lowQualScore : 11111 44444444444 111111111111111
lowQualScore : 1 22 444444 1 1 444 55 1 1 2 2 44 1 1 1 1 66 1 1 22 1 44 555555555 1 1 3 1 4 3333 1 6666666 444 77777 1 1 222 1 1 11111 333 3 00000000000 1 1 1 44 1 44 1 1 44 44 3 1 555555 22 111111111111111 3 3 1 333 444 22 1 1 1 1 1 222 22 1 3 1
lowQualScore : . .. ...... . . ... .. . . . . .. . . . . .. . . .. . .. ......... . . . . . .... . ....... ... ..... . . ... . . ..... ... . ........... . . . .. . .. . . .. .. . . ...... .. ............... . . . ... ... .. . . . . . ... .. . . .
lowQualScore : 5 00 333333 5 5 111 00 4 4 9 9 88 4 4 4 4 44 4 4 00 4 88 777777777 4 7 5 7 8 4444 6 8888888 222 66666 6 6 888 6 7 22222 222 6 33333333333 8 8 8 55 9 55 9 9 55 55 8 9 555555 55 444444444444444 6 6 8 222 444 44 7 7 7 7 7 999 33 7 3 7
consensus : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--A-AA--T---------CTA-ATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TA-A-A--C-TT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--T-AA---A-ACG---T-----TAAA-C-CG-AAAG--TA-G--A-C-CG--TG--T-TT-CAA------GCGG--A---------------AAC-AC-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
Reference ( gi|81628 ) : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--A-AA--T---------CTA-ATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TA-A-A--C-CT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--C-GA---A-A-----T-----TAAA-C-CG-AAAG--TA-G--A-C-CG--TG--T-TT-CAA------GCGG--A---------------AAC-AC-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81626 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--A-AA--T---------CTA-ACTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TA-A-A--C-TT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--T-AA---A-ACG---T-----TAAA-C-CG-AAAG--TA-G--A-C-CG--TG--T-TT-CAA------GCGA--A---------------AAC-AC-GAAAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81631 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--CGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--A-AA--T---------CTA-ATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TA-A-A--C-TT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--T-AA---ACG-----T-----TAAA-C-CG-AAAG--TA-G--G-C-CG--TG--T-TT-CAA------GCGA--A---------------AAC-AC-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-ATT-ATG-GA-G---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81630 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--A-AA--T---------CTA-ATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TA-T-A--C-TT-TT-TC---TC-CCT-CGAC--T-AA---A-ACG---T-----TAAA-C-CG-AAAG--TA-G--A-C-CG--TG--T-TT-CAA------GCGA--A---------------AAC-AC-GTCAA-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ATG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81633 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--T-AA--T---------CTA-ATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TA-T-A--C-TT-GT-TC---TT-CCT-CGAC--T-AA---A-ACG---T-----TAAA-C-CG-AAAG--TA-G--A-C-CG--TG--T-TT-CAA------ACGG--A---------------AAC-AC-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTATCTTAA
gi|81634 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--A--TA-T-A-A-TCG---T--C-AA--T---------CTA-ATTTT-GCT-GCG-G----TT-CC-------TA-A-A--C-CT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--T-AA---A-ACG---T-----TAAA-C-GG-AAAG--TAAG--A-C-CG--TG--T-TT-CAA------GCGG--A---------------AAC-GC-GT-AC-TTA---G-C-TAT--G-A-TCATG-GA-C---G--A-ACA-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81635 : ATA-T-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGGGCG--AA-TG-T-A----TG-A-T--A-A---T---------CTA-ATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TA-A-AA-C-TT-TT-TC---TT-CCT-CAAC--T-AA---A-AG----T-----TAAA-C-AG-AAAG--TA-G--G-C-CG--TGGGT-TT-CAA------GCTG--A---------------AAC-AC-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A---ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81636 : ATAGT-CG--GG------T--C-A---A--TGT-G-GA-AAG-CACAAA-TA-T-A-A-TCG-A-T--A-AA--T---------CTA--TTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TA-G-A--C-TT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--T-TA---A-ACG---T-----TAAA-C-CG--AAG--TA-G--A-C-CG--TG--T-TT-C-A------GCGG--A---------------AAC-GC-GTCAC-TTA-----T-TAT--G-A-T-ATG-GA-C---G--ATACGTTTTCA-TACTACCTTAA
gi|81639 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-G--AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--A-AAA-T---------GTA-ATTTT-G-T-GCGAG----TT-CC-------TACA-A-----T-TT-TC---TT-C-T-CGAC--C-AA---A-ACG---T-----TAAA-C-CG-AAAG--TA-G--A-C-GC--TG--T-TT-CAA------ACGG--A---------------AAC-GC-GTCAC--TA---G-C-TAT--G-A-T-ATG-GA-C------A-ACG---TCA-TACTACCTTAA
gi|81641 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGA-CGG-AA-TA-T-A-G--CG-A-T--A-AA--TTCTATTTCTCTA-ATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TA-T-A--C-TT-TT-TC-----------AAC--C-GN---A-ACG---T-----TAAA-C-CA-AAAG--TA-G--A-C-CG--TG--T-TT-CAA------CCGC--A---------------AAT-AC-GTCAC-TTA---G-TGTAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG--TTCA-TACTACCTTAA
