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lowQualScore                  :      .   .. . .   .. . .......    ....   .  ...  ................ . ... ....    ...  . ...  .  . . . . ....... ..    . .. .... ..   .. . ........ .  ..... . ......   . .. .. .. ........ .  ... .. . .  ..  .  ..    ..  ......  . .   .   .   .  .. .. .. .. .... .   .   ........... . . . .. .  ... ..    . ...... . ..... . . .    ....  . ..     ...   .......    . ...  .    ....... . .  . .   ...  ...   ...    .       
lowQualScore                  :      7   66 7 7   33 7 2222222    3333   5  222  0000000000000000 5 777 3333    111  5 555  4  3 4 4 4 6666666 00    9 00 5555 00   00 9 22222222 4  99999 4 888888   4 22 99 99 44444444 4  777 77 4 4  00  9  00    99  777777  7 4   4   4   8  99 00 33 99 9999 8   9   88888888888 9 9 4 55 9  666 00    5 444444 4 00000 4 3 4    3333  6 11     222   5555555    5 777  5    4444444 5 5  5 1   444  444   888    7       
consensus                     : ATTGA-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-A---T----GCAC---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--GC---AC-GT-G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G-----CC-T-----C-G-C-ATGT----TG-A--ACCAT---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----T-A-T-CA-G-TTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
Reference ( gi|77148 )        : ATTGA-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-A---T----GCAC---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--GC---GT-GT-G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G-----AC-T-----C-G-C-ATGT----TG-A--ACCAT---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----C-A-T-CA-G-TTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77149                      : ATTGA-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-A---T----GCAC---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--GC---GT-GT-G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G-----AC-T-----C-G-C-ATGT----TG-A--ACCAT---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----C-A-T-CA-G-TTG---TG---TTT---AA-T-TTTAATT
gi|77151                      : ATTGA-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GAC-CT---TT---C-------C-C--T-A---T----GCAC---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--T----T--CAT--G-C--------T-TG-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-GT--GA-CT--CAAA--GC---AC-AT-G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-A-----CC-T-----A-T-G-ATGT----TA-A--ACCAT---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----T-A-T-CA-G-TTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77152                      : ATTGA-TTT--A-A-TAA--T-T-------CTTT----GCC-CT---TG---T-------G-C--T-A---T----GCAC---TT-T---TA-GT-G-C-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-T--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-TT---C--A-C-AT--GA-CT--C-AA--GC---AC-GT-G-ATG-ATT-C-A-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G-----AC-T-----C-GCC-ATCT----TG-A--ACTAT---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----T-A-T-CA-G-TGT---TG---TTT---AA-T-TTTAATT
gi|77150                      : ATTGA-TTTT-A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---T-------TTC--T-A---T----GCAC---TT-T---TA-GTTG-T-A-T-------C--ATAA----C----T--CAT--G-C--------C-TA-------A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--GC---GTTGT-G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T------TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---GGCCTTT-G-----AC-T-----C-GGC-ATTT----GG-A--ACCAT---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----C-A-T-CA-G-TTGT--TG---TTT---AATG-TTTAATT
gi|77153                      : ATTGA-TTT--A-A-CAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TGCCAT-------G-CA-T-A---T----GCAC---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--TGAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-G-AT--GA-CT--TATA--GC---AC-GT-A-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGG-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---A--CCTT-G-----CC-T-----C-G-C-ATGT----TG-A--ACCAT---TAC-------TACA-A---TA-AATG-----T-A-T-CA-G-TTG---TG---TTT---ATTT-TTTAATT
