lowQualScore : 111 1
lowQualScore : 000 22 666 1 2 11 0 11 222 11 88888 1 333333 111 1 22 1 1 1 2 1 11 1 1 1
lowQualScore : ... .. ... . . .. . .. ... .. ..... . ...... ... . .. . . . . . .. . . .
lowQualScore : 444 66 777 3 6 88 7 77 111 66 66666 1 222222 999 1 66 1 1 1 4 2 77 2 2 2
consensus : AAAAAN--C--TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
Reference ( gi|40048 ) : AAAAAC--C--TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40049 : AAAAAC--C--TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40052 : AAAAAC--CACTTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AGGAAA-TT-TA--CTGA-TTTT-GACATCCC-TAA
gi|40047 : AAAAAA--C--TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AATGAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40050 : AAAAAA--C--TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AAA-----TCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-TAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40051 : AAAAACATT--TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------TG---AA-TCA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAA
gi|40055 : aAAAAAC--C--TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCAACT--AAA-----TCTA-TGATAATCG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGATA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40053 : AAAAAA--C--TTTTGAAT---AA-T-CAAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------TG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TC-TG--CTAA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40057 : AAAAAC--C--TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GGCA-T------CG---AA-TAA--TC-G-AC--AAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40060 : AGAAAA--C--TTTCGAATG--AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-GAACT-AAGAAA-TT-C---CTCA-TTTT-GACATC
gi|40054 : AAAAAA--C--TTTCGAAT---AA-T-CAAA--TATT--A---TTCGAAT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-TAGAAATTT-TA--CTCA-TTTT-GACAGCCC-TAAT
gi|40056 : AAAAAA--C--TTTCGAAT---AA-TACTAG--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TG-TT--CTTA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40061 : AAAAAT--C--TTTCGCAT---AA-T-CGAA--AATT--C---TTCGACC--AAA-----GGCA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40059 : AAAAAA--C--TTTTGAAT---AA-T-CGAA--TACT--C---TTAGACT--AAATTAA-GCTA-T------CG---AA-CAA--TC-G-ACT-GAAAAT-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40062 : AAAAAT--C--TTTCGAAT---AAAT-CGAA--TATC--T---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACTAAAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTTGGACATCCCTTAAT
gi|40058 : AAAAAA--C--ATTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTTGACT--GAA-----GCTA-T------CG---AA-TAT--TC-G-ACT-AA-AAA-TTATA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40063 : AAAAAT--C--TTTCGAAT---A--T-CGAGATTATTTCC---TTCGACT--AAAA----GTTA-T------CG---AA-TAGC-TC-G-ATT-ACGAAA-TT-TA--CTCA--TTT-GACATCCT-TAAT
gi|40066 : AAAAC--C--TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCAACT--AAATTAA-GCTA-T------TG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40067 : AAAAA--C--TTTCGAAA---AA-T-CCAA--TAAT--C---TTCGACT--AAA-----GTTA-T------CG---AA-TAA--TC-
gi|40065 : AAACA-C--TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TT-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40068 : AACA-C--TTTCGAAT---AA-T-CGAT--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-T-A--TA-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTGATTTTT-GACATCCC-TA
gi|40069 : --TTTTGAAT---AA-T-CAAA--TATT--C---TTTGACT--AAATTAATGCTA-T------CG---AA-TAA--AC-G-ACT-AAAAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40070 : TTCGAATTCTGA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CA---AA-TAA--AC-T-ACT-AAGACA-TT-TA--CTCG-TGTT-GACATCCT-TAAT
