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lowQualScore : . .. . . . .... .... . . . .... ......... ......... . .... .. .............. .. .... .... ... . .. . . ...... .. . . .. ... . ... . . . .... . . . .. . . . .
lowQualScore : 5 77 5 4 4 1111 9999 0 7 3 2222 222222222 666666666 2 4444 55 11111111111111 66 9999 4444 111 1 77 1 1 333333 88 5 2 66 222 2 555 4 4 4 4444 5 3 3 88 9 3 3 4
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Reference ( family-484 ) : TTTTA-AAA--CTT-GA-G-TCC--G-G----GGA-CT-C----ACGA---------TT---------T-TT----G--G--------------AAAGGTT--GC----GT----CCC---A-G--C-T-AAA------TTTGA--TG-AG-T--CCC---A-G---A-A-CAA-T--A-AG-G-C-T--G-A-GTCC-CG-ATT
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gi|87725 : --------------AAAGGTT--GC----GT----CTC---A-G--C-T-AAA------TTTGG--TG-AG-T--CCC---A-A---A-G-C-A-T--ATAG-G-A-T--G-T-ATCC-C
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gi|87726 : TT--GC----GT----CTT---A-GG-C-T-ACACAGTACTTAGAA-TG-AG-T--CCA---A-G---A-A-CAA-T--A-AG-C-C-C--G-A-GTCC-CG-AT