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lowQualScore                  :     9         111     888   55  1 000000000000000000   888888  99 0 1 555555    22   1   3 33    1 000000000000000000000000000 1    11 66 33 1  1   11 1  2 333   2222 5 2 1   1  22    444 5555555 1 333 222  66666666666666666666666666666  1  222   3  777 44444 66666  444 22 44444  1 1111 1 6666    1 1   3333   22    444444 777777  3333  1 1 5 22 22 1 5555   5555  6666 444 2 2 777    5      66  2222  44       77 3 3   8   333  5     2222     
lowQualScore                  :     .         ...     ...   ..  . ..................   ......  .. . . ......    ..   .   . ..    . ........................... .    .. .. .. .  .   .. .  . ...   .... . . .   .  ..    ... ....... . ... ...  .............................  .  ...   .  ... ..... .....  ... .. .....  . .... . ....    . .   ....   ..    ...... ......  ....  . . . .. .. . ....   ....  .... ... . . ...    .      ..  ....  ..       .. . .   .   ...  .     ....     
lowQualScore                  :     7         555     666   00  0 000000000000000000   666666  44 6 7 000000    11   5   0 88    5 999999999999999999999999999 6    99 44 33 4  4   99 4  8 888   9999 3 9 4   4  00    555 5555555 4 999 666  77777777777777777777777777777  5  333   2  555 66666 22222  444 22 00000  7 2222 7 2222    6 5   1111   22    888888 444444  5555  7 7 5 55 66 8 0000   0000  6666 111 4 4 888    0      00  2222  22       99 3 3   9   888  0     5555     
consensus                     :  CCCTGACTTGGTTNTGATTGAC-TTGA--GTAG-------TGATC--C---CTGAT--T-GA-NGCT-G--A---GGAG--CTT-CAT-GG-TGCT-G------T--T-A---------------TCTCCA--CG-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTT----CNT-C-ACT-CA--GACA---G--GCN--A-C---A-C-TG---CGN-A--GGT--TCC--ATG---T--AT-ACC--CAG-TGT-CT--A--T-----GG---T--G-----GC-GAC--A-GTCT-GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA--TTTC--TGTGTTG--T-C-TTT-ATA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
Reference ( gi|115080 )       :  CCCGGACTTGGTTGCGATTGAC-TTGA--GTAG---AC-GTGATT--C---CTGAT--T-GA-TGCT-G--T---AGAG--TTT-CAT-GG-TGCT-G------C--C-A---------------TTTCCA--CG-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTT----CAT-C-ACT-CA--GACA---G--GCC--A-C---A-T-TG---AGA-A--GAT--TCC--ATG---T--AT-ACT--CAG-TGG-GT--A--T-----GG---T--G-----GT-GAC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA--TCTC--TGTGTTG--T-C-TTT-ATA--GTG-TAACC-ATATTCTT
gi|115081                     :  CCCGAACTTAGTTGTGATTGAC-TTGA--GTAG-------TGATC--C---CTGAT--T-GA-TGCT-G--A---AGAG--TTT-TAA-GG-TTCT-G------A--T-A---------------TCTCCA--TA-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTT----CAT-C-ACT-AA--GACA---G--GCC--A-C---A-T-TG---TAA-A--GGT--TAT--TTG---T--AT-ACT--CAT-TGT-GT--A--T-----GG---T--G-----GT-GAC--T-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA--TTTG--TGTGTTG--T-C-TTT-ATA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
gi|115082                     :  CCCTGACCTTGTTCTGATTGAC-TTTA--GTAG-------TGATC--C---CTGAT--T-GA-TGCT-G--A---AGAG--TTT-CAT-GG-TGCT-G------C--C-A---------------TATCCA--CG-G--G-TC-CAG--A-TT-T---CTT----CAT-C-ACC-CT--GACA---G--GCC--A-C---A-T-TGT--AAA-G--GA--------ATG---T--AT-ACC--CAG-TGC-AT--A--T-----GG---A--G-----GT-GAC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-A--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA--TTTC--TGTGTTG--T-C-TTT-GTA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
gi|115079                     :  CCCAGACTTGGTTGTGATTGAC-TTGA--GTAG-------TGATG--G---CTGAT--T-GA-TGCT-G--T---AGAG--TTT-CAT-GA-TGCT-G------C--T-A---------------TCTCCA--CT-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CCT----CAT-C-ACT-CA--GACA---G--GCC--A-C---G-T-TGT--ACA-G--GA-----CAGATC---T--AT-AGT--CAG-TGT-AT--A--T-----GG---T--G-----GT-GCC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--GAA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA--TTTC--TGTGTTG--T-C-TTT-ATG--CTG-TAACC-AGGTTCCT
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gi|115085                     :  CCCAGACTTGGTTATGATTGAC-TTGA--GT------T-CTGATC--C---CTGAT--T-GA-TGCT-G--TT--AGAG--TTT-CATTGG-TGCT-G------CTCC-A---------------T--CCA--CC-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CCT----CATTC-ACT-CA--GACA---G--GCC--A-C---A-T-TG---CGT-A--AGT--CTT--ACC---C--AT-GCT--CAG-TGT-GT-----T-----AGT--T--G-----GTAAAC--A-GTCT-GT-G-T-TCA----TCAATAGCACATATTA-T-C--GT----TT-G-A-T--G--ACG----GGG----GA-G--G---A-TCGGT-CAGCTTTCTGGG-GAT-TTTC--TGTG-TG--TAC-TTT-ATA--CTG-TAACC-A-ATTCTT
gi|115084                     :  CCCAGACTTGGTTGTGATTGAC-TTGA--GT-----TC-GTGATC--C---CTGATGCT-GA--GCTCGTTT---AGAG--TTT-CAT-GGTTGCT-G------C--T-AC--------------CTCCCA--CG-TCGA-TC-CAG--A-TTAT---CCT----CATCC-ACT-CA--GATA---G--GCC--A-C---ATT-TG---CAC-A--GGT----C--ATA---TAGATAATT--CAGCTAT-TT--AATT-----GG---CTAG-----GT-GAT--G-GTCTCGTGA-T-TCATCTTTCA--AGCA------G-CTT--GT----TT---A-T--GCAACA----GGA----GA-G--G---ATT-A---CAGCTTTCTGGGCGA--TTTC--TGTGTTGT-T-C-TTTGATAC-CTG-TAACA-A-GTTCTT
