lowQualScore                  :                           11                                      22222                                                                        11111                     1111                                        22222222                            111111111111     11111                                      222222222                    1111111                                 1111                   22222222222222                   11              11111111                   1          
lowQualScore                  :         4444      44    1 77   444    44444  1 1    66 1   666666 88888      22 9   1 1  1 88  1       1    2222   2222 2 1   1  222 777777 2  55555   1 333 22 555555   7777   3 3   66666666     2 777  1   22  1  00000000       2 555  2 2  6    2   777777777777  2  00000 4444  2  33     33 4 2  2   2 2   2  444444444 55  2  22  2   1   2222222       5    4 2 33 444 7777 2    5555      22 2 55   2  00000000000000 2  66   2 2 2  1  11  2      55 2 44444444 2     2  2  2 2   4  33      
lowQualScore                  :         ....      ..    . ..   ...    .....  . .    .. .   ...... .....      .. .   . .  . ..  .       .    ....   .... . .   .  ... ...... .  .....   . ... .. ......   ....   . .   ........     . ...  .   ..  .  ........       . ...  . .  .    .   ............  .  ..... ....  .  ..     .. . .  .   . .   .  ......... ..  .  ..  .   .   .......       .    . . .. ... .... .    ....      .. . ..   .  .............. .  ..   . . .  .  ..  .      .. . ........ .     .  .  . .   .  ..      
lowQualScore                  :         7777      11    7 66   888    33333  7 7    33 7   777777 11111      22 6   3 2  1 44  0       0    0000   0000 0 1   4  444 888888 9  55555   7 000 44 000000   1111   7 6   66666666     0 777  9   66  9  88888888       1 888  2 2  1    2   777777777777  2  66666 7777  2  11     11 4 2  2   4 4   4  666666666 66  5  55  4   1   2222222       1    5 4 22 111 4444 4    2222      99 1 00   1  99999999999999 2  11   2 2 4  9  55  5      99 5 44444444 5     7  7  7 7   5  99      
consensus                     :   TAGGGA----TGGCAA--TCGA-A-TACA---GAAT-----TG-C-CAAT-CG-GTT------ANCC--GCAACA--C-GTTCC-GA-C--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-GTATC-AA---A------A-TA-N---ATA-C---A--T------TTT--G-AGACA-TAG--------TTGAT-G-G-CT-TCA--AT-TT-TCT--C-AAGTTTT-C---TC-T-GTTTATA-TGC---A-C-AAA--AA-TAC-A--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT---TCTT--TA-TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAAGTGT-G--A---G----A-AAACG---AAGAAA--G-G--ATT-AA-----AC-------A-TG--CAC-A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--T-A--------A-ATCCC-AA-AG-T-CCAGAT--TTCACA
Reference ( gi|73725 )        :   TAGGGA----TGGCAA--TCGA-A-AACA---GAAT-----TG-C-CAAT-TG-GTT------ACAC--GCAACA--C-GTTTC-GA-C--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-GTATC-AA---A------A-TA-A---ATA-C---A--T------TTT--A-AGATA-TAG--------TTGAT-G-A-CT-TCA--AT-TT-TCT--G-AAGTTTT-C---TC-T-GTCTATA-TGC---A-C-ACA--AA-TAT-A--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT---TCTTG-TG-TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAACAAGTAT-G--A---G----A-AAACC---AAGAAA--G-G--ATT-AA-----CC-------A-TG--CAC-A-A-GACTT-TAA-GAGAAA--T-A--------A-ATCCC-AA-AG-T-CCATAT--TTCACA
gi|73714                      :   TAGGGA----TGGCAA--TCGA-A-TACA---GAAT-----TG-C-CAAT-CG-GTT------AACC--GCAACA--C-GTTCC-GA-C--CG-ATTAACC-TGTT----AAT----C-GTATT-AA---A------A-TA-T---ATA-C---A--T------TTT--G-AAACA-TGG--------TTGAT-G-G-CT-TCA--AT-TT-CTT--T-AAGATTT-C---TC-T-GTTTATA-TGC---G-C-AAA--AA-TAC-A--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT---TCT---TA-TG-TTA-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAAGTGT-A--A---G----A-AA--C---AAACAA--G-G--ATT-AA-----AC-------A-TG--CGC-A-A-GAATT-CAA-GAGCAA--A-A--------A-ATCCC-AA-AG-T-CCAGAT--TTCACA
gi|73715                      : acTAGGGA----TGGCAA--TCGA-A-TACA---GAAT-----TG-C-CAAT-CA-GTT------AACC--GGAACA--C-GTTCC-GA-C--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-GTATC-AA---A------A-T------ATA-T---A--T------TTT--G-AATTA-TAG--------TTGAT-G-G-CT-TAA--AT-TT-CTT--T-AAGTTTT-C---TC-T-GTTTATA-TGC---A-CAAAA--AA-TAC-A--A----TG-CA--ACACA--C-C-AG-TAA-T-ATT-TT---TCT---TA-TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAATCGCAACAAGTAT-A--A---G----A-AA--C---AAACAA--G-G--ATT-AA-----AC-------A-TG--CAC-A-A-GAATT-CAA-GAGCAA--T-A--------A-ACCTT-AG-AG-T-CCAGAT--TTCACA
gi|73716                      : acTAGGGA----TGGCAA--TCGA-A-TACA---GAAT-----TG-C-CAAT-CG-GTT------AACC--GCAACA--C-GTTCC-GA-T--CG-ATTAACC-GGTA----AAT----C-ATATC-AA---A------A-TA-T---ATA-C---A--T------TTT--G-AGACA-TAG--------TTGAT-T-G-CT-TCA--AT-TT-TCC-----ATTTTT-T---TC-T-GTTTATA-TG------C-ACA--AA-TAT-ACCA----TA-CA--ACACT--C-C-TG-TAA-T-ATT-CTTAATGTTG-CGCTG-TTA-AA-TTAGAATA--A-TAAGTGCAATATGTGT-G--A---G----A-AAACA---AAGAAA--G-G--ATT-AA-----AC-------A-TG--CAC-A-A-AACTT-AAA-GAGAAA--A-A--------A-ATTCC-AA-AG-T-CTAGAT--TTCACA
gi|73726                      : atTAGGGA----TGACAA--TCGA-A-TACA---GAAT-----TG-C-TAAT-TG-GTT------AACC--GCAACA--T-GTTCC-AA-C--CA-ATTAACC-GGTT----AAT----C-GTAGC-AA---A------A-TA-T---GTA-C---A--T------TTT--G-AGACA-TAATTGATCATTTGAT-G-G-CT-TCA--AT-TT-TCT--C-AAGTTTT-C---TC-T-GTTTATA-TGT---G-C-AAA--AA-TAC-A--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT---ACTTC-TGATA-TTG-AA-ATAG-ACC--A-T--ATGCAATAAGTGT-G--A---G------AAACA---AAAAAA--G-G--ATT-AA-----AC-------A-TGCACAC-A-A-GACTTGTAA-GAGAAA--T----------A-ATCCC-AA-AG-T-CCAGAT--TTCACA
gi|73727                      :   TAGGGA----TGGCAA--TCGA-A-TACA---GAAT-----TG-AACATT-CG-GTT------AACC--GCAAGA--C-GTTCC-GA-C--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-GTATC-AA---A------A-TA-AAT-ATA-C---A--G------TTT--G-AGATA-T-G--------TTGAG-G-A-CT-TCA--A--TT-TCT--C-AAGTTTT-C---TC-T-GTTTATA-TGC---A-A-AAA--AA-TAC-A--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT---------TA-TG-TTG-AA-TTAAAACAATA-TAAATGTAATAAGTGT-G--A---G----A-AAACG---AAGAAA--G-G--ATT-AA-----AA-------A-TG----------------------------T-G--------A-ATCCCAAA-AG-T-CCAGAT--TTCACA
gi|73717                      :   TAGGGA----TGGCAAA-TCGA-A-TACA---GAAT-----TG-C-CAAT-CC-GTA------AC-C--GCACAA--C-GTTCC-GA-C--CG-ATTAACC-G-TT----AAT----C-GTATC-AA---A------A-TA-T---ATA-C---C--T------TTG--GGAAATAATAG--------TCAATAG-G-CT-TCA--AT-TT-CTC--G-AGCTTTT-CC--TC-T-ATTTATA-TGC---AGC-AAAGAAA-TATCA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-A-ATT-CT---TCAT--TA-TG-TTG-AA-TAGAAACA--A-T-AATGCAATAAGTGT-T--A---T----A-AAATCG--AAGAAA--G-G--ATTAAA-----AT-------A-TG--CAA-AGA-GACTT-CAA-GAGAAA--T-A--------A---TAC-AA-AG-T-C
gi|73728                      : atTAGGGA----TGGTAA--TCAA-A-TACG---GAAT-----TG-C-CAAT-CG-GTT------AACC--GTAACA--C-GATCC-GC-C--CG-ATGAACC-GGTT----AAT----C-GTTTC-AA---A------A-TA-T---ATA-C---A--T------TTT--G-AGACA-TAG--------TTGAT-G-G-CT-TCA--AT-TTGTC-----AAGTTTT-C---TC-T-GTTTATA-CGC---C-C-AAA--AA-TGC-A--A----TA-CA--ACACC--C-C-AG-TAtcagaattaca
gi|73729                      :   TAGGGA----TGGCAA--TCGA-A-TACA---GAAT-----TG-C-CAAT-CG-GTT------AACC--GCAACA--C-GTTCC-GA-C--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-GTATC------A------A-TT-T---ATA-C---ATCT------TTT--G-AGACA-TAG--------
gi|73722                      :   TAGGGA----TGGCAA--TCGA-A-TACA---GA
gi|73720                      :  tTAGGGA----TAGCAA--TCGA-A-TACA---GATT-----TA-C-CAAT-CG-GTT------AACC--GCAAGA--C-GTTCC-GA-C--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-GTATC-AA---A------taaaccggttaatcgtatcaaaatacatgcatatatagtttgggacatagttgatggcttcaatttttcaggctttttcagagtatacacaatactctagtaatatcctttttgtgttaatgcaataattgtgagttataaagaagaaaggataaaatatgctcaagatttcaagaaaaataacatc
gi|73723                      : acTAGGGACATATGGTAA--TCGA-A-TACT---GAAT-----TG-C-CAAT-CA-GTC------A-ACT-GCAACA--C-GTTCC-GA-C--CG-ATTAACC-GATT----AAT----C-ATATC-AA---A------A-TA-A---TTA-C---A--T------ATG--T-ATATA-TAG--------T
gi|73721                      :  tTATGGA----TGGCAA--TCGA-A-TACA---GAAT-----TA-C-CAAT-CC-GTT------AACC--GCACGA--T-GTTCC-CA-C--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-GTATC-AA---A------A-TA-
gi|73724                      : atTAGGAA----AGGCAA--TCAG-T-TACA---CAAT-----AG-C-TAAC-AG-GTT------AACC--ACAAAA--T-GTTCT-GA-C--CA-ATTAACC-GGTT----CAC----T-CCATC-AATACA------A-TA-T---ATA-C------T------TTT--t
gi|73730                      :   tAGGGA----TGGCAA--TCGA-A-TACA---GAAT-----TGGC-CAAT-TGCGTT------ATACC-GCAAGA--C-GTTTC-GA-C--CG-ATTAACCTGTTT----AAT----C-GTATC-AA---A------ATTA-AT--ATA-C---A--T------TGTGGA-GAAAA-CAG--------ATGAT-GCA-CT-TCAATAT-CT-TCT--C-AAAGTTT-C---TC-A-GTTTTAA-TGC---A-CAACAAGAA-CAC-G--A----TG-GC--ACACT--CGC-AG-TAA-T--TA-CT---TCTTC-TA-CGTTTT-AA-TTTAACTA--A-GTAATGCCATGAGT----------G----G-GAACCAAGAAGAAA--G-GTAATT-AA-----AT-------ATTGCCCAC-A-ATGACTT-CAATGAGAAAT-T-A--------T-ATTCC-AACAG-T--CAGAT--TCGACAg
gi|73731                      :     GGGA----TGGCAA--TCGA-A-TACA---GAAT-----TG-C-CAAT-CA-ATT------GTTC--GCAACA--C-GTTCC-GA-A--CG-ATTAACC-AGTT----AAT----C-GTATC-AA---A------A-TA-T---TTA-C---A--T------TTT--G-AGAAA-TAG--------ATGAT-G-G-CT-TCA--AT-TT--CT--A-TAGTTTT-C---TC-T-GTTTACA-TGC---A-C-AAA--AA-TAC-AACA----TG-CA--ATACG--C-C-AA-TGA-T-ATT-CT---TCT---TG-TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TGAATACAATAAGTAT-G--A---G----A-AAACA---AAGAAA--G-G--ATT-AA-----AC-------A-TA--CAC-A-G-TAATC-CAA-GAGAAA--T-A--------A-TTCCC-AA-AG-T-CCAGAT--TTCACA
gi|73732                      :     GGAA----TGGCGAATTCGATA-AATACAAGAATAATGGCG-A-CAATGCG-GTTGAATTAATACCGGCAACAGACAGTTTCCGA-C--CGTATTAACC-GGTT----AATTGATC-GTATC-AA---A------AATA-A---ATT-C---A--T------TT-------------G--------TTGAG-G-A-CTATCA--TT-TA-TCTTCA-AAGTTTT-C---TC-TAGTTTATA-AAT---AGC-ACA--AA-TAC-A--A----TG-CATAACACT--C-C-AGGTAAAT-ATT-CT---ATAAA-TA-GA-TTG-AAGTTAAAAAAT-A-TAAATGTAATAAGTGT-G------G----A-AAACG---AAGAGA--A-G--ATT-AA-----
gi|73718                      :      GGA----TGGCAA--TCGA-ATTACAT--GAAT-----TG-C-CATT-CG-GTTA-----ACCC--GCAAaatgtaaataaagtcccaatttcaca
gi|73719                      :  attaGGA----TGGCAA--TCGA-A-T-CA---GAAT------G-C-CAAT-CG--TT------AACC--GCAACA--C-ATTCC-GAACA-CG-ATTAATC-GGTT----AAT----C-ATATCAAA---A------A-TATA---TTA-C---C--T------TTG--G-AG----CAG--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATAAC-TC------AGGTTT-C---TC-T-G----------------------AA-TAC-A--G----TG-CA--ATGCTGGCGC-AG-TAA-T-ATT-CT------------TG-ATG--A-T--------------ATGCAATAAGTGT-G--AATGG----A-AAACA---AAGAAA--G-G--ATA-AAAAATGCTTTAAAAAA-TG--CTT-A-A-GACTT-CAA-GGAAAAATT-AAGTAACCCA-ATTTC-AA-GG-T-CCAGATCGTTCACggcataattcatatcatcttggaggacttagttgaggggcttcaactttctgcaagtttttctcatgtttatactgcacaaaaatacaatggcaacactcccagtaatattctttttatgttgaattagaacaactaaatgcaataagtgtggagaaaacaaagaaagggttaaacatgcacaaagaattcagagaaataaatccaaaagttccagattcaca
gi|73737                      :            atttaAA--CCGA-T-TACA---GATT-----TT-G-CAAC-TG-ATT------AT--------CA--CTGTTCC-GA-C--CG-AGTAACC-GGTT----AAC----C-G-ATT-AA---A------A-