gi|81642 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-T---------------------------------CTA-ATTTT-G-T-GCG-G----TT-C--------TA-G-A--C-CT-TT--C---TT-CCT-CGAC--T-AA---A-A-----CG----TAAA-C-CG-AAAG--TA-G--A-C-CG--TG----TT-CAA------GCGG--A---------------AAC-GC-GTCAC-TTA---G-C-TAT--G-A-T-ATG-GA-C---G----------------CTACCTTAA
gi|81645 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGA-CG--AA-TA-TAA-A-GCG-A-T----AA--T---------CTA-ATTTT-GTT-GCGCG----TT-CC-------TA-A------CT-TTATT---CT-CAT-CGAC--CTAA---A-A-----C-----TAAA-C-CA-AAAA--GA-GA-A-C-CG--TG--TGGT-CAACCGGGGGCGGGCA---------------AAT-AC-GTCAC-TTA---G-TGTAT--A-A-T-ATG-G--C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81644 : ATAGTTCG--GG------TT-------A--TGT----G-AGG-CG--AA-TAAT-A-A-TCG-A-T--A-AA--T---------CTA-ATTTT-G-T-AC--G----TT-C---------A-ATA--CTTT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--T-AA---A-A-----CACGTATAAA-C-CG-AAAG--TA-G--A-C-AG---G--T-TT-CAA------GCGG--A---------------AAG-AC-GTCA--TTA---G---TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G----ACG-TTTCA-T-CTACCT
gi|81646 : ATA-T-CG--GG------T--C-A---A--TGT-C-GA-GGT-CG--AA-AT-T-A-A-TCGCA-T--A-AA--T---------GTA-ATTT--G-TCACG-G----TT-CC-------TA-A-AAAC-CTGTT-TC---TT-CCT-CGAC--T-AATAAA-A-----CGTA--TAAA-CGCGTAAAG--TA-G--A-C-CGAGTG--T-TT-CAA------GCGG--A---------------AAC-GCAGTCAC-GTAGCTG-T-TAG--A-A-T-A-G-GA-CGTAG--A-ACG-TTT-A-TAC-ACTTCAA
gi|81647 : ATAGT-CG--GGGGGGTTTT-C-ACACACCTGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-C---TCG-A-T--A-AA--T---------CAA-ATTTT-G-T-GCGCG----TT-CC--------A-A-A----CT-TT-TC---TT-CTT-C
gi|81629 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--A-AG--T---------CTA-
gi|81627 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--A-AG--T---------CTA-
gi|81632 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-G--CG-A-T--A-AG--T---------CTA-
gi|81643 : ATTGT-CG--GG------TT-C-A---A--TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--A-AG--T---------CTA-
gi|81648 : ATAG--CGATGG------CT-C-A---A--TGTGT-GG-AGG-CG--AG--A---A-A-CTG-A-T--ACAACGT---------CTATATTTC-A----------------C-------TA-A-A------------------------AA--C-G------------T-----TA---C-CG-AAAG--TA----A-CGCG--TG--T-TTTCAA------GAGG--A--------------------C-CTCAT-TCT---G-C--AT--GGA-T-A-G-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81638 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AATTA-T-A-AGCCG-A-T--A-AG--T---------CTA-
gi|81640 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---AA-TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GGG-A-T--A-AA--T---------CTA-
gi|81637 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GGAAGG-CG--AA-TA-T-A-T-GCG-A-T--A-AG--T---------CTA-
gi|81649 : AGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-A-A-A-TAG-A-T--A-A-----------------------------------------------------A--C-TT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--
gi|81650 : GT-CG--GT------TTTC-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--CA-TA-T-A-A-TCT-A-T--A-AAA-T---------CTA-ATTTTTG-T-GCG-G----TT-CC-------TA-A-A--C-TT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--T-AA---A-ACG---T-----TAAA-C-CG-AAGG--TA-G--AAC-CG--TG--T-TT-CAA------GCGG--ACAGTGTTTCAGCGGAAAC-ACCGTCAC-TTA---GTT-TAT--A-A-T-ATG-GACC---G--A-ACGTTTTCA-TACTAta
gi|81651 : -CG--TG------TT-CCA---A--TGT-T-GGGAGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-ATT--A-AA--T---------CCA-ATTTT-G-T--CG-G----TT-CC-------TA-A-A--C-TT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--T-AA---A-ATG---T-----TAAA-C-CG-AAAGGTTA-GGAA-C-CG--TGT-T-TT-CAA------GCGA--A---------------AAC-AC-GTCAC-TTA---G-T-TATTAA-A-T-ATGAGA-C---G--A-ACG-TTTCA-TAC-ACCTTAA
gi|81652 : -CG--GG------TT-C-A---AA-TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-TAAA-AA--T---------CTA-ATTTT-G-T-GCG-G----TT-CCG------TA-T-A----CT-TT-TC---GT-CCTACGAC--T-AA---A-AAACGTT-----TAAA-C-CG-AAAGT-TA-G--A-C-CGC-TG--TCTT-CAA------GCGG--A---------------A---AT-GTCACGTTA---GCT-TAT--A-A-T-AT--GA-C---G--A-ACG--TTCA-TAC-ACCTTAA
gi|81653 : --GG------TT-C-AG--A--TAT-TTGG-AGGACGG-AA-TA-T-ATA-GCG-A-T--A-AA--T---------CTA-ATTTT-G----CG-G----TTTCC-------TA-T-A--C-TT-TT-TTCCGTT-CCT-CGAC--T-AA---A-ACG---T-----TAAA-C-CG-ACA---TA-G--A-C-CG--TG--T-TT-CAA------GTGG--A---------------AACAAT-GTCAC-TTG---T-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---GAAA-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81654 : T-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--A-AA--T---------GTA-ATTCT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TA-A-C--C-CT-TT-TC---TT-
gi|81655 : A-AATTT-G-T-GCG-GGGGGTT-CC-------TA-A-T--A-TT-TT-TC---TA-ACT-CGAC--C-CA---A-AACG--T-----TAAA-C-CG-AAAG--TA-G--A-C-CG--TG--T-TT-C-A------GCGG--A---------------AACTAC-GTCAT-TCA---G-T-AAC--A-A-T-A-G-GA-C---G--A-ACG-TTTCATTACTACCTAAA
gi|81656 : TT-G-T-GCG-G----TT-TCACCTCTATA-G-A--T-CT-TT-TC---TTACCT-CGACTAC-AA---ACG-----T-----TAAA-C-CA-AAA
gi|81657 : G-G----TT-CC-------CA-T-A--C-TT-TT-TC---TT-CCT-CGAC--T-AA---A-ACG---T-----TAAAAC-CG-AGAG--TA-G--A-C-TG--TG--T-TT-CAA------GCGG--A---------------TAT-AC-GTCAC-CAA---A-A-TAG--A-A-T-GTG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TTCTACCTTAA
