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Reference ( gi|3726 ) : CTCGTC--CTGGGATT--------CCGCTCTGC--CAA--A--------G-GTC--GTC--TGTATCT--T--CTCTC-C--------T----CC--A---T-G---GAGA-GA--------------GTGCCA-T-CCTCAAGGTCT-AAT---------TT---------CG-CCT----TACATCCTCGTAT------GAAGT-C----------TACACC-AAGC-AACATAGA------GTC---C-------T-------TCAAGGAAACCACATACA---TGT-----CC-AC-TCA-GATCCCCAGC-A-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCATTCAC---CA---GTCT--TTGCA--GGTAGG-CCCCGAAC------CCATAA-T--TGC-T--CT-GCGTATCCGCTTG
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Reference ( family-486 ) : CTCGTC--CTGGGATT--------CCGCTCTGC--CAA--A--------G-G--TC--GTC--TGTATCT---T--CTCT----C-C--------C-CC-A---T-G---GAGA-GA--------------GTGCCA-TGCTCCAGGTCT-AAT---------TT---------CG-CCT----TACATCCTCG-----CAGGAAGT-C----------TACACC-AAGC-AACA------TGGAGTC---C-------T-------TCAAGGGAGCCACATACAG---GT-----CC-AC-TCA-GATCCCCAGC-A-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTATCCACC-ACGG-NCTC--TGCA--GGTAGG-TCCTGAACCCG------TAA-T--TGC--NCT-GCGTATC-C-CTTTG
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Alignments
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Reference ( family-486 ) : CTCGTC--CTGGGATT--------CCGCTCTGC--CAA--A--------G-G--TC--GTC--TGTATCT---T--CTCT----C-C--------C-CC-A---T-G---GAGA-GA--------------GTGCCA-TGCTCCAGGTCT-AAT---------TT---------CG-CCT----TACATCCTCG-----CAGGAAGT-C----------TACACC-AAGC-AACA------TGGAGTC---C-------T-------TCAAGGGAGCCACATACAG---GT-----CC-AC-TCA-GATCCCCAGC-A-TGC-TCA-TTTCTGCCCCAGTATCCACC-ACGG-NCTC--TGCA--GGTAGG-TCCTGAACCCG------TAA-T--TGC--NCT-GCGTATCCCNTTG
gi|3726 : CTCGTC--CTGGGATT--------CCGCTCTGC--CAA--A--------G-G--TC--GTC--TGTATCT---T--CTCT----C-C--------T-CC-A---T-G---GAGA-GA--------------GTGCCA-TCCTCAAGGTCT-AAT---------TT---------CG-CCT----TACATCCTCG-----TATGAAGT-C----------TACACC-AAGC-AACA------TAGAGTC---C-------T-------TCAAGGAAACCACATACAT---GT-----CC-AC-TCA-GATCCCCAGC-A-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCATTCACC-A--G-TCTT--TGCA--GGTAGG-CCCCGAACCCA------TAA-T--TGC--TCT-GCGTATCCGCTTG
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gi|3734 : ctcgtcctggcagtccgctctgccaaaagtagtcttattctctccctccccccggagagaatgctatgccccatgtctaattttgccttgcattctcgcaggatgtatgtaccaagcaacatggagtccttcatggaagccacatacaggttcagctattgtacattcacccccacttggatggtgCTCATC--CTGGGAGT--------CCCCTCTGC--CAA--ACTGCCAAAA-G--TA--GTC--C-TATCT---T---TCA----C-C--------C-C------T-G---GAGA-GA--------------ATGCCA-TGTCTCAGGTCT-AGT---------TT---------TG-CTT----TACATTAACA-----CAGGGAGT-T----------TATACC-AAGC-AACA------TGGAGCC---C-------T-------TCAAGGGAGCTACATACAT---GT-----TC-A
