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gi|75265 : GGATGATTAATAGTA-CGTC-ACG-TGATATTTAA-CA-C------G-A----T---GGC-G-T-AATA-T---TTA-A-TTTGTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-G-------A-A---------A---T-----------C---------------------AGTAAGTAAACTTGGGTTAGATTATAT-------A---T-TT--T-C-A--C-A----T-GT-A-T-T-AA-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GTAT-A--TA--TGAAAAGA
gi|75266 : GGATGATTGATAGTA-CGTC-ACG-TGAT-----C-CA-T------T------T---GAC-G-T-AATA-T---ATT-A-TT-GTGACGTC-AC-A-A---GC-C----A--G--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-T--------------C-------------TA-T---TT-TCC-A-----AT-G----T---------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A-----TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-C-AT-CT-----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTATAAGA
gi|75267 : GGATGATTAATAGTA-TGTC-ACA-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-C-AATA-CAG-TCA-G-CT-CT--CGTT-AC-A-ACG-GC-C----A-CG--
gi|75268 : GGATGATTAATAGTA-TGTC-ACA-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-C-AATA-CAAGTCA-G-CT-CT--CGTT-AC-A-ACG-GC-C----A-CG--
gi|75269 : GGATGATTAATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AT-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTA-A-TT-GTGGCGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-A-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-CGA-----AT-C----C-A-------A-A---------A---
gi|75270 : GGACGTTTGCTAGAA-CGTC-ACG-TGAGA---AA-CA-C------G-A----T---GGC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACATC-AC-A-AT--GC-A----A-CG--CCA--A---G-T-------G-----G--A---G-A--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------AG------------------------T-------AAACT-TTGGT-T-A--A-ATTTTA-AT-A-T-T-TT-C-G----CAGTTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--
gi|75271 : GGAGGATAAA-AGTA-CGTC-ACG-TGATC---AA-CA-C------TCA----T----AT-G-TTAATA-TA--TTG-A-TT-GTGACTTC-AC-A-AT--AG-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-A-G-----AG-GA---T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---G-TT--T-C-AG-C-A----A-GC-A-TGT-AT-TTGC---C--TTTC-GAA-TG-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75272 : GGATGATTGATAGTA-CGTC-ACG-TGAT----AA-CACC------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GT-T----A-------A--A---A---------------------------------------------------------------T-C-A-------------T-A-------A---------------------------------------------------------------------------------------T-TT--T-C-A--C-A----T-GC-A-T-T-AT-CTG----T--TTTC-AAATTC-T-GTAT-A--TA--TTAAAA
gi|75273 : GGGTGATTTATAGTG-T-TC-ACG-TGATA---AA-AA-T------G-A----T---GGC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTTATGTCAAC-A-AT--AT-C----A-TG--CCACGG---G-C-------G-----G--AG--G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------AAAGC-TT--T-G-GGTT-A----A----A-T-T-AT-AT-----T--TTTG-AAATTT-A-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75274 : GGATGATTGGTAGTA-CGTC-ACG-TAATT---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-ACTA-T---TTG-A-TT-GTGACGT
gi|75275 : GGGTGATTGATAGTA-CGTCAACG-TGATA---AA-CA--------------------AC-G--------C---TTG-A-TTCTTTACGTC-AC-C-AT--A--T----A-AA--TCA--T---A-T-------A-----C------G-GTAC-----------C-------------AA-T---TT-T-T-T-----AT-G----C-ACC-----A-G---------A---TG----------C---------------------G-------------------------C-------A---T-TT--C-G-A--C-A----A-AA-A-T-T-AT-GT-----C--TTTC-A
gi|75276 : GATGATTGATAGTA-CGTC-A-A-TGACG---T--CA----------A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--GCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------CAGTAAACTTTGGTTAAATTAAA-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----T-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAC-A--TA--TTGAAAGA
gi|75277 : GATGATACATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-CTCACTTT-A----T---GATAG-TAAATA-T---TTG---TT-GTGATGTC-TC-ACAT--GC-C----A-CG---CA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-G-C-A-----AT-G----TAA-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-ATCCTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-G--TGTTTTAAAAGA