gi|40071 : TTCGAATTCTGA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACTGAAAA-----GCTA-T------CA---AA-TAAACTC---ACT-AAGACA-TT-TA--CTCG-TGTT-GACATCCT-TAAT
gi|40064 : TTCGAAT---AA-A-TGAA--TATT--C---TTTGACT--ATA-----GCAA-T------CA---AA-TAA--TA-G-ACT-
gi|40072 : aaaaaaggTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AAA-----GCTC-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGGAA-TT-TT--TTCA-TTTT-GACGTCCC-TTAT
gi|40073 : GAAT---AA-TTCGAA--TAGT--CCCCTTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AAATAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40074 : AT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--ATA-----GCTA-T------TGAATAA-TAA--TA-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA--TGT-GACATCCT-TAAT
gi|40075 : -T-CGAA--TATT--C---TTCTACT--AAA-----GCTA-C------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-ATGAAA-TC-TA--CTCA-TTTT-GACATCTC-TA
gi|40076 : -T-TGAA--TATT--C---TTCAACT--AAA-----GCTA-T------CA---AA-TCA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-
gi|40077 : -T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------C----------------------AAAAA-TG-TA--CTCA-TTTT-GACATCCT-TTAT
gi|40078 : -T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AA------GCTAAT------TA---AA-TG---TCAG-ACT-A-GAAA-TT-TATACTTA-TTTT-GACATTCC-TAGT
gi|40079 : T--C---TTCGACT--AAA-----ACTA-T------TA---AA-TAA--TC-T-ACT-AGGAAT-TT-TA--CTAA-TTTT-GACA--CC-TA
gi|40080 : atT--C---TTCGACT--AAA-----CTTA-T-------A---AA-TAA--TC-T-ACT-AGGAAT-TT-TA--CTAA-TTTT-GACA--CC-TA
gi|40081 : at---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AC-TAA--TC-G-ACT-AAGAGATTT-TA--CTCA-TATT-GACAGCCC-TAAT
gi|40082 : --AAA-----CTTG-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TC-TG--CTAA-TTTG-GACATCCC-
gi|40083 : -----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACA-AAGAAA-TT-TA--CTCC-TTTT-GACATCCC-TAGT
Alignments
lowQualScore : 1 555 666 1 2 11 11 222 11 88888 1 333333 111 1 22 1 1 1 2 1 11 1 1 1
lowQualScore : . ... ... . . .. .. ... .. ..... . ...... ... . .. . . . . . .. . . .
lowQualScore : 0 444 444 2 5 77 66 000 55 44444 1 111111 999 1 66 1 1 1 3 1 66 2 2 2
consensus : AAAAAAC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
Reference ( family-465 ) : AAAAANC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40047 : AAAAAAC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AATGAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40048 : AAAAACC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40049 : AAAAACC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40050 : AAAAAAC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AAA-----TCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-TAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40051 : AAAAAACATTTTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------TG---AA-TCA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAA
gi|40052 : AAAAACCAC-TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AGGAAA-TT-TA--CTGA-TTTT-GACATCCC-TAA
gi|40053 : AAAAAAC---TTTTGAAT---AA-T-CAAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------TG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TC-TG--CTAA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40054 : AAAAAAC---TTTCGAAT---AA-T-CAAA--TATT--A---TTCGAAT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-TAGAAATTT-TA--CTCA-TTTT-GACAGCCC-TAAT
gi|40055 : AAAAACC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCAACT--AAA-----TCTA-TGATAATCG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGATA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40056 : AAAAAAC---TTTCGAAT---AA-TACTAG--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TG-TT--CTTA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40057 : AAAAACC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GGCA-T------CG---AA-TAA--TC-G-AC--AAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40058 : AAAAAAC---ATTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTTGACT--GAA-----GCTA-T------CG---AA-TAT--TC-G-ACT-AA-AAA-TTATA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40059 : AAAAAAC---TTTTGAAT---AA-T-CGAA--TACT--C---TTAGACT--AAATTAA-GCTA-T------CG---AA-CAA--TC-G-ACT-GAAAAT-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40060 : AGAAAAC---TTTCGAATG--AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-GAACT-AAGAAA-TT-C---CTCA-TTTT-GACATC
