG-TAGTGACTCA--GG-TGGCC------G-A--T-GCCAA-GAATTTAAGCTG---G-T-G-AG---CT--AT-G---T-CTGGTGTT-GATG-A-----------TCTCG--TCGAAT--A-T-CGACA--ATTTT-C-TCC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GAT----------TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACCTG-CGGCTCTCC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------ATA-A-----GTGAATC-A---G-TAATGCTCAT--C-TT--C--CGTCC--CTG-GT----GA--CT-G--GGACG-----CA----G-CCTACAAAAG-T------GTC-A--C-CA------AGAAC-GA---T--TTCTC---------GA--C-TTGGCCTTG-TCATCTTT------C---AT-TCAAATCT-TTCT---ATCTA--GCT---TA---A-C---GC--GTCCAGAGAAACA
gi|96098                      :  ATGT-CTCTG-C-C-CACT--CTT-CAGA-TC--T-CA-CTA---C---T--TTACT-G--G--TG-CC------G-A--T-GC-AA-G---TTAAGCTG---G-T-G-AG---CT---T-G---T--TGGTGTT-GAGG-ATC-CA-TACT-CTTCG--TCGAAT--T-A-TCCTAC-ATTTT-T-TAC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GA-------TC--TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACT-G-CAGCT--CC-TCCGG-AG-A-GAAAGC------ATA-A-----GTG-ATC-AT--GTT--TGCTCATA-C-TT--C--CGTCCA-CTG-T
gi|96099                      :  ATGTTCTCTG-C-CGCACTATCTTTCAGAGTC--T-CA-CTA---C---T--TAACTGG--GG-TGGGC------GCACAT-GA-AA-A---TT
gi|96100                      :   TGTTCTTTG-C-C-CACT--CTTTCAAAGCC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-TG--C------G-AC-T-GT-AA-G---TTCAGCAG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GCGG-ATC-CA-AATC-TCGCA--TCGAAT--T-T-CCCAAG-GATTT-C-TCCTAAG--AC-TGAGGCTG--GGTGA-GAT--AAT-TA--TCC---AG--TAGAA--G--CGT-----GT-A--AT--AATC-ACTGA-C-GCTC-CC-TCTAG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G----TGTTCAT--C-TT--C--TGTCCA-CTT-TT----GA--CC-GC-GAGT------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------AGAAT-GA------TTC-C---------AA--C-AT-ACCTTG-CCATC-AT------A---AT-GCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC----T---A-C---GC--GT-CAGAG
gi|96101                      :    GTACTTTG-C-C-CACT--ATTTTA--GTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-C--GG-TGGCC------G-AC-T-GC-AG-G---TTCAACTG---G-C-G-AG---TT--AT-T---T-CTGTTGTT-GATG-ATC-CA-AACC-TCTAG--TCGAAT--T-T-CTCCAG-GTTTT-C-TCC-AAG--AT-TGTGGTTG--GGTGA------AAT-C---TCC---AG--TAGAA--G--TGT-----GC-A--AT--AGTA-ACTGG-TGGATC-TA-TCCAG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATT-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--C--CATCCA-CTG-GC----GA--CT-GC-G-------------------T-C----A-C------TTT-A--T-CA------AGAAT-GA---T--TTG-C---------CA--C-TT-GCCTTG-CAATC-AT------A---AT-GCAGATCCTTTGT---ATCTA--GCC---GT---A-A---GT--GT-TAGGG
gi|96102                      :     TGCTCTT-T-C-CACT--CTTTCAAGTTC--TTCA-CT----C---T--TAACT-G--GG-TGGCC------G-AC-A-GC-AA-T---TGC-GCTA---GCT-G-AA---TT--ATTA---T-ATGGTGCT-GAGGGACC-CA-AACT-TCTC----CGATG--T-T-CCAAAG-GATTTTC-TCA-AAGGGAC-TAAGGTTG--GGTGA-GAT------TA--CCC----GCTTGGCA--G--CGT-----GT-A--ATG-AGTC-ACTGGGCGGCTC-CC-TTCAG-AG-ACG-AAGC------AGA-ATTTAAGTG-ATTTATTGG-T--TGTTC-T--G-TT--C--CGTCCA-ATT-TT----CA--CCCGC-GGGC------CA----G-CCT-T-CAAACC------TTCTA--T-CA------AG--CTGA---T--TT--C---------AA--CTTT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AT-GCTGATTC-TTTT---ATCTA--GCC---TC---T-G---GA--AT-CAGAGGAACa
gi|96103                      :       CTCCG-C-CACACT--CTTCAGAAGTC--T-CA-CTA---CAAAT--ATACT-GATGG-TGGCCA-----G-AC-TAGC-AA-G---TTAAAGTGAAAG-TAG-AGCAATA--AT-GAATC-CTGATGTC-G-GG-AAC-CA-TACC-TCTCGCCTCGGACAAT-T-ACCTACAATTTT-C-TAC-AA---ACATGAGGTTG--GG-GA-GA---AAT-C---TCCAAGAA--TAGCA--GAACGTA----GTAA--ATAGAGTCAACTGG-CAGCTCGCC-TCCGGAAG-A-A-AAGCACAAATAAA-A-----GTGAATC-AT--GAA--TGCTCATCAC-TT--C--CGTCAA-CT
gi|96104                      :           G-T-C-CACT--ACCTTAATGTC--T-CA-CCG---C---T--AGACT-G--GT-TGGGC------C-CT-T-GG-AA-A---TTCAGCTG---G-T-G-AT---TG--AT-A---T-CTGGCGCC-GAAG-ACC-CA-AAC
