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Reference ( family-426 ) : ACTA--TG-C-AGAN--CGACTT-AT-G-AAA-GT-G---A-TCG------G-C---G-G-GG-AA--AT------C--A-C-A------T----A-T--------T-T-T-A---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---A-TA---T-T-T--AT---TTTTT
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gi|115295 : TA--TG-CCAGAA--CAATTT-AT-G-AA--GT-G---A-TTG------G-C---G-G-GG-AA--AT------C--A-C-C------T----A-C--------T-T-T-A---AA---T-------C-ATT--------------G---TCATT--C---T---A--------T-T--AT---TTTTT
gi|115296 : A--TG-C-AGAA--CGACTT-AT-G-AAA-GT-G---A-CTG------C-C---C-T-GG-GA--AT------C--A-C-A------A----A-C--------T-T-T-T---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---A-TA---TGT-T--AT---TTTTT
gi|115297 : A--TG-C-AGAA--CAATTT-AT-G-GAA-GTGG---A-TTG------G-CG--G-G-GG-AA--AT------C--A-C--------T----A-C--------T-T-T-T---AA---T-------C-ATT-T---G-----T-CAATTT--TT--C---T---ATTA---T-T-T--AT---TTGTT
gi|115298 : A--TG-CCAGAA--CAATTT-AT-G-GAA-GT-GG--A-TTG------G-C---G-G-GGGAA--AT------C--A-C--------T----ACT--------T-T-T-A---AA---T-------C-A-T-T---G-----T-CAT--T--TT--C---T---A--------T-T--AT---TTTTT
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gi|115301 : G-C-AGAA--CGCCTT-AT-G-AAA-GT-T---A-TTGTGATTTG-C---GAG-GG-AA--AT------C--G-T-A------T----A-T--------T-T-T-G---AA---T-------A-ACT-TATAC-----T-CA---A--TC--C---T---G-TG---G-T-T--GT---TTTT
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gi|115303 : CCT-GT-G-AGA-GT-AT--A-T-G------G-C---G-G-G--AA--AT------C--A-C-A------T----A-T--------T-T-T-A---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---
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Alignments
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lowQualScore : .. . . .... . . . ...... . ... . .. . ... . . . .. ...... .. . . ...... .... . ........ . . ..... ... ....... . . ......... . ...... .. ... ... . ... . . .. ...
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consensus : ACTA--TG-C-AGA-A--CGACTT-AT-G-AAA------GT-G---A-TCG--G-C---G-G-GG-AA--AT------C--A-C-A------T----A-T--------T-T-T-A---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---A-TA---T-T-T--AT---TTTTT
Reference ( family-426 ) : ACTA--TG-C-AGA-A--CGACTT-AT-G-AAA------GT-G---A-TCG--G-C---G-G-GG-AA--AT------C--A-C-A------T----A-T--------T-T-T-A---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---A-TA---T-T-T--AT---TTTTT
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gi|115296 : A--TG-C-AGA-A--CGACTT-AT-G-AAA------GT-G---A-CTG--C-C---C-T-GG-GA--AT------C--A-C-A------A----A-C--------T-T-T-T---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---A-TA---TGT-T--AT---TTTTT
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Alignments
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Reference ( family-426 ) : ACTA--TG-C-AGA-A--CGACTT-AT-G-AAA------GT-G---A-TCG--G-C---G-G-GG-AA--AT------C--A-C-A------T----A-T--------T-T-T-A---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---A-TA---T-T-T--AT---TTTTT
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gi|115277 : ACTA--TGGC-AGA-ATACGACTT-AT---AAA------GTGG---G-TCG--G-T---G-G-GG-AA--AT------CCTA-C-A------T----A-T--------TAT-T-AT--GA---T-------A-AAT-T---TGAATAT-CG---T--TT------T---G-TA---TAT-T--AT---TTT
gi|115278 : ACTA--TG-T-AGA-T--CGATTT-AT-G-AAA------AT-G---A-TCG--G-C---G-A-GG-AA--AT------C--A-C-ATACATGT----A-T--------T-T-T-A---TA---T-------A-ATT-T---
gi|115279 : ACCA--TG-C-AGA-T--CGACTA-ATTG-AAA------GT-G---A-TCG--GAC---A-G-GG-AA--AA------T--A-C-AA-----T----A-T--------T-T---A---GA---T-------A-ATT-C---C-----T-TG---T--TA--C---TGGAA-AA---T-T-T--AT---TTTTT
gi|115280 : ACTA--TGTC-AGA----CGATTT-AT-G-GAA------GT-G---A-TTGGCG-C---G-G-GA-AA--AT------C--A-C-C------T----A-C--------T-T-T-T---GA---CTTATTAAA-ATT-T---G-----T-CA------TT--C---T---ATTT---T-T-T--AT---TTT
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gi|115301 : G-C-AGA-A--CGCCTT-AT-G-AAAGTTATTGT-G---A-TTT--G-C---GAG-GG-AA--AT------C--G-T-A------T----A-T--------T-T-T-G---AA---T-------A-ACT-TATAC-----T-CA---A--TC--C---T---G-TG---G-T-T--GT---TTTT
