lowQualScore : 1111111 44444444 11111111111111111111
lowQualScore : 777 3 3 3 1111111 3 1 3333 555 1 1 6 1 1 8888 11111111 33 1 1 8888888888888 222 1 22 1 3 1 777777 1 22222222222222222222 33 666666666 1 1
lowQualScore : ... . . . ....... . . .... ... . . . . . .... ........ .. . . ............. ... . .. . . . ...... . .................... .. ......... . .
lowQualScore : 666 1 1 1 5555555 1 7 5555 222 7 6 6 5 5 5555 33333333 77 5 5 1111111111111 777 6 00 5 1 5 111111 5 55555555555555555555 77 444444444 7 0
consensus : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAAAG-GGAG-TG----ACCCC---AACC-T-AGG-G-TAGAA--C-AAAGCA-----ACGA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
Reference ( gi|109250 ) : TAGTG--TTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAAAG-GGAG-TA----ACCCC---AACC-T-AAG-G-TAGAA--T-AAAGTA----TACAA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109252 : TAGTG--ATGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-TTTA-----G-AAAAG-GGAT-TA----ACCCC---AACC-T-AGG-G-TAGAA--C-AAAG-A-----ACGA--CCTA-CA-T-------------GGTTTGA---T-GCCGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------CA--ATGATGG---------TTGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109253 : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-ATTA-----G-AAAGG-GGAG-TA----ACCCT---AACC-T-AGG-G-TAGAA--C-AAAG------CACGA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CCAGAT------TATT-G--------------------A-----CATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109251 : TAGTG--TTGTG-TCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----GAAAAAG-GGAG-TA----ACCCC---AA-C-T-AAG-GTTAGAA--TAAAAGTAT---TACAAG-CCTA--A-T--------------GTTTGA---T-GCAAG--A-ATTTG-T-CTAGAT------TATG-G---------------------A--ATGAT-G---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109254 : TAGTT--CTGTGGTCATTT-CTAAAAA-GAAA-CTTA-------AAAAG-GAAA-TA----ACCCC---AACC-T-AGG-A-TAGAA--C-AAAGCA-----ATA---CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---T-GCAGA--A-TATTG-T-CAAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TTGTAG-TCTGATAAAAATTGTTT
gi|109256 : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTTATAA-CAGA-CTTA-----G-AAAAG-GGAG-TA----ACCCC---AACC-T-AGG-G---GAA--C-AAAG------CACAACCCCTA-TA-T-------------GG-TTGA---TGGCAGA--A-TTTTATT-CTAGAT------TGTG-------------------------------GG---------TCGTAG-TATGATAAAATGTGTTT
gi|109255 : TAGTG--CTGTGGTCATTTTCTCAAAA-GAGGACTTAA----G-TAAAG-GGTG-TAGGGTACCCC---AACC-TTAGG-G-TAGAA--C-AAAGCA------CGA--CCTA-TA-T-------------GGTTGAA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-A--------------------AA--ATGATGG---------T
gi|109257 : TAGTG--CTGTGGTTATTT-CTCAAAA-GGGG-CTTA-----G-AAAAGTTGAGTTA----ACCCCAA-AACC-T-AGGAG-TAGAA--C-AAAG------TACGA--CCTA-TATT-------------GGTTTGA---T-GCAGA--ATTTTTGCT-CTAGAT------TATG-G--------------------AAC-ATGATAG---------Tt
gi|109258 : TAGTG--CTGTGGTCA----------------------------AAAAG-GGAA-TA----ACCCC---AACC-T-AGG-G-TAGAG--C-TAAGTA------CAA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTA-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--GTGATGG---------TCGTAG-TGTCATCAAATGt
gi|109261 : TAGTGGCTTGTG-TC-TTT-CTCAAAAAGAGG-CTTA-----G---AAG-GGA--TA----ACGCCGCAAACC-T-AGG-G-TAGAA--C-AAAG------TACGA----TA-TA-T-------------GG-TTAA---T-AT-----A-TTTTG-TCCTAGAT------TAGG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAGTTTTGATTAAATGTGGTT
gi|109262 : TAGTG--CGGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTAAATTAG-AAAAG-GGAG-TA----ACCCC---AACC-T-AGG-G-TAGAA--C-AAAG------GACGA--CCTA-TA-T-------------
gi|109259 : TAGTG--T-GTGGACATTT-CTTCAAA-GGGG-TT---------AAAGG-GGAA-TA----ACCCT---AACC-T-ATA-G-TAGAA--C-AAAGCA------CAA--CCTA-TA-TTTAGTCTATATGTGGTTTGA---A-GCAGA--C-TTTTG-T-CTATATATA---TATG-GTTTGAAGCAAACTTTTGTCTAG--ATTATGGAACTGATGGTCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109263 : GTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAAAT-GGAG-TA----ACCCC---AACT-T-ACG-G-TAGAA--C-AAAGCA------CAA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--CTGATGG---------TTGTAG-CCTGATAAAATGTGTTT