gi|3735 : CTCGTC--CTGGGATT--------CCGATCTGC--CAA--A--------A-G--TC--GTC--TTTA
gi|3736 : CTCGCG--CTGGAGT----------CGCTCTGC--CAA--A--------G----TA--GTC--TTTATCT---T--CTCC----C-CACCCCCCCC-CC-ACCCT-G---GAGA-GA--------------ATGTAA-TGCCCCAGGTCT-AAT---------TT---------TGGTCT----TACATTCTCG-----CAGGCAGT-A----------T-TACC-AAGC-AACT------TGGAGTC---C-------T-------TCAAGAGAG-CACATACAG---GT-----TC-A
gi|3736 : TTCCCAGT-A-TGA-CTA-TTTCTGCCCTAGTATCCACC-ATGG-GCTC--TGCA--CGTAAG-GTCTGACCCTG------TAA-T--TGCA-ACT-GTATATCTCGTTGgctattgtaccataccccatggatgggattgcggcccccgcaataaatataatcatttcccagtatgactatttctgccctagtatccaccatgggctctgcacgtaaggtctgaccctgtaattgcaactgtatatctcgttg
gi|3737 : ctcgcgctggagtcgctctgccaaagtagtctttatcttctccccaccccccccccaccctggagagaatgtaatgccccaggtctaattttggtcttacattctcgcaggcagtattaccaagcaacttggagtccttcaagagagcacatacaggttcagctattgtaccataccccatggatgggattgcggcccccgcaataaatataatcatCTCGTC--CTCAGGTT--------CTGCTCTCC--TAA--A--------G-G--CC--ATG--TGCACGG---T--CTCT----C-CT-------C-CC-A---T-A---GAGA--------------------------TTCCAG-------T---------TT---------CG-CCT----TGCACCCTCG-----CAAGAAAT-C----------CACCCC-AAGC-AGTA------TTGGATC---C-------T-------TTAAGGGCGCTACGTATAG---GT-----CC-AT-T
gi|3738 : CTCGAC--CACAGGTT--------CCGTTACAA--CGA--A--------G-T--TC--ATG--TTAATGG---T--CTCC----C-C--------TTCC-A---G-A---CAGA-GA--------------GTGCCA-TGCTCTATGTCA-AGA---------TT---------TG-CCT----TGCGCCCACG-----CAAGAATT-C----------CACTCC-AAGC-AG------------------C-------T-------TTAAGGGTGCCACGTATAG---GT-----CC-A
gi|3739 : TCGTC--CTAGGATT--------CCACTCTGC--CAA--A--------A-A--TC--GTC--TTTATCT---T--CTCT----C-T--------C-T--A---T-G---GGGA-GA--------------GTAACA-TGCACCATGTCT-AAT---------TT---------TG-CCT----TACATCCTCG-----CAGGAAGT-C----------TACACC-AAGC-AACA------TCGAGTC---A-------T-------TCAAGGGAGCCACATACAT---GT-----CC-A
gi|3739 : T-----CC-AC-TCA-T-TCCCTAGT-A-TGC-TAA-TTTATGCCCCAGTATACACC-ACGA-GCTC--TGCA--GGTAGC-TCCTAAACTCG------TAA-T--TGC--ACT-GTATATCTCGTTGatttttggacaccccccccacttagatagagaatgggcccgcagtcatccactcattccctagtatgctaatttatgccccagtatacaccacgagctctgcaggtagctcctaaactcgtaattgcactgtatatctcgttg
gi|3740 : tcgtcctaggattccactctgccaaaaatcgtctttatcttctctctctatggggagagtaacatgcaccatgtctaattttgccttacatcctcgcaggaagtctacaccaagcaacatcgagtcattcaagggagccacatacatgtccaatttttggacaccccccccacttagatagagaatgggcccgcagtcaTCGTCGTCTGGGGTTTATTTCTACCGCTCTGCTACAACGA--------GTG--CC--ATTCTTGTATCTCA-T--CTCTCCTCC-C--------C-CC-A---TGG---GAGAGGA--------------GTGC