gi|115086                     :  CCCAGACTTGGTTGTGATTGAC-GTGA--GTAG-------TGATC--C---CTGAT--T-GA-TGCT-G--T---AGAG--TTT-CAT-GG-TGTT-G------G--T-G---------------TCTCCA--CA-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CCT----CAT-A-ACT-CA--GACA---G--GCC--A-C---A-T-CG---
gi|115089                     :  CCCTGACTTGGTTTTTATTGAT-GTCA--GTAG----------TT--CA--CTC-T--T-GA-GGCT-A--A---GGAG--CTT-CAT-GA-GATT-G------T--C-A---------------TTTCCA--TG-C--G-TC-CAT--A-TT-T---CGT----TTT-C-ACT-TA--TACA---G--CTA--A-C---A-C-CG---AAA-A--G-----CC--CTA---T--AT-ACC--CGG-TGT-TT--A--T-----AGTTCT--G-----GT-G----A-GT-T-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G---T--GA----TT-----T--G--ACT----GGA----GA-A--GATAA-T-A---CAGC-TGCTGGT-GA--tataggt
gi|115090                     :  CCCTGATTTGGTTTCTATTGAT-GTCA--GTAG----------TT--CACTCTG------GA-GGTT-A--A---GGAG--CTT-CAT-GA-TTTC-G------T--T-C---------------TCCCCG--CA-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GAT----CAT-C-ACT-GA--GACA---G--CTA--A-C---A-C-TG---TAT-A--G----TCT--GT----T--AT-AAT--CAG-TGT-CT--G--T-----GG---T--G-----GC-GGTG-A-ATC--GTGG-T-TCA----TTA--AGCA------G---T--G------T-G-A-C--T--GCA----GGC----GATT--G---A-T-A---CAGC-TTCTGG
gi|115092                     :  CCCTGACTTGGTTTTTACCGAT-GTCA--GTAG-------TTTTC--C---CTGA------A-GGTT-G--A---CGAG--CCT-CAT-GA-TTTC-A------T--C-A---------------CCCCCA--CA-T--G-TC-CAT--A-TT-T---GTT----CTT-C-ACT-----GA--------GCTTAA-C---A-C-TG---AGA-A--G----TC----TG---TC-AT-ACC--CAG-TGT-CT--T--T-----GT---T--G-----GC-GATG-A-GTC--GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------A-T-G--GT----TT-GAA-T--G--A-A----GGA----GG-A--A---A-T-A---CAGT-TTCTTGT-GG--TTTC--tgtttc
gi|115087                     :  CCCTGACTTGGTTTGTATTGAT-GTCA--GTAG-------TTTTC--C---CTG------GA-CGTT-G--A---GGAG--CTT-CAA-GA-TGTT-G------T--T-A---------------TT-CCG--CG-T--G-TC-CAG--A-CT-T---TTT----CGT-C-AGT-GAGTGATA-----------A-C---A-C-TG----------TATG-TCC--GTA---TTCAT-ATC--CAG-TGT-CT--G--T-----GG---T--G-----GC-GGT--G-AATA-GCGG-T-TCA----GCA--GGCA------G-T-T--GT----T------T--G--ACT----GGA----GA-G--G---A-T-GATACAGC-AACTGGT-GA--CTTCATTGTGTCG--C-CATTT-attgcttcgccatgttctt
gi|115091                     :  CCCTGACCTGGTTTGTATTGAT-GTCA--GT------C--T--TT--CACTCTG------GA-GGTT-G--A---GGAG--CTT-CAT-GG-TATT-G------T--T-A---------------CCCCCA--CA-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GTT----CTT-C-ACT-CA--GACA---G--CTA--A-C---A-C-CG---CGT-A--G----TC----TG---TC-AT-ACC--CAG-TGT-CT--A--G-----GG---T--G-----GC-GGTG-A-ATC--GCGG-T-TCA----TCA--ATCA------A-T-G--GT----T------T--G--ACA----G------GA-G--G---A-------------TCTGGT-GAATTCAT--TGTGTCG--C-C-TT
gi|115088                     :  CCCTGATTTGGTTTGTATTGA---TGACAGTAGTTTAC---------C---CTG------GA-GGTT-G--A---GGAG--CTT-CAT-GA-TTTC-G------T--T-A---------------TCCCCG--CG-T--G-TC-CAA--A-CC-T---TTT----CTT-C-ATT-GA--CACA---G--CTA--A-C---A-C-TG---TAT-A--G-T--TC----TT---C--AT-ACC--CAG-TGT-CT--A--T-----GG---T--G-----GC-GGT--G-AATT-GCGG-G-TCA----TCA--AGGA------A-T-G--GT----TT-G-ACT--G--G-A----GCA----GA-C--G---A-T-A---CAGC-TTCTGGT-GA--CTTC-----ATTG--T-C-Tgttcttctgtgataatg
gi|115093                     :  CCCTGACTTTGTTTTTATTGA---TGC--A-AG---AA-GT--TTACC---CTG------GA-GGTT-A--A---GGAG--CTT-CAT-GA-TATT-A------T--T-G---------------TTCCCA--CA-T--G-TC-CAG--ACTT-T---CTT----T-T-C-ACT-GA--GACATC-G--A----A-C---A-C-TG---TG-----TAC--TCT--AC----T--AT-ACC--CAG-TGT-TT--A--T-----GG---T--G-----GC-GGT--G-GGTC-GCGG-T-TCG----TCA--AGCA------G-T-G--AT----TT-G-G-T--cggcatgttctt
gi|115095                     :  CCCTGACTTGGTTTTTATTGA---TGACAGTAGTTTAC---------C---CTGA------A-CGGT-G--A---GGAG--CTT-CAT-GA-TGTT-G------G--T-A---------------TCCCCA--CA-C--G-TC-CAG--A-CT-T---GAT----TTT-C-ACC-GA--GACA---G--CTA--A-C---A-C-TG---AAT-A--GATAGTC------------AT-ACC--CAG-TGT-CT--G--T-----GG---T--G-----G
gi|115099                     :  CCCTGAATTTGTTTTGACTGTA-TTGA--GTA----AC-TTG-TG--C---CT-----T-GA--ACA-G--TCTAAGCA--TTT-CAT-AT-CACT-G------C--T-T---------------CTTGCAACCT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTC------T-C-ACT-CA--GACA---G----T--AGC---A-T--G---CGG-A--GGT--TT---------T--TT-CCT--CAG-TAT-TT--ACCT-----GG---T--A------T-AAC--A-AGCT-CTGG-T-TCA----TCC--ATCA------G-T-T--CT----TG-G-G-T--G--A
gi|115097                     :  CCCTGACTCGGTTTCGATTGAT-GTCA--GTAG----------TT--C---CCCCT--G-GA-GGTT-A--A---GGAG--CTT-CAT-CA-TTTC-G------T--T-A---------------TTTCCA--CT-T--G-TC-CAT--A-TT-T---CTT----C
gi|115096                     :     GAACTGGTTTGTTATTGAT-TTG----TCG---A--GTCGTT--CACTCTG------GAGCGTT-G--A---GGAG--CTT-CATTGG-TGTT-G------T--CTA---------------CTCCCA--CA-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GTT----CTT-C-ACT-CA--GACA---G--CTA--A-C---A---CG---CGT-A--GTC--TCC---TC---C--AT-ACT--CAG-TGT-CT--A--TAGGTCGG---C--G-----GT-GA---A-G--C-GCGG-G-TCA----TCA--tctgaaacacctaacactgcagagata
