lowQualScore : 1111111 1111111 111
lowQualScore : 22 2 1 55 11 6666 1 2 2 11 88888888 11 1 2222222 1 1 55 22 1 3 2 1 1 4444444 6666 3 2222 11 1 1 2 1 2 444 9999999 1 6 666 6
lowQualScore : .. . . .. .. .... . . . .. ........ .. . ....... . . .. .. . . . . . ....... .... . .... .. . . . . . ... ....... . . ... .
lowQualScore : 11 9 4 99 88 7777 3 6 5 77 33333333 77 2 2222222 2 2 00 99 2 6 4 2 2 7777777 4444 6 6666 77 2 2 4 2 5 555 8888888 4 1 999 7
consensus : TTTTG--CTGCT-TTT-CN-T--G-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------AA-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----T-AA----G--T-G-C-G-AC-A---AACAG---TGGACATG-ACGGGAATTA--CCTTGATAGAA
Reference ( gi|115048 ) : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-T--G-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------AA-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----T-AA----G--T-G-C-G-AC-A---ACCGG---TGGACATG-ACGGGAAATT--CCTCGATAGAA
gi|115045 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-T--A-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------AA-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----T-AA----G--T-G-C-C-AC-A---AGCAA---TGGACATG-ACAGG-AATT--ACTTGATAGAA
gi|115049 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-T--G-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------AA-TCC-C--A--TG-C-A-T-TGC-TCATGC--AA----T-AA----G--T-G-C-G-AC-A---AACAG---TGGACATG-ATTGGAATTA--CTTTAATAAAA
gi|115055 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-T--G-T--A-AA-T-A--AA-------TG--GC-A-------AA-TCC-C--G--TG-C-ACT-TGC-T----C--AA----TGAA----G--T-G-C-G-AC-A---AACAG---TGGACATG-ACGGGAA
gi|115057 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-T--G-G--ATGG-T-A--A--------TG--GC-A-------AA-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----C-AA----A--T-G-T-G-AC-A---AACAG---TGGACATG-ACGGGAAttgactttgat
gi|115052 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-T--G-A--A-AA-T-A--T--------TG--A--A-------AA-TCC-C--A--TG-C-A-T-TGC-T----T--AA----T-AA----G--T-G-C-A-AC-A---AACAG---TGGACATC-ACGG-AAATTA-CCTCGATAGAAttac
gi|115063 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-T--G-G--A-AA-T-A--ACACACATTTG--GC-A-------AA-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AT----T-AA----G--T-A-C-G-AC-A---AATAG---TGGACATG-AT-GGAAATA--CCCGGATA
gi|115058 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-T--G-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------AA-TCC-T--T--TG-C-A-TATGC-T----C--AA----TAAA----G--T-G-C-G-AC-A---AAC-----TGGACATA-ACAGGAATTA--ACT-GATAGAA
gi|115047 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-T--G-A--A-AA-T-A--T--------TG--GC-A-------AA-TCA-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----C-AA----G--T-G-C-A-AG-A---AACAG---TGGACATG-GCGGGAATTA--CCTTCATAAAA
gi|115060 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-T--G-G--A-AA-T-A--A--------TG--AC-AATATATTAA-TCC-C--G--TA-C-A-T-TGC-T----TGAGA----T-AA----G--T-G-C-G-AC-A---AACAG---TGGATATG-ACGGGAA
gi|115056 : TTTTG--CTACT-ATT-TT-T--G-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------AA-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----T-AA----G--T-G-T-G-AC-A---AACAG---TGGGAATG-ACAGGAAt
gi|115051 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-T--G-A--A-AA-T-A--G--------CG--GT-A-------AA-CCC-T--G--TG-T-A-T-TGC-T----C--AA----T-AA----G--T-GAC----C-A---AACAG---TGGATAAG-GCGGGAATTA--CCTTGATAGAAtta
gi|115059 : TTTTG--CTGCC-TTT-CG-T--A-A--A-AA-T-A--A--------TA--GC-A-------AA-TTC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----C-AT----G--T-G-C-G-AC-A---AACAC---TGGGTATG-GTGGTAA
gi|115046 : TTTTG--CTGTT-TTT-CT-T--G-A--A-AA-T-A-----------TG--GT-A-------AA-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G--AA----T-AA----G--T-G-C-A-AC-A---AATAC---CGAACATG-GCGGG--ATTGACCATGACAGAAt
