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Reference ( gi|96147 ) : AATAAA-GGATT--TCAAG-G-GAC-C-G--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-T----TTTGA-------T-G-CTT----------T-CT-A---TC-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A--TT-TT---G-T-G-AA----A-CA----C-T-A--T-A-T-A----A-CA-T--G--AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96154 : AATAAG-GGATT--CCAAG-G-GGC-C-A--A--A-A----G-TC-T-----G--A--AA-T----TTTGA-------T-A-ATT----------T-CT-A---TC-T-CT-T------------AAA-TG---A--A-----A---A-A-C--A--TT-TT---G-T-G-AA----A-CA----T-T-A--T-A-T-A----A-CA-T--G--AA-T--T-GC-TTGA
gi|96148 : AATAAG-GGATT--TCAAG-G-G-C-T-G--A--A-A----C-TACT-----G--A--AA-T----TTTGA-------T-G-CTT----------T-CT-A---TC-C-TT-T------------AAAACG---A--A-----A---AAA-C--A--TT-TT---G-T-G-AA----A-CA----T-T-A--T-A-T-A----A-CA-T--G--AA-T--T-GC-TTG
gi|96160 : AATAAG-GGATT--TCAAG-G-GGC-C-G--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----TTTGA-------T-G-CTC----------T-CT-A---AC-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A--TT-TT---G-T-T-AA----A-TG----T-T-A--T-A-G-T----C-CA-T--G--AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96155 : AATAAG-GGATT---CAAG-G-GGC-C-A--A--A-G----G-TA-T-----GG-A--AA-C----TTTGAGG-----T-G-CTT----------T-CTTA---TC-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A--TT-TT---GCT-G-AA----A-TG----T-T-A--T-A-T-A----A-CA-T--G--AA-T--T-GC-TTGAA
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gi|96156 : AATAAG-GGATT--TCAAG-G-GGC-C-A--A--A-A----G-TA-T-----G------A-C----TTTGA-------T-G-C-T----------T-GT-A---TC-T-CT-T------------AAA-CGA--A--A-----A---A-A-C--A--TT-TT---G-T-G-AA-------G----T-T-A--T-A-T-A----A-CA----G--AA-T--T-GC-TTGGA
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gi|96158 : AATAAA-G-ATT--TCAAG-C-GGC-C-A--A--A-A----G-TC-T-----ACTG--AA-T----TTTGA-------T-A-CTT----------TTCT-A---TC-T-CTCT------------AAA-TG---ATAA-----A---A-A-C--A--TTGTT---G-T-G-AA----A-CA----T-T-A--T-A-T-A----A-CA-T--G--AA-T--T-GC-TTGGA
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gi|96163 : AATAG--GGATC--T-AAT-G-GGC-C-A--A--A--------CC-T-----G--A--AAAT----TTTGA-------T-G-CTT----------T-CT-A---TC---CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--AT-TT-TT---G-T-G-AAG---A-CG----T-T-A--T-A-T-A----A-CA-T--GA-AA-A--T-GC-TTGAA
gi|96167 : AATAAG-GGATT--TCAAG-G-G-C-C-A--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----TTTGA-------T-G-CTT----------T-CT-A---TC-T-CT-T------------AA
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gi|96173 : AATAAG-AGATT--GCGAG-G-GGC-A-T--A--A-A----G-TA-CCGTACG--A--CA-C----TTCGA-------T-G-TTT----------T-CA-A---TC-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-T--A--TT-GC---G-T-G-AA----A-CA----T-C-A--T-A-A-T----A-TA-T--G--AA-TTAT-GC-TTGt
gi|96166 : AATAAGTGGATC--TTCAG-G-G-C-C-A--A--A-A----C-TG-G-----A--A--AA-C----TTTGA-------T-GGCTT----------C-CT-A---TC---CT-T------------AAA-GG---A--A-----A-------C--A--TT-TT---G-TGG-AA----A-CG------T-A--T-A-T-A----A-CA-T--G--AA-A--T-GC-TTGGA
gi|96169 : AATAAGCGGATT--T-AAG-G-GGC-A-G--A--A-A----G-T--T-----G--A--AA-C----TTTG--------T-G-CTT----------T--T-A---TT-TTCT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-T-----TT-TT---G-T-G-AA----A-CG------T-A----A-T-A----A-CAGC--GAAAA-T--G-GC-TTGAA
gi|96174 : AATAA--GGATT--CAAAG-G-GGC-CCA--A--A-A----G-TA-T-----G--AATAA-C----TTTGA-------TGG-CTT----------C-CTAA---TC-TGCT-TA-----------AAA-CG------G-----A---A-C-C--AG-TT-TT---G-T-G-AA----A-AATGT-C-TCA--T-ATT-A----ACCA-T--G--AA-T--T-GCTTTGAA
gi|96171 : AATAAG-GGATT--TCAAG-G-GGC-C-A--A--A-A----G-TA-C-----G--A--AG-C----TTTGA-------T-G-CTT----------T-CA-A---TC-
gi|96168 : AATAA--GGATT--CTAGG-A-GGC-C-A--A--A-G----C-TC-T--------A--AA-C----TTTGA-------T---CTT----------T-CT-A---T--T-CT-T------------AA---G---G--A-----ATACA-A-C--A--TT-TT---GGT-G-AA----A--A----CGT-A--T-A-T-A----A-CA-C--G--AA-A--T-GC-TTGAAct
gi|96175 : AATAA--GGATT--TCAAGTG-GGC-G-GGAA--A-A----A-TC-T-----G--A--AAAC----TTTGAAATCCTTT-G-CTT------------AT-A---TC-T-CT-T------------TAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---T-TT---A-A-G-AA----A-TA----G-T-T--T-A-TAA----A-CA-TTGA--AA-T--T-GCGTTGAA