gi|115100                     : cccatGACTTGGTTGTGATTGAC-TTGA--GTAG-------TGATC--C---CTGTT--T-TA-TGCT-G--A---AGAG--TTT-CAT-GG-TGCT-A------T--C-A---------------TTTCCA--CACT--GATCGCAGTAA-TT-TTCGCTTTTGCTAT-A-ACG-CA--GACATTTG----C--A-C---A-C-TG---TAA-A--GGTAATTT--ATG---------ACC--CTG-T----T--G--T-----GG---T--GAGGCTGT-AGCAGA-GTCT-GTGG-TATCA----TCA--A--A------GAC-TAGGT----TTAG-A-T--G---CACTATGGA----GA-GC-G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA----TT--TGTGTTGCTT-C-TTC-TTA--CTG-TTACC--TGTCCTT
gi|115101                     :      GAGTTGGTTGTGATTGAC-TTGA--GTAG-------TGTCC--C---CTGAT--T-GA-TGCT-G--T---AGAG--TTT-CAT-GT-TGTC-GGTATCTC--T-AAATATGGTGTTTTTTTTTCCA--CT-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CAT----CAT-C-ACT-CA--GACA---G--GCC--A-C---A-T-CG---TAA-A--GGT----C--ATC---TTCAT-ACC--CA
gi|115102                     :      GACTTGGTTTTTATTGAT-GTCA--GTAGTTTACCATGGT---------GGT--T-GA-------------GGAG--CTT-CTT-GA-TGTT-G------T--T-T---------------TCCCCA--CG-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GTT----CTT-C-ACT-GA--CACA---G--CTA--A-C---A-C-TG-----------------T--ATGGTCT--AT-ATC--CAG-TGT-CT--A--T-----GG---T--G-----GC-GGTG-A-GTA--GCAA-T-TCA----TCA--AGTA------A-C-G--CT----TT-G-A-CTGG--AC------GA----CA-T--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGT-GA--
gi|115104                     :       ACTTTGGTGTGAATGAC-TTGA--TT--------GTGAT-------CTGAT--TTGA-TG-T-G------AGAG--TTTTCAT-GG-TGCT-G---------------------------TTTTCA--CA-T--G-TC-CAG--A-TTCT---TTT----CAA-C-ACTACA--GAAA---GGCGCC--A-CA--A-T-TG---------------TAC--ACG---T--AT-ACTACCAG-AGT-GTTAA--TGA---GG---T--G-----GG-AAC--GTGCTT-GTGT-T-TCA----TAA--ACTA------G-C-TC-GTGATATC-G-A-C-----ACA----GCAACAGGA-G--G---C-T-G---CAGC-TTC--AG-GA--TTTC--T-TGTTG--T-C-CTTGATAATGTG-TAGTTAATGTTCTT
gi|115103                     :                                        -GTAATTTAC---CT--T--C-GA-GATT-G--T---AAAG--CCT-TAT-GA-TTTT-G------T--C-A---------------TTCCCA--AG-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTT----CAT-C-ATT-AA--GACA---T--ATT--A-C---A-C-T-----GA-A--TAA--TCT--ATA------AT-ACC--CAG-TAT-TT--A--T-----AT---T--G-----AC-AAT--A-AGCT-CAGG-T-TCG----GCA--AGCA------G-T-G--AT----TT-G-ACT--G--AAA----GGA-----A-G--G---A-T-
gi|115094                     :                                                 gacgtggttttcaaagatctca--T---AAAGCATTT-CAT-AT-CACT-G------A--C-T---------------TTTGCA--CT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTT----CTT-C-ACT-CA--GACA---G--GTA--A-C---A-C-TG---CGG-A--GTT--T-----TT---C--AT-ACC--CAG-TAT-TT--G--T-----TG---T--A-----GT-GAC--A-AGCT-CTGG-T-TCA----TCC--ATCA------G-T-T--CT----TT-G-tctgccattgatgtttctat
gi|115105                     :                                  ccctgattttgctttgattgtactgataactgtaccttgaacatGAG--CTT-CAT-GA-TTTC-G------T--T-A---------------TATCCA--TT-T--G-TA-CAG--C-TT-T---CTT----CTG-CAACG-CA---ACA---A--TTA--A-T---A-T-TGTATAGATATTGAT--GCC--CTG---C--AG-TGT--CAA-TGG--------T-----GG---C--G-----GT-G----A-ATC--GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------A-T-G--AT----TT-G-ACT--G--G-A----GGA----GA-T--G---A-T-A---CAGC-TTCTGG------TATC--TTCGTTG--T-C-T
gi|115098                     :                                                                                 --TTT-CAT-AT-CACT-G------A--C-T---------------TGTGCA--CT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTT----CTT-C-ACG-CA--GACA---G--GTA--A-C---A-C-TG---CGG-A--TGT--T-----TT---T--AT-ACC--CTG-TGT-TT--A--T-----TG---T--A-----TT-GACT-A-G-CT-CTGG-T-TCA----TCcgccatgttct
gi|115106                     :                                   cccagatattgttttgattgtattgataactgtaccttggacattaaatca-CAT-GG-TGCT-G------C--C-A---------------TATCCA--CG-T--G-TC-CAA--A-TT-T---CCT----CAT-C-ACT-CA--GACA---G--GCC--A-C---A-T-TG---
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Reference ( family-547 )      :                                                                        CCCTGACTTGGTTN-TGATTG-AC-TTG---A--G-TA----G---TGATCCCTGATT-GANGC--TG--AG--------GAGCTTCA-T-GG-TGCT-GT-TATC---------------------T-C-CA--CG-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTTC-NT-C----A-CT-CAGACA--GGCN--ACA-C---TGCGN--AGGT--TCCATGT--AT-AC--CC---AG-TGT-C-TA--T--GG---T--GGC-G----AC--A-GTCT-GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TTTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
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Reference ( family-547 )      :  CCCTGACTTGGTTT-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGNTCCCTGATT-GAN-GCTG--AG--------GAGCTTCA-T-GG-TGCT-GT-TATC---------------------T-C-CA--CG-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTTC-NT-C----A-CT-CAGACA--GGCN--ACA-C---TGCGN--AGGTTC-CATNT--AT-AC--CC---AG-TGT-C-TA--T--GG---T--GGC-G----AC--A-GTCT-GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TTTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