gi|40061 : AAAAATC---TTTCGCAT---AA-T-CGAA--AATT--C---TTCGACC--AAA-----GGCA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40062 : AAAAATC---TTTCGAAT---AAAT-CGAA--TATC--T---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACTAAAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTTGGACATCCCTTAAT
gi|40063 : AAAAATC---TTTCGAAT---A--T-CGAGATTATTTCC---TTCGACT--AAAA----GTTA-T------CG---AA-TAGC-TC-G-ATT-ACGAAA-TT-TA--CTCA--TTT-GACATCCT-TAAT
gi|40064 : AAAAAAG---GTTCGAAT---AA-A-TGAA--TATT--C---TTTGACT--ATA-----GCAA-T------CA---AA-TAA--TA-G-ACT-
gi|40065 : AAACAC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TT-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40066 : AAAACC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCAACT--AAATTAA-GCTA-T------TG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40067 : AAAAAC---TTTCGAAA---AA-T-CCAA--TAAT--C---TTCGACT--AAA-----GTTA-T------CG---AA-TAA--TC-
gi|40068 : AACAC---TTTCGAAT---AA-T-CGAT--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-T-A--TA-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTGATTTTT-GACATCCC-TA
gi|40069 : ---TTTTGAAT---AA-T-CAAA--TATT--C---TTTGACT--AAATTAATGCTA-T------CG---AA-TAA--AC-G-ACT-AAAAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40070 : TTCGAATTCTGA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CA---AA-TAA--AC-T-ACT-AAGACA-TT-TA--CTCG-TGTT-GACATCCT-TAAT
gi|40071 : TTCGAATTCTGA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACTGAAAA-----GCTA-T------CA---AA-TAAACTC---ACT-AAGACA-TT-TA--CTCG-TGTT-GACATCCT-TAAT
gi|40072 : TCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AAA-----GCTC-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGGAA-TT-TT--TTCA-TTTT-GACGTCCC-TTAT
gi|40073 : GAAT---AA-TTCGAA--TAGT--CCCCTTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AAATAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40074 : AT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--ATA-----GCTA-T------TGAATAA-TAA--TA-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA--TGT-GACATCCT-TAAT
gi|40075 : -T-CGAA--TATT--C---TTCTACT--AAA-----GCTA-C------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-ATGAAA-TC-TA--CTCA-TTTT-GACATCTC-TA
gi|40076 : -T-TGAA--TATT--C---TTCAACT--AAA-----GCTA-T------CA---AA-TCA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-
gi|40077 : -T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------C----------------------AAAAA-TG-TA--CTCA-TTTT-GACATCCT-TTAT
gi|40078 : -T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AA------GCTAAT------TA---AA-TG---TCAG-ACT-A-GAAA-TT-TATACTTA-TTTT-GACATTCC-TAGT
gi|40079 : ATT--C---TTCGACT--AAA-----ACTA-T------TA---AA-TAA--TC-T-ACT-AGGAAT-TT-TA--CTAA-TTTT-GACA--CC-TA
gi|40080 : ATT--C---TTCGACT--AAA-----CTTA-T-------A---AA-TAA--TC-T-ACT-AGGAAT-TT-TA--CTAA-TTTT-GACA--CC-TA
gi|40081 : ---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AC-TAA--TC-G-ACT-AAGAGATTT-TA--CTCA-TATT-GACAGCCC-TAAT
gi|40082 : --AAA-----CTTG-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TC-TG--CTAA-TTTG-GACATCCC-
gi|40083 : -----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACA-AAGAAA-TT-TA--CTCC-TTTT-GACATCCC-TAGT
Alignments
lowQualScore : 22 333 666 1 2 11 11 222 11 88888 1 333333 111 1 22 1 1 1 2 1 11 1 1 1
lowQualScore : .. ... ... . . .. .. ... .. ..... . ...... ... . .. . . . . . .. . . .