gi|115064 : TTTTGGCCTGCT-TTT-CA-C--T-G--A-AA-TTA--A--------AG--AC-A-------AA-TCC-C--GG-TGGC-A-T-TGC-T----CC-AA----T-AA----G--T-G-T-G-AC-A---AACAA---TGGACATG-ACGGGAATTA--CCT
gi|115069 : TTTTG--TTGCT-TTT-CG-T--G-G--A-AA-T-A-----------TA--GC-A-------AA-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----A-AA----G--T-G-C-G-A
gi|115054 : TTTTG--CTGTT-TCT-CT-T--C-A--A-AT-T-T--A--------TG--AC-A-------AA-TTC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----G--TA----T-AA----G--T-G-C-G-AC-AGAGAC------TGGACATG--CAGGAATTG--CCTTGATAGAA
gi|115053 : TTTTG--CTGTT-TTTTCT-T--G-A--A-AA-T-A--A--------TT--GT-A-------AA-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----T--AG----T-AA----G--T-G-C-A-AC-A---AGCAC---TGGGCATG-GTGG
gi|115050 : TTTTG--TTGTT-TTT-AT-T--G-TT-A-AC-T-A--A--------AG--GC-T-------AA-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G--AA----T-AA----G--T-G-A-G-AC-A---AATAC---TGTACATG-GCGGGAATTG--CCTTGATAAAA
gi|115066 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-T--G----A-AA-T-A--C--------TG--GC-T-------AA-TCC------------A-T-TGC----------A----T-A--------T-G-C-G-AC-A---AAC-----TGGACATC-ACGGGAATTA--CTTCGATAGAA
gi|115067 : TTTTG--CTGTT-TTT-CGAT--T-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------AA-TCC-T--GTTTG-CTA-T-TG--T----C--AA----T-AA----G--TGG-C-GTAC-A---A-CAG---T--ACATGTACAGGGAAT
gi|115068 : TTTTG--CTGCT-TTT-CA-T--G-A--A-AA-T-A--A--------TGAAGC-A-------AA-TCG-CAAA--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----T-AC----G--T---T-G-ACAA---AACAG---TGGAgtacttt
gi|115062 : TTGTG--CTGCTATTT-CG-T--G-G--A-AACT-A--A--------TG--AA-ATATTATTAA-TCC-CCAG--TA-CCA-T-TGC-T----T--GACGGAT-AA----G--T-G-C-G-AC-A---AACAG---TGGATATG-ACAGGAAaactcgatcaggactatttgaccattgatac
gi|115061 : TTGTG--CTGCTATTT-CG-T--G-G--A-AACT-A--A--------TG--AA-ATATTATTAA-TCC-CCAG--TA-CCA-T-TGC-T----T--GACGGAT-AA----G--T-G-C-G-AC-A---AACAG---TGGATATG-ACAGGAA
gi|115065 : TTCTG--CTGTT-TTT-CT-T--G-A--A-AA----------------G--AC-A-------GA-CCC-C--G--TG-C-A-A-TGC-T----G--AA----T-AA----G--T-G-C-G-AC-
gi|115070 : TTTG--TT--T-TTT-TA-T--T-GTTA-AC-T-A--A--------AG--GCTA-------AA-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T-------GA----TAAA----G--T-G-A-G-ACAA---ATC-----TGTACATG-GCCGGAATTG--CCTTGATAAAAgtacaaatactgatcaaagcgggaatt
gi|115072 : TTG--CT--T-TTT-TG-TTTG-G--A-AA-TCA--A--------TG--GC-A-------AA-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----T-AA----AGTT-G-C-G-AC-A---AGCAA---TGGACATG-ACGGGAATTTA-CCT
gi|115073 : TGCT-TTT-CT-T--GCA--A-AA-T-A--AA-------CG--GC-A-------AAATCT-C--G--TC-C-A-T-TGC-T----C--AAT---T-AA----G--T-G-CTG-AC-A---TGTAG---TGGACATG-TCGGCGAATT--CCTt
gi|115074 : T-TTT-C--T--G-T--A-AA-T-A--AA-------TG--GC-A-------AA-TCCAC--G--CT-C-ACT-TGCCT----C--AA----T-AA----G--T-G-CTG-AC-A---AACAG---TGGACAAT-ACGGGAAttga
gi|115075 : TT-CT-T--G-A--A-AA-T-ATTA--------CG--GC-A-------AA-TCT-C--G--CG-C-A-T-TGC-T----C--CG----T-AA----G--T-G-C-G-AC-A---AACAG---TGttgacctttgat
gi|115076 : -T--G-A--A-AA-T-A--A--------TG--GG-A-------AA-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G--AA----T-AAACTTG--T-G-C-G-AC-AAATACCAGAATTGGA-------GGGAATAA--CCTTGATACAA
gi|115071 : ct-T-A--A--------TG---C-A-------GA-ACC-C--G--TG-C-A-T-TTA-T----G--AG----T-AA----G--T-G-C---AC-A---AATTC---TTAACATG--CTGGATATA--CCTTGATA
gi|115077 : tttgttttgttttttt-A--A--------TG--GC-A-------AA-TCC-C--A--TG-C-A-C-TGT-T----C--AA----T-AA----G--T-G-C-A-AC-A---AACAT---TGGACATG-A
gi|115078 : --G--TG-C-A-T-TGC-T----C--AA----T-AA----G--T-A-C-G-AC-A---AACAG---TGGACATG-ACGGG-AATA--CCTTAATAGAAatagaatt
Alignments
lowQualScore : 22 2 1 33 6666 1 2 2 11 88888888 11 1 7777777 3333333 1 1 44 22 1 3 2 1 1 222222 7777 3 2222 11 1 1 2 3333 1 1 0 11 111 1 1 11 1 1 55 3
lowQualScore : .. . . .. .... . . . .. ........ .. . ....... ....... . . .. .. . . . . . ...... .... . .... .. . . . .... . . . .. ... . . .. . . .. .