gi|77154                      : ATTGA-TTC--A-A-TAA--T-TTTTCCCCCCTTTGGGGCC-CT---TG---T-------G-C--T-A---T----GCAC---TT-T---TA-GT-G-C-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----TTA------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--GC---AC-GT-G-ATG-ATT-CAA--T--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--ATTT---G--CCTT-G-----AC-T-----C-A-C-ATGT----TG-T--ACCAT---TAC-------TACA-A---TA-GAT------T-A-A-CA-G-TTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77155                      : ATTGA-TT---A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---T-------G-C--T-A---T----AAAC---TT-T----A-AT-G-C-A-T-------C--ATAA----C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--GC---AA-GT-G-ATA-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-A--A-TT---G--CCTT-G-----CC-T-----C-G-C-ATGT----TG-T--ACCAT---TAA-------TACG-A---TA-GATG-----T-A-T-CA-G-TTG---TG---TTT---AATC-TTTAATT
gi|77156                      : ATTGA-TTT--GGA-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-A---T----GC-C---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA----C----C--CAT--G-T--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--ACAACGT-CG-A-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G------C-TG----C-G-CTCTGT----TG-A--AATA----TAC-------TACA-A---TA-GATG-----T-A-T-CA-ACTTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77157                      : ATTGA-TTT--A-A-TAAAAT-T-------TCTT----GTC-CT---TG---T-------G-C--T-A---TT---GCAC---TT-T------GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----C--CAT--G-C--------C-TA-------A------TTT-A--G--A--T--------G-GT---C--A-G-AT--GA-CT--CAAA--GC---AC-GT-G-ATG-ATT-CAA-TT--TTCT--A--T----G-TGACCCAAT---------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-GACA--AC-T-----C-A---ATGT----TGAA--ACCAT---TAC-------TACA-A---AA-GATG-----C-A-T-CG-GTTTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77158                      : ATTTA-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TA---TGCCCTTATGC--T-A---T----GCAC---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--GG-CT--CAAA--GC---AC-GT-G-ATG-ATT-AAA-TT--T--C--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-T-G--A-TT---G--CCTT-G-----CC-T-----C-G-C-ATG
gi|77160                      : ATTAA-TT---A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-TTA--TG---C-------T-CATC-A---T----GTA------------A-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--A----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A-------TT-A--G--C--T--------GCGT---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--GC---AC-GTCG-ATG-ATT-AAATTT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-T-GATA-TT---G--CCTTAG-----CC-T-----T-G-C-ATG-----AG-A--ACTAT---TAC-------TACA-A---T---AT------T-A-T-CA-G-TTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77159                      : ACTGA-TTT--A-A-CGA--T-T-------CCTT----GCC-CT---T----T-------T-CA-C-A---T----GCAC---TT-T---TA-AT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TACCCACT-A-------TT-A--G--C--T--------A-GT---C--A-T-AT--GA-CT--CAAT--GC---AC-GT-G-ATG-ATT-CCC-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TA---G--CATT-G-----CC-T-------G-T-ACAT----TG-A--ACCAT---TAC-------TTCC-A---TA-AATA-----T-A--------TTG---CG---TTT---CATT-TTTAATT
gi|77161                      : ATTGA-TTT--A-A-CAA--T-C-------CCTT----GCC-TT---CG---C-------C-A--T-A---C----GCAC---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-T--G--G--C--------G-GT---C--A-C-AT--GA-CT--C-----------T----------ATA-CAC-GT--T--T--A--T----G-TCA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTC-G-----CC-T-----C-G-C-ATGT----TG-A--ATCAT------------------A---T-------------A-T-CA-C-TTG---TG---TTT---ATTG-TTTAATT
gi|77162                      : ATTGA-TTT--A-A-CAA--T-C-------CCT------CC-CT---CG-------------C--C-A---TA---GCAC---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--CT---T--CAT--G-C--------CATA-----T-A------TTT-T--G--C-----------G-CT---C--A-C-AT--GA-CT--CCAT--AC---AC--T-G-ATG-ATT-CAA--T--T--T--A--T----G-TCA-CCA-------------G-C-G--A--T---G--CCTC-G-----CC-T-----C--------T----TG-A--ATCATATATAC-------T-------------TG-----T-G-T-TA---TTG---C----TTT---AATT-TT
gi|77163                      : ATTGA-TT---A-A-TAA--T-C-------CTCT----GCA-CT---TG---T-------T-C--T-A---T----GCAC---TTCT---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CATTCG-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GCGA-T--A-C-AT--GA-TT--CAAACCAC---AT--T-G-ATG-ATTAAAA-TT--T--T--A--TCTGGG-TTA-TCA-----------T-G-C-
gi|77164                      :  TTGA-TTTT-A-A-TAA--A-T-------TTTT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-A---T-----CAC---TT-T---TG-GT-G-T-A-T-------C--ATAAGA--C----T--CAT--GGC--------C-TA-----T-AG-----TTT-A------------------------C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--GC---AC-GT-G-ATG-ATG-TAT-TT--T--TTTA--T----G-TGA-GCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G-----CC-T-----C-G-C-ATGT----TG-A--ACCAT---TGC-------TACA-A---TA-GATG-----T-A-T-CA-G-TTG---TG---TTT---AACT-TTTAATT