gi|96153 : AATAAC-GGATT--CTTAG-G-G-C-C-A--A--A-A----GGCC-T-----G--A--AC-C----TTTGA-------T-T-CTTGTACATAAAAT-CT------C-T-TT-T------------AAA-AGGTAA--A-----A---A-A-C--A--TT-TTTTTG-T-G-AA----A-CG----T-T-A--TAA-T-A----A-CA-T--T--AA-
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gi|96182 : AG-GGATT--TCAAG-G-GGC---A--A--A-A----G-TA-T-----G--A--A--T----TTTGA-------T-G-CTT----------T-CT-A---TC-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A--TT-TT---G-T-G-AA----G--G----T-T-A--T-A-T-AG---A-CA-T--GT-AATT--T-GC-TGGAA
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Alignments
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Reference ( family-431 ) : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-G--A--A-A----G-TN-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
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gi|96148 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GG--C-T-G--A--A-A----C-TACT-----G--A--AA-T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-C-TT-T------------AAAACG---A--A-----A---AAA-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTG
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gi|96156 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-A--A--A-A----G-TA-T-----G------A-C----T-TT-GA-------T-G-C-T----------T-GT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CGA--A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA-------G----TTA--T-A-TA--A-CA---G-AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96157 : AATAAG-G-AT-T--TCAAG-GG--C-C-A--A--A-A----G-TC-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-A-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-TG------A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T----AA----A-CA----TTA--T-A--A--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGA
gi|96158 : AATAAA-G-AT-T--TCAAG-CGG-C-C-A--A--A-A----G-TC-T-----ACTG--AA-T----T-TT-GA-------T-A-CTT----------TTCT-A---T-C-T-CTCT------------AAA-TG---ATAA-----A---A-A-C--A---TTGTT-G-T-G--AA----A-CA----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96159 : AATAAG-G--C-T--TCAAG-GG--C-C-A--A--A-AC---A-AA-T-----G--A--A--C----T-TT-GA-------T-G-CCT----------T-TT-AATAT-T-G-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AAC---ATCG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TT
gi|96160 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-G--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTC----------T-CT-A---A-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-T--AA----A-TG----TTA--T-A-GT--C-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96161 : AATAAG-GAAT-C--TTAAG-GG--C-C-G--A--A-A----AATC-T-----G--A--AA-C----T-TTTGA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-T-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CGT---TTA--T-A-TAGGA-CAC--G-AA-A--T-GC-TTGAA
gi|96162 : AATAAG-GGAT-T--TCA-G-GGG-C-C-A--A--A-A------CC-T-----G--A--AA-TCGTGT-TT-GA-------T-G-CTT----------C-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA--G---G--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AAT---A-CG----TTA--T-A-TA--A--AT--A-AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96163 : AATA-G-GGAT-C--T-AAT-GGG-C-C-A--A--A--------CC-T-----G--A--AAAT----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C---CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--AT--TT-TT-G-T-G--AAG---A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--GAAA-A--T-GC-TTGAA
gi|96164 : AATAAG-GAAT-C--T-AAG-GGG-C-C-G--A--A-A----A-TC-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-C-T----------T-CT-A---T---T-CT---------------AA-GG---A--A-----A---A-A-C--AT--TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A--AC--G-AA-CAAT-GC-TTGAA
gi|96165 : AATA-G-GGAT-G--TCCAG-GGG-C-TTG--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA------T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---TTC-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-AGC--A---TT-TT-G-A-G--AACCAGA-CA-----TA--T-A-TA--A-TAT--G-AA-T--TGGC-TTGAA
gi|96166 : AATAAGTGGATCT--TCA---GGG-C-C-A--A--A-A----C-TG-G-----A--A--AA-C----T-TT-GA-------T-GGCTT----------C-CT-A---T-C---CT-T------------AAA-GG---A--A-----A-------C--A---TT-TT-G-TGG--AA----A-CG-----TA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-A--T-GC-TTGGA