gi|96105                      :           G-T-C-CACT--ACCTTAATGTC--T-CA-CCG---C---T--AGACT-G--GT-TGGGC------C-CT-T-GG-AACA---TTCAGCTG---G-T-G-CA---TTGGAT-A---T-CT-GCGCCGGAAG-ACC-CA-AAC
gi|96106                      :            -C-C-CACT--TTCTCAAAGTC--T-CA-CCA---C---T--TGACT-G--AG-TGGCG------G-AC-T-GA-AA-A---TTCAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GAAG-ACC-CA-AACC-TCTTG--TCAAAT--T-T-CC--------------------------AAGGTTG--GGTAA-GAT--C-------TCC---AG--TAACA--G--AGT-----GT-AGTAT--AGTC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCGT--T-TT--C--CATCCA-CTG-CT----GA--CT-GC-GAGC------TA----G-CCT-CTCAAA-C------TTA-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AAATA-TT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AC-GCAGATCC-ATGC---ATCTA--GCCTGATT---A-C---GC--AT-TAGAGGGACA
gi|96107                      :                    T--CTTTCAGGCTC--T--A-CTA---C---T--TGACT-G--GGGTGGCC------G--C-T-GC-TA-G---TTAAGCTG---G-T-G-AG---TTT-AT-G---T-ATGGTGTC-GAGG-ACC-CATCACCGTCTCG--TCGAAT--T-T-CCCCAC-GATTT-CCTCC-AAGC-AC-C-AGGTTG--GTTG----TCGAAT--A--TCC---AG--TAGGAAAG--CGT-----GT-A--AT---GTA-CCCGG-CGGCTC-C--TCTGG-AG-A-G-AAGC------CGA-AA----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--CTCCGTCCA-TTG-GT----GA--CT-GT-AGAA------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA--------GAC-GATTGT--TCC-C---------AC--C-TT-GCCTTG-TTATC--T------GTCCAT-TCA-ATCC-TTCT---TTCTA--GTA---CT---ACC---GCG-GG-CGGAGAAACA
gi|96108                      :                        TTTCAGAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-TGGTC------T-AC-T-GC-AA-G---TTAAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-AAGG-ACC-CA-TTCC-TCTTG--TCAAAA--T-T-TTCCAC-GTTTT-C-TCC-AAG--AC-TGAGGTTG--AGTGA-GAT--C-------TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACCGG-TGGCTC-CC-TCTAG-AG-A-A-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--C--CGTCCA-CTG-GT----GA--CT-GA-GGAC------CA----G-TCT-TACACA-C------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------CA--C-TT-GCTTTG-TCATC-TT------C---AT-TCAGATCC-TTCT---ATCTA--GAC---TTA--A-C---GC--AT-TAGAGAAACA
gi|96109                      :                                                                                                   CTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GGGG-ACC-CA-AAGC-TCTCG--TCGAAT--T-A-TCCCAG-GATTT-C-TTC-AAG--AC-TCGGGTTG--GATGA-GAT--AAT-TA--TCC---AG--TAACA--G--CGT-----GT-A--AT--AACC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G-C--TGTTCAT--C-TT--C--CGTCTA-CTT-TT----GA--CT-GC-GAGC------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AA--C-TT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AT-GTAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC---CT---A-C---GC--GT-CAGAGGAACA
gi|96110                      :                                                                                                                                                                --TCAAAT--T-G-TCCCAG-GATCT--------AG--AC-CAGGGAGA--GGCTA-CA---AAC-TAACTCC---AG--CAGGA--A--GGT-----GT-A--AT--AGCC-ACTGG-CAA-TA-TC-TTCTA-AG-G-A-AAG--------GA-A-----TTG-GTT-GT--G-C--TGCTC-T--C-TC-------TCCA-ATA-CA----GA--CT-GC-AGGTTACATGTA----G-TTC-AACAGA-C------T---A--TGCA------AGAAG-GA---T--TTT-C---------CA--C-TG-TACTTA-CCATC-AT------A---CCAGCATTTCC-TT-T---ACCTG--G
gi|96111                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atttcAGC------AGATA-----G---AT---T--G-T--TGTTCAT--C-TT--C--CGTCCAGTTA-TTAGAAGA--CG-AT-TGGA------CATTACGCCCT-CACAAA-CTTATCTTTC-A--T-CACTATCGAAGAT-GA---TTGTTT-CAAGAATAAAAA--C-TT-G-CTTG--CATC-ATAAGGTAA---AT-ACAGATCA-TTGT---GTTTA--G