gi|77165                      :  TTGA-TTT--A---TAA--T---------CCTT----GCC-CT---TG---G-------G-C--T-A---T----GCAC---TA-T---AA-G--G-C-A-T-------C--ATAA-A--C----T--C-T--GTC--------C-TA-----T-A------TTTGA--G--C--T--------G-GT---C--A-C-ATTGAA-CT--CAAA--GC---AC-GT-G-ATG-ATT-CAT-TT--TA-T--A--T----A-TGA-CCA-----------TAG-C-GA-A-TT---G--CCTT-GGAACAAC-T-----C-G-C-ATGT----TG-GACACTAT---TAC-------TACA-A---TA-GATGAT---T-A-T-CA-G-TTG---TG---TTTATAAATT-TT
gi|77166                      :  TTGAATTT--A-A-CA---T-T-------CCTT----GCC-CT---TC---A-------T-CA-T-A---TTAGGACAC---TT-T---TAAGT-GAT-A-T-------CGTATAA-A--T----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------GTT-A--G--T--T--------A-GT---C--ACC-AT--TA-CT--C-AA--GT---AC-GT-G-ATG-ATT-CAA-TT--TA-T--G--T----G-TAA-C----------------------A-TT---G--------------C-T-----C-G-C--TGT----TG-A--ATCAA---TACT------TACAGA---TATAATG-----TGA-T-CA-G-TTG---AG---TTT---A
gi|77167                      :   TGA-TTT--A-AATAA--T-T-------CCTT--------CC---TG---TG------T-C--T-A---T----GTAC---TT-T---TA-GTTG-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-T------T-A------TTT-ACGG--C--T--------G--T---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--GC---AC-GTTG-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-C-A-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCGT-G--------------CAG-T-ATGT----TG-A--ACCAT-----C-------TACA-A---TA-AATG-----C---T-CA-G-TTG---TG---TTT---ATTT-TTTAATT
gi|77168                      :   TGA-TTTTAA-A-TAA--TGT-------CCTT----GCG-CC---TGGG-T-------G-C--T-A---T----GCCA---TT-T---TA-GT-G-C-A-T-------C--ACTA-A--C----T--CAT--G-T--------C-TAATTTAT-G------TTT-AC-G--C--T--------G--TACAC--A-C-AT--GT-CT--CAAA--GC---AC-GT-G-CTT-ATT-CAA-CTATT--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-CCG--A-CTTGCG--CTTT-G-----AC-TTCCGGC-A-T-ATGT----TATG--ACTAT---TACGTAACAATAGA-A---TA-GATG-----T-A-T-CA-G-TTG---TG---TTT---GATT-TTTAA
gi|77169                      :   TGA-TTT--A-A-CAA--T-T-------CCTT----GTC-CT---TG---C-------C-A--T-A---T----GTAC---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---T--A-C-A
gi|77170                      :   TGA-TTT--A-A-ATA--T-T-------C-TT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-AAGAT----GCAC---TT-TACTTA--T-G-T-AGT-------C--ATAAGA--CAGTAT--TAT--G-TAGATCCGGC-TA-----T-AGATGCATGC-A--G--C--TAGGTGTTGG-GTATGC--A-C-GT--AA-GTGGCAAGAGGC---AC-GT-G-ATG-ATT-AAA-TT--TG-TG-A--T----GGTAAGTTA-----------T-GAC-G--A-AT---G--AGT--G-----AC-T-----C-G-C-ATGT----TGAA--ACAAT---TAC-------TACA------A-GATG-----C-A-T-CAGG-TTG---TG---TTT---AA-T-TTTAATT
gi|77171                      :     A-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---G---------C--T-A---T----GCACC--TT-T---TA-GT-G-T-A---------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------ATT-A--AGCC--T--------G-TT---C--A-C-AT--GAACT--CAAA--GC---AC-GCCG-ATG-ATT-CAA-TT--------A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--CCTT---G--CCTT-G-----AC-T-----C-G-C-ATGT----TG-A--A-CAT---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----T-ATT-CA-G-TTGGGTTG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77172                      :        TT--A-A-CAA--G-C-------CCTT----CCCTCC---CA---T-------T-C-------------ACAC---TT-T---TA-GTTG-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT----------T--------G-G----CGAA-C-AT--GA-CT--CCAT--AT---AC-GT-G-ATG-GAT-CAT-AT--T--T--A--T----GCTCA-CCA-----------T-GCC-G--G-TT---T--TCTT-------CC-T-----C-G-C-ATGT----TG-A--A-CAT---T--------------A---TA-G------------T-CA-C-TTG---TG---TTT---A
gi|77174                      :                        -------CCTT----GCC-AT---AA---T-------T------A---T----GCAC---TT-T---TA-GT-T-TTA-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------ATT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--GC---AT-GT-G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T------T------------------------------------CCTT-T-----CC-T-----C-A-C-ATGT----TG-A--ACCAT---TAC-------TACA-A---TA-ATTG-----T-G-T-AA-G-TTG---TGT--TTT---AATT-TTTAATT
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gi|77175                      :                                                                                 ---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-T--------C-TA-----T-A------TTA-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--GA-CT--CAAA--TC---AC-AT-G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-CGA-CCA-----------C-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G-----CC-T-----C-G-C-AT