gi|81658 : G-G----TT-CC-------TA-T-A--C-TA-TT-TC---TT-CC---GAC--T-AA---A-A-----T------------------G--TA-G--A-C-TG--CG--T-TT-TAA------GCGG--A---------------AAT-AC-GTAAC-CAA---T-T-CAC--A-A-T-ATG-GA-C---A--G-ACG-TTTTG-TTCTACCTTAA
gi|81659 : --A---------------AAT-TC-GCC-C-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81660 : T--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTAA-TACTACCTTAA
gi|81661 : -A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111
lowQualScore : 1 22 444444 1 1 333 44 1 1 2 2 44 1 1 1 1 55 1 1 33 1 555555555 1 3 1 4 3333 1 6666666 1 333 222 1 222 1 1 1 44 1 333 22 1 1 3 1 1 1 44 1 66 1 44 22 1 3 1 666666666666666 22 3 1 1 1 333 333 22 1 1 1 1 1 222 22 1 3 1
lowQualScore : . .. ...... . . ... .. . . . . .. . . . . .. . . .. . ......... . . . . .... . ....... . ... ... . ... . . . .. . ... .. . . . . . . .. . .. . .. .. . . . ............... .. . . . . ... ... .. . . . . . ... .. . . .
lowQualScore : 5 00 111111 4 4 999 88 4 4 8 8 77 4 4 4 4 99 4 4 33 4 555555555 7 3 7 6 3333 5 5555555 5 888 777 5 777 5 6 7 00 7 000 44 7 7 5 7 7 7 33 8 11 8 33 55 8 6 8 666666666666666 44 5 7 7 7 000 888 33 6 6 6 6 6 888 22 6 2 6
consensus : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
Reference ( family-477 ) : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81626 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAACTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GAAAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81627 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81628 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-CTTTTC---TT-CCT-CGA-CC--G-A---A--A----T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81629 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81630 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TTTTTC---TC-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GTCAA-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ATG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81631 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--CGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT----A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--GC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-ATT-ATG-GA-G---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81632 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-G--CG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81633 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--TAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TTGTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------ACGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTATCTTAA
gi|81634 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--A--TA-T-A-A-TCG---T--CAA-T---------CTAATTTT-GCT-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-CTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-GG-AAAG--TAAG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-G-C-GT-AC-TTA---G-C-TAT--G-A-TCATG-GA-C---G--A-ACA-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81635 : ATA-T-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGGGCG--AA-TG-T-A----TG-A-T--AA--T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TAA-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CAA-CT--A-A---A--A--G-T-TAAA-C-AG-AAAG--T-AG--GC-CG--TGGG-T-TT-CAA---------------GCTG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A---ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81636 : ATAGT-CG--GG------T--C-A---A--TGT-G-GA-AAG-CACAAA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTA-TTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-G-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--T-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG--AAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-C-A---------------GCGG--AAAC-G-C-GTCAC-TTA-----T-TAT--G-A-T-ATG-GA-C---G--ATACGTTTTCA-TACTACCTTAA
gi|81637 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GGAAGG-CG--AA-TA-T-A-T-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81638 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AATTA-T-A-AGCCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81639 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-G--AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-TA-AAA-T---------GTAATTTT-G-T-GCGAG----TT-CC-------T-ACA-A------TTTTC---TT--CT-CGA-CC--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-GC--T--G-T-TT-CAA---------------ACGG--AAAC-G-C-GTCAC--TA---G-C-TAT--G-A-T-ATG-GA-C------A-ACG---TCA-TACTACCTTAA
gi|81640 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---AA-TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GGG-A-T--AAA-T---------CTA
gi|81641 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGA-CGG-AA-TA-T-A-G--CG-A-T--AAA-TTCTATTTCTCTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TTTTTC-----------AA-CC--G-N---A--A-CG-T-TAAA-C-CA-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------CCGC--AAAT-A-C-GTCAC-TTA---G-TGTAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG--TTCA-TACTACCTTAA
