lowQualScore                  :                               1                        111                    222       1                             1           1111111111         11              1111          111111                     111111111                              11111111              2                             
lowQualScore                  :       2              4        6         1   1  1 1     000    0  555     5555 000       2      1   1     1  1   1  77 1  22  22   9999999999 1 22 22 33  6 1 66666 1 0000   222    000000  22   1   1   1     666666666  55 22    22   1    1  22 1  00000000 1   33     3 1 1  1                        
lowQualScore                  :       .              .        .         .   .  . .     ...    .  ...     .... ...       .      .   .     .  .   .  .. .  ..  ..   .......... . .. .. ..  . . ..... . ....   ...    ......  ..   .   .   .     .........  .. ..    ..   .    .  .. .  ........ .   ..     . . .  .                        
lowQualScore                  :       2              4        8         7   7  7 7     444    9  888     7777 333       9      7   4     6  4   4  77 0  00  00   4444444444 5 99 11 99  8 5 00000 5 5555   777    444444  11   5   8   5     333333333  66 33    44   8    8  55 8  77777777 8   55     6 8 8  8                        
consensus                     : TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TC-A-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCA----CGGNCTCCGCAGGTAGGTCCTG-AACCCGTA-ATT-GC-NCTGC--GT--ATC-CN-TTTGATG-GC-C--T-CACCT-G-----G-CCAG-TGG---TGATG-----CA--CCG-ATCGCCTTCCCCT---GTGA--TCTNT--ATCT--CTG-GGGC-AT--C-CT-------CC-CCG-AGCCCA-CTC-AT-CCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
Reference ( gi|89799 )        : TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TC-A-TTTCTATTCCAGCAT--TCACCA----CATTCTTTGCATGTAGGTTCTG-AACCCATA-ATT-GC-TCAGC--GT--ATC-CA-TTTAATG-GT-C--T-AACTT-G-----G-CAAG-TGG---TGATA-----CA--CCG-ATCACCTCCCCCT---ATGA--TCTGT--ATCT--CTG-GGGC-AT--C-CT-------CC-CCG-GGCCCA-C-C-AT-CCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89800                      : TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TC-ATTTTCTATTCCAGCAT--TCACCA----CATTC-TTGCATGTAGGTTCTG-AACCCATA-ATT-GC-TCAGC--GT--ATC-CACTTTAATG-GT-C--T-AACTT-G-----G-CAA--TGG---TGATA-----CA--CCG-ATCACCTCCCCCT---ATGA--TCTGT--ATCT--CTG-GGGC-AT--C-CT-------CC-CCG-GGCCCA-C-C-AT-CCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89798                      : TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TA-A-TTTCTGTTCTAGCAT--TCACCA----G--TCTTTGTAGGTAGGTTCTT-AACCCATA-ATT-GC-TCTGC--AT--ATC-CC-TTTGATG-GC-C--T-CACCT-G-----G-CCGG-TGG---TGATG-----CA--CCG-ATCACATCCCCCT---ATAA--TCTGT--TTCT--TTG-GGGC-AT--A-CT-------CC-CCG-GGCCCA-C-C-AT-CCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89801                      : TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TC-A-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCA----CAGTCTTTACAGGTAGGTTCTG-AACCCATC-ATT-GC-TCAGC--GT--ATC-CC-TT---TG-GC-C--T-CACCT-G-----G-CAAG-TGGCTTTGATAG----CATCCCG--TCACTCCCCCCT---ATAA--TCTGT--ATCT--CTG-GGGC-AT--C-CT-------AC-CCG-GGCCCA-C-C-A--CCCTGGTTTCTC-GGTCCACTCCC
gi|89802                      : TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGCTTC-A-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCA----CAGTCTTTACAGGTAGG-TCTGAAACCCATT-CAT-GC-TCAGC--GT--ATC-C--TT---TG-GC-C--TCAACCT-G-----G-CAAGTTGG---TGATAC----CA--CCGTATCA-CTCCCCCT---ATAA--TCTGT--ATCT--CTG-GGGC-AT--C-CT-------AC-CCG-GGCCCA-C-C-AT-CCCTGGTTTCTCGTGTCCACTCCC
gi|89803                      : TCAAGGGAACCACATACAGGT-CCACTCAGATCCTCAACA-CTC-TC-A-TTTCTGGCCCAGTAT--CCACCA----CGGTCTCGGCAGGTAGGTCATG-AACCCATA-ATT-GC-TCTGC--GT--ATC-CC-TTTGAGG-GC-C--T-CGCAT-G-----G-CCAG-TGG---TGATGTAATTCA--CCG-ATCACCTCCCCCT---ATAA--TCCCT--TTCT--CTG-GGGC-AT--C-CT-------AC-CCG-AGCCAC-C-C-AT-CCCTGGTTTCTCGAGTCCACTCCC
gi|89804                      : TCAAGCGAACCACATACAGGT-CCACTCCGACCCCCAACA-CCC-TC-A-TTTCTCCGCCAGTAT--CCACCA----CGGTCTCTCTAGGTAGGTCCTA-AACCCACA-ATT-GC-TCTGC--AT--ATC-CT-TTTGAGG-GC-C--T-CACCT-G-----G-CCAG-TGA---TGATG-----CA--TCG-ATCGCTTTACCCT---ATAA--TCTCT--ATCT--CTT-GGGC-AT--C-CT-------CC-TCA-AACCCA-CTT-AT-CCCTGATTTCTTGGGTTCACTCCC
gi|89805                      : TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TC-A-TTTCTGTTCCAGCAT--TCAC------CAGTCTTTGCAGGTAGGCCCCG-AACCCATA-ATT-GC-TCTGC--GT--ATC-CG-CTTGATG-GC-A--T-CACCT-G-----G-CCAG-TGG---TGATG-----CA--CCG-ATCACC
gi|89806                      :   AATGGACCCACA-ATAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTG-CGC-TC-A-TTTCTGCCCCACTGT--CCACCA----TGGCCTCCACAGGTACGTCCTG-AACCCGTA-ATT-GC-ACTGT--GA--ATC-TC-GTAGAGG-GC-C--T-CACCT-G-----G-CCAG-TTG---TGATG-----CA--CCG-ATCGCCTTCCCC----ATGAA-TCTCT--ATCT--CTG-GGGC-AT--C-TT-------CC-CCG-AGCCCA-CTC-AC-CCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89807                      :                ACAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTA-TGC-TA-A-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCA----CGGGCTTTGCACGTAGGTCCTG-AACCTGTA-ATT-GC-ACTGT--TT--ATCTCA-TTGAGTG--T-C--T-CACCT-G-----G-CCAG-TGG---TGATG-----CA--CCA-ATCGCCTTCCCCT---GGGA--TCTCT--ATCT--CTA-GGGT-ATTAC-ATGTATATATC-CAG-AGCCCA-CTC-AT-CCCTGGTATCTAGGGTTCACTCC
gi|89809                      :                  ATGTACTGCTCTG-TTCCAAGAA-CAC-TC-A-CCTCTGCCCCAGTAT--CCACCA----CAGCCTCCGCAGGTAGGTTCTG-AACCCGTA--TT-GC-GCTGA--GT--ATC-CC-ATTGAGA-AC-C--T-CACCA-G-----G-CCA--TGG---TGATG-----CA--CCG-ATCGCCTTCTCCT---G-GAC-TCCGT--ATCT--CTG-GGGC-AT--C-TT-------TTGCCG-AGTCCATT-C-AT-CCCTGGTTCCTCGGGTCCATTCCC
gi|89811                      :                  ATGT-CCACTCAGATCTCCAGCA-TGC-TC-A-TTTCTGTTCCAGCAT--TTACTA----CAGTCTTTGCAGGTAGGCCCTG-AATCCATA-ATT-GC-TCTGC--GT--ATC-CC-TTTGATG-G
gi|89810                      :                  ATGTACTGCTCTG-TCCCCAGCAATGC-TC-A-CCCCCGCCCCAGTAT--CCACCAAGG-CCCTCTT---AGGTAGGTTCTG-AACCCGTA-GTT-GT-GCTGA--GT--ATC-CC-ATAGAGG-GC-C--T-TACCA-G-----G-CCAG-T----------------A--CTT-ATCGCCTTCCCCT---AGAA--TCTGT--ATTT--CTG-GGAC-AT--CTTT-------CC-CCG-AGTCCATT-T-AT-CCCTGGTTCCTCGGGTCCACc
gi|89812                      :                     T-CCAATCAG-TCCCCAGAA-TGC-TA-A-TTTCTAACCCAGTAT--CCACCA----CGGGCTCTGCAGGTAGGCCCTG-AA-CCGTT-ATT-GC-ACTGC--AT--ATCTCG-TTGAAT--GC-C--T-CGCCT-G-----G-CCAG-TGG---TGATG-----CA--CCG-ATCGTCTTCGCCT---GGAA--TC--T--ATCT--CAA-GGGC-AT--C-CTAGC----CC-CCG-AGTTCA-CTC-AT-CCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89814                      :                     T-CCACTCAG-TCCCCCGTT-TGT-TTAA-TTTCTGCCCCAGTAA--CCACCA----CGGGCTCTGCAGGTAGGTCCTG-AACCCGTA-ATT-GC-ACTGC--AT--ATCTCG-TTGAGT--GC-C--T-CACCT-G-----G-CCAG-AGG---TGATG-----CA--CCG-ATCGCCTTCCCCT---GAAA--TC--T--ATCT--TTA-AGGT-AT--A-CT-------CC-CTG-AACCTA-CTC-AT-CCCCGGTTTCTTGGATCAACT
gi|89816                      :                     T-CCACCTAT-TCTCCAGTA-TGC-TT-A-TTTCTGCCCTAGTAT--ACACCA----TGGGCTCTGCACGTAGGTCCTG-ACCCCGTA-ATT-GT-ACTGT--AT--ATCTCG-TTGGGTG--T-C--T-CGCCT-G-----G-CCAT-TGG---TGATG-----CA--GCG-ATCGCCTTCCC------------------ATTT--CTA-GGTC-AT--C-CT-------CC-CCG-AGCCCA-CTC-AT-CCCTGG-TTCTCGGGTTCACTCC
gi|89813                      :                     T-CCACTCAT-TCCCTAGTA-TGC-TA-A-TTTATGCCCCAGTAT--ACACCA----CGAGCTCTGCAGGTAGCTCCTA-AACTCGTA-ATT-GC-ACTGT--AT--ATCTCG-TTGAGTG--C-C--T-CACCA-G-----A-CCAA-TGG---TGATG-----CA--CCA-TTCTCCTTCCCCT-----GAACTCTCT--ACCG--CTA-GGGT-AT--C-CT-------CC-CCG-A-CCCA-CTC-AT-CCCTGGTTTCTGGGGTCCACCCCC
gi|89815                      :                     T-CCAGTCGG-TCCCCAGCA-CGC-TA-A-CTTCTGCCCCAGTAT--CCACCA----CGGTATCTGCAGGTAGGTTCTG-AACCCGTA-ATT-GC-ACTAA--AT--ATC-TT-GTTGAGG-GC-C--T-CCCTTCGTCAGTG-CACG-TAG---TGACG-----CA--CCG-ATCGACTTCCCCT---GGAA--TGTCT--ATCT--CTG-GGACAAT--C-TT----------CCA-AGCCCA-CTC-AT-TCCTGTTTCCTCGGATTTAATTCC
gi|89817                      :                     T-CTACTCA-ATCCCCATTA-TAT-TC-A-TTT-TGCTCCAGTAT--CCACCAAGGGC-TTCTT-GCAGATAGGTCCTG-GACCTGTA-TTT-GC-ATTGC--GT-----------TAAGGAGC-C--C-CGCCT-G-----GACCAG-TGG---TGATG-----CA--GAC-ATCGCCTTTCCCT---G-GA--ACTTTCCAACT--CTG-GGAC-AT--T-CT-------CC-TCGAGATCCA---T-ATATTTTGGTTTTTCGGGT
gi|89818                      :                          CTCAG-TTCCCAGTA-TGC-TA-A-TTTCTGCCCCAGTAG--CCACCA----CAGGATCTGCAAGTAGGTCCCG-AGCTCGTA-ATT-
