lowQualScore                  :                                                       2222222222        333333                                      3333333333333333                                                                           111             11         11                                                                                   
lowQualScore                  :      2 2   33   66     33 7777777     222     444 2   0000000000 2   5  777777      2 55555      66666   2   77     6666666666666666  2    2  2     2      4 1 22 555555 22     44444      1  22  11    88 11  444 1  11   1 1 33    2    11 1   555 99999999  1    1  333     22   3  11   1 7     8888 1  1 1 222 2    1     
lowQualScore                  :      . .   ..   ..     .. .......     ...     ... .   .......... .   .  ......      . .....      .....   .   ..     ................  .    .  .     .      . . .. ...... ..     .....      .  ..  ..    .. ..  ... .  ..   . . ..    .    .. .   ... ........  .    .  ...     ..   .  ..   . .     .... .  . . ... .    .     
lowQualScore                  :      5 5   22   55     22 6666666     555     111 4   1111111111 5   0  222222      4 99999      77777   7   33     6666666666666666  5    2  2     1      0 8 55 222222 55     55555      4  00  99    22 88  444 3  88   3 3 77    8    00 3   555 00000000  3    3  777     11   8  77   5 4     8888 5  5 5 777 2    7     
consensus                     : AAAAA-A-ATC--AGA--ATTTC--G-------ATAAAAA-TGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAAT-A-----AGATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT-AAAAAA-A-A--T------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GA-TT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
Reference ( gi|83394 )        : AAAAA-A-ATC--AGA--ATTTT--G-------ATAAAAA-TGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TG------AGAAAT-A-----AGATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT-AAAAAA-A-A--T------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GA-TT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83393                      : AAAAATA-ATT--AGA--ATTTT--G-------ATAAAAA-TGTTT---T-GAG------CGG-T-AAA-TGC-----AGAAA--A-----AGATTT-----TCG-GTC--GGTCG---------------CAA-CAGA-AA-TGAAT-AAAAAA-A-A--T------A--TGACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--AG-AT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83395                      : AAAAA-A-ATC--AGA--ATTTT--G-------ATAATGA-TGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAAT-A-----AGATTT-----TCG-GTC--GGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGA-T-AAAA-A-A-A--T------A--TCACC-----AGGT-A-AT--AC--AAATA-A--AA--GA-TT--TTC-A-G--TCGGAACAA--A-TTT---A--C-----T--GGTCGGG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83398                      : AAAAA-A-TTC--AGA--ATTTT--G-------ATAAAA--TGTTT---TTGAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAAT-A-----AGATTT-----TCGTGTC--GGTCGC---------------AA-CAAA-AA-TGAAT-AAAAAA-A----T------A--TCAC------TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--AG-TT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TC-GG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--ATTT-T-T---AATTTA-GGC
gi|83397                      : AAAAA-ATATC--AGA--ATTTC--G-------ATAAAAAATGTTT-----GAG------C-GGT-AAAATGC-----AGAAAT-A-----AGATTT-----TCG-GTC--GGTCG---------------CAA--AGA-AA-TGAAT-AAAAAA-A-A--T------A--TCACC-----TGGTAATAT--AC--AAGT--A--AA--AG-AT--TTC-A-G--TC-GAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GGT--TCGGG--AGACCGC-AAA-C-AAACA-A--A-TT-T-T---AATTTA-GGCC
gi|83399                      : AAAAA-A-ATC--AGA--ATCTC--G-------ATAAAAA-TGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA------------AAC-A----------------------C--GGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGAAT-AAAAAA-A-A--T------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAATTAA--AA--AA-AT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83396                      : AAAAA-A-ATC--AGA--ATTTC--G-------ATAAAAA-TGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAAA-A-----AGATTT-----TCG-GTA--GGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGAAT-AAAAAA-A-AAAT------A--CCACC-----TGGTAT-AA--AC--AACT--A--AA--AAATT--TTC-C-G--TAAAAACAA--A-TTT---A--C-----CA-GGCC-GG---TCGGG--AAACCAC-AAA-C-AAAAACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGACT
gi|83400                      : AAAAA-A-ATC--AGA--ATTTT--G-------ATAAAAA-TGTTT---T-GAT------C-----AAA-TG------CAAAATAA-----AGATTT-----TCG-GTC--GGTTTG--------------CAA-CAGA-AA-TGAATAAAAAAA-A-A--T------A--TCAAC-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GA-TT--TTC-A-G--TC-GAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAA-CGCAAAA-C-AA--GGA--A-TT-T-T---
gi|83401                      : AAAAC-A-ATC--AGA--ATCTTCGG-------ATAAA---TGGTT---T-GTA------T-C-T-AAAGTGCCATTTGGAAAT-A-----AGATTTCGTCGTTG-ATCTGGGACGC---------------AA-CAGATAA-TAAA--AAAAAA-A-A--T------A--TCACC-----TGGTAA-ATTTAC--AAAT--A--AAA-GA-TT--TCC-GCG--TCCAGACGA--A-TT----A--C-----GG-GGTC-GG---TCGG----AACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCTtttcaaaccaacgaccgcaaacaaacacaattttgatttaggcct
gi|83402                      : AAAAA-A-ATC--AGA--ATTTT--ATGAATATATATATA-TGTTTAGGT-CAGGATTATT-G-T-CAT-TG------AGAGAG-AGAGGGAGAT-----------GTC--GGTCCG--------------CAA-CAGA-AAATGAAT-AAAAAACA-A--T------A---CACC-----T-GTAA-AT--A---AAAT--AGGAA--GA-TT--TTC-A-G--TCGAAACGA--A-TTT---A--C-----TGAGGTC-GGGTCCCGGG--AAACCGC---G-C-AAACAAA--A-TT-TAA---AATTTATGGTCT
gi|83404                      : AAAAA-A-ATC--AGA--ATTTT--G--------TTAAAA-TGTTT---T-AAG------CGG-T-AAA-TGC-----AGAAAT-A-----A
gi|83405                      : AAAAA-A-ATC--TGA--ATTTC--G-------ATAAAAA-TGTTT---T-GAG------C-G-
gi|83403                      : AAAAA-A-ATC--AGA--ATTTC--G-------ATTTAAA-TGTTT---T-GAG------CGG-T-ATA-TGC-----AGAAAT-A-----AGg
gi|83406                      :  AAAG-A-ATC--CGA--ATTTC--G-------ATAAAAA-TGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAAT-A-----AGATTT-----TCG-GTC--GGTCG---------------CAA-CAGA-AA-TGAAT-AAAAAA-A-A--T------A--TCACT-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GA-TT--TTC-A-G--TCGAAACGA--A-TTT---A--C-----TC-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AA-TTA-GGCC
gi|83407                      :    AA-A-ATC--AGAGAATTTC--G-------ATAAAAA-TGTTT---T-GAG------C-G-TTAAA-TGC-----AGACAT-A-----AGATTT-----TCG-GTC--GGTTG---------------CAA-CAGC-AA-TGAAT-AAAAAG-A-A--T------A--TTATC-----TGGTGA-AT--AC--AAATA-A--AA--GA-TT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83408                      :    AA-A-ATC--AGAGAATTTC--G-------ATAAAAA-TGGTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TAC-----ATGAAT-A-----AGATTT-----TCG-GTC--GGTCGCAACACGGTCGGCCGCAA-AAGC-AA-TGAAT-AAAAAA-A----T------A--TTACC-----TGGTAA-AT--AC--GAAT--A--AA--AA-TT--TTC-A-G--TCGGAAC-A--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TC-GG--AAACCGC-AAA-C-AA--ACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83409                      :    AA-A-ATCGGAGA--ATTTC--G-------ATAAA--------------------------T-AAA-TGC-----AGAAAT-A-----AGATTT-----TCG-GTA--GGTCG----------------------------GAAC-AAGGAA-A-A--TATATACA--TTACG-----CAGTAA-AC--AC--AAAT--
