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lowQualScore                  :       .  . .   . .    ......  .. .. .  ....... . ..   .   .... .   ..  ..... ..    ..     .   .. .   ....  ..  ..  . .. .... . .  ... .. . ... .    . ...   .... ... .   . .     .   .. . ...  .  .     .. . ....    .    .   . . .... .  . .  . .  .   .  .. .      .. .. .. . .  .. . ...     ..      
lowQualScore                  :       5  6 5   5 5    333333  99 88 3  7777777 3 11   3   2222 7   22  33333 22    55     3   00 4   9999  22  99  4 66 9999 4 4  777 88 3 333 3    3 333   7777 444 3   3 2     7   88 4 444  5  1     22 6 4444    6    6   6 8 4444 6  6 6  5 2  6   7  00 7      11 11 11 7 7  44 7 888     55      
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Reference ( gi|86215 )        :   GGGTGTC-A-TAT-T-GTAA----G-CAC-C--C-TA---G---G-TA-CAC-GTG----G-TTT--CG-----G--TCAA--TCGGT-AATC-A-AAC----ACT-TG--CA-G-AT----A-A-AA-G-A--G-A---A-TGAA-C---GGC----A-C-C-CAC-A-TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTTT-GTA-TCA----A-AA-A-ATGA-AT-GTG-AA--T-TTAATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAA--CTTTTT
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gi|86227                      :   GGGTGTT-A-TAT-T-GTAA----G-CTT-C--A-TA---G---C-TG-CAC-GTG----G-TT-------------------TCGGT-AATC-A-AAC----ACT-TG--CA-G-AT----A-A-AT-GTA--G-A---A-TGAA-C---GGC----A-T-C-CAC-A-TACAT-ATC--A-T---
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gi|86233                      : gggggatTC-A-TAC-T-GTAA----A-CAT-C--T-TA---T---G-TG-AAC-GTG----G-TTT--CG-----G--TCAA--TCAGT-AATT-A-AAC----ACG-TG--CA-G-GT----A-A-AA-GGA--G-A---A-TGAA-T---GGC----A-T-C-CAC-A-TACAT-ACA--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTCT-GTA-TTA----A-AA-A-ATAA-AT-GTG-AA--T-ATAATT--C--A--T-T-GA--C-C---CTTAA--TTCT
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gi|86236                      :        TT-A-TTT-T-GTAA----G-CATTC--C-TA---G---G-TG-CAC-GTGT---G-TTT--CG-----G-----------GT---TC-A-A-------CG-T------------------AA-G-G--G-A---A-T-----------------C-C-CAC-AGTACAT-G----A-T---TC-TC-ACAAA--A-C----AAAC-TTGA-TTA-TC-----A-AA-A-AT-A-AT-GTG-AA--T-ATAAT
gi|86221                      :         C-A-TAT-T-GTAA----A-CAT-C--C-TA---T---G-TG--AC-GTG----G-TTT--CG-----G--T-AA--TCGGT-AATT-A-AAA----ACG-TG--CC-G-GT----A-A-AG-G-A--G-A---A-TGAG-C---GGGTATAA-C-C-CAC-A---CAT-ATC--AAT---TC-TC-A--AA--C-A----AAAC-TTTT-GTA-TCA----A-AA-A-ATGA-AT-GTG-AA--T-ATAATT--T--A--A-T-GAAGC-C---CTTAA--CTTTTT
gi|86237                      :   gggggcttc-TAT-T-CTAA----G-TAT-C--C-TA---T---G-TGGCAC-GTGATTGG-TTTG-CG-----GG-TCAA--TCAGT-AATCTA-AAA----ACCGTG--CA-G-GT----A-A-AA-GGA--G-ATTAA-TGAA-AATGGGT----A-T-C-CAC-A-TCCAT--TT--A-TACATC-TC-ACAAA--C-ACATAAGAC-GTTT-GTA-TCA----A-AA-G-ATAAGAT--TGAAA--T-TTAAGT--TCGAC-A-T-GA--CAC---CTTAAACCTTTTT
gi|86238                      :               T-T-GTCA----A-CAT-C--C-TA---AA--G-TG-CA--GTG----G-TTT---A-----G--TCAA--TTG-T-AATT-T-AATTTAAAGG-TG--CAAG-TT----A-A-AA-G-GTTG-A---A-TGAATC---AGC----ATC-C-CAC-A-T-CAT-GTC--A-T---CT-CC-ACAAA--C-A----------TTT-GTA-TTA----A-AA-ATAT---AT-GTG-AA--T-CTAATT--T--A--CTT-GA--C-CGAACTTA
