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Reference ( gi|2671 ) : ATTCCGCCGCCACGTACATG-TACGTCCAAAGGCACC------GGAGG-----AA-CTCTG-GTTG----TCTGGGT-A---CGT-AA-CATCCC---------TAG--TCCATTCCACC-ATAT------G--A-CCG-GGCGA-ATA------T-----C-CTCCG--GAG-TG-TCC-------CAT-AGTC-T-CAAAAA-C-TT----------------GA-TTTCCC--AA-TCA-------CCAT-CCTG--CG---G-----TG-TC---AA-G-----ATCCA-T-AGGAGT--TC-TTC-TGGGTTCC---CG-TTGC--CAGGG---AACAAAC---TT-C-CC-TCTCC--AG---GAACA----TGGC-GCT-CA------A-G--------------T--TCA------A--CA---GT--AGCAC--CCTTTAC---A-------C-----ATCCT-CTC-TGCAACA-T---CGCA-AC--TAGA----TCCAAAGGACT-AC-C-CAGGCAG-AT-CCGAA---AGGAA---TTC-------CC--AC-T-AGCA---TGG-AAAGT-GCGA--GGC-ATCA-GCAGA--AT-CTCAGAGAG---TC----TCCGA-ATG--C-------TA--GGTTCCACC-TT-A-----CA-ATCTGC--C-AACTCCCAATCGAA-G----T--GAGGACGGCATAAGGC-AACGGAAATGGCGCT-G-ACA-T-A------TATCT--TCTGAGG-CA-ACA--AAA-CCCGAG-C-CTCG-CCTTGGGATTCCGATC
gi|2672 : ATTCCGCCGCCACGTACATG-TACGTCCAAAGGCACC------GGAGG-----AA-CTCTG-GTTG----TCTGGGT-A---CTT-AA-AATCCC---------TTG--TCCATTCCACC-ATAT------G--A-CCG-GGCGG-ATA------T-----C-CTCCA--GAG-TG-TCC-------CAT-AGTC-T-CAAAAA-C-TT----------------GA-TTTCCC--AA-TCA-------CCAT-CCTG--CG---G-----TG-TC---AA-G-----GCCCA-T-AGGAGT--TC-TCC-TGGGTCCC---CG-CTGC--CGGAA---AATAAGC---TTCC-CC-TCTCC--AG---GAAC-----TGGT-GCT-CA------A-G--------------T--TCA------A--CA---GT--AGCAC--CCTTTAC---A-------C-----AT-CT-CTC-TGCAACG-T---TGCA-AC--TAGA----TCCAAGGGACT-CC-C-CAGGCAG-AT-CCGAA---AGGTA---TTC-------CC--AC-T-AGCA---TGG-AAAGT-GCTA--GGC-ATCA-GCAGA--AT-CTCAGAGAG---TC----TCCGA-ATG--C-------TA--GGTTCCTCC-TT-A-----CA-ATCTGC--C-AACTCCCTATCGAA-G----T--GAGGAGGGCATAAGGC-AACGGAAATGGCGCT-G-ACA-C-A------TATCT--TCTGAGG-CA-ACA--AAACCCCGAG-C-CTCG-TCCTGGGATTCCGCTC
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gi|2683 : ACTCCGCAGCCAAATACAC-------CCAAAGGCACC------GGTGG-----AA-TCCTG-GCTGTTGCTCTGGGT-ATTTC---ATTA-CTTCC------------GC--CCATTC---------------A--A-CCG-GA-------TGG-ATG------T-----C-C-T
gi|2684 : CACG-T-CGTTTAAAGGAATG------GGAGGGGGTTAATCCCTG-GTTG----TCTCCGT-A-C-----------ATCG----------TAGA--CCCTCCGACCCATAT------A--AGCCAAGG-------CGG-ATACTAGTAT-----CGC-TT-CGG-C-TTTCCC-CAGCTTCA-GAGT-C---------TGGATTT-TCCAAA----TCAACGTTC---CTGAGCG---GTCT-C---AA-G-----ACCCA-T----TGGGTTC-TCCTG-GCGTCC---CGA-CTGT--TAAGGGGAAACA-A---AT-TT-C-CCT-CTCG--AA---GGAAA----TCGCAGCT------CAA-G--C--------------------TC--AACA---GT--AGTAC--CCTTTAC---A-------A-----ATCCTT-CTTTCAAAC---T-TC------GCA---CTCGATCCAAGGTT-TCCACC--AGGCAG-AT-C-GGG---AGGA--ATT---TTTGTGGGCCA-CT-AGCC---TGA-CAAGTGGCG--AGGTAATCA-ACAG--ACT-CTCAGAG---AGCT----TCCGATATGCAC-----TA--GGTTCCCATC-AATA-----TA-TTTGA--C-CGCTTCCTATCGAA-GTGG--GGAGGGCAT---------------GGT-GTGG-AC-ATC-A------TATCT---T---CTGAGA-CATACATCGACC-CC-AGTTCTCGT-CTGGGAGTCGCGCTC