gi|83410                      :            --AGA--ATTTC--G-------ATCAA-----CTG---T-GAG------C---T-AA--TGC-----AGAAAT-A-----AGATTT------CG-GTC--GGTCGC--------------AAAGC-----A-TGAAT-TAAAAA-A-A--T------A----ACG-----TGGC-A-AT--AC----AT--A--CA--GA-TG--TTC-A----TCGGGA--A--A-TTT---G--C-----TG-GGT---G---TCGGA--AA---GC-GAA-C----CA-A--A-TTAT-T---AATT
gi|83411                      :                                                                                  AAT-A-----GCATTT-----TCA-GTCCCGGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGA-T-AAAA-A-A-A--T------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GA-TT--TTCAA-G--TCGG-ACGA--A-TTT---A--C-----TG-GG---GG---TCGG
gi|83412                      :                                                                                                                      --------------CAG-CAAA-AA-AAAAA-AAAAAA-A-A--T------AGATCGCTGATTTTGGAAA-A-------AAAT--A--A-------T--TTC-A-G--TCGG--CGG--T-TTTT--A--A-----TG-GGTC-GG---TCGGG--TAA--GG-GAA-C-AAAC-CT--A-TT-T-T---AATTT--GGCCT
gi|83413                      :                                                                                                                                          GA-AA-TAAAT-AAAATATATA--T------A--TTACG-----TGGTAA-AC--AA--AAAT--A---------TT--TTC-A-G--TTGGTACAA--A-TTT---A--CAGTAATG-GGTC-GG---TCGGC--ACATCTC-GGA---AAACCCA--A-TT-
gi|83414                      :                                                                                                                                           A-AA-TGAAT-TAAACA-A----T------A--TTGCC-----ACGTAA-AC--AC--AAA-------A--TA-TT--TTC-T-G--TAAGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---T
gi|83415                      :                                                                                                                                                  AAT-AAAAAA-A-A--A------A--TAGAT-----TGCTGA-TT--TTTGAAAA--A--AA--TA-AT--TTC-A-G--TCGG--CGG--A-TTTTA-A--A-----TG-G-TC-GG---TCGGG--TAAGGGG-AAA-C-AAAC-TA--A-TT-T-TTACAATTTT-GGCCT
gi|83416                      :                                                                                                                                                       AAATA-T-A--T------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAA-------A--TA-TT--TTC-A-G--TTGTTGCGA--A-TTC---A--A-----TG-AGTC-GG---TCGG
gi|83417                      :                                                                                                                                                              -A--T------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAAC--A--AA------T--TTC-A-G--CTGGTACGA--AATTT---A--C------G-GGTC-GG---TCGGA--AAATCTC-AGA---AAACCAA--A-TT-T-C---AAT
gi|83418                      :                                                                                                                                                              -A--T------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAAT---------TA-TT--TTC-A-C--TGGGCACGA--A-TTT---A--A-----TG-GGTC-GG---CCGG
gi|83421                      :                                                                                                                                                                                          AA-AT--TC--AAAT--A--AA--AA-TG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83420                      :                                                                                                                                                                                          AA-AT--TC--AAAT--A--AA---A-TG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83419                      :                                                                                                                                                                                          AA-AT--TC--AAAT--A--AA---A-TG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83422                      :                                                                                                                                                                                          AA-AT--TC--AAAT--A--AA---A-TT--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTT-GG---TCAGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACACA----TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83423                      :                                                                                                                                                                                          AA-AT--AT--AA-T--A--AAATGA-TT----C-A-GG-TCAGA-CGT--A-TTTTTTC--C-----TG-G-TA-GG---TCGGG--GAGCCGG-AAA-C-ACACATT--A-TT-T-T---A--TTA-GGCCT
gi|83424                      :                                                                                                                                                                                           A-AT--TC--AAAT--A--AA---A-TC--TTT-A-GGGTCGGAGCAATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGGTTAGA--GG-AAA-CTGAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83425                      :                                                                                                                                                                                                  C--AAAT--A--AA---A-TG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A-----------GGTC-GG---TCGGT--GTAGCGG-AAATC-AAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83426                      :                                                                                                                                                                                                      AAT--A--AA---A-TTCTTTC-G-G--TCGCAGCGA--T-TTT---T--T-----CG-GGTC-GG---TCGGG--ATTTGGG-AAA-C-AAACAAT--A-TT-T-T---ATTTTA-GGTC
gi|83427                      :                                                                                                                                                                                                      AAT--A--AA--TT-TA--TTC-A-GG-TCGGA-CGC--A-TTT---TTTC-----CA-GGTA-GG---TCGGG--GAGCCGG-AAA-C-ACACATATTA-TT-T-T---A--TTA-GGCCT
gi|83400                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  atACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---GATTTA-GGCCT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                     111                                                    3333333333333333                                                                           111            11         11                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                              2 2   33   66  2    9999999  2   1      333 2   666666 666 4   2   55555       55555 2     66666   2   66     1111111111111111  2    2  2     22    1  3 1  555555 22     44444      1  11  11    99 11  333   11   1 1 33    2    00 1   555 88888888  1    1  333     22   3   1   1 7     7777 1  1 1 222 1    1     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                              . .   ..   ..  .    .......  .   .      ... .   ...... ... .   .   .....       ..... .     .....   .   ..     ................  .    .  .     ..    .  . .  ...... ..     .....      .  ..  ..    .. ..  ...   ..   . . ..    .    .. .   ... ........  .    .  ...     ..   .   .   . .     .... .  . . ... .    .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                              4 4   11   11  2    4444444  2   4      999 2   444444 111 7   4   99999       66666 2     22222   5   99     8888888888888888  4    1  1     88    9  8 7  000000 44     33333      4  99  88    22 88  666   88   3 3 22    4    66 3   333 44444444  3    3  555     00   3   4   4 1     8888 4  4 5 666 8    7     