gi|115079                     :  CCCAGACTTGGTTG-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGATGGCTGATT-GAT-GCTG--TA--------GAGTTTCA-T-GA-TGCT-GC-TATC---------------------T-C-CA--CT-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CCTC-AT-C----A-CT-CAGACA--GGCC--ACG-T---TGTAC--AGGACA-GATCT--AT-AG--TC---AG-TGT-A-TA--T--GG---T--GGT-G----CC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--GAA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TTTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATG--CTG-TAACC-AGGTTCCT
gi|115080                     :  CCCGGACTTGGTTG-CGATTG-AC-TTG---A--G-TAGACGTGATTCCTGATT-GAT-GCTG--TA--------GAGTTTCA-T-GG-TGCT-GC-CATT---------------------T-C-CA--CG-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTTC-AT-C----A-CT-CAGACA--GGCC--ACA-T---TGAGA--AGATTC-CATGT--AT-AC--TC---AG-TGG-G-TA--T--GG---T--GGT-G----AC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TCTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATA--GTG-TAACC-ATATTCTT
gi|115081                     :  CCCGAACTTAGTTG-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGATCCCTGATT-GAT-GCTG--AA--------GAGTTTTA-A-GG-TTCT-GA-TATC---------------------T-C-CA--TA-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTTC-AT-C----A-CT-AAGACA--GGCC--ACA-T---TGTAA--AGGTTA-TTTGT--AT-AC--TC---AT-TGT-G-TA--T--GG---T--GGT-G----AC--T-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TTTG--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
gi|115082                     :  CCCTGACCTTGTTC-TGATTG-AC-TTT---A--G-TAG---TGATCCCTGATT-GAT-GCTG--AA--------GAGTTTCA-T-GG-TGCT-GC-CATA---------------------T-C-CA--CG-G--G-TC-CAG--A-TT-T---CTTC-AT-C----A-CC-CTGACA--GGCC--ACA-T---TGTAA--AGG----AATGT--AT-AC--CC---AG-TGC-A-TA--T--GG---A--GGT-G----AC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-A--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TTTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-GTA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
gi|115083                     :  CCCAGACT-GGTTG-TGATTG-ACATTG---A--G-TAG---TGATCC-TGATT-GAT-GCTG--TA--------GAGTTTCA-T-GGCTGCTTGC-TACT---------------------T-C-CA--CT-TT-G-TC--AG--A-TT-TT--CCTC-AT-C----A-CT-CAG-CA--GGC-----A-C---TTCATTAAGATAA-CATG-------C--TC---AG-TGT-CATA--T--GG---A--GGT-G----AC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--G-----TT-G-A-T-----ACA----GGA----GG-GAAG---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GATTTTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATG--CTGCTAACC-ATGTTCTT
gi|115084                     :  CCCAGACTTGGTTG-TGATTG-AC-TTG---A--GTTCG---TGATCCCTGAT------GCTG--AGCTCGTTTAGAGTTTCA-T-GGTTGCT-GC-TACC---------------------TCC-CA--CG-TCGA-TC-CAG--A-TTAT---CCTC-ATCC----A-CT-CAGATA--GGCC--ACATT---TGCAC--AGGT---CATATAGATAAT--TC---AGCTAT-T-TAATT--GG---CTAGGT-G----AT--G-GTCTCGTGA-T-TCATCTTTCA--AGCA------G-CTT--GT----TT---A-T--GCAACA----GGA----GA-G--G---ATT-A---CAGCTTTCTGGGCGA-TTTC--TGTGTTGT-T-C-T--TTGATAC-CTG-TAACA-A-GTTCTT
gi|115085                     :  CCCAGACTTGGTTA-TGATTG-AC-TTG---A--G-TTC---TGATCCCTGATT-GAT-GCTGTTA---------GAGTTTCATT-GG-TGCT-GC-TCCA---------------------T-C-CA--CC-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CCTCATT-C----A-CT-CAGACA--GGCC--ACA-T---TGCGT--AAGTCT-TACCC--AT-GC--TC---AG-TGTGT-TAGTT--GG---T--A---A----AC--A-GTCT-GT-G-T-TCA----TCAATAGCACATATTA-T-C--GT----TT-G-A-T--G--ACG----GGG----GA-G--G---A-TCGGT-CAGCTTTCTGGG-GATTTTC--TGTG-TG--TAC-T--TT-ATA--CTG-TAACC-A-ATTCTT
gi|115086                     :  CCCAGACTTGGTTG-TGATTG-AC-GTG---A--G-TAG---TGATCCCTGATT-GAT-GCTG--TA--------GAGTTTCA-T-GG-TGTT-GG-TGTC---------------------T-C-CA--CA-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CCTC-AT-A----A-CT-CAGACA--GGCC--ACA-T---CGTAT--AGGT
gi|115087                     :  CCCTGACTTGGTTT-GTATTG-AT-GTC---A--G-TAG---TTTTCCCTG----GAC-GTTG--AG--------GAGCTTCA-A-GA-TGTT-GT-TAT----------------------T-C-CG--CG-T--G-TC-CAG--A-CT-T---TTTC-GT-C----A-GT-GAGT----GATA--ACA-C---TG--T--ATGTCCGTATTC--AT-AT--CC---AG-TGT-C-TG--T--GG---T--GGC-G----GT--G-AATA-GCGG-T-TCA----GCA--GGCA------G-T-T--GT----T------T--G--ACT----GGA----GA-G--G---A-T-GATACAGC-AACTGGT-GA-CTTCATTGTGTCG--C-CAT--TT-
gi|115088                     :  CCCTGATTTGGTTT-GTATTG-A---TG---ACAG-TAG---TTTACCCTG----GAG-GTTG--AG--------GAGCTTCA-T-GA-TTTC-GT-TATC---------------------C-C-CG--CG-T--G-TC-CAA--A-CC-T---TTTC-TT-C----A-TT-GACACA--GCTA--ACA-C---TGTAT--AG-TTC---TTC--AT-AC--CC---AG-TGT-C-TA--T--GG---T--GGC-G----GT--G-AATT-GCGG-G-TCA----TCA--AGGA------A-T-G--GT----TT-G-ACT--G--G-A----GCA----GA-C--G---A-T-A---CAGC-TTCTGGT-GA-CTTC-----ATTG--T-C-T----------CGG-----C-ATGTTCTT
