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Reference ( family-490 ) : ACAC-G---TG----TG-T-A-AC-AC-G-TGT----TT-CTCT---T---CCGCGA-T-A-TTCCGAA-C-TGG-T-G-A-CCTCC-GAGG-T-CA-T-T-G--C----G--T----C-G-GAGA-TGA-CG--A----A---CAGGAA-T-TA-CTG-AC-GGG--ATG-C-CAG--T--AAT--TCAT--G--AATCGACAT---TTT---CT-GCTG-ATTT--GAC-GCGT-TTA--CTG-CTTCAAAT
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originalCons : ACAC-G---TG----TG-T-A-AC-AC-G-TGT----TT-CTCT---T---CCGCGA-T-A-TTCCGAA-C-TGG-T-G-A-CCTCC-GAGG-T-CA-T-T-G--C----G--T----C-G-GAGA-TGA-CG--A----A---CAGGAA-T-TA-CTG-AC-GGG--ATG-C-CAG--T--AAT--TCAT--G--AATCGACAT---TTT---CT-GCTG-ATTT--GAC-GCGT-TTA--CTG-CTTCAAAT
finalCons : ACAC-G---TG----TG-T-A-AC-AC-G-TGT----TT-CTCT---T---CCGCGA-T-A-TTCCGAA-C-TGG-T-G-A-CCTCC-GAGG-T-CA-T-T-G--C----G--T----C-G-GAGA-TGA-CG--A----A---CAGGAA-T-TA-CTG-AC-GGG--ATG-C-CAG--T--AAT--TCAT--G--AATCGACAT---TTT---CT-GCTG-ATTT--GAC-GCGT-TTA--CTG-CTTCAAAT
Alignments
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lowQualScore : 9 888 4444 8 8 7 7 7 7 7777 7 999 999 2 6 4 4 9 4 4 4 4 4 4 4 999 4 44 7777777 5555 4 4 4 4 99 3333 777 6 3 3 3 3 88 000 88 88 11 88 11 333 333 7 3 33 4 4 77 7
consensus : ACAC-G---TG----TG-T-A-AC-AC-G-TGT----TT-CTCT---T---CCGCGA-T-A-TTCCGAA-C-TGG-T-G-A-CCTCC-GAGG-T-CA-T-T-G--C----G--T----C-G-GAGA-TGA-CG--A----A---CAGGAA-T-TA-CTG-AC-GGG--ATG-C-CAG--T--AAT--TCAT--G--AATCGACAT---TTT---CT-GCTG-ATTT--GAC-GCGT-TTA--CTG-CTTCAAAT
Reference ( family-490 ) : ACAC-G---TG----TG-T-A-AC-AC-G-TGT----TT-CTCT---T---CCGCGA-T-A-TTCCGAA-C-TGG-T-G-A-CCTCC-GAGG-T-CA-T-T-G--C----G--T----C-G-GAGA-TGA-CG--A----A---CAGGAA-T-TA-CTG-AC-GGG--ATG-C-CAG--T--AAT--TCAT--G--AATCGACAT---TTT---CT-GCTG-ATTT--GAC-GCGT-TTA--CTG-CTTCAAAT
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gi|91065 : ACAC-G---TG----TG-T-A-AC-AC-G-TGA----T--CTCT---T---CCGCGA-T-A-TTCCGAA-C-TGG-T-G-A-CCTTC-AAGG-T-CA-T-T-G--T----A--T----C-G-GAGA-TGA-CG--A----A---CAGGAA-T-TA-CTG-AC-GGG--ATG-C-CGG--TTAAAT--TCAT--G--AATCGACAT---TTT---CT-GCTG-ATTT--GAC-GTGT-TTA--CTG-CTTCAAAT