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Reference ( family-497 )      :        GGGTNTC-A-TAT-T-GTAA----G-CAT-CC-TAN------G-T-G-CAC-G--TG----G-TTT--CG-----G--TCAA--T--CGGT-AATC---A-AAC----ACGTG-CAGGT----A--A-AA-G-A--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CC-AC-A-TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTTT-GTA-TCA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AA--T-TTAATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAA--CTTTTT
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lowQualScore                  :            .  . .   . .    ......   .  .  ........ . . .   . ..  .... .   ..  ..... ..    ..     .   .... .   ....  .  .     .... .. .  . . .. . ... .    . ...  .   ..  .  . .     .   .. . ...  .  .     .. . ....    .    .   . . .... .  .     .  .   .  .. .      .. .. .. . .  .. . ...     ..      
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Reference ( family-497 )      :        GGGTNTC-A-TAT-T-GTAA----G-CAT-CC-TA------T-G-T-G-CAC-G--TG----G-TTT--CG-----G--TCAA--TCGGT-AATC---A-AAC----ACGTG-CAGGT----A--A-AA-G-A--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CC-AC-A-TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTTT-GTA-TCA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AA--T-TTAATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAA--CTTTTT
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lowQualScore                  :            0  5 5   4 4    999999   6  3  11111111 9 3 6   6 88  0000 6   11  22222 11    33     3   5555 3   8888  7  3     2222 22 3  3 0 88 6 333 2    2 222  2   55  2  2 2     6   77 3 333  5  0     11 5 3333    5    5   5 3 3333 5  5     2  6   6  88 6      00 00 00 7 7  33 7 666     44      
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Reference ( family-497 )      :        GGGTNTC-A-TAT-T-GTAA----G-CAT-CC-TA------T-G-T-G-CAC-G--TG----G-TTT--CG-----G--TCAA--TCGGT-AATC---A-AAC----ACGTG-CAGGT----A--A-AA-G-A--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CC-AC-A-TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTTT-GTA-TCA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AA--T-TTAATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAA--CTTTTT
gi|86211                      :        GGGTGTC-A-TAT-T-GTAA----G-CAT-CC-TA------G-G-T-G-CAC-A--TG----G-TTT--CG-----G--TCAA--TCGGT-AATC---A-AAC----ACTTG-CAGAT----A--A-AA-GGA--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CC-AC-A-TACAT-ACC--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAGC-TTAT-GTA-TCA----A-AA-TATAA-AT-GTG-AA--T-TTAATT--T--A--A-T-GA--C-T---CTTAA--CTTTTT
gi|86212                      :        GGGGGTC-A-TAT---GTAA----G-CAT-CC-TA------G-A-T-G-TAC-G--TG----G-CTT--CG-----G--TCAA--TCGGT-AATC---A-A-C----AT-TG-CAGAT----A--A-AA-GGA--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CT-AC-A-TACAT-ATC--A-A---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTAT-GTA-TCA----A-AA-AATAA-AT-TTG-AA--T-TTAATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAA--CTTT