gi|109264 : TG--CTGTGTTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-TAAAG-TGAG-TA----ACCCC---AACT-T-ACG-G-TTGAA--C-AAAGCA------CAG--CCTA-TA-T-------------GGTGTGA---T-GCAGA--A-TTGTG-T-CACGAT------TATG-A--------------------AA--CTGATGG---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGTT
gi|109265 : GAA-TG----ACCCC---AAC--T-AGG-G-TAGAA--C-AAAGTA------CGA--CCTAATA-T-------------GGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTT--T-CTAGAT------TATG-G--------------------AGGTATGATGG---------TCGTAG-TTTGATTAAATGTGTT
gi|109266 : G-TG----ACC------ACCAT-AGG-G-TAGAA--C-AAAGCA----GA--A--CCTA-TA-T-------------GGTTTG----T-CTAGA--A-TTTT
gi|109267 : -TG----ACCCC---AACC-T-AGG-G-TAGAA--C-AAAGCA------CAA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---A-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGA---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109268 : -TG----ATCCC---AACC-T-AGG-G-TAGAA--C-AAAGTA------CGA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGCAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109269 : -TG----ACCCC---AACC-T-AGG-G-TAGAA--C-AAAGT-----T-CGA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---T-GCAGC--A-TTTTG-T-ATAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATCAAATGTGTTT
gi|109270 : -TG----ACCCC---AACC-T-AGG-G-TAGTA--C-AAAGTACATGTACAA--CCTA-TA-G-------------GGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTA-T-CTAGAT------TACG-A--------------------GA--ATTATGG---------TTGTAA-TTTGATAAAATGTGCTT
gi|109260 : -TG----ATCCC---AACC-T-AGG-G-TAGAA--C-GAACTA------CGA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---T-GCAAA--A-TTTAA-T-ATAGAT------TATG-G--------------------AA--AGGATGG---------TCGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109272 : tagtgctgcggccgagaggtgaaattctaaga-TG----ACCCC---AACC-T-AGG-G-TAGAA--T-AAACCA------CAA--CCTA-TT-T-------------GGTATAA---T-GCAGA--A-TTGTG-A-CAAGAT------AATG-G--------------------AA--ATGATGA---------TCGTAG-TTTGATAAAAT
gi|109271 : -TG----ACCCC---AACC-T-AGG-G-TAGAACCC-AAAG------TACGA--CCTA-TA-T--------------GTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-C-AGATAAAAACTATGCG--------------------AA--ATGATGG---------TTCTAG-TTTGATTAAATGTGCT
gi|109273 : -TG----ACCCC---CACC-T-AGG-G-TAGAA--C-AAAGTA------CGA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGTT------TATG-G--------------------AA--ATTATG
gi|109274 : -TG----ACCCC---GACA-T-AGG-C-TAGAA--C-AAAGTAT---TATAA--TCTA-TA-T--------------------------------A-TCTTA-T-ATTGGC------TATG-G--------------------AA--ATGGTGG---------TTGTAG-TTTGATAAAATGTGTTtttgacttagt
gi|109275 : -AGG-G-TAGAA--C-AAAGTA------CAG--CCTA-TA-T-------------GGTTTTA---T-GCAGA--A-TTTAG-T-CTACAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TGGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109276 : -G-TAGAA--C-AAAGCA------CAA--CCTA-TA-T-------------GGTTTGA---
gi|109277 : TA-TA-T---------------TTTGAGTTT-GCCGTGTA-TTTTG-T-TTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109278 : A--A-TTTTG-T-CTAGAT------TACG-C--------------------AA--ATGGTGG---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGGTT
gi|109279 : A--G-TTTTG-T-CTAGAT------TATC-G--------------------AA--ATGATAA---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGCTT
Alignments
lowQualScore : 22222222 11111111111111111111
lowQualScore : 33 2 2 2 99999 2 5555 2 1 3333 1 555 1 1 33 88888888 0 33 1 9999999999999 222 1 22 1 3 1 666666 1 22222222222222222222 33 666666666 1 0
lowQualScore : .. . . . ..... . .... . . .... . ... . . .. ........ . .. . ............. ... . .. . . . ...... . .................... .. ......... . .