gi|96112                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T--G-T--TGGTCAT--C-TT--C--TGTGCA-CTG-TT----GA--CT-GC-AGGC------CA----G-CCT-CACAAA-C------T------------------AAT-GA---T--TTC-C---------AG--C-TT-GCCTTT-CCATC-AT------A---AC-ACAGATTT-CGAA---ATCTA--GGT---TT---G-C---
gi|96113                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCTA-CTG-TT----AA--AT-GC-GGGC------CA----G-TCT-CAGAAA-T------TTC-A--T-CA------AAATT-TA---G--TTT-C---------AA--C-TC-ACCTTG-TCATC-AA------A---AT-ACAGATTC-TTGT---ATTTC--GCT---TT---G-C--------T-CAGAG
gi|96114                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -TT----AA--TT-GC-AGAC------CA----G-CCT-CACAAA-G------TTC-A--T-CA------AGAAC-AA---T--TTC-C---------CA--C-TT-GCCTTG-TCATC-TT------C---AT-TCAAATCC-T-------TCTA--GAC---TT---A-A---GC--GT-CAGAGAAACA
gi|96115                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CT-CACAAA-C------T------------------AAT-GA---T--TTC-C---------AG--C-TT-GCCTTT-TCATC-AT------A---AC-ACAGATTT-CTAA---ATCTA--GGT---TT---G-CTATGT--GT-CTGAAGGACA

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lowQualScore                  :      .     . . .    ..           .. .  .   ... ... ..     . ..  .     ...... .  . . ..  . ...        ... . . .  ...  ..  ..... .        .    . . .  ..   .     ..      .. . .     .. .   . . . .   ..  .        ..     .  ...........   ...  ..     .. ..   .....  . ..  ..    .     .      .  .   . .  . . .    ......   . .....   .   .  .. . ..       .. .  .. ..      .   .. ....  ..  .  .    ......  .... .   .      . ......   . .. .  ......     .  ... ..   . .......... .. .  .      .     .  ..........  ..       .  . ...     ..   ...  ... . ...  ..  .          
lowQualScore                  :      2     9 9 8    55           44 7  7   000 222 44     5 44  7     777777 7  7 7 33  7 000        000 7 5 7  888  11  77777 8        8    8 5 8  00   1     88      88 0 0     44 4   0 0 4 0   88  0        99     1  66666666666   777  00     00 99   55555  1 99  00    1     1      2  1   7 1  1 1 1    888888   0 00000   0   0  66 8 66       55 9  66 66      8   11 0000  88  0  0    888888  2222 0   9      9 444444   8 66 9  555555     8  333 66   9 5555555555 66 9  9      9     9  2222222222  11       9  2 333     66   777  888 1 777  33  2          
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Reference ( family-553 )      : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-TGGCC------G-AC-T-GC-AA-G---TTCAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GAGG-ACC-CA-AACC-TCTCG--TCGAAT--T-T-CCCCAC-GNTTT-C-TCC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GAT--AAT-TA--TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCGG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--C--CGTCCA-CTG-TT----GA--CT-GC-GGGC------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AA--C-TT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AT-GCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GT-CAGAGGAACA
gi|96086                      : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAGCC--T-CA-CTC---C---T--TGACT-G--GG-TG-CC------G-AC-T-GG-AA-G---TTCAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-----T-CTGTTGCT-GAGG-ATC-CA-AAGC-TCTTG--TGGAAT--T-T-CCCCAT-AGTTT-C-TGC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GAT--AAT-TA--TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AATC-ACTGC-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------AGA-C-----GTG-ATA-AT--G-T--TGTTCAT--C-TT--C--CATCCG-CTT-TT----GA--CT-GC-GAGC------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AA--C-TT-GGCTTG-CCATC-AT------A---AT-GCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GT-CAAAAGAACA