gi|73734                      :                 AA--CCGA-T-TACG---GAAT-----TT-G-CAAC-CG-ATT------AC--------CA--CTGTTCC-GA-C--CG-AGTAATC-GGTT----AAC----C-G-ATT-AA---A------A-
gi|73736                      :                 AA--CCGA-T-TACG---GAAT-----AA-G-CAAC-CG-ATT------AC--------CA--CTGTTCC-GA-C--CG-AGTAACC-GGTT----AAC----C-G-ATT-AA---A------A-
gi|73733                      :                 AA--CCGA-T-TACG---GATT-----TT-G-CAAC-CG-ATT------AC--------CA--CTGTTCC-GA-C--CG-AGTAACC-GGTT----AAC----C-G-ATT-AA---A------A-
gi|73735                      :                 AA--CCGA-T-TATG---GATT-----TT-C-CAAC-CG-ATT------AT--------CA--CTGTTCG-GA-C--CG-AGTAACC-GGTT----AAT----C-G-ATT-AA---A------A-
gi|73739                      :                                     AT-----TG-C-CAAT-CG-GTT------AATC--GCAACA--C-GTTCC-GT-C--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-GCATC-AC---A------A-TA-T---ATA-C---A--T------TTT----AGACA-TAG--------TTGAT-G-G-CT-TCA--AT-TTCTCT-----AGTTTT-T---TC-T-GTTTATA-TGC---A-C-GAA--AA-TGC-AACA----TG-CA--ACACT--C-C-AA-TAA-T-ATT-TT---TCTTA-TG-T--TT-------------------AATGCAATAAGTGT-G--A---G----A-AAACA---AAAAAA--G-G--ATT-AA-----AC-------A-TG--CAC-T-A-GAAAT-CAA-GAGAAA--T-A--------A-ATCCA-AA-AG-T-TCACAT--TTCACA
gi|73741                      :                                                                     C--GCAACA--C-GTTCC-GA-C--CG-ATTAACC-GTTTTTAAAAT----C-GTATC-AA---A------A-TA-T---ATA-C---A--T------GTT--G-CGACA-TAG--------TTGAT-G-G-CT-TCC--AT-TT--CT--C-AAGTTTT-C---TC-T-GCTTACA-TGCTCAA-A-AAA--AA-TAA-A--AAATATG-CA--ACACT--C-A-AG-TAA-T-----CT---TCTTT-TA-TG-ATG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAAGTGT-G--A---G----A-AAACG---AAGAAA--G-G--ATA-AA-----AC-------A-TG--CAC-G-A-GACTT-GAA-GAGAAA--T-A--------A-ATTCC-AA-TG-T-CGAAAT--TT
gi|73726                      :                                                                        aacACA--T-ATTTT-G--CTACG-ATTAACC-GGTT----AAT----T-G
gi|73738                      :                      tagggatgacaatcgaatacagaattgctaattggttaaccgcaacatgttccaac--C-GTTCC-GA-C--CG-ATCTGCC-GGTT----AAT----C-GTATA-AA---A------A-T--A---ATA-T---A--C------CTT--G-CGACA-T-G--------TTAAT-G-G-CT-TTC--AT-TT-TGT--C-AAG--TT-C---TG-T-TTCTGGA--AC---A-T-AAA--AA-GAC-A--A----T--CA--ACACA--C-C-AG-AAA-TAATTACA---TGTT--TA-TG-TTATAC-TTAGAAC--------------TAAGGAT-G--A---G----AGAAACG---ACGAAA--G-GC-ATG-AA-----TC-------A-TG--CGC-A-acattttgagacataattgatcatttgatggcttcaattttctcaagttttctctgtttatatgtgcaaaaatacaatgcaacactccagtaatattctacttctgatattgaaatagaccatatgcaataagtgtgagaaacaaaaaaaggattaaacatgcacacaagacttgtaagagaaataatcccaaagtccagatttcaca
gi|73715                      :                                                     caaaatttcaatcaacggctaattgaaaatTTTT-GA-TA-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-G
gi|73731                      :                         actagggatggcaatcgaatacagaattgccaatcagttaaccggaacacgttccgacTTTT-GA-TA-CG-ATTAACT-GGTT----AAT----C-GTtatatattttgaattatagttgatggcttaaatttctttaagttttctctgtttatatgcacaaaaaatacaatgcaacacaccagtaatatttttcttatgttgaattagaacaataatcgcaacaagtataagaaacaaacaaggattaaacatgcacaagaattcaagagcaataaaccttagagtccagatttcaca
gi|73727                      :                              gggatggcaatcgaatacagaattgccaatcaattgttcgcaacacgttccgaTTTT-GA-TA-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-Gtatttacattttgagaaatagatgatggcttcaatttctatagttttctctgtttacatgcacaaaaatacaacatgcaatacgccaatgatattcttcttgtgttgaattagaacaatgaatacaataagtatgagaaaacaaagaaaggattaaacatacacagtaatccaagagaaataattcccaaagtccagatttcaca
gi|73719                      :                          tagggatggcaatcgaatacagaattgaacattcggttaaccgcaagacgttccgacTTTT-GA-TA-TG-ATTAACC-GATT----AAT----C-GTGTtaaatatacagtttgagatatgttgaggacttcaatttctcaagttttctctgtttatatgcaaaaaaatacaatgcaacactccagtaatattcttatgttgaattaaaacaatataaatgtaataagtgtgagaaaacgaagaaaggattaaaaatgtgaatcccaaaagtccagatttcaca
gi|73722                      :                             atttaggatggcaatcgaatcagaatgccaatcgttaaccgcaacacattccgaTTTT-GA-TA-CG-ATTAACC-GGTT----TAT----CTGTATatatattacctttggagcagttgatggcttcaataactcaggtttctctgaatacagtgcaatgctggcgcagtaatattcttgatgatatgcaataagtgtgaatggaaaacaaagaaaggataaaaaatgctttaaaaaatgcttaagacttcaaggaaaaattaagtaacccaatttcaaggtccagatcgttcac
gi|73721                      :                                                                  ttagggatggcaatcgaTTTT-GA-TA-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-Gtacatgcatatatagtttgggacatagttgatggcttcaatttttcaggctttttcagagtatacacaatactctagtaatatcctttttgtgttaatgcaataattgtgagttataaagaagaaaggataaaatatgctcaagatttcaagaaaaataacatc
gi|73735                      :                         attatggatggcaatcgaatacagaattaccaatccgttaaccgcacgatgttcccacTTTT-AA-T--CG-ATTAACC-GGTT----ACT----C-Gtat
gi|73732                      :                                             aaccgattatggattttccaaccgattatcactgttcggacC-GA-T--CA-ATTAACC-GGTT----AAT----
gi|73722                      :        ggaatggcgaattcgataaatacaagaataatggcgacaatgcggttgaattaataccggcaacagacagtttccgaccgtA-C--AG-ATAAACC-GGTT----AAT----C-GTATC-AA---A------A-TA-C---ATG-C---A--TATATAGTTT--G-GGACA-TAG--------TTGAT-G-G-CT-TCA--AT-TT-T-T--C-AGGCTTT-T---TC-A-G----------------------AG-TAT----A----CA-CA--ATACT--C-T-AG-TAA-T-ATC-CT---TTTTG-TG-T--T--------------------AATGCAATAATTGT-G--A---GTTATA-AAG-----AAGAAA--G-G--ATA-AA-----AT-------A-TG--CTC-A-A-GATTT-CAA-GAAAAA--T-A--------ACATCtatcaaaaataaattcatttgttgaggactatcatttatcttcaaagttttctctagtttataaatagcacaaatacaatgcataacactccaggtaaatattctataaatagattgaagttaaaaaatataaatgtaataagtgtggaaaacgaagagaagattaaaatgtaaataaagtcccaatttcaca
gi|73740                      :                                                                      ttagggatggcaatcgaatA-C--CG-ATTAACC---TT----AAT----A-GTATC-AA---A------A-TA-A---ACA-C---A--A------TTTGAA-ACATATTAG--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A--TT-TCT--C-AAGTTTT-C---T
gi|73739                      :                                                                       ttgcaactcggctaaaaaact--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-G
gi|73729                      :                                                           attgccaatcggttaatcgcaacacgttccgtc--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-Gcatcacaatatatacattttagacatagttgatggcttcaatttctctagttttttctgtttatatgcacgaaaatgcaacatgcaacactccaataatatttttcttatgtttaatgcaataagtgtgagaaaacaaaaaaaggattaaacatgcactagaaatcaagagaaataaatccaaaagttcacatttcaca
gi|73720                      :                                    tagggatggcaatcgaatacagaattgccaatcggttaaccgcaacacgttccgac--CG-ATTAACC-GGTT----AAT----C-Gtatcaatttatacatcttttgagacatag
gi|73742                      :                                  actagggatagcaatcgaatacagatttaccaatcggttaaccgcaagacgttccgac--CG-ATTAACC-GGTT----AGT----C-GTATC-AA---ATT----A-CA-T---ATA-C---A--T------TTT--G-AGATA-TAG--------TCGAT-G-G-CT-TCA--AT-TT-CTT--T-AAGTTTtatcaaa
gi|73742                      :                                                                                            --CG-ACTAACC-GGTT----AAT----C-Gcttaaagtaattaaacatgcacaaaaatcaa
gi|73743                      :                                                                                                  TTAACC-GGTT----AGT----C-GTATC-AA---ATTATATA-TA-T---ATA-C---A--T------TTT--G-AAACA-TAG--------TCAAT-G-G-CT-TCA--AT-TT-tatcaaattacatatacattttgagatatagtcgatggcttcaatttctttaagtttcttaaagtaattaaacatgcacaaaaatcaa
gi|73718                      :                                                                                                       C-GGTT----AAC----CCG---C-AA---GGC----A-TA-ATTCATATC---A--T------CTTGGA-GGACT-TAG--------TTGAG-G-GGCT-TCA--AC-TT-TCT--GCAAGTTTTTC---TCAT-GTTTATACTGC---A-C-AAA--AA-TAC-A--A----TGGCA--ACACT--C-CCAG-TAA-T-ATT-CT---TTT---TA-TG-TTG-AA-TTAGAACA--ACTAAATGCAATAAGTGTGG--A---G----A-AAACA---AAGAAA--G-G--GTT-AA-----AC-------A-TG--CACAA-A-GAATT-C-A-GAGAAA--T-A--------A-ATCCA-AA-AGTT-CCAGA---TTCACAattcaatt
gi|73744                      :                                                                                                            attaggatggcaatcgaattacatgaattgccattA-A---ATA-CCACA--T------TTTC-G-AAACA-TCG--------TTGTA-G-G-CT-TCC--AT-TT--CT--C-AAGTTTT-CCTCTC-T-GTTCATA-TGC---A-C-AAA--AAATAG-A--A----AG-CA---CACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT---TGTTACTG--G-T---AA-TTA-AAT---A-CAAAT--AATAA-TAT-GTTA---GA---A-AAACA---AAGAAAAGG-A--ATT-AG-----AT-------A-TG--CAC-G-A-
gi|73745                      :                                                                                                                                                                                                        -CT-TCA--AT-TT--CT--C-AAGTTTT-C---TC-T-GTT--------------------AA-TAC-A--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ACT-TT---TTTT
gi|73746                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TG-AA-TTAGAACA--A-GAAATGCAATAAGTGT-G--A---G----A-AAACG---AATAAA--G-G--ATT-AA-----AT-------A-TG--CAC-A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--T-A--------A-ATCCC-AA-AG-T-CCAGAT--TT
gi|73747                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cctcttgttttaatta---AAGAAA--G-G--ATA-AA-----CC-------A-TG--CAC-G-A-GACTT-CAG-GAGAAA--T-AAATT----A-ATCCC-TA-AG-T-CCAGAT--TCC
gi|73748                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAA--GTA--ATT-AA-----AC-------A-TG--CAC-A-A-AAATC--AA-GAGCAA--TTA--------A-ATCCC-AA-AG-TAGCAGAT--TTC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1111                                                                                                                                   11111111                               
lowQualScore                  :                          4444      44    222 1    1 3333    1  33    1 222 1   66666666 22 1     333  22      1 1  1       1    2222   2222  0   1  222 555555 1 44 3 1    22 444444 1  1 22  1   333  333 66666666    1 1 1   1   22 5  4  1 22   1    22 333  6666 2    22   44 2 22 777 2 2   22  2  2  55 4444 2   22     55 4   2   2 2   2  2 6666 4 66 333  2  66  2   0   9999999          2    2  333 8888   2 3      22 2 44   2     2  9999999999999  44 2 2  2  2   2      77  22222222 2     2  2  2 2 2     33      
lowQualScore                  :                          ....      ..    ... .    . ....    .  ..    . ... .   ........ .. .     ...  ..      . .  .       .    ....   ....  .   .  ... ...... . .. . .    .. ...... .  . ..  .   ...  ... ........    . . .   .   .. .  .  . ..   .    .. ...  .... .    ..   .. . .. ... . .   ..  .  .  .. .... .   ..     .. .   .   . .   .  . .... . .. ...  .  ..  .   .   .......          .    .  ... ....   . .      .. . ..   .     .  .............  .. . .  .  .   .      ..  ........ .     .  .  . . .     ..      