gi|89819                      :                                TTCCCAGTA-TGA-CT-A-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCA----TGGGCTCTGCACGTAAGGTCTG-ACCCTGTA-ATT-GCAACTGT--AT--ATCTCG-TTGGGT--GT-C--T-CAC-T-G-----G-C--G-TGG---TGTGA-----CC--GCG-ATCGCCTTCCCCT----TGAATTCTAT--ATCTAGATA-GGGC-AT--C-CT--------C-CCG-AGCCAA-CTC-AT-CCCTGGTTTCTC-GGTTCACTCCtacactgcatatattgttg
gi|89820                      :                                TCCTCAGCA-TGC-TC-A-CCTCTGTCCCAGTAT--CTACCA----CAGCCTCCACAGGTAGGTCCAG-AACTAGTA-GTT-GC-ACCAC--AT--ATC-CG-GTTGA-G-GTCC--T-CACCT-G-----G-CCAA-TGG---TGATG-----CA--CCC-ATTGCCCTC----------------------CT--CTG-AGGT-GT--T-CT-------CC-CTG-AGATTA-CTC-GT-CCCTGG
gi|89821                      :                                TCCCAAGTA-CGC-TT-A-CCACTGCCCCGGTGT--CCACCA----CTGCCTCCACAGGTAGATCCTG-GACTCGTA-GTT-TC-ACCAC--GT--ATC-CG-GTTACGG-GC-C--T-CACCT-GTT---C-CA---CGG---GGACG-----CA--TTC-ATCGCCCTCACCT---G--------GG--GTCT--CTA-GGGT-GT--T-CT-------TC-TCA-AGATTA-CTC-GT-CCCTGG
gi|89822                      :                                 CCCCAGCA-TGC-TC-A-TTTATGTTCCAGCAT--TCACCA----G--TCTTTGCAAGTAGGTCCTG-AACCCATA-ATT-GC-TCTGC--GT--ATC-CC-TTTGATT-GC-C--T-CACAT-G-----G-CCAA-TGG---TGATG-----CA--CC
gi|89823                      :                                  CTCAGCA-TGC-CT-A-CT-CTGT-CCAGTAT--T-AC-A----CAGCCTCCACAGGTAGGT-CAG-AACTAGTA-GTTTGC-ACA-C--AT--ATC-CG-GTGA--G-GT-CCCT-CACAT-G-----G-CCA--TGG---TGATG-----CG--CC--ATTGCC-CTTCCT---CTGA--GGTGT---TCT--C
gi|89824                      :                                                           CTAGCACGCTCACCA----CAGCCTTCATAGGTAGGTTCTG-AACTCTTAGAT-----TTACC--ATAAATC-CT-GCTGATG-GC-C--T-CACCT-G-----G-CCGA-TGG---TAATA-----CA--TTC-GTCACCCTCCCCT---GGGA--TCcctgagatttactcgttccctgg
gi|89826                      :                                                         tttgtccAT--CCACCA----CGGGCTCTGCACTTAGGTCCTG-AATCCGTA-ATT-GC-ACTGT--AT--ATC-------------T-C----AACTT-G-----C-CA-G-TGG---TGATG-----CA--CCG-ATCGCTTTCCCCT---AGAA--TCTCT--ATCT--TGA-GGGC-AT--C-CT-------TT-C-G-AGTCCA-C-CCAT-TCCCCGTTTCTCGGGTTCACTCC
gi|89825                      :                                                                 T--CCACCA----CTGCCTCCACAGGTATGTTCTG-AACTCGTA-GTT----TCACCATGT--ATC-CG-GTTAAGG-GC-C--T-TACCT-G-----T-CCAA-TGG---TGATG-----CA--TTC-ATCGCCCTCACCT---GGGG--TCTCT--A
gi|89808                      :                                                                                               gtgTG-AACCCGTA-ATT-GC-ACCGA--GT--ATC-CC-GTTGAGG-GT-C--T-CACCT-G-----G-ACAG-TGG---TGATG-----CA--CCG-ATCGCTTTCCCCTGGAATAA--C---T--ACCT--CTGTGGGC-GT--C-CG-------TC-TTG-AGCCCA-CTC-AT--TCTGGTTCCTCGGTTTCACTCCCgggtttctcaagattactcgtccctgg
gi|89827                      :                                                                                                                              cgtgtccataagagaaagtcccgagcgaaatggcaatttacaccgccaccaaagtccaaaggcaccg-ATCACCTCCCCCT---ATAA--TCTGT--ATCT--CTG-GGAC-AT--C-CT-------CC-TCG-GGCCCA-C-C-AT-CCTTGGTTTTTCGGGTCCACTCCC





Alignments
lowQualScore                  :                                                           1                                                                                                                                                                          111                                                                                   
lowQualScore                  :                                                  4        5         1   1   3               11       0 2   222            1          1 2    22         2 999    6 1 22    1      1    1  444444 222    1 55555  22   33            1 222 33  33 22     22  1    1  22 1  88888888 1     3     5  1                         
lowQualScore                  :                                                  .        .         .   .   .               ..       . .   ...            .          . .    ..         . ...    . . ..    .      .    .  ...... ...    . .....  ..   ..            . ... ..  .. ..     ..  .    .  .. .  ........ .     .     .  .                         
lowQualScore                  :                                                  2        5         6   6   2               99       4 3   777            4          4 8    44         9 888    5 4 00    5      5    5  333333 666    5 22222  00   55            5 222 77  88 22     22  6    6  22 6  22222222 6     2     0  6                         
consensus                     :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATC-C-CGTTGAGG-G--CCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCC-TGNAA--TCTCT--ATCTC--TG-GGGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
Reference ( family-541 )      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCN-CTGCGTATC-C-NTTTGATG-G--CCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCC-TGTGA--TCTNT--ATCTC--TG-GGGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89798                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TAA-TTTCTGTTCTAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GTAGGTAGGTTC-TTAACCCATA-A-TTGCT-CTGCATATC-C-CTTTGATG-G--CCTC-ACCTGG-CCGG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCACATCCCCC-TATAA--TCTGT--TTCTT--TG-GGGC-AT--A-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89799                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTATTCCAGCAT--TCACCACATTCTTT--GCATGTAGGTTC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CAGCGTATC-C-ATTTAATG-G--TCTA-ACTTGG-CAAG-TG------G---TGAT-A-----CA--CCG--ATCACCTCCCCC-TATGA--TCTGT--ATCTC--TG-GGGC-AT--C-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89800                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCATTTTCTATTCCAGCAT--TCACCACATTCT-T--GCATGTAGGTTC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CAGCGTATC-CACTTTAATG-G--TCTA-ACTTGG--CAA-TG------G---TGAT-A-----CA--CCG--ATCACCTCCCCC-TATGA--TCTGT--ATCTC--TG-GGGC-AT--C-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89801                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCACAGTCTTT--ACAGGTAGGTTC-TGAACCCATC-A-TTGCT-CAGCGTATC-C-CTT---TG-G--CCTC-ACCTGG-CAAG-TG------GCTTTGATAG-----CATCCCG---TCACTCCCCCC-TATAA--TCTGT--ATCTC--TG-GGGC-AT--C-CT-------AC-CCGGG-CCCAC-CA--CCCTGGTTTCTC-GGTCCACTCCC
gi|89802                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGCTTCA-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCACAGTCTTT--ACAGGTAGGTCT-GAAACCCATT-C-ATGCT-CAGCGTATC-C-TT----TG-G--CCTCAACCTGG-CAAGTTG------G---TGAT-AC----CA--CCGT-ATCA-CTCCCCC-TATAA--TCTGT--ATCTC--TG-GGGC-AT--C-CT-------AC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGTGTCCACTCCC
gi|89803                      :                             TCAAGGGAACCACATACAGGT-CCACTCAGATCCTCAACA-CTC-TCA-TTTCTGGCCCAGTAT--CCACCACGGTCTCG--GCAGGTAGGTCA-TGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATC-C-CTTTGAGG-G--CCTC-GCATGG-CCAG-TG------G---TGAT-GTAATTCA--CCG--ATCACCTCCCCC-TATAA--TCCCT--TTCTC--TG-GGGC-AT--C-CT-------AC-CCGAG--CCACCCA-TCCCTGGTTTCTCGAGTCCACTCCC
gi|89804                      :                             TCAAGCGAACCACATACAGGT-CCACTCCGACCCCCAACA-CCC-TCA-TTTCTCCGCCAGTAT--CCACCACGGTCTCT--CTAGGTAGGTCC-TAAACCCACA-A-TTGCT-CTGCATATC-C-TTTTGAGG-G--CCTC-ACCTGG-CCAG-TG------A---TGAT-G-----CA--TCG--ATCGCTTTACCC-TATAA--TCTCT--ATCTC--TT-GGGC-AT--C-CT-------CC-TCAAA-CCCACTTA-TCCCTGATTTCTTGGGTTCACTCCC
gi|89805                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GCAGGTAGGCCC-CGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATC-C-GCTTGATG-G--CATC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCACC
gi|89806                      :                               AATGGACCCACA-ATAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTG-CGC-TCA-TTTCTGCCCCACTGT--CCACCATGGCCTCC--ACAGGTACGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGTGAATC-T-CGTAGAGG-G--CCTC-ACCTGG-CCAG-TT------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCATG-AA--TCTCT--ATCTC--TG-GGGC-AT--C-TT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-CCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89807                      :                                            ACAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTA-TGC-TAA-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCACGGGCTTT--GCACGTAGGTCC-TGAACCTGTA-A-TTGCA-CTGTTTATC-T-CATTGAGT-G--TCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCA--ATCGCCTTCCCC-TGGGA--TCTCT--ATCTC--TA-GGGT-ATTAC-ATGTATATATC-CAGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTATCTAGGGTTCACTCC
gi|89808                      :                                                                                             --CCACCAAAG--TCC--AAAGGCA---CCGTGAACCCGTA-A-TTGCA-CCGAGTATC-C-CGTTGAGG-G--TCTC-ACCTGG-ACAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCTTTCCCC-TGGAA--TAACT--ACCTC--TGTGGGC-GT--C-CG-------TC-TTGAG-CCCACTCA-T-TCTGGTTCCTCGGTTTCACTCCC
gi|89809                      : cgtgtccataagagaaagtcccgagcgaaatggcaatttacaccgATGTACTGCTCTG-TTCCAAGAA-CAC-TCA-CCTCTGCCCCAGTAT--CCACCACAGCCTCC--GCAGGTAGGTTC-TGAACCCGT--A-TTGCG-CTGAGTATC-C-CATTGAGA-A--CCTC-ACCAGG-CCA--TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCTCC-TG-GAC-TCCGT--ATCTC--TG-GGGC-AT--C-TT-------TTGCCGAG-TCCATTCA-TCCCTGGTTCCTCGGGTCCATTCCC
gi|89810                      :                                              ATGTACTGCTCTG-TCCCCAGCAATGC-TCA-CCCCCGCCCCAGTAT--CCACCAAGGCCCTC--TTAGGTAGGTTC-TGAACCCGTA-G-TTGTG-CTGAGTATC-C-CATAGAGG-G--CCTT-ACCAGG-CCAG-T-----------------------A--CTT--ATCGCCTTCCCC-TAGAA--TCTGT--ATTTC--TG-GGAC-AT--CTTT-------CC-CCGAG-TCCATTTA-TCCCTGGTTCCTCGGGTCCAC
gi|89811                      :                                              ATGT-CCACTCAGATCTCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCAT--TTACTACAGTCTTT--GCAGGTAGGCCC-TGAATCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATC-C-CTTTGATG-G--C
gi|89812                      :                                                 T-CCAATCAG-TCCCCAGAA-TGC-TAA-TTTCTAACCCAGTAT--CCACCACGGGCTCT--GCAGGTAGGCCC-TGAACC-GTT-A-TTGCA-CTGCATATC-T-CGTTGAAT-G--CCTC-GCCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGTCTTCGCC-TGGAA--TC--T--ATCTC--AA-GGGC-AT--C-CTAGC----CC-CCGAG-TTCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89813                      :                                                 T-CCACTCAT-TCCCTAGTA-TGC-TAA-TTTATGCCCCAGTAT--ACACCACGAGCTCT--GCAGGTAGCTCC-TAAACTCGTA-A-TTGCA-CTGTATATC-T-CGTTGAGT-G--CCTC-ACCAGA-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CCA--TTCTCCTTCCCC-TGAAC--TCTCT--ACCGC--TA-GGGT-AT--C-CT-------CC-CCGA--CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTGGGGTCCACCCCC
gi|89814                      :                                                 T-CCACTCAG-TCCCCCGTT-TGT-TTAATTTCTGCCCCAGTAA--CCACCACGGGCTCT--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCATATC-T-CGTTGAGT-G--CCTC-ACCTGG-CCAG-AG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCC-TGAAA--TC--T--ATCTT--TA-AGGT-AT--A-CT-------CC-CTGAA-CCTACTCA-TCCCCGGTTTCTTGGATCAACT
gi|89815                      :                                                 T-CCAGTCGG-TCCCCAGCA-CGC-TAA-CTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGTATCT--GCAGGTAGGTTC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTAAATATC-T-TGTTGAGG-G--CCTC-CCTTCG-TCAG-TGCACGTAG---TGAC-G-----CA--CCG--ATCGACTTCCCC-TGGAA--TGTCT--ATCTC--TG-GGACAAT--C-TT----------CCAAG-CCCACTCA-TTCCTGTTTCCTCGGATTTAATTCC
gi|89816                      :                                                 T-CCACCTAT-TCTCCAGTA-TGC-TTA-TTTCTGCCCTAGTAT--ACACCATGGGCTCT--GCACGTAGGTCC-TGACCCCGTA-A-TTGTA-CTGTATATCTC-GTTGGGTG----TCTC-GCCTGG-CCAT-TG------G---TGAT-G-----CA--GCG--ATCGCCTTCCC----------------ATTTC--TA-GGTC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGG-TTCTCGGGTTCACTCC
gi|89817                      :                                                 T-CTACTCA-ATCCCCATTA-TAT-TCA-TTT-TGCTCCAGTAT--CCACCAAGGGCTTCTTGCAGATAGGTCC-TGGACCTGTA-T-TTGCA-TTGCG---------TTAAGGAG--CCCC-GCCTGGACCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--GAC--ATCGCCTTTCCC-TG-GA--ACTTTCCAACTC--TG-GGAC-AT--T-CT-------CC-TCGAGATCCATATA-T-TTTGGTTTTTCGGGT
gi|89818                      :                                                      CTCAG-TTCCCAGTA-TGC-TAA-TTTCTGCCCCAGTAG--CCACCACAGGATCT--GCAAGTAGGTCC-CGAGCTCGTA-ATTTACA-CTGCATAT
gi|89819                      :                                                            TTCCCAGTA-TGA-CTA-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCATGGGCTCT--GCACGTAAGGTC-TGACCCTGTA-A-TTGCAACTGTATATCTC-GTTGGGTG----TCTC-AC-TGG-C--G-TG------G---TG-T-G------A--CCGCGATCGCCTTCCCC-T-TGAATTCTAT--ATCTAGATA-GGGC-AT--C-CT-------CC-C-GAG-CCAACTCA-TCCCTGGTTTCTC-GGTTCACTCCattgttg
gi|89820                      :                                                            TCCTCAGCA-TGC-TCA-CCTCTGTCCCAGTAT--CTACCACAGCCTCC--ACAGGTAGGTCC-AGAACTAGTA-G-TTGCA-CCACATATC-C-GGTTGAGG-T--CCTC-ACCTGG-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CCC--ATTGCCCTC--------------------CTC--TG-AGGT-GT--T-CT-------CC-CTGAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89821                      :                                                            TCCCAAGTA-CGC-TTA-CCACTGCCCCGGTGT--CCACCACTGCCTCC--ACAGGTAGATCC-TGGACTCGTA-G-TTTCA-CCACGTATC-C-GGTTACGG-G--CCTC-ACCTGT-TCCA-CG------G---GGAC-G-----CA--TTC--ATCGCCCTCACC-TGGGG--TCTCT--A---------GGGT-GT--T-CT-------TC-TCAAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89822                      :                                                             CCCCAGCA-TGC-TCA-TTTATGTTCCAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GCAAGTAGGTCC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATC-C-CTTTGATT-G--CCTC-ACATGG-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CC
gi|89823                      :                                                              CTCAGCA-TGC-CTA-CT-CTGTCC-AGTAT--T-AC-ACAGCCTCC--ACAGGTAGGTCA--GAACTAGTA-GTTTGCA-C-ACATATC-C-G-GTGA-G-GTCCCTC-ACATGG-CCA--TG------G---TGAT-G-----CG--CC---ATTGCCCTTC-------------------CTC--TG-AGGT-GT--T-CT-------CC-CTGAGATTTACTCGTTCCCTGG
gi|89824                      :                                                                                    CCCTAGCACGCTCACCACAGCCTTC--ATAGGTAGGTTC-TGAACTCTTAGA-TT-TA-CCATAAATC-C-TGCTGATG-G--CCTC-ACCTGG-CCGA-TG------G---TAAT-A-----CA--TTC--GTCACCCTCCCC-TGGGA--TC
gi|89825                      :                                                                                    tttgtGTGT--CCACCACTGCCTCC--ACAGGTATGTTC-TGAACTCGTA-G-TTTCA-CCATGTATC-C-GGTTAAGG-G--CCTT-ACCTGT-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--TTC--ATCGCCCTCACC-TGGGG--TCTCT--A-------G-GG---------TT-------TC-TCAAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89826                      :                                                                                           AT--CCACCACGGGCTCT--GCACTTAGGTCC-TGAATCCGTA-A-TTGCA-CTGTATATC-----------------TC-AACTTG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCTTTCCCC-TAGAA--TCTCT--ATCTT--GA-GGGC-AT--C-CT--------T-TCGAG-TCCACCCA-TTCCCCGTTTCTCGGGTTCACTCC
gi|89827                      :                                                                                                                                                                                                                      --ATCACCTCCCCC-TATAA--TCTGT--ATCTC--TG-GGAC-AT--C-CT-------CC-TCGGG-CCCAC-CA-TCCTTGGTTTTTCGGGTCCACTCCC





Alignments
lowQualScore                  :                                                           1                                                                                                                                                                                                                                                            
lowQualScore                  :                                                  4        5         1   1   3               11       0 2   222            1          1 2    22          1 2      2     1      1    1  444444 222    1 55555  22   33            1  4  1   1        1 3333   1  22 1  88888888 1     3     5  1                         
lowQualScore                  :                                                  .        .         .   .   .               ..       . .   ...            .          . .    ..          . .      .     .      .    .  ...... ...    . .....  ..   ..            .  .  .   .        . ....   .  .. .  ........ .     .     .  .                         
