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gi|62359                      :                                                                                                                                                                                                   atacttTATAACGGGT-TTTT--TT-T---GCGGT-ATTC-A-CAAAAT----------TT-TG--CCG--AA------C-T--G--C-CCC-AAAA------C----ACTG--CT-------A-CTTCGT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTG-GTATTG-CG-ATTCTT-GAGTACCGT--T---ATAAC-GG--AG-----TAAGTATATGGA-ACACAGATTGG-T-G-----TAA------ATTTTACG-CAG-AA----TT-TAT-TT--GTTTGC--G-AT-TC--AAAATACTCCGCAAAT-AA-AGTATGA-AAATTA---GCT-TAT-C---GC---GAA---AAAA---A-A-AC-C--G-TTATA---CG
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gi|62369                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA------ACTTTGTA-T-G--A----TG-CAT-TT--TTCTGT--G-AT-TC-AGAAATCGT-CGCGAAC-AA-AG--CGA-AAATTG---GA--TA--C---AC---G-A---GGAAAGTA-A-C-------TTATA---CAG
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Reference ( family-517 )      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-T-C--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATTNAGATA-ATG--A-A--ACA---GTTGG-T-G-----TAA------ATTTTATG---C-GA-A-TT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62340                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-T----GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAA-TAAGATA-TGG--A-AT-ACA---GTTGG-T-G-----TAA------TTTTTATG---C-GA-A-TT-CAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-TG-TTATA---GGGTA
gi|62341                      :      aTACCGTATAACGGGG-TTTTTT-T----GCG-C-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---A---CGT--ATA--ACGGG--TAAGATA-TGG--A-AC-ACA---GTTGA-T-G-----TAA------ATTTTATA---C-GA-AATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-AAACAAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62342                      :      aTACCATATAACGGGGGTTTTTT-T-T--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TA-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATTCA-ATG-TGG--A-AC-ACA---GTTGG-T-G-----TAA------ATTTTATG---C-GA-A-TT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-G---AAAA---A-A-A-CG-TTATA---CGGTA
gi|62343                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-T-T--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--TTTT-----GC-ATGT--T-CCTTT-GT-TTG-TG-ATTCTTG-GTA---TTCGTAT--CGC--A-TAAGT--------ATG--G-AACACA---GTTGG-T-G-----TAA------ATTTTATG---T-GA-A-TT-CAG--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62344                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-T-T--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CGC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATTCAAATA-ATG--A-A--A---------A-T-GAAAAACAA------AATTTATG---C-GA-A-TT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CAA-AAATTAGAT-TATC---GC---GAA---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62345                      :      aTACCGTATAACGGGA-TTTTTT-T----GCG-T-AT-CAAGAAA-T-TT-TT-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--GTTT-----AC---GT--T-TCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTGA-A-GAAA---AGAT--ATG--A-AC-ACA---GTTGGTT-G-----TAA------ATTTTTTGC--C-GA-A-TT-CAA--TTGTTTG--CGAAT-TCAAAAAATACT-CGCAAATAAA-AG--CGATAAATTAGAT-TATC---GT---G-A---AAAA---ACGTC-CG-TTATA---CGGTAt
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Reference ( family-517 )      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATTAAG-ATA-ATG-A-ACACAG---TTGG-T-G--TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62340                      :       TACCGTATAACGGGT-TTT-TT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAA-TAAG-ATA-TGG-A-ATACAG---TTGG-T-G--TAA------TTTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-TG-TTATA---GGGTA
gi|62341                      :      aTACCGTATAACGGGG-TTTTTT-T---GCG-C-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---A---CGT--ATA--ACGGG--TAAG-ATA-TGG-A-ACACAG---TTGA-T-G--TAA------ATTTTATA---C-GAA-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-AAACAAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62342                      :      aTACCATATAACGGGGGTTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TA-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATTCA--ATG-TGG-A-ACACAG---TTGG-T-G--TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-G---AAAA---A-A-A-CG-TTATA---CGGTA
gi|62343                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--TTTT-----GC-ATGT--T-CCTTT-GT-TTG-TG-ATTCTTG-GTA---TTCGTAT--C------GCA--TAAG--TA-TGG-A-ACACAG---TTGG-T-G--TAA------ATTTTATG---T-G-A-ATT-CAG--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAt
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lowQualScore                  :                      .   .  . ...   . .  . .     . .  .  . . ..  .... . ..  .   .    ...... ....    ..   .      ..    .....  .    .. .     .  .   .  .       .   .......   ..   .. .   ..    .   .. ....      ...   .. . . .   ......        ... . . .   .   ..       ..  .  .  .         .       .  .  ..   .         .    ...  ... . ...    ... . . .  .     ...     