consensus                     :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
Reference ( family-483 )      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83393                      :                                                                                                                                                                                         AAAAATA-ATT--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAA-A-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TGACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--AGAT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83394                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TG------AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83395                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG-------AT-AATGATGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGA-T--AAAA--A-A-AT------A--TCACC-----AGGT-A-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACAA--A-TTT---A--C-----T--GGTCGGG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83396                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------CGG-T-AAA-TGC-----AGAAAAA-----A-GATTT-----TCG-GTA--GGTCG---------------CAA-CAGA-AA-TGAATAAAAAA-AA-A-AT------A--CCACC-----TGGTAT-AA--AC--AACTA-A--AA--AATT--TTC-C-G--TAAAAACAA--A-TTT---A--C-----CA-GGCC-GG---TCGGG--AAACCAC-AAA-C-AAAAACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGACT
gi|83397                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-ATATC--AGA--AT-TTCG-------ATAAAAAATG-TT---T-GAG------CGG-TAAAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCG---------------CAA--AGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAATAT--AC--AAGT--A--AA--AGAT--TTC-A-G--TC-GAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GGT--TCGGG--AGACCGC-AAA-C-AAACA-A--A-TT-T-T---AATTTA-GGCC
gi|83398                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-TTC--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAA-TGTTT---TTGAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCGTGTC--GGTCGC---------------AA-CAAA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A--T------A--TCAC------TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--AGTT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TC-GG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--ATTT-T-T---AATTTA-GGC
gi|83399                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-CTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G--------GT-----AAAAACA------------------CG-GTC--G-------------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAATTAA--AA--AAAT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83400                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAT------C-----AAA-TGC-----A-AAATA-----AAGATTT-----TCG-GTC--GGTTTG--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAAAAA-A-AT------A--TCAAC-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TC-GAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAA-CGCAAAA-C-AA--GGA--A-TT-T-T---
gi|83400                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---GATTTA-GGCCTtttcaaaccaacgaccgcaaacaaacacaattttgatttaggcct
gi|83401                      : aaaaaaatcagaattttgataaaaatgttttgatcaaatgcaaaataaagattttcggtcggtttgcaacagaaatgaataaaaaaaaatatcaactggtaaatacaaataaaagattttcagtcgaacgaatttactgggtcggtcgggaaacgcaaaacaaggaatttttttcaaaccaacgAAAAC-A-ATC--AGA--ATCTTCGG------AT-AAA--TGGTT---T-GTA------T-C-T-AAAGTGCCATTTGGAAATA-----A-GATTTCGTCGTTG-ATCTGGGACGC---------------AA-CAGATAA-TAAA---AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-ATTTAC--AAAT--A--AAA-GATT--TCC-GCG--TCCAGACGA--A-TT----A--C-----GG-GGTC-GG---TCGG----AACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83402                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTATGAATATAT-ATATATGTTTAGGT-CAGGATTATT-G-T-CAT-TG------AGAGAGAGAGGGA-GAT-----------GTC--GGTCCG--------------CAA-CAGA-AAATGAAT--AAAA-AACA-AT------A---CACC-----T-GTAA-AT--A---AAAT--AGGAA--GATT--TTC-A-G--TCGAAACGA--A-TTT---A--C-----TGAGGTC-GGGTCCCGGG--AAACCGC---G-C-AAACAAA--A-TT-TAA---AATTTATGGTCT
gi|83403                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-TTAAATGTTT---T-GAG------CGG-T-ATA-TGC-----AGAAATA-----A-G
gi|83404                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG--------T-TAAAATGTTT---T-AAG------CGG-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-
gi|83405                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--TGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-
gi|83406                      :                                                                                                                                                                                          AAAG-A-ATC--CGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCG---------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACT-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGAAACGA--A-TTT---A--C-----TC-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AA-TTA-GGCCg
gi|83407                      :                                                                                                                                                                                            AA-A-ATC--AGAGAAT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-TTAAA-TGC-----AGACATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTTG---------------CAA-CAGC-AA-TGAAT--AAAA-AG-A-AT------A--TTATC-----TGGTGA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83408                      :                                                                                                                                                                                            AA-A-ATC--AGAGAAT-TTCG-------AT-AAAAATGGTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TAC-----ATGAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGCAACACGGTCGGCCGCAA-AAGC-AA-TGAAT--AAAA-AA-A--T------A--TTACC-----TGGTAA-AT--AC--GAAT--A--AA--AATT--TTC-A-G--TCGGAAC-A--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TC-GG--AAACCGC-AAA-C-AA--ACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83409                      :                                                                                                                                                                                            AA-A-ATCGGAGA--AT-TTCG-------AT-AAA-------------------------T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTA--GGTCG----------------------------GAAC--AAGG-AA-A-ATATATACA--TTACG-----CAGTAA-AC--AC--AAAT--
gi|83410                      :                                                                                                                                                                                                    --AGA--AT-TTCG-------AT-CAA----CTG---T-GAG------C---T-AA--TGC-----AGAAATA-----A-GA-TT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------AAAGC-----A-TGAAT--TAAA-AA-A-AT------A----ACG-----TGGC-A-AT--AC----AT--A--CA--GATG--TTC-A----TCGGGA--A--A-TTT---G--C-----TG-GGT---G---TCGGA--AA---GC-GAA-C----CA-A--A-TTAT-T---AATT
