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gi|58267 : AT-GAAATTG----G-T----ACTT--T-G-----TA--TTGTA-A-G------GC--G-AA-G---CTT-A-------A-------TC-A--TT-A-----AT-CAAT--T----AAGG--GT-AAA--A-G-A-CC--ATTT---CA-----T-CAT--GA-TTA-GATG-CCAA
gi|58268 : AATTG----G-T----GCTT--T-A-----TA--C---A-A-GCTGAA-GC--A-AA-A---CT--A-------A-------TC-A--TA-A-----AA-CAAA--T----AA-G--GT-AAA--A-G-A-CCA-TATT---CA-----T--AT--GA-TTA-GATGTTCAA
gi|58269 : ----G-T----ACTT--C-G-----TA--C---A-A-G------TC--A-AA-A---CT--A-------A-------TC-A--TT-A-----AT-CAAA--T----TAGG--TT-AAA--G-G-A-CC--ATTT---CA-----T-CAT--GA-CTA-AATA-TTAA
blockSeqs : T TACC G TTAT GT AATTTG AC TGT G A CTGAAG CA T T AAA TA CACTGTA AATGACC A TG T CCGGT A AA ATTA GC T AT TA T AAAA GAG ACAAG G CG G G T
blockSeqs : T . . . A AGAGT T . . . CTGAA C . T T T . . . . . . T A . . . T AT G TAA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A TA A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . ATA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . CA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . CA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . CT . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TATTAT-GAAATTG----G-T----GCTT--T-A-----TA--C---A-A-G------GC--A-AA-A---CT--A-------A-------TC-A--TT-A-----AA-CAAA--T----AAGG--GT-AAA--A-G-A-CC--NNTT---CA-----T-CAT--GA-TTA-GATG-TCAA
finalCons : TATTAT-GAAATTG----G-T----GCTT--T-A-----TA--C---A-A-G------GC--A-AA-A---CT--A-------A-------TC-A--TT-A-----AA-CAAA--T----AAGG--GT-AAA--A-G-A-CC--NNTT---CA-----T-CAT--GA-TTA-GATG-TCAA
Alignments
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lowQualScore : . .... . .... .. ....... .. ... . . ...... .. . . ... .. ....... ....... . .. . ..... . .. .... .. . .. ... . .... ... ..... . .. . . .
lowQualScore : 3 3333 1 3333 66 8888888 66 999 1 1 888888 66 1 2 000 66 5555555 5555555 1 55 1 77777 3 66 4444 55 1 66 222 2 3333 999 88888 1 66 1 2 3
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Reference ( family-458 ) : TATTAT-GAAATTG----G-T----GCTT--T-A-----TA--C---A-A-G------GC--A-AA-A---CT--A-------A-------TC-A--TT-A-----AA-CAAA--T----AAGG--GT-AAA--A-G-A-CC--NNTT---CA-----T-CAT--GA-TTA-GATG-TCAA
gi|58233 : TATTAT-GAAATTG----G-T----GCTT--T-A-----TA--C---A-A-G------GC--A-AA-A---CT--A-------A-------TC-A--TT-A-----AA-CAAA--T----AAGG--GT-AAA--A-T-A-CC--TATT---CA-----T-CAT--GA-TTA-GATG-TCAA
gi|58234 : TATTAT-GAAATTG----G-T----GCTT--T-A-----TA--C---A-A-T------GC--A-AA-A---CT--A-------A-------TC-A--TT-A-----AA-CAAA--T----AAGG--GT-AAA--A-T-ATCT--ATTT---CA-----T-CAT--GA-TTA-TATG-TCAA
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gi|58242 : TATTAT-GAAATTG----GGT----GCTT--T-A-----TA--C---A-A-G------GC--A-AA-C---CT--C-------A-------AC-A--TT-A-----AA-CAAAAAT----AAGG--GT-AAA--A-T-A-CC--TATT---CA-----T-CAT--GA-TTA-
gi|58243 : TATTATTGAAATTG----G-T----TCTT--TTA-----CA--C---A-A-A------GC--A-AATA---CT--A-------A-------TC-A--TT-A-----AAACAAA--T----AAGG--GTTAAA--A-T-A-TC--TATT---CA-----T-CAT--GA-TTA-GATG-TCAA
gi|58244 : TATTAT-GAAATTG----G-T----ACTT--T-G-----TA--C---A-AAG------GC--A-AA-A---CT-------------------C-A--TT-A-----AT-CAAA--T----AAGA--GT-TAA--A-G-A-GC--ATTT---CA-----T-CTT--GA-TTA-GATG-TCAA
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gi|58251 : TAGTAT-GAAATTG-----------------------------C---A-A-G------GC--A-AA-A---CT--A-------A-------TC-A--TT-A-----AT-CAAA--T----AAGG--GT-ATA--A-G-A-CC--ATTT---CA-----T-CAT--GA-TTA-GATG-CCAA
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