gi|75278 : TGATAAATAGTA-TGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---AAC-GCT-AATA-TC--TTG-A-CT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------T-----C--AA--G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----ATTG----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------TG------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TCTT-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75279 : AATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AACCA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-----TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---A-G--------------C-------------TATT---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-T-----------------------------T-CTG----C--TTTC-AAGTCT-T-GCAT-A--TA--
gi|75280 : AATAG-A-CGTC-ACG-TGATA---AA-CAGC------T-A----T---GA--G-TGAATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-A--A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------CT------------TA-T---TT-T-C-A-----A---------A-------C-A---------A---T-----------T---------------------A-----------------------------------------------A--A-A----A--------T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75281 : GTA-CGCC-ATG-----A---AA-TA-C-----------------G---G-T-AATA-T---TTGGA-TT-GTGACGTC-ACAA-ATTAGC-C----A-CG--CCA--ACATG-C-------GC----C--A---GCG--------------C-------------TA-T---TTAT-C-A-----ATGG----T-A-------ACA---------ACT-T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---TATT--T-CAA--C-A----ACGC-ATT-T-ATACTGAACTC--TCTC-AAATTC-T-GCATAA--TA--ATTAAAGA
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gi|75284 : A-T---TTG-A-TT-GTGAC-TC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---GCC-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTCTT-GCAC-A--TA--TTAAAAGA
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gi|75286 : A-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------GGAGGAC--ATTTG-G--------------CGAATTCCATTTAATA-T---TT-A-C-A-----AT-G----T-A-------C-A---------A---TGAGTAAAGTAAC---------------------A-------------------------TTGGTTGAA---TATT--TTC-A--C-A----T-GC-A-T-T-GA-TTG----C--TTTT-AAATTC-T-GCAT-A--TA--
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gi|75288 : A-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G--------A---G-GACATTTGGCGAATTC-------------CA-TTTATT-T-C-A-----AT-G----T-ACATGAGTA-A---------A---TATTGGTTA---A---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----T-GC-A-T-TGAT-C-G----C--TTAA-AATTTT-T-GCATAA--TA--TTAGA
gi|75289 : A-T---TTG-A-TT-GTGAGGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G-----G--G---G-G--------------A-------------CA-T---T
gi|75290 : A-T---TTG-AGTT-GTGAAGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CGC-CCA--A---A-C-------G-----G--A---G-A--------------C--------------A-T---TT-T-
gi|75291 : TG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G-----G--A---G-G--------------A-------------CA-T---TT-
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gi|75293 : G--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-TTC-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------A---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-T-A--C-A----A-GC-A-G-T-AT-CTG----C--TTTC-GAATTC-T-GCAT-A--TA--TTTAAAGA
gi|75294 : -A-----AT-G----T-A-------G-A---------AATAT-----------C---------------------A-------------------------T-----------T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG-------TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAAA
gi|75295 : T-A----T-A-------G-A---------C---T-----------C---------------------A---------------------------------A---T-TT--T-A-A--C-A----A-GC-A-T-A-A--CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAA
Alignments
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lowQualScore : . . . ... . ........ . .... ... . . . . ... . . . . . . .. . .... . .. .. ... . ....... ..... .. ... . ............................ . ... . . . ..... . .... . ....... . ......... ... ....................................................................... . .. . . .. . .... . . . . . . .... .. . . . . .. ..
