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lowQualScore                  :     .   ... . ..  .. .. ..  ..    .     .. .. .....  . . ... ..  . . ...................  .. ... ..... .  .   .    ..   .   . .......................... .... ..  .. ....... .  . ............    ...   ..... ... ........  .. ..  ....  . . . .................. . .  .   .. .  .   .    . .. . ... .. ...  ..... .......... ..   .     .... . ....  . . ..    ....   .. . .       
lowQualScore                  :     4   444 4 99  66 88 88  88    6     88 88 00000  3 3 888 88  3 3 5555555555555555555  44 333 00000 3  3   6    44   6   5 88888888888888888888888888 9999 77  55 9999999 2  2 888888888888    333   99999 000 33333333  99 77  0000  1 1 6 111111111111111111 1 1  1   77 1  1   3    1 77 1 111 66 666  00000 3333333333 88   3     7777 4 3333  8 4 44    0000   00 4 4       
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Reference ( gi|64168 )        : TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A---C---T-C-AT-CTT-ACTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-------A-TGGA------------TTTT--AATT-----C---A----A---TT--T--AA---CGC-A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--T-C---T--A---AA-----T--A--T----C--GGC-ACTCA----A-A----CA-T-A--CTCC----TTT--T-G-ACAATTA
gi|64169                      : TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-T---------T--T------TTT-A---C---T-C-AT-CTT-ACTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-------A-TGGA------------TTTT--AATT-----C---A----A---TT--T--AA---CGC-A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGTG-C--T-C---T--A---AA-----TA-A--TA---C--GGC-ACTCA----A-A----CG-T-A--CTCC----TTT--T-G-ACAATTA
gi|64170                      : TGAT-TTC---C-G--CG--T--G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--T---C---C-C-AT-CTT-ACTC--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-------A-CTAA------------TTTT--AATT-----T---A----A---TT--T--AA---AGC-A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-A--T-C---T--A---AA-----TA-A--TA---C--GGC-ACTCA----A-A----CA-T-A--CTCC----TTT--T-G-ACAATT
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gi|64185                      : TGAT-TTC---C-A--CGGTT--G--TC--TTT--GCAGT--A--A-A---CG-A-C---C-----------------T--G------TTCTA---C---C-A-AT-CTT-AATT---A--GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-------GCTGAA------------TTTT--AATT-----A---G----A---TC--T--AA---C---A-A-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAT-AGAG-C--T-C---T--A---AA-----G--A--T----acaaaaaggcgaagttaacattgtgtcaaacgtaatttgattttatccggtgaattttaattcaatttctacagacagaactctaaataatacggcactcaaaccttttgacaatta
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Reference ( family-443 )      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A---C---C-CA-T-CTT-ACTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-A--CT-CC----TTT--T-G-ACAATTA
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gi|64178                      :                                                                                                                       TGAT-TTT---C-C--CG--T--T--TC--TTTT-GCAGT--A--A-----CG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A---C---T-CAAT-CTT-ACTT--CAG-GCA-A---------C----------------A----A--T---T-A--GA----------------------TTT-----------A---AT-C---AAGGCT------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------T-G-TT-TT---A-CA-GAC-AGAG-C--T-C--A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-AG-CT-CC----TTT--T-G-ACAA
gi|64179                      :                                                                                                                       TGAT-TTCGCGC-A--AG--T--G--TC--TTTT-GC-GT--A--A-C---TG-A-C---T--AA-C-T---------T--G------TT--A---C---TTCA-T-CTT--CTT--CAT-GCA-----------C----------------A-------TT--T-A-TGGA--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--T--AA---CG----A-TAT------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--T-CT---A--G--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-T--CT-CC----TTT--T-G-ACAATTA
gi|64180                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-AA--CG-A-C---C--GA-C-T---------T---------TT--A---C---T-CA-T-CTT-ACTTG-CAT-GCA-AA--------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------CTTT-----------A---ATTC---A----T------T--T--AA-----------------------------------------------G-GAC-AGAT-C--T-CT-A-A--A--T-CA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-T--AT-CC----TTT--T-G-CCAATTA
gi|64181                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CGG-T--G--TC--TTTT-GCAATCTA--A-A---CG-AGC---T---A-C-T---------T--G------TT--G---T---C--A-TGCTT-ACTT---AT-GCA-A---------C----------------AG---A--TG--T-A-TGGA--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--TTAAA---CGC---A-T------------------------AT-TTT--A-CA-GAC-AGAGCC--T-CT---A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-----TACC----TTT--T-GCACAATTA
gi|64182                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---CTA--CG--TCTG--TC--TTTT-GCAGT--GGTA-A---CG-A-CC--T--GA-C-TGG-------T--G------TT--A---C---T-C--T-CTT-ACTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGGG--------------------ATTT-----------A---ATTC---AA----------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--TACT---A--A--T-AA-TA
gi|64183                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTCT-GCAGT--A--A-A---TG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A---C---C-CA-T------CTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------T