gi|115089                     :  CCCTGACTTGGTTT-TTATTG-AT-GTC---A--G-TAG---T--TCACTC-TT-GAG-GCTA--AG--------GAGCTTCA-T-GA-GATT-GT-CATT---------------------T-C-CA--TG-C--G-TC-CAT--A-TT-T---CGTT-TT-C----A-CT-TATACA--GCTA--ACA-C---CGAAA--AG---C-CCTAT--AT-AC--CC---GG-TGT-T-TA--T--AGTTCT--GGT-G--------A-GT-T-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G---T--GA----TT-----T--G--ACT----GGA----GA-A--GATAA-T-A---CAGC-TGCTGGT-GA-
gi|115090                     :  CCCTGATTTGGTTT-CTATTG-AT-GTC---A--G-TAG---TTCACTCTG----GAG-GTTA--AG--------GAGCTTCA-T-GA-TTTC-GT-TCTC---------------------C-C-CG--CA-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GATC-AT-C----A-CT-GAGACA--GCTA--ACA-C---TGTAT--AG--TC-TGT-T--AT-AA--TC---AG-TGT-C-TG--T--GG---T--GGC-G----GTG-A-ATC--GTGG-T-TCA----TTA--AGCA------G---T--G------T-G-A-C--T--GCA----GGC----GATT--G---A-T-A---CAGC-TTCTGGT-G--TTTC--
gi|115091                     :  CCCTGACCTGGTTT-GTATTG-AT-GTC---A--G-TCT---TTCACTCTG----GAG-GTTG--AG--------GAGCTTCA-T-GG-TATT-GT-TACC---------------------C-C-CA--CA-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GTTC-TT-C----A-CT-CAGACA--GCTA--ACA-C---CGCGT--AG--TC-TGTC---AT-AC--CC---AG-TGT-C-TA--G--GG---T--GGC-G----GTG-A-ATC--GCGG-T-TCA----TCA--ATCA------A-T-G--GT----T------T--G--ACA----G------GA-G--G---A-------------TCTGGT-GA-ATTCATTGTGTCG--C-C-TTGTT-CTT--CTG-TGATA-ATG
gi|115092                     :  CCCTGACTTGGTTT-TTACCG-AT-GTC---A--G-TAG---TTTTCCCTGA----AG-GTTG--AC--------GAGCCTCA-T-GA-TTTC-AT-CACC---------------------C-C-CA--CA-T--G-TC-CAT--A-TT-T---GTTC-TT-C----A-CT---GA-----GCTTAACA-C---TGAGA--AG--TC-TGTC---AT-AC--CC---AG-TGT-C-TT--T--GT---T--GGC-G----ATG-A-GTC--GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------A-T-G--GT----TT-GAA-T--G--A-A----GGA----GG-A--A---A-T-A---CAGT-TTCTTGT-GG-TTTC-----ATTG----C-T--TC------------GCC-ATGTTCTT
gi|115093                     :  CCCTGACTTTGTTT-TTATTG-AT-GCA---A--G-AAG---TTTACCCTG----GAG-GTTA--AG--------GAGCTTCA-T-GA-TATT-AT-TGTT---------------------C-C-CA--CA-T--G-TC-CAG--ACTT-T---CTT--TT-C----A-CT-GAGACA--TCGA--ACA-C---TGTGT--A--CTC-TA-CT--AT-AC--CC---AG-TGT-T-TA--T--GG---T--GGC-G----GT--G-GGTC-GCGG-T-TCG----TCA--AGCA------G-T-G--AT----TT-G-G-T--
gi|115094                     :  CCCTGATTTTGCTT-TGATTGTAC-T-G---A--T-AAC---TGTACCTTGA----AC-ATTA--AA--------GCATTTCA-T-AT-CACT-GA-CTTT---------------------T-G-CA--CT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTTC-TT-C----A-CT-CAGACA--GGTA--ACA-C---TGCGG--AGTTT----TTC--AT-AC--CC---AG-TAT-T-TG--T--TG---T--AGT-G----AC--A-AGCT-CTGG-T-TCA----TCC--ATCA------G-T-T--CT----TT-G-
gi|115095                     :  CCCTGACTTGGTTT-TTATTG-A---TG---ACAG-TAG---TTTACCCTGA----AC-GGTG--AG--------GAGCTTCA-T-GA-TGTT-GG-TATC---------------------C-C-CA--CA-C--G-TC-CAG--A-CT-T---GATT-TT-C----A-CC-GAGACA--GCTA--ACA-C---TGAAT--AGAT----AGTC--AT-AC--CC---AG-TGT-C-TG--T--GG---T--GG
gi|115096                     :  CCATGAACTGGTTTGTTATTG-AT-TTGTCGA--G-TCG---TTCACTCTG----GAGCGTTG--AG--------GAGCTTCA-TTGG-TGTT-GTCTACT---------------------C-C-CA--CA-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GTTC-TT-C----A-CT-CAGACA--GCTA--ACA-C----GCGT--AGTCTC-C-TCC--AT-AC--TC---AG-TGT-C-TA--TA-GG---TC-GGC-G----GTGAA-G--C-GCGG-G-TCA----TCA--
gi|115097                     : cCCCTGACTCGGTTT-CGATTG-AT-GTC---A--G-TAG---TTCCCCCTG----GAG-GTTA--AG--------GAGCTTCA-T-CA-TTTC-GT-TATT---------------------T-C-CA--CT-T--G-TC-CAT--A-TT-T---CTTC-T---------CT-GAAACA--CCTA--ACA-C---TGCAG--AGAT
gi|115098                     :  CCCAGATATTGTTT-TGATTG-TA-TTG---A--T-AAC---TGTACCTTG----GAC-ATTA--AA--------TCATTTCA-T-AT-CACT-GA-CTTG---------------------T-G-CA--CT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTTC-TT-C----A-CG-CAGACA--GGTA--ACA-C---TGCGG--ATGTT----TTT--AT-AC--CC---TG-TGT-T-TA--T--TG---T--ATT-G----ACT-A-G-CT-CTGG-T-TCA----TCa
gi|115099                     :  CCCTGAATTTGTTT-TGACTG-TA-TTG---A--G-TAACT-TGTGCCTTGAAC--AG-TCTA--AG--------CA-TTTCA-T-AT-CACT-GC-T-TC---------------------T-TGCAACCT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CT---CT-C----A-CT-CAGACA---GTA--GCA-----TGCGG--AGGTT----TTT---T-CC--TC---AG-TAT-T-TACCT--GG---T---AT-A----AC--A-AGCT-CTGG-T-TCA----TCC--ATCA------G-T-T--CT----TG-G-G-T--G--A
gi|115100                     :      GACTTGGTTG-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGATCCCTGTTT-TAT-GCTG--AA--------GAGTTTCA-T-GG-TGCT-AT-CATT---------------------T-C-CA--CACT--GATCGCAGTAA-TT-TTCGCTTT-TG-CTATAA-CG-CAGACATTTGC---ACA-C---TGTAA--AGGT---AATTT--ATGAC--CC------TGT---TG--T--GG---TGAGGCTGTAGCAG--A-GTCT-GTGG-TATCA----TCA--A--A------GAC-TAGGT----TTAG-A-T--G---CACTATGGA----GA-GC-G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TT----TGTGTTGCTT-C-T--TC-TTA--CTG-TTACC--TGTCCTT
gi|115101                     :      GAGTTGGTTG-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGTCCCCTGATT-GAT-GCTG--TA--------GAGTTTCA-T-GT-TGTC-GG-TATCTCTAAATATGGTGTTTTTTTTT-C-CA--CT-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CATC-AT-C----A-CT-CAGACA--GGCC--ACA-T---CGTAA--AGGT---CATCTTCAT-AC--CC---A