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Reference ( family-523 )      : ATTGA-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-A---T----GCA-C---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-C-G-T--G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G---C--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--ACCA-T---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----T-A-T-CAG-TTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
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gi|77159                      : ACTGA-TTT--A-A-CGA--T-T-------CCTT----GCC-CT---T----T-------T-CA-C-A---T----GCA-C---TT-T---TA-AT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TACCCACT-A------TT--A--G--C--T--------A-GT---C--A-T-AT--G-A-CT--CAAT--GCA-C-G-T--G-ATG-ATT-CCC-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TA---G--CATT-G---C--CT---G-T-AC--AT----TG-A--ACCA-T---TAC-------TTCC-A---TA-AATA-----T-A-------TTG---CG---TTT---CATT-TTTAATT
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gi|77165                      :  TTGA-TTT--A---TAA--T---------CCTT----GCC-CT---TG---G-------G-C--T-A---T----GCA-C---TA-T---AA-G--G-C-A-T-------C--ATAA-A--C----T--C-T--GTC--------C-TA-----T-A------TTTGA--G--C--T--------G-GT---C--A-C-ATTGA-A-CT--CAAA--GCA-C-G-T--G-ATG-ATT-CAT-TT--TA-T--A--T----A-TGA-CCA-----------TAG-C-GA-A-TT---G--CCTT-GGAACAACTC--G-C-AT--GT----TG-GACACTA-T---TAC-------TACA-A---TA-GATGAT---T-A-T-CAG-TTG---TG---TTTATAAATT-TT
gi|77166                      :  TTGAATTT--A-A-CA---T-T-------CCTT----GCC-CT---TC---A-------T-CA-T-A---TTAGGACA-C---TT-T---TAAGT-GAT-A-T-------CGTATAA-A--T----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------GTT-A--G--T--T--------A-GT---C--ACC-AT--T-A-CT--C-AA--GTA-C-G-T--G-ATG-ATT-CAA-TT--TA-T--G--T----G-TAA-C----------------------A-TT---G--------------CTC--G-C--T--GT----TG-A--ATCA-A---TACT------TACAGA---TATAATG-----TGA-T-CAG-TTG---AG---TTT---A
gi|77167                      :   TGA-TTT--A-AATAA--T-T-------CCTT--------CC---TG---TG------T-C--T-A---T----GTA-C---TT-T---TA-GTTG-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-T------T-A------TTT-ACGG--C--T--------G--T---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-C-G-TT-G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-C-A-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCGT-G---C----A--G-T-AT--GT----TG-A--ACCA-T-----C-------TACA-A---TA-AATG-----C---T-CAG-TTG---TG---TTT---ATTT-TTTAATT
gi|77168                      :   TGA-TTTTAA-A-TAA--TGT-------CCTT----GCG-CC---TGGG-T-------G-C--T-A---T----GCC-A---TT-T---TA-GT-G-C-A-T-------C--ACTA-A--C----T--CAT--G-T--------C-TAATTTAT-G------TTT-AC-G--C--T--------G--TACAC--A-C-AT--G-T-CT--CAAA--GCA-C-G-T--G-CTT-ATT-CAA-CTATT--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-CCG--A-CTTGCG--CTTT-GA--C--TTCCGG-C-ATATGT----TATG--ACTA-T---TACGTAACAATAGA-A---TA-GATG-----T-A-T-CAG-TTG---TG---TTT---GATT-TTTAA
gi|77169                      :   TGA-TTT--A-A-CAA--T-T-------CCTT----GTC-CT---TG---C-------C-A--T-A---T----GTA-C---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---T--A-C-A
gi|77170                      :   TGA-TTT--A-A-ATA--T-T-------C-TT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-AAGAT----GCA-C---TT-TACTTA--T-G-T-AGT-------C--ATAAGA--CAGTAT--TAT--G-TAGATCCGGC-TA-----T-AGATGCATGC-A--G--C--TAGGTGTTGG-GTATGC--A-C-GT--A-A-GTGGCAAGAGGCA-C-G-T--G-ATG-ATT-AAA-TT--TG-TG-A--T----GGTAAGTTA-----------T-GAC-G--A-AT---G--AGT--G---A--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--AACAAT---TAC-------TACA-A------GATG-----C-A-T-CAGGTTG---TG---TTT---AA-T-TTTAATT
gi|77171                      :     A-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG-----------G-C--T-A---T----GCACC---TT-T---TA-GT-G-T-A---------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------ATT-A--AGCC--T--------G-TT---C--A-C-AT--GAA-CT--CAAA--GCA-C-GCC--G-ATG-ATT-CAA-----T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-GC-C-TT---G--CCTT-G---A--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--A-CA-T---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----T-ATT-CAG-TTGGGTTG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77172                      :        TT--A-A-CAA--G-C-------CCTT----CCCTCC---CA---T-------T-C-------------ACA-C---TT-T---TA-GTTG-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT----------T--------G-G----CGAA-C-AT--G-A-CT--CCAT--ATA-C-G-T--G-ATG-GAT-CAT-AT--T--T--A--T----GCTCA-CCA-----------T-GCC-G--G-TT---T--TCTT-----C--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--A-CA-T---T--------------A---TA-G------------T-CAC-TTG---TG---TTT---A