lowQualScore                  :                      9   0  9 222   9 8  9 7     9 9  9  9 9 55  7777 9 66  9   9    111111 0000    66   9      55    88888  9    88 0     0  0   0  0       5   0000000   77   77 3   88    1   77 1111      555   88 0 9 9   222222        555 2 7 7   7   11       44  2  7  5         7       5  5  44   5         5    000  000 2 000    888 5 3 8  8     333     
consensus                     :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATTAAG-ATATNG-A--ACACAG---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
Reference ( family-517 )      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATTAAG-ATANTG-A--ACACAG---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62340                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-T---GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAAT-AAG-ATATGG-A--ATACAG---TTG--G-T-G-TAA------TTTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-TG-TTATA---GGGTA
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gi|62342                      :      aTACCATATAACGGGGGTTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TA-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATTCA--ATGTGG-A--ACACAG---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-G---AAAA---A-A-A-CG-TTATA---CGGTA
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gi|62348                      : atacttTACCGTATAACGGGT-TTT--T-TT--GCG-T-AT-C-ACAAT-A-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-CAAA------C----ACTG--CTA--TTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T--CTTT-GT-TT--CG-AT--CTG---A---T---TAT--CTG--A-GATAATAAG-ATA-TG----ATACA----TTG--G-T---T-G------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA---TGTTTG--TA----TC-AAAAATACT-CGCAAAT--A-AG--CGA-AAATT-GAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-
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gi|62351                      :    attTACCGTATAACGGGT-TTT-TT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTG---T---TAT--CTG--A-GAAATTCAG-ATA
gi|62352                      :      aTACCGTATAACAGGT-TTTATT-T---GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-A--CA--A-A-T--AC-CTC-CAAG------C----AGTG--CTG--TTTTT--ATTT-----GT-GT
gi|62353                      :      aTACTATATAACGGAC-TTTGTT-T---GCG-T-AT-C-AC-AA-T-TT-TG-C-GAAAA--T-A-C--CC-CCC-AAAATG----T----GTTG--TTGCTTTTTT--ATTT-----GCTGCAG--T-TCTCT-AT-TTG-CG-TTTCCT
gi|62354                      :      aTACCATTTAACAGGT-TTTGTT-T---GCG-T-AA-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA------T--G------AAAAAACAATC----AGTT--TTG-TTTTTT--ATTG-----GC-GTATAGT-CATTT-GT-TTG-CG-ATTC
gi|62355                      :      aTACCGTACAACGG-T-TTTGCT-TG--GCG-A-AT-C-ACAAT-T-TC-TA-T-G--AA--A-A-T--GC-CCC-CAGA------C----AGTG--TTG-TTTTGTCAATTT-----GC-G-----T-CCTCT-CG-TTG-C--ATT
gi|62356                      :      aTACCGTATAACGT-T-TTTTTT-TT--GTG-TTAT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---CGT--ATA--ACGGG--TAAG-ATATGG-A--ACACAG---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CAA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAgtagagtaatcattat
gi|62357                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CCG--A-GAAATTCAA-ATAATG-A--A-ACAG---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-T-ATT-CAA--TTTTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62358                      :        ACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TTTTGCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCCCAAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATTCAA-AAAATG-A--A
gi|62359                      :            TATAACGGGT-TTTTTT-T---GCGGT-ATTC-ACAAAAT-TT-TG-CCG--AA----C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-CTTCGT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTG-GTATTG-CG-ATTCTTGAGTACCGT---TATAACGG--A-G----TAAGTATATGG-A--ACACAGA--TTG--G-T-G-TAA------ATTTTACG---CAG-A-ATT-TAT--TTGTTTG--CG-AT-TC--AAAATACTCCGCAAAT-AA-AGTATGA-AAATTAGCT-TATC---GC---GAA---AAAA---A-AAC-CG-TTATA---CGaatgaaaaaca
gi|62360                      :                  GGGT-TCTTTTCTT--GCG-T-AT-C-ACAAA-C-TTCTG-C-G--AA--T-C-TCTGC-CCC-AAA-------------CTGACCTA-TTTTCT--ATTT-----GC-GTCG--T-CCTTT-GT-TTG-CGTATTCTT
gi|62361                      :                                                                                                                                                                                          TAAG-ATATGC-A--ACACAG---TTG--G-C-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTAtatgtgtatt
gi|62362                      :                                                                                                                                                                            ttattcatatcgcgTAAG-ATA-TG-AT-ACACAA---TTG--G-T-G-TAC------ATTTTATG---C-A-T-ATT-TAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CACATAC-AA-AA--CGA-AAAGTGGAT-TATT---GC---A-A---AAAT---A-ACC-TG-TTATA---TGGTAt
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gi|62366                      :                                                                                                                                                                                                          CACAGGGGTTG--G-T-GGTAA------ATTTTACGGCACAG-A-ATT-TAAACTGGTTTGGCCGGAT-GC-AAAAATACT-CGGAAA---A-AG--TGA-AGTTTAGCT-TATCGCGGC---G-A---AAAA---A-ACCGGG-TTATA---CGGTA
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Alignments
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lowQualScore                  :                      9   0  9 222   9 8  9 7     9 9  9  9 9 55  7777 9 66  9   9    111111 0000    66   9      55    88888  9    88 0     0  0   0  0       5   0000000   77   77 3   88 1   1  1  3        555   88 0 9 9   222222        555 2 7 7   7   11       44  2  7  5         7       5  5  44   5         5    000  000 2 000    888 5 3 8  8     333     
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Reference ( family-517 )      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATT-AAG-AT-ATNGAACACAG---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62340                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-T---GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAAT--AAG-AT-ATGGAATACAG---TTG--G-T-G-TAA------TTTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-TG-TTATA---GGGTA
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gi|62342                      :      aTACCATATAACGGGGGTTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TA-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATT-CA--AT-GTGGAACACAG---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-G---AAAA---A-A-A-CG-TTATA---CGGTA