lowQualScore                  :                          5555      00    999 7    6 4444    5  77    5 777 5   99999999 55 4     666  11      4 4  4       3    8888   8888  2   3  333 555555 3 44 2 7    33 888888 7  7 33  7   000  000 33333333    9 9 9   8   55 0  3  8 55   9    66 333  2222 0    88   88 0 88 000 0 0   88  0  0  55 2222 1   99     00 2   1   2 2   1  1 9999 2 11 999  2  00  2   5   5555555          2    2  999 0000   2 2      88 0 88   0     0  2222222222222  88 0 1  0  2   2      55  88888888 2     4  4  4 4 4     22      
consensus                     :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTT--------A-ACCGCAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-G--AG-ACA---TA---G--------TTGA-T-G-GCT-TCA--ATTTTCT-C--AAG-TTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----T-GCA--ACACT--C-CAG-TAA-T-ATT-CT-T--CTT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGT-GA---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
Reference ( family-489 )      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTT--------A-NCCGCAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ANA-TACA--T------T-TT-G--AG-ACA---TA---G--------TTGA-T-G-GCT-TCA--ATTTTCT-C--AAG-TTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----T-GCA--ACACT--C-CAG-TAA-T-ATT-CT-T--CTT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGT-GA---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73714                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTT--------A-ACCGCAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-TGTT----AAT----CGTATT-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-G--AA-ACA---TG---G--------TTGA-T-G-GCT-TCA--ATTTCTT-T--AAG-ATTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---G-C-AAA--AA-TA-CA--A----T-GCA--ACACT--C-CAG-TAA-T-ATT-CT-T--C-T-T--A---TG-TTA-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGT-AA---G----AAA-C-AAACAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------GC--A-A-GAATT-CAA-GAGCAA--AA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73715                      :                  acTAGGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----AATT-GC--CAAT-C---A-GTT--------A-ACCGGAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-T--A--T------T-TT-G--AA-TTA---TA---G--------TTGA-T-G-GCT-TAA--ATTTCTT-T--AAG-TTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-CAAAA--AA-TA-CA--A----T-GCA--ACACA--C-CAG-TAA-T-ATT-TT-T--C-T-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAATCGCAACAA-GTAT-AA---G----AAA-C-AAACAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GAATT-CAA-GAGCAA--TA--------A-ACCTT-AG-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73716                      :                  acTAGGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTT--------A-ACCGCAACA--CG--TTCCGA-T-CG-ATTAACC-GGTA----AAT----CATATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-G--AG-ACA---TA---G--------TTGA-T-T-GCT-TCA--ATTTTCC-----AT-TTTT--T---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--TA-TA-CC--A----T-ACA--ACACT--C-CTG-TAA-T-ATT-CT-TAATGT-T--GCGCTG-TTA-AA-TTAGAATA--A-TAAGTGCAATAT-GTGT-GA---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-AACTT-AAA-GAGAAA--AA--------A-ATTCC-AA-AG-T-C-TAGAT--TTCACA
gi|73717                      :                  atTAGGGA----TGGCAAA-TCGA---A-TACA-G----AATT-GC--CAAT-C---C-GT---------A-ACCGCACAA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-G-TT----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TAC---C------T-TT-G--GG-AAA---TAATAG--------TCAA-TAG-GCT-TCA--ATTT-CT-C--GAG-CTTTTCC---TC----T-ATTT--ATA--T-G--C---AGC-AAAGAAA-TATCA--A----T-GCA--ACACT--C-CAG-TAA-A-ATT-CT-T--CAT-T--A---TG-TTG-AA-TAGAAACA--A-T-AATGCAATAA-GTGT-TA---T--A-AAATCGAAGAAA--G-G--ATTAAAATA-TG--C----------AA--AGA-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A---TAC-AA-AG-T-CTCAGAA--TT-ACA
gi|73718                      :                     atGGA----TGGCAA--TCGA---ATTACATG----AATT-GC--CATT-C---G-GTTA-------A-CCCGCAAGG--CA--T---------A-AT----------------T----CATATC-A--------------------------T------C-TT-GGAGG-ACT---TA---G--------TTGAGG-G-GCT-TCA--ACTTTCTGC--AAGTTTTT--C---TCA---T-GTTT--ATAC-T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TGGCA--ACACTC-C-CAG-TAA-T-ATT-CT-T---TT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--ACTAAATGCAATAA-GTGTGGA---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--GTT-AAACA-TG--C----------ACA-A-A-GAATT-C-A-GAGAAA--TA--------A-ATCCA-AA-AGTT-C-CAGA---TTCACA
gi|73719                      :                   attaGGA----TGGCAA--TCGA---A-T-CA-G----AAT--GC--CAAT-C---G--TT--------A-ACCGCAACA--CA--TTCCGAACACG-ATTAATC-GGTT----AAT----CATATCAAA---A------A-T--ATATTACC--T------T-TG-G--AG-------CA---G--------TTGA-T-G-GCT-TCA--A-TAACT-C--AGG--TTT--C---TC----T-G----------------------------AA-TA-CA--G----T-GCA--ATGCTGGCGCAG-TAA-T-A----T-T--CTT-G--A---TG------A-T--------------ATGCAATAA-GTGT-GAATGG--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATA-AAAAA-TG--CTTTAAAAAATGCTTA-A-GACTT-CAA-GGAAAAATTAAGTAACCCA-ATTTC-AA-GG-T-C-CAGATCGTTCAC
gi|73720                      :               atttaTAGGGA----TAGCAA--TCGA---A-TACA-G----ATTT-AC--CAAT-C---G-GTT--------A-ACCGCAAGA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----CGTATC-AA---A------
gi|73721                      :                  acTATGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----AATT-AC--CAAT-C---C-GTT--------A-ACCGCACGA--TG--TTCCCA-C-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--A
gi|73722                      :                  atTAGGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----A--T-A----AAC-C---G-GTT--------A-ATCGTATCA--t
gi|73722                      :                                                                                                             tA-C-AG-ATAAACC-GGTT----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ACA-TGCA--TATATAGT-TT-G--GG-ACA---TA---G--------TTGA-T-G-GCT-TCA--ATTTT-T-C--AGG-CTTT--T---TC----A-G------------------------AG--TA-TA-CA----------CA--ATACT--C-TAG-TAA-T-ATC-CT-T---TT-T--G---TG-TT-------------------AATGCAATAA-TTGT-GA---GTTA-TAA-AGAAGAAA--G-G--ATA-AAATA-TG--C----------TC--A-A-GATTT-CAA-GAAAAA--TA--------ACATCaaatacatgcatatatagtttgggacatagttgatggcttcaatttttcaggctttttcagagtatacacaatactctagtaatatcctttttgtgttaatgcaataattgtgagttataaagaagaaaggataaaatatgctcaagatttcaagaaaaataacatc
gi|73723                      : ttagggatggcaatcgaatTAGGGACATATGGTAA--TCGA---A-TACT-G----AATT-GC--CAAT-C---A-GTC--------A-ACTGCAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GATT----AAT----CATATC-AA---A------A-T--AAT-TACA--T------A-TG-T--AT-ATA---TA---G--------T
gi|73724                      :                   tTAGGAA----AGGCAA--TCAG---T-TACA-C----AATA-GC--TAAC-A---G-GTT--------A-ACCACAAAA--TG--TTCTGA-C-CA-ATTAACC-GGTT----CAC----TCCATC-AATACA------A-T--ATA-TAC---T------T-TT-G--
gi|73725                      :                   tTAGGGA----TGGCAA--TCGA---A-AACA-G----AATT-GC--CAAT-T---G-GTT--------A-CACGCAACA--CG--TTTCGA-C-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--AAA-TACA--T------T-TT-A--AG-ATA---TA---G--------TTGA-T-G-ACT-TCA--ATTTTCT-G--AAG-TTTT--C---TC----T-GTCT--ATA--T-G--C---A-C-ACA--AA-TA-TA--A----T-GCA--ACACT--C-CAG-TAA-T-ATT-CT-T--CTTGT--G---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAACAA-GTAT-GA---G--A-AAA-CCAAGAAA--G-G--ATT-AACCA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-TAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CATAT--TTCACA
gi|73726                      :                    TAGGGA----TGACAA--TCGA---A-TACA-G----AATT-GC--TAAT-T---G-GTT--------A-ACCGCAACA--TG--TTCCAA-C-CA-ATTAACC-GGTT----AAT----CGTAGC-AA---A------A-T--ATG-TACA--T------T-TT-G--AG-ACA---TA---ATTGATCATTTGA-T-G-GCT-TCA--ATTTTCT-C--AAG-TTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--T---G-C-AAA--AA-TA-CA--A----T-GCA--ACACT--C-CAG-TAA-T-ATT-CT-A--CTT-CTGA---TA-TTG-AA-ATAG-ACC--A-T--ATGCAATAA-GTGT-GA---G----AAA-CAAAAAAA--G-G--ATT-AAACA-TGCAC----------AC--A-A-GACTTGTAA-GAGAAA--T---------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73727                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----AATT-GAA-CATT-C---G-GTT--------A-ACCGCAAGA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----CGTATC-AA---A------A-TAAATA-TACA--G------T-TT-G--AG-ATA---T----G--------TTGA-G-G-ACT-TCA--A-TTTCT-C--AAG-TTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-A-AAA--AA-TA-CA--A----T-GCA--ACACT--C-CAG-TAA-T-ATT-C-------T-T--A---TG-TTG-AA-TTAAAACAATA-TAAATGTAATAA-GTGT-GA---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAAAA-TG---------------------------------------TG--------A-ATCCCAAA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73728                      :                    TAGGGA----TGGTAA--TCAA---A-TACG-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTT--------A-ACCGTAACA--CG--ATCCGC-C-CG-ATGAACC-GGTT----AAT----CGTTTC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-G--AG-ACA---TA---G--------TTGA-T-G-GCT-TCA--A-TTTGT-C--AAG-TTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--C-G--C---C-C-AAA--AA-TG-CA--A----T-ACA--ACACC--C-CAG-TA