gi|77173                      :                                  T----GCC-TTCTATG---T-------T-C--TTA---T----GCA-TCCTTT-T---TA-TT-A-T-A-TGTTAATAC--ATAA-AAAC----TATC-T--G-T--------T-AA-----T-AATT---TTT-A--G--CGCT--------G-GT---CG-A-C-AT--G-AACT--CAAA--ACA-C-G-TT-G-ATG-ATT-CAAATT--T--T--A--T----G-TGA-CAA-----------TCG-C-G--AGTT---G--CCTT-GTG-C--ATC--G-C-AT--GT----TG-A--A-CA-T---TTA-------TACA-A----A-GATG-----T-A-T-CAG-
gi|77174                      :                        -------CCTT----GCC-AT---AA---T-------T------A---T----GCA-C---TT-T---TA-GT-T-TTA-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------ATT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-T-G-T--G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T------T------------------------------------CCTT-T---C--CTC--A-C-AT--GT----TG-A--ACCA-T---TAC-------TACA-A---TA-ATTG-----T-G-T-AAG-TTG---TGT--TTT---AATT-TTTAATT
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gi|77176                      :                                                                                         ---TA-AT-G-T-C-T----------ATAA-C--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------GTT-ACTG--C--CTTG-----G-GT---CT-A-CAAC--G-A-GA--CAAAGGGCA-C-G-T--GAATGTATT-CTA-TT--T--T--A--T----G-TG--CCATCTTGATAAACT-G-C-G--ATTT---G--CCTT-G---A--CTC--GAG-AT--GTGGGATA-A--ACCA-TG--TAC-------TACA-AATGTA-TATGATTGTT-A-TACAC-TTG---TGAACTAT---AATTCTTTAATT
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Reference ( family-523 )      : ATTGA-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-A---T----GCA-C---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-C-G-T--G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G---C--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--ACCA-T---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----T-A-T-CAG-TTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
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gi|77154                      : ATTGA-TTC--A-A-TAA--T-TTTTCCCCCCTTTGGGGCC-CT---TG---T-------G-C--T-A---T----GCA-C---TT-T---TA-GT-G-C-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----TTA------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-C-G-T--G-ATG-ATT-CAA--T--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--ATTT---G--CCTT-G---A--CTC--A-C-AT--GT----TG-T--ACCA-T---TAC-------TACA-A---TA-GAT------T-A-A-CAG-TTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77155                      : ATTGA-TT---A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---T-------G-C--T-A---T----AAA-C---TT-T----A-AT-G-C-A-T-------C--ATAA----C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-A-G-T--G-ATA-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-A--A-TT---G--CCTT-G---C--CTC--G-C-AT--GT----TG-T--ACCA-T---TAA-------TACG-A---TA-GATG-----T-A-T-CAG-TTG---TG---TTT---AATC-TTTAATT
gi|77156                      : ATTGA-TTT--GGA-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-A---T----GC--C---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA----C----C--CAT--G-T--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--ACAAC-G-TCGA-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G---C--TGC--G-CTCT--GT----TG-A--A--A-TA--TAC-------TACA-A---TA-GATG-----T-A-T-CAACTTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77157                      : ATTGA-TTT--A-A-TAAAAT-T-------TCTT----GTC-CT---TG---T-------G-C--T-A---TT---GCA-C---TT-T------GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----C--CAT--G-C--------C-TA-------A------TTT-A--G--A--T--------G-GT---C--A-G-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-C-G-T--G-ATG-ATT-CAA-TT--TTCT--A--T----G-TGACCCAAT---------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-GA--CAACTC--A---AT--GT----TGAA--ACCA-T---TAC-------TACA-A---AA-GATG-----C-A-T-CGGTTTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77158                      : ATTTA-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TA---TGCCCTTATGC--T-A---T----GCA-C---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--G-G-CT--CAAA--GCA-C-G-T--G-ATG-ATT-AAA-TT--T--C--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-T-G--A-TT---G--CCTT-G---C--CTC--G-C-AT--G