lowQualScore : 55 000 444 2 5 77 66 000 55 44444 1 111111 999 1 66 1 1 1 3 1 66 2 2 2
consensus : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
Reference ( family-465 ) : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40047 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AATGAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40048 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40049 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40050 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AAA-----TCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-TAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40051 : AAAAA--ACATTTTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------TG---AA-TCA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAA
gi|40052 : AAAAACCAC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AGGAAA-TT-TA--CTGA-TTTT-GACATCCC-TAA
gi|40053 : AAAAA--AC---TTTTGAAT---AA-T-CAAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------TG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TC-TG--CTAA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40054 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CAAA--TATT--A---TTCGAAT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-TAGAAATTT-TA--CTCA-TTTT-GACAGCCC-TAAT
gi|40055 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCAACT--AAA-----TCTA-TGATAATCG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGATA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40056 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-TACTAG--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TG-TT--CTTA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40057 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GGCA-T------CG---AA-TAA--TC-G-AC--AAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40058 : AAAAA--AC---ATTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTTGACT--GAA-----GCTA-T------CG---AA-TAT--TC-G-ACT-AA-AAA-TTATA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40059 : AAAAA--AC---TTTTGAAT---AA-T-CGAA--TACT--C---TTAGACT--AAATTAA-GCTA-T------CG---AA-CAA--TC-G-ACT-GAAAAT-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40060 : AGAAA--AC---TTTCGAATG--AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-GAACT-AAGAAA-TT-C---CTCA-TTTT-GACATC
gi|40061 : AAAAA--TC---TTTCGCAT---AA-T-CGAA--AATT--C---TTCGACC--AAA-----GGCA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40062 : AAAAA--TC---TTTCGAAT---AAAT-CGAA--TATC--T---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACTAAAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTTGGACATCCCTTAAT
gi|40063 : AAAAA--TC---TTTCGAAT---A--T-CGAGATTATTTCC---TTCGACT--AAAA----GTTA-T------CG---AA-TAGC-TC-G-ATT-ACGAAA-TT-TA--CTCA--TTT-GACATCCT-TAAT
gi|40064 : AAAAA--AG---GTTCGAAT---AA-A-TGAA--TATT--C---TTTGACT--ATA-----GCAA-T------CA---AA-TAA--TA-G-ACT-
gi|40065 : AAAC--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TT-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40066 : AAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCAACT--AAATTAA-GCTA-T------TG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40067 : AAAA--AC---TTTCGAAA---AA-T-CCAA--TAAT--C---TTCGACT--AAA-----GTTA-T------CG---AA-TAA--TC-
gi|40068 : AAC--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAT--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-T-A--TA-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTGATTTTT-GACATCCC-TA
gi|40069 : ---TTTTGAAT---AA-T-CAAA--TATT--C---TTTGACT--AAATTAATGCTA-T------CG---AA-TAA--AC-G-ACT-AAAAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40070 : TTCGAATTCTGA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CA---AA-TAA--AC-T-ACT-AAGACA-TT-TA--CTCG-TGTT-GACATCCT-TAAT
gi|40071 : TTCGAATTCTGA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACTGAAAA-----GCTA-T------CA---AA-TAAACTC---ACT-AAGACA-TT-TA--CTCG-TGTT-GACATCCT-TAAT
gi|40072 : TCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AAA-----GCTC-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGGAA-TT-TT--TTCA-TTTT-GACGTCCC-TTAT
gi|40073 : GAAT---AA-TTCGAA--TAGT--CCCCTTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AAATAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40074 : AT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--ATA-----GCTA-T------TGAATAA-TAA--TA-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA--TGT-GACATCCT-TAAT
gi|40075 : -T-CGAA--TATT--C---TTCTACT--AAA-----GCTA-C------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-ATGAAA-TC-TA--CTCA-TTTT-GACATCTC-TA
gi|40076 : -T-TGAA--TATT--C---TTCAACT--AAA-----GCTA-T------CA---AA-TCA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-
gi|40077 : -T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------C----------------------AAAAA-TG-TA--CTCA-TTTT-GACATCCT-TTAT
gi|40078 : -T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AA------GCTAAT------TA---AA-TG---TCAG-ACT-A-GAAA-TT-TATACTTA-TTTT-GACATTCC-TAGT
gi|40079 : ATT--C---TTCGACT--AAA-----ACTA-T------TA---AA-TAA--TC-T-ACT-AGGAAT-TT-TA--CTAA-TTTT-GACA--CC-TA
gi|40080 : ATT--C---TTCGACT--AAA-----CTTA-T-------A---AA-TAA--TC-T-ACT-AGGAAT-TT-TA--CTAA-TTTT-GACA--CC-TA
gi|40081 : ---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AC-TAA--TC-G-ACT-AAGAGATTT-TA--CTCA-TATT-GACAGCCC-TAAT
gi|40082 : --AAA-----CTTG-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TC-TG--CTAA-TTTG-GACATCCC-
gi|40083 : -----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACA-AAGAAA-TT-TA--CTCC-TTTT-GACATCCC-TAGT
Alignments
lowQualScore : 22 333 666 1 2 11 11 222 11 88888 1 333333 111 1 22 1 1 1 2 1 11 1 1 1
lowQualScore : .. ... ... . . .. .. ... .. ..... . ...... ... . .. . . . . . .. . . .