gi|62343                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--TTTT-----GC-ATGT--T-CCTTT-GT-TTG-TG-ATTCTTG-GTA---TTCGTAT--C------GCA--T-AAG--T-ATGGAACACAG---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---T-G-A-ATT-CAG--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62344                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CGC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATT-CAA-AT-AATGAAAA-------TGAAA-A-A-CAA------AATTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CAA-AAATTAGAT-TATC---GC---GAA---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62345                      :      aTACCGTATAACGGG--ATTTTT-TT--GCG-T-AT-CAAGAAA-T-TT-TT-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--GTTT-----AC---GT--T-TCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-AGAA---AAG-AT-AT-GAACACAG---TTG--GTT-G-TAA------ATTTTTTGC--C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CGAAT-TCAAAAAATACT-CGCAAATAAA-AG--CGATAAATTAGAT-TATC---GT---G-A---AAAA---ACGTC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62346                      :      aTACCGTATAACGGG--ATTTTT-TT--GCG-T-AT-CAAGAAA-T-TT-TT-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--GTTT-----AC---GT--T-TCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-AGAA---AAG-AT-AT-GAACACAG---TTG--GTT-G-TAA------ATTTTTTGC--C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CGAAT-TCAAAAAATACT-CGCAAATAAA-AG--CGATAAATTAGAT-TATC---GT---G-A---AAAA---ACGTC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62347                      :          aGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-TTAT-CCACAAA-T-TT-TGGC-G--AAAAT-C-T--GC-C---AAAA------C----ACTG--CTA-CTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTTGGT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---t
gi|62348                      : atacttTACCGTATAACGGGT-TTT--T-TT--GCG-T-AT-C-ACAAT-A-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-CAAA------C----ACTG--CTA--TTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T--CTTT-GT-TT--CG-AT--CTG---A---T---TAT--CTG--A-GATAAT-AAG-AT-ATG--ATACA----TTG--G-T---T-G------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA---TGTTTG--TA----TC-AAAAATACT-CGCAAAT--A-AG--CGA-AAATT-GAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-
gi|62349                      :      aTACCGTAATACGGGT-TTTTTT-T---GCG-T-AT-C-ACAGA-A-TT-TG-C-G--AA--T-CAT--GCGCCC-GAAA------CCATAACTG--C-A-TTTTTT--ATT------GC-GTTT--CACCTTT-GT-TTG-C--ATTCTTG-TTA--------AA--CTG--A-GAAAAG-AA--ATGATGGAACACAG---TTG--G-TTG-TAATTTTCAATTTTATG---C-G-A-ATTTCAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAATATACT-CGCAAAT-AACAG--CGA-ATA-TAGATATACG---GC---GAA---AAAA---A-ACC-C---TA-A---CGGTA
gi|62350                      :        aCCGTATAACTGGT-TTTC-------GCG-T-AT-T-ACAAA-TATT-TG-C-GC-AA--TTC-T--GC-CCC-AAAA------C----A-TG--CTA-TTTTTTT-ATTTTGCCGGC--TGT--T-CCTTT-GT-TTGTCG-AT-CTTG--TA---T---CAT--CTGTTG-TATATT-ATA-CT-ACATTATATAT---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---CCG-A-ATT-TAAA-TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAA-TACT-CGCAAAT-AATAG--CGA-AA-TTAGATCTATC---GCCGCG-A---AAAA---A-ACT-CG-TTATACCCCGGTAt
gi|62351                      :    attTACCGTATAACGGGT-TTT-TT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTG---T---TAT--CTG--A-GAAATT-CAG-AT-A
gi|62352                      :      aTACCGTATAACAGGT-TTTATT-T---GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-A--CA--A-A-T--AC-CTC-CAAG------C----AGTG--CTG--TTTTT--ATTT-----GT-GT
gi|62353                      :      aTACTATATAACGGAC-TTTGTT-T---GCG-T-AT-C-AC-AA-T-TT-TG-C-GAAAA--T-A-C--CC-CCC-AAAATG----T----GTTG--TTGCTTTTTT--ATTT-----GCTGCAG--T-TCTCT-AT-TTG-CG-TTTCCT
gi|62354                      :      aTACCATTTAACAGGT-TTTGTT-T---GCG-T-AA-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA------T--G------AAAAAACAATC----AGTT--TTG-TTTTTT--ATTG-----GC-GTATAGT-CATTT-GT-TTG-CG-ATTC
gi|62355                      :      aTACCGTACAACGG-T-TTTGCT-TG--GCG-A-AT-C-ACAAT-T-TC-TA-T-G--AA--A-A-T--GC-CCC-CAGA------C----AGTG--TTG-TTTTGTCAATTT-----GC-G-----T-CCTCT-CG-TTG-C--ATT
gi|62356                      :      aTACCGTATAACGT-T-TTTTTT-TT--GTG-TTAT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---CGT--ATA--ACGGG--T-AAG-AT-ATGGAACACAG---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CAA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAgtagagtaatcattat
gi|62357                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CCG--A-GAAATT-CAA-AT-AATGAA-ACAG---TTG--G-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-T-ATT-CAA--TTTTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62358                      :        ACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TTTTGCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCCCAAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---T---TAT--CTG--A-GAAATTCAAA-AA-ATGAAA
gi|62359                      :            TATAACGGGT-TTTTTT-T---GCGGT-ATTC-ACAAAAT-TT-TG-CCG--AA----C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-CTTCGT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTG-GTATTG-CG-ATTCTTGAGTACCGT---TATAACGG--A-G----T-AAGTAT-ATGGAACACAGA--TTG--G-T-G-TAA------ATTTTACG---CAG-A-ATT-TAT--TTGTTTG--CG-AT-TC--AAAATACTCCGCAAAT-AA-AGTATGA-AAATTAGCT-TATC---GC---GAA---AAAA---A-AAC-CG-TTATA---CGatgaaaaaca
gi|62360                      :                  GGGT-TCTTTTCTT--GCG-T-AT-C-ACAAA-C-TTCTG-C-G--AA--T-C-TCTGC-CCC-AAA-------------CTGACCTA-TTTTCT--ATTT-----GC-GTCG--T-CCTTT-GT-TTG-CGTATTCTT
gi|62361                      :                                                                                                                                                                                          T-AAG-AT-ATGCAACACAG---TTG--G-C-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTAtatgtgtatt
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lowQualScore                  :                      9   0  9 222   9 8  9 7     9 9  9  9 9 55  7777 9 66  9   9    111111 0000    66   9      55    88888  9    88 0     0  0   0  0       5   444  777  77   77 3   88 1   1  1 8888888          555    0 9 9   222222        555 2 7 7   7   11       44  2  7  5         7       5  5  44   5         5    000  000 2 000    888 5 3 8  8     333     