gi|81642 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-T-------------------------------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-C--------T-A-G-A---C-CTTT-C---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T--AAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-T--CAA---------------GCGG--AAAC-G-C-GTCAC-TTA---G-C-TAT--G-A-T-ATG-GA-C---G----------------CTACCTTAA
gi|81643 : ATTGT-CG--GG------TT-C-A---A--TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81644 : ATAGTTCG--GG------TT-------A--TGT----G-AGG-CG--AA-TAAT-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-AC--G----TT-C----------A-ATA---CTTTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---AACA-CG-TATAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-AG-----G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAG-A-C-GTCA--TTA---G---TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G----ACG-TTTCA-T-CTACCT
gi|81645 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGA-CG--AA-TA-TAA-A-GCG-A-T---AA-T---------CTAATTTT-GTT-GCGCG----TT-CC-------T---A-A---C-TTTATT---CT-CAT-CGACCT--A-A---A--A-C----TAAA-C-CA-AAAA--G-AGA-AC-CG--T--G-TGGT-CAACCGGGG---------GCGGGCAAAT-A-C-GTCAC-TTA---G-TGTAT--A-A-T-ATG-G--C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81646 : ATA-T-CG--GG------T--C-A---A--TGT-C-GA-GGT-CG--AA-AT-T-A-A-TCGCA-T--AAA-T---------GTAATTT--G-TCACG-G----TT-CC-------T-A-A-AAACC-TGTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-ATAAA--A-CG-TATAAA-CGCGTAAAG--T-AG--AC-CGAGT--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-G-CAGTCAC-GTAGCTG-T-TAG--A-A-T-A-G-GA-CGTAG--A-ACG-TTT-A-TAC-ACTTCAA
gi|81647 : ATAGT-CG--GGGGGGTTTT-C-ACACACCTGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-C---TCG-A-T--AAA-T---------CAAATTTT-G-T-GCGCG----TT-CC---------A-A-A---C--TTTTC---TT-CTT-C
gi|81648 : ATAG--CGATGG------CT-C-A---A--TGTGT-GG-AGG-CG--AG--A---A-A-CTG-A-T--ACA-A---------C----------------G----T---C-------T-A-T-A-------TTTC------------A-CT--A-A---A--AACG-T-TA---C-CG-AAAG--T-A---ACGCG--T--G-T-TTTCAA---------------GAGG--A------C-CTCAT-TCT---G-C--AT--GGA-T-A-G-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81649 : AGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-A-A-A-TAG-A----------------------------------------------------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-
gi|81650 : GT-CG--GT------TTTC-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--CA-TA-T-A-A-TCT-A-T--AAAAT---------CTAATTTTTG-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAGG--T-AGA-AC-CG--T--G-T-TT-CAAGCGGACAGTGTTTCAGCGG--AAAC-ACC-GTCAC-TTA---GTT-TAT--A-A-T-ATG-GACC---G--A-ACGTTTTCA-TACTA
gi|81651 : -CG--TG------TT-CCA---A--TGT-T-GGGAGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-ATT--AAA-T---------CCAATTTT-G-T--CG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-TG-T-TAAA-C-CG-AAAGGTT-AGGAAC-CG--T--GTT-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TATTAA-A-T-ATGAGA-C---G--A-ACG-TTTCA-TAC-ACCTTAA
gi|81652 : -CG--GG------TT-C-A---AA-TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-TAAAAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CCG------T-A-T-A---C--TTTTC---GT-CCTACGA-CTAAA-A---A--A-CGTT-TAAA-C-CG-AAAGT-T-AG--AC-CGC-T--G-TCTT-CAA---------------GCGG--AA---A-T-GTCACGTTA---GCT-TAT--A-A-T-AT--GA-C---G--A-ACG--TTCA-TAC-ACCTTAA
gi|81653 : --GG------TT-C-AG--A--TAT-TTGG-AGGACGG-AA-TA-T-ATA-GCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G----CG-G----TTTCC-------T-A-T-A---C-TTTTTTCCGTT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-ACA---T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GTGG--AAACAA-T-GTCAC-TTG---T-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---GAAA-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81654 : T-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------GTAATTCT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-C---C-CTTTTC---TT-
gi|81655 : AAATTT-G-T-GCG-GGGGGTT-CC-------T-A-A-T---A-TTTTTC---TA-ACT-CGA-CCC-A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-C-A---------------GCGG--AAACTA-C-GTCAT-TCA---G-T-AAC--A-A-T-A-G-GA-C---G--A-ACG-TTTCATTACTACCTAAA
gi|81656 : TT-G-T-GCG-G----TT-TCACCTCTAT-A-G-A---T-CTTTTC---TTACCT-CGA-CT--ACA---A--A-CG-T-TAAA-C-CA-AAA
gi|81657 : G-G----TT-CC-------C-A-T-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAAAC-CG-AGAG--T-AG--AC-TG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--ATAT-A-C-GTCAC-CAA---A-A-TAG--A-A-T-GTG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TTCTACCTTAA
gi|81658 : G-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TATTTC---TT-C---CGA-CT--A-A---A--A-T-----------------G--T-AG--AC-TG--C--G-T-TT-TAA---------------GCGG--AAAT-A-C-GTAAC-CAA---T-T-CAC--A-A-T-ATG-GA-C---A--G-ACG-TTTTG-TTCTACCTTAA
gi|81659 : --AAAT-T-C-GCC-C-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81660 : T--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTAA-TACTACCTTAA
gi|81661 : -A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111
lowQualScore : 1 22 444444 1 1 333 44 1 1 2 2 44 1 1 1 1 55 1 1 33 1 555555555 1 3 1 4 3333 1 6666666 1 333 222 1 222 1 1 1 44 1 333 22 1 1 3 1 1 1 44 1 66 1 44 22 1 3 1 666666666666666 22 3 1 1 1 333 333 22 1 1 1 1 1 222 22 1 3 1
