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gi|103735                     : ACTCGTT-CA-T-CT---T--T---AA----C--T---AGT----C-GT-AC-------TT---A--------------------------------T-AG-T------------------------T---TT-C--T--A--TTA--AC---G-T--T--------TA---T---A--T-----AAAA------T-TGTAACA--A-AAA---A-----T--A---T---AT--AT-G-AT-T-----G----A-----T-----T-T-T-C-A-A--C----A----------AAT-T---A-T-TG--TTT--G---A------A--ACACA-----A-A---T-A-CA-TG---TCAG-A---------G-T-TA-C-A-TA---------TT-T-GT--GA--------------C-A----G--T-T-A--GGT--T-T---A---CT--CG--AAT--A-AC--T-GT-TG--A-A--G-C-AACT-AAT-A---AAGAAAA
gi|103736                     : ACTAGTT-CAAT-CTA--T--T---AA----GG-T---CGT-AG-C-GT-AC-------TT---A--CA-------------T----G---TA--TCT-AGTT------------------------T---TT-C--T--A--TCA--AT---T-A--T--------TA---G---GT-T-----AAAA--G---C-TACGAC-----AAAG-AA-----T--T---T---AT--AC-T-AC-TC----G----AT----T-----T-T-T-G-A-A--G----A----------A---T---A-G-TG--TTT--G---G------A--
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gi|103738                     : ACTCGTT-CA-T-CTA--TATT---AA----G--T---CGT----C-GT-AC-------TT---G--CA-------------TT---A---TA--CGT-AG-T------------------------TGTTCT-C--T--A--TCA--AT---A-A--T--------TT---A---G--T-----ATAACCA---C-TCGAACA--A-AAAG-AAG----T--TCTGT---AT--AC-T-AC-TCTTGTG----ACACTCT-----C-T-C-G-AGA--G----ATTCTAATTAAA---T-----G-TG--TTT--G---ACATTGTA--TAGCA-----A-A---T-AGCA-TG---TCAGTG---------G-T-TA---A-TA---------TT-T-GTA-AA--------------C-A----G--T-T-A--GGT--T---------CT--CG--AAT--ATTC--T-GTATG--A-A--G-CAAATT-AAT-TTAAAATAAAA
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Reference ( family-509 )      : ACTCGTT-CA-T-CTA--T--T---AA----G--T---CGT-A--C-GT-AC-------TT---A--CA-------------T----G---TA--TCT-AG-T------------------------T---TT-C--T--A--TCA--AT---T-A--T--------TA---G---G--T-----AAAA--A---C-TGCAACA--A-AAAG-AA-----T--T---T---AT--AC-T-AC-T-----G----A-----T-----T-T-T-G-A-A--G----A----------A---T---A-G-TG--TTT--G---A------A--TAACA-----A-AAT-T-A-CA-TG---TCAG-A---------G-T-TA-C-A-TA---------TT-T-GT--AA--------------C-A----G--T-T-A--GGT--T-T---A---CT--CG--AAT--A-TC--T-GT-TG--A-A--G-C-AACT-AAT-T---AATAAAA
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gi|103749                     :  CTCGAT-CA-T-GCA--C--T---TA----G--T---CGT-A--C-TT-AA-------CT---AGTCG-------------T--------TA---CT-GA-T------------------------T---CT-C--T--T--TTC--AT---C-A--T--------TA---G---C--T-----ACAA------T-TGTAACA--A-AAGT-AA-----T--A-------AC--AC-C-TT-T-----G----A-----T-----T-T-T-G-A-A--C----A----------AG--T---G-GGTG--TTT--G---A------A--TTACA-----A-A-T-T-A-CA-TG---CAAG-A---------G-T-CA-T-G-CA---------TT-T-GT--CG--------------C-A----G--T-T-A--GAT--T-TTTAA---CT--CG--AAT--A-AC--T-GA-TG--A-A--A-T-AAAT-AAT-G---AA
gi|103750                     :    CGTT-CA-T-CTA--T--T---AA----G--T---CGTCA--C--T-AC-------TT---G--CA-------------T----G---TA--TCT-AG-T------------------------T---TT-C--T--A--TCA-------T-A--T--------TA---G---G--T-----CAAA--A---C-TGCAACA--A-AAAG-AA-----T--T---T---AT--AC-T-AC-T-----GCA--A-----TC----T-T-T-A-G-A--A----A----------A---T---A-G-TG--TTT--G---A------ATTTAACA-----A-A---T-AGCA-TGT--TCAG-A---------G-T-TA-C-A-TA---------TT-T-GT--AA--------------C-A----G--T-T-A--GGT--T-T---A---CT--CGC-AAT--A-TC--T-GT-TG--A-A--G-C-AATT-AAT-T---AATAAAA
gi|103751                     :           -T-CTA--T--T---AA----A--C---AGT----C-GT-GC-------TT---T-----------------T----G---GA--TCT-AG-T------------------------T---TTGC--T--A--TCAT-AT---C-A--T--------TA---G---GTTT-----AGAA--G---CTTGTAATACTA-CAAG-AA-----G--T---T---AT--AC-T-TCAT-----GTTTCA-----T-----T-T-T-G-A-A--A----C----------A---A---A-G-CGGATTC--GGTCA------G--TATCATTAACA-AAT-T-A-CA-TG---TCAG-AGG-------G-T-TA-C-ATTATT-------TT-T-GTTAGA--------------C-ACCGTG--C-T-G--CGTTAT-T---A---CCTACT--GAC--A-TCATT-TT-TG--A-A--G-C-ATCT-AAT-
gi|103752                     :               TA--T--T---AA----G--T---CGT-A--C-GT-A--------TT---G--CAA------------T----G---T---TTT-AG-TACAAT-------------------T---TC-C--T--AAGTCG--AT---T-C--T--------TA---G------T-----AAAG--------TGCAT------AAAG-A---------T---T---AT--AC-T-AC-T-----G----A-----T-----T-T-T-G-A-A--GA---A----------A---T---A---TG--TTT--G---A------A--TAACA-----A-AAT-T-A-CA-T----TCAG-A---------GTT-TA-C-A-TA---------TT-T-GT--AA--------------C-A----A--T-T-A--GGT--T-TTC-A---CT--CG--AAT--A-TCT-T-GT-TG--G-AATG-C-AACT--AT-T---AAT
gi|103753                     :                 --T--T---AA----G--TA--CGT-A--C-AG-AC-------TT---A--CA-------------G----GAAGTAA-TCT-AG-T------------------------T---TT-C--T--A--TCAT-AT---T-AAGT--------TAAGGG---A--T-----AAAA--AAAGC-TGCAACA--A-ACAGAAA-----T--T---T---ATTAAC-TAAC-T-----G----A-----T-----G-TATAG-A-A--GAAAAA----------A---TA--A-G-TA--GTTAGG---A------A--TAAGA-----ACAATCT-A-CA-GA---TC-G-A---------G-T-TT-A-A-TA---------CT-T-ATGAAA--------------CAA----G--T-TAA--GGTGAT-T---A---CT--CAGCAAT--A-TT--TGGT-TG--A-A--GCC-AATT-AAT-TA--AATAAAA