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Reference ( family-517 )      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATT-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62340                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-T---GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAAT--AAG-AT-A-------TGGAATACAG---TTGG-T-G-TAA------TTTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-TG-TTATA---GGGTA
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gi|62343                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--TTTT-----GC-ATGT--T-CCTTT-GT-TTG-TG-ATTCTTG-GTA---TTCGTAT--C------GCA--T-AAG--T-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---T-G-A-ATT-CAG--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62344                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CGC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATT-CAA-AT-AATGAAAATGAAAAACA--------------AA------ATTT-ATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CAA-AAATTAGAT-TATC---GC---GAA---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62345                      :      aTACCGTATAACGGG--ATTTTT-TT--GCG-T-AT-CAAGAAA-T-TT-TT-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--GTTT-----AC---GT--T-TCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-AGAA---AAG-AT-A-------T-GAACACAG---TTGGTT-G-TAA------ATTTTTTGC--C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CGAAT-TCAAAAAATACT-CGCAAATAAA-AG--CGATAAATTAGAT-TATC---GT---G-A---AAAA---ACGTC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62346                      :      aTACCGTATAACGGG--ATTTTT-TT--GCG-T-AT-CAAGAAA-T-TT-TT-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--GTTT-----AC---GT--T-TCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-AGAA---AAG-AT-A-------T-GAACACAG---TTGGTT-G-TAA------ATTTTTTGC--C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CGAAT-TCAAAAAATACT-CGCAAATAAA-AG--CGATAAATTAGAT-TATC---GT---G-A---AAAA---ACGTC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62347                      :          aGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-TTAT-CCACAAA-T-TT-TGGC-G--AAAAT-C-T--GC-C---AAAA------C----ACTG--CTA-CTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTTGGT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---t
gi|62348                      : atacttTACCGTATAACGGGT-TTT--T-TT--GCG-T-AT-C-ACAAT-A-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-CAAA------C----ACTG--CTA--TTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T--CTTT-GT-TT--CG-AT--CTG---A---TT---AT--CTG--A-GATAAT-AAG-AT-A-------TG--ATACA----TTGG-T---T-G------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA---TGTTTG--TA----TC-AAAAATACT-CGCAAAT--A-AG--CGA-AAATT-GAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-
gi|62349                      :      aTACCGTAATACGGGT-TTTTTT-T---GCG-T-AT-C-ACAGA-A-TT-TG-C-G--AA--T-CAT--GCGCCC-GAAA------CCATAACTG--C-A-TTTTTT--ATT------GC-GTTT--CACCTTT-GT-TTG-C--ATTCTTG-TTA--------AA--CTG--A-GAAAAG-AA--ATGA-------TGGAACACAG---TTGG-TTG-TAATTTTCAATTTTATG---C-G-A-ATTTCAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAATATACT-CGCAAAT-AACAG--CGA-ATA-TAGATATACG---GC---GAA---AAAA---A-ACC-C---TA-A---CGGTA
gi|62350                      :        aCCGTATAACTGGT-TTTC-------GCG-T-AT-T-ACAAA-TATT-TG-C-GC-AA--TTC-T--GC-CCC-AAAA------C----A-TG--CTA-TTTTTTT-ATTTTGCCGGC--TGT--T-CCTTT-GT-TTGTCG-AT-CTTG--TA---TC---AT--CTGTTG-TATATT-ATA-CT-A-------CATTATATAT---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---CCG-A-ATT-TAAA-TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAA-TACT-CGCAAAT-AATAG--CGA-AA-TTAGATCTATC---GCCGCG-A---AAAA---A-ACT-CG-TTATACCCCGGTAt
gi|62351                      :    attTACCGTATAACGGGT-TTT-TT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTG---TT---AT--CTG--A-GAAATT-CAG-AT-A-------
gi|62352                      :      aTACCGTATAACAGGT-TTTATT-T---GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-A--CA--A-A-T--AC-CTC-CAAG------C----AGTG--CTG--TTTTT--ATTT-----GT-GT
gi|62353                      :      aTACTATATAACGGAC-TTTGTT-T---GCG-T-AT-C-AC-AA-T-TT-TG-C-GAAAA--T-A-C--CC-CCC-AAAATG----T----GTTG--TTGCTTTTTT--ATTT-----GCTGCAG--T-TCTCT-AT-TTG-CG-TTTCCT
gi|62354                      :      aTACCATTTAACAGGT-TTTGTT-T---GCG-T-AA-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA------T--G------AAAAAACAATC----AGTT--TTG-TTTTTT--ATTG-----GC-GTATAGT-CATTT-GT-TTG-CG-ATTC
gi|62355                      :      aTACCGTACAACGG-T-TTTGCT-TG--GCG-A-AT-C-ACAAT-T-TC-TA-T-G--AA--A-A-T--GC-CCC-CAGA------C----AGTG--TTG-TTTTGTCAATTT-----GC-G-----T-CCTCT-CG-TTG-C--ATT
gi|62356                      :      aTACCGTATAACGT-T-TTTTTT-TT--GTG-TTAT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TC---GT--ATA--ACGGG--T-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CAA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAgtagagtaatcattat
gi|62357                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CCG--A-GAAATT-CAA-AT-A-------ATGAA-ACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-T-ATT-CAA--TTTTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62358                      :        ACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TTTTGCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCCCAAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATTCAAA-AA-A-------TGAAA
gi|62359                      :            TATAACGGGT-TTTTTT-T---GCGGT-ATTC-ACAAAAT-TT-TG-CCG--AA----C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-CTTCGT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTG-GTATTG-CG-ATTCTTGAGTACCGTT---ATAACGG--A-G----T-AAGTAT-A-------TGGAACACAGA--TTGG-T-G-TAA------ATTTTACG---CAG-A-ATT-TAT--TTGTTTG--CG-AT-TC--AAAATACTCCGCAAAT-AA-AGTATGA-AAATTAGCT-TATC---GC---GAA---AAAA---A-AAC-CG-TTATA---CGatgaaaaaca
gi|62360                      :                  GGGT-TCTTTTCTT--GCG-T-AT-C-ACAAA-C-TTCTG-C-G--AA--T-C-TCTGC-CCC-AAA-------------CTGACCTA-TTTTCT--ATTT-----GC-GTCG--T-CCTTT-GT-TTG-CGTATTCTT
gi|62361                      :                                                                                                                                                                                          T-AAG-AT-A-------TGCAACACAG---TTGG-C-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTAtatgtgtatt
gi|62362                      :                                                                                                                                                                            ttattcatatcgcgT-AAG-AT-A-------TGATACACAA---TTGG-T-G-TAC------ATTTTATG---C-A-T-ATT-TAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CACATAC-AA-AA--CGA-AAAGTGGAT-TATT---GC---A-A---AAAT---A-ACC-TG-TTATA---TGGTAt