lowQualScore : 00 8 3 55 1111 3 5 4 77 00000000 77 2 9999999 9999999 2 2 99 88 2 5 4 2 2 666666 8888 5 5555 66 2 2 4 7777 2 2 5 77 666 2 2 88 3 4 00 5
consensus : TTTTG--CTGCT-TTT-CN-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
Reference ( family-493 ) : TTTTG--CTGCT-TTT-CN-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
gi|115045 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TA-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-C----AC-AAG-CAATGGACA--TG-A-C-AG-GA--A-T-T--A-C-TTGATAGAA
gi|115046 : TTTTG--CTGTT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A-----------TG--GT-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-AA----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAA-TACCGAACA--TG-G-C-GG-GA--T-T-G--ACC-ATGACAGAA
gi|115047 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A--T--------TG--GC-A-------A-------A-TCA-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----C-AA----G--T-G-C-A----AG-AAA-CAGTGGACA--TG-G-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTCATAAAA
gi|115048 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAC-CGGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-A-T--TCC-TCGATAGAA
gi|115049 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--A--TG-C-A-T-TGC-TCATGC-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-T-TG-GA--A-T-T--ACT-TTAATAAAA
gi|115050 : TTTTG--TTGTT-TTT-AT-TG-TT-A-AC-T-A--A--------AG--GC-T-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-AA----T-AA----G--T-G-A-G----AC-AAA-TACTGTACA--TG-G-C-GG-GA--A-T-T--GCC-TTGATAAAA
gi|115051 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A--G--------CG--GT-A-------A-------A-CCC-T--G--TG-T-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-GAC-------C-AAA-CAGTGGATA--AG-G-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
gi|115052 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A--T--------TG--A--A-------A-------A-TCC-C--A--TG-C-A-T-TGC-T----T-AA----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAA-CAGTGGACA--TC-A-C-GG-AA--A-T-T--ACC-TCGATAGAA
gi|115053 : TTTTG--CTGTT-TTTTCT-TG-A--A-AA-T-A--A--------TT--GT-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----T-AG----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAG-CACTGGGCA--TG-G-T-GG-
gi|115054 : TTTTG--CTGTT-TCT-CT-TC-A--A-AT-T-T--A--------TG--AC-A-------A-------A-TTC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-TA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AGA-GACTGGACA--TG---C-AG-GA--A-T-T--GCC-TTGATAGAA
gi|115055 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-T--A-AA-T-A--AA-------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-ACT-TGC-T----C-AA----TGAA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-TG-ACT-TTGAT
gi|115056 : TTTTG--CTACT-ATT-TT-TG-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-T-G----AC-AAA-CAGTGGGAA--TG-A-C-AG-GA--A-T-T--A
gi|115057 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--ATGG-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----C-AA----A--T-G-T-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--AC
gi|115058 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--T--TG-C-A-TATGC-T----C-AA----TAAA----G--T-G-C-G----AC-AAA-C--TGGACA--TA-A-C-AG-GA--A-T-T--AAC--TGATAGAA
gi|115059 : TTTTG--CTGCC-TTT-CG-TA-A--A-AA-T-A--A--------TA--GC-A-------A-------A-TTC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----C-AT----G--T-G-C-G----AC-AAA-CACTGGGTA--TG-G-T-GG-TA--A-T-
gi|115060 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--AC-A-------ATATATTAA-TCC-C--G--TA-C-A-T-TGC-T----T-GAGA--T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGATA--TG-A-C-GG-GA--A-T-