lowQualScore                  :                                                  2        5         6   6   2               99       4 3   777            4          4 8    44          4 0      9     5      5    5  333333 666    5 22222  00   55            5  1  5   0        6 4444   6  22 6  22222222 6     2     0  6                         
consensus                     :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATCC-CGTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCC-TGGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
Reference ( family-541 )      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATCC-CGTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCC-TGNAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89798                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TAA-TTTCTGTTCTAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GTAGGTAGGTTC-TTAACCCATA-A-TTGCT-CTGCATATCC-CTTTGATG-GCCTC-ACCTGG-CCGG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCACATCCCCC-TATAA-TCTGTTTCTTTG-G----GGC-AT--A-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89799                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTATTCCAGCAT--TCACCACATTCTTT--GCATGTAGGTTC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CAGCGTATCC-ATTTAATG-GTCTA-ACTTGG-CAAG-TG------G---TGAT-A-----CA--CCG--ATCACCTCCCCC-TATGA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89800                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCATTTTCTATTCCAGCAT--TCACCACATTCT-T--GCATGTAGGTTC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CAGCGTATCCACTTTAATG-GTCTA-ACTTGG--CAA-TG------G---TGAT-A-----CA--CCG--ATCACCTCCCCC-TATGA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89801                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCACAGTCTTT--ACAGGTAGGTTC-TGAACCCATC-A-TTGCT-CAGCGTATCC-CTTT---G-GCCTC-ACCTGG-CAAG-TG------GCTTTGATAG-----CATCCCG---TCACTCCCCCC-TATAA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGGG-CCCAC-CA--CCCTGGTTTCTC-GGTCCACTCCC
gi|89802                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGCTTCA-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCACAGTCTTT--ACAGGTAGGTCT-GAAACCCATT-C-ATGCT-CAGCGTATCC-T-TT---G-GCCTCAACCTGG-CAAGTTG------G---TGAT-AC----CA--CCGT-ATCA-CTCCCCC-TATAA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGTGTCCACTCCC
gi|89803                      :                             TCAAGGGAACCACATACAGGT-CCACTCAGATCCTCAACA-CTC-TCA-TTTCTGGCCCAGTAT--CCACCACGGTCTCG--GCAGGTAGGTCA-TGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGAGG-GCCTC-GCATGG-CCAG-TG------G---TGAT-GTAATTCA--CCG--ATCACCTCCCCC-TATAA-TCCCTTTCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGAG--CCACCCA-TCCCTGGTTTCTCGAGTCCACTCCC
gi|89804                      :                             TCAAGCGAACCACATACAGGT-CCACTCCGACCCCCAACA-CCC-TCA-TTTCTCCGCCAGTAT--CCACCACGGTCTCT--CTAGGTAGGTCC-TAAACCCACA-A-TTGCT-CTGCATATCC-TTTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------A---TGAT-G-----CA--TCG--ATCGCTTTACCC-TATAA-TCTCTATCTCTT-G----GGC-AT--C-CT-------CC-TCAAA-CCCACTTA-TCCCTGATTTCTTGGGTTCACTCCC
gi|89805                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GCAGGTAGGCCC-CGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-GCTTGATG-GCATC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCACC
gi|89806                      :                               AATGGACCCACA-ATAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTG-CGC-TCA-TTTCTGCCCCACTGT--CCACCATGGCCTCC--ACAGGTACGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGTGAATCT-CGTAGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TT------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCATG-AA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-TT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-CCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89807                      :                                            ACAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTA-TGC-TAA-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCACGGGCTTT--GCACGTAGGTCC-TGAACCTGTA-A-TTGCA-CTGTTTATCT-CATTGAGT-GTCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCA--ATCGCCTTCCCC-TGGGA-TCTCTATCTCTA-G----GGT-ATTAC-ATGTATATATC-CAGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTATCTAGGGTTCACTCC
gi|89808                      :                                                                                             --CCACCAAAG--TCC--AAAGGCA---CCGTGAACCCGTA-A-TTGCA-CCGAGTATCC-CGTTGAGG-GTCTC-ACCTGG-ACAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCTTTCCCC-TGGAA-TAACTACCTCTGTG----GGC-GT--C-CG-------TC-TTGAG-CCCACTCA-T-TCTGGTTCCTCGGTTTCACTCCC
gi|89809                      : cgtgtccataagagaaagtcccgagcgaaatggcaatttacaccgATGTACTGCTCTG-TTCCAAGAA-CAC-TCA-CCTCTGCCCCAGTAT--CCACCACAGCCTCC--GCAGGTAGGTTC-TGAACCCGT--A-TTGCG-CTGAGTATCC-CATTGAGA-ACCTC-ACCAGG-CCA--TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCTCC-TGGAC-TCCGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-TT-------TTGCCGAG-TCCATTCA-TCCCTGGTTCCTCGGGTCCATTCCC
gi|89810                      :                                              ATGTACTGCTCTG-TCCCCAGCAATGC-TCA-CCCCCGCCCCAGTAT--CCACCAAGGCCCTC--TTAGGTAGGTTC-TGAACCCGTA-G-TTGTG-CTGAGTATCC-CATAGAGG-GCCTT-ACCAGG-CCAG-T-----------------------A--CTT--ATCGCCTTCCCC-TAGAA-TCTGTATTTCTG-G----GAC-AT--CTTT-------CC-CCGAG-TCCATTTA-TCCCTGGTTCCTCGGGTCCAC
gi|89811                      :                                              ATGT-CCACTCAGATCTCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCAT--TTACTACAGTCTTT--GCAGGTAGGCCC-TGAATCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGATG-GC
gi|89812                      :                                                 T-CCAATCAG-TCCCCAGAA-TGC-TAA-TTTCTAACCCAGTAT--CCACCACGGGCTCT--GCAGGTAGGCCC-TGAACC-GTT-A-TTGCA-CTGCATATCT-CGTTGAAT-GCCTC-GCCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGTCTTCGCC-TGGAA---TCTATCTCAA-G----GGC-AT--C-CTAGC----CC-CCGAG-TTCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89813                      :                                                 T-CCACTCAT-TCCCTAGTA-TGC-TAA-TTTATGCCCCAGTAT--ACACCACGAGCTCT--GCAGGTAGCTCC-TAAACTCGTA-A-TTGCA-CTGTATATCT-CGTTGAGT-GCCTC-ACCAGA-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CCA--TTCTCCTTCCCC-TGAAC-TCTCTACCGCTA-G----GGT-AT--C-CT-------CC-CCGA--CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTGGGGTCCACCCCC
gi|89814                      :                                                 T-CCACTCAG-TCCCCCGTT-TGT-TTAATTTCTGCCCCAGTAA--CCACCACGGGCTCT--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCATATCT-CGTTGAGT-GCCTC-ACCTGG-CCAG-AG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCC-TGAAA---TCTATCTTTA-A----GGT-AT--A-CT-------CC-CTGAA-CCTACTCA-TCCCCGGTTTCTTGGATCAACT
gi|89815                      :                                                 T-CCAGTCGG-TCCCCAGCA-CGC-TAA-CTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGTATCT--GCAGGTAGGTTC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTAAATATCT-TGTTGAGG-GCCTC-CCTTCG-TCAG-TGCACGTAG---TGAC-G-----CA--CCG--ATCGACTTCCCC-TGGAA-TGTCTATCTCTG-G----GACAAT--C-TT----------CCAAG-CCCACTCA-TTCCTGTTTCCTCGGATTTAATTCC
gi|89816                      :                                                 T-CCACCTAT-TCTCCAGTA-TGC-TTA-TTTCTGCCCTAGTAT--ACACCATGGGCTCT--GCACGTAGGTCC-TGACCCCGTA-A-TTGTA-CTGTATATCT-CGTTGGGT-GTCTC-GCCTGG-CCAT-TG------G---TGAT-G-----CA--GCG--ATCGCCTTCCC-------------ATTTCTA-G----GTC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGG-TTCTCGGGTTCACTCC
gi|89817                      :                                                 T-CTACTCA-ATCCCCATTA-TAT-TCA-TTT-TGCTCCAGTAT--CCACCAAGGGCTTCTTGCAGATAGGTCC-TGGACCTGTA-T-TTGCA-TTG--------CGTTAAGGAGCCCC-GCCTGGACCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--GAC--ATCGCCTTTCCC-TGGAACTTTCCAACTCTG-G----GAC-AT--T-CT-------CC-TCGAGATCCATATA-T-TTTGGTTTTTCGGGT
gi|89818                      :                                                      CTCAG-TTCCCAGTA-TGC-TAA-TTTCTGCCCCAGTAG--CCACCACAGGATCT--GCAAGTAGGTCC-CGAGCTCGTA-ATTTACA-CTGCATATAT-TGTTG
gi|89819                      :                                                            TTCCCAGTA-TGA-CTA-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCATGGGCTCT--GCACGTAAGGTC-TGACCCTGTA-A-TTGCAACTGTATATCT-CGTTGGGT-GTCTC-AC-TGG-C--G-TG------G---TG-T-G------A--CCGCGATCGCCTTCCCC-TTGAA-T-TCTATATCTA-GATAGGGC-AT--C-CT-------CC-C-GAG-CCAACTCA-TCCCTGGTTTCTC-GGTTCACTCC
gi|89820                      :                                                            TCCTCAGCA-TGC-TCA-CCTCTGTCCCAGTAT--CTACCACAGCCTCC--ACAGGTAGGTCC-AGAACTAGTA-G-TTGCA-CCACATATCC-GGTTGAGG-TCCTC-ACCTGG-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CCC--ATTGCCCTC-----------------CTCTG-A----GGT-GT--T-CT-------CC-CTGAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89821                      :                                                            TCCCAAGTA-CGC-TTA-CCACTGCCCCGGTGT--CCACCACTGCCTCC--ACAGGTAGATCC-TGGACTCGTA-G-TTTCA-CCACGTATCC-GGTTACGG-GCCTC-ACCTGT-TCCA-CG------G---GGAC-G-----CA--TTC--ATCGCCCTCACC-TGGGG-TCTCTA-------G----GGT-GT--T-CT-------TC-TCAAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89822                      :                                                             CCCCAGCA-TGC-TCA-TTTATGTTCCAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GCAAGTAGGTCC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGATT-GCCTC-ACATGG-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CC
gi|89823                      :                                                              CTCAGCA-TGC-CTA-CT-CTGTCC-AGTAT--T-AC-ACAGCCTCC--ACAGGTAGGTCA--GAACTAGTA-GTTTGCA-C-ACATAT-C-CGGTGAGGTCCCTC-ACATGG-CCA--TG------G---TGAT-G-----CG--CC---ATTGCCCTTC----------------CTCTG-A----GGT-GT--T-CT-------CC-CTGAGATTTACTCGTTCCCTGG
gi|89824                      :                                                                                    CCCTAGCACGCTCACCACAGCCTTC--ATAGGTAGGTTC-TGAACTCTTAGA-TT-TA-CCATAAATCC-TGCTGATG-GCCTC-ACCTGG-CCGA-TG------G---TAAT-A-----CA--TTC--GTCACCCTCCCC-TGGGA-TC
gi|89825                      :                                                                                    tttgtGTGT--CCACCACTGCCTCC--ACAGGTATGTTC-TGAACTCGTA-G-TTTCA-CCATGTATCC-GGTTAAGG-GCCTT-ACCTGT-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--TTC--ATCGCCCTCACC-TGGGG-TCTCTA-----G-G----G---------TT-------TC-TCAAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89826                      :                                                                                           AT--CCACCACGGGCTCT--GCACTTAGGTCC-TGAATCCGTA-A-TTGCA-CTGTATATC--------------TC-AACTTG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCTTTCCCC-TAGAA-TCTCTATCTTGA-G----GGC-AT--C-CT--------T-TCGAG-TCCACCCA-TTCCCCGTTTCTCGGGTTCACTCC
gi|89827                      :                                                                                                                                                                                                                   --ATCACCTCCCCC-TATAA-TCTGTATCTCTG-G----GAC-AT--C-CT-------CC-TCGGG-CCCAC-CA-TCCTTGGTTTTTCGGGTCCACTCCC





Alignments
lowQualScore                  :                                                           1                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                  4        5         1   1   3               11       0 2   222            1          1 2    22          333      2     1      1    1  444444 222    1 55555  22   33             22  1   1        1 3333   1  22 1  88888888 1     3     5  1                         
lowQualScore                  :                                                  .        .         .   .   .               ..       . .   ...            .          . .    ..          ...      .     .      .    .  ...... ...    . .....  ..   ..             ..  .   .        . ....   .  .. .  ........ .     .     .  .                         