gi|96087                      : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAGCC--T-CA-CTC---C---T--TGACT-G--GG-TG-CC------G-AC-T-G--AA-G---T-CAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-----T-CTGTTGCT-GAGG-ATC-CA-AAGC-TCTTG--TGGAAT--T-T-CCCCAT-AGTTT-C-TGC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGAAGAT--AAT-TA--TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AATC-ACTGC-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------A-A-C-----GTG-A-A-AT--G-T--TGTTCAT--C-TT--T--CATC-G-CTT-TT----GA--CT-GC-GAGC------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AA--C-TT-GGCTTG-CCATC-AT------A---AT-GCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GCGTGT-CAAAAGAACA
gi|96088                      : TATGTGCTCTG-C-C-CATT--CCTC--AAGTC--T-CA-ATA---C---A--TGACT-G--GG-TGGTC------G-AC-T-GC-AA-G---TTAAGATG---A-T-G-AG---TT--AT-G---C-CTGGTGCT-GTGG-ACC-CA-AACC-TCTCT--TCGAAT--T-T-CCCCA--GGTTT-C-TCC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GAT--C-------TTC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTA-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-G-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-GT--G-A--TGCTCAT--C-TT--C--CGTCCA-CTG-CT----GA--AT-GC-GGGA------TA----A-TCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CG------AAAAC-GA---T--TCC-C---------CA--C-TT-GCTTTG-CCATC-AT------A---AT-GCAGGTCC-TTGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GT-CAGAGGAACA
gi|96089                      : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--TTTTCAAAGTC--T-CA-CCA---C---T--TGACT-A--GG-TGGCC------G-AC-A-GC-AA-G---TTCAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGATGAT-GGGG-ACT-CA-AACC-TCTCG--TCGAAT--T-T-CTC-AG-GATTT-C-TAC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTTG-GGT--GAGATA--TCC---AG--TAGCA--A--CGTAACGTGT-G--AA--AGCC-CC----CCCCCC-CA-CCCCG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATT-AT--G-T--T---CAT--C-TT--C--CGTCCT-TTT-TT----GA--CT-GC-GGAC------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------ATAAC-GA---T--TTC-T---------AA--C-TT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AT-GTAGATCC-TCGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GT-CAGAGGAACA
gi|96090                      : TATGCGCTCTA-C-C-CACT--TTTTCAAAGTC--T-CA-ACA---C---T--TAAC--G--GG-TTGCC------A-AC-T-GG-AA-G---TTCAGCTA---G-T-G-AG---TT------------TGGTGCT-GAGG-ATC-CA-AACC-TCATG--TCGAAC--T-T-CCCCA--GTTTTAT-TCA-AAA--AT-TGAGATTG--GGTG--------AT-TA--TCC---CGT-TAGCA--G--CGTA----GT-A--AT--AG-C-GCT----------CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC--------G-A-----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--T--CCTCCA-CTG-CTG---GA--CT-GCTGAGC------CA----GCCCT-CACAAA-CG-----TTC-ATCT-CG------AGAAC-GA---T--TT-------------A--C-TT-ATCTTG-TCACG-AT------A---AA-GCTGGTCT-TTGTATGATCTA--GCT---TTATAA-C---GC--AT-CAGAGGGACA
gi|96091                      : TATGTGCTTTG-C-C-CACT--TTTTCAAAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-AGTCC------G-AC-T-GC-AA-G---TTCAGCTT---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GAGG-ATA-CA-AACC-TCTCG--TCGAAT--G-T-CCCCAG-GTTTT-C-TCC-AAG--AC-GGGGG
gi|96092                      : TATGCGCTCTG-C-C-AATG--TTTTCAAAGTC--T-CA-CCG---T---T--TGACT-G--TT-TGG------------------AA-T---TTCAACTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGATGTT-GAGG-A------------CTTG--TCTAA----------------TTT-C-TCC-AAA--AC-TAAGGTTG--GGT---GAT--A---TC--TCC---AG--TAGCA--G--AGC-----GC-A--AT--AGTA-AATGG-TGGATC-CCATCCAA-AG---C-AAGC------AGA-T-----GAG-ATC-AT--G-T--TGCTTAT--T-TTTGC--CGTCTA-CTG-TT----aggtctggtaaatct
gi|96093                      : TATGTGATCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-TGGCCATGGCTG-AC-T-GC-AA-G---TTCAGCTC---G-TCG-AA---TT--