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lowQualScore                  :                      9   0  9 222   9 8  9 7     9 9  9  9 9 55  7777 9 66  9   9    111111 0000    66   9      55    88888  9    88 0     0  0   0  0       5   444  777  77   77 3   88 1   1  1 8888888          555    0 9 9   222222        555 2 7 7   7   11       44  2  7  5         7       5  5  44   5         5    000  000 2 000    888 5 3 8  8     333     
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Reference ( family-517 )      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATT-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62340                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-T---GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAAT--AAG-AT-A-------TGGAATACAG---TTGG-T-G-TAA------TTTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-TG-TTATA---GGGTA
gi|62341                      :      aTACCGTATAACGGGG-TTTTTT-T---GCG-C-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---AC---GT--ATA--ACGGG--T-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGA-T-G-TAA------ATTTTATA---C-GAA-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-AAACAAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTAt
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gi|62343                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--TTTT-----GC-ATGT--T-CCTTT-GT-TTG-TG-ATTCTTG-GTA---TTCGTAT--C------GCA--T-AAG--T-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---T-G-A-ATT-CAG--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62344                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CGC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATT-CAA-AT-AATGAAAATGAAAAACA--------------AA------ATTT-ATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CAA-AAATTAGAT-TATC---GC---GAA---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62345                      :      aTACCGTATAACGGG--ATTTTT-TT--GCG-T-AT-CAAGAAA-T-TT-TT-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--GTTT-----AC---GT--T-TCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-AGAA---AAG-AT-A-------T-GAACACAG---TTGGTT-G-TAA------ATTTTTTGC--C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CGAAT-TCAAAAAATACT-CGCAAATAAA-AG--CGATAAATTAGAT-TATC---GT---G-A---AAAA---ACGTC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62346                      :      aTACCGTATAACGGG--ATTTTT-TT--GCG-T-AT-CAAGAAA-T-TT-TT-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--GTTT-----AC---GT--T-TCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-AGAA---AAG-AT-A-------T-GAACACAG---TTGGTT-G-TAA------ATTTTTTGC--C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CGAAT-TCAAAAAATACT-CGCAAATAAA-AG--CGATAAATTAGAT-TATC---GT---G-A---AAAA---ACGTC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62347                      :          aGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-TTAT-CCACAAA-T-TT-TGGC-G--AAAAT-C-T--GC-C---AAAA------C----ACTG--CTA-CTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTTGGT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---t
gi|62348                      : atacttTACCGTATAACGGGT-TTT--T-TT--GCG-T-AT-C-ACAAT-A-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-CAAA------C----ACTG--CTA--TTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T--CTTT-GT-TT--CG-AT--CTG---A---TT---AT--CTG--A-GATAAT-AAG-AT-A-------TG--ATACA----TTGG-T---T-G------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA---TGTTTG--TA----TC-AAAAATACT-CGCAAAT--A-AG--CGA-AAATT-GAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-
gi|62349                      :      aTACCGTAATACGGGT-TTTTTT-T---GCG-T-AT-C-ACAGA-A-TT-TG-C-G--AA--T-CAT--GCGCCC-GAAA------CCATAACTG--C-A-TTTTTT--ATT------GC-GTTT--CACCTTT-GT-TTG-C--ATTCTTG-TTA--------AA--CTG--A-GAAAAG-AA--ATGA-------TGGAACACAG---TTGG-TTG-TAATTTTCAATTTTATG---C-G-A-ATTTCAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAATATACT-CGCAAAT-AACAG--CGA-ATA-TAGATATACG---GC---GAA---AAAA---A-ACC-C---TA-A---CGGTA
gi|62350                      :        aCCGTATAACTGGT-TTTC-------GCG-T-AT-T-ACAAA-TATT-TG-C-GC-AA--TTC-T--GC-CCC-AAAA------C----A-TG--CTA-TTTTTTT-ATTTTGCCGGC--TGT--T-CCTTT-GT-TTGTCG-AT-CTTG--TA---TC---AT--CTGTTG-TATATT-ATA-CT-A-------CATTATATAT---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---CCG-A-ATT-TAAA-TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAA-TACT-CGCAAAT-AATAG--CGA-AA-TTAGATCTATC---GCCGCG-A---AAAA---A-ACT-CG-TTATACCCCGGTAt
gi|62351                      :    attTACCGTATAACGGGT-TTT-TT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTG---TT---AT--CTG--A-GAAATT-CAG-AT-A-------
gi|62352                      :      aTACCGTATAACAGGT-TTTATT-T---GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-A--CA--A-A-T--AC-CTC-CAAG------C----AGTG--CTG--TTTTT--ATTT-----GT-GT
gi|62353                      :      aTACTATATAACGGAC-TTTGTT-T---GCG-T-AT-C-AC-AA-T-TT-TG-C-GAAAA--T-A-C--CC-CCC-AAAATG----T----GTTG--TTGCTTTTTT--ATTT-----GCTGCAG--T-TCTCT-AT-TTG-CG-TTTCCT
gi|62354                      :      aTACCATTTAACAGGT-TTTGTT-T---GCG-T-AA-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA------T--G------AAAAAACAATC----AGTT--TTG-TTTTTT--ATTG-----GC-GTATAGT-CATTT-GT-TTG-CG-ATTC
gi|62355                      :      aTACCGTACAACGG-T-TTTGCT-TG--GCG-A-AT-C-ACAAT-T-TC-TA-T-G--AA--A-A-T--GC-CCC-CAGA------C----AGTG--TTG-TTTTGTCAATTT-----GC-G-----T-CCTCT-CG-TTG-C--ATT
gi|62356                      :      aTACCGTATAACGT-T-TTTTTT-TT--GTG-TTAT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TC---GT--ATA--ACGGG--T-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CAA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAgtagagtaatcattat
gi|62357                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CCG--A-GAAATT-CAA-AT-A-------ATGAA-ACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-T-ATT-CAA--TTTTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62358                      :        ACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TTTTGCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCCCAAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATTCAAA-AA-A-------TGAAA
gi|62359                      :            TATAACGGGT-TTTTTT-T---GCGGT-ATTC-ACAAAAT-TT-TG-CCG--AA----C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-CTTCGT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTG-GTATTG-CG-ATTCTTGAGTACCGTT---ATAACGG--A-G----T-AAGTAT-A-------TGGAACACAGA--TTGG-T-G-TAA------ATTTTACG---CAG-A-ATT-TAT--TTGTTTG--CG-AT-TC--AAAATACTCCGCAAAT-AA-AGTATGA-AAATTAGCT-TATC---GC---GAA---AAAA---A-AAC-CG-TTATA---CGatgaaaaaca