gi|2685 : tccggcCCAC---CACG-TACGTCCAAAGGCACC------GGGGA-----AA-CCCTG-GTTG----TCTGGTT-A-CTT---A--A-CATCCC---------TAGC--CCATTCCACC-ATAT------G--A-GCG-GG-------CGG-ATA------T-----C-C-TC-CGGAT-TGTCTCTCAGCCTCC-AAAGTC---------TTGATTT-CTCAA-----TTACCAT-C---CTG--CG---GTGT-C---AA-T-----ACCCA-A-A--TGAGTTC-TCCTG-G-GTCC---CCG-CTCC--CAGGG---AACA-A---AC-TT-C-TCT-CTCC--AG---GAACA----TGGC-GTT------CAA-G--T--------------------TT--AACA---AT--AGCAA--CCTTTAC---A-------C-----ATCATC-TCTTCAA-C---G-TC------GCAA--CTCGATCCAGGGGA-CTCACC--AGGCAG-AT-CCGGG---AGGA--ATT---T-------CCA-CT-AGCA---TGG-AAAGTG-CG--AGGCA-TCA-GCAG--AAT-CTCAGAG---AGCC----TCCGA-ATAC-------TA--GGTTCC-ACC-A-TA-----CAATCTGC--CAAACTCCCTATCGAA-GTGG--AGAGGGCATAAAGC-AACGGAAATGGC-ACTG-AC-A-C-A------TATCT---T---CTGAGG-CA-ACA-AAATC-CC-AG-CCTCGTCCTTGGATTC-TGCTC
gi|2686 : CCA-GTGGACG-TAC-TTCAAAGGAATG------GGAGG-----AA-CCATG-GTTG----TCTGCGT-G-CTC---A--A-CATCCCAA-------TGAC--CC--TCTACC-ATAT------G--A-CC--GG-------CGG-ATA------
gi|2687 : ACGTCCACGATACGTC-AAAGGCACCCCATGGGAAGG-----AA-TCCTG-GCC-----TCTAGGT---CTCCGTA--A-C-TCCCAGAAAACAACAGCATCCG--CCACC-AAATCCCACTGCCA-CCA-GGACATACTCAG--TAC-----T-----C-C-TCACGGGCATATTCCCAAAACTTC--AAC-CAAGAGTACATGGATTTTCCCAAATCATTCAACGC-TAATCTG--CACCCGCGT-CCACAA-GCG---ACCTAAT-A--GGT-TCC-TCCTG-G-GTCCCGACCGACTGCAATAGGA---AACA-AACCAC-TT-CACCT-TTCC--AAAGCGAACACAACTCGC-GCCCACACGCAA-GCAC--------------------TCAAAACAAACGTGAAGCAC--CC-TTAC---AAAAATCCC-----CTCCTCTCCTGCCA-CCTTC-TC------GCAACCCTCGATCCAAGGGATTTCACC--AGGCAGTAT-CCGGGGCCAGGAACATTTCCC-------CCACCT-AGCACACTGACAAAGTG-CGACAGGTG--CA-GCAGATAATACTCAAAGAGAAGCT----TCGGA-ATGC-------TA--GGTTCC-ACCAA-TAACCCTCAATCTGCTTC-AAATTCCTATCGAACGTGGGAGAAGGAGATAAGG
gi|2688 : CATG-TA--TTCAAAGGCAT-------GGAGA-----A---CCTGTATTG----TCTGGGTTA-CTC---A--ATCATCCT---------CAGC--CTATTCCACC-ATAT------A--A-AGC-GG-------CGGCATA------T-----C-GAT---GAGC-TGTCCCAAAGCCTCC-GGAT-A---------TAGATTTTCCCAA-----TCA-CAT-A---CTG--TG---GGGTTC---AA-A-----ACC-A-T-A--GA--TTC-TC-TG-G-GCCG---ACG--TGT--CGGGG---AA-A-A---AC-TT-C-CCTTCGCC--AG---GAA
gi|2689 : CATG-TA--TTCAAAGGCAT-------GGAGA-----A---CCTGTATTG----TCTGGGTTA-CTC---A--ATCATCCT---------CAGC--CTATTCCACC-ATAT------A--A-AGC-GG-------CGGCATA------T-----C-GAT---GAGC-TGTCCCAAAGCCTCC-GGAT-A---------TAGATTTTCCCAA-----TCA-CAT-A---CTG--TG---GGGTTC---AA-A-----ACC-A-T-A--GA--TTC-TC-TG-G-GCCG---ACG--TGT--CGGGG---AA-A-A---AC-TT-C-CCTTCGCC--AG---GAA
gi|2690 : ACG-TACGTTCAAAGGAATG------GGAGG-----AA-CCATG-GTTG----TCTGCGT-A-CTC---A--A-CATCCC---------ATGA--CCACTCTACC-ATAT------G--A-CCG-GG-------CGG-ATA------
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gi|2692 : cccaaaagtcccatcagggcctat-A--GGAGTTT-TTCTG-G-ATCC---CCG-CTGC--CAGGG---AACA-A---AT-TT-C-CCT-CTCC--AG---GAACA----TGGC-GCT------CAA-
gi|2693 : CC--AG---GAA-A----TGGC-TCT------TAAAG--C--------------------TC--AACA---GC--AGCAC--C-TCTAC---A-------------ACCCTC-C-TGCAA-C---G-TC------GCAT--TTCGACTCAAGAGA-CTCACC--AGGCAG-AT-TTGAG---AGGA--CCT---C-------ACA-TT-ACCA---TGG-C-AGTG-CG--AGGCA-TCA-GCAG--AAT-C---GAG---AGCT----TCCGC-ATGCGAAACCGTA--GGTTCC-ACT-G-TA-----CAATCTGC--T-AACTCCCTACCGTA-GTGG--GGAGGACATAAGGCTAACGCAAATGGT-GCGGAACAA-C-A------TCTCG---T---CTGAGGCCA-ACA-TTA------A------ATCCTGGGATTC-CCCTC