lowQualScore : 77 7 7 7 33333 7 7777 7 6 4444 6 000 5 5 55 44444444 1 55 4 3333333333333 666 5 00 4 0 5 999999 5 00000000000000000000 55 222222222 7 6
consensus : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGCA-----ACGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
Reference ( family-550 ) : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGCA-----ACGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109250 : TAGTG--TTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACCT-AAG-GTAGAAT--AAAGTAT----ACAA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109251 : TAGTG--TTGTG-TCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----GAAAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACTA-AGG-TTAGAATA-AAAGTATT---ACAAG-CCT-A-A-------------T-GTTTGA---T-GCAAG--A-ATTTG-T-CTAGAT------TATG-G---------------------A--ATGAT-G---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109252 : TAGTG--ATGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-TTTA-----G-AAA----AG-GGAT-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG-A-----ACGA--CCT-ACA-------------TGGTTTGA---T-GCCGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------CA--ATGATGG---------TTGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109253 : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-ATTA-----G-AAA----GG-GGAG-TA----ACC-CT---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGC------ACGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CCAGAT------TATT-G--------------------A-----CATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109254 : TAGTT--CTGTGGTCATTT-CTAAAAA-GAAA-CTTA-------AAA----AG-GAAA-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-ATAGAAC--AAAGCA-----AT-A--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TATTG-T-CAAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TTGTAG-TCTGATAAAAATTGTTT
gi|109255 : TAGTG--CTGTGGTCATTTTCTCAAAA-GAGGACTTAA----G-TAA----AG-GGTG-TAGGGTACC-CC---AACCTTAGG-GTAGAAC--AAAGCA------CGA--CCT-ATA-------------TGGTTGAA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-A--------------------AA--ATGATGG---------T
gi|109256 : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTTATAA-CAGA-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-G--GAAC--AAAGC------ACAACCCCT-ATA-------------TGG-TTGA---TGGCAGA--A-TTTTATT-CTAGAT------TGTG-------------------------------GG---------TCGTAG-TATGATAAAATGTGTTTt
gi|109257 : TAGTG--CTGTGGTTATTT-CTCAAAA-GGGG-CTTA-----G-AAA----AGTTGAGTTA----ACC-CCAA-AACCT-AGGAGTAGAAC--AAAGT------ACGA--CCT-ATAT------------TGGTTTGA---T-GCAGA--ATTTTTGCT-CTAGAT------TATG-G--------------------AAC-ATGATAG---------T
gi|109258 : TAGTG--CTGTGGTCA----------------------------AAA----AG-GGAA-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAGC--TAAGTA------CAA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTA-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--GTGATGG---------TCGTAG-TGTCATCAAATGt
gi|109259 : TAGTG---TGTGGACATTT-CTTCAAA-GGGG-TT---------AAA----GG-GGAA-TA----ACC-CT---AACCT-ATA-GTAGAAC--AAAGC------ACAA--CCT-ATATTTAGTCTATATGTGGTTTGA---A-GCAGA--C-TTTTG-T-CTATATATA---TATG-GTTTGAAGCAAACTTTTGTCTAG--ATTATGGAACTGATGGTCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109260 : TAGTG--CTGCGGCCG----------A-GAGG-T--------G-AAATTCTAA-GA---TG----ATC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--GAA-CT-----ACGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAAA--A-TTTAA-T-ATAGAT------TATG-G--------------------AA--AGGATGG---------TCGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109261 : TAGTGGCTTGTG-TC-TTT-CTCAAAAAGAGG-CTTA-----G---A----AG-GGA--TA----ACG-CCGCAAACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGT------ACGA----T-ATA-------------TGG-TTAA---T-AT-----A-TTTTG-TCCTAGAT------TAGG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAGTTTTGATTAAATGTGGTT
gi|109262 : TAGTG--CGGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTAAATTAG-AAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG-G-----ACGA--CCT-ATA-------------T
gi|109263 : GTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AT-GGAG-TA----ACC-CC---AACTT-ACG-GTAGAAC--AAAGCA------CAA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--CTGATGG---------TTGTAG-CCTGATAAAATGTGTTT
gi|109264 : TG--CTGTGTTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-TAA----AG-TGAG-TA----ACC-CC---AACTT-ACG-GTTGAAC--AAAGCA------CAG--CCT-ATA-------------TGGTGTGA---T-GCAGA--A-TTGTG-T-CACGAT------TATG-A--------------------AA--CTGATGG---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGTT
gi|109265 : GAA-TG----ACC-CC---AAC-T-AGG-GTAGAAC--AAAGT------ACGA--CCTAATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTT--T-CTAGAT------TATG-G--------------------AGGTATGATGG---------TCGTAG-TTTGATTAAATGTGTT
gi|109266 : G-TG----ACCACC---A---T-AGG-GTAGAAC--AAAGCA-----G-AA--CCT-ATA-------------TGGTTTG----T-CTAGA--A-TTTT
gi|109267 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGCA------CAA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---A-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGA---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109268 : -TG----ATC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGTA------CGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGCAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109269 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGTT------CGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGC--A-TTTTG-T-ATAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATCAAATGTGTTT
gi|109270 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGTAC--AAAGTACATGTACAA--CCT-ATA-------------GGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTA-T-CTAGAT------TACG-A--------------------GA--ATTATGG---------TTGTAA-TTTGATAAAATGTGCTT
gi|109271 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAACCCAAAGTA------CGA--CCT-ATA-------------TG-TTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-C-AGATAAAAACTATGCG--------------------AA--ATGATGG---------TTCTAG-TTTGATTAAATGTGCT
gi|109272 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAT--AAACCA------CAA--CCT-ATT-------------TGGTATAA---T-GCAGA--A-TTGTG-A-CAAGAT------AATG-G--------------------AA--ATGATGA---------TCGTAG-TTTGATAAAAT
gi|109273 : -TG----ACC-CC---CACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGTA------CGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGTT------TATG-G--------------------AA--ATTATG
gi|109274 : -TG----ACC-CC---GACAT-AGG-CTAGAAC--AAAGTATT---ATAA--TCT-ATA-------------T-------------------A-TCTTA-T-ATTGGC------TATG-G--------------------AA--ATGGTGG---------TTGTAG-TTTGATAAAATGTGTTtttgacttagt
gi|109275 : -AGG-GTAGAAC--AAAGTA------CAG--CCT-ATA-------------TGGTTTTA---T-GCAGA--A-TTTAG-T-CTACAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TGGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109276 : -GTAGAAC--AAAGCA------CAA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---
gi|109277 : T-ATA-------------T--TTTGAGTTT-GCCGTGTA-TTTTG-T-TTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109278 : A--A-TTTTG-T-CTAGAT------TACG-C--------------------AA--ATGGTGG---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGGTT
gi|109279 : A--G-TTTTG-T-CTAGAT------TATC-G--------------------AA--ATGATAA---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGCTT
Alignments
lowQualScore : 22222222 11111111111111111111
lowQualScore : 33 2 2 2 99999 2 5555 2 1 3333 1 555 1 1 33 88888888 0 33 1 9999999999999 222 1 22 1 3 1 666666 1 22222222222222222222 33 666666666 1 0
lowQualScore : .. . . . ..... . .... . . .... . ... . . .. ........ . .. . ............. ... . .. . . . ...... . .................... .. ......... . .