gi|64183                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TGAA--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--T--------------------------------------------CT--A-CA-GAC-AGAA-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A---------------CC----TTT--T-G-ACAATTAacaaaaaggcgaagttaacattgtgtcaaacgtaatttgattttatccggtgaattttaattcaatttctacagacagaactctaaataatacggcactcaaaccttttgacaatta
gi|64184                      : tgatttccacgtgtcttctgcagtaaatgactgacttgttacccatcttcatgcaacaatgtatgaatacaaaaaggcgaagttaacattgtgtcaaacgtaatttgattttatccggTGAT-TTT---C-A--CG--T--G--TC--TTTC-GCAGT--A--A-G---CG-A-C---T--AA-C-G---------T--AAGTACATT--A---C---C-CA-T-CTT-------CAT-ACA-A---------CTAAGTTTCAGAGGATAA----ACTTG--T-A-TGAA--------------------TTTT-----------------TC---AT---T------TC-T--AA----GC---A-T-T--------------------G-TT-TTT--G-CA-GAC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AACTAC-G-AC-ATTCA----------------A--TT-CCCTTGTTT--T-G-ACAATCA
gi|64185                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CGGTT--G--TC--TTT--GCAGT--A--A-A---CG-A-C---C-----------------T--G------TTCTA---C---C-AA-T-CTT-AATT---A--GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-GCTGAA--------------------TTTT-----------A---ATTA---GA---T------C--T--AA---C-----A-A-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAT-AGAG-C--T-CT-A-AAGA--T-AA-T
gi|64186                      :                                                                                                                       TGAT-TTT---T-A---G--T--GGATCATCTTT-GCAGT--A--A-AATACGTA-CCCTT--GA-G-TGT-------T--G------TTT-A---C---C-CA-T-CTTTACTTT-CATCGCT-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGA-------------------------------------------C----G---T------T--T--AA---AGC---ACT-T------------------T-G-TTATTG--A-CA-GAC-AGTG-C--T-CT-A-A--A--TAAA-CAC-A-GA-AGTCT----A-A----CG-T-A--
gi|64187                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--T--TG--TTTC-ACAGT--A--A-G---GG-A-CG--C--GA-C--------------A------AA--A---CAAGA-CA-------ATTT--C-T-G---A---------G----------------G----A--TGAGT-A-TGCT--------------------TTTT-----------T---TTTT---AT---T------T--C--AA---AGC---A---T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-ATCG-C--T-GTAA-A--A--T-AATTAC-G-GC-ACTCA----ATATCCTCA-T-A--TT-CA----TTT--T-G-ACAATTA
gi|64188                      :                                                                                                                       TGATATTC---C-A--CGA-T--G--TC--TTTC-GCAGT--A--A-G---CG-A-C---T--GA-C-G---------TACG------CT--ATAGC---C-CA-T-CT--------CAT-GCA-A---------C----------------A----A--AG--T---TGAGAAGGTGGGTAAGTTGTGTTTTTTT-----------T---TTTT---TA---T------TTCT--AA---GGCA--A-T-G------------------T-A-TG-TTT--A-CG-GACAAGCG-C--T-CT-A-A--A--T-AATTAC-G-TC-ACTCA----
gi|64189                      :                                                                                                                       TGAT-TTT---C-A--CG--T--T--TA--TTTC-GCTGT--A---------G-A-C---T--GG-CGTA--------T--G------TT--A---C---T-CA-A-----ATTT--CA----A-A---------G----------------G----A--TGAGT-A-TGAT--------------------TTTT-----------T---CTTT---AT---T------T--C--AA---AGT---A-TAT------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGCG-C--T-GT-ACA--A--T-A
gi|64190                      :                                                                                                                       TAAT-TTC---C-A--CG--T--G--CC--TTTC-GCAGT--A--A-G---CG-A-T---T--TG-C-A---------TACG------TT--A---C---C-CA-T------CTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--
gi|64191                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--TG--C------------T-GCAGT--A--A-G---CG-A-C---T--GA-C-A---------TACG------TT--A---C---C-CA---CTT----T--CAT-GCA-AAGAAAATTCC----------------AGAGGA--TGAAT-A-TAAA--------------------TTTTTCTTTTCTCTAAGGCATTC---AA---CATATTGT--T--GA---GGTTTTG-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GTC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TCT-ATGC-ACACATTACA-A----CA---A-----------TTT--T-C-ACAATTA
gi|64192                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--T--TA--TTTT-GCAGG--A--A-GC--CG-A-G---T--GA-C-G---------T--ATGT---TT--A---C---A-CA-----A-ATTT--CAG-AGG-A---------T----------------G----A---G--T-A-TGAT--------------------TTTT----------------TTCTTTAT---T------T--C--AA---AGC---A-TAT------------------T-G----TTT--A-CA-GAC-AGCG-C--T-
gi|64193                      :                                                                                                                         AT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-TGTTAACAGTT--G------TT--A---C---C--A-T-CTT-ACTTTTCAT-GCA-ATGTA-----C----------------A----A--TT--T-A-TGAA--------------------TTTTT----------G---ATTC---AC---T------T--T--AA---AGC---A-T-T------------------TTG-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--T-CT-A-A--AAAT-AA-CAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-A--CT-CC----TTT--T-G-ACAAT
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gi|64195                      :                                                                                                                          T-TTC---A-A--CG--T--A--T---TTTT-GTAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A---C---C-CA-T-CTT-ACTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------TTTTT----------A---ATTC---AA---T------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------T-G-TT-TTT--G-CA-GAG-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T----CT-CC----TTT--T-G-ACAATTA