gi|103754                     :                                                                                              --TCT-AG-T------------------------T---TT-C--T--A--TTA--AT---T-A--C--------TA---A---G--T-----AAAA--A---C-TGTAACA--A-AAAT-AA-----T--T---T---AT--AT-T----T-----A----A-----T-----T-T-T-
gi|103755                     :                                                                                                      -T------------------------T---TT-C--T--A--TCA--AT---T-A--T--------TA---G---G--T-----AAAA--A---C-TGCAAGA--A-AAAG-A----------------------------------------------T-----T-T-T-G-A-A--G----A----------AA--T---A-G-TG--TTT--G---A------A--TAACA-----A-Atttttatttttaacaaatcagtattttgaatcttaaa
gi|103756                     :                                                                                                                                              --TCT--AT---T-A--T--------TA---G---G--T-----AAAA--A---C-TACAATA--A-AAA---A-----C--C---G---AT--AT-T-AT-T-----G----A-----T-----T-T-T-G-A-A--------------------------------------------------------CA-----A-A-T-T-A-CG-TG---TCAG-A---------A-T-TA-C-A-TA---------TT-T-GT--GA--------------C-A----G--T-T-A--AGT--T-T---A---CT--CG--A
gi|103757                     :                                                                                                                                                                                                                -AAAC-AA-----TAAT---T---AT--AC-C----------G----A-----T-----T-T-T-G-A-A--C----A----------AAG-G---A-G-TA--TTT--G---A------A--TATCA-----A-A-T-T-A-CA-TG---TCCG-A---------G-T-GC-T-G-TA---------TT-T-GT--GA--------------C-A----C--T-T-A--CAT--T-TAAAA---CT--TA--AAT--C-GC--T-GT-AG--A-A--G-C-AACT-AAT-


blockSeqs                     :        T  A G   GG AT TGA  TTAA AT GTT   ACTTACCAAGTCG       ATACCTAGCCTTTAATTGTT                 T  T TTTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTT GTT  G TT TT AG   TT  ATA T AG TACAGTTG  AGG TGCA   TTTAA    AAAG   T       CT T   GA  TTAATTT      GTT  AA  T A  T CTTGT TTTC CACTC TCATC A A A A G GATTCTAATTAAAT             A G  GA   AG GTC CATTGT TT A  ATTAAC C A C A G  T  ACG    A GTCTGTGTT T C  C A T  ACCATATAT  G G  NNNNNNNNNNNNNNGT   A CCGT AT A A TC   TA C AAA AAA  TA  GC   TA T  AT G  A  AA C AT C A    G   TTAA 
blockSeqs                     :        .  . .   .  AT CT   .    G  A     ATACGTAT            AGATCTAGGTG                          .  . ACAAT                    .    . TT G  A    T   .   . T  .         A   GTT    TA       CCA    .       .  .   G   GTTCTG       .    TA  . .  A T     CA   T     C     . . . . . GAAAAAATA                  G .  T    T  .   G      TT A  AT     . A . . G  .  T      T GG        T .  . A .  TT         . .  TAGA               . .    .  . . .    GA . TTA ATG  .   A    GA .  T  .  .  .  . .  . .    .   AA   
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ATACGTAT            ACAGGAAGTAA                          .  . .                        .    . T  .  .    T   .   . .  .         .   GT     .        AG     .       .  .   G   TAAT         .    .   . .  . C     .    .     .     . . . . . GAAATAT                    . .  .    .  .   .      T  A  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  T          . .  GAAA               . .    .  . . .    .  . AAA TG   .   C    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   TA   
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     AGCGTAC             TATACATGTA                           .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        G      .       .  .   G   TTG          .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . AAATCTG                    . .  .    .  .   .      T  A  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AAA                . .    .  . . .    .  . TA  .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   T    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ATAGAAT             AGATTCTAGG                           .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        G      .       .  .   T   TG           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GACATGG                    . .  .    .  .   .      .  A  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AAA                . .    .  . . .    .  . TC  .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   T    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ACGTAC              AGATGTAGG                            .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        A      .       .  .   G   TA           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GACATGG                    . .  .    .  .   .      .  A  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AAA                . .    .  . . .    .  . C   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   T    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ACGTAC              AGATATAGG                            .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        G      .       .  .   G   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . CAAATTT                    . .  .    .  .   .      .  A  A      . T . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   T    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ACGTAC              GCATTATA                             .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        T      .       .  .   G   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . CAGATT                     . .  .    .  .   .      .  C  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   T    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ACGTAC              AGTCGTTA                             .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        C      .       .  .   G   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . CAAATT                     . .  .    .  .   .      .  A  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   G    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ACGTAC              ACATGTA                              .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        A      .       .  .   G   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . CAAATT                     . .  .    .  .   .      .  C  G      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AG                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   T    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     GTCATA              GCATGTA                              .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        G      .       .  .   G   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . CAAATT                     . .  .    .  .   .      .  A  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  GA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   A    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ATATAC              ACATGTA                              .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        A      .       .  .   G   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . CAAATT                     . .  .    .  .   .      .  T  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   G    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     TCATGA              ACATGTA                              .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   A      .        A      .       .  .   G   TA           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . CAAAGG                     . .  .    .  .   .      .  C  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  GA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   C    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ACTTAA              ACATGTA                              .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        A      .       .  .   G   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GAAAT                      . .  .    .  .   .      .  C  A      . T . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  TA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   T    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     CACTAC              ACATGTA                              .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        A      .       .  .   T   TC           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GAGAA                      . .  .    .  .   .      .  T  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  GA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   G    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ACAGAC              ACATGTA                              .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   C      .        A      .       .  .   G   AT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GAAAT                      . .  .    .  .   .      .  T  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  GA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   A    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ACGAC               GCATGTA                              .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   A      .        A      .       .  .   T   CT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . ACAAA                      . .  .    .  .   .      .  T  A      . A . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AC                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   G    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     CGTAC               GCAATGT                              .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   T      .        A      .       .  .   T   CT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . CAAGT                      . .  .    .  .   .      .  C  A      . . . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  GA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   T    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     CGTAC               ACATTA                               .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   C      .        A      .       .  .   G   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GAAAT                      . .  .    .  .   .      .  T  A      . . . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  TA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .   T    
