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Reference ( family-527 ) : TTT-TTTTTTTTT----A-T---TT--C--A----C-T--C--AT-A-AG-A-T-GTG---T--GA--A-AG-AA-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---TG-A-A--C---A---CT-A---TC-A-A-G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--T---A--C----A-----A----TG-TCTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
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gi|70135 : TTTCTTT----A-T---CG--C--A----C-T--C--AT-A-AG-A-T-GTG---T--GA--A-A--AA-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---TG-A-A--C---A---CT-A---TC-A-G-G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--TACAA--C----A-----A----TG-TCTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AG----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-TTT-
gi|70136 : TTTTTTT----A-T---CT--C--G----C-------AT-A-AG-A-T-GCG---T--GA--A-A--AA-AA-GC---A-T--TT---------GCA-TTGAGGGG--ATAT---TG-ATC--C---A---CT-A---TC-ATA-G---T--GGA--A-A-----G--C--G-CAGTGCT-----A--TA---------C----A-----ACACTTG-TGTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
gi|70137 : TTTTTT----C-T---CT--C--A----C-T--T--AT-A-A--A-C-GAG---T--GA--A-AA-AA--------------TT---------CTC-ATAAAGGT--AT-T---TG-A-------------------TC-A-A-A---T--GGT--C-ACGGTTG--T--G-CAAT-C------A--CAC-T---A--C----A----------TG-ACTT----T--GT--GA-A--AC-AA--AACAATA--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---GC----TG-GTT-C-ATTT
gi|70138 : A--A-AA-AA-AA-GC---A-T--TT---------GC--TTGAGGG---ATAT---TG-A-AA-C---A---CT-A---TC-A-A-G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--T---G--TTATAA-----A----CGTTTTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T-----CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
gi|70139 : cagtcacaaaaca-AA-AA-GT---A-T--TT---------ACC-AAGAGAGG--G-------------------------G---TC-A-A-A---TCGGGT--A-A-----G--C--GGCTGTGCA-----A--TG--T---A--C----AC----A----TG-ACTT----T--GT--GA-A--AC-AA--AAAAC-A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---
gi|70140 : tgtgaaaaaattctcatA--A-AA-AA-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---TGAA-A--C---A---CT-A---TC-A-A-G---T---GC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TATGT---A--T----A-----AACG-TA-TTTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T-----CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
gi|70141 : A-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGTG--ATAT---TG-A-AC-C---A---CT-A---TC---A-G---T---GCAAA-A-----G--C--G-CA-T-CT-----A---A--T---A--C----A-----A----CG-TCTT----C--GT--AA-A--G--AA--AA----A--CCATTG---T--GCTCTA-A-T-------C---ACT---TT-GTT-
gi|70142 : aaacA-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---TG-A-A--CAGGA---TG-A---TC-A-A-G---T--GGC--A-A-----G--T--G-CAGT-CT-----A--TA--T---A--C----AAT---A----TG-TCTT----T--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---A
gi|70143 : GAGGGG--ATAT---TG-A-A--C---A---CT-A---TC-G-A-G---T--GGCT-ATA-----G--C--G-CAGT-TT-----A--CA--CA--A--C----A-----A----TG-TCTTCATAC--GT--AA-A--AC-AATTAA----A--C----G---T--G--TTG-A-T-------C---ATT---TT-GTT-G-ATTTT
gi|70144 : AT---TG-A-A--C---A---TT-A---TC-A-A-G-------------------G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--C---AA-C----A-----A----TG-TTTT----C--GT--AA-A--A
gi|70145 : ----A-----A----TG-TCTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
blockSeqs : . GCTC A AGA GC CC TCGC G TA CT A T C AT AGC TT AG C GA G A GCT G CT CTCGATATT C GA TTC A T AC AGG CAT T ATC A C A ATA CG AAA CGGTT GC CC C T CGATG AT TACA AC TATA AGCAT CACT T CATA CA CC T AC T TT CAAT TC CATT TGC GG CT . T CCCCCCC ACA AAA G G C
blockSeqs : . . . . . . . C . T T . . TT . . T . GA . . . A . . A . . A . C T AGC . A . T . . . AAA A GC . G G TC T TGT A T ACAC ACG . A . A T T A . AAC . . C . . . . C . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . CT . . T . G . . . . . . C . . A . A A . . . . . . . . TAT . . . . G . T CA . G AT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . CT . . . . . . C CT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . CA . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTT-TTTTTTTTT----A-T---TT--C--A----C-T--C--AT-A-AG-A-T-GTG---T--GA--A-AG-AA-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---TG-A-A--C---A---CT-A---TC-A-A-G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--T---A--C----A-----A----TG-TCTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
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Alignments
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lowQualScore : . .... . ... .. .. .... . .. .. . . . ... ... .. .. . .. . . ... . .. ......... . .. ... . . .. ... ... . ... . . . ... .. .... ..... .. .. . . ..... .. ...... .. .... ..... .... . .... .. .. . .. . .. .... .. .... ... .. .. . . ....... ... ... . . .