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Reference ( family-443 )      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A---C---C-CA-T-CTT-ACTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-A--CT-CC----TTT--T-G-ACAATTA
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gi|64175                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-T------------------------------------------ACTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGGA--------------------TTTT-----------A---TTTC---A----T------T--T--AA---CG----A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-A--CT-CC----TTT--T-G-ACAATT
gi|64176                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTT-GCA----A--ATA---TG-A-C---T--GA-C-T---------T----------T--A---C---T-CA-T-CTT-ACTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------TTTT-----------A---ATTC----A---T------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGA--C--T-C--A-A--A--TAAA-TAC---GC-ACTCA----A-A----CA-T-A--CT-CC----TTT--T-G-AC-ATTA
gi|64177                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--C----TTT-GCAGT--A--A-----CG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A---C---T-CA-T-CTT-ACTT--TAT-GCACA---------C----------------A----A--TG--T-AGTGA----------------------TTT-----------A---ATTC---AA---T------T--T--AA---CGC---A---T------------------T-G-TT-TTA--A-GT-GAC-ACAG-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCATC--A-A----CA-T-A--CT-CC----TTT--T-G-ACAATTA
gi|64178                      :                                                                                                                       TGAT-TTT---C-C--CG--T--T--TC--TTTT-GCAGT--A--A-----CG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A---C---T-CAAT-CTT-ACTT--CAG-GCA-A---------C----------------A----A--T---T-A--GA----------------------TTT-----------A---AT-C---AAGGCT------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------T-G-TT-TT---A-CA-GAC-AGAG-C--T-C--A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-AG-CT-CC----TTT--T-G-ACAA
gi|64179                      :                                                                                                                       TGAT-TTCGCGC-A--AG--T--G--TC--TTTT-GC-GT--A--A-C---TG-A-C---T--AA-C-T---------T--G------TT--A---C---TTCA-T-CTT--CTT--CAT-GCA-----------C----------------A-------TT--T-A-TGGA--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--T--AA---CG----A-TAT------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--T-CT---A--G--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-T--CT-CC----TTT--T-G-ACAATTA
gi|64180                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-AA--CG-A-C---C--GA-C-T---------T---------TT--A---C---T-CA-T-CTT-ACTTG-CAT-GCA-AA--------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------CTTT-----------A---ATTC---A----T------T--T--AA-----------------------------------------------G-GAC-AGAT-C--T-CT-A-A--A--T-CA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-T--AT-CC----TTT--T-G-CCAATTA
gi|64181                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CGG-T--G--TC--TTTT-GCAATCTA--A-A---CG-AGC---T---A-C-T---------T--G------TT--G---T---C--A-TGCTT-ACTT---AT-GCA-A---------C----------------AG---A--TG--T-A-TGGA--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--TTAAA---CGC---A-T------------------------AT-TTT--A-CA-GAC-AGAGCC--T-CT---A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-----TACC----TTT--T-GCACAATTA
gi|64182                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---CTA--CG--TCTG--TC--TTTT-GCAGT--GGTA-A---CG-A-CC--T--GA-C-TGG-------T--G------TT--A---C---T-C--T-CTT-ACTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGGG--------------------ATTT-----------A---ATTC---AA----------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--TACT---A--A--T-AA-TA
gi|64183                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTCT-GCAGT--A--A-A---TG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A---C---C-CA-T------CTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------T
gi|64183                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TGAA--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--T--------------------------------------------CT--A-CA-GAC-AGAA-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A---------------CC----TTT--T-G-ACAATTAacaaaaaggcgaagttaacattgtgtcaaacgtaatttgattttatccggtgaattttaattcaatttctacagacagaactctaaataatacggcactcaaaccttttgacaatta
gi|64184                      : tgatttccacgtgtcttctgcagtaaatgactgacttgttacccatcttcatgcaacaatgtatgaatacaaaaaggcgaagttaacattgtgtcaaacgtaatttgattttatccggTGAT-TTT---C-A--CG--T--G--TC--TTTC-GCAGT--A--A-G---CG-A-C---T--AA-C-G---------T--AAGTACATT--A---C---C-CA-T-CTT-------CAT-ACA-A---------CTAAGTTTCAGAGGATAA----ACTTG--T-A-TGAA--------------------TTTT-----------------TC---AT---T------TC-T--AA----GC---A-T-T--------------------G-TT-TTT--G-CA-GAC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AACTAC-G-AC-ATTCA----------------A--TT-CCCTTGTTT--T-G-ACAATCA