lowQualScore                  :                                                  2        5         6   6   2               99       4 3   777            4          4 8    44          000      9     5      5    5  333333 666    5 22222  00   55             88  5   0        6 4444   6  22 6  22222222 6     2     0  6                         
consensus                     :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATCC-CGTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
Reference ( family-541 )      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATCC-CGTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89798                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TAA-TTTCTGTTCTAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GTAGGTAGGTTC-TTAACCCATA-A-TTGCT-CTGCATATCC-CTTTGATG-GCCTC-ACCTGG-CCGG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCACATCCCCCTATAA-TCTGTTTCTTTG-G----GGC-AT--A-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89799                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTATTCCAGCAT--TCACCACATTCTTT--GCATGTAGGTTC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CAGCGTATCC-ATTTAATG-GTCTA-ACTTGG-CAAG-TG------G---TGAT-A-----CA--CCG--ATCACCTCCCCCTATGA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89800                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCATTTTCTATTCCAGCAT--TCACCACATTCT-T--GCATGTAGGTTC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CAGCGTATCCACTTTAATG-GTCTA-ACTTGG--CAA-TG------G---TGAT-A-----CA--CCG--ATCACCTCCCCCTATGA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89801                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCACAGTCTTT--ACAGGTAGGTTC-TGAACCCATC-A-TTGCT-CAGCGTATCC-CTTT---G-GCCTC-ACCTGG-CAAG-TG------GCTTTGATAG-----CATCCCG---TCACTCCCCCCTATAA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGGG-CCCAC-CA--CCCTGGTTTCTC-GGTCCACTCCC
gi|89802                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGCTTCA-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCACAGTCTTT--ACAGGTAGGTCT-GAAACCCATT-C-ATGCT-CAGCGTATCC-T-TT---G-GCCTCAACCTGG-CAAGTTG------G---TGAT-AC----CA--CCGT-ATCA-CTCCCCCTATAA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGTGTCCACTCCC
gi|89803                      :                             TCAAGGGAACCACATACAGGT-CCACTCAGATCCTCAACA-CTC-TCA-TTTCTGGCCCAGTAT--CCACCACGGTCTCG--GCAGGTAGGTCA-TGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGAGG-GCCTC-GCATGG-CCAG-TG------G---TGAT-GTAATTCA--CCG--ATCACCTCCCCCTATAA-TCCCTTTCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGAG--CCACCCA-TCCCTGGTTTCTCGAGTCCACTCCC
gi|89804                      :                             TCAAGCGAACCACATACAGGT-CCACTCCGACCCCCAACA-CCC-TCA-TTTCTCCGCCAGTAT--CCACCACGGTCTCT--CTAGGTAGGTCC-TAAACCCACA-A-TTGCT-CTGCATATCC-TTTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------A---TGAT-G-----CA--TCG--ATCGCTTTACCCTATAA-TCTCTATCTCTT-G----GGC-AT--C-CT-------CC-TCAAA-CCCACTTA-TCCCTGATTTCTTGGGTTCACTCCC
gi|89805                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GCAGGTAGGCCC-CGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-GCTTGATG-GCATC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCACC
gi|89806                      :                               AATGGACCCACA-ATAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTG-CGC-TCA-TTTCTGCCCCACTGT--CCACCATGGCCTCC--ACAGGTACGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGTGAATCT-CGTAGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TT------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCATGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-TT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-CCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89807                      :                                            ACAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTA-TGC-TAA-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCACGGGCTTT--GCACGTAGGTCC-TGAACCTGTA-A-TTGCA-CTGTTTATCT-CATTGAGT-GTCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCA--ATCGCCTTCCCCTGGGA-TCTCTATCTCTA-G----GGT-ATTAC-ATGTATATATC-CAGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTATCTAGGGTTCACTCC
gi|89808                      :                                                                                             --CCACCAAAG--TCC--AAAGGCA---CCGTGAACCCGTA-A-TTGCA-CCGAGTATCC-CGTTGAGG-GTCTC-ACCTGG-ACAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCTTTCCCCTGGAA-TAACTACCTCTGTG----GGC-GT--C-CG-------TC-TTGAG-CCCACTCA-T-TCTGGTTCCTCGGTTTCACTCCC
gi|89809                      : cgtgtccataagagaaagtcccgagcgaaatggcaatttacaccgATGTACTGCTCTG-TTCCAAGAA-CAC-TCA-CCTCTGCCCCAGTAT--CCACCACAGCCTCC--GCAGGTAGGTTC-TGAACCCGT--A-TTGCG-CTGAGTATCC-CATTGAGA-ACCTC-ACCAGG-CCA--TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCTCCTGGAC-TCCGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-TT-------TTGCCGAG-TCCATTCA-TCCCTGGTTCCTCGGGTCCATTCCC
gi|89810                      :                                              ATGTACTGCTCTG-TCCCCAGCAATGC-TCA-CCCCCGCCCCAGTAT--CCACCAAGGCCCTC--TTAGGTAGGTTC-TGAACCCGTA-G-TTGTG-CTGAGTATCC-CATAGAGG-GCCTT-ACCAGG-CCAG-T-----------------------A--CTT--ATCGCCTTCCCCTAGAA-TCTGTATTTCTG-G----GAC-AT--CTTT-------CC-CCGAG-TCCATTTA-TCCCTGGTTCCTCGGGTCCAC
gi|89811                      :                                              ATGT-CCACTCAGATCTCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCAT--TTACTACAGTCTTT--GCAGGTAGGCCC-TGAATCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGATG-GC
gi|89812                      :                                                 T-CCAATCAG-TCCCCAGAA-TGC-TAA-TTTCTAACCCAGTAT--CCACCACGGGCTCT--GCAGGTAGGCCC-TGAACC-GTT-A-TTGCA-CTGCATATCT-CGTTGAAT-GCCTC-GCCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGTCTTCGCCTGGAA---TCTATCTCAA-G----GGC-AT--C-CTAGC----CC-CCGAG-TTCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89813                      :                                                 T-CCACTCAT-TCCCTAGTA-TGC-TAA-TTTATGCCCCAGTAT--ACACCACGAGCTCT--GCAGGTAGCTCC-TAAACTCGTA-A-TTGCA-CTGTATATCT-CGTTGAGT-GCCTC-ACCAGA-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CCA--TTCTCCTTCCCCTGAAC-TCTCTACCGCTA-G----GGT-AT--C-CT-------CC-CCGA--CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTGGGGTCCACCCCC
gi|89814                      :                                                 T-CCACTCAG-TCCCCCGTT-TGT-TTAATTTCTGCCCCAGTAA--CCACCACGGGCTCT--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCATATCT-CGTTGAGT-GCCTC-ACCTGG-CCAG-AG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGAAA---TCTATCTTTA-A----GGT-AT--A-CT-------CC-CTGAA-CCTACTCA-TCCCCGGTTTCTTGGATCAACT
gi|89815                      :                                                 T-CCAGTCGG-TCCCCAGCA-CGC-TAA-CTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGTATCT--GCAGGTAGGTTC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTAAATATCT-TGTTGAGG-GCCTC-CCTTCG-TCAG-TGCACGTAG---TGAC-G-----CA--CCG--ATCGACTTCCCCTGGAA-TGTCTATCTCTG-G----GACAAT--C-TT----------CCAAG-CCCACTCA-TTCCTGTTTCCTCGGATTTAATTCC
gi|89816                      :                                                 T-CCACCTAT-TCTCCAGTA-TGC-TTA-TTTCTGCCCTAGTAT--ACACCATGGGCTCT--GCACGTAGGTCC-TGACCCCGTA-A-TTGTA-CTGTATATCT-CGTTGGGT-GTCTC-GCCTGG-CCAT-TG------G---TGAT-G-----CA--GCG--ATCGCCTTCCC------------ATTTCTA-G----GTC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGG-TTCTCGGGTTCACTCC
gi|89817                      :                                                 T-CTACTCA-ATCCCCATTA-TAT-TCA-TTT-TGCTCCAGTAT--CCACCAAGGGCTTCTTGCAGATAGGTCC-TGGACCTGTA-T-TTGCA-TTGCGT--------TAAGGAGCCCC-GCCTGGACCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--GAC--ATCGCCTTTCCCTGGAACTTTCCAACTCTG-G----GAC-AT--T-CT-------CC-TCGAGATCCATATA-T-TTTGGTTTTTCGGGT
gi|89818                      :                                                      CTCAG-TTCCCAGTA-TGC-TAA-TTTCTGCCCCAGTAG--CCACCACAGGATCT--GCAAGTAGGTCC-CGAGCTCGTA-ATTTACA-CTGCATATAT-TGTTG
gi|89819                      :                                                            TTCCCAGTA-TGA-CTA-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCATGGGCTCT--GCACGTAAGGTC-TGACCCTGTA-A-TTGCAACTGTATATCT-CGTTGGGT-GTCTC-AC-TGG-C--G-TG------G---TG-T-G------A--CCGCGATCGCCTTCCCCTTGAA-T-TCTATATCTA-GATAGGGC-AT--C-CT-------CC-C-GAG-CCAACTCA-TCCCTGGTTTCTC-GGTTCACTCC
gi|89820                      :                                                            TCCTCAGCA-TGC-TCA-CCTCTGTCCCAGTAT--CTACCACAGCCTCC--ACAGGTAGGTCC-AGAACTAGTA-G-TTGCA-CCACATATCC-GGTTGAGG-TCCTC-ACCTGG-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CCC--ATTGCCCTC----------------CTCTG-A----GGT-GT--T-CT-------CC-CTGAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89821                      :                                                            TCCCAAGTA-CGC-TTA-CCACTGCCCCGGTGT--CCACCACTGCCTCC--ACAGGTAGATCC-TGGACTCGTA-G-TTTCA-CCACGTATCC-GGTTACGG-GCCTC-ACCTGT-TCCA-CG------G---GGAC-G-----CA--TTC--ATCGCCCTCACCTGGGG-TCTCTA-------G----GGT-GT--T-CT-------TC-TCAAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89822                      :                                                             CCCCAGCA-TGC-TCA-TTTATGTTCCAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GCAAGTAGGTCC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGATT-GCCTC-ACATGG-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CC
gi|89823                      :                                                              CTCAGCA-TGC-CTA-CT-CTGTCC-AGTAT--T-AC-ACAGCCTCC--ACAGGTAGGTCA--GAACTAGTA-GTTTGCA-C-ACATAT-C-CGGTGAGGTCCCTC-ACATGG-CCA--TG------G---TGAT-G-----CG--CC---ATTGCCCTTC---------------CTCTG-A----GGT-GT--T-CT-------CC-CTGAGATTTACTCGTTCCCTGG
gi|89824                      :                                                                                    CCCTAGCACGCTCACCACAGCCTTC--ATAGGTAGGTTC-TGAACTCTTAGA-TT-TA-CCATAAATCC-TGCTGATG-GCCTC-ACCTGG-CCGA-TG------G---TAAT-A-----CA--TTC--GTCACCCTCCCCTGGGA-TC
gi|89825                      :                                                                                    tttgtGTGT--CCACCACTGCCTCC--ACAGGTATGTTC-TGAACTCGTA-G-TTTCA-CCATGTATCC-GGTTAAGG-GCCTT-ACCTGT-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--TTC--ATCGCCCTCACCTGGGG-TCTCTA-----G-G----G---------TT-------TC-TCAAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89826                      :                                                                                           AT--CCACCACGGGCTCT--GCACTTAGGTCC-TGAATCCGTA-A-TTGCA-CTGTATATC--------------TC-AACTTG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCTTTCCCCTAGAA-TCTCTATCTTGA-G----GGC-AT--C-CT--------T-TCGAG-TCCACCCA-TTCCCCGTTTCTCGGGTTCACTCC
gi|89827                      :                                                                                                                                                                                                                   --ATCACCTCCCCCTATAA-TCTGTATCTCTG-G----GAC-AT--C-CT-------CC-TCGGG-CCCAC-CA-TCCTTGGTTTTTCGGGTCCACTCCC





Alignments
lowQualScore                  :                                                           1                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                  4        5         1   1   3               11       0 2   222            1          1 2    22          333      2     1      1    1  444444 222    1 55555  22   33             22  1   1        1 3333   1  22 1  88888888 1     3     5  1                         
lowQualScore                  :                                                  .        .         .   .   .               ..       . .   ...            .          . .    ..          ...      .     .      .    .  ...... ...    . .....  ..   ..             ..  .   .        . ....   .  .. .  ........ .     .     .  .                         