gi|91066 : ACAC-G---TG----TC-T-A-AC-AT-A-TGT----TT-CTCT---T---CAGCGA-T-A-TTCCGAA-C-TGG-T-G-A-CCTCC-GAGG-T-CA-T-T-G--T----G--T----C-G-GAGA-TGATCG--A----A---CAAGAA-T-TA-CTG-AT-GGG--ATG-C-CAG--T--AAT--TCAT--T--AATCGATAT---TTT---CT-GCTG-AATT--GAC-ACGT-TTG--CTG-CTTCAAAT
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gi|91070 : ACAC-G---T-----TA-T-A-GC-TC-G-TGT----TT-CCCTCCTT---CCG-GA-T-A-TTCCGAA-C-T-G-T-G-A-CCTCC-GAGG-TCCC-T-T-G--C----G--T----C-G-GAGA-TGA-CG--A----A---CAAGAA-T-TA-CTG-AC-GGG--A-G-C-CAG--T--AAT--TCAT--G--AA-CGACAT---TTT---CT-GCTGAATTT--GAC-GCGTATTA--CTG-CTTCAAAT
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gi|91073 : ACAC-GC--TG----TGGT-A-AC-ACCG-TGT----TTGCTCT---TGGGCCGCGA-T-A-TTCCGAA-C-TGA-T-G-ACCCTCC-GAGGAT-CA-T-T-G--C----G--T----C-T---AA-TGA-CG--A----AC--CAAGAATT-TA-ATGTAC-GGGAAATG---CAG--T--AATGATCAT--GA-AATCGATAT---TTT---CTGGCTG-ATTTTGAACAGCGT-TTAG-TTGTTTTCAAAT
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gi|91077 : ACAC-G---TGCATGTG-T-A-AC-AC-G-TGT----TT-CTCT---T---CTGTGA-T-A-TTCCGAA-C-TAG-T-G-A----CC-GAGG-T-CA-T-T-G--C----G--T----C-G-GAGA-TGA-CG--A----A---CA
gi|91078 : ACAC-GATCTG----T--T-A-ACCAC-GAGGT----TT-CTCT---T---CCGCAA-TTA-TTCCGGA-CCTGG-T-G-A-CCTCC-GAGG-T-CA---T-G--C----C--T----C-G-GAGA---------------------------TA-CTG-AG-GGG--A-G-C-CAT--A--AAT--TCAT--G---ATCGACAT---TTT---CT-GTTT-A-TT--GA--GCGT-
gi|91079 : ACAC-G---TA----TG-T-A-TC-AC-G-TTT----TT-CTCT---T---CCACGA-T-A-TTCCGAA-C-TGG-T-G-A-C
gi|91080 : ACGC-A---TG----CG-T-A-CT-AC-G-TGT----C----------------------A-TTCTGAA-C-TGA-T-G-A-CCTCC-GAGG-T-CA-A-T-GTAC----A--T----C-G-GAGA-T
gi|91081 : CAT-G---TGAA--TC-T-G-AC-AC-G-TGT----TT-CTCT---T---CCGCGA-T-A-TTCCGAA-C-TGG-T-G-A-CCTCC-GAGG-T-CA-T-T-G--C----G--T----C-G-GAGA-TGA-CG--ATTTAA---CAAGAA-T-TA-CCG-AC-GGG--ATG-C-CAG--T--AAT--TCAT--G--AATCAACAT---TTT---CT-GCTG-ATTT--GAC-GCGT-TTA--CTG-CTTCAAAT
gi|91082 : AC-A---TG----TG-C-A-GC-AC-G-TGT----TC-CTCT---T---CTGTAA-T-AATTCCGAA-C-TGG-T-G-A-CCTCC-GAGG-T-CA-T-T-G--C----A--T----C-G-GAGA---A-CGAAA----A---CAATAA-T-TA-CTG-AC-AGG--AAG-C-CAA--T--AAT--TCAC--G--AATCGACAT---TTC---CT-GCTG-ATTT--GAC-TCGT-TTG--TTG-CTTCAAAT
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