gi|64185                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CGGTT--G--TC--TTT--GCAGT--A--A-A---CG-A-C---C-----------------T--G------TTCTA---C---C-AA-T-CTT-AATT---A--GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-GCTGAA--------------------TTTT-----------A---ATTA---GA---T------C--T--AA---C-----A-A-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAT-AGAG-C--T-CT-A-AAGA--T-AA-T
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gi|64187                      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--T--TG--TTTC-ACAGT--A--A-G---GG-A-CG--C--GA-C--------------A------AA--A---CAAGA-CA-------ATTT--C-T-G---A---------G----------------G----A--TGAGT-A-TGCT--------------------TTTT-----------T---TTTT---AT---T------T--C--AA---AGC---A---T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-ATCG-C--T-GTAA-A--A--T-AATTAC-G-GC-ACTCA----ATATCCTCA-T-A--TT-CA----TTT--T-G-ACAATTA
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gi|64189                      :                                                                                                                       TGAT-TTT---C-A--CG--T--T--TA--TTTC-GCTGT--A---------G-A-C---T--GG-CGTA--------T--G------TT--A---C---T-CA-A-----ATTT--CA----A-A---------G----------------G----A--TGAGT-A-TGAT--------------------TTTT-----------T---CTTT---AT---T------T--C--AA---AGT---A-TAT------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGCG-C--T-GT-ACA--A--T-A
gi|64190                      :                                                                                                                       TAAT-TTC---C-A--CG--T--G--CC--TTTC-GCAGT--A--A-G---CG-A-T---T--TG-C-A---------TACG------TT--A---C---C-CA-T------CTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--
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gi|64196                      :                                                                                                                          T-TTC---A-A--CG--T--A--AT--TTTT-GTAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A-------C-CA-T-TTT-CCTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------TTTTA----------A---ATTC---AA---T------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------T-G-TT-TTT--G-CA-GAG-AGAG-C--T--T-A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-A-TCA----A-A----CATT-A--CT-CC----TTT--T-G-ACAATTA
gi|64197                      :                                                                                                                          T-CTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTTTGCAGT--A--A-A---AG-A-----T--GACC-T---------T--G------TT--A---C---T-CA-T-CTT-ACTT--CAT--CA----------------------------A----A--TGGTC-A-TGGA--------------------TTTT-----------A---ATT----AA---T------T--TAAAA---CGC-----T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CAGGAC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-CA-TAC---GC-ACTCA----A-AC---CA-T-A--CC-CT----TTG--T-G-ACAAT
gi|64198                      :                                                                                                                                            --G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-TGT-------T--G------TT--A---C---C-CA-T-CTT-ATTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--T--AA---AGC---A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-AC-ACTCA----A-A----CA-T-ATGCT-CC----TTT--T-G-ACAATTA
gi|64199                      :                                                                                                                                                        T-GCAGT--A--A-A---AC-A-C---T--GA-C-T---------TC-G------TT--A---C---C-CA-T-CTT-ACTT--CAT-GCA----------------------------A----A--CA--T-AGTTAA--------------------TTTT-----------A---TTCC---AA---T------T--T--AA---AGC---A---T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-G---AG--------CC-A-A--A----AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A-----A-T-A--CT-CC----TTT--C-G-ACAATTA
gi|64200                      :                                                                                                                                                                                                                                                 CA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------TTTT-----------A---ATTC---CA---T------T--TAAAA---AGC---A-T-T------------------C-G-TT-TT---------------G-C--T-CT-A-AACA--T-AA-TAC-G-AC-ACTCA----A-A----CA-
gi|64201                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TG--T-A-TGAA--------------------TTTT-----------------TC---AT---T------T--C--GA---AGT-----T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GACAAGAG-T--T-CT-A-A--A--T-AATTAC-G-GC-ACTTA----A-A-------------T-CC----CTTACT-G-ACAATTA
gi|64202                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                        G--T-A-GGAA--------------------TTT----------------ATTC---AA---T------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------G-G-TT-TTT--AACA-GAC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TACAG-GC-ACTCA----T-A----T--T-A--CT-CC----TTT--TGG-ACAATTA
gi|64203                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         --T-A-TAAA--------------------TTTTTC---------A---TTTC---AAA--G------T--T--GT---TGG---G-T-T------------------T-T-TT-TTTCCA-CA-GAC-GGAG-T--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-AC-ACTC------------CA-T-ACCCT-CA----TTT--T-G-ACTATTA
gi|64204                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            -A-TGGC--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--T--AA---CGT---A-T-TGGTACCGTATATGTTTTGT-A-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-