gi|96094                      : TACGCGGTCTG-C-C-CAAT--GTCGCAGCGAC--T-CGCCCA---CA--T--T--CT-G--TG-AAGCT------G-AC-T-GG-AA-G---TTGAGCTG---A-T-G-AG---TG--AG-A---T-CTGGCGCA-GACG-ACCTCA-AAC
gi|96095                      :  ATGTTCTCTG-C-C-AACT--CTTTCAGAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GA-TGGTC------G-AC-T-GC-AA-G---TTTAGCTG---G-T-G-AG---CT--AA-G---T-CTGGTGTT-GAGG-ACC-CA-TACC-TCTCG--TCGAAT--C-A-TCGCAC-GTTTT-C-TCC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GAT--C-------TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCGG-AG-A-G-AAGA------ATT-A-----GTG-ATC-AG--G-T--TACTCAT--G-TT--C--CGTCCA-CTG-GT----GA--CT-GT-GGAC------CA----G-CCT-CACAAA-G------TTC-A--T-CA------AGAAC-GT---T--TTC-C---------CA--C-TT-TCCTTG-TCATC-TT------C---AT-TCAAATCC-TTCT---ATCTA--GAC---TT---A-C---GC--GT-CAGAGAAACA
gi|96096                      :  ATGTTCTCTGGC-C-CACT--CATTCGGAGTC--T-CA-TTAACTT---T--TGATT-G--G--TGGC-------G-AC-T-GC-AA-G---TTTAGCTG---C-T-GGAGC--TT--AT-G---TTCTGATGTT-CAGG-ATC-CA-TACC-TCTCG--TCGAAT--TATATCCCAC-ATTTT-C-TTC-AAG--AC-TGAGGTTGAGGGCGT-GAG--AAT-C---TCC---AG--TAGCAA-G--CGT-----GT-A--A---AGTC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCGG-AGAA-G-AAGC------ATA-A-----GTA-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--CTTT--C--CGTCCA-CTGAGT----GAACCT-GT-GGAC------CA----G-CCT-TACAAA-G------TTCAA--T-CA------AGAACGGA---T--TGC-C---------CA--C-TT-GCCTTGTTCATC-TT------C---AT-TCAAATCC-TTCT---ATCTAGGGAC---TT---A-C---GC--GT-CAGAGAAACA
gi|96097                      :  ATGTTCTCTG-TAC-CACT--CTTTCAGAGTCCCT-CA-CTA---CAG-TAGTGACTCA--GG-TGGCC------G-A--T-GCCAA-GAATTTAAGCTG---G-T-G-AG---CT--AT-G---T-CTGGTGTT-GATG-A-----------TCTCG--TCGAAT--A-T-CGACA--ATTTT-C-TCC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GAT----------TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACCTG-CGGCTCTCC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------ATA-A-----GTGAATC-A---G-TAATGCTCAT--C-TT--C--CGTCC--CTG-GT----GA--CT-G--GGACG-----CA----G-CCTACAAAAG-T------GTC-A--C-CA------AGAAC-GA---T--TTCTC---------GA--C-TTGGCCTTG-TCATCTTT------C---AT-TCAAATCT-TTCT---ATCTA--GCT---TA---A-C---GC--GTCCAGAGAAACA
gi|96098                      :  ATGT-CTCTG-C-C-CACT--CTT-CAGA-TC--T-CA-CTA---C---T--TTACT-G--G--TG-CC------G-A--T-GC-AA-G---TTAAGCTG---G-T-G-AG---CT---T-G---T--TGGTGTT-GAGG-ATC-CA-TACT-CTTCG--TCGAAT--T-A-TCCTAC-ATTTT-T-TAC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GA-------TC--TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACT-G-CAGCT--CC-TCCGG-AG-A-GAAAGC------ATA-A-----GTG-ATC-AT--GTT--TGCTCATA-C-TT--C--CGTCCA-CTG-T
gi|96099                      :  ATGTTCTCTG-C-CGCACTATCTTTCAGAGTC--T-CA-CTA---C---T--TAACTGG--GG-TGGGC------GCACAT-GA-AA-A---TT
gi|96100                      :   TGTTCTTTG-C-C-CACT--CTTTCAAAGCC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-TG--C------G-AC-T-GT-AA-G---TTCAGCAG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GCGG-ATC-CA-AATC-TCGCA--TCGAAT--T-T-CCCAAG-GATTT-C-TCCTAAG--AC-TGAGGCTG--GGTGA-GAT--AAT-TA--TCC---AG--TAGAA--G--CGT-----GT-A--AT--AATC-ACTGA-C-GCTC-CC-TCTAG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G----TGTTCAT--C-TT--C--TGTCCA-CTT-TT----GA--CC-GC-GAGT------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------AGAAT-GA------TTC-C---------AA--C-AT-ACCTTG-CCATC-AT------A---AT-GCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC----T---A-C---GC--GT-CAGAG
gi|96101                      :    GTACTTTG-C-C-CACT--ATTTTA--GTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-C--GG-TGGCC------G-AC-T-GC-AG-G---TTCAACTG---G-C-G-AG---TT--AT-T---T-CTGTTGTT-GATG-ATC-CA-AACC-TCTAG--TCGAAT--T-T-CTCCAG-GTTTT-C-TCC-AAG--AT-TGTGGTTG--GGTGA------AAT-C---TCC---AG--TAGAA--G--TGT-----GC-A--AT--AGTA-ACTGG-TGGATC-TA-TCCAG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATT-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--C--CATCCA-CTG-GC----GA--CT-GC-G-------------------T-C----A-C------TTT-A--T-CA------AGAAT-GA---T--TTG-C---------CA--C-TT-GCCTTG-CAATC-AT------A---AT-GCAGATCCTTTGT---ATCTA--GCC---GT---A-A---GT--GT-TAGGG