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Reference ( family-456 ) : GGATGATTAATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75259 : GGATGATTGATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-T----A-CG--GCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-T---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-T-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
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gi|75274 : GGATGATTGGTAGTA-CGTC-ACG-TAATT---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-ACTA-T---TTG-A-TT-GTGACGT
gi|75275 : GGGTGATTGATAGTA-CGTCAACG-TGATA---AA-CA--------------------AC-G--------C---TTG-A-TTCTTTACGTC-AC-C-AT--A--T----A-AA--TCA--T---A-T-------A-----C------G-GTAC-----------C-------------AA-T---TT-T-T-T-----AT-G----C-ACC-----A-G---------A---TG----------C---------------------G-------------------------C-------A---T-TT--C-G-A--C-A----A-AA-A-T-T-AT-GT-----C--TTTC-A
gi|75276 : GATGATTGATAGTA-CGTC-A-A-TGACG---T--CA----------A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--GCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------CAGTAAACTTTGGTTAAATTAAA-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----T-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAC-A--TA--TTGAAAGA
gi|75277 : GATGATACATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-CTCACTTT-A----T---GATAG-TAAATA-T---TTG---TT-GTGATGTC-TC-ACAT--GC-C----A-CG---CA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-G-C-A-----AT-G----TAA-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-ATCCTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-G--TGTTTTAAAAGA
gi|75278 : TGATAAATAGTA-TGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---AAC-GCT-AATA-TC--TTG-A-CT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------T-----C--AA--G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----ATTG----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------TG------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TCTT-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75279 : AATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AACCA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-----TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---A-G--------------C-------------TATT---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-T-----------------------------T-CTG----C--TTTC-AAGTCT-T-GCAT-A--TA--
gi|75280 : AATAG-A-CGTC-ACG-TGATA---AA-CAGC------T-A----T---GA--G-TGAATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-A--A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------CT------------TA-T---TT-T-C-A-----A---------A-------C-A---------A---T-----------T---------------------A-----------------------------------------------A--A-A----A--------T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75281 : GTA-CGCC-ATG-----A---AA-TA-C-----------------G---G-T-AATA-T---TTGGA-TT-GTGACGTC-ACAA-ATTAGC-C----A-CG--CCA--ACATG-C-------GC----C--A---GCG--------------C-------------TA-T---TTAT-C-A-----ATGG----T-A-------ACA---------ACT-T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---TATT--T-CAA--C-A----ACGC-ATT-T-ATACTGAACTC--TCTC-AAATTC-T-GCATAA--TA--ATTAAAGA
gi|75282 : TA---AA-CATC------T-GGTATT---GAG-T-T-AATA-T---GTG-A-TT-GTGA-GTC-AC-A-AT--GC-TCCTGATCGTTCCA--T---G-ATTGTGTAG-----C--A---G-G--------------C-------------TAATG--TT-T-C-AGGCGAAT-GGTTTT-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------TGT-----A---T-TTG-T-C-A--CGA----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC--AATTC-TGGCAT-ATTTA--TTA
gi|75283 : C-G-T-GTTA-A---TTG-A-TT-GTGATGTC-AC-A-AT--GC-C----A-TG--CCA--A---A-C-------G-----
gi|75284 : A-T---TTG-A-TT-GTGAC-TC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---GCC-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTCTT-GCAC-A--TA--TTAAAAGA
gi|75285 : A-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----CGCA---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------AT--T-TT--T-C-A--C------A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTCTT-GCAC-A--TA--TTAAAAGA
gi|75286 : A-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------GGAGGAC--ATTTG-G--------------CGAATTCCATTTAATA-T---TT-A-C-A-----AT-G----T-A-------C-A---------A---TGAGTAAAGTAAC---------------------A-------------------------TTGGTTGAA---TATT--TTC-A--C-A----T-GC-A-T-T-GA-TTG----C--TTTT-AAATTC-T-GCAT-A--TA--
gi|75287 : A-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------GGAGGAC--ATTTG-G--------------CGAATCCATT----TA-T---TT-G-C-A-----AT-G----T-AC------A-ATGAGTAAACA---T-----------CGGTTAA---------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----T-GC-A-T-CGAT-C-G----C--TTTT-TAATTC-T-GCAT--------TTATAAGA
gi|75288 : A-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G--------A---G-GACATTTGGCGAATTC-------------CA-TTTATT-T-C-A-----AT-G----T-ACATGAGTA-A---------A---TATTGGTTA---A---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----T-GC-A-T-TGAT-C-G----C--TTAA-AATTTT-T-GCATAA--TA--TTAGA
gi|75289 : A-T---TTG-A-TT-GTGAGGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G-----G--G---G-G--------------A-------------CA-T---T
gi|75290 : A-T---TTG-AGTT-GTGAAGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CGC-CCA--A---A-C-------G-----G--A---G-A--------------C--------------A-T---TT-T-
gi|75291 : TG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G-----G--A---G-G--------------A-------------CA-T---TT-
gi|75292 : -AT-A-AT--GC-CC---A-CG--CCA--A---G-C-------GG----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----TAA-------A-A---------A---T-----------C---------------------AG------------------------T-------AAACT-TG--T-T-A--A-G----A-TC-A-A-T-AT-----------TTTT-AAA-------CAT-G--CA--TTAAA
gi|75293 : G--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-TTC-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------A---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-T-A--C-A----A-GC-A-G-T-AT-CTG----C--TTTC-GAATTC-T-GCAT-A--TA--TTTAAAGA
gi|75294 : -A-----AT-G----T-A-------G-A---------AATAT-----------C---------------------A-------------------------T-----------T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG-------TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAAA
gi|75295 : T-A----T-A-------G-A---------C---T-----------C---------------------A---------------------------------A---T-TT--T-A-A--C-A----A-GC-A-T-A-A--CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAA
blockSeqs : A A C TTT C CTCACTT C GTAT CAT A C T A AAG G G T A A C TA G CCTG T TT CG CAT C TTGTGTA GAGGA GC TTT C ACATTTGGCGAATTC T TTA A C G GGCGA T GTTT A CATGAGT C TGAGTAAAC ATA CAGTAAGTAAACTTGGGTTAGATTATATA A GG T A GT G TTTT C A T G G C AACT AG A T G A TT TT
blockSeqs : . . . G . CC . . . . . A A AG . . C . . . G . C . C . . . . GAGGA . TTT . CGAATTCCATTTAA A G . T . . G A A CC . . CT CAGTAAACGTGGGTTGGATTAAATA A G . . G . . . . . . G A C . . T . A . .