lowQualScore                  :                                                  2        5         6   6   2               99       4 3   777            4          4 8    44          000      9     5      5    5  333333 666    5 22222  00   55             88  5   0        6 4444   6  22 6  22222222 6     2     0  6                         
consensus                     :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATCC-CGTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
Reference ( family-541 )      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATCC-CGTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89798                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TAA-TTTCTGTTCTAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GTAGGTAGGTTC-TTAACCCATA-A-TTGCT-CTGCATATCC-CTTTGATG-GCCTC-ACCTGG-CCGG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCACATCCCCCTATAA-TCTGTTTCTTTG-G----GGC-AT--A-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89799                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTATTCCAGCAT--TCACCACATTCTTT--GCATGTAGGTTC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CAGCGTATCC-ATTTAATG-GTCTA-ACTTGG-CAAG-TG------G---TGAT-A-----CA--CCG--ATCACCTCCCCCTATGA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89800                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCATTTTCTATTCCAGCAT--TCACCACATTCT-T--GCATGTAGGTTC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CAGCGTATCCACTTTAATG-GTCTA-ACTTGG--CAA-TG------G---TGAT-A-----CA--CCG--ATCACCTCCCCCTATGA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89801                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCACAGTCTTT--ACAGGTAGGTTC-TGAACCCATC-A-TTGCT-CAGCGTATCC-CTTT---G-GCCTC-ACCTGG-CAAG-TG------GCTTTGATAG-----CATCCCG---TCACTCCCCCCTATAA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGGG-CCCAC-CA--CCCTGGTTTCTC-GGTCCACTCCC
gi|89802                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGCTTCA-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCACAGTCTTT--ACAGGTAGGTCT-GAAACCCATT-C-ATGCT-CAGCGTATCC-T-TT---G-GCCTCAACCTGG-CAAGTTG------G---TGAT-AC----CA--CCGT-ATCA-CTCCCCCTATAA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGTGTCCACTCCC
gi|89803                      :                             TCAAGGGAACCACATACAGGT-CCACTCAGATCCTCAACA-CTC-TCA-TTTCTGGCCCAGTAT--CCACCACGGTCTCG--GCAGGTAGGTCA-TGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGAGG-GCCTC-GCATGG-CCAG-TG------G---TGAT-GTAATTCA--CCG--ATCACCTCCCCCTATAA-TCCCTTTCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGAG--CCACCCA-TCCCTGGTTTCTCGAGTCCACTCCC
gi|89804                      :                             TCAAGCGAACCACATACAGGT-CCACTCCGACCCCCAACA-CCC-TCA-TTTCTCCGCCAGTAT--CCACCACGGTCTCT--CTAGGTAGGTCC-TAAACCCACA-A-TTGCT-CTGCATATCC-TTTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------A---TGAT-G-----CA--TCG--ATCGCTTTACCCTATAA-TCTCTATCTCTT-G----GGC-AT--C-CT-------CC-TCAAA-CCCACTTA-TCCCTGATTTCTTGGGTTCACTCCC
gi|89805                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GCAGGTAGGCCC-CGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-GCTTGATG-GCATC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCACC
gi|89806                      :                               AATGGACCCACA-ATAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTG-CGC-TCA-TTTCTGCCCCACTGT--CCACCATGGCCTCC--ACAGGTACGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGTGAATCT-CGTAGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TT------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCATGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-TT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-CCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89807                      :                                            ACAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTA-TGC-TAA-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCACGGGCTTT--GCACGTAGGTCC-TGAACCTGTA-A-TTGCA-CTGTTTATCT-CATTGAGT-GTCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCA--ATCGCCTTCCCCTGGGA-TCTCTATCTCTA-G----GGT-ATTAC-ATGTATATATC-CAGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTATCTAGGGTTCACTCC
gi|89808                      :                                                                                             --CCACCAAAG--TCC--AAAGGCA---CCGTGAACCCGTA-A-TTGCA-CCGAGTATCC-CGTTGAGG-GTCTC-ACCTGG-ACAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCTTTCCCCTGGAA-TAACTACCTCTGTG----GGC-GT--C-CG-------TC-TTGAG-CCCACTCA-T-TCTGGTTCCTCGGTTTCACTCCC
gi|89809                      : cgtgtccataagagaaagtcccgagcgaaatggcaatttacaccgATGTACTGCTCTG-TTCCAAGAA-CAC-TCA-CCTCTGCCCCAGTAT--CCACCACAGCCTCC--GCAGGTAGGTTC-TGAACCCGT--A-TTGCG-CTGAGTATCC-CATTGAGA-ACCTC-ACCAGG-CCA--TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCTCCTGGAC-TCCGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-TT-------TTGCCGAG-TCCATTCA-TCCCTGGTTCCTCGGGTCCATTCCC
gi|89810                      :                                              ATGTACTGCTCTG-TCCCCAGCAATGC-TCA-CCCCCGCCCCAGTAT--CCACCAAGGCCCTC--TTAGGTAGGTTC-TGAACCCGTA-G-TTGTG-CTGAGTATCC-CATAGAGG-GCCTT-ACCAGG-CCAG-T-----------------------A--CTT--ATCGCCTTCCCCTAGAA-TCTGTATTTCTG-G----GAC-AT--CTTT-------CC-CCGAG-TCCATTTA-TCCCTGGTTCCTCGGGTCCAC
gi|89811                      :                                              ATGT-CCACTCAGATCTCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCAT--TTACTACAGTCTTT--GCAGGTAGGCCC-TGAATCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGATG-GC
gi|89812                      :                                                 T-CCAATCAG-TCCCCAGAA-TGC-TAA-TTTCTAACCCAGTAT--CCACCACGGGCTCT--GCAGGTAGGCCC-TGAACC-GTT-A-TTGCA-CTGCATATCT-CGTTGAAT-GCCTC-GCCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGTCTTCGCCTGGAA---TCTATCTCAA-G----GGC-AT--C-CTAGC----CC-CCGAG-TTCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89813                      :                                                 T-CCACTCAT-TCCCTAGTA-TGC-TAA-TTTATGCCCCAGTAT--ACACCACGAGCTCT--GCAGGTAGCTCC-TAAACTCGTA-A-TTGCA-CTGTATATCT-CGTTGAGT-GCCTC-ACCAGA-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CCA--TTCTCCTTCCCCTGAAC-TCTCTACCGCTA-G----GGT-AT--C-CT-------CC-CCGA--CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTGGGGTCCACCCCC
gi|89814                      :                                                 T-CCACTCAG-TCCCCCGTT-TGT-TTAATTTCTGCCCCAGTAA--CCACCACGGGCTCT--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCATATCT-CGTTGAGT-GCCTC-ACCTGG-CCAG-AG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGAAA---TCTATCTTTA-A----GGT-AT--A-CT-------CC-CTGAA-CCTACTCA-TCCCCGGTTTCTTGGATCAACT
gi|89815                      :                                                 T-CCAGTCGG-TCCCCAGCA-CGC-TAA-CTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGTATCT--GCAGGTAGGTTC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTAAATATCT-TGTTGAGG-GCCTC-CCTTCG-TCAG-TGCACGTAG---TGAC-G-----CA--CCG--ATCGACTTCCCCTGGAA-TGTCTATCTCTG-G----GACAAT--C-TT----------CCAAG-CCCACTCA-TTCCTGTTTCCTCGGATTTAATTCC
gi|89816                      :                                                 T-CCACCTAT-TCTCCAGTA-TGC-TTA-TTTCTGCCCTAGTAT--ACACCATGGGCTCT--GCACGTAGGTCC-TGACCCCGTA-A-TTGTA-CTGTATATCT-CGTTGGGT-GTCTC-GCCTGG-CCAT-TG------G---TGAT-G-----CA--GCG--ATCGCCTTCCC------------ATTTCTA-G----GTC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGG-TTCTCGGGTTCACTCC
gi|89817                      :                                                 T-CTACTCA-ATCCCCATTA-TAT-TCA-TTT-TGCTCCAGTAT--CCACCAAGGGCTTCTTGCAGATAGGTCC-TGGACCTGTA-T-TTGCA-TTGCGT--------TAAGGAGCCCC-GCCTGGACCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--GAC--ATCGCCTTTCCCTGGAACTTTCCAACTCTG-G----GAC-AT--T-CT-------CC-TCGAGATCCATATA-T-TTTGGTTTTTCGGGT
gi|89818                      :                                                      CTCAG-TTCCCAGTA-TGC-TAA-TTTCTGCCCCAGTAG--CCACCACAGGATCT--GCAAGTAGGTCC-CGAGCTCGTA-ATTTACA-CTGCATATAT-TGTTG
gi|89819                      :                                                            TTCCCAGTA-TGA-CTA-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCATGGGCTCT--GCACGTAAGGTC-TGACCCTGTA-A-TTGCAACTGTATATCT-CGTTGGGT-GTCTC-AC-TGG-C--G-TG------G---TG-T-G------A--CCGCGATCGCCTTCCCCTTGAA-T-TCTATATCTA-GATAGGGC-AT--C-CT-------CC-C-GAG-CCAACTCA-TCCCTGGTTTCTC-GGTTCACTCC
gi|89820                      :                                                            TCCTCAGCA-TGC-TCA-CCTCTGTCCCAGTAT--CTACCACAGCCTCC--ACAGGTAGGTCC-AGAACTAGTA-G-TTGCA-CCACATATCC-GGTTGAGG-TCCTC-ACCTGG-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CCC--ATTGCCCTC----------------CTCTG-A----GGT-GT--T-CT-------CC-CTGAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89821                      :                                                            TCCCAAGTA-CGC-TTA-CCACTGCCCCGGTGT--CCACCACTGCCTCC--ACAGGTAGATCC-TGGACTCGTA-G-TTTCA-CCACGTATCC-GGTTACGG-GCCTC-ACCTGT-TCCA-CG------G---GGAC-G-----CA--TTC--ATCGCCCTCACCTGGGG-TCTCTA-------G----GGT-GT--T-CT-------TC-TCAAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89822                      :                                                             CCCCAGCA-TGC-TCA-TTTATGTTCCAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GCAAGTAGGTCC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGATT-GCCTC-ACATGG-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CC
gi|89823                      :                                                              CTCAGCA-TGC-CTA-CT-CTGTCC-AGTAT--T-AC-ACAGCCTCC--ACAGGTAGGTCA--GAACTAGTA-GTTTGCA-C-ACATAT-C-CGGTGAGGTCCCTC-ACATGG-CCA--TG------G---TGAT-G-----CG--CC---ATTGCCCTTC---------------CTCTG-A----GGT-GT--T-CT-------CC-CTGAGATTTACTCGTTCCCTGG
gi|89824                      :                                                                                    CCCTAGCACGCTCACCACAGCCTTC--ATAGGTAGGTTC-TGAACTCTTAGA-TT-TA-CCATAAATCC-TGCTGATG-GCCTC-ACCTGG-CCGA-TG------G---TAAT-A-----CA--TTC--GTCACCCTCCCCTGGGA-TC