gi|96102                      :     TGCTCTT-T-C-CACT--CTTTCAAGTTC--TTCA-CT----C---T--TAACT-G--GG-TGGCC------G-AC-A-GC-AA-T---TGC-GCTA---GCT-G-AA---TT--ATTA---T-ATGGTGCT-GAGGGACC-CA-AACT-TCTC----CGATG--T-T-CCAAAG-GATTTTC-TCA-AAGGGAC-TAAGGTTG--GGTGA-GAT------TA--CCC----GCTTGGCA--G--CGT-----GT-A--ATG-AGTC-ACTGGGCGGCTC-CC-TTCAG-AG-ACG-AAGC------AGA-ATTTAAGTG-ATTTATTGG-T--TGTTC-T--G-TT--C--CGTCCA-ATT-TT----CA--CCCGC-GGGC------CA----G-CCT-T-CAAACC------TTCTA--T-CA------AG--CTGA---T--TT--C---------AA--CTTT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AT-GCTGATTC-TTTT---ATCTA--GCC---TC---T-G---GA--AT-CAGAGGAACa
gi|96103                      :       CTCCG-C-CACACT--CTTCAGAAGTC--T-CA-CTA---CAAAT--ATACT-GATGG-TGGCCA-----G-AC-TAGC-AA-G---TTAAAGTGAAAG-TAG-AGCAATA--AT-GAATC-CTGATGTC-G-GG-AAC-CA-TACC-TCTCGCCTCGGACAAT-T-ACCTACAATTTT-C-TAC-AA---ACATGAGGTTG--GG-GA-GA---AAT-C---TCCAAGAA--TAGCA--GAACGTA----GTAA--ATAGAGTCAACTGG-CAGCTCGCC-TCCGGAAG-A-A-AAGCACAAATAAA-A-----GTGAATC-AT--GAA--TGCTCATCAC-TT--C--CGTCAA-CT
gi|96104                      :           G-T-C-CACT--ACCTTAATGTC--T-CA-CCG---C---T--AGACT-G--GT-TGGGC------C-CT-T-GG-AA-A---TTCAGCTG---G-T-G-AT---TG--AT-A---T-CTGGCGCC-GAAG-ACC-CA-AAC
gi|96105                      :           G-T-C-CACT--ACCTTAATGTC--T-CA-CCG---C---T--AGACT-G--GT-TGGGC------C-CT-T-GG-AACA---TTCAGCTG---G-T-G-CA---TTGGAT-A---T-CT-GCGCCGGAAG-ACC-CA-AAC
gi|96106                      :            -C-C-CACT--TTCTCAAAGTC--T-CA-CCA---C---T--TGACT-G--AG-TGGCG------G-AC-T-GA-AA-A---TTCAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GAAG-ACC-CA-AACC-TCTTG--TCAAAT--T-T-CC--------------------------AAGGTTG--GGTAA-GAT--C-------TCC---AG--TAACA--G--AGT-----GT-AGTAT--AGTC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCGT--T-TT--C--CATCCA-CTG-CT----GA--CT-GC-GAGC------TA----G-CCT-CTCAAA-C------TTA-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AAATA-TT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AC-GCAGATCC-ATGC---ATCTA--GCCTGATT---A-C---GC--AT-TAGAGGGACA
gi|96107                      :                    T--CTTTCAGGCTC--T--A-CTA---C---T--TGACT-G--GGGTGGCC------G--C-T-GC-TA-G---TTAAGCTG---G-T-G-AG---TTT-AT-G---T-ATGGTGTC-GAGG-ACC-CATCACCGTCTCG--TCGAAT--T-T-CCCCAC-GATTT-CCTCC-AAGC-AC-C-AGGTTG--GTTG----TCGAAT--A--TCC---AG--TAGGAAAG--CGT-----GT-A--AT---GTA-CCCGG-CGGCTC-C--TCTGG-AG-A-G-AAGC------CGA-AA----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--CTCCGTCCA-TTG-GT----GA--CT-GT-AGAA------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA--------GAC-GATTGT--TCC-C---------AC--C-TT-GCCTTG-TTATC--T------GTCCAT-TCA-ATCC-TTCT---TTCTA--GTA---CT---ACC---GCG-GG-CGGAGAAACA
gi|96108                      :                        TTTCAGAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-TGGTC------T-AC-T-GC-AA-G---TTAAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-AAGG-ACC-CA-TTCC-TCTTG--TCAAAA--T-T-TTCCAC-GTTTT-C-TCC-AAG--AC-TGAGGTTG--AGTGA-GAT--C-------TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACCGG-TGGCTC-CC-TCTAG-AG-A-A-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--C--CGTCCA-CTG-GT----GA--CT-GA-GGAC------CA----G-TCT-TACACA-C------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------CA--C-TT-GCTTTG-TCATC-TT------C---AT-TCAGATCC-TTCT---ATCTA--GAC---TTA--A-C---GC--AT-TAGAGAAACA