lowQualScore : 77 7 7 7 33333 7 7777 7 6 4444 6 000 5 5 55 44444444 1 55 4 3333333333333 666 5 00 4 0 5 999999 5 00000000000000000000 55 222222222 7 6
consensus : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGCA-----ACGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
Reference ( family-550 ) : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGCA-----ACGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109250 : TAGTG--TTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACCT-AAG-GTAGAAT--AAAGTAT----ACAA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109251 : TAGTG--TTGTG-TCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----GAAAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACTA-AGG-TTAGAATA-AAAGTATT---ACAAG-CCT-A-A-------------T-GTTTGA---T-GCAAG--A-ATTTG-T-CTAGAT------TATG-G---------------------A--ATGAT-G---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109252 : TAGTG--ATGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-TTTA-----G-AAA----AG-GGAT-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG-A-----ACGA--CCT-ACA-------------TGGTTTGA---T-GCCGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------CA--ATGATGG---------TTGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109253 : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-ATTA-----G-AAA----GG-GGAG-TA----ACC-CT---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGC------ACGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CCAGAT------TATT-G--------------------A-----CATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109254 : TAGTT--CTGTGGTCATTT-CTAAAAA-GAAA-CTTA-------AAA----AG-GAAA-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-ATAGAAC--AAAGCA-----AT-A--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TATTG-T-CAAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TTGTAG-TCTGATAAAAATTGTTT
gi|109255 : TAGTG--CTGTGGTCATTTTCTCAAAA-GAGGACTTAA----G-TAA----AG-GGTG-TAGGGTACC-CC---AACCTTAGG-GTAGAAC--AAAGCA------CGA--CCT-ATA-------------TGGTTGAA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-A--------------------AA--ATGATGG---------T
gi|109256 : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTTATAA-CAGA-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-G--GAAC--AAAGC------ACAACCCCT-ATA-------------TGG-TTGA---TGGCAGA--A-TTTTATT-CTAGAT------TGTG-------------------------------GG---------TCGTAG-TATGATAAAATGTGTTTt
gi|109257 : TAGTG--CTGTGGTTATTT-CTCAAAA-GGGG-CTTA-----G-AAA----AGTTGAGTTA----ACC-CCAA-AACCT-AGGAGTAGAAC--AAAGT------ACGA--CCT-ATAT------------TGGTTTGA---T-GCAGA--ATTTTTGCT-CTAGAT------TATG-G--------------------AAC-ATGATAG---------T
gi|109258 : TAGTG--CTGTGGTCA----------------------------AAA----AG-GGAA-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAGC--TAAGTA------CAA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTA-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--GTGATGG---------TCGTAG-TGTCATCAAATGt
gi|109259 : TAGTG---TGTGGACATTT-CTTCAAA-GGGG-TT---------AAA----GG-GGAA-TA----ACC-CT---AACCT-ATA-GTAGAAC--AAAGC------ACAA--CCT-ATATTTAGTCTATATGTGGTTTGA---A-GCAGA--C-TTTTG-T-CTATATATA---TATG-GTTTGAAGCAAACTTTTGTCTAG--ATTATGGAACTGATGGTCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109260 : TAGTG--CTGCGGCCG----------A-GAGG-T--------G-AAATTCTAA-GA---TG----ATC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--GAA-CT-----ACGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAAA--A-TTTAA-T-ATAGAT------TATG-G--------------------AA--AGGATGG---------TCGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109261 : TAGTGGCTTGTG-TC-TTT-CTCAAAAAGAGG-CTTA-----G---A----AG-GGA--TA----ACG-CCGCAAACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGT------ACGA----T-ATA-------------TGG-TTAA---T-AT-----A-TTTTG-TCCTAGAT------TAGG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAGTTTTGATTAAATGTGGTT
gi|109262 : TAGTG--CGGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTAAATTAG-AAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG-G-----ACGA--CCT-ATA-------------T
gi|109263 : GTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AT-GGAG-TA----ACC-CC---AACTT-ACG-GTAGAAC--AAAGCA------CAA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--CTGATGG---------TTGTAG-CCTGATAAAATGTGTTT