gi|73729                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTT--------A-ACCGCAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----CGTATC------A------A-T--TTA-TACATCT------T-TT-G--AG-ACA---TA---G--------
gi|73730                      :                     AGGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----AATTGGC--CAAT-T---GCGTT--------ATACCGCAAGA--CG--TTTCGA-C-CG-ATTAACCTGTTT----AAT----CGTATC-AA---A------A-TTAATA-TACA--T------TGTG-G--AGAAAA---CA---G--------ATGA-T-GCACT-TCAATATCTTCT-C--AAA-GTTT--C---TC----A-GTTT--TAA--T-G--CACAA-C-AAG--AA-CA-CG--A----T-GGC--ACACT--CGCAG-TAA-T--TA-CT-T--CTTCT--A---CGTTTT-AA-TTTAACTA--A-GTAATGCCATGA-GTGG-GA---A--C-CAA--GAAGAAA--G-GTAATT-AAATATTGCCC----------AC--A-ATGACTT-CAATGAGAAAT-TA--------T-ATTCC-AACAG-T---CAGAT--TCGACA
gi|73731                      :                      GGGA----TGGCAA--TCGA---A-TACA-G----AATT-GC--CAAT-C---A-ATT--------G-TTCGCAACA--CG--TTCCGA-A-CG-ATTAACC-AGTT----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATT-TACA--T------T-TT-G--AG-AAA---TA---G--------ATGA-T-G-GCT-TCA--A-TTTCT-A--TAG-TTTT--C---TC----T-GTTT--ACA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CAACA----T-GCA--ATACG--C-CAA-TGA-T-ATT-CT-T--C-T-T--G---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TGAATACAATAA-GTAT-GA---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TA--C----------AC--A-G-TAATC-CAA-GAGAAA--TA--------A-TTCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73732                      :                      GGAA----TGGCGAATTCGATAAA-TACA-AGAATAATG-GCGACAATGC---G-GTTGAATTAATA-CCGGCAACAGACAGTTTCCGA-C-CGTATTAACC-GGTT----AATTGATCGTATC-AA---A------AAT--AAA-TTCA--T------T-T-------------------G--------TTGA-G-G-ACTATCA--TTTATCT-TCAAAG-TTTT--C---TC----TAGTTT--ATAAATAG--C---A-C-AAA-----TA-CA--A----T-GCATAACACT--C-CAGGTAAAT-ATT-CTAT--AAA-T--A---GA-TTG-AAGTTAAAAAAT-A-TAAATGTAATAA-GTGT-G----G--A-AAA-CGAAGAGA--A-G--ATT-AAA-A-TG---------------------------------------TA--------A-AT----AA-AG-T-C-CCAAT--TTCACA
gi|73733                      :                                  AA--CCGA---T-TACG-G----ATTT-TG--CAAC-C---G-ATT--------A-CC----AC---TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGTT----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73734                      :                                  AA--CCGA---T-TACG-G----AATT-TG--CAAC-C---G-ATT--------A-CC----AC---TG--TTCCGA-C-CG-AGTAATC-GGTT----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73735                      :                                  AA--CCGA---T-TATG-G----ATTT-TC--CAAC-C---G-ATT--------A-TC----AC---TG--TTCGGA-C-CG-AGTAACC-GGTT----AAT----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73736                      :                                  AA--CCGA---T-TACG-G----AATA-AG--CAAC-C---G-ATT--------A-CC----AC---TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGTT----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73737                      :                                  AA--CCGA---T-TACA-G----ATTT-TG--CAAC-T---G-ATT--------A-TC----AC---TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGTT----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73738                      :                                                 CA-A----AATT--T--CAAT-CAACG-GCT--------A-ATTGAAAAT--CG--TTCCGA-C-CG-ATCTGCC-GGTT----AAT----CGTATA-AA---A------A-T--A-A-TATA--C------C-TT-G--CG-ACA---T----G--------TTAA-T-G-GCT-TTC--ATTTTGT-C--AAG-T---------TC----T-GTTT--CTG----GAAC---A-T-AAA--AA-GA-CA--A----T--CA--ACACA--C-CAG-AAA-TAATTACA-T--GTT-T--A---TG-TTATAC-TTAGAAC--------------TAA-GGAT-GA---G--AGAAA-CGACGAAA--G-GC-ATG-AATCA-TG--C----------GC--A-
gi|73739                      :                                                          ATT-GC--CAAT-C---G-GTT--------A-ATCGCAACA--CG--TTCCGT-C-CG-ATTAACC-GGTT----AAT----CGCATC-AC---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT----AG-ACA---TA---G--------TTGA-T-G-GCT-TCA--A-TTTCT-C--TAG-TTTT--T---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-GAA--AA-TG-CAACA----T-GCA--ACACT--C-CAA-TAA-T-ATT-TT-T--C-T-T--A---TG-TT-----T-------------AATGCAATAA-GTGT-GA---G--A-AAA-CAAAAAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--T-A-GAAAT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCA-AA-AG-T-T-CACAT--TTCACA
gi|73740                      :                                                                                                              A-C-CG-ATTAACC---TT----AAT----AGTATC-AA---A------A-T--AAA-CACA--A------T-TT-G--AA-ACATATTA---G--------TTGA-T-G-GCT-TCA--A-TTTCT-C--AAG-TTTT--C---T
gi|73741                      :                                                           ttgcaactcggctaaaaaact--------A-ACCGCAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GTTTTTAAAAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------G-TT-G--CG-ACA---TA---G--------TTGA-T-G-GCT-TCC--ATTT-CT-C--AAG-TTTT--C---TC----T-GCTT--ACA--T-G--CTCAA-A-AAA--AA-TA-AA--AAATAT-GCA--ACACT--C-AAG-TAA-T-CTT-CT-T----T-T--A---TG-ATG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGT-GA---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATA-AAACA-TG--C----------AC--G-A-GACTT-GAA-GAGAAA--TA--------A-ATTCC-AA-TG-T-C-GAAAT--TT
gi|73742                      :                                                                                                                 -CG-ATTAACC-GGTT----AGT----CGTATC-AA---ATT----A-C--ATA-TACA--T------T-TT-G--AG-ATA---TA---G--------TCGA-T-G-GCT-TCA--ATTTCTT-T--AAG--TTT--C---TTAAAGT-AATTAAACA--T-G--C---A-C-AAA--AA-T--CA--A----
gi|73743                      :                                                                                                                      TTAACC-GGTT----AGT----CGTATC-AA---ATTATATA-T--ATA-TACA--T------T-TT-G--AA-ACA---TA---G--------TCAA-T-G-GCT-TCA--ATTTATT-C--AA
gi|73744                      :                                                                                                                                                    A---A------A-T--AC--CACA--T------T-TTCG--AA-ACA---TC---G--------TTGT-A-G-GCT-TCC--ATTT-CT-C--AAG-TTTT--CCTCTC----T-GTTC--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AAATA-GA--A----A-GCA---CACT--C-CAG-TAA-T-ATT-CT-T--GTT-A--C---TG-GT--AA-TTA-AAT---A-CAAAT--AATAATATGT-TA---GA-A-AAA-CAAAGAAAAGG-A--ATT-AGATA-TG--C----------AC--G-A-tt
gi|73745                      :                                                                                                                                                                                                                              CT-TCA--ATTT-CT-C--AAG-TTTT--C---TC----T-GTT--------------------------AA-TA-CA--A----T-GCA--ACACT--C-CAG-TAA-T-ACT-TT-T--TTT-
gi|73746                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T-CT-T--GTT-TTAA---TT-ATG-AA-TTAGAACA--A-GAAATGCAATAA-GTGT-GA---G--A-AAA-CGAATAAA--G-G--ATT-AAATA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TT
gi|73747                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ccAAGAAA--G-G--ATA-AACCA-TG--C----------AC--G-A-GACTT-CAG-GAGAAA--TAAATT----A-ATCCC-TA-AG-T-C-CAGAT--TCC
gi|73748                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAA--GTA--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-AAA-T-CAA-GAGCAAT-TA--------A-ATCCC-AA-AG-TAG-CAGAT--TTC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1111                                                                                                                                   11111111                               
lowQualScore                  :                          4444      44    222  1   1 3333    1  33    1 222 1    666666666   1   2222  22      1 1  1       1   1 2222   2222  1   1  222 555555 1 44   1    22 444444 1  1  22 1   333  333 66666666     1 1 1  1   22 5  4  1 22       44 333  6666 2    22   44 2 22 777 2 2   22  2  2  55 4444  2  22     22 4 2  2   2 2   2  2 6666 4 66 333  2  66  2   0   9999999          2     2 333 8888   2 3      22 2 44   2     2  9999999999999  44 2 2  2  2   2      77  22222222 2     2  2  2 2 2     33      
lowQualScore                  :                          ....      ..    ...  .   . ....    .  ..    . ... .    .........   .   ....  ..      . .  .       .   . ....   ....  .   .  ... ...... . ..   .    .. ...... .  .  .. .   ...  ... ........     . . .  .   .. .  .  . ..       .. ...  .... .    ..   .. . .. ... . .   ..  .  .  .. ....  .  ..     .. . .  .   . .   .  . .... . .. ...  .  ..  .   .   .......          .     . ... ....   . .      .. . ..   .     .  .............  .. . .  .  .   .      ..  ........ .     .  .  . . .     ..      