gi|83411                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         AATA-----G-CATTT-----TCA-GTCCCGGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGA-T--AAAA--A-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTCAA-G--TCGG-ACGA--A-TTT---A--C-----TG-GG---GG---TCGG
gi|83412                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --------------CAG-CAAA-AA-AAAAA--AAAA-AA-A-AT------AGATCGCTGATTTTGGAAA-A-------AAAT--A--A------T--TTC-A-G--TCGG--CGG--T-TTTT--A--A-----TG-GGTC-GG---TCGGG--TAA--GG-GAA-C-AAAC-CT--A-TT-T-T---AATTT--GGCCT
gi|83413                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GA-AA-TAAAT--AAAA-TATATAT------A--TTACG-----TGGTAA-AC--AA--AAAT--A--------TT--TTC-A-G--TTGGTACAA--A-TTT---A--CAGTAATG-GGTC-GG---TCGGC--ACATCTC-GGA---AAACCCA--A-TT-
gi|83414                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-AA-TGAAT--TAAA-CA-A--T------A--TTGCC-----ACGTAA-AC--AC--AAA-------A--TATT--TTC-T-G--TAAGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---T
gi|83415                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAT--AAAA-AA-A-AA------A--TAGAT-----TGCTGA-TT--TTTGAAAA--A--AA--TAAT--TTC-A-G--TCGG--CGG--A-TTTTA-A--A-----TG-G-TC-GG---TCGGG--TAAGGGG-AAA-C-AAAC-TA--A-TT-T-TTACAATTTT-GGCCT
gi|83416                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAA-TA-T-AT------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAA-------A--TATT--TTC-A-G--TTGTTGCGA--A-TTC---A--A-----TG-AGTC-GG---TCGG
gi|83417                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AT------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAAC--A--AA-----T--TTC-A-G--CTGGTACGA--AATTT---A--C------G-GGTC-GG---TCGGA--AAATCTC-AGA---AAACCAA--A-TT-T-C---AAT
gi|83418                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AT------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAAT---------TATT--TTC-A-C--TGGGCACGA--A-TTT---A--A-----TG-GGTC-GG---CCGG
gi|83419                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA---ATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83420                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA---ATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83421                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA--AATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83422                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA---ATT--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTT-GG---TCAGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACACA----TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83423                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--AT--AA-T--A--AAATGATT----C-A-GG-TCAGA-CGT--A-TTTTTTC--C-----TG-G-TA-GG---TCGGG--GAGCCGG-AAA-C-ACACATT--A-TT-T-T---A--TTA-GGCCT
gi|83424                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-AT--TC--AAAT--A--AA---ATC--TTT-A-GGGTCGGAGCAATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGGTTAGA--GG-AAA-CTGAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83425                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C--AAAT--A--AA---ATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A-----------GGTC-GG---TCGGT--GTAGCGG-AAATC-AAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83426                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAT--A--AA---ATTCTTTC-G-G--TCGCAGCGA--T-TTT---T--T-----CG-GGTC-GG---TCGGG--ATTTGGG-AAA-C-AAACAAT--A-TT-T-T---ATTTTA-GGTC
gi|83427                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAT--A--AA--TTTA--TTC-A-GG-TCGGA-CGC--A-TTT---TTTC-----CA-GGTA-GG---TCGGG--GAGCCGG-AAA-C-ACACATATTA-TT-T-T---A--TTA-GGCCT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                     111                                                    3333333333333333                                                                           111            11         11                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                              2 2   33   66  2    9999999  2   1      333 2   666666 666 4   2   55555       55555 2     66666   2   66     1111111111111111  2    2  2     22    1  3 1  555555 22     44444      1  11  11    99 11  333   11   1 1 33    2    00 1   555 88888888  1    1  333     22   3   1   1 7     7777 1  1 1 222 1    1     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                              . .   ..   ..  .    .......  .   .      ... .   ...... ... .   .   .....       ..... .     .....   .   ..     ................  .    .  .     ..    .  . .  ...... ..     .....      .  ..  ..    .. ..  ...   ..   . . ..    .    .. .   ... ........  .    .  ...     ..   .   .   . .     .... .  . . ... .    .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                              4 4   11   11  2    4444444  2   4      999 2   444444 111 7   4   99999       66666 2     22222   5   99     8888888888888888  4    1  1     88    9  8 7  000000 44     33333      4  99  88    22 88  666   88   3 3 22    4    66 3   333 44444444  3    3  555     00   3   4   4 1     8888 4  4 5 666 8    7     
consensus                     :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
Reference ( family-483 )      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83393                      :                                                                                                                                                                                         AAAAATA-ATT--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAA-A-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TGACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--AGAT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83394                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TG------AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83395                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG-------AT-AATGATGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGA-T--AAAA--A-A-AT------A--TCACC-----AGGT-A-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACAA--A-TTT---A--C-----T--GGTCGGG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83396                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------CGG-T-AAA-TGC-----AGAAAAA-----A-GATTT-----TCG-GTA--GGTCG---------------CAA-CAGA-AA-TGAATAAAAAA-AA-A-AT------A--CCACC-----TGGTAT-AA--AC--AACTA-A--AA--AATT--TTC-C-G--TAAAAACAA--A-TTT---A--C-----CA-GGCC-GG---TCGGG--AAACCAC-AAA-C-AAAAACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGACT
gi|83397                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-ATATC--AGA--AT-TTCG-------ATAAAAAATG-TT---T-GAG------CGG-TAAAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCG---------------CAA--AGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAATAT--AC--AAGT--A--AA--AGAT--TTC-A-G--TC-GAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GGT--TCGGG--AGACCGC-AAA-C-AAACA-A--A-TT-T-T---AATTTA-GGCC