gi|109264 : TG--CTGTGTTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-TAA----AG-TGAG-TA----ACC-CC---AACTT-ACG-GTTGAAC--AAAGCA------CAG--CCT-ATA-------------TGGTGTGA---T-GCAGA--A-TTGTG-T-CACGAT------TATG-A--------------------AA--CTGATGG---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGTT
gi|109265 : GAA-TG----ACC-CC---AAC-T-AGG-GTAGAAC--AAAGT------ACGA--CCTAATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTT--T-CTAGAT------TATG-G--------------------AGGTATGATGG---------TCGTAG-TTTGATTAAATGTGTT
gi|109266 : G-TG----ACCACC---A---T-AGG-GTAGAAC--AAAGCA-----G-AA--CCT-ATA-------------TGGTTTG----T-CTAGA--A-TTTT
gi|109267 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGCA------CAA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---A-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGA---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109268 : -TG----ATC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGTA------CGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGCAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109269 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGTT------CGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGC--A-TTTTG-T-ATAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATCAAATGTGTTT
gi|109270 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGTAC--AAAGTACATGTACAA--CCT-ATA-------------GGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTA-T-CTAGAT------TACG-A--------------------GA--ATTATGG---------TTGTAA-TTTGATAAAATGTGCTT
gi|109271 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAACCCAAAGTA------CGA--CCT-ATA-------------TG-TTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-C-AGATAAAAACTATGCG--------------------AA--ATGATGG---------TTCTAG-TTTGATTAAATGTGCT
gi|109272 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAT--AAACCA------CAA--CCT-ATT-------------TGGTATAA---T-GCAGA--A-TTGTG-A-CAAGAT------AATG-G--------------------AA--ATGATGA---------TCGTAG-TTTGATAAAAT
gi|109273 : -TG----ACC-CC---CACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGTA------CGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGTT------TATG-G--------------------AA--ATTATG
gi|109274 : -TG----ACC-CC---GACAT-AGG-CTAGAAC--AAAGTATT---ATAA--TCT-ATA-------------T-------------------A-TCTTA-T-ATTGGC------TATG-G--------------------AA--ATGGTGG---------TTGTAG-TTTGATAAAATGTGTTtttgacttagt
gi|109275 : -AGG-GTAGAAC--AAAGTA------CAG--CCT-ATA-------------TGGTTTTA---T-GCAGA--A-TTTAG-T-CTACAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TGGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109276 : -GTAGAAC--AAAGCA------CAA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---
gi|109277 : T-ATA-------------T--TTTGAGTTT-GCCGTGTA-TTTTG-T-TTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109278 : A--A-TTTTG-T-CTAGAT------TACG-C--------------------AA--ATGGTGG---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGGTT
gi|109279 : A--G-TTTTG-T-CTAGAT------TATC-G--------------------AA--ATGATAA---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGCTT
blockSeqs : GC T A A AATTA A TTCT T T GGGT A GCA T A CC TACATGTA CC A TTTAGTCTATATG GTT G GT T T C AAAAAC C TTTGAAGCAAACTTTTGTCT GT AACTGATGG T
blockSeqs : . . . . A . . . . . . AA . . A TATTA G . T . . . . C . ATA . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TATTA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CTA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CAG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . CA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : CA******
originalCons : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGCA-----ACGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
finalCons : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAGCA------CGA--CCT-ATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111
lowQualScore : 33 2 2 2 99999 2 5555 2 1 3333 1 555 1 1 22 55555 22 444444 33 1 9999999999999 222 1 22 1 3 1 666666 1 22222222222222222222 33 666666666 1 0
lowQualScore : .. . . . ..... . .... . . .... . ... . . .. ..... .. ...... .. . ............. ... . .. . . . ...... . .................... .. ......... . .