gi|86213                      :        GGGGGTC-A-TAT-T-GTAA----G-CAT-CC-TA------G-A-T-G-TAC-G--TG----G-CTT--CG-----G--TCAA--TCGGT-AATC---A-AAC----ACTTG-CAGAT----A--A-AG-G-A--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT---T-AC-A-TACAT-ATC--A-A---TC-TC-AACAA--C-A----AAAC-TTAT-GTA-TCA----A-AA-AATAA-AT-TTG-AA--T-TTAATT--T--A--A-T-GA----C---CTTAA--CTTTTT
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gi|86226                      :      ggGGGTCTT-C-TAT-T-GTTA----C-AAT-CC-TA------T-G-TAG-CACTG--TG----G-TTT--CG-----G--ATAAGATCG-T-AATCT--A-AAC----ACGTG-CCGGC----A--A-AA-G-G--G-A---A-TGA------GG-TATA-AC-AC-A-TGTAT-GTTCAA-T---TC-TC-A-ACA--C-A----AGACATTTT-GTA---A----A-AA-AATAA-AT-CTG-AAC-T-TTAATTCAT--A--A-T-GA--C-C---CTTAA--CTTTTT
gi|86227                      :      ggGGGTGTT-A-TAT-T-GTAA----G-CTT-CA-TA------G-C-T-G-CAC-G--TG----G-TTT--CG-----G--T-----------AATC---A-AAC----ACTTG-CAGAT----A--A-AT-GTA--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CC-AC-A-TACAT-ATC--A-T---
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gi|86231                      : gggggatGGGTTTC-A-TAT-T-GTAA----A-CAT-CT-TA------T-G-T-G-CAC-G--TG----G-TT---CG-----G--TTAA--TTGGT-AGTT---A-AAC----ACGTG-CAGGT----AT-A-AG-G-A--G-A---A-TGAA-C---AA-CAT--CC-AT-A-TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTTT-GAA-TTA----A-AA-AATGA-AT-ATG-AA--T-TTAATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAA--CTTTTT
gi|86232                      :       gGGGTC-C-A-TAT-T-GTAA----G-TAT-CC-TA------T-A-T-G-CAC-G--TG----G-CTT--TG-----G--TCAA--TCAGT-AATC---A-AAC----ACTTG-GAGGT----A--A-AAGG-A--G-A---A-TGAA-T---GA-CAT--CC-AC-A-TCCAT-AT
gi|86233                      :            gTC-A-TAC-T-GTAA----A-CAT-CT-TA------T-G-T-G-AAC-G--TG----G-TTT--CG-----G--TCAA--TCAGT-AATT---A-AAC----ACGTG-CAGGT----A--A-AA-GGA--G-A---A-TGAA-T---GG-CAT--CC-AC-A-TACAT-ACA--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTCT-GTA-TTA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AA--T-ATAATT--C--A--T-T-GA--C-C---CTTAA--TTCT
gi|86234                      :             TC-A-TAT-T-GTAA----A-CAT-CC-TA------T-G-T-G-CAC-G--TG----G-CTT--CC-----G--TCAA--TCAGA-AATT---A-AAC----ACCTG-CAGAT----A--A-AA-G-G--GGA---A-TAAA-C---GG-CAT--TC-AC-A-TTCAT-ATC--A-T---TA-TC-ACAAA--C-A----GAAC-CTTT-GTA-TTA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AG--T-ATAATG--T--A--T-A-GG--T-C---CTTAA--CATTT
gi|86235                      :             TC-A-TAT-T-GTAA----AACATTCC-TA------T-G-T-G-CAC-G--TG----G-CTT--CC-----G--TCAA--TCAA--AATT---A-AAC----ACCTG-CAGAT----A--A-AA-G-G--GGA---A-T-AA-C---GG-CAT--TC-AC-A-TTCATCATC--A-T---TA-TC-ACAA---C-A----GAAC-CTTT-GTA-TTA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AG--T-ATAATG--T--T--A-TAGG--T-C---ATTAA--CATTT
gi|86236                      :             TT-A-TTT-T-GTAA----G-CATTCC-TA------G-G-T-G-CAC-G--TGT---G-TTT--CG-----G-----------GT---TC---A-A-------CGT----------------AA-G-G--G-A---A-T-------------C--CC-AC-AGTACAT-G----A-T---TC-TC-ACAAA--A-C----AAAC-TTGA-TTA-TC-----A-AA-AAT-A-AT-GTG-AA--T-ATAAT