gi|77159                      : ACTGA-TTT--A-A-CGA--T-T-------CCTT----GCC-CT---T----T-------T-CA-C-A---T----GCA-C---TT-T---TA-AT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TACCCACT-A------TT--A--G--C--T--------A-GT---C--A-T-AT--G-A-CT--CAAT--GCA-C-G-T--G-ATG-ATT-CCC-TT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-G--A-TA---G--CATT-G---C--CT---G-T-AC--AT----TG-A--ACCA-T---TAC-------TTCC-A---TA-AATA-----T-A-------TTG---CG---TTT---CATT-TTTAATT
gi|77160                      : ATTAA-TT---A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-TTA--TG---C-------T-CATC-A---T----GTA-------------A-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--A----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A-------TT-A--G--C--T--------GCGT---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-C-G-TC-G-ATG-ATT-AAATTT--T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-T-GATA-TT---G--CCTTAG---C--CTT--G-C-AT--G-----AG-A--ACTA-T---TAC-------TACA-A---T---AT------T-A-T-CAG-TTG---TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77161                      : ATTGA-TTT--A-A-CAA--T-C-------CCTT----GCC-TT---CG---C-------C-A--T-A---C----GCA-C---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-T--G--G--C--------G-GT---C--A-C-AT--G-A-CT--CTAT--ACA-C-G-------------------T--T--T--A--T----G-TCA-CCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTC-G---C--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--ATC-----------------------------ATA-----T-A-T-CAC-TTG---TG---TTT---ATTG-TTTAATT
gi|77162                      : ATTGA-TTT--A-A-CAA--T-C-------CCT------CC-CT---CG-------------C--C-A---TA---GCA-C---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--CT---T--CAT--G-C--------CATA-----T-A------TTT-T--G--C-----------G-CT---C--A-C-AT--G-A-CT--CCAT--ACA-C---T--G-ATG-ATT-CAA--T--T--T--A--T----G-TCA-CCA-------------G-C-G--A--T---G--CCTC-G---C--CTC-----------T----TG-A--ATCA-TATATAC-------T-------------TG-----T-G-T-TA--TTG---C----TTT---AATT-TT
gi|77163                      : ATTGA-TT---A-A-TAA--T-C-------CTCT----GCA-CT---TG---T-------T-C--T-A---T----GCA-C---TTCT---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CATTCG-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GCGA-T--A-C-AT--G-A-TT--CAAA--CCA-C-ATT--G-ATG-ATTAAAA-TT--T--T--A--TCTGGG-TTA-TCA-----------T-G-C-
gi|77164                      :  TTGA-TTTT-A-A-TAA--A-T-------TTTT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-A---T-----CA-C---TT-T---TG-GT-G-T-A-T-------C--ATAAGA--C----T--CAT--GGC--------C-TA-----T-AG-----TTT-A------------------------C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-C-G-T--G-ATG-ATG-TAT-TT--T--TTTA--T----G-TGA-GCA-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G---C--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--ACCA-T---TGC-------TACA-A---TA-GATG-----T-A-T-CAG-TTG---TG---TTT---AACT-TTTAATT
gi|77165                      :  TTGA-TTT--A---TAA--T---------CCTT----GCC-CT---TG---G-------G-C--T-A---T----GCA-C---TA-T---AA-G--G-C-A-T-------C--ATAA-A--C----T--C-T--GTC--------C-TA-----T-A------TTTGA--G--C--T--------G-GT---C--A-C-ATTGA-A-CT--CAAA--GCA-C-G-T--G-ATG-ATT-CAT-TT--TA-T--A--T----A-TGA-CCA-----------TAG-C-GA-A-TT---G--CCTT-GGAACAACTC--G-C-AT--GT----TG-GACACTA-T---TAC-------TACA-A---TA-GATGAT---T-A-T-CAG-TTG---TG---TTTATAAATT-TT
gi|77166                      :  TTGAATTT--A-A-CA---T-T-------CCTT----GCC-CT---TC---A-------T-CA-T-A---TTAGGACA-C---TT-T---TAAGT-GAT-A-T-------CGTATAA-A--T----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------GTT-A--G--T--T--------A-GT---C--ACC-AT--T-A-CT--C-AA--GTA-C-G-T--G-ATG-ATT-CAA-TT--TA-T--G--T----G-TAA-C----------------------A-TT---G--------------CTC--G-C--T--GT----TG-A--ATCA-A---TACT------TACAGA---TATAATG-----TGA-T-CAG-TTG---AG---TTT---A
gi|77167                      :   TGA-TTT--A-AATAA--T-T-------CCTT--------CC---TG---TG------T-C--T-A---T----GTA-C---TT-T---TA-GTTG-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-T------T-A------TTT-ACGG--C--T--------G--T---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-C-G-TT-G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-TGA-C-A-----------T-G-C-G--A-TT---G--CCGT-G---C----A--G-T-AT--GT----TG-A--ACCA-T-----C-------TACA-A---TA-AATG-----C---T-CAG-TTG---TG---TTT---ATTT-TTTAATT