gi|115061 : TTGTG--CTGCTATTT-CG-TG-G--A-AACT-A--A--------TG--AA-ATATTATTA-------A-TCC-CCAG--TA-CCA-T-TGC-T----T-GACGGAT-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGATA--TG-A-C-AG-GA--A-
gi|115062 : TTGTG--CTGCTATTT-CG-TG-G--A-AACT-A--A--------TG--AA-ATATTATTA-------A-TCC-CCAG--TA-CCA-T-TGC-T----T-GACGGAT-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGATA--TG-A-C-AG-GA--A-
gi|115063 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--ACACACATTTG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AT----T-AA----G--T-A-C-G----AC-AAA-TAGTGGACA--TG-A-T-GG-AA--A---T--ACC-CGGATA
gi|115064 : TTTTGGCCTGCT-TTT-CA-CT-G--A-AA-TTA--A--------AG--AC-A-------A-------A-TCC-C--GG-TGGC-A-T-TGC-T----CCAA----T-AA----G--T-G-T-G----AC-AAA-CAATGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-
gi|115065 : TTCTG--CTGTT-TTT-CT-TG-A--A-AA----------------G--AC-A-------G-------A-CCC-C--G--TG-C-A-A-TGC-T----G-AA----T-AA----G--T-G-C-GACGTAC-AAA-TACTGATCA--AA-G-C-GG-GA--A-T-T--
gi|115066 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG----A-AA-T-A--C--------TG--GC-T-------A-------A-TCC------------A-T-TGC---------A----T-A--------T-G-C-G----AC-AAA-C--TGGACA--TC-A-C-GG-GA--A-T-T--ACT-TCGATAGAA
gi|115067 : TTTTG--CTGTT-TTT-CGATT-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--GTTTG-CTA-T-TG--T----C-AA----T-AA----G--TGG-C-GT---AC--AA-CAGT--ACA--TGTA-CAGG-GA--A-TGT--ACT-TT
gi|115068 : TTTTG--CTGCT-TTT-CA-TG-A--A-AA-T-A--A--------TGAAGC-A-------A-------A-TCG-CAAA--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AC----G--T---T-G----ACAAAA-CAGTGGAAACTCG-ATC-AG-GACTA-T-TTGACCATTGATA
gi|115069 : TTTTG--TTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A-----------TA--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----A-AA----G--T-G-C-G----Ac
gi|115070 : TTTG--TT--T-TTT-TA-TT-GTTA-AC-T-A--A--------AG--GCTA-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T------GA----TAAA----G--T-G-A-G----AC-AAATC--TGTACA--TG-G-C-CG-GA--A-T-T--GCC-TTGATAAAA
gi|115071 : -T-A--A--------TG---C-A-------G-------A-ACC-C--G--TG-C-A-T-TTA-T----G-AG----T-AA----G--T-G-C------AC-AAA-TTCTTAACA--TG---C-TG-GA--T-A-T--ACC-TTGATA
gi|115072 : tttgttttgtttttttTTG--CTTTT-TTG-TT-TG-G--A-AA-TCA--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----AGTT-G-C-G----AC-AAG-CAATGGACA--TG-A-C-GG-GA--ATT-T--ACC-TT
gi|115073 : TGCT-TTT-CT-TGCA--A-AA-T-A--AA-------CG--GC-A-------A-------AATCT-C--G--TC-C-A-T-TGC-T----C-AAT---T-AA----G--T-G-CTG----AC-ATG-TAGTGGACA--TG-T-C-GGCGA--A-T-T--CCT-TTGA
gi|115074 : T-TTT-C--TG-T--A-AA-T-A--AA-------TG--GC-A-------A-------A-TCCAC--G--CT-C-ACT-TGCCT----C-AA----T-AA----G--T-G-CTG----AC-AAA-CAGTGGACA--AT-A-C-GG-GA--A-T-TG-ACCTTTGAT
gi|115075 : TT-CT-TG-A--A-AA-T-ATTA--------CG--GC-A-------A-------A-TCT-C--G--CG-C-A-T-TGC-T----C-CG----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTG
gi|115076 : -CT-TG-A--A-AA-T-A--A--------TG--GG-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-AA----T-AAACTTG--T-G-C-G----AC-AAA-TACCAGAAT--TG-G-A-GG-GA--A-T-A--ACC-TTGATACAA
gi|115077 : -A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--A--TG-C-A-C-TGT-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAA-CATTGGACA--TG-A-A-TA-GA--A-T-T--
gi|115078 : --G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-A-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A---T--ACC-TTAATAGAA
Alignments
lowQualScore : 22 2 1 33 6666 1 2 2 11 88888888 11 1 7777777 3333333 1 1 44 22 1 3 2 1 1 222222 7777 3 2222 11 1 1 2 3333 1 1 0 11 111 1 1 11 1 1 55 3
lowQualScore : .. . . .. .... . . . .. ........ .. . ....... ....... . . .. .. . . . . . ...... .... . .... .. . . . .... . . . .. ... . . .. . . .. .