gi|96167 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GG--C-C-A--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AA
gi|96168 : AATAAG-G-AT-T--CTAGG-AGG-C-C----A--A-A----G-CT-C-----T--A--AA-C----T-TT-GA-------T---CTT----------T-CT-A---T---T-CT-T------------AA---G---G--A-----ATACA-A-C--A---TT-TTGG-T-GA-AA----A-CG-----TA--T-A-TA--A-CAC--G-AA-A--T-GC-TTGAAgag
gi|96169 : AATAAGCGGAT-T--T-AAG-GGG-C-A-G--A--A-A----G-T--T-----G--A--AA-C----T-TT-G--------T-G-CTT----------T--T-A---T-T-TTCT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-T------TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TAA--TAA-CA--G-CGA--A-AA-T--G-GC-TTGAA
gi|96170 : AATAAG-AGAT-T--TCAAG-GAG-C-C-G--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CA---A--A-----A---A-C-T--A---TT-TT-G-T-G--GA----
gi|96171 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-A--A--A-A----G-TA-C-----G--A--AG-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CA-A---T-C-
gi|96172 : AATAAG-GGAT-T--TCTAG-GGG-C-C-G--A--T-A----T-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-TTTTACTCGCCTGAAA-CA---A--A-----AC--A-G-CGGA---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----Tct
gi|96173 : AATAAG-AGAT-T--GCGAG-GGG-C-A-T--A--A-A----G-TA-CCGTACG--A--CA-C----T-TC-GA-------T-G-TTT----------T-CA-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-T--A---TT-GC-G-T-G--AA----A-CA----TCA--T-A-AT--A-TAT--G-AA-TTAT-GC-TTG
gi|96174 : AATAA--GGAT-T--CAAAG-GGGCC-C-A--A--A-A----G-TA-T-----G--AATAA-C----T-TT-GA-------TGG-CTT----------C-CTAA---T-C-TGCT-TA-----------AAA-CG------G-----A---A-C-C--AG--TT-TT-G-T-GAAAA----A-TGTC--TCA--T-ATTA--ACCAT--G-AA-T--T-GCTTTGAA
gi|96175 : AATAAG-G-AT-T--TCAAGTGGG-C-G-GGAA--A-A----A-TC-T-----G--A--AAAC----T-TT-GAAATCCTTT-G-CTT------------AT-A---T-C-T-CT-T------------TAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A----T-TT-A-A-G--AA----A-TAGT--TTA--T-A--A--A-CATTGA-AA-T--T-GCGTTGAA
gi|96176 : ATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-CCA--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-C--T------------AAA-CA---A--A-----A---A-A-C--ATT-TT-TT-G-T-G--AA----A-TG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96177 : ATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-T-----A-A----G-TA-T-----G--A--AA-CT---T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-T---T-C-T-CT-T------------AAA-TG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G---A----A-TG----TTA--T-A-TAT-G-GAT--G-AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96178 : ATCAG-GGAT-T--TCAAG-GG----C-A--AT-ACA----G-TCCT-----T--A--AA-C----T-TT-AAA------T-G-CTT----------T-CT-G---T-C-CGCG-T------------AAA-AG---A--A-----A---A-A-C--A---TTCTT-G-T-A--AA----A-CG----GTA--T-AGTA--G-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96179 : TAAG-GGAT-TGCTTAAT-GGG-C-C-T--T--A-A----A-CC-T-----G--A--AA-T----T-TT-GAA------T-GGCTT----------T-CT-AA--T-C-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---AGA-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-A--T-GC-TTGA
gi|96180 : AAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-CAA-A--A--A-A----G-TC-T-----T--A--AA-C----T-TT-AA-------T-G-CTT----------T--T-G---T-C-C-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-GT-C-G-A--AA----A-CATGTTTTATCT-A-TA--A-CAT--G-AATT--T-GC-
gi|96181 : --TCAAG-T---C-C-G--A--A-A----C-CT-T-----G--A--AA-A----C-TT-GA-------T---CCT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G---A----A-CGA---TTA--T-A-TA--A-CACAGA-AA-A--T-GC-TTGAA
gi|96182 : aaaagaAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C---A--A--A-A----G-TA-T-----G--A--A--T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----G--G----TTA--T-A-TAG-A-CAT--GTAATT--T-GC-TGGAA
gi|96183 : -GGAT-T---CAAG-GG--C-C-A--A--A-AACCAG-TC-T-----T--A--AA-C----T-TT--A-------T-G-CTT------------CT-G---T-C-T-CCGT------------AAA-AG---A--A-----A---A-AAC--A---TT----G-T-A--AA----A-CG----T-A--T-A-TA--G-CA---G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96184 : a-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-T-T--G--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------TCCT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----C-CA----ATA--TAA-TAG-A-TATG-G-AA-T--T-GCTTTGAA