gi|115102                     :      GACTTGGTTT-TTATTG-AT-GTC---A--G-TAG---TTTACCATGGT----G-GTTG--AG--------GAGCTTCT-T-GA-TGTT-GT-TTTC---------------------C-C-CA--CG-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GTTC-TT-C----A-CT-GACACA--GCTA--ACA-C---TGTAT--GG-------TCT--AT-AT--CC---AG-TGT-C-TA--T--GG---T--GGC-G----GTG-A-GTA--GCAA-T-TCA----TCA--AGTA------A-C-G--CT----TT-G-A-CTGG--AC------GA----CA-T--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGT-GA-
gi|115103                     :      GACGTGGTTT-TCAAAG-AT-CTC---A--G-TAA---T-TTACCT--TC-GAG-ATTG--TA--------AAGCCTTA-T-GA-TTTT-GT-CATT---------------------C-C-CA--AG-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTTC-AT-C----A-TT-AAGACA--TATT--ACA-C---TGAAT--AA--TC-TATA---AT-AC--CC---AG-TAT-T-TA--T--AT---T--GAC-A----AT--A-AGCT-CAGG-T-TCG----GCA--AGCA------G-T-G--AT----TT-G-ACT--G--AAA----GGA-----A-G--G---A-T-T---CTGC-CATTGAT-G--TTTC--TAT
gi|115104                     :       ACTTTGGTG-TGAATG-AC-TTG---A--T-T-G---TGATC--TGATTTGAT-G-TG--AG--------AGTTTTCA-T-GG-TGCT-GT-T------------------------T-T-CA--CA-T--G-TC-CAG--A-TTCT---TTTC-AA-C----A-CTACAGAAA--GGCG--CCA-CAATTG---------TA-CACGT--AT-ACTACCAG-AG-TGT-T-AA--TGAGG---T--GGG-A----AC--GTGCTT-GTGT-T-TCA----TAA--ACTA------G-C-TC-GTGATATC-G-A-C-----ACA----GCAACAGGA-G--G---C-T-G---CAGC-TTC--AG-GA-TTTC--T-TGTTG--T-C-C--TTGATAATGTG-TAGTTAATGTTCTT
gi|115105                     :                                                                     --------GAGCTTCA-T-GA-TTTC-GT-TATA---------------------T-C-CA--TT-T--G-TA-CAG--C-TT-T---CTTC-TG-C----AACG-CA-ACA--ATTA--ATA-T---TGTAT--AGAT----ATTG--AT-GC--CCTGCAG-TGT-C-AA--T--GG---T--GGC-G----GTG-A-ATC--GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------A-T-G--AT----TT-G-ACT--G--G-A----GGA----GA-T--G---A-T-A---CAGC-TTCTGG-----TATC--TTCGTTG--T-C-T--C-------------GCC-ATGTTCT
gi|115106                     :                                                                                   CA-T-GG-TGCT-GC-CATA---------------------T-C-CA--CG-T--G-TC-CAA--A-TT-T---CCTC-AT-C----A-CT-CAGACA--GGCC--ACA-T---TG
gi|115107                     :                                                                                                                               -CA--CT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTTC-TT-C----A-CT-CAGACA--AGTA--ACA-T---TGCGC--AGTTTC----TC--AT-AC--CC---AG-TAT-T-TA--C--TA---A--AGT-G----AC--A-AGCC-CTGG-T-TCA----TCC--ATCA------G-T-T--CT----TT-G-t
gi|115108                     :                                                                                                                               -CA--CT-T--G-CC-CAG--G-AT-T---CTTC-TT-C----A-CT-CAGACA--GG-T--ACATC---TGCGG--AGGCTT---TAT--AT-AC--CC---AGATAT-T-TA--C--TG---T---GT-G----AC--A-GCCT-GTGGCT-TCA----TC

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lowQualScore                  :     .         .. .    . ...  ... .. .   ... ...     ....  .. .  ..  ........        . . ..    . .. . ...................... . .  .. .. .. .  .   .. .  . ...    .. . ....   .      ..  ....   . ...  .....  ............  .  .. ... ..  .   ...  .. ..  ... ..   . ........ . . .. .  . .   ....   ..    ...... ......  ....  . . . .. .. . ....   ....  .... ... . .....    .      ..  .    ..       .. . . ..  ......   .     . .      
lowQualScore                  :     7         44 6    5 222  777 22 5   888 555     0000  11 3  11  44444444        4 4 33    4 11 1 4444444444444444444444 4 3  88 88 22 3  3   88 3  7 777    33 3 2222   3      88  9999   7 333  88888  333333333333  0  00 666 00  1   666  33 77  777 88   6 00000000 6 0 22 2  6 6   4444   44    222222 888888  9999  8 8 0 88 99 1 7777   7777  7777 999 2 33333    4      11  4    99       88 9 9 99  999999   1     1 4      
consensus                     :  CCCTGACTTGGTTT-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGNNCCCTGATT-GAN-GCTG--AG--------GAGCTTCA-T-GG-TGCT-GT-TATC---------------------T-C-CA--CG-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTTC-NT-C----ACT-CAGACA--GGCN--ACA-C---TGCGN--AGGTTC-CATNT--AT-AC--C---C--AG-TGT-C-TA--T--GG---T--GGC-G----AC--A-GTCT-GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TTTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
Reference ( family-547 )      :  CCCTGACTTGGTTT-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGNNCCCTGATT-GAN-GCTG--AG--------GAGCTTCA-T-GG-TGCT-GT-TATC---------------------T-C-CA--CG-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTTC-NT-C----ACT-CAGACA--GGCN--ACA-C---TGCGN--AGGTTC-CATNT--AT-AC--C---C--AG-TGT-C-TA--T--GG---T--GGC-G----AC--A-GTCT-GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TTTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