gi|86237                      :                 -TAT-T-CTAA----G-TAT-CC-TA------T-G-T-GGCAC-G--TGATTGG-TTTG-CG-----GG-TCAA--TCAGT-AATCTAAA-AAC-----CGTG-CAGGT----A--A-AA-GGA--G-ATTAA-TGAA-AATGGG-TAT--CC-AC-A-TCCAT--TT--A-TACATC-TC-ACAAA--C-ACATAAGAC-GTTT-GTA-TCA----A-AA-GATAAGAT--TGAAA--T-TTAAGT--TCGAC-A-T-GA--CAC---CTTAAACCTTTTT
gi|86238                      :                    T-T-GTCA----A-CAT-CC-TA------AAG-T-G-CA--G--TG----G-TTT---A-----G--TCAA--TTG-T-AATT---T-AATTTAAAGGTG-CAAGTT---A--A-AA-G-GTTG-A---A-TGAATC---AG-CAT--CCCAC-A-T-CAT-GTC--A-T---CT-CC-ACAAA--C-A----------TTT-GTA-TTA----A-AA-A-TAT-AT-GTG-AA--T-CTAATT--T--A--CTT-GA--C-CGAACTTA
gi|86239                      :                           A----G-CAT-CC-TA------T-G---G-CAC-G--TG----GATTT--CG-----G--TCAATTTC-GT--ATC---A-AAC----ACTTG-CAGGT----A--A-AAGG-A--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CT-AC-A-TA
gi|86240                      :                           A----G-CAT-CC-TA------T-G---G-CAC-G--TG----GATTT--CG-----G--TCAATTTC-GT--ATC---A-AAC----ACTTG-CAGGT----A--A-AAGG-A--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CT-AC-A-TA
gi|86241                      :                                 -CAT-CC-TA------T-G-T-T-CAC-G--AG----A-TTT--CG-----G--TCAA--TTGGT-AATT---A-AAC----ATGCG-CAGGT----A--A-AATG-A--G-A---A-TGAA-C---AT-CAT--CC-AC-A-TACAT-ATC--A-T---T
gi|86242                      :                                                                                                                                           -A--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CC-AC-A-TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTTT-GTA-TCA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AA--T-TTGATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAA--CTTTTT
gi|86243                      :                                                                                                                                                      -TGAA-C---GG-CAT--CC-GC-A-TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACTAA--C-A----AAAC-CTTT-GTA-TTA----ACAA-GAT
gi|86244                      :                                                                                                                                                                               -TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACAAG--C-A----AAAC-TTTT-GTA-TTA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AA--T-TTTATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAT--CTTTTTgtatt


blockSeqs                     :            G  G A   G T    ACATG    T  C  CATGTAT  G A A   T CT  ATTG A   TC  CGCGC GT    GA     A   CTAA T   TTAA  T  T     TTAA TA T  G G TT G TTA A    T ATG  G   AA  C  G G     T   AG A ACA  A  A     AA A CATA    A    G   A   CCGT C  C     T  T   A  TT C      CA CG TT T A  AG A GAA     AC
blockSeqs                     :            G  . .   . .    AA       T  .  CT       G . G   A .   T    A   G   .     G     TT     .   CT   .   .     T  .     T    T  .  G G .  G .   .    . .    .   A   .  . .     C   CA . .    .  C     .  . .       .    .   .   .    .  .     G  .   .  C  .      G  A  C  . .  .  . G       . 