lowQualScore : 00 8 3 55 1111 3 5 4 77 00000000 77 2 9999999 9999999 2 2 99 88 2 5 4 2 2 666666 8888 5 5555 66 2 2 4 7777 2 2 5 77 666 2 2 88 3 4 00 5
consensus : TTTTG--CTGCT-TTT-CN-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
Reference ( family-493 ) : TTTTG--CTGCT-TTT-CN-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
gi|115045 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TA-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-C----AC-AAG-CAATGGACA--TG-A-C-AG-GA--A-T-T--A-C-TTGATAGAA
gi|115046 : TTTTG--CTGTT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A-----------TG--GT-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-AA----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAA-TACCGAACA--TG-G-C-GG-GA--T-T-G--ACC-ATGACAGAA
gi|115047 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A--T--------TG--GC-A-------A-------A-TCA-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----C-AA----G--T-G-C-A----AG-AAA-CAGTGGACA--TG-G-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTCATAAAA
gi|115048 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAC-CGGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-A-T--TCC-TCGATAGAA
gi|115049 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--A--TG-C-A-T-TGC-TCATGC-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-T-TG-GA--A-T-T--ACT-TTAATAAAA
gi|115050 : TTTTG--TTGTT-TTT-AT-TG-TT-A-AC-T-A--A--------AG--GC-T-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-AA----T-AA----G--T-G-A-G----AC-AAA-TACTGTACA--TG-G-C-GG-GA--A-T-T--GCC-TTGATAAAA
gi|115051 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A--G--------CG--GT-A-------A-------A-CCC-T--G--TG-T-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-GAC-------C-AAA-CAGTGGATA--AG-G-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
gi|115052 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A--T--------TG--A--A-------A-------A-TCC-C--A--TG-C-A-T-TGC-T----T-AA----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAA-CAGTGGACA--TC-A-C-GG-AA--A-T-T--ACC-TCGATAGAA
gi|115053 : TTTTG--CTGTT-TTTTCT-TG-A--A-AA-T-A--A--------TT--GT-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----T-AG----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAG-CACTGGGCA--TG-G-T-GG-
gi|115054 : TTTTG--CTGTT-TCT-CT-TC-A--A-AT-T-T--A--------TG--AC-A-------A-------A-TTC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-TA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AGA-GACTGGACA--TG---C-AG-GA--A-T-T--GCC-TTGATAGAA
gi|115055 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-T--A-AA-T-A--AA-------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-ACT-TGC-T----C-AA----TGAA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-TG-ACT-TTGAT
gi|115056 : TTTTG--CTACT-ATT-TT-TG-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-T-G----AC-AAA-CAGTGGGAA--TG-A-C-AG-GA--A-T-T--A
gi|115057 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--ATGG-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----C-AA----A--T-G-T-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--AC
gi|115058 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--T--TG-C-A-TATGC-T----C-AA----TAAA----G--T-G-C-G----AC-AAA-C--TGGACA--TA-A-C-AG-GA--A-T-T--AAC--TGATAGAA
gi|115059 : TTTTG--CTGCC-TTT-CG-TA-A--A-AA-T-A--A--------TA--GC-A-------A-------A-TTC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----C-AT----G--T-G-C-G----AC-AAA-CACTGGGTA--TG-G-T-GG-TA--A-T-
gi|115060 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--AC-A-------ATATATTAA-TCC-C--G--TA-C-A-T-TGC-T----T-GAGA--T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGATA--TG-A-C-GG-GA--A-T-
