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Reference ( gi|5450 ) : TTGT-GAC-A-TC-A-G-AT--GC----C-GCG--AAG---A--G-CA--C-TGG---AG-T-A---CA--TT--T-A-G---T-A-----C---A-G-T-A-----CT----G-CGA----T--T-TT-TC-TC-G-G-G-G---A--AACCTTAACC-TAGCTGCG
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lowQualScore : . . . . ... .. ...... .. ... .. . .. . ... . . ... .. .. . ..... . .. ... . ... ..... .... . .... .. . . . ... . . ... .. .
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gi|5465 : TTGT-GAC-G-TC-A-T-AT--GA----T-GTG--AAG---T--G-CA--C-AGA---GG-T-G---CA--TT--T-ATA---T-A--C---A-G-C-A-----CT----G-TG--------T-TT-GT-TC-GTG-G-G---A--AGCCTTTATT-TAGCTG
gi|5466 : TTGT-GAC-G-TC-A-T-AT--GG----T-GGG--AAG---T--G-CA--C-AGA---GG-T-A---CA--TT--TGA-A---T-T--C---A-G-C-A-----CT----G-TGA----TA-G-TT-TA-T----G-G-G---A--AGCCTTAACT-TAGCTG
gi|5467 : TTGT-GAC-G-TC-A-T-AT--GG----T-GCG--AAG---T--G-CA--C-AGA---GG-T-A---CA--TT--T-A-----T-A--TTG-A-G-C-A-----CT----G-TGA----TA-G-TT-TA-T----G-G-G---A--AGCCTTAATT-AAGCTG
gi|5468 : TTGT-GGC-G-TC-A-C-AC--AC----T-GCG--AAG---T--G-CA--C-TGG---GG-T-A---CA--TG--T-ATG---T-A--C---A-G-C-A-----GT----G-TGG----C--A-TT-CA-TC---G-G-G---A--CGCCTCAACC-
gi|5469 : TTGT-GAC-G-TC-A-T-AT--GG----T-GCG--GAG---T--G-CA--C-AGA---GA-T-A---CA--TTA-T-A-T---T-A------A-A-C-A-----CT----G-TCA----T--TGTT-TA-T----G-G-G---A--AGCCTTAACT-TAGCCG
gi|5470 : TTGT-GAC-G-TC-G-T-AT--GG----T-GCG--AAG---T--G-CA--C-AGA---GG-T-A---CA--TT--T-A-----T-ATTC---A-G-C-A-----CT----G-TGA----T--
gi|5471 : TGT-GAC-G-TCCA-G-AT--GC----T-ATG--AAG---A--G-CA----TAT---AG-T-A---CA--TT--T-A-G---T-A--C---A-G-T-A-----CT----G-GGA----T--T-TT-TT-AA-A-G-A-G---A--AACCTTAACC-TAACTGC
gi|5472 : TGT-GAC-G-TC-A-G-AT--GC----C-GCG--ACG---A--A---------G---AG-C-A---C---------------T-A--C---A-G-T-A-----CT----G-CGAT---T--T-TT-TC-TC---G-G-G---A--ATCCTTAACC-TAGCTGCG
gi|5473 : TGT-AAC-G-TC-A-G-AT--GC----C-GCG--AAG---A--G-CA--C-TGG---AA-T-A----------------------------------A-----CT----G-CGA----T--T-TT-TC-TC-G-G-G-G---A--AACCTTAA
gi|5474 : TGT-GA----TC-A-G-AT--CA----T-GTG--AAA---A--G-CA--C-TGG---GG-T-A---CA--TT--T-A-G---T-A--C---ATG-T-ACAGTTCT----G-CAA----T--T-TT-TC-TT-G-G-GAG---G--CAC---GACT-TAGCTGCG
gi|5475 : TGT-GAC-G-TC-A-T-AT--AA----T-GCA--AAG---T--G-CA--T-AGA---GG-T-A---CA--TTA-T-A-T---T----C---A-G-C-A-----AT----G-TGA----T--T-GT-TC-TT---G-G-G---A--AGCCTTAACT-TAG
gi|5476 : TGT-GAC-G-TC-A-T-AT--GT------GCG--AAA---GTTG-CA--C--AG---AG-T-A---CA--TT--T-A-----T-A--TTG-A-G-C-AAAA--CT----G-TGA----TAGG-TT-TA-T----G-G-G---A--AGCCTTAACT-AAGCTG
gi|5477 : TGT-GAC-G-TC-A-T-AT--AA----T-GCA--AAG---T--A-CA--T-AGA---GG-T-A---CA--TTA-T-A-T---T----C---A-G-C-A-----AT----G-TGA----T--T-GC-TC-TT---G-G-G---A--AGCCTTAACT-TAG
gi|5478 : T-GAC-G-TC-A-G-AT--GC----C-GCGCAAAG---A--G-CA--A-TGG---AT-T-G---CA--TTC-T-A-G---TTA--C---A-AAT-A-----CT----G-CGA----T--T-TT-TC-TC-T-G-G-G---A--AACCTCAACT-TAGCTGCG
gi|5479 : -GAC-G-TC-A-G-ATTGGC----CAGCG--AAG---A--G-CA--C-TGG---AG-T-A---CA--TTATT-A-G---T-A--C---A-G-T-A-----CT----G-CGA----T--T-TT-TT-AC-G-G-T-G---A--AACCTTAACT-TAGCTGCG
gi|5480 : AC-G-TC-A---AT--GC----C-GCG--AAG---A----CG----TGG---AG-T-A---CA--TT--T-A-GA--T-A--C-----G-A-A-----CT----G-CTA----A--T-TT-TC-TCTG-G-G-G---A--AACCTTAA-C-TAGCTGCG
gi|5481 : C-A-G-AT--GC----C-G-A--AAG---A--G-CA--A-TGGGTCAG-T-A----A--TT----A-G---T-A--C---A-G-T-A-----CT----G-CAT----T--T-TT-TC-TC-G-G-G-G---AGGAACCTTAACC-TAGCTGCG
gi|5482 : -A-G-AT--GC----C-GCG--AAG---A--G-CA--C-TGG---AG-T-A---CAT-TT--T-A-G---T-A--C---A-G-T-A-----CT----G-CGA----T--A-TT-T--TC-G-G-G-G---A--AACCTTAATC-TAGCTGTG
gi|5483 : ---A--G-CA--C-TGG---AG-T-A---CA--TT--T-A-G---T-A--C---A-G-T-A-----CT----G-C-A----T--T-TT-TC-TC-G-G-G-G---A--AACCTTAACC-TAGCTGCG
gi|5484 : G---AGCT-A---CA--TT--T-A-G---T-A--C---A-G-T-G-----CT----G-CGA----T--T-CT-TC-TA-T-G-G-A---A--AGCCTTAACA-TAGCAGCG
gi|5485 : --T-A-G---T-A--C---A-G-TTA-----CTT---G-CGGAT--T--T-TT-TC-TC-G-C-G-G---G--AACCTTAACC-TAGTTGCG
gi|5486 : T-TC-TC-G-G-G-G---A--AACCTTAACC-TAGCTGCG