blockSeqs : . . . . . GC . . . . . G . A . . . . . . G . . . . . . . . C . G . CGAATCCATT . G . . . . . . . C . . . CAGTAAACTTTGGTTAAATTAAATA . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . TC . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G . A . TACC . . . . . . . . . . . . . GAGTAAAGTAACATTGGTTGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . ATTGGTTAAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CGGTTAAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . CAGTAAAC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CAGTAAAC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATAAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATGTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . GCGCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . AATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : GGATGATTAATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
finalCons : GGATGATTAATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
Alignments
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lowQualScore : . . . ... . ........ . .... ... . . . . ... . . . . . . .. . .... . .. .. ... . ....... ..... .. ... . ............................ . ... . . . ..... . .... . ....... . ......... ... ....................................................................... . .. . . .. . .... . . . . . . .... .. . . . . .. ..
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consensus : GGATGATTAATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
Reference ( family-456 ) : GGATGATTAATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75259 : GGATGATTGATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-T----A-CG--GCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-T---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-T-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75260 : GGATGATTAATAGTAACGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATAAT---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GCGT----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----T--A---A-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GCAA-T-T-AT-CTG----C--CTTCAAAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75261 : GGATGATTGATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----TCATGAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CA--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------A-------------TA-T---TT-T-C-A-----AC-A----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GA-A-T-T-AT-CTG----C--TCTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75262 : GGATGATAAATAGTG-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CC--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C-------------------------------------------------------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----A--TTTC-AAATTC-T-GCAT-G--TA--TTAGAAAA
gi|75263 : GGATGATAAATAGTA-CGTC-ACGCTGATAG--AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATAAT---TTG-A-TT-GTGACATC-AC-A-AT--GC-C----A-AG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-TG--TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---------------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C---TTC-AAATTCTT-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75264 : GGATGATAAATAGTA-CATC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------T-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-C-------A-A---------A---T-----------CAGTAAACGTGGGTTGGATTAAA-------------------------T-------A---T-TT--T-T-A--T-A----T-GT-A-T-T-AA-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GTAT-A--TA--TTAAAAAA
gi|75265 : GGATGATTAATAGTA-CGTC-ACG-TGATATTTAA-CA-C------G-A----T---GGC-G-T-AATA-T---TTA-A-TTTGTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-G-------A-A---------A---T-----------C---------------------AGTAAGTAAACTTGGGTTAGATTATAT-------A---T-TT--T-C-A--C-A----T-GT-A-T-T-AA-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GTAT-A--TA--TGAAAAGA