gi|115079                     :  CCCAGACTTGGTTG-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGATGGCTGATT-GAT-GCTG--TA--------GAGTTTCA-T-GA-TGCT-GC-TATC---------------------T-C-CA--CT-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CCTC-AT-C----ACT-CAGACA--GGCC--ACG-T---TGTAC--AGGACA-GATCT--AT-AG--T---C--AG-TGT-A-TA--T--GG---T--GGT-G----CC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--GAA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TTTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATG--CTG-TAACC-AGGTTCCT
gi|115080                     :  CCCGGACTTGGTTG-CGATTG-AC-TTG---A--G-TAGACGTGATTCCTGATT-GAT-GCTG--TA--------GAGTTTCA-T-GG-TGCT-GC-CATT---------------------T-C-CA--CG-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTTC-AT-C----ACT-CAGACA--GGCC--ACA-T---TGAGA--AGATTC-CATGT--AT-AC--T---C--AG-TGG-G-TA--T--GG---T--GGT-G----AC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TCTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATA--GTG-TAACC-ATATTCTT
gi|115081                     :  CCCGAACTTAGTTG-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGATCCCTGATT-GAT-GCTG--AA--------GAGTTTTA-A-GG-TTCT-GA-TATC---------------------T-C-CA--TA-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CTTC-AT-C----ACT-AAGACA--GGCC--ACA-T---TGTAA--AGGTTA-TTTGT--AT-AC--T---C--AT-TGT-G-TA--T--GG---T--GGT-G----AC--T-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-G--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TTTG--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
gi|115082                     :  CCCTGACCTTGTTC-TGATTG-AC-TTT---A--G-TAG---TGATCCCTGATT-GAT-GCTG--AA--------GAGTTTCA-T-GG-TGCT-GC-CATA---------------------T-C-CA--CG-G--G-TC-CAG--A-TT-T---CTTC-AT-C----ACC-CTGACA--GGCC--ACA-T---TGTAA--AGG----AATGT--AT-AC--C---C--AG-TGC-A-TA--T--GG---A--GGT-G----AC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--GT----TT-G-A-T--G--ACA----GGA----GA-A--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TTTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-GTA--CTG-TAACC-ATGTTCTT
gi|115083                     :  CCCAGACT-GGTTG-TGATTG-ACATTG---A--G-TAG---TGATCC-TGATT-GAT-GCTG--TA--------GAGTTTCA-T-GGCTGCTTGC-TACT---------------------T-C-CA--CT-TT-G-TC--AG--A-TT-TT--CCTC-AT-C----ACT-CAG-CA--GGC-----A-C---TTCATTAAGATAA-CATG-------C--T---C--AG-TGT-CATA--T--GG---A--GGT-G----AC--A-GTCT-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G-C-T--G-----TT-G-A-T-----ACA----GGA----GG-GAAG---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GATTTTC--TGTGTTG--T-C-T--TT-ATG--CTGCTAACC-ATGTTCTT
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gi|115089                     :  CCCTGACTTGGTTT-TTATTG-AT-GTC---A--G-TAG---TTCACTCT---T-GAG-GCTA--AG--------GAGCTTCA-T-GA-GATT-GT-CATT---------------------T-C-CA--TG-C--G-TC-CAT--A-TT-T---CGTT-TT-C----ACT-TATACA--GCTA--ACA-C---CGAAA--AG---C-CCTAT--AT-AC--C---C--GG-TGT-T-TA--T--AGTTCT--GGT-G--------A-GT-T-GTGG-T-TCA----TCA--AGCA------G---T--GA----TT-----T--G--ACT----GGA----GA-A--GATAA-T-A---CAGC-TGCTGGT-GA-
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gi|115091                     :  CCCTGACCTGGTTT-GTATTG-AT-GTC---A--G-TCT---TTCACTCTG----GAG-GTTG--AG--------GAGCTTCA-T-GG-TATT-GT-TACC---------------------C-C-CA--CA-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GTTC-TT-C----ACT-CAGACA--GCTA--ACA-C---CGCGT--AG--TC-TGTC---AT-AC--C---C--AG-TGT-C-TA--G--GG---T--GGC-G----GTG-A-ATC--GCGG-T-TCA----TCA--ATCA------A-T-G--GT----T------T--G--ACA----G------GA-G--G---A-------------TCTGGT-GA-ATTCATTGTGTCG--C-C-TTGTT-CTT--CTG-TGATA-ATG
gi|115092                     :  CCCTGACTTGGTTT-TTACCG-AT-GTC---A--G-TAG---TTTTCCCTGA----AG-GTTG--AC--------GAGCCTCA-T-GA-TTTC-AT-CACC---------------------C-C-CA--CA-T--G-TC-CAT--A-TT-T---GTTC-TT-C----ACT---GA-----GCTTAACA-C---TGAGA--AG--TC-TGTC---AT-AC--C---C--AG-TGT-C-TT--T--GT---T--GGC-G----ATG-A-GTC--GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------A-T-G--GT----TT-GAA-T--G--A-A----GGA----GG-A--A---A-T-A---CAGT-TTCTTGT-GG-TTTC-----ATTG----C-T--TC------------GCC-ATGTTCTT
gi|115093                     :  CCCTGACTTTGTTT-TTATTG-AT-GCA---A--G-AAG---TTTACCCTG----GAG-GTTA--AG--------GAGCTTCA-T-GA-TATT-AT-TGTT---------------------C-C-CA--CA-T--G-TC-CAG--ACTT-T---CTT--TT-C----ACT-GAGACA--TCGA--ACA-C---TGTGT--A--CTC-TA-CT--AT-AC--C---C--AG-TGT-T-TA--T--GG---T--GGC-G----GT--G-GGTC-GCGG-T-TCG----TCA--AGCA------G-T-G--AT----TT-G-G-T--
gi|115094                     :  CCCTGATTTTGCTT-TGATTGTAC-T-G---A--T-AAC---TGTACCTTGA----AC-ATTA--AA--------GCATTTCA-T-AT-CACT-GA-CTTT---------------------T-G-CA--CT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTTC-TT-C----ACT-CAGACA--GGTA--ACA-C---TGCGG--AGTTT----TTC--AT-AC--C---C--AG-TAT-T-TG--T--TG---T--AGT-G----AC--A-AGCT-CTGG-T-TCA----TCC--ATCA------G-T-T--CT----TT-G-
gi|115095                     :  CCCTGACTTGGTTT-TTATTG-A---TG---ACAG-TAG---TTTACCCTGA----AC-GGTG--AG--------GAGCTTCA-T-GA-TGTT-GG-TATC---------------------C-C-CA--CA-C--G-TC-CAG--A-CT-T---GATT-TT-C----ACC-GAGACA--GCTA--ACA-C---TGAAT--AGAT----AGTC--AT-AC--C---C--AG-TGT-C-TG--T--GG---T--GG