lowQualScore : . .. ...... . . ... .. . . . . .. . . . . .. . . .. . ......... . . . . .... . ....... . ... ... . ... . . . .. . ... .. . . . . . . .. . .. . .. .. . . . ............... .. . . . . ... ... .. . . . . . ... .. . . .
lowQualScore : 5 00 111111 4 4 999 88 4 4 8 8 77 4 4 4 4 99 4 4 33 4 555555555 7 3 7 6 3333 5 5555555 5 888 777 5 777 5 6 7 00 7 000 44 7 7 5 7 7 7 33 8 11 8 33 55 8 6 8 666666666666666 44 5 7 7 7 000 888 33 6 6 6 6 6 888 22 6 2 6
consensus : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
Reference ( family-477 ) : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81626 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAACTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GAAAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81627 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81628 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-CTTTTC---TT-CCT-CGA-CC--G-A---A--A----T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81629 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81630 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TTTTTC---TC-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GTCAA-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ATG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81631 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--CGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT----A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--GC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-ATT-ATG-GA-G---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81632 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-G--CG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81633 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--TAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TTGTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------ACGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTATCTTAA
gi|81634 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--A--TA-T-A-A-TCG---T--CAA-T---------CTAATTTT-GCT-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-CTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-GG-AAAG--TAAG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-G-C-GT-AC-TTA---G-C-TAT--G-A-TCATG-GA-C---G--A-ACA-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81635 : ATA-T-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGGGCG--AA-TG-T-A----TG-A-T--AA--T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TAA-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CAA-CT--A-A---A--A--G-T-TAAA-C-AG-AAAG--T-AG--GC-CG--TGGG-T-TT-CAA---------------GCTG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A---ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81636 : ATAGT-CG--GG------T--C-A---A--TGT-G-GA-AAG-CACAAA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTA-TTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-G-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--T-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG--AAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-C-A---------------GCGG--AAAC-G-C-GTCAC-TTA-----T-TAT--G-A-T-ATG-GA-C---G--ATACGTTTTCA-TACTACCTTAA
gi|81637 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GGAAGG-CG--AA-TA-T-A-T-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81638 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AATTA-T-A-AGCCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81639 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-G--AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-TA-AAA-T---------GTAATTTT-G-T-GCGAG----TT-CC-------T-ACA-A------TTTTC---TT--CT-CGA-CC--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-GC--T--G-T-TT-CAA---------------ACGG--AAAC-G-C-GTCAC--TA---G-C-TAT--G-A-T-ATG-GA-C------A-ACG---TCA-TACTACCTTAA
gi|81640 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---AA-TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GGG-A-T--AAA-T---------CTA
gi|81641 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGA-CGG-AA-TA-T-A-G--CG-A-T--AAA-TTCTATTTCTCTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TTTTTC-----------AA-CC--G-N---A--A-CG-T-TAAA-C-CA-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------CCGC--AAAT-A-C-GTCAC-TTA---G-TGTAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG--TTCA-TACTACCTTAA
gi|81642 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-T-------------------------------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-C--------T-A-G-A---C-CTTT-C---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T--AAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-T--CAA---------------GCGG--AAAC-G-C-GTCAC-TTA---G-C-TAT--G-A-T-ATG-GA-C---G----------------CTACCTTAA
gi|81643 : ATTGT-CG--GG------TT-C-A---A--TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81644 : ATAGTTCG--GG------TT-------A--TGT----G-AGG-CG--AA-TAAT-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-AC--G----TT-C----------A-ATA---CTTTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---AACA-CG-TATAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-AG-----G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAG-A-C-GTCA--TTA---G---TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G----ACG-TTTCA-T-CTACCT