lowQualScore                  :                          5555      00    999  7   6 4444    5  55    5 666 5    888888888   4   3333  00      4 4  4       3   3 8888   8888  0   3  333 555555 3 44   7    33 888888 7  7  44 7   000  000 33333333     9 9 8  8   55 0  3  8 55       55 333  2222 0    88   88 0 88 000 0 0   88  0  0  55 2222  1  99     99 2 1  1   2 2   1  1 9999 2 11 999  2  00  2   5   5555555          2     2 999 0000   2 2      88 0 88   0     0  2222222222222  88 0 1  0  2   2      55  88888888 2     4  4  4 4 4     22      
consensus                     :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--CTT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
Reference ( family-489 )      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--CTT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73714                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-TGT-T----AAT----CGTATT-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--A-ACA---TG---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTCTT-T--AAGATTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---G-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--C-T-T--A---TG-TTA-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTA-A---G----AAA-C-AAACAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------GC--A-A-GAATT-CAA-GAGCAA--AA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73715                      :                  acTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---A-GTTA-A-------CCG-GAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-T--A--T------T-TT-GA--A-TTA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TAA--ATTTCTT-T--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-CAAAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACA--C-C-AG-TAA-T-ATT-TT-T--C-T-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAATCGCAACAA-GTATA-A---G----AAA-C-AAACAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GAATT-CAA-GAGCAA--TA--------A-ACCTT-AG-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73716                      :                  acTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-T-CG-ATTAACC-GGT-A----AAT----CATATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-T-G-CT-TCA--ATTTTCC-----ATTTTT--T---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--TA-TA-CC--A----TA-CA--ACACT--C-C-TG-TAA-T-ATT-CT-TAATGT-T--GCGCTG-TTA-AA-TTAGAATA--A-TAAGTGCAATAT-GTGTG-A---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-AACTT-AAA-GAGAAA--AA--------A-ATTCC-AA-AG-T-C-TAGAT--TTCACA
gi|73717                      :                  atTAGGGA----TGGCAAA-TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---C-GT-A-A-------CCG-CACAA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-G-T-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TAC---C------T-TT-GG--G-AAA---TAATAG--------TCAATAG-G-CT-TCA--ATTT-CT-C--GAGCTTTTCC---TC----T-ATTT--ATA--T-G--C---AGC-AAAGAAA-TATCA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-A-ATT-CT-T--CAT-T--A---TG-TTG-AA-TAGAAACA--A-T-AATGCAATAA-GTGTT-A---T--A-AAATCGAAGAAA--G-G--ATTAAAATA-TG--C----------AA--AGA-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A---TAC-AA-AG-T-CTCAGAA--TT-ACA
gi|73718                      :                     atGGA----TGGCAA--TCGA---ATTACATG----AATT-GC--CATT-C---G-GTT---------------AAC---------CCG----CA-A-------GGCAT----AAT--------TC-A-----------------TA-T-CA--T------C-TT-GGAGG-ACT---TA---G--------TTGAG-G-GGCT-TCA--ACTTTCTGC--AAGTTTTT-C---TCA---T-GTTT--ATAC-T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TGGCA--ACACT--C-CCAG-TAA-T-ATT-CT-T---TT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--ACTAAATGCAATAA-GTGTGGA---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--GTT-AAACA-TG--C----------ACA-A-A-GAATT-C-A-GAGAAA--TA--------A-ATCCA-AA-AGTT-C-CAGA---TTCACA
gi|73719                      :                   attaGGA----TGGCAA--TCGA---AT--CA-G----AAT--GC--CAAT-C---G--TTA-A-------CCG-CAACA--CA--TTCCGAACACG-ATTAATC-GGT-T----AAT----CATATCAAA---A------A-T--ATATTACC--T------T-TG-GA--G-------CA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TAACT-C--AGG-TTT--C---TC----T-G----------------------------AA-TA-CA--G----TG-CA--ATGCTGGCGC-AG-TAA-T-A----T-T--CTT-G--A---TG------A-T--------------ATGCAATAA-GTGTG-AATGG--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATA-AAAAA-TG--CTTTAAAAAATGCTTA-A-GACTT-CAA-GGAAAAATTAAGTAACCCA-ATTTC-AA-GG-T-C-CAGATCGTTCAC
gi|73720                      :               atttaTAGGGA----TAGCAA--TCGA---AT-ACA-G----ATTT-AC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAAGA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------
gi|73721                      :                  acTATGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-AC--CAAT-C---C-GTTA-A-------CCG-CACGA--TG--TTCCCA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--AT
gi|73722                      :                  atTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----A--T-A----AAC-C---G-GTTA-A-------TCG-TA
gi|73722                      :                                                                                                             tA-C-AG-ATAAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ACA-TGCA--TATATAGT-TT-GG--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTT-T-C--AGGCTTT--T---TC----A-G------------------------AG--TA-TA-CA----------CA--ATACT--C-T-AG-TAA-T-ATC-CT-T---TT-T--G---TG-TT-------------------AATGCAATAA-TTGTG-A---GTTA-TAA-AGAAGAAA--G-G--ATA-AAATA-TG--C----------TC--A-A-GATTT-CAA-GAAAAA--TA--------ACATCtcaaaatacatgcatatatagtttgggacatagttgatggcttcaatttttcaggctttttcagagtatacacaatactctagtaatatcctttttgtgttaatgcaataattgtgagttataaagaagaaaggataaaatatgctcaagatttcaagaaaaataacatc
gi|73723                      : ttagggatggcaatcgaatTAGGGACATATGGTAA--TCGA---AT-ACT-G----AATT-GC--CAAT-C---A-GTCA-A-------CTG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GAT-T----AAT----CATATC-AA---A------A-T--AAT-TACA--T------A-TG-TA--T-ATA---TA---G--------T
gi|73724                      :                   tTAGGAA----AGGCAA--TCAG---TT-ACA-C----AATA-GC--TAAC-A---G-GTTA-A-------CCA-CAAAA--TG--TTCTGA-C-CA-ATTAACC-GGT-T----CAC----TCCATC-AATACA------A-T--ATA-TAC---T------T-TT-G
gi|73725                      :                   tTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AA-ACA-G----AATT-GC--CAAT-T---G-GTTA-C-------ACG-CAACA--CG--TTTCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--AAA-TACA--T------T-TT-AA--G-ATA---TA---G--------TTGAT-G-A-CT-TCA--ATTTTCT-G--AAGTTTT--C---TC----T-GTCT--ATA--T-G--C---A-C-ACA--AA-TA-TA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--CTTGT--G---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAACAA-GTATG-A---G--A-AAA-CCAAGAAA--G-G--ATT-AACCA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-TAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CATAT--TTCACA
gi|73726                      :                    TAGGGA----TGACAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--TAAT-T---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--TG--TTCCAA-C-CA-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTAGC-AA---A------A-T--ATG-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---ATTGATCATTTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--T---G-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-A--CTT-CTGA---TA-TTG-AA-ATAG-ACC--A-T--ATGCAATAA-GTGTG-A---G----AAA-CAAAAAAA--G-G--ATT-AAACA-TGCAC----------AC--A-A-GACTTGTAA-GAGAAA--T---------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73727                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GAA-CATT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAAGA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-TAAATA-TACA--G------T-TT-GA--G-ATA---T----G--------TTGAG-G-A-CT-TCA--A-TTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-A-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-C-------T-T--A---TG-TTG-AA-TTAAAACAATA-TAAATGTAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAAAA-TG---------------------------------------TG--------A-ATCCCAAA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73728                      :                    TAGGGA----TGGTAA--TCAA---AT-ACG-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-TAACA--CG--ATCCGC-C-CG-ATGAACC-GGT-T----AAT----CGTTTC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTGT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--C-G--C---C-C-AAA--AA-TG-CA--A----TA-CA--ACACC--C-C-AG-TA
gi|73729                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC------A------A-T--TTA-TACATCT------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------
gi|73730                      :                     AGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATTGGC--CAAT-T---GCGTTATA-------CCG-CAAGA--CG--TTTCGA-C-CG-ATTAACCTGTT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-TTAATA-TACA--T------TGTG-GA--GAAAA---CA---G--------ATGAT-GCA-CT-TCAATATCTTCT-C--AAAGTTT--C---TC----A-GTTT--TAA--T-G--CACAA-C-AAG--AA-CA-CG--A----TG-GC--ACACT--CGC-AG-TAA-T--TA-CT-T--CTTCT--A---CGTTTT-AA-TTTAACTA--A-GTAATGCCATGA-GTGGG-A---A--C-CAA--GAAGAAA--G-GTAATT-AAATATTGCCC----------AC--A-ATGACTT-CAATGAGAAAT-TA--------T-ATTCC-AACAG-T---CAGAT--TCGACA
gi|73731                      :                      GGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---A-ATTG-T-------TCG-CAACA--CG--TTCCGA-A-CG-ATTAACC-AGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATT-TACA--T------T-TT-GA--G-AAA---TA---G--------ATGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTCT-A--TAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ACA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CAACA----TG-CA--ATACG--C-C-AA-TGA-T-ATT-CT-T--C-T-T--G---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TGAATACAATAA-GTATG-A---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TA--C----------AC--A-G-TAATC-CAA-GAGAAA--TA--------A-TTCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73732                      :                      GGAA----TGGCGAATTCGATAAAT-ACA-AGAATAATG-GCGACAATGC---G-GTTG-AATTAATACCGGCAACAGACAGTTTCCGA-C-CGTATTAACC-GGT-T----AATTGATCGTATC-AA---A------AAT--AAA-TTCA--T------T-T-------------------G--------TTGAG-G-A-CTATCA--TTTATCT-TCAAAGTTTT--C---TC----TAGTTT--ATAAATAG--C---A-C-AAA-----TA-CA--A----TG-CATAACACT--C-C-AGGTAAAT-ATT-CTAT--AAA-T--A---GA-TTG-AAGTTAAAAAAT-A-TAAATGTAATAA-GTGTG-----G--A-AAA-CGAAGAGA--A-G--ATT-AAA-A-TG---------------------------------------TA--------A-AT----AA-AG-T-C-CCAAT--TTCACA
gi|73733                      :                                  AA--CCGA---TT-ACG-G----ATTT-TG--CAAC-C---G-ATTA---------CCA-C------TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73734                      :                                  AA--CCGA---TT-ACG-G----AATT-TG--CAAC-C---G-ATTA---------CCA-C------TG--TTCCGA-C-CG-AGTAATC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73735                      :                                  AA--CCGA---TT-ATG-G----ATTT-TC--CAAC-C---G-ATTA-T-------C-----AC---TG--TTCGGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAT----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73736                      :                                  AA--CCGA---TT-ACG-G----AATA-AG--CAAC-C---G-ATTA---------CCA-C------TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73737                      :                                  AA--CCGA---TT-ACA-G----ATTT-TG--CAAC-T---G-ATTA-T-------C-----AC---TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73738                      :                                                 CA-A----AATT--T--CAAT-CAACG-GCTA-A-------TTG-AAAAT--CG--TTCCGA-C-CG-ATCTGCC-GGT-T----AAT----CGTATA-AA---A------A-T--A-A-TATA--C------C-TT-GC--G-ACA---T----G--------TTAAT-G-G-CT-TTC--ATTTTGT-C--AAGT---------TC----T-GTTT--CTG----GAAC---A-T-AAA--AA-GA-CA--A----T--CA--ACACA--C-C-AG-AAA-TAATTACA-T--GTT-T--A---TG-TTATAC-TTAGAAC--------------TAA-GGATG-A---G--AGAAA-CGACGAAA--G-GC-ATG-AATCA-TG--C----------GC--A-
gi|73739                      :                                                          ATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------TCG-CAACA--CG--TTCCGT-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGCATC-AC---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT--A--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTCT-C--TAGTTTT--T---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-GAA--AA-TG-CAACA----TG-CA--ACACT--C-C-AA-TAA-T-ATT-TT-T--C-T-T--A---TG-TT-----T-------------AATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CAAAAAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--T-A-GAAAT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCA-AA-AG-T-T-CACAT--TTCACA
gi|73740                      :                                                           TT-GC--AACT-C---G-GCTA-A------------AAAA--C----T---A-C-CG-ATTAACC---T-T----AAT----AGTATC-AA---A------A-T--AAA-CACA--A------T-TT-GA--A-ACATATTA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTCT-C--AAGTTTT--C---T
gi|73741                      :                                                                                A-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GTT-TTTAAAAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------G-TT-GC--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCC--ATTT-CT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GCTT--ACA--T-G--CTCAA-A-AAA--AA-TA-AA--AAATATG-CA--ACACT--C-A-AG-TAA-T-CTT-CT-T----T-T--A---TG-ATG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATA-AAACA-TG--C----------AC--G-A-GACTT-GAA-GAGAAA--TA--------A-ATTCC-AA-TG-T-C-GAAAT--TT
gi|73742                      :                                                                                                                 -CG-ATTAACC-GGT-T----AGT----CGTATC-AA---ATT----A-C--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ATA---TA---G--------TCGAT-G-G-CT-TCA--ATTTCTT-T--AAG-TTT--C---TTAAAGT-AATTAAACA--T-G--C---A-C-AAA--AA-T--CA--A----
gi|73743                      :                                                                                                                      TTAACC-GGT-T----AGT----CGTATC-AA---ATTATATA-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--A-ACA---TA---G--------TCAAT-G-G-CT-TCA--ATTTATT-C--AA
gi|73744                      :                                                                                                                                                     A---A------A-T--AC--CACA--T------T-TTCGA--A-ACA---TC---G--------TTGTA-G-G-CT-TCC--ATTT-CT-C--AAGTTTT--CCTCTC----T-GTTC--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AAATA-GA--A----AG-CA---CACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--GTT-A--C---TG-GT--AA-TTA-AAT---A-CAAAT--AATAATATGTT-A---GA-A-AAA-CAAAGAAAAGG-A--ATT-AGATA-TG--C----------AC--G-A-tt
gi|73745                      :                                                                                                                                                                                                                              -CT-TCA--ATTT-CT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTT--------------------------AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ACT-TT-T--TTT-
gi|73746                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T-CT-T--GTT-TTAA---TT-ATG-AA-TTAGAACA--A-GAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAATAAA--G-G--ATT-AAATA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TT
gi|73747                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccAAGAAA--G-G--ATA-AACCA-TG--C----------AC--G-A-GACTT-CAG-GAGAAA--TAAATT----A-ATCCC-TA-AG-T-C-CAGAT--TCC
gi|73748                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAA--GTA--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-AAA-T-CAA-GAGCAAT-TA--------A-ATCCC-AA-AG-TAG-CAGAT--TTC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1111                                                                                                                                   11111111                               
lowQualScore                  :                          4444      44    222  1   1 3333    1  33    1 222 1    666666666   1   2222  22      1 1  1       1   1 2222   2222  1   1  222 555555 1 44   1    22 444444 1  1  22 1   333  333 66666666     1 1 1  1   22 5  4  1 22       44 333  6666 2    22   44 2 22 777 2 2   22  2  2  55 4444  2  22     22 4 2  2   2 2   2  2 6666 4 66 333  2  66  2   0   9999999          2     2 333 8888   2 3      22 2 44   2     2  9999999999999  44 2 2  2  2   2      77  22222222 2     2  2  2 2 2     33      
lowQualScore                  :                          ....      ..    ...  .   . ....    .  ..    . ... .    .........   .   ....  ..      . .  .       .   . ....   ....  .   .  ... ...... . ..   .    .. ...... .  .  .. .   ...  ... ........     . . .  .   .. .  .  . ..       .. ...  .... .    ..   .. . .. ... . .   ..  .  .  .. ....  .  ..     .. . .  .   . .   .  . .... . .. ...  .  ..  .   .   .......          .     . ... ....   . .      .. . ..   .     .  .............  .. . .  .  .   .      ..  ........ .     .  .  . . .     ..      