gi|96185 : -GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-A--AACA-A----G-TC-T-----T-----AA-C----T-TC--A-------T-G-CTT----------T-CT-G---T-C-C-CG-T------------AAA--G---A--A-----A---A------A---TT-TT-G-TAA--AA----A-CG----GTA--T-ACTAG-A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96186 : -GGAT-T--TCAAA-GAG-C-C-G--A--A-A----G-TT-T-----G--A--AA-C----T-GT-GT-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CC-T------------GAA-CG---G--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----TTG--T-T-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-GTGGA
gi|96187 : -C-C-A--G--A-A----A-TC-T-----A--A--AA-C----T-GT-GA-------T-G-CT-------------CT-A---T-C-G-CG-T------------AAA-CA---A--ACACGAA---A-A-C--A---TT-TT-G-T-A--AA----A-TG----TTA--C-G-GA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
Alignments
lowQualScore : 2 0 1 22 2 2 1 5555 22 1 3333 2 44 22222 22 11 3 3333 1 1 6666666 1 2 4444444444 2 2 444 1 1 3 2 888888888888 44 222 11 22222 222 2 2 11 777 2 1 1 2 33 5555 1 7777 11 3 3 66 1 44 2 2 33 1 3
lowQualScore : . . . .. . . . .... .. . .... . .. ..... .. .. . .... . . ....... . . .......... . . ... . . . . ............ .. ... .. ..... ... . . .. ... . . . . .. .... . .... .. . . .. . .. . . .. . .
lowQualScore : 1 2 0 44 0 0 0 5555 33 0 0000 0 99 44444 33 33 9 0000 0 0 5555555 0 0 3333333333 9 0 000 0 0 0 0 555555555555 88 888 44 66666 888 1 1 44 333 1 0 0 1 55 3333 1 2222 55 2 2 99 1 11 2 2 11 1 3
consensus : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-G--A--A-A----G-TN-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
Reference ( family-431 ) : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-G--A--A-A----G-TN-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96147 : AATAAA-GGAT-T--TCAAG-GGA-C-C-G--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----CTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96148 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GG--C-T-G--A--A-A----C-TACT-----G--A--AA-T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-C-TT-T------------AAAACG---A--A-----A---AAA-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTG
gi|96149 : AATAAA-GGAT-C--TTA-G-GGG-C-C-A--A--A-A----G-CC-T-----G--A--AAAC----T-TT-GA-------T-G-CTT----------TTCT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--AT--TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TAT-A-CAC--G-AA-A--T-GC-TTGAA
gi|96150 : AATAAG-G-AT-C--TTAAGAGGG-C-C-A--A--A-A----G-CC-T-----G--A--A--C----TGTT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-GAG-T-C-T-CT-TTA----------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-T-AA--A-CAT--G-AA-A--T-GC-TT
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gi|96152 : AATAAG-GATT-T--TCAAG-GAGAC-C-G--A--A-A----G-T--T-----G--A--A---------TT-AC-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-CCT-CT-TT-----------AAA-CC---G--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----CTA--T-A-TA--T-CTT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96153 : AATAAC-GGAT-TC-TTA---GGG-C-C-A--A--A-A----GGCC-T-----G--A--AC-C----T-TT-GA-------T-T-CTTGTACATAAAAT-C------T-C-T-TT-T------------AAA-AGGTAA--A-----A---A-A-C--ATTTTT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--TAA-TA--A-CAT--T-AA-
gi|96154 : AATAAG-GGAT-T--CCAAG-GGG-C-C-A--A--A-A----G-TC-T-----G--A--AA-T----T-TT-GA-------T-A-ATT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-TG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGA
gi|96155 : AATAAG-GGAT-T---CAAG-GGG-C-C-A--A--A-G----G-TA-T-----GG-A--AA-C----T-TT-GAGG-----T-G-CTT----------T-CTTA---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-GCT-G--AA----A-TG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96156 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-A--A--A-A----G-TA-T-----G------A-C----T-TT-GA-------T-G-C-T----------T-GT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CGA--A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA-------G----TTA--T-A-TA--A-CA---G-AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96157 : AATAAG-G-AT-T--TCAAG-GG--C-C-A--A--A-A----G-TC-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-A-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-TG------A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T----AA----A-CA----TTA--T-A--A--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGA
gi|96158 : AATAAA-G-AT-T--TCAAG-CGG-C-C-A--A--A-A----G-TC-T-----ACTG--AA-T----T-TT-GA-------T-A-CTT----------TTCT-A---T-C-T-CTCT------------AAA-TG---ATAA-----A---A-A-C--A---TTGTT-G-T-G--AA----A-CA----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96159 : AATAAG-G--C-T--TCAAG-GG--C-C-A--A--A-AC---A-AA-T-----G--A--A--C----T-TT-GA-------T-G-CCT----------T-TT-AATAT-T-G-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AAC---ATCG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TT
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gi|96161 : AATAAG-GAAT-C--TTAAG-GG--C-C-G--A--A-A----AATC-T-----G--A--AA-C----T-TTTGA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-T-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CGT---TTA--T-A-TAGGA-CAC--G-AA-A--T-GC-TTGAA
gi|96162 : AATAAG-GGAT-T--TCA-G-GGG-C-C-A--A--A-A------CC-T-----G--A--AA-TCGTGT-TT-GA-------T-G-CTT----------C-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA--G---G--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AAT---A-CG----TTA--T-A-TA--A--AT--A-AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96163 : AATA-G-GGAT-C--T-AAT-GGG-C-C-A--A--A--------CC-T-----G--A--AAAT----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C---CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--AT--TT-TT-G-T-G--AAG---A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--GAAA-A--T-GC-TTGAA
gi|96164 : AATAAG-GAAT-C--T-AAG-GGG-C-C-G--A--A-A----A-TC-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-C-T----------T-CT-A---T---T-CT---------------AA-GG---A--A-----A---A-A-C--AT--TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A--AC--G-AA-CAAT-GC-TTGAA
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gi|96166 : AATAAGTGGATCT--TCA---GGG-C-C-A--A--A-A----C-TG-G-----A--A--AA-C----T-TT-GA-------T-GGCTT----------C-CT-A---T-C---CT-T------------AAA-GG---A--A-----A-------C--A---TT-TT-G-TGG--AA----A-CG-----TA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-A--T-GC-TTGGA
gi|96167 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GG--C-C-A--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AA
gi|96168 : AATAAG-G-AT-T--CTAGG-AGG-C-C----A--A-A----G-CT-C-----T--A--AA-C----T-TT-GA-------T---CTT----------T-CT-A---T---T-CT-T------------AA---G---G--A-----ATACA-A-C--A---TT-TTGG-T-GA-AA----A-CG-----TA--T-A-TA--A-CAC--G-AA-A--T-GC-TTGAAgag
gi|96169 : AATAAGCGGAT-T--T-AAG-GGG-C-A-G--A--A-A----G-T--T-----G--A--AA-C----T-TT-G--------T-G-CTT----------T--T-A---T-T-TTCT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-T------TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TAA--TAA-CA--G-CGA--A-AA-T--G-GC-TTGAA
gi|96170 : AATAAG-AGAT-T--TCAAG-GAG-C-C-G--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CA---A--A-----A---A-C-T--A---TT-TT-G-T-G--GA----
gi|96171 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-A--A--A-A----G-TA-C-----G--A--AG-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CA-A---T-C-
gi|96172 : AATAAG-GGAT-T--TCTAG-GGG-C-C-G--A--T-A----T-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-TTTTACTCGCCTGAAA-CA---A--A-----AC--A-G-CGGA---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----Tct
gi|96173 : AATAAG-AGAT-T--GCGAG-GGG-C-A-T--A--A-A----G-TA-CCGTACG--A--CA-C----T-TC-GA-------T-G-TTT----------T-CA-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-T--A---TT-GC-G-T-G--AA----A-CA----TCA--T-A-AT--A-TAT--G-AA-TTAT-GC-TTG
gi|96174 : AATAA--GGAT-T--CAAAG-GGGCC-C-A--A--A-A----G-TA-T-----G--AATAA-C----T-TT-GA-------TGG-CTT----------C-CTAA---T-C-TGCT-TA-----------AAA-CG------G-----A---A-C-C--AG--TT-TT-G-T-GAAAA----A-TGTC--TCA--T-ATTA--ACCAT--G-AA-T--T-GCTTTGAA
gi|96175 : AATAAG-G-AT-T--TCAAGTGGG-C-G-GGAA--A-A----A-TC-T-----G--A--AAAC----T-TT-GAAATCCTTT-G-CTT------------AT-A---T-C-T-CT-T------------TAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A----T-TT-A-A-G--AA----A-TAGT--TTA--T-A--A--A-CATTGA-AA-T--T-GCGTTGAA