gi|115061 : TTGTG--CTGCTATTT-CG-TG-G--A-AACT-A--A--------TG--AA-ATATTATTA-------A-TCC-CCAG--TA-CCA-T-TGC-T----T-GACGGAT-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGATA--TG-A-C-AG-GA--A-
gi|115062 : TTGTG--CTGCTATTT-CG-TG-G--A-AACT-A--A--------TG--AA-ATATTATTA-------A-TCC-CCAG--TA-CCA-T-TGC-T----T-GACGGAT-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGATA--TG-A-C-AG-GA--A-
gi|115063 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--ACACACATTTG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AT----T-AA----G--T-A-C-G----AC-AAA-TAGTGGACA--TG-A-T-GG-AA--A---T--ACC-CGGATA
gi|115064 : TTTTGGCCTGCT-TTT-CA-CT-G--A-AA-TTA--A--------AG--AC-A-------A-------A-TCC-C--GG-TGGC-A-T-TGC-T----CCAA----T-AA----G--T-G-T-G----AC-AAA-CAATGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-
gi|115065 : TTCTG--CTGTT-TTT-CT-TG-A--A-AA----------------G--AC-A-------G-------A-CCC-C--G--TG-C-A-A-TGC-T----G-AA----T-AA----G--T-G-C-GACGTAC-AAA-TACTGATCA--AA-G-C-GG-GA--A-T-T--
gi|115066 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG----A-AA-T-A--C--------TG--GC-T-------A-------A-TCC------------A-T-TGC---------A----T-A--------T-G-C-G----AC-AAA-C--TGGACA--TC-A-C-GG-GA--A-T-T--ACT-TCGATAGAA
gi|115067 : TTTTG--CTGTT-TTT-CGATT-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--GTTTG-CTA-T-TG--T----C-AA----T-AA----G--TGG-C-GT---AC--AA-CAGT--ACA--TGTA-CAGG-GA--A-TGT--ACT-TT
gi|115068 : TTTTG--CTGCT-TTT-CA-TG-A--A-AA-T-A--A--------TGAAGC-A-------A-------A-TCG-CAAA--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AC----G--T---T-G----ACAAAA-CAGTGGAAACTCG-ATC-AG-GACTA-T-TTGACCATTGATA
gi|115069 : TTTTG--TTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A-----------TA--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----A-AA----G--T-G-C-G----Ac
gi|115070 : TTTG--TT--T-TTT-TA-TT-GTTA-AC-T-A--A--------AG--GCTA-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T------GA----TAAA----G--T-G-A-G----AC-AAATC--TGTACA--TG-G-C-CG-GA--A-T-T--GCC-TTGATAAAA
gi|115071 : -T-A--A--------TG---C-A-------G-------A-ACC-C--G--TG-C-A-T-TTA-T----G-AG----T-AA----G--T-G-C------AC-AAA-TTCTTAACA--TG---C-TG-GA--T-A-T--ACC-TTGATA
gi|115072 : tttgttttgtttttttTTG--CTTTT-TTG-TT-TG-G--A-AA-TCA--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----AGTT-G-C-G----AC-AAG-CAATGGACA--TG-A-C-GG-GA--ATT-T--ACC-TT
gi|115073 : TGCT-TTT-CT-TGCA--A-AA-T-A--AA-------CG--GC-A-------A-------AATCT-C--G--TC-C-A-T-TGC-T----C-AAT---T-AA----G--T-G-CTG----AC-ATG-TAGTGGACA--TG-T-C-GGCGA--A-T-T--CCT-TTGA
gi|115074 : T-TTT-C--TG-T--A-AA-T-A--AA-------TG--GC-A-------A-------A-TCCAC--G--CT-C-ACT-TGCCT----C-AA----T-AA----G--T-G-CTG----AC-AAA-CAGTGGACA--AT-A-C-GG-GA--A-T-TG-ACCTTTGAT
gi|115075 : TT-CT-TG-A--A-AA-T-ATTA--------CG--GC-A-------A-------A-TCT-C--G--CG-C-A-T-TGC-T----C-CG----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTG
gi|115076 : -CT-TG-A--A-AA-T-A--A--------TG--GG-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-AA----T-AAACTTG--T-G-C-G----AC-AAA-TACCAGAAT--TG-G-A-GG-GA--A-T-A--ACC-TTGATACAA
gi|115077 : -A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--A--TG-C-A-C-TGT-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAA-CATTGGACA--TG-A-A-TA-GA--A-T-T--
gi|115078 : --G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-A-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A---T--ACC-TTAATAGAA
blockSeqs : GC A T GA GTT T C T TT CACACATT AA T TATTATT TATATTA A A CA TT G C C A C CATGC CGGA G ACTT GT G A T ACGT A T CT TA A C CT T G TG A
blockSeqs : . A . T TT . C C . A . . TATTATT . . . CA G . C C . . CC CGGA A . . . . T T . . . AT . . . . . G T
blockSeqs : . . . T CA . . . . A . . . . . . AA . . T . . . G GA A . . . . . . . . . G . . . . . G .