gi|83398                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-TTC--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAA-TGTTT---TTGAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCGTGTC--GGTCGC---------------AA-CAAA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A--T------A--TCAC------TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--AGTT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TC-GG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--ATTT-T-T---AATTTA-GGC
gi|83399                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-CTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G--------GT-----AAAAACA------------------CG-GTC--G-------------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAATTAA--AA--AAAT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83400                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAT------C-----AAA-TGC-----A-AAATA-----AAGATTT-----TCG-GTC--GGTTTG--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAAAAA-A-AT------A--TCAAC-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TC-GAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAA-CGCAAAA-C-AA--GGA--A-TT-T-T---
gi|83400                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---GATTTA-GGCCTtttcaaaccaacgaccgcaaacaaacacaattttgatttaggcct
gi|83401                      : aaaaaaatcagaattttgataaaaatgttttgatcaaatgcaaaataaagattttcggtcggtttgcaacagaaatgaataaaaaaaaatatcaactggtaaatacaaataaaagattttcagtcgaacgaatttactgggtcggtcgggaaacgcaaaacaaggaatttttttcaaaccaacgAAAAC-A-ATC--AGA--ATCTTCGG------AT-AAA--TGGTT---T-GTA------T-C-T-AAAGTGCCATTTGGAAATA-----A-GATTTCGTCGTTG-ATCTGGGACGC---------------AA-CAGATAA-TAAA---AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-ATTTAC--AAAT--A--AAA-GATT--TCC-GCG--TCCAGACGA--A-TT----A--C-----GG-GGTC-GG---TCGG----AACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83402                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTATGAATATAT-ATATATGTTTAGGT-CAGGATTATT-G-T-CAT-TG------AGAGAGAGAGGGA-GAT-----------GTC--GGTCCG--------------CAA-CAGA-AAATGAAT--AAAA-AACA-AT------A---CACC-----T-GTAA-AT--A---AAAT--AGGAA--GATT--TTC-A-G--TCGAAACGA--A-TTT---A--C-----TGAGGTC-GGGTCCCGGG--AAACCGC---G-C-AAACAAA--A-TT-TAA---AATTTATGGTCT
gi|83403                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-TTAAATGTTT---T-GAG------CGG-T-ATA-TGC-----AGAAATA-----A-G
gi|83404                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG--------T-TAAAATGTTT---T-AAG------CGG-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-
gi|83405                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--TGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-
gi|83406                      :                                                                                                                                                                                          AAAG-A-ATC--CGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCG---------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACT-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGAAACGA--A-TTT---A--C-----TC-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AA-TTA-GGCCg
gi|83407                      :                                                                                                                                                                                            AA-A-ATC--AGAGAAT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-TTAAA-TGC-----AGACATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTTG---------------CAA-CAGC-AA-TGAAT--AAAA-AG-A-AT------A--TTATC-----TGGTGA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83408                      :                                                                                                                                                                                            AA-A-ATC--AGAGAAT-TTCG-------AT-AAAAATGGTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TAC-----ATGAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGCAACACGGTCGGCCGCAA-AAGC-AA-TGAAT--AAAA-AA-A--T------A--TTACC-----TGGTAA-AT--AC--GAAT--A--AA--AATT--TTC-A-G--TCGGAAC-A--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TC-GG--AAACCGC-AAA-C-AA--ACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83409                      :                                                                                                                                                                                            AA-A-ATCGGAGA--AT-TTCG-------AT-AAA-------------------------T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTA--GGTCG----------------------------GAAC--AAGG-AA-A-ATATATACA--TTACG-----CAGTAA-AC--AC--AAAT--
gi|83410                      :                                                                                                                                                                                                    --AGA--AT-TTCG-------AT-CAA----CTG---T-GAG------C---T-AA--TGC-----AGAAATA-----A-GA-TT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------AAAGC-----A-TGAAT--TAAA-AA-A-AT------A----ACG-----TGGC-A-AT--AC----AT--A--CA--GATG--TTC-A----TCGGGA--A--A-TTT---G--C-----TG-GGT---G---TCGGA--AA---GC-GAA-C----CA-A--A-TTAT-T---AATT
gi|83411                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         AATA-----G-CATTT-----TCA-GTCCCGGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGA-T--AAAA--A-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTCAA-G--TCGG-ACGA--A-TTT---A--C-----TG-GG---GG---TCGG
gi|83412                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --------------CAG-CAAA-AA-AAAAA--AAAA-AA-A-AT------AGATCGCTGATTTTGGAAA-A-------AAAT--A--A------T--TTC-A-G--TCGG--CGG--T-TTTT--A--A-----TG-GGTC-GG---TCGGG--TAA--GG-GAA-C-AAAC-CT--A-TT-T-T---AATTT--GGCCT
gi|83413                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GA-AA-TAAAT--AAAA-TATATAT------A--TTACG-----TGGTAA-AC--AA--AAAT--A--------TT--TTC-A-G--TTGGTACAA--A-TTT---A--CAGTAATG-GGTC-GG---TCGGC--ACATCTC-GGA---AAACCCA--A-TT-
gi|83414                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-AA-TGAAT--TAAA-CA-A--T------A--TTGCC-----ACGTAA-AC--AC--AAA-------A--TATT--TTC-T-G--TAAGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---T
gi|83415                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAT--AAAA-AA-A-AA------A--TAGAT-----TGCTGA-TT--TTTGAAAA--A--AA--TAAT--TTC-A-G--TCGG--CGG--A-TTTTA-A--A-----TG-G-TC-GG---TCGGG--TAAGGGG-AAA-C-AAAC-TA--A-TT-T-TTACAATTTT-GGCCT
gi|83416                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAA-TA-T-AT------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAA-------A--TATT--TTC-A-G--TTGTTGCGA--A-TTC---A--A-----TG-AGTC-GG---TCGG
gi|83417                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AT------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAAC--A--AA-----T--TTC-A-G--CTGGTACGA--AATTT---A--C------G-GGTC-GG---TCGGA--AAATCTC-AGA---AAACCAA--A-TT-T-C---AAT
gi|83418                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AT------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAAT---------TATT--TTC-A-C--TGGGCACGA--A-TTT---A--A-----TG-GGTC-GG---CCGG