gi|75266 : GGATGATTGATAGTA-CGTC-ACG-TGAT-----C-CA-T------T------T---GAC-G-T-AATA-T---ATT-A-TT-GTGACGTC-AC-A-A---GC-C----A--G--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-T--------------C-------------TA-T---TT-TCC-A-----AT-G----T---------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A-----TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-C-AT-CT-----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTATAAGA
gi|75267 : GGATGATTAATAGTA-TGTC-ACA-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-C-AATA-CAG-TCA-G-CT-CT--CGTT-AC-A-ACG-GC-C----A-CG--
gi|75268 : GGATGATTAATAGTA-TGTC-ACA-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-C-AATA-CAAGTCA-G-CT-CT--CGTT-AC-A-ACG-GC-C----A-CG--
gi|75269 : GGATGATTAATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AT-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTA-A-TT-GTGGCGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-A-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-CGA-----AT-C----C-A-------A-A---------A---
gi|75270 : GGACGTTTGCTAGAA-CGTC-ACG-TGAGA---AA-CA-C------G-A----T---GGC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACATC-AC-A-AT--GC-A----A-CG--CCA--A---G-T-------G-----G--A---G-A--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------AG------------------------T-------AAACT-TTGGT-T-A--A-ATTTTA-AT-A-T-T-TT-C-G----CAGTTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--
gi|75271 : GGAGGATAAA-AGTA-CGTC-ACG-TGATC---AA-CA-C------TCA----T----AT-G-TTAATA-TA--TTG-A-TT-GTGACTTC-AC-A-AT--AG-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-A-G-----AG-GA---T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---G-TT--T-C-AG-C-A----A-GC-A-TGT-AT-TTGC---C--TTTC-GAA-TG-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75272 : GGATGATTGATAGTA-CGTC-ACG-TGAT----AA-CACC------T-A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GT-T----A-------A--A---A---------------------------------------------------------------T-C-A-------------T-A-------A---------------------------------------------------------------------------------------T-TT--T-C-A--C-A----T-GC-A-T-T-AT-CTG----T--TTTC-AAATTC-T-GTAT-A--TA--TTAAAA
gi|75273 : GGGTGATTTATAGTG-T-TC-ACG-TGATA---AA-AA-T------G-A----T---GGC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTTATGTCAAC-A-AT--AT-C----A-TG--CCACGG---G-C-------G-----G--AG--G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------AAAGC-TT--T-G-GGTT-A----A----A-T-T-AT-AT-----T--TTTG-AAATTT-A-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75274 : GGATGATTGGTAGTA-CGTC-ACG-TAATT---AA-CA-C------T-A----T---GAC-G-T-ACTA-T---TTG-A-TT-GTGACGT
gi|75275 : GGGTGATTGATAGTA-CGTCAACG-TGATA---AA-CA--------------------AC-G--------C---TTG-A-TTCTTTACGTC-AC-C-AT--A--T----A-AA--TCA--T---A-T-------A-----C------G-GTAC-----------C-------------AA-T---TT-T-T-T-----AT-G----C-ACC-----A-G---------A---TG----------C---------------------G-------------------------C-------A---T-TT--C-G-A--C-A----A-AA-A-T-T-AT-GT-----C--TTTC-A
gi|75276 : GATGATTGATAGTA-CGTC-A-A-TGACG---T--CA----------A----T---GAC-G-T-AATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--GCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------CAGTAAACTTTGGTTAAATTAAA-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----T-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAC-A--TA--TTGAAAGA
gi|75277 : GATGATACATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AA-CA-CTCACTTT-A----T---GATAG-TAAATA-T---TTG---TT-GTGATGTC-TC-ACAT--GC-C----A-CG---CA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-G-C-A-----AT-G----TAA-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-ATCCTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-G--TGTTTTAAAAGA
gi|75278 : TGATAAATAGTA-TGTC-ACG-TGATA---AA-CA-C------T-A----T---AAC-GCT-AATA-TC--TTG-A-CT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------T-----C--AA--G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----ATTG----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------TG------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TCTT-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75279 : AATAGTA-CGTC-ACG-TGATA---AACCA-C------T-A----T---GAC-G-T-AATA-----TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---A-G--------------C-------------TATT---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-T-----------------------------T-CTG----C--TTTC-AAGTCT-T-GCAT-A--TA--