gi|89825                      :                                                                                    tttgtGTGT--CCACCACTGCCTCC--ACAGGTATGTTC-TGAACTCGTA-G-TTTCA-CCATGTATCC-GGTTAAGG-GCCTT-ACCTGT-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--TTC--ATCGCCCTCACCTGGGG-TCTCTA-----G-G----G---------TT-------TC-TCAAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89826                      :                                                                                           AT--CCACCACGGGCTCT--GCACTTAGGTCC-TGAATCCGTA-A-TTGCA-CTGTATATC--------------TC-AACTTG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCTTTCCCCTAGAA-TCTCTATCTTGA-G----GGC-AT--C-CT--------T-TCGAG-TCCACCCA-TTCCCCGTTTCTCGGGTTCACTCC
gi|89827                      :                                                                                                                                                                                                                   --ATCACCTCCCCCTATAA-TCTGTATCTCTG-G----GAC-AT--C-CT-------CC-TCGGG-CCCAC-CA-TCCTTGGTTTTTCGGGTCCACTCCC


blockSeqs                     :                                                  A        A         A   T   T               GC         T   CTT            G          G T    AA          ACT      A     A      A    T  CACGTA CTT    A TAATT  TC   CG             AT  C   G        T ATAG   A  TA T  GTATATAT G     A     C  T
blockSeqs                     :                                                  A        A         .   .   A               .          T   T              .          . T    T           AT       T     .      .    .  .      .      . C      .    T              AT  .   G        . .      .  .  .  AGCC     .     A     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        A         .   .   .               .          T   T              .          . .    T           CT       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              AT  .   G        . .      .  .  .  C        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        A         .   .   .               .          T   T              .          . .    T           CT       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              AT  .   G        . .      .  .  .  C        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        A         .   .   .               .          T   T              .          . .    T           TT       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              AT  .   C        . .      .  .  .  A        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        A         .   .   .               .          T   G              .          . .    T           GC       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              AT  .   C        . .      .  .  .  A        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        A         .   .   .               .          T   T              .          . .    T           CG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              TG  .   C        . .      .  .  .  A        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        A         .   .   .               .          C   T              .          . .    T           CA       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GG  .   C        . .      .  .  .  C        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        A         .   .   .               .          G   C              .          . .    A           CG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GG  .   C        . .      .  .  .  C        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        .         .   .   .               .          C   T              .          . .    A           CA       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GG  .   G        . .      .  .  .  T        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        .         .   .   .               .          C   C              .          . .    A           CA       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              AG  .   G        . .      .  .  .  T        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        .         .   .   .               .          T   C              .          . .    G           CT       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GG  .   C        . .      .  .  .  C        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        .         .   .   .               .          G   C              .          . .    G           CG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GA  .   C        . .      .  .  .  C        .     .     A  .
blockSeqs                     :                                                  .        .         .   .   .               .          G   T              .          . .    T           CG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GA  .   C        . .      .  .  .  C        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        .         .   .   .               .          G   T              .          . .    A           CG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GG  .   C        . .      .  .  .  C        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        .         .   .   .               .          T   T              .          . .    A           TG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GG  .   C        . .      .  .  .  C        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        .         .   .   .               .          G   T              .          . .    A           CG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              TG  .   C        . .      .  .  .  C        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                  .        .         .   .   .               .          G   T              .          . .    A           TG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GG  .   C        . .      .  .  .  C        .     .     T  .
blockSeqs                     :                                                           .         .   .   .               .          G   T              .          . .    A           CG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GG  .   C        . .      .  .  .  T        .     .     C  .
blockSeqs                     :                                                                     .   .   .               .          G   T              .          . .    A           GG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              GG  .   C        . .      .  .  .  C        .     .     .  .
blockSeqs                     :                                                                     .   .   .               .          C   T              .          . .    A           GG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              AG  .   G        . .      .  .  .  T        .     .     .  .
blockSeqs                     :                                                                     .   .   .               .          C   C              .          . .    A           CT       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              AT  .   .        . .      .  .  .  C        .     .     .  .
blockSeqs                     :                                                                     .   .   .               .          T   C              .          . .    A           CG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              .   .   .        . .      .  .  .  .        .     .     .  .
blockSeqs                     :                                                                     .   .   .               .          C   T              .          . .    T           TG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              .   .   .        . .      .  .  .  .        .     .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                             .          C   C              .          . .    A           GG       .     .      .    .  .      .      . .      .    .              .   .                                                       
blockSeqs                     :                                                                                             .          C   C              .          . .    A           T        .     .      .    .  .      .      . .      .    .                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                             .          G   C              .          . .    A           .        .                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                             .          .   T              .          . .    A           .                                                                                                                                    


blockSeqCons                  :                             
originalCons                  :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATCC-CGTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
finalCons                     :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATCC-CGTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC





Alignments
lowQualScore                  :                                                           1                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                  4        5         1   1   3               11       0 2   222            1          1 2    22          333      2     1      1    1  444444 222    1 55555  22   33             22  1   1        1 3333   1  22 1  88888888 1     3     5  1                         
lowQualScore                  :                                                  .        .         .   .   .               ..       . .   ...            .          . .    ..          ...      .     .      .    .  ...... ...    . .....  ..   ..             ..  .   .        . ....   .  .. .  ........ .     .     .  .                         