gi|83419                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA---ATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83420                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA---ATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83421                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA--AATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83422                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA---ATT--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTT-GG---TCAGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACACA----TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83423                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--AT--AA-T--A--AAATGATT----C-A-GG-TCAGA-CGT--A-TTTTTTC--C-----TG-G-TA-GG---TCGGG--GAGCCGG-AAA-C-ACACATT--A-TT-T-T---A--TTA-GGCCT
gi|83424                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-AT--TC--AAAT--A--AA---ATC--TTT-A-GGGTCGGAGCAATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGGTTAGA--GG-AAA-CTGAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83425                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C--AAAT--A--AA---ATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A-----------GGTC-GG---TCGGT--GTAGCGG-AAATC-AAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83426                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAT--A--AA---ATTCTTTC-G-G--TCGCAGCGA--T-TTT---T--T-----CG-GGTC-GG---TCGGG--ATTTGGG-AAA-C-AAACAAT--A-TT-T-T---ATTTTA-GGTC
gi|83427                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAT--A--AA--TTTA--TTC-A-GG-TCGGA-CGC--A-TTT---TTTC-----CA-GGTA-GG---TCGGG--GAGCCGG-AAA-C-ACACATATTA-TT-T-T---A--TTA-GGCCT


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . T   GG   GA  C    TGAATAT  A   A      AGG T   GATTAT GG  A   G   CATTT       GAGGG A     CGTCG   T   TG     CAACACGGTCGGCCGC  G    T  A     AA    A  C T  ATATAC GA     GATTT      T  TT  TG    TA GG  ATG   CT   A C GG    A    TA A   TTT CAGTAA    A    G  GTC     TT   C   A   T T     TATT T  A A TAC A    T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    GA  .    G        .   G      .   .   .      GG  T   .   .           .     .     .       .   CC     CC                .    .  .     .     .  T .  .      .      .          .  .   .     A  .   AG    .    . . GG    A    TA .   TA  TTC       .    .  T       .    C   .   . T     CA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      GG  .   .   .           .     .     .       .   .      GC                .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     A  .   G     .    . . GG    A    TA .   T   C         .    .  .       .    C   .   . T     AA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      GG  .   .   .           .     .     .       .   .      GC                .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     A  .   G     .    . . GG    A    TA .   .   C         .    .  .       .    C   .   . T     CA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      GG  .   .   .           .     .     .       .   .      CA                .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     A  .   A     .    . . GG    A    TA .   .   C         .    .  .       .    C   .   . T     AA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      GG  .   .   .           .     .     .       .   .      C                 .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     A  .   A     .    . . GG    A    TA .   .   C         .    .  .       .    C   .   . .     AA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      GG  .   .   .           .     .     .       .   .      C                 .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     A  .   A     .    . . G     A    .  .   .   C         .    .  .       .    C   .   . .     GA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   T      .   .   .      G   .   .   .           .     .     .       .   .      C                 .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   A     .    . . G     G    .  .   .   C         .    .  .       .    C   .   . .     CA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      G   .   .   .           .     .     .       .   .      C                 .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   G     .    . . .     A    .  .   .   C         .    .  .       .    C   .   . .     CA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      G   .   .   .           .     .     .       .   .      C                 .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   G     .    . . .     A    .  .   .   C         .    .  .       .    C   .   . .     AA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      C   .   .   .           .     .     .       .   .      C                 .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   G     .    . . .     A    .  .   .   C         .    .  .       .    C   .   . .     AA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      G   .   .   .           .     .     .       .   .      C                 .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   G     .    . . .     A    .  .   .   C         .    .  .       .    C   .   . .     AA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      G   .   .   .           .     .     .       .   .      C                 .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   A     .    . . .     G    .  .   .   C         .    .  .       .    T   .   . .     CA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   A      .   .   .      G   .   .   .           .     .     .       .   .      C                 .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   G     .    . . .     T    .  .   .   C         .    .  .       .    G   .   . .     CT   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   .      .   .   .      .   .   .   .           .     .     .       .   .      .                 .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   G     .    . . .     A    .  .   .   C         .    .  .       .    T   .   . .     CA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .   .    .   .    .        .   .      .   .   .      .   .   .   .           .     .                                          .    .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   T     .    . . .     T    .  .   .   C         .    .  .       .    G   .   . .     TA   .  . . .   A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    .    .   .    .        .   .      .   .   .      .                       .     .                                               .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   T     .    . . .     T    .  .   .   A         .    .  .       .    G   .   . .     AA   .  . . .   T    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .  .     .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   T     .    . . .     C    .  .   .   C         .    .  .       .    G   .   . .     CA   .  . . .   T    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .     .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   T     .    . . .     G    .  .   .   A         .    .  .       .    G   .   . .     TT   .  . . .   T    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .  . .  .      .      .          .  .   .     .  .   