gi|96176 : ATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-CCA--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-C--T------------AAA-CA---A--A-----A---A-A-C--ATT-TT-TT-G-T-G--AA----A-TG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96177 : ATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-T-----A-A----G-TA-T-----G--A--AA-CT---T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-T---T-C-T-CT-T------------AAA-TG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G---A----A-TG----TTA--T-A-TAT-G-GAT--G-AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96178 : ATCAG-GGAT-T--TCAAG-GG----C-A--AT-ACA----G-TCCT-----T--A--AA-C----T-TT-AAA------T-G-CTT----------T-CT-G---T-C-CGCG-T------------AAA-AG---A--A-----A---A-A-C--A---TTCTT-G-T-A--AA----A-CG----GTA--T-AGTA--G-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96179 : TAAG-GGAT-TGCTTAAT-GGG-C-C-T--T--A-A----A-CC-T-----G--A--AA-T----T-TT-GAA------T-GGCTT----------T-CT-AA--T-C-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---AGA-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-A--T-GC-TTGA
gi|96180 : AAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-CAA-A--A--A-A----G-TC-T-----T--A--AA-C----T-TT-AA-------T-G-CTT----------T--T-G---T-C-C-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-GT-C-G-A--AA----A-CATGTTTTATCT-A-TA--A-CAT--G-AATT--T-GC-
gi|96181 : --TCAAG-T---C-C-G--A--A-A----C-CT-T-----G--A--AA-A----C-TT-GA-------T---CCT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G---A----A-CGA---TTA--T-A-TA--A-CACAGA-AA-A--T-GC-TTGAA
gi|96182 : aaaagaAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C---A--A--A-A----G-TA-T-----G--A--A--T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----G--G----TTA--T-A-TAG-A-CAT--GTAATT--T-GC-TGGAA
gi|96183 : -GGAT-T---CAAG-GG--C-C-A--A--A-AACCAG-TC-T-----T--A--AA-C----T-TT--A-------T-G-CTT------------CT-G---T-C-T-CCGT------------AAA-AG---A--A-----A---A-AAC--A---TT----G-T-A--AA----A-CG----T-A--T-A-TA--G-CA---G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96184 : a-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-T-T--G--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------TCCT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----C-CA----ATA--TAA-TAG-A-TATG-G-AA-T--T-GCTTTGAA
gi|96185 : -GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-A--AACA-A----G-TC-T-----T-----AA-C----T-TC--A-------T-G-CTT----------T-CT-G---T-C-C-CG-T------------AAA--G---A--A-----A---A------A---TT-TT-G-TAA--AA----A-CG----GTA--T-ACTAG-A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96186 : -GGAT-T--TCAAA-GAG-C-C-G--A--A-A----G-TT-T-----G--A--AA-C----T-GT-GT-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CC-T------------GAA-CG---G--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----TTG--T-T-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-GTGGA
gi|96187 : -C-C-A--G--A-A----A-TC-T-----A--A--AA-C----T-GT-GA-------T-G-CT-------------CT-A---T-C-G-CG-T------------AAA-CA---A--ACACGAA---A-A-C--A---TT-TT-G-T-A--AA----A-TG----TTA--C-G-GA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
blockSeqs : T C GC A A GGA AC ACCA G AC CGTAC CT AT A CGTG AATCCTT G GTACATAAAA T T ATA T C TTTACTCGCCTG AC GTA TA CACGA TAC A G GG TTT G G C G AA CCAG T TGTT TC A T GG C TG A T AA G T
blockSeqs : C . C T C TG T C A CC . G . A T GG G . T A AG G G TA G A . . C G A . TT C . . A A C . TC . A G T . AG T T TA . G
blockSeqs : . . . . . CA . . . C . . . A . A . . C . A G . T G . . . . . . . T . . . . A T . GT . A C T . G . . . . T
blockSeqs : . . . . . G . . . C . . . A . A . . . . . . . A C . . . . . . . T . . . . . G . T . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . A . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-G--A--A-A----G-TN-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
finalCons : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-G--A--A-A----G-TN-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
Alignments
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lowQualScore : . . . .. . . . .... .. . .... . .. ..... .. .. . .... . . ....... . . .......... . . ... . . . . ............ .. ... .. ..... ... . . .. ... . . . . .. .... . .... .. . . .. . .. . . .. . .