lowQualScore : 77 7 7 7 33333 7 7777 7 6 4444 6 000 5 5 00 99999 00 333333 55 4 3333333333333 666 5 00 4 0 5 999999 5 00000000000000000000 55 222222222 7 6
consensus : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG----CA--CG------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
Reference ( family-550 ) : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG----CA--CG------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109250 : TAGTG--TTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACCT-AAG-GTAGAAT--AAAG----TATACA------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109251 : TAGTG--TTGTG-TCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----GAAAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACTA-AGG-TTAGAAT--AAAAGTATTA--CA------AG-CCTA--A-------------T-GTTTGA---T-GCAAG--A-ATTTG-T-CTAGAT------TATG-G---------------------A--ATGAT-G---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109252 : TAGTG--ATGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-TTTA-----G-AAA----AG-GGAT-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG----AA--CG------A--CCTA-CA-------------TGGTTTGA---T-GCCGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------CA--ATGATGG---------TTGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109253 : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-ATTA-----G-AAA----GG-GGAG-TA----ACC-CT---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG----CA--CG------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CCAGAT------TATT-G--------------------A-----CATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109254 : TAGTT--CTGTGGTCATTT-CTAAAAA-GAAA-CTTA-------AAA----AG-GAAA-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-ATAGAAC--AAAG----CA--AT------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TATTG-T-CAAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TTGTAG-TCTGATAAAAATTGTTT
gi|109255 : TAGTG--CTGTGGTCATTTTCTCAAAA-GAGGACTTAA----G-TAA----AG-GGTG-TAGGGTACC-CC---AACCTTAGG-GTAGAAC--AAAG----CA--CG------A--CCTA-TA-------------TGGTTGAA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-A--------------------AA--ATGATGG---------T
gi|109256 : TAGTG--CTGTGGTCATTT-CTTATAA-CAGA-CTTA-----G-AAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-G--GAAC--AAAG----CA--CA------ACCCCTA-TA-------------TGG-TTGA---TGGCAGA--A-TTTTATT-CTAGAT------TGTG-------------------------------GG---------TCGTAG-TATGATAAAATGTGTTTt
gi|109257 : TAGTG--CTGTGGTTATTT-CTCAAAA-GGGG-CTTA-----G-AAA----AGTTGAGTTA----ACC-CCAA-AACCT-AGGAGTAGAAC--AAAG----TA--CG------A--CCTA-TAT------------TGGTTTGA---T-GCAGA--ATTTTTGCT-CTAGAT------TATG-G--------------------AAC-ATGATAG---------T
gi|109258 : TAGTG--CTGTGGTCA----------------------------AAA----AG-GGAA-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAGC--TAAG----TA--CA------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTA-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--GTGATGG---------TCGTAG-TGTCATCAAATGt
gi|109259 : TAGTG---TGTGGACATTT-CTTCAAA-GGGG-TT---------AAA----GG-GGAA-TA----ACC-CT---AACCT-ATA-GTAGAAC--AAAG----CA--CA------A--CCTA-TATTTAGTCTATATGTGGTTTGA---A-GCAGA--C-TTTTG-T-CTATATATA---TATG-GTTTGAAGCAAACTTTTGTCTAG--ATTATGGAACTGATGGTCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109260 : TAGTG--CTGCGGCCG----------A-GAGG-T--------G-AAATTCTAA-GA---TG----ATC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--GAAC----TA--CG------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAAA--A-TTTAA-T-ATAGAT------TATG-G--------------------AA--AGGATGG---------TCGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109261 : TAGTGGCTTGTG-TC-TTT-CTCAAAAAGAGG-CTTA-----G---A----AG-GGA--TA----ACG-CCGCAAACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG----TA--CG------A----TA-TA-------------TGG-TTAA---T-AT-----A-TTTTG-TCCTAGAT------TAGG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAGTTTTGATTAAATGTGGTT
gi|109262 : TAGTG--CGGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTAAATTAG-AAA----AG-GGAG-TA----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG----GA--CG------A--CCTA-TA-------------T
gi|109263 : GTG--CTGTGGTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-AAA----AT-GGAG-TA----ACC-CC---AACTT-ACG-GTAGAAC--AAAG----CA--CA------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--CTGATGG---------TTGTAG-CCTGATAAAATGTGTTT
gi|109264 : TG--CTGTGTTCATTT-CTCAAAA-GAGG-CTTA-----G-TAA----AG-TGAG-TA----ACC-CC---AACTT-ACG-GTTGAAC--AAAG----CA--CA------G--CCTA-TA-------------TGGTGTGA---T-GCAGA--A-TTGTG-T-CACGAT------TATG-A--------------------AA--CTGATGG---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGTT
gi|109265 : GAA-TG----ACC-CC---AAC-T-AGG-GTAGAAC--AAAG----TA--CG------A--CCTAATA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTT--T-CTAGAT------TATG-G--------------------AGGTATGATGG---------TCGTAG-TTTGATTAAATGTGTT
gi|109266 : G-TG----ACCACC---A---T-AGG-GTAGAAC--AAAG----CA--GA------A--CCTA-TA-------------TGGTTTG----T-CTAGA--A-TTTT
gi|109267 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG----CA--CA------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---A-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGA---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109268 : -TG----ATC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG----TA--CG------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGCAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109269 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG----TT--CG------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAGC--A-TTTTG-T-ATAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATCAAATGTGTTT
gi|109270 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGTAC--AAAG----TA--CATGTACAA--CCTA-TA-------------GGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTA-T-CTAGAT------TACG-A--------------------GA--ATTATGG---------TTGTAA-TTTGATAAAATGTGCTT
gi|109271 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAACCCAAAG----TA--CG------A--CCTA-TA-------------TG-TTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-C-AGATAAAAACTATGCG--------------------AA--ATGATGG---------TTCTAG-TTTGATTAAATGTGCT
gi|109272 : -TG----ACC-CC---AACCT-AGG-GTAGAAT--AAAC----CA--CA------A--CCTA-TT-------------TGGTATAA---T-GCAGA--A-TTGTG-A-CAAGAT------AATG-G--------------------AA--ATGATGA---------TCGTAG-TTTGATAAAAT
gi|109273 : -TG----ACC-CC---CACCT-AGG-GTAGAAC--AAAG----TA--CG------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---T-GCAGA--A-TTTTG-T-CTAGTT------TATG-G--------------------AA--ATTATG
gi|109274 : -TG----ACC-CC---GACAT-AGG-CTAGAAC--AAAGTAT-TA--TA------A--TCTA-TA-------------T-------------------A-TCTTA-T-ATTGGC------TATG-G--------------------AA--ATGGTGG---------TTGTAG-TTTGATAAAATGTGTTtttgacttagt
gi|109275 : -AGG-GTAGAAC--AAAG----TA--CA------G--CCTA-TA-------------TGGTTTTA---T-GCAGA--A-TTTAG-T-CTACAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TGGTAG-TTTGATTAAATGTGTTT
gi|109276 : -GTAGAAC--AAAG----CA--CA------A--CCTA-TA-------------TGGTTTGA---
gi|109277 : TA-TA-------------T--TTTGAGTTT-GCCGTGTA-TTTTG-T-TTAGAT------TATG-G--------------------AA--ATGATGG---------TCGTAG-TTTGATAAAATGTGTTT
gi|109278 : A--A-TTTTG-T-CTAGAT------TACG-C--------------------AA--ATGGTGG---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGGTT
gi|109279 : A--G-TTTTG-T-CTAGAT------TATC-G--------------------AA--ATGATAA---------TTGTAG-TCTGATAAAATGTGCTT