lowQualScore                  :                                                  2        5         6   6   2               99       4 3   777            4          4 8    44          000      9     5      5    5  333333 666    5 22222  00   55             88  5   0        6 4444   6  22 6  22222222 6     2     0  6                         
consensus                     :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATCC-CGTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
Reference ( family-541 )      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGNCTCC--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCGTATCC-CGTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89798                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TAA-TTTCTGTTCTAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GTAGGTAGGTTC-TTAACCCATA-A-TTGCT-CTGCATATCC-CTTTGATG-GCCTC-ACCTGG-CCGG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCACATCCCCCTATAA-TCTGTTTCTTTG-G----GGC-AT--A-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89799                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTATTCCAGCAT--TCACCACATTCTTT--GCATGTAGGTTC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CAGCGTATCC-ATTTAATG-GTCTA-ACTTGG-CAAG-TG------G---TGAT-A-----CA--CCG--ATCACCTCCCCCTATGA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89800                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCATTTTCTATTCCAGCAT--TCACCACATTCT-T--GCATGTAGGTTC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CAGCGTATCCACTTTAATG-GTCTA-ACTTGG--CAA-TG------G---TGAT-A-----CA--CCG--ATCACCTCCCCCTATGA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------CC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89801                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCACAGTCTTT--ACAGGTAGGTTC-TGAACCCATC-A-TTGCT-CAGCGTATCC-CTTT---G-GCCTC-ACCTGG-CAAG-TG------GCTTTGATAG-----CATCCCG---TCACTCCCCCCTATAA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGGG-CCCAC-CA--CCCTGGTTTCTC-GGTCCACTCCC
gi|89802                      :                             TCAAGGGAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGCTTCA-TTTCTGTCCCAGCAT--ACACCACAGTCTTT--ACAGGTAGGTCT-GAAACCCATT-C-ATGCT-CAGCGTATCC-T-TT---G-GCCTCAACCTGG-CAAGTTG------G---TGAT-AC----CA--CCGT-ATCA-CTCCCCCTATAA-TCTGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGGG-CCCAC-CA-TCCCTGGTTTCTCGTGTCCACTCCC
gi|89803                      :                             TCAAGGGAACCACATACAGGT-CCACTCAGATCCTCAACA-CTC-TCA-TTTCTGGCCCAGTAT--CCACCACGGTCTCG--GCAGGTAGGTCA-TGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGAGG-GCCTC-GCATGG-CCAG-TG------G---TGAT-GTAATTCA--CCG--ATCACCTCCCCCTATAA-TCCCTTTCTCTG-G----GGC-AT--C-CT-------AC-CCGAG--CCACCCA-TCCCTGGTTTCTCGAGTCCACTCCC
gi|89804                      :                             TCAAGCGAACCACATACAGGT-CCACTCCGACCCCCAACA-CCC-TCA-TTTCTCCGCCAGTAT--CCACCACGGTCTCT--CTAGGTAGGTCC-TAAACCCACA-A-TTGCT-CTGCATATCC-TTTTGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TG------A---TGAT-G-----CA--TCG--ATCGCTTTACCCTATAA-TCTCTATCTCTT-G----GGC-AT--C-CT-------CC-TCAAA-CCCACTTA-TCCCTGATTTCTTGGGTTCACTCCC
gi|89805                      :                             TCAAGGAAACCACATACATGT-CCACTCAGATCCCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GCAGGTAGGCCC-CGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-GCTTGATG-GCATC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCACC
gi|89806                      :                               AATGGACCCACA-ATAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTG-CGC-TCA-TTTCTGCCCCACTGT--CCACCATGGCCTCC--ACAGGTACGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGTGAATCT-CGTAGAGG-GCCTC-ACCTGG-CCAG-TT------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCATGAA-TCTCTATCTCTG-G----GGC-AT--C-TT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-CCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89807                      :                                            ACAAAT-CCACTCAG-TCCCCAGTA-TGC-TAA-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCACGGGCTTT--GCACGTAGGTCC-TGAACCTGTA-A-TTGCA-CTGTTTATCT-CATTGAGT-GTCTC-ACCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCA--ATCGCCTTCCCCTGGGA-TCTCTATCTCTA-G----GGT-ATTAC-ATGTATATATC-CAGAG-CCCACTCA-TCCCTGGTATCTAGGGTTCACTCC
gi|89808                      :                                                                                             --CCACCAAAG--TCC--AAAGGCA---CCGTGAACCCGTA-A-TTGCA-CCGAGTATCC-CGTTGAGG-GTCTC-ACCTGG-ACAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCTTTCCCCTGGAA-TAACTACCTCTGTG----GGC-GT--C-CG-------TC-TTGAG-CCCACTCA-T-TCTGGTTCCTCGGTTTCACTCCC
gi|89809                      : cgtgtccataagagaaagtcccgagcgaaatggcaatttacaccgATGTACTGCTCTG-TTCCAAGAA-CAC-TCA-CCTCTGCCCCAGTAT--CCACCACAGCCTCC--GCAGGTAGGTTC-TGAACCCGT--A-TTGCG-CTGAGTATCC-CATTGAGA-ACCTC-ACCAGG-CCA--TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCTCCTGGAC-TCCGTATCTCTG-G----GGC-AT--C-TT-------TTGCCGAG-TCCATTCA-TCCCTGGTTCCTCGGGTCCATTCCC
gi|89810                      :                                              ATGTACTGCTCTG-TCCCCAGCAATGC-TCA-CCCCCGCCCCAGTAT--CCACCAAGGCCCTC--TTAGGTAGGTTC-TGAACCCGTA-G-TTGTG-CTGAGTATCC-CATAGAGG-GCCTT-ACCAGG-CCAG-T-----------------------A--CTT--ATCGCCTTCCCCTAGAA-TCTGTATTTCTG-G----GAC-AT--CTTT-------CC-CCGAG-TCCATTTA-TCCCTGGTTCCTCGGGTCCAC
gi|89811                      :                                              ATGT-CCACTCAGATCTCCAGCA-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCAT--TTACTACAGTCTTT--GCAGGTAGGCCC-TGAATCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGATG-GC
gi|89812                      :                                                 T-CCAATCAG-TCCCCAGAA-TGC-TAA-TTTCTAACCCAGTAT--CCACCACGGGCTCT--GCAGGTAGGCCC-TGAACC-GTT-A-TTGCA-CTGCATATCT-CGTTGAAT-GCCTC-GCCTGG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGTCTTCGCCTGGAA---TCTATCTCAA-G----GGC-AT--C-CTAGC----CC-CCGAG-TTCACTCA-TCCCTGGTTTCTCGGGTCCACTCCC
gi|89813                      :                                                 T-CCACTCAT-TCCCTAGTA-TGC-TAA-TTTATGCCCCAGTAT--ACACCACGAGCTCT--GCAGGTAGCTCC-TAAACTCGTA-A-TTGCA-CTGTATATCT-CGTTGAGT-GCCTC-ACCAGA-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CCA--TTCTCCTTCCCCTGAAC-TCTCTACCGCTA-G----GGT-AT--C-CT-------CC-CCGA--CCCACTCA-TCCCTGGTTTCTGGGGTCCACCCCC
gi|89814                      :                                                 T-CCACTCAG-TCCCCCGTT-TGT-TTAATTTCTGCCCCAGTAA--CCACCACGGGCTCT--GCAGGTAGGTCC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTGCATATCT-CGTTGAGT-GCCTC-ACCTGG-CCAG-AG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCCTTCCCCTGAAA---TCTATCTTTA-A----GGT-AT--A-CT-------CC-CTGAA-CCTACTCA-TCCCCGGTTTCTTGGATCAACT
gi|89815                      :                                                 T-CCAGTCGG-TCCCCAGCA-CGC-TAA-CTTCTGCCCCAGTAT--CCACCACGGTATCT--GCAGGTAGGTTC-TGAACCCGTA-A-TTGCA-CTAAATATCT-TGTTGAGG-GCCTC-CCTTCG-TCAG-TGCACGTAG---TGAC-G-----CA--CCG--ATCGACTTCCCCTGGAA-TGTCTATCTCTG-G----GACAAT--C-TT----------CCAAG-CCCACTCA-TTCCTGTTTCCTCGGATTTAATTCC
gi|89816                      :                                                 T-CCACCTAT-TCTCCAGTA-TGC-TTA-TTTCTGCCCTAGTAT--ACACCATGGGCTCT--GCACGTAGGTCC-TGACCCCGTA-A-TTGTA-CTGTATATCT-CGTTGGGT-GTCTC-GCCTGG-CCAT-TG------G---TGAT-G-----CA--GCG--ATCGCCTTCCC------------ATTTCTA-G----GTC-AT--C-CT-------CC-CCGAG-CCCACTCA-TCCCTGG-TTCTCGGGTTCACTCC
gi|89817                      :                                                 T-CTACTCA-ATCCCCATTA-TAT-TCA-TTT-TGCTCCAGTAT--CCACCAAGGGCTTCTTGCAGATAGGTCC-TGGACCTGTA-T-TTGCA-TTGCGT--------TAAGGAGCCCC-GCCTGGACCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--GAC--ATCGCCTTTCCCTGGAACTTTCCAACTCTG-G----GAC-AT--T-CT-------CC-TCGAGATCCATATA-T-TTTGGTTTTTCGGGT
gi|89818                      :                                                      CTCAG-TTCCCAGTA-TGC-TAA-TTTCTGCCCCAGTAG--CCACCACAGGATCT--GCAAGTAGGTCC-CGAGCTCGTA-ATTTACA-CTGCATATAT-TGTTG
gi|89819                      :                                                            TTCCCAGTA-TGA-CTA-TTTCTGCCCTAGTAT--CCACCATGGGCTCT--GCACGTAAGGTC-TGACCCTGTA-A-TTGCAACTGTATATCT-CGTTGGGT-GTCTC-AC-TGG-C--G-TG------G---TG-T-G------A--CCGCGATCGCCTTCCCCTTGAA-T-TCTATATCTA-GATAGGGC-AT--C-CT-------CC-C-GAG-CCAACTCA-TCCCTGGTTTCTC-GGTTCACTCC
gi|89820                      :                                                            TCCTCAGCA-TGC-TCA-CCTCTGTCCCAGTAT--CTACCACAGCCTCC--ACAGGTAGGTCC-AGAACTAGTA-G-TTGCA-CCACATATCC-GGTTGAGG-TCCTC-ACCTGG-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CCC--ATTGCCCTC----------------CTCTG-A----GGT-GT--T-CT-------CC-CTGAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89821                      :                                                            TCCCAAGTA-CGC-TTA-CCACTGCCCCGGTGT--CCACCACTGCCTCC--ACAGGTAGATCC-TGGACTCGTA-G-TTTCA-CCACGTATCC-GGTTACGG-GCCTC-ACCTGT-TCCA-CG------G---GGAC-G-----CA--TTC--ATCGCCCTCACCTGGGG-TCTCTA-------G----GGT-GT--T-CT-------TC-TCAAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89822                      :                                                             CCCCAGCA-TGC-TCA-TTTATGTTCCAGCAT--TCACCA--GTCTTT--GCAAGTAGGTCC-TGAACCCATA-A-TTGCT-CTGCGTATCC-CTTTGATT-GCCTC-ACATGG-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--CC
gi|89823                      :                                                              CTCAGCA-TGC-CTA-CT-CTGTCC-AGTAT--T-AC-ACAGCCTCC--ACAGGTAGGTCA--GAACTAGTA-GTTTGCA-C-ACATAT-C-CGGTGAGGTCCCTC-ACATGG-CCA--TG------G---TGAT-G-----CG--CC---ATTGCCCTTC---------------CTCTG-A----GGT-GT--T-CT-------CC-CTGAGATTTACTCGTTCCCTGG
gi|89824                      :                                                                                    CCCTAGCACGCTCACCACAGCCTTC--ATAGGTAGGTTC-TGAACTCTTAGA-TT-TA-CCATAAATCC-TGCTGATG-GCCTC-ACCTGG-CCGA-TG------G---TAAT-A-----CA--TTC--GTCACCCTCCCCTGGGA-TC
gi|89825                      :                                                                                    tttgtGTGT--CCACCACTGCCTCC--ACAGGTATGTTC-TGAACTCGTA-G-TTTCA-CCATGTATCC-GGTTAAGG-GCCTT-ACCTGT-CCAA-TG------G---TGAT-G-----CA--TTC--ATCGCCCTCACCTGGGG-TCTCTA-----G-G----G---------TT-------TC-TCAAG-ATTACTCG-TCCCTGG
gi|89826                      :                                                                                           AT--CCACCACGGGCTCT--GCACTTAGGTCC-TGAATCCGTA-A-TTGCA-CTGTATATC--------------TC-AACTTG-CCAG-TG------G---TGAT-G-----CA--CCG--ATCGCTTTCCCCTAGAA-TCTCTATCTTGA-G----GGC-AT--C-CT--------T-TCGAG-TCCACCCA-TTCCCCGTTTCTCGGGTTCACTCC
gi|89827                      :                                                                                                                                                                                                                   --ATCACCTCCCCCTATAA-TCTGTATCTCTG-G----GAC-AT--C-CT-------CC-TCGGG-CCCAC-CA-TCCTTGGTTTTTCGGGTCCACTCCC