blockSeqs                     :            G  . .   . .    G        .  .  AA       C . .   . .   .    .   .   .     .     TT     .   TT   .   .     T  .     .    .  .  G G .  . .   .    . .    .   A   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            G  . .   . .    G        .  .  G        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   C    .   .     T  .     .    .  .  G T .  . .   .    . .    .   A   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            G  . .   . .    G        .  .  G        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   C    .   .     T  .     .    .  .  G G .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            G  . .   . .    G        .  .  G        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   C    .   .     G  .     .    .  .  G G .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            T  . .   . .    G        .  .  G        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   C    .   .     G  .     .    .  .  T . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            T  . .   . .    G        .  .  G        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   C    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            T  . .   . .    A        .  .  G        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   A    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            T  . .   . .    A        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            T  . .   . .    A        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            G  . .   . .    A        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            G  . .   . .    G        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            T  . .   . .    A        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            C  . .   . .    C        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     T  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            G  . .   . .    C        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            T  . .   . .    G        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   C    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            T  . .   . .    A        .  .  G        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            T  . .   . .    A        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     T  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            T  . .   . .    A        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   C    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :            C  . .   . .    G        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     C  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :               . .   . .    A        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     C  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .       . 
blockSeqs                     :               . .   . .    A        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .      .  .  .  . .  .  . .         
blockSeqs                     :               . .   . .    G        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   C    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .     .  .   .  .  .                                   
blockSeqs                     :               . .   . .    G        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .     .  . .       .    .   .   .    .  .                                                      
blockSeqs                     :                 .   . .    A        .  .  G        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   C    .   .     T  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .    .  .                                                                                              
blockSeqs                     :                     . .    G        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   C    .   .     T  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .                                                                                                      
blockSeqs                     :                            G        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   T    .   .     G  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .                                                                                                      
blockSeqs                     :                            .        .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .   .    .   .     .  .     .    .  .  . . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .   .  . .                                                                                                      
blockSeqs                     :                                     .  .  T        . . .   . .   .    .   .   .     .     .      .                                        . .  . .   .    . .    .   .   .  . .     .                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .    . .    .   .   .  . .                                                                                                                     
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Reference ( family-497 )      :        GGGTNTC-A-TAT-T-GTAA----G-CAT-CC-TA------T-G-T-G-CAC-G--TG----G-TTT--CG-----G--TCAA--TCGGT-AATC---A-AAC----ACGTG-CAGGT----A--A-AA-G-A--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CC-AC-A-TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTTT-GTA-TCA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AA--T-TTAATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAA--CTTTTT
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gi|86240                      :                           A----G-CAT-CC-TA------T-G---G-CAC-G--TG----GATTT--CG-----G--TCAATTTC-GT--ATC---A-AAC----ACTTG-CAGGT----A--A-AAGG-A--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CT-AC-A-TA
gi|86241                      :                                 -CAT-CC-TA------T-G-T-T-CAC-G--AG----A-TTT--CG-----G--TCAA--TTGGT-AATT---A-AAC----ATGCG-CAGGT----A--A-AATG-A--G-A---A-TGAA-C---AT-CAT--CC-AC-A-TACAT-ATC--A-T---T
gi|86242                      :                                                                                                                                           -A--G-A---A-TGAA-C---GG-CAT--CC-AC-A-TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACAAA--C-A----AAAC-TTTT-GTA-TCA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AA--T-TTGATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAA--CTTTTT
gi|86243                      :                                                                                                                                                      -TGAA-C---GG-CAT--CC-GC-A-TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACTAA--C-A----AAAC-CTTT-GTA-TTA----ACAA-GAT
gi|86244                      :                                                                                                                                                                               -TACAT-ATC--A-T---TC-TC-ACAAG--C-A----AAAC-TTTT-GTA-TTA----A-AA-AATAA-AT-GTG-AA--T-TTTATT--T--A--A-T-GA--C-C---CTTAT--CTTTTTgtatt