gi|81645 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGA-CG--AA-TA-TAA-A-GCG-A-T---AA-T---------CTAATTTT-GTT-GCGCG----TT-CC-------T---A-A---C-TTTATT---CT-CAT-CGACCT--A-A---A--A-C----TAAA-C-CA-AAAA--G-AGA-AC-CG--T--G-TGGT-CAACCGGGG---------GCGGGCAAAT-A-C-GTCAC-TTA---G-TGTAT--A-A-T-ATG-G--C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81646 : ATA-T-CG--GG------T--C-A---A--TGT-C-GA-GGT-CG--AA-AT-T-A-A-TCGCA-T--AAA-T---------GTAATTT--G-TCACG-G----TT-CC-------T-A-A-AAACC-TGTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-ATAAA--A-CG-TATAAA-CGCGTAAAG--T-AG--AC-CGAGT--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-G-CAGTCAC-GTAGCTG-T-TAG--A-A-T-A-G-GA-CGTAG--A-ACG-TTT-A-TAC-ACTTCAA
gi|81647 : ATAGT-CG--GGGGGGTTTT-C-ACACACCTGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-C---TCG-A-T--AAA-T---------CAAATTTT-G-T-GCGCG----TT-CC---------A-A-A---C--TTTTC---TT-CTT-C
gi|81648 : ATAG--CGATGG------CT-C-A---A--TGTGT-GG-AGG-CG--AG--A---A-A-CTG-A-T--ACA-A---------C----------------G----T---C-------T-A-T-A-------TTTC------------A-CT--A-A---A--AACG-T-TA---C-CG-AAAG--T-A---ACGCG--T--G-T-TTTCAA---------------GAGG--A------C-CTCAT-TCT---G-C--AT--GGA-T-A-G-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81649 : AGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-A-A-A-TAG-A----------------------------------------------------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-
gi|81650 : GT-CG--GT------TTTC-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--CA-TA-T-A-A-TCT-A-T--AAAAT---------CTAATTTTTG-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAGG--T-AGA-AC-CG--T--G-T-TT-CAAGCGGACAGTGTTTCAGCGG--AAAC-ACC-GTCAC-TTA---GTT-TAT--A-A-T-ATG-GACC---G--A-ACGTTTTCA-TACTA
gi|81651 : -CG--TG------TT-CCA---A--TGT-T-GGGAGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-ATT--AAA-T---------CCAATTTT-G-T--CG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-TG-T-TAAA-C-CG-AAAGGTT-AGGAAC-CG--T--GTT-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TATTAA-A-T-ATGAGA-C---G--A-ACG-TTTCA-TAC-ACCTTAA
gi|81652 : -CG--GG------TT-C-A---AA-TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-TAAAAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CCG------T-A-T-A---C--TTTTC---GT-CCTACGA-CTAAA-A---A--A-CGTT-TAAA-C-CG-AAAGT-T-AG--AC-CGC-T--G-TCTT-CAA---------------GCGG--AA---A-T-GTCACGTTA---GCT-TAT--A-A-T-AT--GA-C---G--A-ACG--TTCA-TAC-ACCTTAA
gi|81653 : --GG------TT-C-AG--A--TAT-TTGG-AGGACGG-AA-TA-T-ATA-GCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G----CG-G----TTTCC-------T-A-T-A---C-TTTTTTCCGTT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-ACA---T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GTGG--AAACAA-T-GTCAC-TTG---T-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---GAAA-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81654 : T-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------GTAATTCT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-C---C-CTTTTC---TT-
gi|81655 : AAATTT-G-T-GCG-GGGGGTT-CC-------T-A-A-T---A-TTTTTC---TA-ACT-CGA-CCC-A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-C-A---------------GCGG--AAACTA-C-GTCAT-TCA---G-T-AAC--A-A-T-A-G-GA-C---G--A-ACG-TTTCATTACTACCTAAA
gi|81656 : TT-G-T-GCG-G----TT-TCACCTCTAT-A-G-A---T-CTTTTC---TTACCT-CGA-CT--ACA---A--A-CG-T-TAAA-C-CA-AAA
gi|81657 : G-G----TT-CC-------C-A-T-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAAAC-CG-AGAG--T-AG--AC-TG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--ATAT-A-C-GTCAC-CAA---A-A-TAG--A-A-T-GTG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TTCTACCTTAA
gi|81658 : G-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TATTTC---TT-C---CGA-CT--A-A---A--A-T-----------------G--T-AG--AC-TG--C--G-T-TT-TAA---------------GCGG--AAAT-A-C-GTAAC-CAA---T-T-CAC--A-A-T-ATG-GA-C---A--G-ACG-TTTTG-TTCTACCTTAA
gi|81659 : --AAAT-T-C-GCC-C-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81660 : T--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTAA-TACTACCTTAA
gi|81661 : -A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
blockSeqs : T AT GGGGTT T C CAC CC G T A G CA T A A T GC C T AA A TCTATTTCT T C C A GGGG T ACCTCTA A CA AAC T CCG A A C AA C TAA AC A T A A G T GT A GA G AG GG T G T GCGGACAGTGTTTCA GC A C A G GCT TG TA G T C A C GTA AA T T T
blockSeqs : . . . . . G A . . G A G . . . . G . . A . . . T . C . . G . AT . . . . . . C . . . . . A . . . T . A . C . . C . CCGGGG . T . . . . TG . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . G . . . . T . . . . . . . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
finalCons : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111
lowQualScore : 1 22 444444 1 1 333 44 1 1 2 2 44 1 1 1 1 55 1 1 33 1 555555555 1 3 1 4 3333 1 6666666 1 333 222 1 222 1 1 1 44 1 333 22 1 1 3 1 1 1 44 1 66 1 44 22 1 3 1 666666666666666 22 3 1 1 1 333 333 22 1 1 1 1 1 222 22 1 3 1
lowQualScore : . .. ...... . . ... .. . . . . .. . . . . .. . . .. . ......... . . . . .... . ....... . ... ... . ... . . . .. . ... .. . . . . . . .. . .. . .. .. . . . ............... .. . . . . ... ... .. . . . . . ... .. . . .
