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Reference ( gi|47147 )        :                  TAAAGCCCCCATCACAC--TG-G--A-CCACG-AT--CTTA---------CTACGATC----T---T-----GA-TTTT--T------GCCT--AA--A--TCGTGACA-----G-G-T--C--G--TAGCA-T-G--A---T-C------GTCGTGA
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gi|47171                      :   AAGCCCCCGTCACAC--CA-GA-CCACG-AC-CTTA---------CTACTATC----T---T-----GA-TTTT--C-------CCT--AA---T-TCGTGACA-----A-G-T--C--G--TAGC-GT-GG---T-C------
gi|47172                      :   AAGCCCCCGTTACAC--TG-G--CCACG-AT-TTCA---------CTACGCTC----T---T-----CA-------C------GACT---G---A-TCGTAGTA-----GAA-T--C--G--TA---GT-GG---T-C------GGTGTGA
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Reference ( family-537 )      : TAAAGCCCCCATCACAC--CG-GA-CCACG-AT-CTTA---------CTACGATC----T---T-----GA-TTTT--T------GCCT--AA---A-TCGTGACA-----G-G-T--C--G--TAGC-GT-GG---T-C------GTCGTGA
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blockSeqs                     :                  .   . A      .  .    .                .    T          .    T            .   .   .        G       . .  .  .     .  .  .   . .     
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blockSeqs                     :                  .   . A      .  .    .                .    T          .    C            .   .   .        A       . .  .  .     .  .  .   . .     
blockSeqs                     :                  .   . A      .  .    .                .    T          .    A            .   .   .        G       . .  .  .     .  .  .   . .     
blockSeqs                     :                  .   . .      .  .    .                .    T          .    T            .   .   .        G       . .  .  .     .  .  .   . .     
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blockSeqs                     :                  .   . .      .  .    .                .    T          .    .            .   .   .        .       . .  .  .     .  .  .   . .     
blockSeqs                     :                  .   . .      .  .    .                .    T          .    .            .   .   .        .       . .  .  .     .  .  .   . .     
blockSeqs                     :                  .   . .      .  .    .                .    .          .    .            .   .   .        .       . .  .  .     .  .  .   .       
blockSeqs                     :                      . .      .  .    .                .    .          .                                                                          


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