gi|2694 : CC--AG---GAA-A----TGGC-TCT------TAAAG--C--------------------TC--AACA---GC--AGCAC--C-TCTAC---A-------------ACCCTC-C-TGCAA-C---G-TC------GCAT--TTCGACTCAAGAGA-CTCACC--AGGCAG-AT-TTGAG---AGGA--CCT---C-------ACA-TT-ACCA---TGG-C-AGTG-CG--AGGCA-TCA-GCAG--AAT-C---GAG---AGCT----TCCGC-ATGCGAAACCGTA--GGTTCC-ACT-G-TA-----CAATCTGC--T-AACTCCCTACCGTA-GTGG--GGAGGACATAAGGCTAACGCAAATGGT-GCGGAACAA-C-A------TCTCG---T---CTGAGGCCA-ACA-TTA------A------ATCCTGGGATTC-CCCTC
gi|2695 : CT------CAA-T--C--------------------TC--AAGA---GT--AGTAC--CCTTTAC---A-------A-----ATCCTT-CCTACAA-C---A-TC------GCAA--CTCAATCCAAGGGA-CTCACT--AGGCAG-AA-CAGAC---AAGA--ATT---C-------CCA-CT----------------TG-TG-------------------AT-ATCAGAG---AGCC----ACCAA-ATGC-------TA--GGTTCC-ACG-G-TA-----CA
gi|2696 : TT---C-------TCA-CT-AGCA---TGG-AAAGTG-CG--AGGCG-TCA-ACAG--AAT-CTCAGAG---AGTG----TCCAA-ATAC-------TA--AGTTCC-ACT-T-TA-----CAATCTGC--C-AATTCCCTATCGAA-GTGA--GGAGGGCATAAGGT-AACGGAAATGGT-GCTG-AT-A-C-A------TATCT---C---CTGAGG-CA-ACA-AAACC-CG-AG-CCTCGTCCTGGGATTC-CGCTC
gi|2697 : -GCAC--AAT-CTGAAAA---AGCC----TCCGA-AT-------------------------------------CTGC--C-AACTCCCTATCGAA-GTGG--GGAGGACCTAAGAC-TATAGAAATGGT-GCGG-AC-A-C-A------TATCG---T---CTGAGG-CA-ATA-TCACC-CC-AG-CCTCGTCCTGGGATTC-CGCTC
gi|2698 : ggcatcagcacatgcctcACGGGAATGGT-GTGG-AC-A-C-ACACTAGTATTT---T---CTGAAG-TA-ACA-TCACCACC-A---CTCGTCCTGGGATTC-CGATC
gi|2699 : AGATGGT-ATGA-AC-T-C-A------TATTT---T---CTGAGG-CA-ACA-TCTCC-CC-AG-CATCGTCCTAGGATTC-CACTC
gi|2700 : -C-A------TATCT---T---CTGAGG-CA-ACA-TCACC-CC-AG-CCTGGTCCTGG
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blockSeqs : ATGTAC C . . T . T . T . T AA . . . . G G . C CTAGTA . . A . . T AAAGTC T T A C A . . . . T . . CG . . G GA . . . CCG . . . . . . . T . . A G . C A . . . . . . . CAATGT C . GT . A . . . . . . . TT . . . A . . . . . . A . . . GAAACCG . . AA . . . . . TA . A A . . T . . C . AA . C G .
blockSeqs : ATGTAC C . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . T AAAGTA T T A C A . . . . . . . . . . G GG . . . CCT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . C C . G . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . AC . . T . . . . . A . . . . . . . . . . AA . A G .
blockSeqs : ATGTAC C . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T AGAGTC T . A C A . . . . . . . . . . G GG . . . CCT . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . C C . G . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . TC . C G .
blockSeqs : ATGCAC C . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T AGAGTC G . . A G . . . . . . . . . . G GG . . . CAA . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . C T . A . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . TC . C G .