lowQualScore : 5 00 111111 4 4 999 88 4 4 8 8 77 4 4 4 4 99 4 4 33 4 555555555 7 3 7 6 3333 5 5555555 5 888 777 5 777 5 6 7 00 7 000 44 7 7 5 7 7 7 33 8 11 8 33 55 8 6 8 666666666666666 44 5 7 7 7 000 888 33 6 6 6 6 6 888 22 6 2 6
consensus : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
Reference ( family-477 ) : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81626 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAACTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GAAAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81627 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81628 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-CTTTTC---TT-CCT-CGA-CC--G-A---A--A----T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81629 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81630 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TTTTTC---TC-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GTCAA-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ATG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81631 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--CGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT----A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--GC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-ATT-ATG-GA-G---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81632 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-G--CG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81633 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--TAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TTGTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------ACGG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTATCTTAA
gi|81634 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--A--TA-T-A-A-TCG---T--CAA-T---------CTAATTTT-GCT-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-CTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-GG-AAAG--TAAG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-G-C-GT-AC-TTA---G-C-TAT--G-A-TCATG-GA-C---G--A-ACA-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81635 : ATA-T-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGGGCG--AA-TG-T-A----TG-A-T--AA--T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------TAA-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CAA-CT--A-A---A--A--G-T-TAAA-C-AG-AAAG--T-AG--GC-CG--TGGG-T-TT-CAA---------------GCTG--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TAT--A-A---ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81636 : ATAGT-CG--GG------T--C-A---A--TGT-G-GA-AAG-CACAAA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTA-TTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-G-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--T-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG--AAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-C-A---------------GCGG--AAAC-G-C-GTCAC-TTA-----T-TAT--G-A-T-ATG-GA-C---G--ATACGTTTTCA-TACTACCTTAA
gi|81637 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GGAAGG-CG--AA-TA-T-A-T-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81638 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AATTA-T-A-AGCCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81639 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-G--AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-TA-AAA-T---------GTAATTTT-G-T-GCGAG----TT-CC-------T-ACA-A------TTTTC---TT--CT-CGA-CC--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-GC--T--G-T-TT-CAA---------------ACGG--AAAC-G-C-GTCAC--TA---G-C-TAT--G-A-T-ATG-GA-C------A-ACG---TCA-TACTACCTTAA
gi|81640 : ATGGT-CG--GG------TT-C-A---AA-TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GGG-A-T--AAA-T---------CTA
gi|81641 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGA-CGG-AA-TA-T-A-G--CG-A-T--AAA-TTCTATTTCTCTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TTTTTC-----------AA-CC--G-N---A--A-CG-T-TAAA-C-CA-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------CCGC--AAAT-A-C-GTCAC-TTA---G-TGTAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG--TTCA-TACTACCTTAA
gi|81642 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-T-------------------------------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-C--------T-A-G-A---C-CTTT-C---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T--AAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-T--CAA---------------GCGG--AAAC-G-C-GTCAC-TTA---G-C-TAT--G-A-T-ATG-GA-C---G----------------CTACCTTAA