lowQualScore                  :                          5555      00    999  7   6 4444    5  55    5 666 5    888888888   4   3333  00      4 4  4       3   3 8888   8888  0   3  333 555555 3 44   7    33 888888 7  7  44 7   000  000 33333333     9 9 8  8   55 0  3  8 55       55 333  2222 0    88   88 0 88 000 0 0   88  0  0  55 2222  1  99     99 2 1  1   2 2   1  1 9999 2 11 999  2  00  2   5   5555555          2     2 999 0000   2 2      88 0 88   0     0  2222222222222  88 0 1  0  2   2      55  88888888 2     4  4  4 4 4     22      
consensus                     :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--CTT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
Reference ( family-489 )      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--CTT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73714                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-TGT-T----AAT----CGTATT-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--A-ACA---TG---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTCTT-T--AAGATTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---G-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--C-T-T--A---TG-TTA-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTA-A---G----AAA-C-AAACAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------GC--A-A-GAATT-CAA-GAGCAA--AA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73715                      :                  acTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---A-GTTA-A-------CCG-GAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-T--A--T------T-TT-GA--A-TTA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TAA--ATTTCTT-T--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-CAAAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACA--C-C-AG-TAA-T-ATT-TT-T--C-T-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAATCGCAACAA-GTATA-A---G----AAA-C-AAACAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GAATT-CAA-GAGCAA--TA--------A-ACCTT-AG-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73716                      :                  acTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-T-CG-ATTAACC-GGT-A----AAT----CATATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-T-G-CT-TCA--ATTTTCC-----ATTTTT--T---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--TA-TA-CC--A----TA-CA--ACACT--C-C-TG-TAA-T-ATT-CT-TAATGT-T--GCGCTG-TTA-AA-TTAGAATA--A-TAAGTGCAATAT-GTGTG-A---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-AACTT-AAA-GAGAAA--AA--------A-ATTCC-AA-AG-T-C-TAGAT--TTCACA
gi|73717                      :                  atTAGGGA----TGGCAAA-TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---C-GT-A-A-------CCG-CACAA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-G-T-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TAC---C------T-TT-GG--G-AAA---TAATAG--------TCAATAG-G-CT-TCA--ATTT-CT-C--GAGCTTTTCC---TC----T-ATTT--ATA--T-G--C---AGC-AAAGAAA-TATCA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-A-ATT-CT-T--CAT-T--A---TG-TTG-AA-TAGAAACA--A-T-AATGCAATAA-GTGTT-A---T--A-AAATCGAAGAAA--G-G--ATTAAAATA-TG--C----------AA--AGA-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A---TAC-AA-AG-T-CTCAGAA--TT-ACA
gi|73718                      :                     atGGA----TGGCAA--TCGA---ATTACATG----AATT-GC--CATT-C---G-GTT---------------AAC---------CCG----CA-A-------GGCAT----AAT--------TC-A-----------------TA-T-CA--T------C-TT-GGAGG-ACT---TA---G--------TTGAG-G-GGCT-TCA--ACTTTCTGC--AAGTTTTT-C---TCA---T-GTTT--ATAC-T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TGGCA--ACACT--C-CCAG-TAA-T-ATT-CT-T---TT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--ACTAAATGCAATAA-GTGTGGA---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--GTT-AAACA-TG--C----------ACA-A-A-GAATT-C-A-GAGAAA--TA--------A-ATCCA-AA-AGTT-C-CAGA---TTCACA
gi|73719                      :                   attaGGA----TGGCAA--TCGA---AT--CA-G----AAT--GC--CAAT-C---G--TTA-A-------CCG-CAACA--CA--TTCCGAACACG-ATTAATC-GGT-T----AAT----CATATCAAA---A------A-T--ATATTACC--T------T-TG-GA--G-------CA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TAACT-C--AGG-TTT--C---TC----T-G----------------------------AA-TA-CA--G----TG-CA--ATGCTGGCGC-AG-TAA-T-A----T-T--CTT-G--A---TG------A-T--------------ATGCAATAA-GTGTG-AATGG--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATA-AAAAA-TG--CTTTAAAAAATGCTTA-A-GACTT-CAA-GGAAAAATTAAGTAACCCA-ATTTC-AA-GG-T-C-CAGATCGTTCAC
gi|73720                      :               atttaTAGGGA----TAGCAA--TCGA---AT-ACA-G----ATTT-AC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAAGA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------
gi|73721                      :                  acTATGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-AC--CAAT-C---C-GTTA-A-------CCG-CACGA--TG--TTCCCA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--AT
gi|73722                      :                  atTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----A--T-A----AAC-C---G-GTTA-A-------TCG-TA
gi|73722                      :                                                                                                             tA-C-AG-ATAAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ACA-TGCA--TATATAGT-TT-GG--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTT-T-C--AGGCTTT--T---TC----A-G------------------------AG--TA-TA-CA----------CA--ATACT--C-T-AG-TAA-T-ATC-CT-T---TT-T--G---TG-TT-------------------AATGCAATAA-TTGTG-A---GTTA-TAA-AGAAGAAA--G-G--ATA-AAATA-TG--C----------TC--A-A-GATTT-CAA-GAAAAA--TA--------ACATCtcaaaatacatgcatatatagtttgggacatagttgatggcttcaatttttcaggctttttcagagtatacacaatactctagtaatatcctttttgtgttaatgcaataattgtgagttataaagaagaaaggataaaatatgctcaagatttcaagaaaaataacatc
gi|73723                      : ttagggatggcaatcgaatTAGGGACATATGGTAA--TCGA---AT-ACT-G----AATT-GC--CAAT-C---A-GTCA-A-------CTG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GAT-T----AAT----CATATC-AA---A------A-T--AAT-TACA--T------A-TG-TA--T-ATA---TA---G--------T
gi|73724                      :                   tTAGGAA----AGGCAA--TCAG---TT-ACA-C----AATA-GC--TAAC-A---G-GTTA-A-------CCA-CAAAA--TG--TTCTGA-C-CA-ATTAACC-GGT-T----CAC----TCCATC-AATACA------A-T--ATA-TAC---T------T-TT-G
gi|73725                      :                   tTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AA-ACA-G----AATT-GC--CAAT-T---G-GTTA-C-------ACG-CAACA--CG--TTTCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--AAA-TACA--T------T-TT-AA--G-ATA---TA---G--------TTGAT-G-A-CT-TCA--ATTTTCT-G--AAGTTTT--C---TC----T-GTCT--ATA--T-G--C---A-C-ACA--AA-TA-TA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--CTTGT--G---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAACAA-GTATG-A---G--A-AAA-CCAAGAAA--G-G--ATT-AACCA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-TAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CATAT--TTCACA
gi|73726                      :                    TAGGGA----TGACAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--TAAT-T---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--TG--TTCCAA-C-CA-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTAGC-AA---A------A-T--ATG-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---ATTGATCATTTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--T---G-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-A--CTT-CTGA---TA-TTG-AA-ATAG-ACC--A-T--ATGCAATAA-GTGTG-A---G----AAA-CAAAAAAA--G-G--ATT-AAACA-TGCAC----------AC--A-A-GACTTGTAA-GAGAAA--T---------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73727                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GAA-CATT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAAGA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-TAAATA-TACA--G------T-TT-GA--G-ATA---T----G--------TTGAG-G-A-CT-TCA--A-TTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-A-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-C-------T-T--A---TG-TTG-AA-TTAAAACAATA-TAAATGTAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAAAA-TG---------------------------------------TG--------A-ATCCCAAA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73728                      :                    TAGGGA----TGGTAA--TCAA---AT-ACG-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-TAACA--CG--ATCCGC-C-CG-ATGAACC-GGT-T----AAT----CGTTTC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTGT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--C-G--C---C-C-AAA--AA-TG-CA--A----TA-CA--ACACC--C-C-AG-TA
gi|73729                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC------A------A-T--TTA-TACATCT------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------
gi|73730                      :                     AGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATTGGC--CAAT-T---GCGTTATA-------CCG-CAAGA--CG--TTTCGA-C-CG-ATTAACCTGTT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-TTAATA-TACA--T------TGTG-GA--GAAAA---CA---G--------ATGAT-GCA-CT-TCAATATCTTCT-C--AAAGTTT--C---TC----A-GTTT--TAA--T-G--CACAA-C-AAG--AA-CA-CG--A----TG-GC--ACACT--CGC-AG-TAA-T--TA-CT-T--CTTCT--A---CGTTTT-AA-TTTAACTA--A-GTAATGCCATGA-GTGGG-A---A--C-CAA--GAAGAAA--G-GTAATT-AAATATTGCCC----------AC--A-ATGACTT-CAATGAGAAAT-TA--------T-ATTCC-AACAG-T---CAGAT--TCGACA
gi|73731                      :                      GGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---A-ATTG-T-------TCG-CAACA--CG--TTCCGA-A-CG-ATTAACC-AGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATT-TACA--T------T-TT-GA--G-AAA---TA---G--------ATGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTCT-A--TAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ACA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CAACA----TG-CA--ATACG--C-C-AA-TGA-T-ATT-CT-T--C-T-T--G---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TGAATACAATAA-GTATG-A---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TA--C----------AC--A-G-TAATC-CAA-GAGAAA--TA--------A-TTCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73732                      :                      GGAA----TGGCGAATTCGATAAAT-ACA-AGAATAATG-GCGACAATGC---G-GTTG-AATTAATACCGGCAACAGACAGTTTCCGA-C-CGTATTAACC-GGT-T----AATTGATCGTATC-AA---A------AAT--AAA-TTCA--T------T-T-------------------G--------TTGAG-G-A-CTATCA--TTTATCT-TCAAAGTTTT--C---TC----TAGTTT--ATAAATAG--C---A-C-AAA-----TA-CA--A----TG-CATAACACT--C-C-AGGTAAAT-ATT-CTAT--AAA-T--A---GA-TTG-AAGTTAAAAAAT-A-TAAATGTAATAA-GTGTG-----G--A-AAA-CGAAGAGA--A-G--ATT-AAA-A-TG---------------------------------------TA--------A-AT----AA-AG-T-C-CCAAT--TTCACA
gi|73733                      :                                  AA--CCGA---TT-ACG-G----ATTT-TG--CAAC-C---G-ATTA---------CCA-C------TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73734                      :                                  AA--CCGA---TT-ACG-G----AATT-TG--CAAC-C---G-ATTA---------CCA-C------TG--TTCCGA-C-CG-AGTAATC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73735                      :                                  AA--CCGA---TT-ATG-G----ATTT-TC--CAAC-C---G-ATTA-T-------C-----AC---TG--TTCGGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAT----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73736                      :                                  AA--CCGA---TT-ACG-G----AATA-AG--CAAC-C---G-ATTA---------CCA-C------TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73737                      :                                  AA--CCGA---TT-ACA-G----ATTT-TG--CAAC-T---G-ATTA-T-------C-----AC---TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73738                      :                                                 CA-A----AATT--T--CAAT-CAACG-GCTA-A-------TTG-AAAAT--CG--TTCCGA-C-CG-ATCTGCC-GGT-T----AAT----CGTATA-AA---A------A-T--A-A-TATA--C------C-TT-GC--G-ACA---T----G--------TTAAT-G-G-CT-TTC--ATTTTGT-C--AAGT---------TC----T-GTTT--CTG----GAAC---A-T-AAA--AA-GA-CA--A----T--CA--ACACA--C-C-AG-AAA-TAATTACA-T--GTT-T--A---TG-TTATAC-TTAGAAC--------------TAA-GGATG-A---G--AGAAA-CGACGAAA--G-GC-ATG-AATCA-TG--C----------GC--A-
gi|73739                      :                                                          ATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------TCG-CAACA--CG--TTCCGT-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGCATC-AC---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT--A--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTCT-C--TAGTTTT--T---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-GAA--AA-TG-CAACA----TG-CA--ACACT--C-C-AA-TAA-T-ATT-TT-T--C-T-T--A---TG-TT-----T-------------AATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CAAAAAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--T-A-GAAAT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCA-AA-AG-T-T-CACAT--TTCACA
gi|73740                      :                                                           TT-GC--AACT-C---G-GCTA-A------------AAAA--C----T---A-C-CG-ATTAACC---T-T----AAT----AGTATC-AA---A------A-T--AAA-CACA--A------T-TT-GA--A-ACATATTA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTCT-C--AAGTTTT--C---T
gi|73741                      :                                                                                A-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GTT-TTTAAAAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------G-TT-GC--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCC--ATTT-CT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GCTT--ACA--T-G--CTCAA-A-AAA--AA-TA-AA--AAATATG-CA--ACACT--C-A-AG-TAA-T-CTT-CT-T----T-T--A---TG-ATG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATA-AAACA-TG--C----------AC--G-A-GACTT-GAA-GAGAAA--TA--------A-ATTCC-AA-TG-T-C-GAAAT--TT