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     TCATA               ACTGAA                               .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        A      .       .  .   A   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GAAAT                      . .  .    .  .   .      .  A  A      . . . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  CG                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .        
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     TCATA               ACGTA                                .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   A      .        A      .       .  .   T   TA           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GAAT                       . .  .    .  .   .      .  A  .      . . . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .        
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     CGTGC               TTGGA                                .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   C      .        A      .       .  .   G   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . AAAT                       . .  .    .  .   .      .  A  .      . . . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  AA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .        
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ACGTA               AGGG                                 .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   A      .        G      .       .  .   G   GT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GAAA                       . .  .    .  .   .      .  A  .      . . . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  GA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .  .  .  .  .  . .  . .    .        
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     ATAC                GAAT                                 .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   C      .        A      .       .  .   G   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GAAA                       . .  .    .  .   .      .  A  .      . . . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  GA                 . .    .  . . .    .  . .   .    .   .    .  .                                   
blockSeqs                     :        .  . .   .  .  .    .    .  .     AC                  TTG                                  .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        A      .       .  .   T   TT           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . GAAT                       . .  .    .  .   .      .  A  .      . . . . .  .  .      . .         . .  . . .  .          . .  A                  . .    .  . . .    .  . .   .    .   .                                           
blockSeqs                     :           . .   .  .  .    .    .  .     AC                  ACA                                  .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   A      .        A      .       .  .   G   CC           .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . AAAT                       . .  .    .  .   .      .  .  .      . . . . .  .  .                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                 .  .  .    .    .  .     AC                  A                                    .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        .      .       .  .   C   T            .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . ACAA                       . .  .    .  .   .      .  .  .      . . . . .  .  .                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                 .  .  .    .    .  .     A                   C                                    .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        .      .       .  .   .   C            .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . CAA                        . .  .    .  .   .      .  .  .      .                                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                   .  . .                        .    . .  .  .    .   .   . .  .         .   G      .        .      .       .  .   .   T            .    .   . .  . .     .    .     .     . . . . . .                          . .  .    .  .   .      .                                                                                                                                                                             
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