lowQualScore : 55 000 444 2 5 77 66 000 55 44444 1 111111 999 1 66 1 1 1 3 1 66 2 2 2
consensus : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
Reference ( family-465 ) : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40047 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AATGAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40048 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40049 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40050 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AAA-----TCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-TAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40051 : AAAAA--ACATTTTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------TG---AA-TCA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAA
gi|40052 : AAAAACCAC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AGGAAA-TT-TA--CTGA-TTTT-GACATCCC-TAA
gi|40053 : AAAAA--AC---TTTTGAAT---AA-T-CAAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------TG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TC-TG--CTAA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40054 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CAAA--TATT--A---TTCGAAT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-TAGAAATTT-TA--CTCA-TTTT-GACAGCCC-TAAT
gi|40055 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCAACT--AAA-----TCTA-TGATAATCG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGATA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40056 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-TACTAG--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TG-TT--CTTA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40057 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GGCA-T------CG---AA-TAA--TC-G-AC--AAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40058 : AAAAA--AC---ATTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTTGACT--GAA-----GCTA-T------CG---AA-TAT--TC-G-ACT-AA-AAA-TTATA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40059 : AAAAA--AC---TTTTGAAT---AA-T-CGAA--TACT--C---TTAGACT--AAATTAA-GCTA-T------CG---AA-CAA--TC-G-ACT-GAAAAT-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40060 : AGAAA--AC---TTTCGAATG--AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-GAACT-AAGAAA-TT-C---CTCA-TTTT-GACATC
gi|40061 : AAAAA--TC---TTTCGCAT---AA-T-CGAA--AATT--C---TTCGACC--AAA-----GGCA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40062 : AAAAA--TC---TTTCGAAT---AAAT-CGAA--TATC--T---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACTAAAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTTGGACATCCCTTAAT
gi|40063 : AAAAA--TC---TTTCGAAT---A--T-CGAGATTATTTCC---TTCGACT--AAAA----GTTA-T------CG---AA-TAGC-TC-G-ATT-ACGAAA-TT-TA--CTCA--TTT-GACATCCT-TAAT
gi|40064 : AAAAA--AG---GTTCGAAT---AA-A-TGAA--TATT--C---TTTGACT--ATA-----GCAA-T------CA---AA-TAA--TA-G-ACT-
gi|40065 : AAAC--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TT-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40066 : AAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCAACT--AAATTAA-GCTA-T------TG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40067 : AAAA--AC---TTTCGAAA---AA-T-CCAA--TAAT--C---TTCGACT--AAA-----GTTA-T------CG---AA-TAA--TC-
gi|40068 : AAC--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAT--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-T-A--TA-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTGATTTTT-GACATCCC-TA
gi|40069 : ---TTTTGAAT---AA-T-CAAA--TATT--C---TTTGACT--AAATTAATGCTA-T------CG---AA-TAA--AC-G-ACT-AAAAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40070 : TTCGAATTCTGA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CA---AA-TAA--AC-T-ACT-AAGACA-TT-TA--CTCG-TGTT-GACATCCT-TAAT
gi|40071 : TTCGAATTCTGA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACTGAAAA-----GCTA-T------CA---AA-TAAACTC---ACT-AAGACA-TT-TA--CTCG-TGTT-GACATCCT-TAAT