blockSeqs : . . . G A . . . . A . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTTG--CTGCT-TTT-CN-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
finalCons : TTTTG--CTGCT-TTT-CN-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
Alignments
lowQualScore : 22 2 1 33 6666 1 2 2 11 88888888 11 1 7777777 3333333 1 1 44 22 1 3 2 1 1 222222 7777 3 2222 11 1 1 2 3333 1 1 0 11 111 1 1 11 1 1 55 3
lowQualScore : .. . . .. .... . . . .. ........ .. . ....... ....... . . .. .. . . . . . ...... .... . .... .. . . . .... . . . .. ... . . .. . . .. .
lowQualScore : 00 8 3 55 1111 3 5 4 77 00000000 77 2 9999999 9999999 2 2 99 88 2 5 4 2 2 666666 8888 5 5555 66 2 2 4 7777 2 2 5 77 666 2 2 88 3 4 00 5
consensus : TTTTG--CTGCT-TTT-CN-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
Reference ( family-493 ) : TTTTG--CTGCT-TTT-CN-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
gi|115045 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TA-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-C----AC-AAG-CAATGGACA--TG-A-C-AG-GA--A-T-T--A-C-TTGATAGAA
gi|115046 : TTTTG--CTGTT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A-----------TG--GT-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-AA----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAA-TACCGAACA--TG-G-C-GG-GA--T-T-G--ACC-ATGACAGAA
gi|115047 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A--T--------TG--GC-A-------A-------A-TCA-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----C-AA----G--T-G-C-A----AG-AAA-CAGTGGACA--TG-G-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTCATAAAA
gi|115048 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAC-CGGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-A-T--TCC-TCGATAGAA
gi|115049 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--A--TG-C-A-T-TGC-TCATGC-AA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-T-TG-GA--A-T-T--ACT-TTAATAAAA
gi|115050 : TTTTG--TTGTT-TTT-AT-TG-TT-A-AC-T-A--A--------AG--GC-T-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-AA----T-AA----G--T-G-A-G----AC-AAA-TACTGTACA--TG-G-C-GG-GA--A-T-T--GCC-TTGATAAAA
gi|115051 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A--G--------CG--GT-A-------A-------A-CCC-T--G--TG-T-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-GAC-------C-AAA-CAGTGGATA--AG-G-C-GG-GA--A-T-T--ACC-TTGATAGAA
gi|115052 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG-A--A-AA-T-A--T--------TG--A--A-------A-------A-TCC-C--A--TG-C-A-T-TGC-T----T-AA----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAA-CAGTGGACA--TC-A-C-GG-AA--A-T-T--ACC-TCGATAGAA
gi|115053 : TTTTG--CTGTT-TTTTCT-TG-A--A-AA-T-A--A--------TT--GT-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----T-AG----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAG-CACTGGGCA--TG-G-T-GG-
gi|115054 : TTTTG--CTGTT-TCT-CT-TC-A--A-AT-T-T--A--------TG--AC-A-------A-------A-TTC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-TA----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AGA-GACTGGACA--TG---C-AG-GA--A-T-T--GCC-TTGATAGAA
gi|115055 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-T--A-AA-T-A--AA-------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-ACT-TGC-T----C-AA----TGAA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-TG-ACT-TTGAT
gi|115056 : TTTTG--CTACT-ATT-TT-TG-A--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-G-T-G----AC-AAA-CAGTGGGAA--TG-A-C-AG-GA--A-T-T--A
gi|115057 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--ATGG-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----C-AA----A--T-G-T-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--AC