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Reference ( family-527 ) : TTT-TTTTTTTTT----A-T---TT--C--A----C-T--C--AT-A-AG-A-T-GTG---T--GA--A-AG-AA-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---TG-A-A--C---A---CT-A---TC-A-A-G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--T---A--C----A-----A----TG-TCTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
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gi|70129 : T-TGTTTTTTT----A-T---T---C--A----C-T--C--AT-A-GA-A-T-GT----T--GA--A-AG-AA-AG-CC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--AAGT---TG-A-A--G---A---CT-A---AC-A-A-G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT--T-----A--TA--T---A--CG---A-----A----TG-TCTG----C--GT--GA-A--CA-AA--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
gi|70130 : T-TTTTTTTTT----A-T---CT--C--G----C-T--C--AT-A-AG-A-T-GTG---T--GA--A----AA-AA-AC---A-T--AT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---TG-A-A--C---A---CT-A---TC-A-A-G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT-TT-----A--TA--CA--A--C----G-----A----TG-TCTT----
gi|70131 : -TTTTTTTTT----A-T---TT--C--A----C-T--C--AT-A-AG-A-T-GTG---T--AA--A-AA-AA-AA-GC---A-T--TT---------GCT-TTGAGGGG--ATAT---TG-A-A--C-------CT-----TC---A-G---T--GGC----A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--T---A--C----A-----A----CG--CTT----C--GT--AA-A--AC--A--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-----------A-----TT-GTT-G-ATTTT
gi|70132 : -TCTTTTTTT----A-T---TT--C--A----CCT--A--ATCA-AGCA-T-CCG---T--GA--A-AA-AAGAA-GC---A-T--TT---------GCC-TTT-GAGG--ATAT---TG-A-AACC---A---CT-A---GT-ACA-G---T---GC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--T---A--C----A-----A----GC-CCTTA---C--GT--AA-A--CC-AA--AA----A--C----GC--T--G--CT--A-T-------C---AC-----T-GTT-GCATTT
gi|70133 : TTTTTTTT----A-T---TT--C--A----C-T--C--AT-A-AG-A-T-GTG---G--GG--A-A--AA-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGA--ATAT---TG-A-A--C---A---CT-A---TC-A-A-G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--T---A--C----A-----A----CG-TCTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----GTGCT--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G--TTT
gi|70134 : TTTTTTTT----A-T---AT--C--A----C-T--C--AT-A-AG------------------------------C---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---T--A-A--C---A---CT-A---TC-A---G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--T---A--C----AACAC-A----TG-TCTT----C--CT--AA-A--ACAAA--AA----A--C----G---T--G--CTA-T-T-------C---ACT---TT-TTT-G-ATTT
gi|70135 : TTTCTTT----A-T---CG--C--A----C-T--C--AT-A-AG-A-T-GTG---T--GA--A-A--AA-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---TG-A-A--C---A---CT-A---TC-A-G-G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--TACAA--C----A-----A----TG-TCTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AG----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-TTT-
gi|70136 : TTTTTTT----A-T---CT--C--G----C-------AT-A-AG-A-T-GCG---T--GA--A-A--AA-AA-GC---A-T--TT---------GCA-TTGAGGGG--ATAT---TG-ATC--C---A---CT-A---TC-ATA-G---T--GGA--A-A-----G--C--G-CAGTGCT-----A--TA---------C----A-----ACACTTG-TGTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
gi|70137 : TTTTTT----C-T---CT--C--A----C-T--T--AT-A-A--A-C-GAG---T--GA--A-AA-AA--------------TT---------CTC-ATAAAGGT--AT-T---TG-A-------------------TC-A-A-A---T--GGT--C-ACGGTTG--T--G-CAAT-C------A--CAC-T---A--C----A----------TG-ACTT----T--GT--GA-A--AC-AA--AACAATA--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---GC----TG-GTT-C-ATTT
gi|70138 : A--A-AA-AA-AA-GC---A-T--TT---------GC--TTGAGGG---ATAT---TG-A-AA-C---A---CT-A---TC-A-A-G---T--GGC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--T---G--TTATAA-----A----CGTTTTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T-----CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
gi|70139 : cagtcacaaaaca-AA-AA-GT---A-T--TT---------ACC-AAGAGAGG--G-------------------------G---TC-A-A-A---TCGGGT--A-A-----G--C--GGCTGTGCA-----A--TG--T---A--C----AC----A----TG-ACTT----T--GT--GA-A--AC-AA--AAAAC-A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---
gi|70140 : tgtgaaaaaattctcatA--A-AA-AA-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---TGAA-A--C---A---CT-A---TC-A-A-G---T---GC--A-A-----G--C--G-CAGT-CT-----A--TATGT---A--T----A-----AACG-TA-TTTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T-----CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT
gi|70141 : A-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGTG--ATAT---TG-A-AC-C---A---CT-A---TC---A-G---T---GCAAA-A-----G--C--G-CA-T-CT-----A---A--T---A--C----A-----A----CG-TCTT----C--GT--AA-A--G--AA--AA----A--CCATTG---T--GCTCTA-A-T-------C---ACT---TT-GTT-
gi|70142 : aaacA-AA-GC---A-T--TT---------GCC-TTGAGGGG--ATAT---TG-A-A--CAGGA---TG-A---TC-A-A-G---T--GGC--A-A-----G--T--G-CAGT-CT-----A--TA--T---A--C----AAT---A----TG-TCTT----T--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---A
gi|70143 : GAGGGG--ATAT---TG-A-A--C---A---CT-A---TC-G-A-G---T--GGCT-ATA-----G--C--G-CAGT-TT-----A--CA--CA--A--C----A-----A----TG-TCTTCATAC--GT--AA-A--AC-AATTAA----A--C----G---T--G--TTG-A-T-------C---ATT---TT-GTT-G-ATTTT
gi|70144 : AT---TG-A-A--C---A---TT-A---TC-A-A-G-------------------G--C--G-CAGT-CT-----A--TA--C---AA-C----A-----A----TG-TTTT----C--GT--AA-A--A
gi|70145 : ----A-----A----TG-TCTT----C--GT--AA-A--AC-AA--AA----A--C----G---T--G--CTG-A-T-------C---ACT---TT-GTT-G-ATTTT