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Reference ( family-426 ) : ACTA--TG-C-AGA-A--CGACTT-AT-G-AAA------GT-G---A-TCG--G-C---G-G-GG-AA--AT------C--A-C-A------T----A-T--------T-T-T-A---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---A-TA---T-T-T--AT---TTTTT
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gi|115284 : ACTA--TA-C-AGA-T--CGACTT-AT-G-AAA------GA-G---A-TCA--G-C---G-G-GG-AA--AT------
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gi|115287 : CTC--TG-C-AGA-T--TGACTT-AC-G-AAG------AT-G---A-TTG--G-CCG-A-G-GA-AA--AT------C--A-C-A------T----A-T--------T-T-T-G---GA---C-------A-GTC-A---T-----T-CA------TT--C---T---A-TA---T-C-T--CT---
gi|115288 : CTA--TG-C-TGA-A--CAACTC-GT-G----------GT-G---A-TCG--G-T---T-G-GG-AA--AT------T--G-C-A------T----A-T--------T-T-C-G---GA---T-------A-ATT-C---A-----T-TA---G--TT--C---T---A-TA---T-C-T--
gi|115289 : CTA--TG-C-TGA-A--TGACTT-AT-G-AAG------GT-G---A-TCA--G-T---G-A-GG-AA--ATAGCATAT--A-C-A------T----G-T--------A-T-T-G---GA---T-------A-AAT-A---A-----T-TG---G--TG--C---T---C-TA---T-C-T--AT---TTTT
gi|115290 : CTA--TG-C-AGA-C--CGACTT-AT-T-AAG------TT-G---A-TTG--G-C---G-G-GG-GG--AT-----------T-A------T----T-T--------T-T-T-A---TA-----------A-ATTGT---T-----T-TG---T--TT--T---T---A-T
gi|115291 : TA--TG-C-AGA-T--CGACTT-AT-G-AAA------GT-G---A-TCG--C-C---A-G-GG-AA--AT------C--A-C-A------T----A-T--------T-T-T-A---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---T--TT--T---T---G-TA---T-T-T--AT---TTTTT
gi|115292 : TA--TG-C-AGACG--CGACTT-AT-G-AAAA-----GT-A---A-TCG--G-C---G-G-GG-GACAAT------C--A-C-A------T----A-TGT------T-T-T-A---GA---T-------A-TGG-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---G-TA---T-T-T--AA---TTTTT
gi|115293 : TA--TG-C--GA-T--CGATTT-AT-G-AAA------GT-G---A-TCG--G-C---G-G-GG-AA--AT------C--A-C-A------T----A-T--------T-TAT-A---GA---C-------A-ATG-C---C-----A-GA---T--TT--CTGAT---A-TA---T-TAT--AT---TTTTT
gi|115294 : TA--TG-C-AGA-TT-CGACT--AT-G-AAA------GT-A---A-TTG--G-C---G-GCGG-AA--AT------C--A-T-ACC----C----A-T--------T-A-T-A---GA---TG------A-AAT-T---C-------CG---T--TT--C---T---A-TA---T-T-TTAAT---TTTTT
gi|115295 : TA--TG-CCAGA-A--CAATTT-AT-G-AA-------GT-G---A-TTG--G-C---G-G-GG-AA--AT------C--A-C-C------T----A-C--------T-T-T-A---AA---T-------C-ATT--------------G---TCATT--C---T---A--------T-T--AT---TTTTT
gi|115296 : A--TG-C-AGA-A--CGACTT-AT-G-AAA------GT-G---A-CTG--C-C---C-T-GG-GA--AT------C--A-C-A------A----A-C--------T-T-T-T---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---A-TA---TGT-T--AT---TTTTT
gi|115297 : A--TG-C-AGA-A--CAATTT-AT-G-GAA------GTGG---A-TTG--G-CG--G-G-GG-AA--AT------C--A-C--------T----A-C--------T-T-T-T---AA---T-------C-ATT-T---G-----T-CAATTT--TT--C---T---ATTA---T-T-T--AT---TTGTT
gi|115298 : A--TG-CCAGA-A--CAATTT-AT-G-GAA------GT-GG--A-TTG--G-C---G-G-GGGAA--AT------C--A-C--------T----ACT--------T-T-T-A---AA---T-------C-A-T-T---G-----T-CAT--T--TT--C---T---A--------T-T--AT---TTTTT
gi|115299 : --TG-C-AGA-T--CGATTT-AT-G-AAAA-----GT-GGAAA-T-G--G-C---G-G-GG-AA--AT------C--A-C-A------T----G-T--------T-T-T-A---GA---C-------A-ATT-T---T-----T-CG---T--TT--T---T---A-CA---G-T-T--
gi|115300 : G-C-AGA----CG--TT-TT-G-AAA------GT-T---ACTCG--G-T---G-G-GG-AA--AT------C--A-C-A--------------------------T-A---GA---T-------AGATT-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---A-TA---TGT-T--ATAAGTTTT
gi|115301 : G-C-AGA-A--CGCCTT-AT-G-AAAGTTATTGT-G---A-TTT--G-C---GAG-GG-AA--AT------C--G-T-A------T----A-T--------T-T-T-G---AA---T-------A-ACT-TATAC-----T-CA---A--TC--C---T---G-TG---G-T-T--GT---TTTT
gi|115302 : ACTTGAC-G-GAA------GT-G---A-TCG--G-CCGAA-G-GG-AA--AT------C--A-C-A------TTGT-A-T--------T-T-TTA---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---T--TT--C---T---C-T----T-T-T--AT---TTTTT
gi|115303 : CCT-GT-G-AGA------GT-AT--A-T-G--G-C---G-G-G--AA--AT------C--A-C-A------T----A-T--------T-T-T-A---GA---T-------A-ATT-T---C-----T-CG---
gi|115304 : T-AT-G-AAA------GT-G---A-TCG--G-C---G-G-GG--A--AT------C--A-C-G------T----A-T--------T-T-T-AGATGA---T-------A-ATT-T---T-----T-CA------TT--C---T---A-TA---T-T-T---T---TT
gi|115305 : T-G-AAA------GT-G---A-TCG--G-C---G-G-AG-AA---T------C--A-C-A------T----A-T--------T-T-T-A---AA---T-------A-TTT-T---T-----T-TG---A--TT--C---T---A-TA---T-A-T--AT---TTTTT