gi|64205                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAG-C--T-CT-T-A--A--T-AA-TAT-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-A--CT-CC----TTT--T-G-
gi|64206                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-A--CT-CC----TTT--T-A-ACAAT


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blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   G  .  .   .     .     .  .  TA     . . G   .   . . TATGT                T  .   T      . .   A    T    .   . TGTAC                      .    .   AA . G    .                       TG                 .    A   .      C  AA  A     .   . A .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  T   . .  .     .    . .     . . G   .  .      .  . .
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blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  GC     . . .   .   . . GGTG                 .  .   C      . .   A    .    .   . AC                         .    .   .  . .    .                       AA                 .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . GTTG                 .  .   T      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
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blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TACG                 .  .   T      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TACG                 .  .   T      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TACG                 .  .   T      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       T                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . GTTG                 .  .   T      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  C      . . .   .   . . TTG                  .  .   T      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . ATG                  .  .   C      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TCG                  .  .   T      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TT                   .  .   C      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  G      . . .   .   . . TG                   .  .   C      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TG                   .  .   C      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   G     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  G      . . .   .   . . TG                   .  .   C      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  G      . . .   .   . . TG                   .  .   C      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   G     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  G      . . .   .   . . TG                   .  .   T      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  G      . . .   .   . . TG                   .  .   C      . .   C    .    .   . G                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TG                   .  .   C      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       T                  .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TG                   .  .   A      . .   A    .    .   . G                          .    .   .  . .    .                       T                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TG                   .  .   C      . .   A    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       T                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TG                   .  .   T      . .   .    .    .   . T                          .    .   .  . .    .                       T                  .    .   .      .  .   C     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TG                   .  .   C      . .   .    .    .   . G                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . TG                   .  .   C      . .   .    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  A      . . .   .   . . T                    .  .   T      . .   .    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .   .  .      .  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .   .   . .   .  .  .   .     .     .  .  .      . . .   .   . . T                    .  .   C      . .   .    .    .   . C                          .    .   .  . .    .                       A                  .    .   .      .  .   A     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .  . . .  .  .  .   . .  .     .    . .     . . .                   
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                            . .    .                       .                  .    .   .      .  .   .     .   . . .                  . .  .   .  .  .   .    . .  .                                                                   
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Reference ( family-443 )      :                                                                                                                       TGAT-TTC---C-A--CG--T--G--TC--TTTT-GCAGT--A--A-A---CG-A-C---T--GA-C-T---------T--G------TT--A---C---C-CA-T-CTT-ACTT--CAT-GCA-A---------C----------------A----A--TG--T-A-TGAA--------------------TTTT-----------A---ATTC---AA---T------T--T--AA---CGC---A-T-T------------------T-G-TT-TTT--A-CA-GAC-AGAG-C--T-CT-A-A--A--T-AA-TAC-G-GC-ACTCA----A-A----CA-T-A--CT-CC----TTT--T-G-ACAATTA
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