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consensus : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-G--A--A-A----G-TN-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
Reference ( family-431 ) : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-G--A--A-A----G-TN-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96147 : AATAAA-GGAT-T--TCAAG-GGA-C-C-G--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----CTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96148 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GG--C-T-G--A--A-A----C-TACT-----G--A--AA-T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-C-TT-T------------AAAACG---A--A-----A---AAA-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTG
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gi|96161 : AATAAG-GAAT-C--TTAAG-GG--C-C-G--A--A-A----AATC-T-----G--A--AA-C----T-TTTGA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-T-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CGT---TTA--T-A-TAGGA-CAC--G-AA-A--T-GC-TTGAA
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gi|96163 : AATA-G-GGAT-C--T-AAT-GGG-C-C-A--A--A--------CC-T-----G--A--AAAT----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C---CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--AT--TT-TT-G-T-G--AAG---A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--GAAA-A--T-GC-TTGAA
gi|96164 : AATAAG-GAAT-C--T-AAG-GGG-C-C-G--A--A-A----A-TC-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-C-T----------T-CT-A---T---T-CT---------------AA-GG---A--A-----A---A-A-C--AT--TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A--AC--G-AA-CAAT-GC-TTGAA
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gi|96166 : AATAAGTGGATCT--TCA---GGG-C-C-A--A--A-A----C-TG-G-----A--A--AA-C----T-TT-GA-------T-GGCTT----------C-CT-A---T-C---CT-T------------AAA-GG---A--A-----A-------C--A---TT-TT-G-TGG--AA----A-CG-----TA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-A--T-GC-TTGGA
gi|96167 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GG--C-C-A--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AA
gi|96168 : AATAAG-G-AT-T--CTAGG-AGG-C-C----A--A-A----G-CT-C-----T--A--AA-C----T-TT-GA-------T---CTT----------T-CT-A---T---T-CT-T------------AA---G---G--A-----ATACA-A-C--A---TT-TTGG-T-GA-AA----A-CG-----TA--T-A-TA--A-CAC--G-AA-A--T-GC-TTGAAgag
gi|96169 : AATAAGCGGAT-T--T-AAG-GGG-C-A-G--A--A-A----G-T--T-----G--A--AA-C----T-TT-G--------T-G-CTT----------T--T-A---T-T-TTCT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-T------TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TAA--TAA-CA--G-CGA--A-AA-T--G-GC-TTGAA
gi|96170 : AATAAG-AGAT-T--TCAAG-GAG-C-C-G--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CA---A--A-----A---A-C-T--A---TT-TT-G-T-G--GA----
gi|96171 : AATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-A--A--A-A----G-TA-C-----G--A--AG-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CA-A---T-C-
gi|96172 : AATAAG-GGAT-T--TCTAG-GGG-C-C-G--A--T-A----T-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-TTTTACTCGCCTGAAA-CA---A--A-----AC--A-G-CGGA---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----Tct
gi|96173 : AATAAG-AGAT-T--GCGAG-GGG-C-A-T--A--A-A----G-TA-CCGTACG--A--CA-C----T-TC-GA-------T-G-TTT----------T-CA-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-T--A---TT-GC-G-T-G--AA----A-CA----TCA--T-A-AT--A-TAT--G-AA-TTAT-GC-TTG