A     .    . . .     G    .  .   .   A         .    .  .       .    C   .   . .     AT   .  . . .   T    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .      .      .          .  .   .     .  .   T     .    . . .     G    .  .   .   C         .    .  .       .    G   .   . .     A    .  . . .   T    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .      .      .          .  .   .     .  .   .     .    . . .     G    .  .   .   A         .    .  .       .    T   .   . .     A    .  . . .   T    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .  .   .     .  .   .     .    . . .     A    .  .   .   C         .    .  .       .    C   .   . .     C    .  . . .   T    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .  .   .     .  .   .     .    . . .     A    .  .   .   T         .    .  .       .    .   .   . .     C    .  . . .   .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .  .   .     .  .   .     .    . . .     G    .  .   .   .         .    .  .       .    .   .   . .     C    .  . . .   .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .  .   .     .  .   .     .    . . .     A    .  .   .   .         .    .  .       .    .   .   . .     C    .  . . .         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .  .   .     .  .   .     .    . . .     A    .  .   .   .         .    .  .            .   .   . .     C    .  .             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .  .   .     .  .   .     .    . . .     .    .  .   .   .         .    .  .                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .     .  .   .     .    . . .     .    .  .   .   .         .    .  .                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .  .   .     .    . . .     .    .  .   .   .         .    .  .                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .                                                                                                                


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                         
originalCons                  :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
finalCons                     :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                     111                                                    3333333333333333                                                                           111            11         11                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                              2 2   33   66  2    9999999  2   1      333 2   666666 666 4   2   55555       55555 2     66666   2   66     1111111111111111  2    2  2     22    1  3 1  555555 22     44444      1  11  11    99 11  333   11   1 1 33    2    00 1   555 88888888  1    1  333     22   3   1   1 7     7777 1  1 1 222 1    1     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                              . .   ..   ..  .    .......  .   .      ... .   ...... ... .   .   .....       ..... .     .....   .   ..     ................  .    .  .     ..    .  . .  ...... ..     .....      .  ..  ..    .. ..  ...   ..   . . ..    .    .. .   ... ........  .    .  ...     ..   .   .   . .     .... .  . . ... .    .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                              4 4   11   11  2    4444444  2   4      999 2   444444 111 7   4   99999       66666 2     22222   5   99     8888888888888888  4    1  1     88    9  8 7  000000 44     33333      4  99  88    22 88  666   88   3 3 22    4    66 3   333 44444444  3    3  555     00   3   4   4 1     8888 4  4 5 666 8    7     
consensus                     :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
Reference ( family-483 )      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83393                      :                                                                                                                                                                                         AAAAATA-ATT--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAA-A-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TGACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--AGAT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83394                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-T-AAA-TG------AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83395                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG-------AT-AATGATGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGA-T--AAAA--A-A-AT------A--TCACC-----AGGT-A-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACAA--A-TTT---A--C-----T--GGTCGGG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83396                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------CGG-T-AAA-TGC-----AGAAAAA-----A-GATTT-----TCG-GTA--GGTCG---------------CAA-CAGA-AA-TGAATAAAAAA-AA-A-AT------A--CCACC-----TGGTAT-AA--AC--AACTA-A--AA--AATT--TTC-C-G--TAAAAACAA--A-TTT---A--C-----CA-GGCC-GG---TCGGG--AAACCAC-AAA-C-AAAAACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGACT
gi|83397                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-ATATC--AGA--AT-TTCG-------ATAAAAAATG-TT---T-GAG------CGG-TAAAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCG---------------CAA--AGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAATAT--AC--AAGT--A--AA--AGAT--TTC-A-G--TC-GAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GGT--TCGGG--AGACCGC-AAA-C-AAACA-A--A-TT-T-T---AATTTA-GGCC
gi|83398                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-TTC--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAA-TGTTT---TTGAG------C-G-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCGTGTC--GGTCGC---------------AA-CAAA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A--T------A--TCAC------TGGTAA-AT--AC--AAAT--A--AA--AGTT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TC-GG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--ATTT-T-T---AATTTA-GGC
gi|83399                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-CTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G--------GT-----AAAAACA------------------CG-GTC--G-------------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAATTAA--AA--AAAT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83400                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAT------C-----AAA-TGC-----A-AAATA-----AAGATTT-----TCG-GTC--GGTTTG--------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAAAAA-A-AT------A--TCAAC-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TC-GAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAA-CGCAAAA-C-AA--GGA--A-TT-T-T---
gi|83400                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---GATTTA-GGCCTtttcaaaccaacgaccgcaaacaaacacaattttgatttaggcct
gi|83401                      : aaaaaaatcagaattttgataaaaatgttttgatcaaatgcaaaataaagattttcggtcggtttgcaacagaaatgaataaaaaaaaatatcaactggtaaatacaaataaaagattttcagtcgaacgaatttactgggtcggtcgggaaacgcaaaacaaggaatttttttcaaaccaacgAAAAC-A-ATC--AGA--ATCTTCGG------AT-AAA--TGGTT---T-GTA------T-C-T-AAAGTGCCATTTGGAAATA-----A-GATTTCGTCGTTG-ATCTGGGACGC---------------AA-CAGATAA-TAAA---AAAA-AA-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-ATTTAC--AAAT--A--AAA-GATT--TCC-GCG--TCCAGACGA--A-TT----A--C-----GG-GGTC-GG---TCGG----AACCGC-AAA-C-AAACACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83402                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTATGAATATAT-ATATATGTTTAGGT-CAGGATTATT-G-T-CAT-TG------AGAGAGAGAGGGA-GAT-----------GTC--GGTCCG--------------CAA-CAGA-AAATGAAT--AAAA-AACA-AT------A---CACC-----T-GTAA-AT--A---AAAT--AGGAA--GATT--TTC-A-G--TCGAAACGA--A-TTT---A--C-----TGAGGTC-GGGTCCCGGG--AAACCGC---G-C-AAACAAA--A-TT-TAA---AATTTATGGTCT