gi|40072 : TCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AAA-----GCTC-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGGAA-TT-TT--TTCA-TTTT-GACGTCCC-TTAT
gi|40073 : GAAT---AA-TTCGAA--TAGT--CCCCTTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AAATAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40074 : AT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--ATA-----GCTA-T------TGAATAA-TAA--TA-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA--TGT-GACATCCT-TAAT
gi|40075 : -T-CGAA--TATT--C---TTCTACT--AAA-----GCTA-C------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-ATGAAA-TC-TA--CTCA-TTTT-GACATCTC-TA
gi|40076 : -T-TGAA--TATT--C---TTCAACT--AAA-----GCTA-T------CA---AA-TCA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-
gi|40077 : -T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------C----------------------AAAAA-TG-TA--CTCA-TTTT-GACATCCT-TTAT
gi|40078 : -T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AA------GCTAAT------TA---AA-TG---TCAG-ACT-A-GAAA-TT-TATACTTA-TTTT-GACATTCC-TAGT
gi|40079 : ATT--C---TTCGACT--AAA-----ACTA-T------TA---AA-TAA--TC-T-ACT-AGGAAT-TT-TA--CTAA-TTTT-GACA--CC-TA
gi|40080 : ATT--C---TTCGACT--AAA-----CTTA-T-------A---AA-TAA--TC-T-ACT-AGGAAT-TT-TA--CTAA-TTTT-GACA--CC-TA
gi|40081 : ---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AC-TAA--TC-G-ACT-AAGAGATTT-TA--CTCA-TATT-GACAGCCC-TAAT
gi|40082 : --AAA-----CTTG-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TC-TG--CTAA-TTTG-GACATCCC-
gi|40083 : -----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACA-AAGAAA-TT-TA--CTCC-TTTT-GACATCCC-TAGT
blockSeqs : CC ATT TCT A A AT TC CCC GA TTAAT A GATAAT AAT A AC A A A T A TA T G T
blockSeqs : . . TCT . T . . . . TTAA . . . . C . . . T . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . TTAA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
finalCons : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
Alignments
lowQualScore : 22 333 666 1 2 11 11 222 11 88888 1 333333 111 1 22 1 1 1 2 1 11 1 1 1
lowQualScore : .. ... ... . . .. .. ... .. ..... . ...... ... . .. . . . . . .. . . .
lowQualScore : 55 000 444 2 5 77 66 000 55 44444 1 111111 999 1 66 1 1 1 3 1 66 2 2 2
consensus : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
Reference ( family-465 ) : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40047 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AATGAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40048 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40049 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40050 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AAA-----TCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-TAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40051 : AAAAA--ACATTTTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------TG---AA-TCA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAA
gi|40052 : AAAAACCAC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AGGAAA-TT-TA--CTGA-TTTT-GACATCCC-TAA
gi|40053 : AAAAA--AC---TTTTGAAT---AA-T-CAAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------TG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TC-TG--CTAA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40054 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-T-CAAA--TATT--A---TTCGAAT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-TAGAAATTT-TA--CTCA-TTTT-GACAGCCC-TAAT