gi|62360                      :                  GGGT-TCTTTTCTT--GCG-T-AT-C-ACAAA-C-TTCTG-C-G--AA--T-C-TCTGC-CCC-AAA-------------CTGACCTA-TTTTCT--ATTT-----GC-GTCG--T-CCTTT-GT-TTG-CGTATTCTT
gi|62361                      :                                                                                                                                                                                          T-AAG-AT-A-------TGCAACACAG---TTGG-C-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTAtatgtgtatt
gi|62362                      :                                                                                                                                                                            ttattcatatcgcgT-AAG-AT-A-------TGATACACAA---TTGG-T-G-TAC------ATTTTATG---C-A-T-ATT-TAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CACATAC-AA-AA--CGA-AAAGTGGAT-TATT---GC---A-A---AAAT---A-ACC-TG-TTATA---TGGTAt
gi|62363                      :                                                                                                                                                                                          T-AAG-AT-A-------TGTTACACCA---TCGT-T-A-TAT------ATTTAATG---T-G-G-ACT-TAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTTGAT-TATC---GC---G-A---AAAT---G-ACC-CA-TTATA---TGATAt
gi|62364                      :                                                                                                                                                                                          T-AAG-AT-G-------TGGTACACAG---TTTA-T-G-TAC------ATTTTATG---T-G-C-ATT-------TGTTT---TA-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAGC-AA-AA--CAA-AAATTGGAT-TGTC----C---G-A---AAAAT--A-ACC-TG-TTTTG---CGGTAt
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gi|62366                      :                                                                                                                                                                                                                CACAGGGGTTGG-T-GGTAA------ATTTTACGGCACAG-A-ATT-TAAACTGGTTTGGCCGGAT-GC-AAAAATACT-CGGAAA---A-AG--TGA-AGTTTAGCT-TATCGCGGC---G-A---AAAA---A-ACCGGG-TTATA---CGGTA
gi|62367                      :                                                                                                                                                                                                                     ---TTGG-A-A-TAG------ATTTTTAG---C-G-ATATT-TAA--TT-TTAG--CG-ATCTC-AAAGAC-CT-CGCTAAT-AA-TT--CCA-AAATTAAAT-CCTC---GC---T-A---AAAT---T--TC-TGCTTATA---CGGTA
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blockSeqs                     :                      .   T  . T     . .  . .     . .  .  . . .   T    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .       .   .    .    .    .  .   AT .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . C .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   T  . T     . .  . .     . .  .  . . .   T    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .       .   .    .    .    .  .   AT .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . A .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   C  . T     . .  . .     . .  .  . . .   T    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .       .   .    .    .    .  .   A  .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . C .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   A  . G     . .  . .     . .  .  . . .   T    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .       .   .    .    .    .  .   A  .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . A .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   G  . T     . .  . .     . .  .  . . .   T    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .       .   .    .    .    .  .   .  .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . C .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   G  . T     . .  . .     . .  .  . . .   A    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .       .   .    .    .    .  .   .  .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . C .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   G  . T     . .  . .     . .  .  . . .   T    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .       .   .    .    .    .  .   .  .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . C .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   T  . .     . .  . .     . .  .  . . .   A    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .       .   .    .    .    .  .   .  .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . C .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   T  . .     . .  . .     . .  .  . . .   T    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .       .   .                        .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . C .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   T  . .     . .  . .     . .  .  . . .   T    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .                                    .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . T .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   T  . .     . .  . .     . .  .  . . .   T    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .                                    .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . C .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   T  . .     . .  . .     . .  .  . . .   T    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .                                    .   .  . .                .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . C .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   .  . .     . .  . .     . .  .  . . .   .    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .    .  .     .  .   .  .                                                              .      . . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . A .  .     .  
blockSeqs                     :                      .   .  . .     . .  . .     . .  .  . . .   .    . .   .   .    .      .       .    .      .     .      .                                                                                               . .   .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . . .  .     .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .             .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   . . .  .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                  .   . . .   .   .        .   .  .  .         .       .  .  .    .         .    .    .   . .      .   .               