gi|115058 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--T--TG-C-A-TATGC-T----C-AA----TAAA----G--T-G-C-G----AC-AAA-C--TGGACA--TA-A-C-AG-GA--A-T-T--AAC--TGATAGAA
gi|115059 : TTTTG--CTGCC-TTT-CG-TA-A--A-AA-T-A--A--------TA--GC-A-------A-------A-TTC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----C-AT----G--T-G-C-G----AC-AAA-CACTGGGTA--TG-G-T-GG-TA--A-T-
gi|115060 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--A--------TG--AC-A-------ATATATTAA-TCC-C--G--TA-C-A-T-TGC-T----T-GAGA--T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGATA--TG-A-C-GG-GA--A-T-
gi|115061 : TTGTG--CTGCTATTT-CG-TG-G--A-AACT-A--A--------TG--AA-ATATTATTA-------A-TCC-CCAG--TA-CCA-T-TGC-T----T-GACGGAT-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGATA--TG-A-C-AG-GA--A-
gi|115062 : TTGTG--CTGCTATTT-CG-TG-G--A-AACT-A--A--------TG--AA-ATATTATTA-------A-TCC-CCAG--TA-CCA-T-TGC-T----T-GACGGAT-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTGGATA--TG-A-C-AG-GA--A-
gi|115063 : TTTTG--CTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A--ACACACATTTG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AT----T-AA----G--T-A-C-G----AC-AAA-TAGTGGACA--TG-A-T-GG-AA--A---T--ACC-CGGATA
gi|115064 : TTTTGGCCTGCT-TTT-CA-CT-G--A-AA-TTA--A--------AG--AC-A-------A-------A-TCC-C--GG-TGGC-A-T-TGC-T----CCAA----T-AA----G--T-G-T-G----AC-AAA-CAATGGACA--TG-A-C-GG-GA--A-T-T--ACC-
gi|115065 : TTCTG--CTGTT-TTT-CT-TG-A--A-AA----------------G--AC-A-------G-------A-CCC-C--G--TG-C-A-A-TGC-T----G-AA----T-AA----G--T-G-C-GACGTAC-AAA-TACTGATCA--AA-G-C-GG-GA--A-T-T--
gi|115066 : TTTTG--CTGCT-TTT-CT-TG----A-AA-T-A--C--------TG--GC-T-------A-------A-TCC------------A-T-TGC---------A----T-A--------T-G-C-G----AC-AAA-C--TGGACA--TC-A-C-GG-GA--A-T-T--ACT-TCGATAGAA
gi|115067 : TTTTG--CTGTT-TTT-CGATT-G--A-AA-T-A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-T--GTTTG-CTA-T-TG--T----C-AA----T-AA----G--TGG-C-GT---AC--AA-CAGT--ACA--TGTA-CAGG-GA--A-TGT--ACT-TT
gi|115068 : TTTTG--CTGCT-TTT-CA-TG-A--A-AA-T-A--A--------TGAAGC-A-------A-------A-TCG-CAAA--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AC----G--T---T-G----ACAAAA-CAGTGGAAACTCG-ATC-AG-GACTA-T-TTGACCATTGATA
gi|115069 : TTTTG--TTGCT-TTT-CG-TG-G--A-AA-T-A-----------TA--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----A-AA----G--T-G-C-G----Ac
gi|115070 : TTTG--TT--T-TTT-TA-TT-GTTA-AC-T-A--A--------AG--GCTA-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T------GA----TAAA----G--T-G-A-G----AC-AAATC--TGTACA--TG-G-C-CG-GA--A-T-T--GCC-TTGATAAAA
gi|115071 : -T-A--A--------TG---C-A-------G-------A-ACC-C--G--TG-C-A-T-TTA-T----G-AG----T-AA----G--T-G-C------AC-AAA-TTCTTAACA--TG---C-TG-GA--T-A-T--ACC-TTGATA
gi|115072 : tttgttttgtttttttTTG--CTTTT-TTG-TT-TG-G--A-AA-TCA--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----AGTT-G-C-G----AC-AAG-CAATGGACA--TG-A-C-GG-GA--ATT-T--ACC-TT
gi|115073 : TGCT-TTT-CT-TGCA--A-AA-T-A--AA-------CG--GC-A-------A-------AATCT-C--G--TC-C-A-T-TGC-T----C-AAT---T-AA----G--T-G-CTG----AC-ATG-TAGTGGACA--TG-T-C-GGCGA--A-T-T--CCT-TTGA
gi|115074 : T-TTT-C--TG-T--A-AA-T-A--AA-------TG--GC-A-------A-------A-TCCAC--G--CT-C-ACT-TGCCT----C-AA----T-AA----G--T-G-CTG----AC-AAA-CAGTGGACA--AT-A-C-GG-GA--A-T-TG-ACCTTTGAT
gi|115075 : TT-CT-TG-A--A-AA-T-ATTA--------CG--GC-A-------A-------A-TCT-C--G--CG-C-A-T-TGC-T----C-CG----T-AA----G--T-G-C-G----AC-AAA-CAGTG
gi|115076 : -CT-TG-A--A-AA-T-A--A--------TG--GG-A-------A-------A-TCC-T--G--TG-C-A-T-TGC-T----G-AA----T-AAACTTG--T-G-C-G----AC-AAA-TACCAGAAT--TG-G-A-GG-GA--A-T-A--ACC-TTGATACAA
gi|115077 : -A--A--------TG--GC-A-------A-------A-TCC-C--A--TG-C-A-C-TGT-T----C-AA----T-AA----G--T-G-C-A----AC-AAA-CATTGGACA--TG-A-A-TA-GA--A-T-T--
gi|115078 : --G--TG-C-A-T-TGC-T----C-AA----T-AA----G--T-A-C-G----AC-AAA-CAGTGGACA--TG-A-C-GG-GA--A---T--ACC-TTAATAGAA