gi|115096                     :  CCATGAACTGGTTTGTTATTG-AT-TTGTCGA--G-TCG---TTCACTCTG----GAGCGTTG--AG--------GAGCTTCA-TTGG-TGTT-GTCTACT---------------------C-C-CA--CA-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GTTC-TT-C----ACT-CAGACA--GCTA--ACA-C----GCGT--AGTCTC-C-TCC--AT-AC--T---C--AG-TGT-C-TA--TA-GG---TC-GGC-G----GTGAA-G--C-GCGG-G-TCA----TCA--
gi|115097                     : cCCCTGACTCGGTTT-CGATTG-AT-GTC---A--G-TAG---TTCCCCCTG----GAG-GTTA--AG--------GAGCTTCA-T-CA-TTTC-GT-TATT---------------------T-C-CA--CT-T--G-TC-CAT--A-TT-T---CTTC-T--------CT-GAAACA--CCTA--ACA-C---TGCAG--AGAT
gi|115098                     :  CCCAGATATTGTTT-TGATTG-TA-TTG---A--T-AAC---TGTACCTTG----GAC-ATTA--AA--------TCATTTCA-T-AT-CACT-GA-CTTG---------------------T-G-CA--CT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTTC-TT-C----ACG-CAGACA--GGTA--ACA-C---TGCGG--ATGTT----TTT--AT-AC--C---C--TG-TGT-T-TA--T--TG---T--ATT-G----ACT-A-G-CT-CTGG-T-TCA----TCa
gi|115099                     :  CCCTGAATTTGTTT-TGACTG-TA-TTG---A--G-TAACT-TGTGCCTTGAAC--AG-TCTA--AG--------CA-TTTCA-T-AT-CACT-GC-T-TC---------------------T-TGCAACCT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CT---CT-C----ACT-CAGACA---GTA--GCA-----TGCGG--AGGTT----TTT---T-CC--T---C--AG-TAT-T-TACCT--GG---T---AT-A----AC--A-AGCT-CTGG-T-TCA----TCC--ATCA------G-T-T--CT----TG-G-G-T--G--A
gi|115100                     :      GACTTGGTTG-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGATCCCTGTTT-TAT-GCTG--AA--------GAGTTTCA-T-GG-TGCT-AT-CATT---------------------T-C-CA--CACT--GATCGCAGTAA-TT-TTCGCTTT-TG-CTATAACG-CAGACATTTGC---ACA-C---TGTAA--AGGT---AATTT--ATGAC--C---C-----TGT---TG--T--GG---TGAGGCTGTAGCAG--A-GTCT-GTGG-TATCA----TCA--A--A------GAC-TAGGT----TTAG-A-T--G---CACTATGGA----GA-GC-G---A-T-G---CAGC-TTCTGGG-GA-TT----TGTGTTGCTT-C-T--TC-TTA--CTG-TTACC--TGTCCTT
gi|115101                     :      GAGTTGGTTG-TGATTG-AC-TTG---A--G-TAG---TGTCCCCTGATT-GAT-GCTG--TA--------GAGTTTCA-T-GT-TGTC-GG-TATCTCTAAATATGGTGTTTTTTTTT-C-CA--CT-T--G-TC-CAG--A-TT-T---CATC-AT-C----ACT-CAGACA--GGCC--ACA-T---CGTAA--AGGT---CATCTTCAT-AC--C---C--A
gi|115102                     :      GACTTGGTTT-TTATTG-AT-GTC---A--G-TAG---TTTACCATGGT----G-GTTG--AG--------GAGCTTCT-T-GA-TGTT-GT-TTTC---------------------C-C-CA--CG-T--G-TC-CAG--A-CT-T---GTTC-TT-C----ACT-GACACA--GCTA--ACA-C---TGTAT--GG-------TCT--AT-AT--C---C--AG-TGT-C-TA--T--GG---T--GGC-G----GTG-A-GTA--GCAA-T-TCA----TCA--AGTA------A-C-G--CT----TT-G-A-CTGG--AC------GA----CA-T--G---A-T-G---CAGC-TTCTGGT-GA-
gi|115103                     :      GACGTGGTTT-TCAAAG-AT-CTC---A--G-TAA---TTTACCTT---C-GAG-ATTG--TA--------AAGCCTTA-T-GA-TTTT-GT-CATT---------------------C-C-CA--AG-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTTC-AT-C----ATT-AAGACA--TATT--ACA-C---TGAAT--AA--TC-TATA---AT-AC--C---C--AG-TAT-T-TA--T--AT---T--GAC-A----AT--A-AGCT-CAGG-T-TCG----GCA--AGCA------G-T-G--AT----TT-G-ACT--G--AAA----GGA-----A-G--G---A-T-T---CTGC-CATTGAT-G--TTTC--TAT
gi|115104                     :       ACTTTGGTG-TGAATG-AC-TTG---A--T-T-G---TGATC--TGATTTGAT-G-TG--AG--------AGTTTTCA-T-GG-TGCT-GT-T------------------------T-T-CA--CA-T--G-TC-CAG--A-TTCT---TTTC-AA-C----ACTACAGAAA--GGCG--CCA-CAATTG---------TA-CACGT--AT-ACTAC---CAGAG-TGT-T-AA--TGAGG---T--GGG-A----AC--GTGCTT-GTGT-T-TCA----TAA--ACTA------G-C-TC-GTGATATC-G-A-C-----ACA----GCAACAGGA-G--G---C-T-G---CAGC-TTC--AG-GA-TTTC--T-TGTTG--T-C-C--TTGATAATGTG-TAGTTAATGTTCTT
gi|115105                     :                                                                     --------GAGCTTCA-T-GA-TTTC-GT-TATA---------------------T-C-CA--TT-T--G-TA-CAG--C-TT-T---CTTC-TG-CA---ACG-CA-ACA--ATTA--ATA-T---TGTAT--AGAT----ATTG--AT-GC--CCTGC--AG-TGT-C-AA--T--GG---T--GGC-G----GTG-A-ATC--GCGG-T-TCA----TCA--AGCA------A-T-G--AT----TT-G-ACT--G--G-A----GGA----GA-T--G---A-T-A---CAGC-TTCTGG-----TATC--TTCGTTG--T-C-T--C-------------GCC-ATGTTCT
gi|115106                     :                                                                                   CA-T-GG-TGCT-GC-CATA---------------------T-C-CA--CG-T--G-TC-CAA--A-TT-T---CCTC-AT-C----ACT-CAGACA--GGCC--ACA-T---TG
gi|115107                     :                                                                                                                               -CA--CT-T--G-TC-CAG--A-AT-T---CTTC-TT-C----ACT-CAGACA--AGTA--ACA-T---TGCGC--AGTTTC----TC--AT-AC--C---C--AG-TAT-T-TA--C--TA---A--AGT-G----AC--A-AGCC-CTGG-T-TCA----TCC--ATCA------G-T-T--CT----TT-G-t
gi|115108                     :                                                                                                                               -CA--CT-T--G-CC-CAG--G-AT-T---CTTC-TT-C----ACT-CAGACA--GG-T--ACATC---TGCGG--AGGCTT---TAT--AT-AC--C---C--AGATAT-T-TA--C--TG---T---GT-G----AC--A-GCCT-GTGGCT-TCA----TC