gi|96109                      :                                                                                                   CTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GGGG-ACC-CA-AAGC-TCTCG--TCGAAT--T-A-TCCCAG-GATTT-C-TTC-AAG--AC-TCGGGTTG--GATGA-GAT--AAT-TA--TCC---AG--TAACA--G--CGT-----GT-A--AT--AACC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCAG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G-C--TGTTCAT--C-TT--C--CGTCTA-CTT-TT----GA--CT-GC-GAGC------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AA--C-TT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AT-GTAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC---CT---A-C---GC--GT-CAGAGGAACA
gi|96110                      :                                                                                                                                                                --TCAAAT--T-G-TCCCAG-GATCT--------AG--AC-CAGGGAGA--GGCTA-CA---AAC-TAACTCC---AG--CAGGA--A--GGT-----GT-A--AT--AGCC-ACTGG-CAA-TA-TC-TTCTA-AG-G-A-AAG--------GA-A-----TTG-GTT-GT--G-C--TGCTC-T--C-TC-------TCCA-ATA-CA----GA--CT-GC-AGGTTACATGTA----G-TTC-AACAGA-C------T---A--TGCA------AGAAG-GA---T--TTT-C---------CA--C-TG-TACTTA-CCATC-AT------A---CCAGCATTTCC-TT-T---ACCTG--G
gi|96111                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atttcAGC------AGATA-----G---AT---T--G-T--TGTTCAT--C-TT--C--CGTCCAGTTA-TTAGAAGA--CG-AT-TGGA------CATTACGCCCT-CACAAA-CTTATCTTTC-A--T-CACTATCGAAGAT-GA---TTGTTT-CAAGAATAAAAA--C-TT-G-CTTG--CATC-ATAAGGTAA---AT-ACAGATCA-TTGT---GTTTA--G
gi|96112                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T--G-T--TGGTCAT--C-TT--C--TGTGCA-CTG-TT----GA--CT-GC-AGGC------CA----G-CCT-CACAAA-C------T------------------AAT-GA---T--TTC-C---------AG--C-TT-GCCTTT-CCATC-AT------A---AC-ACAGATTT-CGAA---ATCTA--GGT---TT---G-C---
gi|96113                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCTA-CTG-TT----AA--AT-GC-GGGC------CA----G-TCT-CAGAAA-T------TTC-A--T-CA------AAATT-TA---G--TTT-C---------AA--C-TC-ACCTTG-TCATC-AA------A---AT-ACAGATTC-TTGT---ATTTC--GCT---TT---G-C--------T-CAGAG
gi|96114                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -TT----AA--TT-GC-AGAC------CA----G-CCT-CACAAA-G------TTC-A--T-CA------AGAAC-AA---T--TTC-C---------CA--C-TT-GCCTTG-TCATC-TT------C---AT-TCAAATCC-T-------TCTA--GAC---TT---A-A---GC--GT-CAGAGAAACA
gi|96115                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CT-CACAAA-C------T------------------AAT-GA---T--TTC-C---------AG--C-TT-GCCTTT-TCATC-AT------A---AC-ACAGATTT-CTAA---ATCTA--GGT---TT---G-CTATGT--GT-CTGAAGGACA


blockSeqs                     :      G     G A G    AT           CC T  C   ACT AAA AG     C AT  G     ATGGCT C  A A CC  C AAT        AAA C C G  CAA  GG  GAAT  T        G    G T T  TC   G     CC      AA A A     CA G   A C   T   GG  A        AG     A  TGAGATA       AAG  CT     AA AA   AACGT  A GT  AG    A     G      T  A   A A  A C A    ACAAAT   T TTTAA   A   T  TG T AA       CA T  TG TC      G   AG AGAA  AC  C  T    TACATG  TTAC C   A      C TTATCT   A TC G  CTATCG     G  TTG TG   T AAGAATAAAA AT T  G      T     T  AAGGTAA     AG       T  G ATG     GG   TGA  ATA C TAT  GT  C
blockSeqs                     :      G     . . A    .            .  .  .   .   AG  .      G .   .     A      .  . . C   . .          .   . A .  C    T   TA    .        .    . C .  A    .     .       .  . .     T  G   T .   .   C   .        .      .  TCGAATA       .    T      A  .    A      . .   G     .     .      G  .   A .  . . .    .        . A       A   .  .  A .        A  .  .  .       .   T  G     .   .  .    G       .    C   .      . G        T .  .  .          T  .   .    . A          .  .  .      .     .  GTCC        G        .  G .       .    .    A   . .    G   .