blockSeqs : ACGTAC C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T AGAGTC G . . A T . . . . . . . . . . T GG . . . CAC . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . C T . G . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . AA . C A .
blockSeqs : ACGTAC G . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T AGAGTC G . . A T . . . . . . . . . . G GG . . . CAC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A T . T . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . AT . A G .
blockSeqs : ACGTAC C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T AGAGTC G . . A A . . . . . . . . . . G TG . . . CAC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A T . G . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . TT . G A .
blockSeqs : ACGTC C . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T AGAGTC G . . A G . . . . . . . . . . T TG . . . TCT . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A T . G . G . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . TT . C G .
blockSeqs : ATGTA G . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T AAAGTC G . . A G . . . . . . . . . . T GG . . . GCA . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A T . C . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . AA . C G .
blockSeqs : ATGTA C . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C AAAAC A . . G T . . . . . . . . . . G AG . . . CAC . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . G C . C . T . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . TC . C G .
blockSeqs : TA C . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A AAAAC G . . A G . . . . . . . . . . G AG . . . CGA . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A A . T . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . TC . C G .
blockSeqs : AC C . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A AAAAC T . . C A . . . . . . . . . . G G . . . CCG . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . C C . G . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . .
blockSeqs : A G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . GAGTC G . . A G . . . . . . . . . . G T . . . ACG . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . C C . G . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . .
blockSeqs : A C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . GGATA A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . ACG . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A T . G . T . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A G . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . GGATA A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . CCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : AGAGTC**********
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gi|2699 : AGATGGT-ATGA-AC-T-C-A------TATTT---T---CTGAGG-CA-ACA-TCTCC-CC-AG-CATCGTCCTAGGATTC-CACTC
gi|2700 : -C-A------TATCT---T---CTGAGG-CA-ACA-TCACC-CC-AG-CCTGGTCCTGG