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Reference ( gi|86769 ) : CCCCT---CTAACT-C-TT-T--GATT--G--TTT--G-A--TTTT-------G---A-A-AT-T--G--ATCG--C-T--C------TGCA-GT--A-G-T---AC-AT-A-TTC--G--T-C-A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGAGTAT
gi|86768 : CCCCT---CTAACT-C-TT-T--GATT--G--TTC--G-A--TTTT-------C---A-A-AT-T--G--ATTG--C-T--C------TGCA-GT--A-G-T---AC-AT-A-TTC--G--T-T-A-T--A---T-G-AA-TTC--TT-T-G-CAAGGTAT
gi|86772 : CCCTT---CTAGCT-C-TT-T--GATT--G--TCC--G-ATTTTTT-------C---A-A-AT-T--G--ATCGC-C-T--C------TGCA-GT--A-G-T---ACTAT-A-TTC--GTTT-C-A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTA
gi|86785 : cCCCTT---CTGGCT-C-TT-T--GATT--G--TTC--G-A--TTTT-------C---A-T-AT-T--G--ATCG--C-T--C------TGCA-GT--T-G-T---TT-AT-A-TTC--G--T-T-T-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-A-CAGGGTAT
gi|86777 : CCCCT---CTAACT-C-TT-T--ATTT--G--TTC--G-A--TTTT-------C---A-A-ATAT--G--AGCG--C----C------TGCA-GT--A-GTT---AC-AT-A-TTC--G--T-T-A-T--A---T-G-GA-TTC--TT---G-CAGGGT
gi|86771 : CCCTT---CCCTCT-C-CT-T--GGTT--G--TTT--G-A--GTTT-------T---A-C-AT-T--G--ATCG--C-T--C------TGCA-GT--A-G-T---AC-TT-G-TTC--G--T-T-A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-T-TAGGGTAT
gi|86782 : CCCTT---CCTTCT-C-TT-T--GATT--G--TTC--G-A--CTTT-----------A-C-AT-T--G--ATTG--C-T--C------TGCA-GT--A-G-T---AC-AT-A-TTC--G--T-A-A-T-----------A-TTC--TT-G-G-CAGGGTAT
gi|86774 : CCCCTTC-CT--CT-C-TT-T--GATT--G--TTC--G-A--TTTT-------ATTCA-C-AC-T--G--ATCA--CAT--C------TGCAGGT--A-G-T---AC-AT-ATTTC--G--T-T-A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-
gi|86773 : CCCCTTC-CT--CT-C-TT-T--GATT--G--TTC--G-A--TTTT-------ATTCA-C-AC-T--G--ATCA--CAT--C------TGCAGGT--A-G-T---AC-AT-ATTTC--G--T-T-A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-agg
gi|86770 : CCCCT----TGCCT-CCTT-T--GATT--G--TTC--G-A--TTTT-------C---A-C-AT----G--AT-G--C-T--C------TGCAAGT--A-G-T---AC-AT-A-TTC--G--T-T-A----A---T-G-GA-TT---TT-G-G-CAGGTTATagg
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gi|86775 : tcttctattgTTT-------G---ATA-AT-T--G--ATC---C-T--C------TGCA-GT--A-G-T---AC-AT-A-TTC--G--T-T-A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTAT
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Reference ( family-478 ) : CCCCT--C-TN--C----T--C-TT-T--GATT--G--TT--CG-A-TT---TT--C-------ACA--T-T--G--ATCG--C-T--C------TGC-A-GT--A-GT---AC-AT-A-TTC--G-T-T--A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTAT
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gi|86769 : CCCCT--C-TAA-C----T--C-TT-T--GATT--G--TT--TG-A-TT---TT--G-------AAA--T-T--G--ATCG--C-T--C------TGC-A-GT--A-GT---AC-AT-A-TTC--G-T-C--A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGAGTAT
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gi|86795 : c--C-CT--C----T--C-TT-T--GATT--G--TT--CG-A-TT---TT--C-------ACA--T-T--G--ATTG--T-T--C------TGC-A-GT--A-GT---AC-AT-A-TTC--G-T-T--A-T--A---T-G-
gi|86796 : --C-TT--C----T--T-TT-T--GATT--G--TT--CG-A--T---TT--C-------AAA--T-T--G--AT-G--C-T--C------TGC-A-GTCCA-GT---AC-AT-A--TC--T-C-T--A-TG-A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTAT
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gi|86799 : ct--C-TC--T----T--C-TT-T--GATT--GGTTT--CG-A-TT---TT--C-------AAA--T-T--G--ATCG----T--C------TGC-ACGT--A-GT---AT-AT-A-TTCCTG-T-T--A-TCAA---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTAT
gi|86800 : ----T--C-TT-T--GATT--G--TT--CG-A-TT---TT--C-------ACA--T-T--G--ATCG--C-T--C------TGC-G-GT--A-GTA--AC-AT-A-TTC--G-T-T--A-T--A---A-G-GA-TTC--CT-G-G-CAGGGTAT
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Alignments