gi|75280 : AATAG-A-CGTC-ACG-TGATA---AA-CAGC------T-A----T---GA--G-TGAATA-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-A--A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------CT------------TA-T---TT-T-C-A-----A---------A-------C-A---------A---T-----------T---------------------A-----------------------------------------------A--A-A----A--------T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAGA
gi|75281 : GTA-CGCC-ATG-----A---AA-TA-C-----------------G---G-T-AATA-T---TTGGA-TT-GTGACGTC-ACAA-ATTAGC-C----A-CG--CCA--ACATG-C-------GC----C--A---GCG--------------C-------------TA-T---TTAT-C-A-----ATGG----T-A-------ACA---------ACT-T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---TATT--T-CAA--C-A----ACGC-ATT-T-ATACTGAACTC--TCTC-AAATTC-T-GCATAA--TA--ATTAAAGA
gi|75282 : TA---AA-CATC------T-GGTATT---GAG-T-T-AATA-T---GTG-A-TT-GTGA-GTC-AC-A-AT--GC-TCCTGATCGTTCCA--T---G-ATTGTGTAG-----C--A---G-G--------------C-------------TAATG--TT-T-C-AGGCGAAT-GGTTTT-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------TGT-----A---T-TTG-T-C-A--CGA----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC--AATTC-TGGCAT-ATTTA--TTA
gi|75283 : C-G-T-GTTA-A---TTG-A-TT-GTGATGTC-AC-A-AT--GC-C----A-TG--CCA--A---A-C-------G-----
gi|75284 : A-T---TTG-A-TT-GTGAC-TC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---GCC-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTCTT-GCAC-A--TA--TTAAAAGA
gi|75285 : A-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------G-----CGCA---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------C---------------------A-------------------------T-------AT--T-TT--T-C-A--C------A-GC-A-T-T-AT-CTG----C--TTTC-AAATTCTT-GCAC-A--TA--TTAAAAGA
gi|75286 : A-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---G-C-------GGAGGAC--ATTTG-G--------------CGAATTCCATTTAATA-T---TT-A-C-A-----AT-G----T-A-------C-A---------A---TGAGTAAAGTAAC---------------------A-------------------------TTGGTTGAA---TATT--TTC-A--C-A----T-GC-A-T-T-GA-TTG----C--TTTT-AAATTC-T-GCAT-A--TA--
gi|75287 : A-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------GGAGGAC--ATTTG-G--------------CGAATCCATT----TA-T---TT-G-C-A-----AT-G----T-AC------A-ATGAGTAAACA---T-----------CGGTTAA---------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----T-GC-A-T-CGAT-C-G----C--TTTT-TAATTC-T-GCAT--------TTATAAGA
gi|75288 : A-T---TTG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G--------A---G-GACATTTGGCGAATTC-------------CA-TTTATT-T-C-A-----AT-G----T-ACATGAGTA-A---------A---TATTGGTTA---A---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-C-A--C-A----T-GC-A-T-TGAT-C-G----C--TTAA-AATTTT-T-GCATAA--TA--TTAGA
gi|75289 : A-T---TTG-A-TT-GTGAGGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G-----G--G---G-G--------------A-------------CA-T---T
gi|75290 : A-T---TTG-AGTT-GTGAAGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CGC-CCA--A---A-C-------G-----G--A---G-A--------------C--------------A-T---TT-T-
gi|75291 : TG-A-TT-GTGACGTC-AC-A-AT--GC-C----A-CG--CCA--A---A-C-------G-----G--A---G-G--------------A-------------CA-T---TT-
gi|75292 : -AT-A-AT--GC-CC---A-CG--CCA--A---G-C-------GG----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-T-C-A-----AT-G----TAA-------A-A---------A---T-----------C---------------------AG------------------------T-------AAACT-TG--T-T-A--A-G----A-TC-A-A-T-AT-----------TTTT-AAA-------CAT-G--CA--TTAAA
gi|75293 : G--CCA--A---G-C-------G-----C--A---G-G--------------C-------------TA-T---TT-TTC-A-----AT-G----T-A-------A-A---------A---T-----------A---------------------A-------------------------T-------A---T-TT--T-T-A--C-A----A-GC-A-G-T-AT-CTG----C--TTTC-GAATTC-T-GCAT-A--TA--TTTAAAGA
gi|75294 : -A-----AT-G----T-A-------G-A---------AATAT-----------C---------------------A-------------------------T-----------T-TT--T-C-A--C-A----A-GC-A-T-T-AT-CTG-------TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAAAA
gi|75295 : T-A----T-A-------G-A---------C---T-----------C---------------------A---------------------------------A---T-TT--T-A-A--C-A----A-GC-A-T-A-A--CTG----C--TTTC-AAATTC-T-GCAT-A--TA--TTAAAA