gi|3740 : CAGGTCT-AAT---------TTATGGTGTTTTG-CATATATTACATCTTCG-----CATGAAGT-CGGTAACGCAACACGCC-ATGCAAACATAGAATTGGGGTC---CT------T-------TCGAGGGAACC-CATACAATTTGTGCTGACC-ACTTCACAACCTTCAGCAA-TGC-TCA-TTCTT--TCCAGCATCAACTAATAA-TGTT--TGCATCGGTAGGTTTCTGAACCCGTTGCCATAA-TTCTGCTGACTAGCGTATCGCCTTtccactgttgttgtcgctcgcctccggatggtaagactcaggtctaatttatggtgttttgcatatattacatcttcgcatgaagtcggtaacgcaacacgccatgcaaacatagaattggggtcctttcgagggaacccatacaatttgtgctgaccacttcacaaccttcagcaatgctcattctttccagcatcaactaataatgtttgcatcggtaggtttctgaacccgttgccataattctgctgactagcgtatcgccttt
gi|3741 : tcgtcgtctggggtttatttctaccgctctgctacaacgagtgccattcttgtatctcatctctcctccccccatgggagaggagtgctccactgttgttgtcgctcgcctccggatggtaagactCGTC--CTGGGATT--------CCACTCTTC--AAA--A--------T-G--TC--GTC--TGTATCT---T--CTCT----C-C--------T-CC-A---T-G---GAGA-GA--------------ATGCCA-TGCTCAAGGTCT-AAT---------AT---------CG-CCT----TACATCCTCG-----CATGAAGT-C----------TACACC-AAGC-AACA------TAGAGTC---C-------T-------TCAAGGGAACCACATACAT---GT-----CC-AC-TCA-GATCCCCAGC-A-TGC-TCA-TTTCTGTCCCAGCATACACC-ACAG-TCTT--TACA--GGTAGG-TTCTGAACCCA------TCA-T--TGC--TCA-GCGTATCCCTTTGt
gi|3742 : CGTC--CTGGGATT--------CCACTCT-T--CAA--A--------T-G--TC--GTC--TGTATCT---T--CTCT----C-C--------T-CC-A---T-G---GAGA-GA--------------ATGCCA-TGCTCAAGGTCT-AAT---------AT---------CG-CCT----TACATCCTCG-----CATGAAGT-C----------TACACCAAAGC-AACA------TAGAGTC---C-------T-------TCAAGGGAACCACATACAT---GT-----CC-AC-TCA-GATCCCCAGC-A-TGCTTCA-TTTCTGTCCCAGCATACACC-ACAG-TCTT--TACA--GGTAGG-TCTGAAACCCA------TTC-A--TGC--TCA-GCGTATCCTT
gi|3743 : TC--CTGGGATT--------CCCCTCTGC--CAA--A--------C-ACATCCAGTC--TGTATAT---T--CTCT----C-T--------C-CC-A---T-GGAAGAAA-GA--------------GTGTCACTGCTCCAG
gi|3744 : TC--CTGGGATT--------CCCCTCTGC--CAA--A--------C-ACATCCAGTC--TGTATAT---T--CTCT----C-T--------C-CC-A---T-GGAAGAAA-GA--------------GTGTCACTGCTCCAG
gi|3745 : T--------CCGCTCTGC--CAA--A--------A-G--TA--GTC--T-TATCT---TTCCCCC----C-C--------C-CC-C---T-G---AAAA-GA--------------ATGCTA-TGCCCCAGGTCA-AAC---------TT---------TG-CCT----TACATTCTCG-----CAGGAAGT-A----------TGTAC
gi|3746 : CT---T--CTCT----C-C--------C-CCCA---T-A---GAGA-GAATATCATGTTCCAGGTTCCG-TGCTCCAGGTTC-AAT---------TT---------GG-TCT----TACACCCTATATTATCAAGATGT-C----------TATACA-AAGC-AACA------TGGAGTC---C-------T-------TCAAGAGAGCCATATGCAG---GT-----CCAAC-TC
gi|3747 : T----C-C--------C-CC-A---T-G---GAGA-AA--------------GTGCCA-CGCTCCAGGTTT-AAT---------TT---------CG-CCT----TACATTCTCG-----AAAGGAATAC----------TACACC-AAGC-AACA------CAGAGTC---C-------T-------TCAAGGGAGCCACGTTCAG---GT-----CC-A
gi|3747 : A------TGGAG-----------------------AATGGACCCACA-ATAA---AT-----CC-AC-TCA-G-TCCCCAGT-G-CGC-TCA-TTTCTGCCCCACTGTCCACC-ATGG-CCTC--CACA--GGTACG-TCCTGAACCCG------TAA-T--TGC--ACT-GTGAATCTCactattggacattctcccccacttggatggagaatggacccacaataaatccactcagtccccagtgcgctcatttctgccccactgtccaccatggcctccacaggtacgtcctgaacccgtaattgcactgtgaatctc