gi|77168                      :   TGA-TTTTAA-A-TAA--TGT-------CCTT----GCG-CC---TGGG-T-------G-C--T-A---T----GCC-A---TT-T---TA-GT-G-C-A-T-------C--ACTA-A--C----T--CAT--G-T--------C-TAATTTAT-G------TTT-AC-G--C--T--------G--TACAC--A-C-AT--G-T-CT--CAAA--GCA-C-G-T--G-CTT-ATT-CAA-CTATT--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-CCG--A-CTTGCG--CTTT-GA--C--TTCCGG-C-ATATGT----TATG--ACTA-T---TACGTAACAATAGA-A---TA-GATG-----T-A-T-CAG-TTG---TG---TTT---GATT-TTTAA
gi|77169                      :   TGA-TTT--A-A-CAA--T-T-------CCTT----GTC-CT---TG---C-------C-A--T-A---T----GTA-C---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT-A--G--C--T--------G-GT---T--A-C-A
gi|77170                      :   TGA-TTT--A-A-ATA--T-T-------C-TT----GCC-CT---TG---T-------T-C--T-AAGAT----GCA-C---TT-TACTTA--T-G-T-AGT-------C--ATAAGA--CAGTAT--TAT--G-TAGATCCGGC-TA-----T-AGATGCATGC-A--G--C--TAGGTGTTGG-GTATGC--A-C-GT--A-A-GTGGCAAGAGGCA-C-G-T--G-ATG-ATT-AAA-TT--TG-TG-A--T----GGTAAGTTA-----------T-GAC-G--A-AT---G--AGT--G---A--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--AACAAT---TAC-------TACA-A------GATG-----C-A-T-CAGGTTG---TG---TTT---AA-T-TTTAATT
gi|77171                      :     A-TTT--A-A-TAA--T-T-------CCTT----GCC-CT---TG-----------G-C--T-A---T----GCACC---TT-T---TA-GT-G-T-A---------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------ATT-A--AGCC--T--------G-TT---C--A-C-AT--GAA-CT--CAAA--GCA-C-GCC--G-ATG-ATT-CAA-----T--T--A--T----G-TGA-CCA-----------T-G-C-GC-C-TT---G--CCTT-G---A--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--A-CA-T---TAC-------TACA-A---TA-GATG-----T-ATT-CAG-TTGGGTTG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77172                      :        TT--A-A-CAA--G-C-------CCTT----CCCTCC---CA---T-------T-C-------------ACA-C---TT-T---TA-GTTG-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------TTT----------T--------G-G----CGAA-C-AT--G-A-CT--CCAT--ATA-C-G-T--G-ATG-GAT-CAT-AT--T--T--A--T----GCTCA-CCA-----------T-GCC-G--G-TT---T--TCTT-----C--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--A-CA-T---T--------------A---TA-G------------T-CAC-TTG---TG---TTT---A
gi|77173                      :                                  T----GCC-TTCTATG---T-------T-C--TTA---T----GCA-TCCTTT-T---TA-TT-A-T-A-TGTTAATAC--ATAA-AAAC----TATC-T--G-T--------T-AA-----T-AATT---TTT-A--G--CGCT--------G-GT---CG-A-C-AT--G-AACT--CAAA--ACA-C-G-TT-G-ATG-ATT-CAAATT--T--T--A--T----G-TGA-CAA-----------TCG-C-G--AGTT---G--CCTT-GTG-C--ATC--G-C-AT--GT----TG-A--A-CA-T---TTA-------TACA-A----A-GATG-----T-A-T-CAG-
gi|77174                      :                        -------CCTT----GCC-AT---AA---T-------T------A---T----GCA-C---TT-T---TA-GT-T-TTA-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------ATT-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--GCA-T-G-T--G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T------T------------------------------------CCTT-T---C--CTC--A-C-AT--GT----TG-A--ACCA-T---TAC-------TACA-A---TA-ATTG-----T-G-T-AAG-TTG---TGT--TTT---AATT-TTTAATT
gi|77175                      :                                                                                gc---TT-T---TA-GT-G-T-A-T-------C--ATAA-A--C----T--CAT--G-T--------C-TA-----T-A------TTA-A--G--C--T--------G-GT---C--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--TCA-C-A-T--G-ATG-ATT-CAA-TT--T--T--A--T----G-CGA-CCA-----------C-G-C-G--A-TT---G--CCTT-G---C--CTC--G-C-AT--
gi|77176                      :                                                                                         ---TA-AT-G-T-C-T----------ATAA-C--C----T--CAT--G-C--------C-TA-----T-A------GTT-ACTG--C--CTTG-----G-GT---CT-A-CAAC--G-A-GA--CAAAGGGCA-C-G-T--GAATGTATT-CTA-TT--T--T--A--T----G-TG--CCATCTTGATAAACT-G-C-G--ATTT---G--CCTT-G---A--CTC--GAG-AT--GTGGGATA-A--ACCA-TG--TAC-------TACA-AATGTA-TATGATTGTT-A-TACAC-TTG---TGAACTAT---AATTCTTTAATT
gi|77177                      :                                                                                                                                                    -TA-----T-C------TTT-G--C--C--T-----------T---T--A-C-AT--G-A-CT--CAAA--ACA-C-A-T--A-ATG-ATT-TAA-TT--T--T--A--T----G-T
gi|77178                      :                                                                                                                                                                                                                                                   -TT--T--T--ACAT----G-TGA-CCA-----------T-A-C-G--A-TT---G--CCTT-G---C--CTC--G-C-AT--GT----TG-A--ACCA-T---TAC-------TGTA-A---TA-AATG-----T-A-T--AG-T-----TG---TTT---AATT-TTTAATT