blockSeqCons                  :                               T**
originalCons                  :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATT-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
finalCons                     :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATT-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA





Alignments
lowQualScore                  :                               111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
lowQualScore                  :                      1   1  1 222   1 3  1 5     1 1  1  1 1 44  2222 1 22  1   1    888888 4444    22   1      44    44444  1    22 2     2  2   2  2       2   444  444  33   33 5   99 2   2  2 6666666          555    4 1 1   555555        666 5 1 1   1   44       22  5  1  3         1       3  3  22   3         3    333  333 5 333    444 3 1 1  1     333     
lowQualScore                  :                      .   .  . ...   . .  . .     . .  .  . . ..  .... . ..  .   .    ...... ....    ..   .      ..    .....  .    .. .     .  .   .  .       .   ...  ...  ..   .. .   .. .   .  . .......          ...    . . .   ......        ... . . .   .   ..       ..  .  .  .         .       .  .  ..   .         .    ...  ... . ...    ... . . .  .     ...     
lowQualScore                  :                      9   0  9 222   9 8  9 7     9 9  9  9 9 55  7777 9 66  9   9    111111 0000    66   9      55    88888  9    88 0     0  0   0  0       5   444  777  77   77 3   88 1   1  1 8888888          555    0 9 9   222222        555 2 7 7   7   11       44  2  7  5         7       5  5  44   5         5    000  000 2 000    888 5 3 8  8     333     
consensus                     :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATT-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
Reference ( family-517 )      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATT-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62340                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-T---GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAAT--AAG-AT-A-------TGGAATACAG---TTGG-T-G-TAA------TTTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-TG-TTATA---GGGTA
gi|62341                      :      aTACCGTATAACGGGG-TTTTTT-T---GCG-C-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---AC---GT--ATA--ACGGG--T-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGA-T-G-TAA------ATTTTATA---C-GAA-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-AAACAAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62342                      :      aTACCATATAACGGGGGTTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TA-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATT-CA--AT-G-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-G---AAAA---A-A-A-CG-TTATA---CGGTA
gi|62343                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--TTTT-----GC-ATGT--T-CCTTT-GT-TTG-TG-ATTCTTG-GTA---TTCGTAT--C------GCA--T-AAG--T-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---T-G-A-ATT-CAG--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATT---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62344                      :      aTACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CGC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATT-CAA-AT-AATGAAAATGAAAAACA--------------AA------ATTT-ATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CAA-AAATTAGAT-TATC---GC---GAA---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62345                      :      aTACCGTATAACGGG--ATTTTT-TT--GCG-T-AT-CAAGAAA-T-TT-TT-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--GTTT-----AC---GT--T-TCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-AGAA---AAG-AT-A-------T-GAACACAG---TTGGTT-G-TAA------ATTTTTTGC--C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CGAAT-TCAAAAAATACT-CGCAAATAAA-AG--CGATAAATTAGAT-TATC---GT---G-A---AAAA---ACGTC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62346                      :      aTACCGTATAACGGG--ATTTTT-TT--GCG-T-AT-CAAGAAA-T-TT-TT-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--GTTT-----AC---GT--T-TCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-AGAA---AAG-AT-A-------T-GAACACAG---TTGGTT-G-TAA------ATTTTTTGC--C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CGAAT-TCAAAAAATACT-CGCAAATAAA-AG--CGATAAATTAGAT-TATC---GT---G-A---AAAA---ACGTC-CG-TTATA---CGGTAt
gi|62347                      :          aGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-TTAT-CCACAAA-T-TT-TGGC-G--AAAAT-C-T--GC-C---AAAA------C----ACTG--CTA-CTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTTGGT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---t
gi|62348                      : atacttTACCGTATAACGGGT-TTT--T-TT--GCG-T-AT-C-ACAAT-A-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-CAAA------C----ACTG--CTA--TTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T--CTTT-GT-TT--CG-AT--CTG---A---TT---AT--CTG--A-GATAAT-AAG-AT-A-------TG--ATACA----TTGG-T---T-G------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA---TGTTTG--TA----TC-AAAAATACT-CGCAAAT--A-AG--CGA-AAATT-GAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-
gi|62349                      :      aTACCGTAATACGGGT-TTTTTT-T---GCG-T-AT-C-ACAGA-A-TT-TG-C-G--AA--T-CAT--GCGCCC-GAAA------CCATAACTG--C-A-TTTTTT--ATT------GC-GTTT--CACCTTT-GT-TTG-C--ATTCTTG-TTA--------AA--CTG--A-GAAAAG-AA--ATGA-------TGGAACACAG---TTGG-TTG-TAATTTTCAATTTTATG---C-G-A-ATTTCAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAATATACT-CGCAAAT-AACAG--CGA-ATA-TAGATATACG---GC---GAA---AAAA---A-ACC-C---TA-A---CGGTA
gi|62350                      :        aCCGTATAACTGGT-TTTC-------GCG-T-AT-T-ACAAA-TATT-TG-C-GC-AA--TTC-T--GC-CCC-AAAA------C----A-TG--CTA-TTTTTTT-ATTTTGCCGGC--TGT--T-CCTTT-GT-TTGTCG-AT-CTTG--TA---TC---AT--CTGTTG-TATATT-ATA-CT-A-------CATTATATAT---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---CCG-A-ATT-TAAA-TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAA-TACT-CGCAAAT-AATAG--CGA-AA-TTAGATCTATC---GCCGCG-A---AAAA---A-ACT-CG-TTATACCCCGGTAt
gi|62351                      :    attTACCGTATAACGGGT-TTT-TT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTG---TT---AT--CTG--A-GAAATT-CAG-AT-A-------