gi|73742                      :                                                                                                                 -CG-ATTAACC-GGT-T----AGT----CGTATC-AA---ATT----A-C--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ATA---TA---G--------TCGAT-G-G-CT-TCA--ATTTCTT-T--AAG-TTT--C---TTAAAGT-AATTAAACA--T-G--C---A-C-AAA--AA-T--CA--A----
gi|73743                      :                                                                                                                      TTAACC-GGT-T----AGT----CGTATC-AA---ATTATATA-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--A-ACA---TA---G--------TCAAT-G-G-CT-TCA--ATTTATT-C--AA
gi|73744                      :                                                                                                                                                     A---A------A-T--AC--CACA--T------T-TTCGA--A-ACA---TC---G--------TTGTA-G-G-CT-TCC--ATTT-CT-C--AAGTTTT--CCTCTC----T-GTTC--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AAATA-GA--A----AG-CA---CACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--GTT-A--C---TG-GT--AA-TTA-AAT---A-CAAAT--AATAATATGTT-A---GA-A-AAA-CAAAGAAAAGG-A--ATT-AGATA-TG--C----------AC--G-A-tt
gi|73745                      :                                                                                                                                                                                                                              -CT-TCA--ATTT-CT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTT--------------------------AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ACT-TT-T--TTT-
gi|73746                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T-CT-T--GTT-TTAA---TT-ATG-AA-TTAGAACA--A-GAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAATAAA--G-G--ATT-AAATA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TT
gi|73747                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccAAGAAA--G-G--ATA-AACCA-TG--C----------AC--G-A-GACTT-CAG-GAGAAA--TAAATT----A-ATCCC-TA-AG-T-C-CAGAT--TCC
gi|73748                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAA--GTA--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-AAA-T-CAA-GAGCAAT-TA--------A-ATCCC-AA-AG-TAG-CAGAT--TTC


blockSeqs                     :                          CATA      AT    TAA  T   T GAAT    G  GA    G AAC C    AATTAATA    G   CAGA  GT      A A  T       T   A TTAA   TGAT      A  TAC TTATAT A AA   T    TC ATATAG G  C  AG A   TAT  ATA TTGATCAT     A C G  A   AT T  C  G CA       TC CTC  AAAG A    AA   AA A AA ACA G A   GA  A  T  AC AATA  G  TA     GG G C  G   A A   A  A AATG G TG CGC  T  AT  G       AATATA           T     G ATG TTA    T A      AG T TA   A     T  CTTTAAAAAAT    TT G T  A  G   T      AT  AGTAACCC C     A  C  T A T     CG
blockSeqs                     :                          .         A     .    .   . .       .  A     . .   .    TA          .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   TT     . TA   .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        T  .    A    .    .    C  . .  TCA . .   .   .  .  AC .     .  .      .  G .  .   . .   .  . CA   C TA .    .  G   .       AACTA            .     . .   AG     . G      .  . C    .     .  CAC            A  . .  C  .   .      T   AATT     .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . CT   . .  .    .  A   .       ATATA            .     . .   AA     . A      .  . .    .     .  CCC            .  . .  C  .   .      T   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   AA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  C  A  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . CT   . .  .    .  G   .       AATA             .     . .   A      . A      .  . .    .     .  C              .  . .  A  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . CT   . .  .    .  G   .       AATA             .     . .   A      . G      .  . .    .     .  C              .  . .  C  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   GA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . CT   . .  .    .  G   .       AATA             .     . .   A      . C      .  . .    .     .  C              .  . .  T  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   GA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . AA   . .  .    .  G   .       AAGT             .     . .   A      . A      .  . .    .     .  C              .  . .  C  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . GT   . .  .    .  G   .       AATG             .     . .   A      . G      .  . .    .     .  C              .  . .  C  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   AA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . GT   . .  .    .  T   .       AATA             .     . .   A      . G      .  . .    .     .  C              .  . .  C  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . TT   . .  .    .  G   .       AAGA             .     . .   C      . A      .  . .    .     .  C              .  . .  A  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . GT   . .  .    .  G   .       AAT              .     . .   A      . G      .  . .    .     .  C              .  . .  A  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    C           .   GA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . C    . .  .    .  G   .       CAT              .     . .   A      . G      .  . .    .     .  C              .  . .  C  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . T    . .  .    .  G   .       ACA              .     . .   A      . A      .  . .    .     .  C              .  . .  C  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . T    . .  .    .  .   .       .                .     . .   A      . G      .  . .    .     .  C              .  . .  C  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   GA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  T  T  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . C    . .  .    .  .   .       .                .     . .   A      . A      .  . .    .     .  C              .  . .  A  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  .  C  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . C    . .  .    .  .   .       .                .     . .   .      . G      .  . .    .     .  C              .  . .  .  .   .      .   .        .     .  .  . . .     . 
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    T           .   AT    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  .  A  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .   . .   .  . .    . .  .    .  .   .       .                .     . .   .      . .      .  . .    .     .  C              .  . .  .  .   .      .   .        .                       
blockSeqs                     :                          .         .     .    .   . .       .  .     . .   .    T           .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  .  .  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .     .  .      .  . .  .         .  . .    .                                                                     .  . .    .     .  .              .  . .                                                     
blockSeqs                     :                                    .     .    .   . .       .  .     . .   .    T           .   AA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  .  .  . .        .  .    .    .    .    .  . .  .   . .   .   .  .  .  .                                                                                                                 .  . .    .     .  .              .  .                                                       
blockSeqs                     :                                    .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   CA    .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .            . . .  .   .  .  .  . .        .  .                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                    .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   C     .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .                .  .   .  .  .  . .                                                                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                    .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   C     .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .  .  .   .    .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                    .     .    .   . .       .  .     . .   .    A           .   C     .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .    .    .  .      .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                   . .       .  .     . .   .    .           .   .     .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                             .  .     . .   .    .           .   .     .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                             .  .     . .   .    .           .   .     .       . .  .       .   . .      .         .  .   .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                 .           .                 . .  .       .   . .      .         .  .   .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                 .  .       .   . .      .         .  .   .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                            .   . .      .         .  .   .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CT**                                                       A***
originalCons                  :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--CTT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
finalCons                     :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-TCT--T-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---GA---AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1111                                                                                                                                   11111111                               
lowQualScore                  :                          4444      44    222  1   1 3333    1  33    1 222 1    666666666   1   2222  22      1 1  1       1   1 2222   2222  1   1  222 555555 1 44   1    22 444444 1  1  22 1   333  333 66666666     1 1 1  1   22 5  4  1 22       44 333  6666 2    22   44 2 22 777 2 2   22  2  2  55 4444  2  22     22 4 2  2   2 2   2  2 6666 4 66 333  2  66  2   0   9999999          2     2 333 8888   2 3      22 2 44   2     2  9999999999999  44 2 2  2  2   2      77  22222222 2     2  2  2 2 2     33      
lowQualScore                  :                          ....      ..    ...  .   . ....    .  ..    . ... .    .........   .   ....  ..      . .  .       .   . ....   ....  .   .  ... ...... . ..   .    .. ...... .  .  .. .   ...  ... ........     . . .  .   .. .  .  . ..       .. ...  .... .    ..   .. . .. ... . .   ..  .  .  .. ....  .  ..     .. . .  .   . .   .  . .... . .. ...  .  ..  .   .   .......          .     . ... ....   . .      .. . ..   .     .  .............  .. . .  .  .   .      ..  ........ .     .  .  . . .     ..      
lowQualScore                  :                          5555      00    999  7   6 4444    5  55    5 666 5    888888888   4   3333  00      4 4  4       3   3 8888   8888  0   3  333 555555 3 44   7    33 888888 7  7  44 7   000  000 33333333     9 9 8  8   55 0  3  8 55       55 333  2222 0    88   88 0 88 000 0 0   88  0  0  55 2222  1  99     99 2 1  1   2 2   1  1 9999 2 11 999  2  00  2   5   5555555          2     2 999 0000   2 2      88 0 88   0     0  2222222222222  88 0 1  0  2   2      55  88888888 2     4  4  4 4 4     22      
consensus                     :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--CTT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
Reference ( family-489 )      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--CTT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73714                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-TGT-T----AAT----CGTATT-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--A-ACA---TG---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTCTT-T--AAGATTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---G-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--C-T-T--A---TG-TTA-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTA-A---G----AAA-C-AAACAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------GC--A-A-GAATT-CAA-GAGCAA--AA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73715                      :                  acTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---A-GTTA-A-------CCG-GAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-T--A--T------T-TT-GA--A-TTA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TAA--ATTTCTT-T--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-CAAAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACA--C-C-AG-TAA-T-ATT-TT-T--C-T-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAATCGCAACAA-GTATA-A---G----AAA-C-AAACAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-GAATT-CAA-GAGCAA--TA--------A-ACCTT-AG-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73716                      :                  acTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-T-CG-ATTAACC-GGT-A----AAT----CATATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-T-G-CT-TCA--ATTTTCC-----ATTTTT--T---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-AAA--TA-TA-CC--A----TA-CA--ACACT--C-C-TG-TAA-T-ATT-CT-TAATGT-T--GCGCTG-TTA-AA-TTAGAATA--A-TAAGTGCAATAT-GTGTG-A---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-AACTT-AAA-GAGAAA--AA--------A-ATTCC-AA-AG-T-C-TAGAT--TTCACA