gi|83403                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTCG-------AT-TTAAATGTTT---T-GAG------CGG-T-ATA-TGC-----AGAAATA-----A-G
gi|83404                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--AGA--AT-TTTG--------T-TAAAATGTTT---T-AAG------CGG-T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-
gi|83405                      :                                                                                                                                                                                         AAAAA-A-ATC--TGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-
gi|83406                      :                                                                                                                                                                                          AAAG-A-ATC--CGA--AT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCG---------------CAA-CAGA-AA-TGAAT--AAAA-AA-A-AT------A--TCACT-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGAAACGA--A-TTT---A--C-----TC-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AA-TTA-GGCCg
gi|83407                      :                                                                                                                                                                                            AA-A-ATC--AGAGAAT-TTCG-------AT-AAAAATGTTT---T-GAG------C-G-TTAAA-TGC-----AGACATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTTG---------------CAA-CAGC-AA-TGAAT--AAAA-AG-A-AT------A--TTATC-----TGGTGA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTC-A-G--TCGGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TCGGG--AAACCGC-AAA-C-AAACAAA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83408                      :                                                                                                                                                                                            AA-A-ATC--AGAGAAT-TTCG-------AT-AAAAATGGTT---T-GAG------C-GGT-AAA-TAC-----ATGAATA-----A-GATTT-----TCG-GTC--GGTCGCAACACGGTCGGCCGCAA-AAGC-AA-TGAAT--AAAA-AA-A--T------A--TTACC-----TGGTAA-AT--AC--GAAT--A--AA--AATT--TTC-A-G--TCGGAAC-A--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---TC-GG--AAACCGC-AAA-C-AA--ACA--A-TT-T-T---AATTTA-GGCCT
gi|83409                      :                                                                                                                                                                                            AA-A-ATCGGAGA--AT-TTCG-------AT-AAA-------------------------T-AAA-TGC-----AGAAATA-----A-GATTT-----TCG-GTA--GGTCG----------------------------GAAC--AAGG-AA-A-ATATATACA--TTACG-----CAGTAA-AC--AC--AAAT--
gi|83410                      :                                                                                                                                                                                                    --AGA--AT-TTCG-------AT-CAA----CTG---T-GAG------C---T-AA--TGC-----AGAAATA-----A-GA-TT-----TCG-GTC--GGTCGC--------------AAAGC-----A-TGAAT--TAAA-AA-A-AT------A----ACG-----TGGC-A-AT--AC----AT--A--CA--GATG--TTC-A----TCGGGA--A--A-TTT---G--C-----TG-GGT---G---TCGGA--AA---GC-GAA-C----CA-A--A-TTAT-T---AATT
gi|83411                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         AATA-----G-CATTT-----TCA-GTCCCGGTCGC---------------AA-CAGA-AA-TGA-T--AAAA--A-A-AT------A--TCACC-----TGGTAA-AT--AC--AAATA-A--AA--GATT--TTCAA-G--TCGG-ACGA--A-TTT---A--C-----TG-GG---GG---TCGG
gi|83412                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --------------CAG-CAAA-AA-AAAAA--AAAA-AA-A-AT------AGATCGCTGATTTTGGAAA-A-------AAAT--A--A------T--TTC-A-G--TCGG--CGG--T-TTTT--A--A-----TG-GGTC-GG---TCGGG--TAA--GG-GAA-C-AAAC-CT--A-TT-T-T---AATTT--GGCCT
gi|83413                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GA-AA-TAAAT--AAAA-TATATAT------A--TTACG-----TGGTAA-AC--AA--AAAT--A--------TT--TTC-A-G--TTGGTACAA--A-TTT---A--CAGTAATG-GGTC-GG---TCGGC--ACATCTC-GGA---AAACCCA--A-TT-
gi|83414                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-AA-TGAAT--TAAA-CA-A--T------A--TTGCC-----ACGTAA-AC--AC--AAA-------A--TATT--TTC-T-G--TAAGAACGA--A-TTT---A--C-----TG-GGTC-GG---T
gi|83415                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAT--AAAA-AA-A-AA------A--TAGAT-----TGCTGA-TT--TTTGAAAA--A--AA--TAAT--TTC-A-G--TCGG--CGG--A-TTTTA-A--A-----TG-G-TC-GG---TCGGG--TAAGGGG-AAA-C-AAAC-TA--A-TT-T-TTACAATTTT-GGCCT
gi|83416                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAA-TA-T-AT------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAA-------A--TATT--TTC-A-G--TTGTTGCGA--A-TTC---A--A-----TG-AGTC-GG---TCGG
gi|83417                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AT------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAAC--A--AA-----T--TTC-A-G--CTGGTACGA--AATTT---A--C------G-GGTC-GG---TCGGA--AAATCTC-AGA---AAACCAA--A-TT-T-C---AAT
gi|83418                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AT------A--TTACC-----TGGTAA-AC--AT--AAAT---------TATT--TTC-A-C--TGGGCACGA--A-TTT---A--A-----TG-GGTC-GG---CCGG
gi|83419                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA---ATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83420                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA---ATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83421                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA--AATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83422                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--TC--AAAT--A--AA---ATT--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A---------G-GGTT-GG---TCAGG--TTAGCGG-AAA-CTCAACACA----TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83423                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-AT--AT--AA-T--A--AAATGATT----C-A-GG-TCAGA-CGT--A-TTTTTTC--C-----TG-G-TA-GG---TCGGG--GAGCCGG-AAA-C-ACACATT--A-TT-T-T---A--TTA-GGCCT
gi|83424                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-AT--TC--AAAT--A--AA---ATC--TTT-A-GGGTCGGAGCAATAA-TTT---A---------G-GGTC-GG---TCGGGTTAGA--GG-AAA-CTGAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83425                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C--AAAT--A--AA---ATG--TTT-A-GGGTCGGGGCTATAA-TTT---A-----------GGTC-GG---TCGGT--GTAGCGG-AAATC-AAACAC---A-TT-T-T---ATTTTA-GGCCT
gi|83426                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAT--A--AA---ATTCTTTC-G-G--TCGCAGCGA--T-TTT---T--T-----CG-GGTC-GG---TCGGG--ATTTGGG-AAA-C-AAACAAT--A-TT-T-T---ATTTTA-GGTC
gi|83427                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAT--A--AA--TTTA--TTC-A-GG-TCGGA-CGC--A-TTT---TTTC-----CA-GGTA-GG---TCGGG--GAGCCGG-AAA-C-ACACATATTA-TT-T-T---A--TTA-GGCCT