blockSeqs                     :      G     . . .    .            .  .  .   .   A   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . C .  A    .     .       .  . .     G  A   . .   .   .   .        .      .  AACTAAC       .    .      .  .    A      . .   .     .     .      .  .   C .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   C  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . C          .  .  .      .     .  A           G        .  G .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      G     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . G   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . T .  A    .     .       .  . .     G  T   . .   .   .   .        .      .  TAATTA        .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   A .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   T  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . A          .  .  .      .     .  A           G        .  G .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      G     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . T .  A    .     .       .  . .     C  T   . .   .   .   .        .      .  TAATTA        .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   A .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   C  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . C          .  .  .      .     .  A           G        .  C .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      G     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . C .  A    .     .       .  . .     C  T   . .   .   .   .        .      .  TAATTA        .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   G .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   T  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . C          .  .  .      .     .  A           T        .  C .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      G     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . G   . .          .   . . .  .    .   A     .        .    . C .  A    .     .       .  . .     C  T   . .   .   .   .        .      .  GAATC         .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   G .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   G  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . G          .  .  .      .     .  C           T        .  C .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      G     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . T .  T    .     .       .  . .     G  T   . .   .   .   .        .      .  ATTA          .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   A .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   G  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . A          .  .  .      .     .  C           T        .  G .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      T     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . T .  T    .     .       .  . .     G  T   . .   .   .   .        .      .  TATC          .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   G .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   T  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . C          .  .  .      .     .  C           G        .  G .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      T     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . T .  T    .     .       .  . .     G  A   . .   .   .   .        .      .  AATC          .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   A .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   T  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . A          .  .  .      .     .  A           G        .  T .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      T     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . A   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . T .  A    .     .       .  . .     C  T   . .   .   .   .        .      .  AATC          .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   A .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   G  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . A          .  .  .      .     .  A           G        .  G .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      T     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . T   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . C .  A    .     .       .  . .     C  A   . .   .   .   .        .      .  TTA           .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   A .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   T  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . A          .  .  .      .     .  A           G        .  C .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      T     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   T     .        .    . A .  A    .     .       .  . .     G  T   . .   .   .   .        .      .  TC            .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   G .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   C  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . C          .  .  .      .     .  A           T        .  C .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      A     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   A     .        .    . C .  T    .     .       .  . .     G  A   . .   .   .   .        .      .  TC            .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   A .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   G  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . A          .  .  .      .     .  C           T        .  G .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      G     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   A     .        .    . C .  A    .     .       .  . .     .  T   . .   .   .   .        .      .  TC            .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   G .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   G  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . C          .  .  .      .     .  A           G        .  G .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :      .     . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . G   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . C .  A    .     .       .  . .     .  A   . .   .   .   .        .      .  TC            .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   A .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   T  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . A          .  .  .      .     .  A           A        .  A .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :            . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . G   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . C .  A    .     .       .  . .     .  A   . .   .   .   .        .      .  TC            .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   A .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   C  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . A          .  .  .      .     .  A           A        .  G .       .    .    .   . .    .   .
blockSeqs                     :            . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . A   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . C .  T    .     .       .  . .     .  .   . .   .   .   .        .      .  T             .    .      .  .    .      . .   .     .     .      .  .   T .  . . .    .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   T  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . C          .  .  .      .     .  A           A        .  A .       .    .    .   . .         
blockSeqs                     :            . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   G     .        .    . C .  A          .       .  . .     .  .   . .   .   .   .                                                                                                         .        . .       .   .  .  . .        .  .  .  .       .   T  .     .   .  .    .       .    .   .      . .        . .  .  .          .  .   .    . A          .  .  .      .     .  C           T        .  . .       .                         
blockSeqs                     :            . . .    .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . C   . .          .   . . .  .    .   .     .        .    . . .  .                                                                                                                                                                                      .  . .        .  .  .  .       .   T  .                                  .      . .        . .  .  .          .  .   .    . .          .  .  .      .     .  A           A        .  . .       .                         
blockSeqs                     :                     .            .  .  .   .   .   .      . .   .     .      .  . . .   . .          .   . . .  .    .   .     .        .    . . .  .                                                                                                                                                                                                                     .   T                                                                                                                                                                                     
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originalCons                  : TATGTGCTCTG-C-C-CACT--CTTTCAAAGTC--T-CA-CTA---C---T--TGACT-G--GG-TGGCC------G-AC-T-GC-AA-G---TTCAGCTG---G-T-G-AG---TT--AT-G---T-CTGGTGCT-GAGG-ACC-CA-AACC-TCTCG--TCGAAT--T-T-CCCCAC-GNTTT-C-TCC-AAG--AC-TGAGGTTG--GGTGA-GAT--AAT-TA--TCC---AG--TAGCA--G--CGT-----GT-A--AT--AGTC-ACTGG-CGGCTC-CC-TCCGG-AG-A-G-AAGC------AGA-A-----GTG-ATC-AT--G-T--TGCTCAT--C-TT--C--CGTCCA-CTG-TT----GA--CT-GC-GGGC------CA----G-CCT-CACAAA-C------TTC-A--T-CA------AGAAC-GA---T--TTC-C---------AA--C-TT-GCCTTG-CCATC-AT------A---AT-GCAGATCC-TTGT---ATCTA--GCC---TT---A-C---GC--GT-CAGAGGAACA
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