gi|40055 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCAACT--AAA-----TCTA-TGATAATCG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGATA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40056 : AAAAA--AC---TTTCGAAT---AA-TACTAG--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TG-TT--CTTA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40057 : AAAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GGCA-T------CG---AA-TAA--TC-G-AC--AAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40058 : AAAAA--AC---ATTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTTGACT--GAA-----GCTA-T------CG---AA-TAT--TC-G-ACT-AA-AAA-TTATA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40059 : AAAAA--AC---TTTTGAAT---AA-T-CGAA--TACT--C---TTAGACT--AAATTAA-GCTA-T------CG---AA-CAA--TC-G-ACT-GAAAAT-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40060 : AGAAA--AC---TTTCGAATG--AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-GAACT-AAGAAA-TT-C---CTCA-TTTT-GACATC
gi|40061 : AAAAA--TC---TTTCGCAT---AA-T-CGAA--AATT--C---TTCGACC--AAA-----GGCA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40062 : AAAAA--TC---TTTCGAAT---AAAT-CGAA--TATC--T---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACTAAAGAAA-TT-TT--CCTA-TTTTGGACATCCCTTAAT
gi|40063 : AAAAA--TC---TTTCGAAT---A--T-CGAGATTATTTCC---TTCGACT--AAAA----GTTA-T------CG---AA-TAGC-TC-G-ATT-ACGAAA-TT-TA--CTCA--TTT-GACATCCT-TAAT
gi|40064 : AAAAA--AG---GTTCGAAT---AA-A-TGAA--TATT--C---TTTGACT--ATA-----GCAA-T------CA---AA-TAA--TA-G-ACT-
gi|40065 : AAAC--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TAGT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-TAA--TT-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--TTCA-TTTT-GACATCCC-TAGT
gi|40066 : AAAA--CC---TTTCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCAACT--AAATTAA-GCTA-T------TG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TA
gi|40067 : AAAA--AC---TTTCGAAA---AA-T-CCAA--TAAT--C---TTCGACT--AAA-----GTTA-T------CG---AA-TAA--TC-
gi|40068 : AAC--AC---TTTCGAAT---AA-T-CGAT--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AA-T-A--TA-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTGATTTTT-GACATCCC-TA
gi|40069 : ---TTTTGAAT---AA-T-CAAA--TATT--C---TTTGACT--AAATTAATGCTA-T------CG---AA-TAA--AC-G-ACT-AAAAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40070 : TTCGAATTCTGA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CA---AA-TAA--AC-T-ACT-AAGACA-TT-TA--CTCG-TGTT-GACATCCT-TAAT
gi|40071 : TTCGAATTCTGA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACTGAAAA-----GCTA-T------CA---AA-TAAACTC---ACT-AAGACA-TT-TA--CTCG-TGTT-GACATCCT-TAAT
gi|40072 : TCGAAT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AAA-----GCTC-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGGAA-TT-TT--TTCA-TTTT-GACGTCCC-TTAT
gi|40073 : GAAT---AA-TTCGAA--TAGT--CCCCTTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AAATAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA-TTTT-GACATCCC-TAAT
gi|40074 : AT---AA-T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--ATA-----GCTA-T------TGAATAA-TAA--TA-G-ACT-AAGAAA-TT-TA--CTCA--TGT-GACATCCT-TAAT
gi|40075 : -T-CGAA--TATT--C---TTCTACT--AAA-----GCTA-C------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-ATGAAA-TC-TA--CTCA-TTTT-GACATCTC-TA
gi|40076 : -T-TGAA--TATT--C---TTCAACT--AAA-----GCTA-T------CA---AA-TCA--TC-G-ACT-AAGAAA-TT-
gi|40077 : -T-CGAA--TATT--C---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------C----------------------AAAAA-TG-TA--CTCA-TTTT-GACATCCT-TTAT
gi|40078 : -T-CGAA--TATT--C---TTCGAAT--AA------GCTAAT------TA---AA-TG---TCAG-ACT-A-GAAA-TT-TATACTTA-TTTT-GACATTCC-TAGT
gi|40079 : ATT--C---TTCGACT--AAA-----ACTA-T------TA---AA-TAA--TC-T-ACT-AGGAAT-TT-TA--CTAA-TTTT-GACA--CC-TA
gi|40080 : ATT--C---TTCGACT--AAA-----CTTA-T-------A---AA-TAA--TC-T-ACT-AGGAAT-TT-TA--CTAA-TTTT-GACA--CC-TA
gi|40081 : ---TTCGACT--AAA-----GCTA-T------CG---AC-TAA--TC-G-ACT-AAGAGATTT-TA--CTCA-TATT-GACAGCCC-TAAT
gi|40082 : --AAA-----CTTG-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACT-AAGAAA-TC-TG--CTAA-TTTG-GACATCCC-
gi|40083 : -----GCTA-T------CG---AA-TAA--TC-G-ACA-AAGAAA-TT-TA--CTCC-TTTT-GACATCCC-TAGT