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Reference ( family-478 ) : CCCCT--C---CT--CT-CT------T-TGATT--G--TT-CG-A-TT---TT--C-------ACA--T-T--G--ATCG--C-T--C------TGC-A-GT--A-GT---AC-AT-A-TTC--G-T-T--A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTAT
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gi|86784 : ccctgT--C---CT--CT-CT------T-GGATT--G--TT-CG-A-TT---TT--T-------ACA--T-T--G--ATTG--C-T--C------TGC-A-GT--A-GT---AC-AT-A-TTC--G---T--A-A--A---T----A-TTCAATT-G-G-CAGGGTAT
gi|86785 : ccctgCCCT--T---CTGGCT-CT------T-TGATT--G--TT-CG-A-TT---TT--C-------ATA--T-T--G--ATCG--C-T--C------TGC-A-GT--T-GT---TT-AT-A-TTC--G-T-T--T-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-A-CAGGGTAT
gi|86786 : CCCT--CACCCT--CT-TT------T-CAATT--T--TT-CG-A-AT---TT--C-------ACA--A-T--G--ATCG--C-T--C------TGG-A-GT--A-AT---AC-GT-A-TTC--T-T-T--A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-A-CAGGGTAT
gi|86787 : CCCCT--CTAGCT---T-CT------TATGATTCGA--TT-CACA-TT---TT--C-------ACA--T-T--G--AT-G--C-T--CAATTTGCGC-A-GT--A-GT---AC-AT-A-TTC--G---T--A-T--A---TAG-GA-TTC--TT---G-CAGGGT
gi|86788 : CCCT--C---TA--CT-CT------T-TGAT---G--TT-CA-A-TT---TT--C-------AAA--T-T--G--ATCG--C-T--C------TGC-A-TT--A-GT---AC-AT-A-TTC--G-T-T--A-T--ATC-T-G-GACTTC--TT-G-GACA-GGTAT
gi|86789 : T--C---CT--CT-CTCAGTTTT-TG--T--G--TT-CGTA-TT---TT--TCA-----AGA--T-T--G--ATCGGGC-T--C------TGC-A-GT--A--T---AA-AT-A-TTC--GTT-T--A-T--A---T-G-GA-ATT--TT-GAG-CAGGGTAT
gi|86790 : cttT-CT------T-AGATT--GG-TT-CG-A-TT---TTTTC-------ACA--T-TTTG--ATCA--C-TTTC------TTC-T-GT--A-GTT--AC-AT-A-TTC--G-T-T--A-T--A---T-G-GA-TTC--TTGG-G-CAGG
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gi|86792 : --C---CT--AT-CT------T-TGATT--A--TT-TG-A-TT---TT--G-------ACA--T-T--G--ATTG--C-T--C------TGC-A-GT--A-GT---AC-AT-A-TTC--G-T-T--A-T--ATATT-G-GA-TTC--TT-G-G-CGGGTTAT
gi|86793 : --C---CT--CT-TT------T-TAGTT-----TA-CG-A-TT---TT--C-------ACA--TAT--G--ATCG--C-T--T------TGC-A-GT--A-GT---AC-AT-A-TTC--G-T-T--A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTAT
gi|86794 : --C---CT--CT-TT------T-TAGTT-----TA-CG-A-TT---TT--C-------ACA--T-T--G--ATCG--C-T--T------TGC-A-GT--A-GT---A
gi|86795 : --C---CT--CT-CT------T-TGATT--G--TT-CG-A-TT---TT--C-------ACA--T-T--G--ATTG--T-T--C------TGC-A-GT--A-GT---AC-AT-A-TTC--G-T-T--A-T--A---T-G-
gi|86796 : --C---TT--CT-TT------T-TGATT--G--TT-CG-A--T---TT--C-------AAA--T-T--G--AT-G--C-T--C------TGC-A-GTCCA-GT---AC-AT-A--TC--T-C-T--A-TG-A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTAT
gi|86797 : --C---CT--CT-CT------T-CA--T--G--TT-CG-A-TT---TT--A-------ACA--T-T--G--ATCG--T-G--C------TG--A-GTA-A-GT---AC-AT-A-TTC--
gi|86798 : ---CT--CT-CT------T-TGATT--G--TT-CG-A-TT---T---C-------ACA--T-T--G--ATTG--C-T--C------TGC-A-GT--AGGT---AC-AT-A--TC--G-T-T--A-T--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTATctgcggtcggagtaatataaactttgaacagggaat
gi|86799 : ---CT--CTTCT------T-TGATT--GGTTT-CG-A-TT---TT--C-------AAA--T-T--G--ATCG----T--C------TGC-ACGT--A-GT---AT-AT-A-TTCCTG-T-T--A-TCAA---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTAT
gi|86800 : T-CT------T-TGATT--G--TT-CG-A-TT---TT--C-------ACA--T-T--G--ATCG--C-T--C------TGC-G-GT--A-GTA--AC-AT-A-TTC--G-T-T--A-T--A---A-G-GA-TTC--CT-G-G-CAGGGTAT
gi|86801 : --C-T--CA-----TGC-A-GT--A-G----AC-AT-A-T-A--G-T-T--A----A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTAT
gi|86802 : attt--C------TGT-A-GT--A-GT---AC-AA-C-TTC--G-T-T--A-T--A---T-T-GA-TTC--CT-G-G-CAGGGTAT
gi|86803 : T---AC-ATTA-TTA--G-T-T--AAT--A---T-G-GA-TTC--TT-G-G-CAGGGTA