gi|3748 : tcccccatggagaaagtgccacgctccaggtttaatttcgccttacattctcgaaaggaatactacaccaagcaacacagagtccttcaagggagccacgttcaggtccaactattggacattctcccccacttgg-C--------C-CC-C---T-G---GAGA-GA--------------ATGACA-TGCCCCAGGTCT-GGTCTTATTTTTTT---------TG-CCT----TACATTTTCC-----CAGGAAGT-C----------TATACC-AAAC-AACA------TGGAGTC---C-------T-------TCAAGGGA
gi|3749 : -CC-A---T-G---GAGA-GA--------------GTGCCA-TGCTC---------------------T---------TG-CCT----TACATCATCA-----CAGGAAAT-A----------CACACC-AAGC-AACA------TGAAGTC---C-------T-------TCAAGGAATCCACATACAG---GT-----C
gi|3749 : CCGCA-ATAA---AT-----CC-AA-TCA-G-TCCCCAGA-A-TGC-TAA-TTTCTAACCCAGTATCCACC-ACGG-GCTC--TGCA--GGTAGG-CCCTGAA-CCG------TTA-T--TGC--ACT-GCATATCTCGTTGgaactactgaacacccccccccggatggaaaattggcccgcaataaatccaatcagtccccagaatgctaatttctaacccagtatccaccacgggctctgcaggtaggccctgaaccgttattgcactgcatatctcgttg
gi|3750 : ccatggagagagtgccatgctcttgccttacatcatcacaggaaatacacaccaagcaacatgaagtccttcaaggaatccacatacaggtcgaactactgaacacccccccccggatggaaaattggc-GA--------------ATGCCA-TGCTCAAGGTCT-AAT---------AT---------CG-CCT----TACATCCTCG-----CATGAAAT-C----------TACACC-AAGC-AACA------TAGAGTC---CAACTCAGTCCA----TCAAGGAAACCACATACAT---GT-----CC-AC-TCA-GATCCCCAGC-A-TGC-TCA-TTTCTATTCCAGCATTCACC-ACAT-TCTT--TGCA--TGTAGG-TTCTGAACCCA------TAA-T--TGC--TCA-GCGTATCCATTT
gi|3751 : -GA--------------ATGCCA-TGCTCAAGGTCT-AAT---------AT---------CG-CCT----TACATCCTCG-----CATGAAAT-C----------TACACC-AAGC-AACA------TAGAGTCCAAC-------TCAGTCCATCAAGGAAACCACATACAT---GT-----CC-AC-TCA-GATCCCCAGC-A-TGC-TCATTTTCTATTCCAGCATTCACC-ACAT-TCT---TGCA--TGTAGG-TTCTGAACCCA------TAA-T--TGC--TCA-GCGTATCCACTT
gi|3752 : -AAGC-AACA------TGGGGTC---C-------T-------TCAAGGGAGCCACATACAG---GC-----CCAAC-TCt
gi|3753 : ---GT-----CC-AC-TCA-GATCTCCAGC-A-TGC-TCA-TTTCTGTTCCAGCATTTACT-ACAG-TCTT--TGCA--GGTAGG-CCCTGAATCCA------TAA-T--TGC--TCT-GCGTATCCCTTTG
gi|3754 : atTTCCAAGA-A-CAC-TCA-CCTCTGCCCCAGTATCCACC-ACAG-CCTC--CGCA--GGTAGG-TTCTGAACCCG------T-A-T--TGC--GCT-GAGTATCCCATTG
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gi|3756 : atgtactgctctgT-----CT-AC-TCA--ATCCCCATT-A-TAT-TCA-TTT-TGCTCCAGTATCCACC-AAGG-GCTTCTTGCA--GATAGG-TCCTGGACCTG------TAT-T--TGC--ATT-GCGT
gi|3757 : C-TCA-G-TTCCCAGT-A-TGC-TAA-TTTCTGCCCCAGTAGCCACC-ACAG-GATC--TGCA--AGTAGG-TCCCGAGCTCG------TAATT--TAC--ACT-GCATAT
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gi|3759 : TCCCAAGT-A-CGC-TTA-CCACTGCCCCGGTGTCCACC-ACTG-CCTC--CACA--GGTAGA-TCCTGGACTCG------TAG-T--TTC--ACC-ACGTATCC
gi|3760 : CCCCAGC-A-TGC-TCA-TTTATGTTCCAGCATTCACC-A--G-TCTT--TGCA--AGTAGG-TCCTGAACCCA------TAA-T--TGC--TCT-GCGTATCCCTTTG