gi|77179                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --CTC--G-A-AT--GT----TG-A--ACCA-T---TAC-------TACA-A---AA-AATG-------A-T-CAC-TTC---TA---TTT---AATT-TTGAATT


blockSeqs                     :      A   TA G A   AA G TTTCCCC    TGGG   T  CTA  TGCCCTTATGC      T AGA TAGG   C CCT  C ACT  A  T A T G GTTAATA GT    G AA AGTA AT   TC G AGATCCGG A  CCCAC T GATGCA   G CG GC GC AGGTGTTG C  ACA GA C A  TG A A  GG    AG   A T T CG A   T   A   T  AT TC TT CA CTGG G   C   TCTTGATAAAC A A C AT T  TGC GC    A GAACAA   CG G T  AT  GGGA  A AC    A ATA   GTAACAA    G ATG  T    ATTGT G T A   C   GGT  AAC   ATA    C
blockSeqs                     :      .   T  . .   .  . .          .      .  A    CCATGCA          . .   T      . .    . .    .  T . . . .       .     G .  T    .    .  T .        .  ATTTA . ATT      . CT .  .  TTG      .  ATG G  . .  .  . .  .     GG   . . C C  .   .   .   A  .  A  G  .  .    C   G   AT          C C . A  G  .   .     . ACAA     .  C .  .   .     T .     . A     T          . .    .    AT    . . .   T   T    T     .      .
blockSeqs                     :      .   T  . .   .  . .          .      .  .    CTCAT            . .   A      . .    . .    .  T . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . G        . C  .  .  .        .  GA  T  . .  .  . .  .     .    . . . T  .   .   .   .  .  A  .  .  .    .   .   .           . . . C  T  .   .     . TGC      .  A .  .   .     . .     . G     .          . .    .    .     . . .   G   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    GGTGC            . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . T  .   .   .   .  .  G  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . AC       .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TTTC             . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . A        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TTCA             . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . A        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    ATCA             . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TGTC             . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . A        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TTC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    CCC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . A        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TGC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TGC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TGC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TTC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TGC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    CCA              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TTC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TTC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    GGC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    CCA              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . A        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TTC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . A        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TTC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :      .   .  . .   .  . .          .      .  .    TTC              . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .      .
blockSeqs                     :          .  . .   .  . .          .      .  .    GC               . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .       
blockSeqs                     :                        .          .      .  .    TT               . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . A        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .   .    .     .       
blockSeqs                     :                                   .      .  .    C                . .   .      . .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . C        .  . .  .   .     . .     . .     .          . .    .    .     . . .   .                      
blockSeqs                     :                                                                                  .    . .    .  . . . . .       .     . .  .    .    .  . .        .  .     . .        . .  .  .  .        .  .   .  . .  .  . .  .     .    . . . .  .   .   .   .  .  .  .  .  .    .   .   .           . . . .  .  .   .     . .        .  . .  .                                                                                     
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