gi|81643 : ATTGT-CG--GG------TT-C-A---A--TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-GCG-A-T--AAG-T---------CTA
gi|81644 : ATAGTTCG--GG------TT-------A--TGT----G-AGG-CG--AA-TAAT-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G-T-AC--G----TT-C----------A-ATA---CTTTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---AACA-CG-TATAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-AG-----G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAG-A-C-GTCA--TTA---G---TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G----ACG-TTTCA-T-CTACCT
gi|81645 : ATAGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGA-CG--AA-TA-TAA-A-GCG-A-T---AA-T---------CTAATTTT-GTT-GCGCG----TT-CC-------T---A-A---C-TTTATT---CT-CAT-CGACCT--A-A---A--A-C----TAAA-C-CA-AAAA--G-AGA-AC-CG--T--G-TGGT-CAACCGGGG---------GCGGGCAAAT-A-C-GTCAC-TTA---G-TGTAT--A-A-T-ATG-G--C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81646 : ATA-T-CG--GG------T--C-A---A--TGT-C-GA-GGT-CG--AA-AT-T-A-A-TCGCA-T--AAA-T---------GTAATTT--G-TCACG-G----TT-CC-------T-A-A-AAACC-TGTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-ATAAA--A-CG-TATAAA-CGCGTAAAG--T-AG--AC-CGAGT--G-T-TT-CAA---------------GCGG--AAAC-G-CAGTCAC-GTAGCTG-T-TAG--A-A-T-A-G-GA-CGTAG--A-ACG-TTT-A-TAC-ACTTCAA
gi|81647 : ATAGT-CG--GGGGGGTTTT-C-ACACACCTGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-C---TCG-A-T--AAA-T---------CAAATTTT-G-T-GCGCG----TT-CC---------A-A-A---C--TTTTC---TT-CTT-C
gi|81648 : ATAG--CGATGG------CT-C-A---A--TGTGT-GG-AGG-CG--AG--A---A-A-CTG-A-T--ACA-A---------C----------------G----T---C-------T-A-T-A-------TTTC------------A-CT--A-A---A--AACG-T-TA---C-CG-AAAG--T-A---ACGCG--T--G-T-TTTCAA---------------GAGG--A------C-CTCAT-TCT---G-C--AT--GGA-T-A-G-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81649 : AGT-CG--GG------TT-C-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-A-A-A-TAG-A----------------------------------------------------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-
gi|81650 : GT-CG--GT------TTTC-A---A--TGT-T-GG-AGG-CG--CA-TA-T-A-A-TCT-A-T--AAAAT---------CTAATTTTTG-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAGG--T-AGA-AC-CG--T--G-T-TT-CAAGCGGACAGTGTTTCAGCGG--AAAC-ACC-GTCAC-TTA---GTT-TAT--A-A-T-ATG-GACC---G--A-ACGTTTTCA-TACTA
gi|81651 : -CG--TG------TT-CCA---A--TGT-T-GGGAGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-ATT--AAA-T---------CCAATTTT-G-T--CG-G----TT-CC-------T-A-A-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-TG-T-TAAA-C-CG-AAAGGTT-AGGAAC-CG--T--GTT-TT-CAA---------------GCGA--AAAC-A-C-GTCAC-TTA---G-T-TATTAA-A-T-ATGAGA-C---G--A-ACG-TTTCA-TAC-ACCTTAA
gi|81652 : -CG--GG------TT-C-A---AA-TAT-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-TAAAAA-T---------CTAATTTT-G-T-GCG-G----TT-CCG------T-A-T-A---C--TTTTC---GT-CCTACGA-CTAAA-A---A--A-CGTT-TAAA-C-CG-AAAGT-T-AG--AC-CGC-T--G-TCTT-CAA---------------GCGG--AA---A-T-GTCACGTTA---GCT-TAT--A-A-T-AT--GA-C---G--A-ACG--TTCA-TAC-ACCTTAA
gi|81653 : --GG------TT-C-AG--A--TAT-TTGG-AGGACGG-AA-TA-T-ATA-GCG-A-T--AAA-T---------CTAATTTT-G----CG-G----TTTCC-------T-A-T-A---C-TTTTTTCCGTT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-ACA---T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-CAA---------------GTGG--AAACAA-T-GTCAC-TTG---T-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---GAAA-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81654 : T-T-GG-AGG-CG--AA-TA-T-A-A-TCG-A-T--AAA-T---------GTAATTCT-G-T-GCG-G----TT-CC-------T-A-A-C---C-CTTTTC---TT-
gi|81655 : AAATTT-G-T-GCG-GGGGGTT-CC-------T-A-A-T---A-TTTTTC---TA-ACT-CGA-CCC-A-A---A--A-CG-T-TAAA-C-CG-AAAG--T-AG--AC-CG--T--G-T-TT-C-A---------------GCGG--AAACTA-C-GTCAT-TCA---G-T-AAC--A-A-T-A-G-GA-C---G--A-ACG-TTTCATTACTACCTAAA
gi|81656 : TT-G-T-GCG-G----TT-TCACCTCTAT-A-G-A---T-CTTTTC---TTACCT-CGA-CT--ACA---A--A-CG-T-TAAA-C-CA-AAA
gi|81657 : G-G----TT-CC-------C-A-T-A---C-TTTTTC---TT-CCT-CGA-CT--A-A---A--A-CG-T-TAAAAC-CG-AGAG--T-AG--AC-TG--T--G-T-TT-CAA---------------GCGG--ATAT-A-C-GTCAC-CAA---A-A-TAG--A-A-T-GTG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TTCTACCTTAA
gi|81658 : G-G----TT-CC-------T-A-T-A---C-TATTTC---TT-C---CGA-CT--A-A---A--A-T-----------------G--T-AG--AC-TG--C--G-T-TT-TAA---------------GCGG--AAAT-A-C-GTAAC-CAA---T-T-CAC--A-A-T-ATG-GA-C---A--G-ACG-TTTTG-TTCTACCTTAA
gi|81659 : --AAAT-T-C-GCC-C-TTA---G-T-TAT--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA
gi|81660 : T--A-A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTAA-TACTACCTTAA
gi|81661 : -A-T-ATG-GA-C---G--A-ACG-TTTCA-TACTACCTTAA