gi|73717                      :                  atTAGGGA----TGGCAAA-TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---C-GT-A-A-------CCG-CACAA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-G-T-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TAC---C------T-TT-GG--G-AAA---TAATAG--------TCAATAG-G-CT-TCA--ATTT-CT-C--GAGCTTTTCC---TC----T-ATTT--ATA--T-G--C---AGC-AAAGAAA-TATCA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-A-ATT-CT-T--CAT-T--A---TG-TTG-AA-TAGAAACA--A-T-AATGCAATAA-GTGTT-A---T--A-AAATCGAAGAAA--G-G--ATTAAAATA-TG--C----------AA--AGA-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A---TAC-AA-AG-T-CTCAGAA--TT-ACA
gi|73718                      :                     atGGA----TGGCAA--TCGA---ATTACATG----AATT-GC--CATT-C---G-GTT---------------AAC---------CCG----CA-A-------GGCAT----AAT--------TC-A-----------------TA-T-CA--T------C-TT-GGAGG-ACT---TA---G--------TTGAG-G-GGCT-TCA--ACTTTCTGC--AAGTTTTT-C---TCA---T-GTTT--ATAC-T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CA--A----TGGCA--ACACT--C-CCAG-TAA-T-ATT-CT-T---TT-T--A---TG-TTG-AA-TTAGAACA--ACTAAATGCAATAA-GTGTGGA---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--GTT-AAACA-TG--C----------ACA-A-A-GAATT-C-A-GAGAAA--TA--------A-ATCCA-AA-AGTT-C-CAGA---TTCACA
gi|73719                      :                   attaGGA----TGGCAA--TCGA---AT--CA-G----AAT--GC--CAAT-C---G--TTA-A-------CCG-CAACA--CA--TTCCGAACACG-ATTAATC-GGT-T----AAT----CATATCAAA---A------A-T--ATATTACC--T------T-TG-GA--G-------CA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TAACT-C--AGG-TTT--C---TC----T-G----------------------------AA-TA-CA--G----TG-CA--ATGCTGGCGC-AG-TAA-T-A----T-T--CTT-G--A---TG------A-T--------------ATGCAATAA-GTGTG-AATGG--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATA-AAAAA-TG--CTTTAAAAAATGCTTA-A-GACTT-CAA-GGAAAAATTAAGTAACCCA-ATTTC-AA-GG-T-C-CAGATCGTTCAC
gi|73720                      :               atttaTAGGGA----TAGCAA--TCGA---AT-ACA-G----ATTT-AC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAAGA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------
gi|73721                      :                  acTATGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-AC--CAAT-C---C-GTTA-A-------CCG-CACGA--TG--TTCCCA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--AT
gi|73722                      :                  atTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----A--T-A----AAC-C---G-GTTA-A-------TCG-TA
gi|73722                      :                                                                                                             tA-C-AG-ATAAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ACA-TGCA--TATATAGT-TT-GG--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTT-T-C--AGGCTTT--T---TC----A-G------------------------AG--TA-TA-CA----------CA--ATACT--C-T-AG-TAA-T-ATC-CT-T---TT-T--G---TG-TT-------------------AATGCAATAA-TTGTG-A---GTTA-TAA-AGAAGAAA--G-G--ATA-AAATA-TG--C----------TC--A-A-GATTT-CAA-GAAAAA--TA--------ACATCtcaaaatacatgcatatatagtttgggacatagttgatggcttcaatttttcaggctttttcagagtatacacaatactctagtaatatcctttttgtgttaatgcaataattgtgagttataaagaagaaaggataaaatatgctcaagatttcaagaaaaataacatc
gi|73723                      : ttagggatggcaatcgaatTAGGGACATATGGTAA--TCGA---AT-ACT-G----AATT-GC--CAAT-C---A-GTCA-A-------CTG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GAT-T----AAT----CATATC-AA---A------A-T--AAT-TACA--T------A-TG-TA--T-ATA---TA---G--------T
gi|73724                      :                   tTAGGAA----AGGCAA--TCAG---TT-ACA-C----AATA-GC--TAAC-A---G-GTTA-A-------CCA-CAAAA--TG--TTCTGA-C-CA-ATTAACC-GGT-T----CAC----TCCATC-AATACA------A-T--ATA-TAC---T------T-TT-G
gi|73725                      :                   tTAGGGA----TGGCAA--TCGA---AA-ACA-G----AATT-GC--CAAT-T---G-GTTA-C-------ACG-CAACA--CG--TTTCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--AAA-TACA--T------T-TT-AA--G-ATA---TA---G--------TTGAT-G-A-CT-TCA--ATTTTCT-G--AAGTTTT--C---TC----T-GTCT--ATA--T-G--C---A-C-ACA--AA-TA-TA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--CTTGT--G---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAACAA-GTATG-A---G--A-AAA-CCAAGAAA--G-G--ATT-AACCA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-TAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CATAT--TTCACA
gi|73726                      :                    TAGGGA----TGACAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--TAAT-T---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--TG--TTCCAA-C-CA-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTAGC-AA---A------A-T--ATG-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---ATTGATCATTTGAT-G-G-CT-TCA--ATTTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--T---G-C-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-A--CTT-CTGA---TA-TTG-AA-ATAG-ACC--A-T--ATGCAATAA-GTGTG-A---G----AAA-CAAAAAAA--G-G--ATT-AAACA-TGCAC----------AC--A-A-GACTTGTAA-GAGAAA--T---------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73727                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GAA-CATT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAAGA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-TAAATA-TACA--G------T-TT-GA--G-ATA---T----G--------TTGAG-G-A-CT-TCA--A-TTTCT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-A-AAA--AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-C-------T-T--A---TG-TTG-AA-TTAAAACAATA-TAAATGTAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATT-AAAAA-TG---------------------------------------TG--------A-ATCCCAAA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73728                      :                    TAGGGA----TGGTAA--TCAA---AT-ACG-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-TAACA--CG--ATCCGC-C-CG-ATGAACC-GGT-T----AAT----CGTTTC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTGT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ATA--C-G--C---C-C-AAA--AA-TG-CA--A----TA-CA--ACACC--C-C-AG-TA
gi|73729                      :                    TAGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGTATC------A------A-T--TTA-TACATCT------T-TT-GA--G-ACA---TA---G--------
gi|73730                      :                     AGGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATTGGC--CAAT-T---GCGTTATA-------CCG-CAAGA--CG--TTTCGA-C-CG-ATTAACCTGTT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-TTAATA-TACA--T------TGTG-GA--GAAAA---CA---G--------ATGAT-GCA-CT-TCAATATCTTCT-C--AAAGTTT--C---TC----A-GTTT--TAA--T-G--CACAA-C-AAG--AA-CA-CG--A----TG-GC--ACACT--CGC-AG-TAA-T--TA-CT-T--CTTCT--A---CGTTTT-AA-TTTAACTA--A-GTAATGCCATGA-GTGGG-A---A--C-CAA--GAAGAAA--G-GTAATT-AAATATTGCCC----------AC--A-ATGACTT-CAATGAGAAAT-TA--------T-ATTCC-AACAG-T---CAGAT--TCGACA
gi|73731                      :                      GGGA----TGGCAA--TCGA---AT-ACA-G----AATT-GC--CAAT-C---A-ATTG-T-------TCG-CAACA--CG--TTCCGA-A-CG-ATTAACC-AGT-T----AAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATT-TACA--T------T-TT-GA--G-AAA---TA---G--------ATGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTCT-A--TAGTTTT--C---TC----T-GTTT--ACA--T-G--C---A-C-AAA--AA-TA-CAACA----TG-CA--ATACG--C-C-AA-TGA-T-ATT-CT-T--C-T-T--G---TG-TTG-AA-TTAGAACA--A-TGAATACAATAA-GTATG-A---G--A-AAA-CAAAGAAA--G-G--ATT-AAACA-TA--C----------AC--A-G-TAATC-CAA-GAGAAA--TA--------A-TTCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TTCACA
gi|73732                      :                      GGAA----TGGCGAATTCGATAAAT-ACA-AGAATAATG-GCGACAATGC---G-GTTG-AATTAATACCGGCAACAGACAGTTTCCGA-C-CGTATTAACC-GGT-T----AATTGATCGTATC-AA---A------AAT--AAA-TTCA--T------T-T-------------------G--------TTGAG-G-A-CTATCA--TTTATCT-TCAAAGTTTT--C---TC----TAGTTT--ATAAATAG--C---A-C-AAA-----TA-CA--A----TG-CATAACACT--C-C-AGGTAAAT-ATT-CTAT--AAA-T--A---GA-TTG-AAGTTAAAAAAT-A-TAAATGTAATAA-GTGTG-----G--A-AAA-CGAAGAGA--A-G--ATT-AAA-A-TG---------------------------------------TA--------A-AT----AA-AG-T-C-CCAAT--TTCACA
gi|73733                      :                                  AA--CCGA---TT-ACG-G----ATTT-TG--CAAC-C---G-ATTA---------CCA-C------TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73734                      :                                  AA--CCGA---TT-ACG-G----AATT-TG--CAAC-C---G-ATTA---------CCA-C------TG--TTCCGA-C-CG-AGTAATC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73735                      :                                  AA--CCGA---TT-ATG-G----ATTT-TC--CAAC-C---G-ATTA-T-------C-----AC---TG--TTCGGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAT----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73736                      :                                  AA--CCGA---TT-ACG-G----AATA-AG--CAAC-C---G-ATTA---------CCA-C------TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73737                      :                                  AA--CCGA---TT-ACA-G----ATTT-TG--CAAC-T---G-ATTA-T-------C-----AC---TG--TTCCGA-C-CG-AGTAACC-GGT-T----AAC----CG-ATT-AA---A------A-
gi|73738                      :                                                 CA-A----AATT--T--CAAT-CAACG-GCTA-A-------TTG-AAAAT--CG--TTCCGA-C-CG-ATCTGCC-GGT-T----AAT----CGTATA-AA---A------A-T--A-A-TATA--C------C-TT-GC--G-ACA---T----G--------TTAAT-G-G-CT-TTC--ATTTTGT-C--AAGT---------TC----T-GTTT--CTG----GAAC---A-T-AAA--AA-GA-CA--A----T--CA--ACACA--C-C-AG-AAA-TAATTACA-T--GTT-T--A---TG-TTATAC-TTAGAAC--------------TAA-GGATG-A---G--AGAAA-CGACGAAA--G-GC-ATG-AATCA-TG--C----------GC--A-
gi|73739                      :                                                          ATT-GC--CAAT-C---G-GTTA-A-------TCG-CAACA--CG--TTCCGT-C-CG-ATTAACC-GGT-T----AAT----CGCATC-AC---A------A-T--ATA-TACA--T------T-TT--A--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTCT-C--TAGTTTT--T---TC----T-GTTT--ATA--T-G--C---A-C-GAA--AA-TG-CAACA----TG-CA--ACACT--C-C-AA-TAA-T-ATT-TT-T--C-T-T--A---TG-TT-----T-------------AATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CAAAAAAA--G-G--ATT-AAACA-TG--C----------AC--T-A-GAAAT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCA-AA-AG-T-T-CACAT--TTCACA
gi|73740                      :                                                           TT-GC--AACT-C---G-GCTA-A------------AAAA--C----T---A-C-CG-ATTAACC---T-T----AAT----AGTATC-AA---A------A-T--AAA-CACA--A------T-TT-GA--A-ACATATTA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCA--A-TTTCT-C--AAGTTTT--C---T
gi|73741                      :                                                                                A-A-------CCG-CAACA--CG--TTCCGA-C-CG-ATTAACC-GTT-TTTAAAAT----CGTATC-AA---A------A-T--ATA-TACA--T------G-TT-GC--G-ACA---TA---G--------TTGAT-G-G-CT-TCC--ATTT-CT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GCTT--ACA--T-G--CTCAA-A-AAA--AA-TA-AA--AAATATG-CA--ACACT--C-A-AG-TAA-T-CTT-CT-T----T-T--A---TG-ATG-AA-TTAGAACA--A-TAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAAGAAA--G-G--ATA-AAACA-TG--C----------AC--G-A-GACTT-GAA-GAGAAA--TA--------A-ATTCC-AA-TG-T-C-GAAAT--TT
gi|73742                      :                                                                                                                 -CG-ATTAACC-GGT-T----AGT----CGTATC-AA---ATT----A-C--ATA-TACA--T------T-TT-GA--G-ATA---TA---G--------TCGAT-G-G-CT-TCA--ATTTCTT-T--AAG-TTT--C---TTAAAGT-AATTAAACA--T-G--C---A-C-AAA--AA-T--CA--A----
gi|73743                      :                                                                                                                      TTAACC-GGT-T----AGT----CGTATC-AA---ATTATATA-T--ATA-TACA--T------T-TT-GA--A-ACA---TA---G--------TCAAT-G-G-CT-TCA--ATTTATT-C--AA
gi|73744                      :                                                                                                                                                     A---A------A-T--AC--CACA--T------T-TTCGA--A-ACA---TC---G--------TTGTA-G-G-CT-TCC--ATTT-CT-C--AAGTTTT--CCTCTC----T-GTTC--ATA--T-G--C---A-C-AAA--AAATA-GA--A----AG-CA---CACT--C-C-AG-TAA-T-ATT-CT-T--GTT-A--C---TG-GT--AA-TTA-AAT---A-CAAAT--AATAATATGTT-A---GA-A-AAA-CAAAGAAAAGG-A--ATT-AGATA-TG--C----------AC--G-A-tt
gi|73745                      :                                                                                                                                                                                                                              -CT-TCA--ATTT-CT-C--AAGTTTT--C---TC----T-GTT--------------------------AA-TA-CA--A----TG-CA--ACACT--C-C-AG-TAA-T-ACT-TT-T--TTT-
gi|73746                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T-CT-T--GTT-TTAA---TT-ATG-AA-TTAGAACA--A-GAAATGCAATAA-GTGTG-A---G--A-AAA-CGAATAAA--G-G--ATT-AAATA-TG--C----------AC--A-A-GACTT-CAA-GAGAAA--TA--------A-ATCCC-AA-AG-T-C-CAGAT--TT
gi|73747                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccAAGAAA--G-G--ATA-AACCA-TG--C----------AC--G-A-GACTT-CAG-GAGAAA--TAAATT----A-ATCCC-TA-AG-T-C-CAGAT--TCC
gi|73748                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAA--GTA--ATT-AAACA-TG--C----------AC--A-A-AAA-T-CAA-GAGCAAT-TA--------A-ATCCC-AA-AG-TAG-CAGAT--TTC