gi|62352                      :      aTACCGTATAACAGGT-TTTATT-T---GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-A--CA--A-A-T--AC-CTC-CAAG------C----AGTG--CTG--TTTTT--ATTT-----GT-GT
gi|62353                      :      aTACTATATAACGGAC-TTTGTT-T---GCG-T-AT-C-AC-AA-T-TT-TG-C-GAAAA--T-A-C--CC-CCC-AAAATG----T----GTTG--TTGCTTTTTT--ATTT-----GCTGCAG--T-TCTCT-AT-TTG-CG-TTTCCT
gi|62354                      :      aTACCATTTAACAGGT-TTTGTT-T---GCG-T-AA-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA------T--G------AAAAAACAATC----AGTT--TTG-TTTTTT--ATTG-----GC-GTATAGT-CATTT-GT-TTG-CG-ATTC
gi|62355                      :      aTACCGTACAACGG-T-TTTGCT-TG--GCG-A-AT-C-ACAAT-T-TC-TA-T-G--AA--A-A-T--GC-CCC-CAGA------C----AGTG--TTG-TTTTGTCAATTT-----GC-G-----T-CCTCT-CG-TTG-C--ATT
gi|62356                      :      aTACCGTATAACGT-T-TTTTTT-TT--GTG-TTAT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TC---GT--ATA--ACGGG--T-AAG-AT-A-------TGGAACACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CAA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-AAA-CG-TTATA---CGGTAgtagagtaatcattat
gi|62357                      :       TACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TT--GCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GT-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CCG--A-GAAATT-CAA-AT-A-------ATGAA-ACAG---TTGG-T-G-TAA------ATTTTATG---C-G-T-ATT-CAA--TTTTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTA
gi|62358                      :        ACCGTATAACGGGT-TTTTTT-TTTTGCG-T-AT-C-ACAAA-T-TT-TG-C-G--AA--T-C-T--GC-CCCCAAAA------C----ACTG--CTA-TTTTTT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTT-GT-TTG-CG-ATTCTTG-GTA---TT---AT--CTG--A-GAAATTCAAA-AA-A-------TGAAA
gi|62359                      :            TATAACGGGT-TTTTTT-T---GCGGT-ATTC-ACAAAAT-TT-TG-CCG--AA----C-T--GC-CCC-AAAA------C----ACTG--CTA-CTTCGT--ATTT-----GC-GTGT--T-CCTTG-GTATTG-CG-ATTCTTGAGTACCGTT---ATAACGG--A-G----T-AAGTAT-A-------TGGAACACAGA--TTGG-T-G-TAA------ATTTTACG---CAG-A-ATT-TAT--TTGTTTG--CG-AT-TC--AAAATACTCCGCAAAT-AA-AGTATGA-AAATTAGCT-TATC---GC---GAA---AAAA---A-AAC-CG-TTATA---CGatgaaaaaca
gi|62360                      :                  GGGT-TCTTTTCTT--GCG-T-AT-C-ACAAA-C-TTCTG-C-G--AA--T-C-TCTGC-CCC-AAA-------------CTGACCTA-TTTTCT--ATTT-----GC-GTCG--T-CCTTT-GT-TTG-CGTATTCTT
gi|62361                      :                                                                                                                                                                                          T-AAG-AT-A-------TGCAACACAG---TTGG-C-G-TAA------ATTTTATG---C-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-TATC---GC---G-A---AAAA---A-ACC-CG-TTATA---CGGTAtatgtgtatt
gi|62362                      :                                                                                                                                                                            ttattcatatcgcgT-AAG-AT-A-------TGATACACAA---TTGG-T-G-TAC------ATTTTATG---C-A-T-ATT-TAA--TTGTTTG--TG-AT-TC-AAAAATACT-CACATAC-AA-AA--CGA-AAAGTGGAT-TATT---GC---A-A---AAAT---A-ACC-TG-TTATA---TGGTAt
gi|62363                      :                                                                                                                                                                                          T-AAG-AT-A-------TGTTACACCA---TCGT-T-A-TAT------ATTTAATG---T-G-G-ACT-TAA--TTGTTTG--CG-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTTGAT-TATC---GC---G-A---AAAT---G-ACC-CA-TTATA---TGATAt
gi|62364                      :                                                                                                                                                                                          T-AAG-AT-G-------TGGTACACAG---TTTA-T-G-TAC------ATTTTATG---T-G-C-ATT-------TGTTT---TA-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAGC-AA-AA--CAA-AAATTGGAT-TGTC----C---G-A---AAAAT--A-ACC-TG-TTTTG---CGGTAt
gi|62365                      :                                                                                                                                                                                                               ACACAG---TTAA-T-G-TAC------ATTTTATG---C-G-T-ATT-TAA--TTTTTTG--CG-AT-Tt
gi|62366                      :                                                                                                                                                                                                                CACAGGGGTTGG-T-GGTAA------ATTTTACGGCACAG-A-ATT-TAAACTGGTTTGGCCGGAT-GC-AAAAATACT-CGGAAA---A-AG--TGA-AGTTTAGCT-TATCGCGGC---G-A---AAAA---A-ACCGGG-TTATA---CGGTA
gi|62367                      :                                                                                                                                                                                                                     ---TTGG-A-A-TAG------ATTTTTAG---C-G-ATATT-TAA--TT-TTAG--CG-ATCTC-AAAGAC-CT-CGCTAAT-AA-TT--CCA-AAATTAAAT-CCTC---GC---T-A---AAAT---T--TC-TGCTTATA---CGGTA
gi|62368                      :                                                                                                                                                                                                                              -G-TAT------ATTTTATG---C-G-G-ATT-TAA--TCATTAG--CT-AT-TC-AGAAATACT-CTCAAAC-AA-AG--TAA-ACATTAGAT-TATT---GC---G-A---AAAT---A-ACC-CG-TTATt
gi|62369                      :                                                                                                                                                                                                                                  AA------ACTTTGTA---T-G-A--TG-CAT--TTTTCTG--TG-AT-TC-AGAAATCGT-CGCGAAC-AA-AG--CGA-AAATTGGA--TA-C---AC---G-A---GGAAAGTA-AC-----TTATA---CAG
gi|62370                      :                                                                                                                                                                                                                                           TTTTATG---T-G-A-ATT-CAA--TTGTTTG--CA-AT-TC-AAAAATACT-CGCAAAT-AA-AG--CGA-AAATTAGAT-AATT---GC---A-A---AAAA---A-A-A-TG-TTATG---CGGTA
gi|62371                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                     -AAAAATACT-CGCAAA--AA-AG--TGA-AA--TGGAT-TATC---AC---G-A---AAAT---A-AAC-CT-TTATA---CGGTAt