gi|96174 : AATAA--GGAT-T--CAAAG-GGGCC-C-A--A--A-A----G-TA-T-----G--AATAA-C----T-TT-GA-------TGG-CTT----------C-CTAA---T-C-TGCT-TA-----------AAA-CG------G-----A---A-C-C--AG--TT-TT-G-T-GAAAA----A-TGTC--TCA--T-ATTA--ACCAT--G-AA-T--T-GCTTTGAA
gi|96175 : AATAAG-G-AT-T--TCAAGTGGG-C-G-GGAA--A-A----A-TC-T-----G--A--AAAC----T-TT-GAAATCCTTT-G-CTT------------AT-A---T-C-T-CT-T------------TAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A----T-TT-A-A-G--AA----A-TAGT--TTA--T-A--A--A-CATTGA-AA-T--T-GCGTTGAA
gi|96176 : ATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-CCA--A--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-C----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-C--T------------AAA-CA---A--A-----A---A-A-C--ATT-TT-TT-G-T-G--AA----A-TG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96177 : ATAAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-T-----A-A----G-TA-T-----G--A--AA-CT---T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-T---T-C-T-CT-T------------AAA-TG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G---A----A-TG----TTA--T-A-TAT-G-GAT--G-AA-T--T-GC-TTGGA
gi|96178 : ATCAG-GGAT-T--TCAAG-GG----C-A--AT-ACA----G-TCCT-----T--A--AA-C----T-TT-AAA------T-G-CTT----------T-CT-G---T-C-CGCG-T------------AAA-AG---A--A-----A---A-A-C--A---TTCTT-G-T-A--AA----A-CG----GTA--T-AGTA--G-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96179 : TAAG-GGAT-TGCTTAAT-GGG-C-C-T--T--A-A----A-CC-T-----G--A--AA-T----T-TT-GAA------T-GGCTT----------T-CT-AA--T-C-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---AGA-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CG----TTA--T-A-TA--A-CAT--G-AA-A--T-GC-TTGA
gi|96180 : AAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-CAA-A--A--A-A----G-TC-T-----T--A--AA-C----T-TT-AA-------T-G-CTT----------T--T-G---T-C-C-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-GT-C-G-A--AA----A-CATGTTTTATCT-A-TA--A-CAT--G-AATT--T-GC-
gi|96181 : --TCAAG-T---C-C-G--A--A-A----C-CT-T-----G--A--AA-A----C-TT-GA-------T---CCT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G---A----A-CGA---TTA--T-A-TA--A-CACAGA-AA-A--T-GC-TTGAA
gi|96182 : aaaagaAG-GGAT-T--TCAAG-GGG-C---A--A--A-A----G-TA-T-----G--A--A--T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-CG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----G--G----TTA--T-A-TAG-A-CAT--GTAATT--T-GC-TGGAA
gi|96183 : -GGAT-T---CAAG-GG--C-C-A--A--A-AACCAG-TC-T-----T--A--AA-C----T-TT--A-------T-G-CTT------------CT-G---T-C-T-CCGT------------AAA-AG---A--A-----A---A-AAC--A---TT----G-T-A--AA----A-CG----T-A--T-A-TA--G-CA---G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96184 : a-GGAT-T--TCAAG-GGG-C-T-T--G--A-A----G-TA-T-----G--A--AA-T----T-TT-GA-------T-G-CTT----------TCCT-A---T-C-T-CT-T------------AAA-GG---A--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----C-CA----ATA--TAA-TAG-A-TATG-G-AA-T--T-GCTTTGAA
gi|96185 : -GGAT-T--TCAAG-GGG-C-C-A--AACA-A----G-TC-T-----T-----AA-C----T-TC--A-------T-G-CTT----------T-CT-G---T-C-C-CG-T------------AAA--G---A--A-----A---A------A---TT-TT-G-TAA--AA----A-CG----GTA--T-ACTAG-A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA
gi|96186 : -GGAT-T--TCAAA-GAG-C-C-G--A--A-A----G-TT-T-----G--A--AA-C----T-GT-GT-------T-G-CTT----------T-CT-A---T-C-T-CC-T------------GAA-CG---G--A-----A---A-A-C--A---TT-TT-G-T-G--AA----A-CA----TTG--T-T-TA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-GTGGA
gi|96187 : -C-C-A--G--A-A----A-TC-T-----A--A--AA-C----T-GT-GA-------T-G-CT-------------CT-A---T-C-G-CG-T------------AAA-CA---A--ACACGAA---A-A-C--A---TT-TT-G-T-A--AA----A-TG----TTA--C-G-GA--A-CAT--G-AA-T--T-GC-TTGAA